MATERI MATRIKULASI BIOLOGI TA 2010/2011

PRESENTED BY YATI SUPRIATIN,S.PD.,M.Si

AAK BAKTI ASIH Jl.Padasuka Atas No.233 Pasir layung Bandung

Biologi
-

Biologi ? Ilmu tentang makhluk hidup meliputi morfologi, fisiologi, anatomi, interaksi antar makhluk hidup. Cakupan Biologi ?? Kegiatan sehari-hari merupakan fenomena biologi, contoh ??? Tujuan mempelajari biologi ? untuk mengenal proses proses yang terjadi dalam tubuh kita, lebih bertafakur terhadap semua ciptaan Tuhan Mencari solusi terhadap rahasia-rahasia alam yang belum terpecahkan.

Cabang ilmu biologi

Cabang ilmu Botani virologi parasitologi embriologi fisiologi hematologi patologi Mikologi Ruang lingkup Ilmu tentang tumbuhan Ilmu tentang virus Ilmu tentang organisme yang bersifat parasait Ilmu tentang perkembangan janin dalam kandungan Ilmu tentang proses kegiatan tubuh makhluk hidup Ilmu tentang darah Ilmu tentang penyakit & pengaruhnya terhadap kehidupan organisme Ilmu tentang jamur

Bakteriologi Ilmu tentang bakteri

Biologi sebagai induk dari beberapa ilmu terapan

Sebutkan ilmu terapan yang terkait dengan biologi ?
Bidang kesehatan -kedokteran -keperawatan -kebidanan

-Analis kesehatan
Bidang pertanian Bidang peternakan

Konsep dasar kehidupan

Paramecium sp
Manusia Tumbuhan

Apa yang membedakan ketiga gambar tersebut ? ukuran

Apa yang menyebabkan ukuran ketiga makhluk hidup itu berbeda ??????????

ORGANISASI KEHIDUPAN

organisasi kehidupan dari urutan terkecil :

Sel jaringan organ

-Sistem respirasi

- Sistem reproduksi
- Sistem transportasi Sistem organ Organisme /individu

Sel disebut unit terkecil kehidupan ??? Karena sel memiliki ciri-ciri hidup
Penggolongan sel berdasarkan Keberadaan membran nukleus

Prokariotik
Nukleus tidak diselubungi Membran,sehingga materi Genetik terletak pada sitoplasma

Eukariotik
Nukleus diselubungi membran,sehingga materi genetik terlokalisasi dalam nukleus Terdapat pada sel hewan,sel tumbuhan, Sel jamur

Terdapat pada sel bakteri

Perbandingan struktur sel prokariotik & sel eukariotik

Syarat utama suatu sel hidup

Memiliki 4 organel dasar : Membran plasma Ribosom Materi genetik sitoplasma

Protoplasma

Membran sel

Plasma (cairan sel)

Organel sel

Nukleoplasma (cairan inti)

Sitoplasma (cairan di luar inti) inti sel (nukleus) -mitokondria -badan golgi -retikulum endoplasma -ribosom -lisosom

Sitoskelet

RE Kasar

RE halus

lysosomes

Nama Bagian Sel Dinding sel Membran sel

Sifat dasar Bersifat kaku karena tersusun dari selulosa Bersifat selektif permeabel, tersusun dari lipoprotein

fungsi Untuk memberi bentuk pada sel

-Sebagai

keberadaan Sel tumbuhan Semua sel

pembatas antara bagian luar sel dengan bagian dalam sel -Sebagai pengatur transportasi zat kedalam & keluar sel Mengatur seluruh aktivitas sel

Nukleus

Dibatasi oleh membran nukleus, terdapat materi genetik, terdapat nukleolus -Terdapat bebas pada sitoplasma & melekat pada RE - Terdapat tipe yang bermacammacam tergantung fungsi,

Sel eukariotik/sel hewan dan sel tumbuhan Semua sel Sel tumbuhan

ribosom Plastida

Tempat terjadinya sintesis protein -Kloroplas : tempat terjadinya fotosintesis -Amiloplast : tempat menyimpan amilum -Leukoplast : tempat menyimpan lemak
-REK

Retikulum endoplasma

Merupakan organel dengan sistem membran, terdapat 2 tipe: REK & REH Merupakan organel dengan sistem membran, Mengandung lisozim

