Anda di halaman 1dari 3

Menggunakan ClustalX2 untuk membuat pohon Filogenetik

1. Buka program ClustalX2, masukkan format fasta dari note pad (digunakan lebih dari sequences), klik File load sequences pilih folder

2. Apabila lebih dari 2 sequences gunakan Multiple Alignment Mode, apabila hanya 2 sequences gunakan Profile Alignment Mode

3. Buka Do Complete Alignment, lalu klik OK

Akan muncul tampilan seperti di bawah ini (nukleotida bergeser dan mensejajarkan diri ke sequens yang convers)

4. Untuk membuat primer, dicari daerah yang mempunyai konservasi (tingkat kesamaan) yang tinggi

Pencarian pada NCBI Nukleotide, Citrate Synthase and Homo Search Chordata Translasi Blastts

Anda mungkin juga menyukai