Universidad Nacional Del Callao Facultad De Ciencias Naturales Y Matemtica Escuela Profesional De Fsica

INTRODUCCIN A LOS PROGRAMAS Curso: Profesor: Alumnos: -Yallico Laura Daysi Jesusa - Sinche Huamn, Ronnie A. 062924 - B 062947 - B Introduccin a la Cristalografa Lic. Carlos Quiones Monteverde

Ciclo: 2012-A

INTRODUCCIN A LOS PROGRAMAS a) OBJETIVOS Familiarizarse con el uso de los programas aplicativos: CaRIne Crystallography 3.0 y PowderCell 2.3 for Windows. Identificar y describir las funciones de los elementos de la pantalla principal de estas aplicaciones. b) GENERALIDADES El CaRIne Crystallography 3.0 es una herramienta informtica que permite la creacin, visualizacin y modificacin simulada de estructuras cristalinas. Realiza diversos clculos cristalogrficos de los diferentes modelos simulando una variedad de condiciones experimentales. Controlar automticamente, entre otras: la apertura o creacin de celdas cristalogrficas, la rotacin de las celdas para una mejor visualizacin de los planos cristalogrficos la traslacin de los planos

Calcular: las distancias entre los tomos de la celda, el ngulo entre las direcciones de los planos, el volumen y la densidad de la celda unitaria.

Crear: Proyecciones estereogrficas. Registros de difraccin de rayos x para diferentes longitudes de onda.

c) PROCEDIMIENTO

Cargar el programa CaRIne Crystalloghraphy 3.0 y usando el comando open cell del men File, aperturar el archivo correspondiente a la celda ya creada de un compuesto, a fin de activar algunos comandos de la barra de mens.

Colocar el puntero del mouse en cada uno de los mens de la barra de mens y observar, en cada caso, el despliegue del cuadro de comandos. Observe y registre la lista de comandos e intente definir la funcin de cada uno de ellos aplicndoselos a la celda aperturada. Cargar el programa Powder Cell 2.3 for Windows y repita los pasos anteriores para estudiar su funcionamiento. d) TAREA a) Identificar los elementos de la pantalla principal del programa CaRIne Crystalloghraphy 3.0. b) En relacin a la pregunta 1, indicar y describir las funciones de los comandos de los mens: File Edit Cell hkl/uvw Calcul Specials Crystal View ? Window

c) Identificar los elementos de la pantalla principal del programa PowderCell 2.3 for Windows que se muestra en la Figura 1.2. d) En relacin a la pregunta 3, describir las funciones principales de los mens: File Structure Select Options Diffraction Refinement Windows Special Help

e) De lo observado, Qu similitudes y diferencias encuentra usted entre estos dos programas aplicativos?

PRIMERA PARTE 1.- Identificar los elementos de la pantalla principal del programa carine crystalloghraphy 3.0 Los elementos del los elementos de la ventana principal del programa Carine Crytalloghraphy 3.0 se presenta a continuacin:
Barra de titulo Barra de Men Barra de herramientas

Paneles Flotantes de Herramientas

rea de trabajo

SEGUNFDA PARTE 2.- En relacin a la pregunta 1, indicar y describir las funciones de los comandos de los mens: File , Cell, Calcul, Crystal, Window, Edit, hkl/uvw, Specials, View

File: Las funciones del men de FILES permiten la direccin de los archivos de su documento. Hay 3 tipos de archivos: - Adorno o clulas ( CEL,MTF2,MTF* ) - Cristales (CRY, RES2, RES*) - Cuadros (WMF, PICT) CaRine permite a varios archivos de cristal de la misma clula de unidad se guarden. Con el fin de diferenciar estos archivos, CaRine da automticamente la extensin cel a los archivos de adorno y cry a los archivos de cristales. CaRine tambin maneja la importacin y la exportacin de adornos y enrejados de los archivos de ASCII (formato de texto).