(Retikulum Endoplasma Kasar) -REH (Retikulum endoplasma Halus) Tempat yang berkaitan dengan ekskresi Fagositosis benda asing yang masuk ke dalam sel

Sel tumbuhan & sel hewan

Badan golgi Lisosom

sel eukariotik Sel hewan

Perbedaan sel hewan & sel tumbuhan

Cell wall

SEL TUMBUHAN
Memiliki dinding sel yang kaku terbuat dari selulosa. Bila sel dimasukkan ke dalam larutan hypertonis : - Ukuran tetap namun isi sel berkurang, sehingga terbentuk vakuola. Bila proses ini berlangsung terus akan terjadi plasmolisis yaitu lepasnya protoplasma dari dinding sel Memiliki vakuola yang besar dan permanen memiliki plastida (kloroplast, leukoplast,kromoplast, amiloplast) tidak memiliki sentriol tidak memiliki lisosom

SEL HEWAN
tidak memiliki dinding sel. Bila sel dimasukkan ke dalam larutan hypertonis : -Ukuran mengecil, isi sel berkurang Bagaimana jika dimasukkan ke dalam larutan hypotonis ???

vakuola kecil dan tentatif tidak memiliki plastida

memiliki sentriol memiliki lisosom

Struktur membran sel

Lalu lintas melalui membran sel

Sistem lalu lintas sel Endositosis( pinositosis & Pagositosis), Eksositosis Untuk mentranport molekul besar Transport aktif Transport pasif Difusi biasa melalui membran Air, O2, CO2 Difusi berpasilitas
Glukosa Ion Na dan ion K

Melalui protein transport

pinositosis

Pagositosis

Diperlukan energi karena melawan gradien konsentrasi

Cellular Drinking

Cellular eating

RIBOSOM

Struktur Ribosom
-Ribosom fungsional terdiri dari 2 unit subunit ribosom besar dan sub unit ribosom kecil masing-masing merupakan kumpulan RNA ribosom dan banyak protein. -1 ribosom memiliki 1 tempat pengikatan mRNA dan 3 tempat pengikatan tRNA dikenal sebagai tempat P,A, dan E.

Fungsi Ribosom
-Organel yang berfungsi untuk membuat protein (sintesis protein) dalam sel - komponen-komponen ribosom dirakit di dalam nukleolus (anak inti) di dalam sel, lalu dilewatkan melalui pori nukleus ke sitoplasma untuk bergabung membenruk struktur ribosom yang utuh. -Ada 2 jenis ribosom Ribosom bebas dan ribosom terikat pada membran luar retikulum endoplasma -Ribosom bebas mensintesis protein yang berfungsi di dalam sitosol, ex: enzim yang mengkatalisis prodses metabolisme -Ribosom terikat memsintesis protein yang berfungsi untuk penyusun membran, lisosom, atau dikirim ke luar sel.ex: sel pankreas

Mikroorganisme ??? Makhluk hidup kecil yang hanya dapat dilihat dengan mikroskop Mikroorganisme yang dipelajari : Virus Bakteri Jamur patogen protozoa

PERALATAN YANG TERLIBAT DALAM PENGAMATAN MIKROORGANISME DI LABORATORIUM

Mikroskop

Mikroskop

Mikroskop cahaya

Mikroskop fluorescence

Mikroskop electrone

PERALATAN YANG TERLIBAT DALAM PENGAMATAN MIKROORGANISME DI LABORATORIUM

-

Alat untuk sterilisasi Sterilisasi basah Otoklaf (pada suhu 1210C tekanan 1 atm selama 15-20. Sterilisasi kering Oven (pada suhu 2000C selama 1 jam Prinsip sterilisasi : upaya membebaskan alat atau bahan dari mikroorganisme.

Asal kata Virion ==> Poison / Racun Ciri-ciri Virus : - Struktur bagian luar memiliki selubung/envelope dari protein , hanya memiliki 1 macam materi genetik (hanya DNA atau RNA saja) -Hanya dapat hidup dan reproduksi dalam sel makhluk hidup -Bentuk : batang, bola, kotak, atau huruf T

Virus yang sedang menyerang suatu sel

Struktur Virus

Penampang melintang virus Rabies

Penampang membujur virus Rabies

Mari kita saksikan CD multimedia macam-macam virus

Struktur Bakteri Macam-macam bentuk bakteri Penggolongan bakteri berdasarkan struktur dinding sel

