Biokimia

Dr. Pudjadi S.U.

Mempelajari makhluk hidup dengan menggunakan pengertian ilmu kimia

Di alam ini ada benda tidak hidup (mati) dan benda hidup Benda mati terdiri dari materi kimia i. Kimia Benda hidup juga tersusun dari zat kimia yang merupakan benda tidak hidup (mati) Satuan benda/makhluk hidup adalah sel.

Makhluk hidup ada yang terdiri dari 1 sel (monoseluler), ada yang t.a. banyak sel (multiseluler)

Jenis Makhluk hidup

Dilihat dari struktur inti sel

Dilihat dari cara mendapatkan tenaga dan bahan penyusunan dirinya Dilihat dari organisasi sel/tubuh nya

Penggolongan makhluk hidup

Tidak punya inti sel ( prokariot ), monoseluler, autotroph Tidak punya inti sel ( prokariot ), monoseluler, heterotroph Punya inti sel, monoseluler, autotroph Punya inti sel, monoseluler, heterotroph Ragi algae

bakteri

Punya inti sel, multiseluler, autotroph

Punya inti sel, multiseluler, heterotroph

Tumbuhan

Hewan

Keistimewaan Makhluk hidup

Satuan hidup adalah sel

1. Benda hidup ( =sel = makhluk hidup) tersusun dari banyak macam molekul kimawi yang berupa benda mati, dan mereka berorganisasi 2. Organisasi molekul ini mempunyai kemampuan menyerap tenaga dan materi kimia dari lingkungannya 3. Mampu membentuk replikanya

Unsur dan molekul

Benda yang biasa kita lihat merupakan campuran / kombi nasi zat murni. Zat dasar murni disebut elemen kimia = unsur kimia Unsur kimia bergabung membentuk senyawa = molekul Setiap molekul mempunyai komposisi/struktur kimianya masing-masing (unik) Berbagai molekul murni bergabung membentuk Bahan alam
Hidrogen dgn hidrogen membentuk molekul hidrogen Oksigen dgn molekul oksigen membentuk molekul Oksigen Hidrogen dan oksigen bersenyawa membentuk air murni , .Dst.

Unsur penyusun kehidupan

H = hidrogen O = oksigen C = karbon N = nitrogen P = fosfor K = kalium Na = Natrium Ca = Kalsium Mg= Magnesium Cl = Chlor Fe = Ferrum Mn = Mangan I = Iodium F = Fluor Cu = Cuprum Si = Silikon B = Boron

S = sulfur
95 % 4,5 %

Co = Cobalt
Zn = Zink Se = selenium Mo = Molibdenum 0,49999 %

Sn = Stannum
Cr = Chrome Al = Aluminium Pb = Plumbum Ag = Argentum Hg = Hidrargirum 0,00001 %

Ikatan/kekuatan dalam senyawa kimia

Ikatan kimia = ikatan kovalen Ikatan ion Ikatan Hidrogen Ikatan Van der Walls

Molekul penyusun kehidupan

Zat kimia Air anorganik Mineral

Zat kimia organik :

Protein dan asam amino Lipida : al, TG, FL, C, CE Karbohidrat ; Rbs, Glks, Glkgn Asam Nukleat dan nukleotida Zat-zat intermedia

Air
Merupakan 60% - 80% berat sel Tdpt sbg : Air sel, air ekstra sel, Air lingkungan

Berkutub
Sebagian kecil terionisasi mbtk H+ dan OHBerfungsi sebagai pelarut

Mineral
Sebagai elektrolit = ion dalam air
Ikut berperan dalam osmolaritas air intra sel / ekstra sel (K+, Na+, Cl-, )

Sebagai garam, mengendap memperkuat jaringan : [Ca3(PO4)2] Menyusun molekul penting :

Iodium menyusun hormon tiroksin

Besi menyusun hem

Cobalt menyusun as. Folat, dsb.

Protein dan asam amino

Merupakan 15% massa sel

Merupakan molekul besar, t.a. asam amino

Fungsinya banyak

Struktur sangat bervariasi, ada 4 tingkatan struktur

Struktur ditentukan oleh gen (pembawa sifat) dalam DNA Bisa bergabung dengan zat non peptida, membentuk protein kompleks

Asam amino penyusun protein

Alanine Asparagine Aspartate Cysteine Glutamate Glutamine Arginine Histidine Isoleucine Leucine Lysine Methionine

Glycine
Proline Serine

Phenylalanine
Threonine Tyrptophan

Tyrosine

Valine

Lipida
Merupakan 11-13% dari massa sel

T.a. :

Asam lemak : jenuh / tak jenuh Gliserida : MG, DG, TG

Fosfolipida : Fosfatidat dsb.

Steroid : Kholesterol, dll

dan lain-lain

Karbohidrat
2-3% massa sel Fungsi utama sebagai bahan bakar Fungsi struktur : glikoprotein, proteoglikan

Struktur kimia :
monosakarida - gula : glukosa, fruktosa, galaktosa, ribosa, deoksiribosa disakarida gula : sukrosa, maltosa, laktosa polisakarida pati : amilum, glikogen serat : selulosa

Asam Nukleat
Tersusun dari nukleotida = polinukleotida

t.a. 2 jenis: DNA & RNA

Fungsi DNA : penyimpan sifat organisme

Fungsi RNA :
1.salinan isyarat struktur protein (mRNA)

2.Penyusun ribosom (rRNA)

3.Pembawa asam amino spesifik (tRNA)

Gbr sel

Jaringan

Organ

Tubuh