FILE: Como se 1puede observar en la figura 1 se encuentran algunos comandos de este Figura men y tambin las combinaciones de teclas para el acceso rpido, describiremos algunos de ellos: New: Close: Open Cell: Save: Save as: Open Crystal Save Save as Muestra una nueva ventana de trabajo en blanco. Cierra la ventana de trabajo. Abre una celda de la biblioteca del programa. Guarda automticamente el trabajo. Guarda en un sitio especifico el trabajo.
Estos comandos tienen las mismas funciones de lo descrito para las celdas, solo que esto lo realiza para un cristal

Import: importa algn trabajo hacia la ventana del programa. Import Cell Standart ASCI I File Cell*.MTF Cell CaRIne Macintosh Crystal Standard ASCII File Crystall*.RES Export: exporta el trabajo realizado en el programa. Export Cell Standar ASCII File Crystal Standard ASCII File Standard ASCII File Prefs Print preview Print Esta seccin es para las opciones impresin del los grficos

Printer setup Options Quit EDIT:

El men edit nos permite realizar las operaciones siguientes: Cant undo: Deshace la accin realizada. Copy: Realiza una copia

CELL:

Los comandos de Cell nos permiten definir muestro propios adornos o clulas de unidad. Creation: permite observar cmo est compuesto la partcula y tambin modificarla agregando o quitando algn elemento a la muestra.

Triclinic: primitive (p) /Primitive

Primitiva Base centrada

Primitiva Base centrada Cuerpo centrado Cara centrada

Primitiva Cuerpo centrado

Primitiva Cuerpo centrado Cara centrada

Primitiva

Primitiva Space groups: grupo de espacios. Cristal to cell : celda del Cristal.

Hkl/uvw:
Este men tiene las funciones de permitir la visualizacin y la seleccin de planos y direcciones, adems de las proyecciones basadas en ndices cristalogrficos.

Los comandos son:

CALCUL:
En el men de Calcul tenemos herramientas interactivas que cumplen la funcin o permiten las mediciones geomtricas de los cristales estructuradas en 3D. Esto se da utilizando el Mouse, pues las distancias y los ngulos son fcilmente calculados utilizando las formulas trigonomtricas habituales

Los comandos de Calcul.: Distancia entre tomos Angulo entre 2 direcciones Angulo entre 2 direcciones con el mouse Angulo entre 2 planos Angulo entre 2 direcciones con el mouse Angulo entre plano y la direccin Angulo entre plano y la direccin con el mouse
Volumen de la celda unitaria Densidad de la celda unitaria Lista de espacio de los planos Lista de ngulo en los planos Identificacin de planos

Specials:
El men Especial reagrupa las funciones que le son relativas a: El Estudio de los tomos de un medio ambiente. La visualizacin de plano / direccin de rodadura. La relacin de orientacin entre varios enrejados. La proyeccin estereogrfica. El diagrama de difraccin de rayos X. Los enrejados recprocos

Los comandos son:

Entorno Textura Proyecciones estreos Retcula reciproca Relacin epitaxia Retculas asociadas

CRYSTAL: Las funciones de este men permiten la visualizacin de los tomos, los enlaces y poliedros que se acte en consecuencia. Cualquier modificacin realizada sobre la estructura, utilizando las siguientes funciones, slo se refieren a las de cristal y no afecten a la unidad de la clula. Para los tomos de la unidad de clulas que se modific debe utilizarse la funcin creation`` o la funcin Crystal to cell``. La mayora de las funciones que permiten a las modificaciones puntuales de la estructura y la visualizacin de cristal se puede acceder mediante la paleta de herramientas. Cuando este es el caso, aparece un icono en frente de la funcin.

Los comandos son:

Desplegarse en

Esconder el tomo Esconder todo Llamar Llamar a todos

Modificar Etiquetar Etiquetar todo Remover Remover lo oculto Agregar Vacancia Agregar link Multi link Remover Remover todo Modificar Preferencias Modificar poli Ocultar Mostrar Mostrar todo Remover Etiquetar Etiquetar todo

VIEW: Este men tiene las funciones de permitir las escalas de los enrejados verdaderos o recprocos y los parmetros de la rotacin de cristal para ser modificada.

Los comandos son:

Graficas Escala general Radial escala Aumento WINDOW: Disminucin Este men permite la organizacin de las ventanas de CaRine. Rotacin Alrededor de un tomo Alrededor del centro

Los comandos son:

Actualizar Herramientas del cristal P.s herramientas Herramientas de rotacin Cascada Mosaico Arreglar iconos Cerrar todo

TERCERA PARTE c) Identificar los elementos de la pantalla principal del programa

powdercell 2.3 for windows

I. Barra de instrumento para influir en la representacin de una estructura

Esta barra nos presenta diferentes botones con funciones como girar, rotar o aumentar y disminuir una estructura, mostrar sus distancias de los tomos. II. Barra de herramientas o la barra de instrumento superior. coordenadas, los smbolos las

Esta barra puede llamar las funciones ms importantes usando botones especiales III. Barra de mens: donde encontramos los mens: archive, estructura, seleccin, opciones, difraccin, Windows, especial, ayuda.