Macam-macam bentuk bakteri Tipe alat gerak bakteri

Struktur Bakteri

Penggolongan bakteri berdasarkan struktur dinding sel

Prinsip pewarnaan Gram

hasil

Gram negatif akan berwarna merah. Ex: Escherichia coli,

Salmonella thyposa,

Interpretasi hasil -Bentuk (coccus/bulat atau basil/batang) -Susunan (rantai, sarcina, dua dua, bergerombol) -Sifat (gram positif atau gram negatif) Gram positif akan berwarna biru/ungu Ex: Staphilococcus aureus,

Streptococcus sp

Ciri umum fungi : Merupakan organisme eukariotik Bagian sel terdiri dari nukleus, retikulum endoplasma, mitokondria Tidak memiliki daun, akar, batang sejati & tidak dapat melakukan fotosintesis sehingga tidak dimasukkan kedalam gol tumbuhan Cara hidup :

Cara reproduksi seksual (konjugasi), aseksual (membelah diri, membentuk spora, membentuk konidia) Pengelompokkan jamur berdasarkan alat reproduksi seksual

Heterotrof sebagai parasit gol jamur patogen Heterotrof sebagai saprofit gol jamur pengurai

Zygomycetes reproduksi seksual terjadi di zygospora Ascomycetes reproduksi seksual terjadi di dalam sebuah askus(askospora) Basidiomycetesreproduksi seksual terjadi pada organ yang berbentuk tongkat yang disebut basidium Deuteuromycetessekelompok jamur yang proses seksualnya belum teramati

Contoh jamur
Sifat hidup
saprofit

spesies

keterangan

Aspergillus sp Penicillium sp Rhizopus sp Mucor sp Malassezia furfur -Microsporum sp & trycophiton sp -Candida albicans
-

Parasit

Penyebab penyakit panu -penyebab dermatofitosis - penyebab keputihan

-

Peranan jamur dalam dunia industri & medis

golongan
Zygomycetes

Nama spesies
Rhizopus oryzae

peranan
Pengurai senyawa protein menjadi senyawa peptida pada pembuatan tempe Pengubah gula menjadi alkohol, dipakai dalam pembuatan tape, sake dipakai dalam pembuatan kecap Penghasil antibiotik penicillin dapat dimakan

Saccharomyces sp

Ascomycetes

Aspergillus wentii

Penicillium notatum Volvariella volvacea/jamur

merang Basidiomycetes

Auricularia polytricha/ jamur

kuping deuteuromycetes

Dapat dimakan

Monilia sitophila

Digunakan dalam pembuatan oncom

Media pertumbuhan
Mikroorganisme Media pertumbuhan

Virus
Mikrofungi

Embrio ayam
Media agar

Bakteri

Kaldu steril -Media agar

-

Ciri umum Bersifat monoseluler bentuk tetap, kecuali Amoeba Habitat : - sebagai Parasit pada tubuh manusia/hewan - hidup bebas di alam Alat pencernaan (cytostoma/ mulut sel, vakuola makanan, cytopige (anus sel), kec: Amoeba Alat pernafasan : dengan seluruh permukaan tubuh Tidak memiliki susunan syaraf Perkembangbiakan : vegetatif/aseksual (pembelahan biner) & generatif (membentuk mikrogamet & makrogamet). Klasifikasi didasarkan pada alat gerak : Rhizopoda protozoa yang bergerak dengan pseudopodia, ex :

Entamoeba hystolitica vaginalis

Flagellata protozoa yang bergerak dengan flagel, ex : Trichomonas Ciliata protozoa yang bergerak dengan cilia, ex : Balantidium coli Sporozoa protozoa yang tidak memiliki alat gerak khusus, ex :

Plasmodium sp ,Toxoplasma

METABOLISME

KATABOLISME
Perombakan Senyawa kompleks Jadi senyawa Sederhana

ANABOLISME
Penyusunan senyawa Sederhana menjadi Senyawa kompleks
Proses fotosintesis

Proses respirasi sel Terjadi dalam mitokondria

Terjadi pada sel tumbuhan

kloroplast

GENETIKA

Sejak kapan manusia mengenal pengetahuan GENETIKA?

Bapak Burik, anaknya tentu Burik

Pepatah yang kita jumpai di seluruh dunia. Secara tak sadar mengekspresikan penyebaran pengetahuan genetika di segala lapisan masyarakat

Varietas tumbuhan dan hewan yang ada saat ini sebagian besar dikembangkan oleh manusia prasejarah dengan bekal pengetahuan genetika berdasarkan pengalaman.

