La geometra molecular o estructura molecular se refieren se refiere a la disposicin tridimensional de los tomos que constituyen una molcula.

Determina muchas de las propiedades de las molculas. Como son la relatividad, polaridad, fase, color, magnetismo, actividad biolgica, actualmente el principal modelo de geometra molecular es la teora repulsin de pares de eletronones de valencia empleada internacionalmente por su gran predictibilidad

Las geometras moleculares de determinan mejor a temperaturas prximas al cero absoluto porque a temperaturas ms altas las molculas presentaran un movimiento de rotacin considerable en el estado slido la geometra molecular puede ser medida por difraccin de rayos x. la geometra se puede calcular por procedimientos mecnicos cunticos ab initio o por mtodos semiempiricos de modelamiento molecular sonarmonicas al menos en una primera aproximacin lo que significa que los tomos oscilan en torno a su posicin

La posicin de tomos se determina por la naturaleza de los enlaces qumicos con los que se conectan a su tomo vecino. La geometra molecular puede describirse por la posiciones de estos tomos en el espacio, mencionando la longitud de enlace de dos tomos unidos, Angulo de enlace de tres tomos conectados y ngulo de torsin de tres enlaces consecutivos

Dado que el movimiento de los tomos en una molcula est determinada por la mecnica cuntica, uno debe de definir el movimiento de una manera cuntica, (externo) de traslacin y rotacin cambia fuertemente la energa molecular

El tercer tipo de movimiento es la vibracin, un movimiento interno de los tomos en una molcula. La vibracin molecular anomonicas al menos en una primera aproximacin lo que significa que los tomos oscilan en torno a su posicin de equilibrio, incluso a la temperatura del cero absoluto. En el cero absoluto todos los tomos estn en su estado de vibracin basal y significa que los tomos oscilan en torno a su posicin de equilibrio incluso a la temperatura del cero absoluto todos los tomos estn en su estado

Por definicin los tomos en las molculas suelen estar unidas unos a otros con enlaces covalentes, que pueden ser simples, dobles o triples donde un enlace es un par de electrones compartidos entre tomos se denominan enlace es el ngulo formado por tres tomos enlazados consecutivamente para cuatro tomos unidos consecutivamente en una cadena lnea, el ngulo torsional es el ngulo entre el plano formado por los tres primero tomos y el plano formado por los tres ltimos tomos

Una sustancia pura est compuesta de solo un tipo de ismero de una molcula (todas tiene la mima estructura geomtrica) resulta en propiedad muy distinta Una sustancia pura est compuesta de solo un tipo de ismeros de una molcula todos tienen la misma estructura tiene la misma frmula qumica pero diferente ordenamiento fsico, frecuentando formas geomtricas alternas con propiedades muy distintas Una sustancia "pura" est compuesta de slo un tipo de ismero de una molcula (todas tienen la misma estructura geomtrica). Los ismeros estructurales tienen la misma frmula qumica, pero diferente ordenamiento fsico, frecuentemente formando geometras moleculares alternas con propiedades muy diferentes. Los tomos no estn enlazados (conectados) en el mismo orden. Los ismeros funcionales son una clase especial de ismeros estructurales, donde ciertos grupos de tomos exhiben un tipo especial de comportamiento, como es un ter o un alcohol.

La estereoismeros pueden tener muchas propiedades fsicoqumicas idnticas y, al mismo tiempo, actividad biolgica muy diferente. Esto se debe a que poseen la quiralidad que es muy comn en los sistemas vivientes. Una manifestacin de esta quiralidad es su habilidad para hacer rotar la luz polarizada en direcciones diferentes. Protein folding, que concierne a la compleja geometra y diferentes ismeros que las protenas pueden tener.

La geometra molecular se representa en una pirmide en la cual en la punta inicial hay una molcula de oxgeno con carga negativa, quedando en las otras dos puntas dos molculas de hidrgeno con carga positiva, que son separadas por un ngulo de 104.5; el enlace que une los hidrgenos con el oxgeno se llama enlace covalente, y tambin existe un enlace que une a otra pirmide idntica a la anteriormente nombrada llamado enlace puente hidrgeno.