IV. Barra de titulo.- esta barra nos muestra el nombre del programa, as como la direccin donde se encuentra guardado el archivo.

Funciones de algunos iconos de las barras

CUARTA PARTE d) DESCRIPCION DE LAS FUNCIONES PRINCIPALES DE LOS MENS

FILE: este men tienes las funciones de guardar o abrir un archivo ya

existente, o crear un nuevo archivo, as como cerrarlo.

STRUCTURE: nos da funciones de toda la estructura, como una proyeccin

plana de tal, representacin de lmites; muestra los grupos y subgrupo.

SELECT: tiene las funciones de seleccionar un tomo, una molcula y su

rango o seleccionar toda la figura de un cristal que se esta representando, as tambin tiene las funciones de deshacer o borrar lo seleccionado; y tambin de mover los tomos seleccionados.
OPTIONS: este men tiene las funciones: mostrar la barra de smbolos,

mostrar la representacin de una estructura (de un elemento qumico) muestra su nmero atmico, radio, etc.
DIFFRACTION: como su nombre indica, este men tiene que ver con todo

relacionado a la difraccin de una estructura, como tenga que ver con clculos de difraccin.
REFINEMENT: este men indica todo que tiene que ver con el clculo del

refinamiento de una estructura.

WINDOWS: este men tiene las funciones de cmo mostrar las ventanas

abiertas en el programa, ya sea en forma cascada, o mostrando el titulo de una ventana as como cerrar las ventanas abiertas.
SPECIAL: contiene funciones especiales al tratar una estructura de un cristal. HELP: este men tiene las ayudas para las funciones describiendo las

funciones o actividades que describe cada botn para el uso del programa, as tambin nos describe y presenta el programa.

e) 2.3

DIFERENCIAS ENTRE CARINE CRYSTALLOGRAPHY 3.0 Y POWDER CELL

.0 Carine crystalloghraphy 3.0

El CaRIne Crystallography 3.0 es una herramienta informtica que permite la creacin, visualizacin y modificacin Realiza diferentes simulada de estructuras una cristalinas. de los de diversos clculos cristalogrficos

Powdercell 2.3
El programa PowderCell 2.3 est pensado para realizar la simulacin del difractograma que se obtendra en un experimento de difraccin de un material cristalino (mineral en nuestro caso). Simultneamente, se realiza la visualizacin de la estructura cristalina del mineral. Tambin con ayuda de este programa se pueden

modelos

simulando

variedad

condiciones experimentales Unas de las tantas funciones para usar en el CaRIne Crystallography 3.0 son: Controlar la apertura o creacin de celdas cristalogrficas. Controlar la rotacin de las celdas para un mejor visualizacin de los planos cristalogrficos. Controlar la traslacin de los planos. Calcular las distancias entre los tomos de las celdas. Calcular el ngulo entre las direcciones de los planos. Calcular el volumen y la densidad de la celda unitaria. Crear proyecciones estereogrficas. Crear registros de difraccin de rayos x para diferentes longitudes de onda. modificar el cristal. La creacin de un cristal. Aadir tomos. Estudiar las relaciones entre la orientacin de los cristales cambiar algunos de los parmetros que describen sus estructuras cristalinas (parmetros de celda elemental, grupo espacial de simetra o coordenadas de los tomos constituyentes) para estudiar cmo se modifica el difractograma correspondiente. PowderCell es muy til para ilustrar de forma sencilla la relacin que existe entre la estructura interna de un material cristalino y el diagrama de difraccin (de rayos X o de neutrones). Adems, PowderCell permite realizar un estudio bastante completo de un modelo, ya que : Calcula los parmetros geomtricos generales de la estructura (distancias y ngulos de enlace, ngulos de torsin interatmicos, etc) o de los tomos. Este programa es la incluso, disposicin puede variarse o la

interactivamente

espacial

naturaleza qumica de los tomos seleccionados en la estructura, y analizar los cambios que ello provocara en el diagrama de difraccin.

Pregunta extra Por qu el programa CaRIne Crystallography 3.0 muestra en la celda elemental ms tomos que los que debera mostrar de las estructuras cristalogrficas? Bueno ello podra deberse a que la celda elemental es un bloque estructural que debera repetirse entonces cuando observamos los tomos vecinos y el numero de tomos que aparezca depender tambin del tipo de estructura cristalina que tenga (cubica simple, BCC ,FCC, HEXAGONAL COMPACTA).