La clula sintetiza un gran nmero de diversas macromolculas necesarias para la vida.

El aparato de Golgi se encarga de la modificacin, distribucin y envo de dichas macromolculas en la clula.. Las principales funciones del aparato de Golgi vienen a ser las siguientes:

Las protenas recin sintetizadas en el RER son transferidas por medio de pequeas vesculas (vesculas de transporte) desde el RER o REL hasta la cara CIS, fusionndose con las pilas de cisternas de esta cara. En esta regin y en la media se fosforilan las nuevas protenas y se les agrega residuos de azcar (se forman glicoprotenas y proteoglicanos). El material continua desplazndose hacia las pilas de la cara TRANS donde si es necesario se parten las protenas en segmentos menores. Posteriormente se desprenden como vesculas o vacuolas de condensacin de los extremos de las pilas cncavas. Estas vacuolas son modificadas posteriormente para formar vacuolas secretoras maduras. Participa en la sntesis y reciclado de las membranas celulares. Distribuye, empaqueta y entrega enzimas a los lisosomas formando vesculas.

Las protenas, al igual que los lpidos y los polisacridos, son transportadas desde el aparato de Golgi a sus destinos finales a travs de la via secretora. Esto implica que las protenas se distribuyan en diferentes tipos de vesculas de transporte, las cuales saldrn por gemacin desde la red trans del Golgi y llevarn su contenido hasta la localizacin celular adecuada. Algunas protenas se transportan desde el Golgi a la membrana plasmtica por una va secretora constitutiva, responsable de la incorporacin de nuevas protenas y lpidos a la membrana plasmtica, as como de la secrecin continua de protenas desde la clula. Otras protenas son transportadas a la superficie celular a travs de una va diferente de secrecin regulada, o son dirigidas especficamente a otros destinos intracelulares, como los lisosomas en las clulas animales o las vacuolas en las levaduras.