Dado que el movimiento de los tomos en una molcula est determinado por la mecnica cuntica, uno debe definir el "movimiento" de una manera cuntica. Los movimientos cunticos (externos) de traslacin y rotacin cambian fuertemente la geometra molecular. (En algn grado la rotacin influye en la geometra por medio de la fuerza de Coriolisy la distorsin centrfuga, pero son despreciables en la presente discusin). Un tercer tipo de movimiento es la vibracin, un movimiento interno de los tomos en una molcula. Las vibraciones moleculares son armnicas (al menos en una primera aproximacin), lo que significa que los tomos oscilan en torno a su posicin de equilibrio, incluso a la temperatura del cero absoluto. En el cero absoluto todos los tomos estn en su estado vibracional basal y muestran movimiento mecnico cuntico de punto cero, esto es, la funcin de onda de un modo vibracional simple no es un pico agudo, sino un exponencial de ancho finito. A temperaturas mayores, los modos vibracionales pueden ser excitados trmicamente (en un interpretacin clsica, esto se expresa al enunciar que "las molculas vibrarn ms rpido"), pero siempre oscilan alrededor de una geometra reconocible para la molcula. Para tener una comprensin ms clara de la probabilidad de que la vibracin de una molcula pueda ser trmicamente excitada, se inspecciona el factor de Boltzmann , donde es la energa de excitacin del modo vibracional, es la constante de Boltzmann y es la temperatura -1 absoluta. A 298K (25 C), unos valores tpicos del factor de Boltzmann son: E = 500 cm --> 0.089; E = -1 -1 -4 -1 1000 cm --> 0.008; E = 1500 cm --> 7 10 . Esto es, si la energa de excitacin es 500 cm , aproximadamente el 9% de las molculas estn trmicamente excitadas a temperatura ambiente. La -1 menor energa vibracional de excitacin es el modo de flexin (aproximadamente 1600 cm ). En consecuencia, a temperatura ambiente menos del 0,07% de todas las molculas de una cantidad dada de agua vibrarn ms rpido que en el cero absoluto. Como se mencion anteriormente, la rotacin influye fuertemente sobre la geometra molecular. Pero, como movimiento mecnico cuntico, se excita a bajas temperaturas (comparada con la vibracin). Desde un punto de vista clsico, puede decirse que ms molculas rotan ms rpidamente a temperatura ambiente, esto es que tienen mayor velocidad angular y momentum angular. En lenguaje de mecnica cuntica: ms "eigenstates" de alto momentum angular son poblados trmicamente al aumentar la -1 temperatura. Las energas de excitacin rotacionales tpicas estn en el orden de unos pocos cm . Los resultados de muchos experimentos espectroscpicos estn ensanchados porque involucran una media de varios estados rotacionales. Frecuentemente es difcil obtener las geometras a partir de los espectros a altas temperaturas, porque el nmero de estados rotacionales rastreados en el experimento aumenta al incrementarse la temperatura. En consecuencia,

Tipo de molcula

Forma

Disposicin electrnica

Geometra

Ejemplos

AX1En

Molcula diatmica

HF, O2, CO

AX2E0

Lineal

BeCl2, HgCl2, CO2,PbCl2

AX2E1

Angular

NO2 , SO2, O3

AX2E2

Angular

H2O, OF2, SCl2

AX2E3

Lineal

XeF2, I3

AX3E0

Trigonal plana

BF3, CO3 , NO3 , SO3

AX3E1

Pirmide trigonal

NH3, PCl3

AX3E2

Forma de T

ClF3, BrF3

Tipo de molcula

Forma

Disposicin electrnica

Geometra

Ejemplos

AX4E0

Tetradrica

CH4, PO4 , SO4 , ClO4

AX4E1

Balancn

SF4

AX4E2

Cuadrada plana

XeF4

AX5E0

Bipirmide trigonal

PCl5

AX5E1

Pirmide cuadrangular

ClF5, BrF5

AX6E0

Octadrica

SF6

AX6E1

Pirmide pentagonal

XeOF 5, IOF25
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