Varietas yang dikembangkan memiliki sifat-sifat khas yang diinginkan : produktivitas tinggi, penghasil daging dengan kuantitas dan kualitas yang tinggi dll

Penemuan prinsip-prinsip genetika

Peletak dasar ilmiah ilmu genetika ; Pdt. Austria, GREGOR MENDEL Penelitian dimulai dari tahun 1857-1865 dengan menggunakan tanaman ERCIS Penemuannya dibukukan Proceedings of the Brunn Society for the Study of Natural Science Wafat 1884 bersama dengan penemuannya 1900 : karya Mendel ditemukan kembali oleh De Vries (Belanda), Correns (Austria) dan Tschermak (Cekoslowakia). Secara terpisah mereka melakukan penelitian dalam bidang genetika. Sejak saat itu ilmu genetika berkembang dengan pesat

Pengertian yang SALAH mengenai kebakaan (gen)

Cacat menurun (bukan) karena kejadian sewaktu hamil : kelahiran anak cacat sering dihubungkan dengan kejadiankejadian saat ibu mengandung
Sifat-sifat yang didapat dari lingkungan (tidak) dapat diturunkan kepada anak : otot besar karena latihan binaragawan tidak dapat diturunkan kepada anaknya tanpa latihan Penuruan sifat kepada anak (bukan) melalui darah: anak mewarisi sifat dari kedua orang tuanya melalui sel-sel kelamin (sel telur dan sel sperma) yang bersatu dan membentuk individu baru Kebanyakan sifat tidak akan berkembang dengan dukungan lingkungannya: hijau rumput ditentukan oleh gen dan juga tergantung dari lingkungannya (sinar matahari, pemberian pupuk). Sifat-sifat yang tidak dipengaruhi oleh lingkungan misalnya: golongan darah.

Pola Penurunan Sifat

Beberapa faktor yang menunjang keberhasilan Mendel

Memilih organisme yang cocok : Ercis

Siklus hidup pendek, jumlah keturunan besar, variasi dalam sifat yang menurun, kepraktisan dan ekonomi

Mencatat hasil penelitiannya Mengulang percobaannya Bekerja dengan satu sifat pada suatu waktu dalam beberapa percobaan

Bagaimana sifat diturunkan?

Meiosis
B b A a b B A a b B a

A b

A Profase 2

a B

Profase 2 B

Profase 1

Metafase 1 A b

Anafase 1 Telofase 1 b A A A b a B A b a B

Metafase 2

Anafase 2

Telofase 2

Beberapa kesimpulan Mendel

Sifat-sifat menurun M dikontrol oleh satu unit tertentu yang akan M P diturunkan dari satu generasi ke generasi meiosis lainnya Masing-masing sifat dihasilkan oleh 2 faktor M hereditas game Jika 2 faktor yang kontras t terdapat dalam satu organisme, maka sifat yang muncul adalah yang dominan Tiap-tiap induk dengan 2 F1 faktor hereditas yang dikandungnya hanya akan mengkontribusikan satu faktor hereditasnya kepada tiap-tiap gamet

M m M m

Mm

Beberapa konsep penting

Genotip : sifat yang tersembunyi

Dilambangkan dengan huruf Huruf Besar : Dominan (T, B, K) Huruf kecil : resesif (t, b,k)

Fenotip : sifat yang tampak : tinggi, pendek, manis, asam, merah, kurus, gemuk Homozigot : dominan (TT), resesif (tt) Heterozigot: Tt Alela : pasangannya, alternatif sesamanya

Tinggi Rendah : Tt Bulat Kisut

: Bb

Hukum Mendel

Hukum Mendel I : Persilangan hukum segregasi Hukum Mendel II : M m x M m Hukum pengelompokan secara bebas MM, Mm, Mm, mm Intermediet
1 MM 2Mm 1mm

Persilangan dengan satu tanda Beda (Monohibrid) dominan

sempurna

P: Tumb. Tinggi domina Pendek

n

x
resesif

Tumb.
tt t, t

gamet

TT T, T

F1

100% Tinggi Tt, Tt, Tt, Tt

Tt x Tt T, t T, t

F1 x F1 gamet
F2 ?

F2
T T TT tinggi Tt tinggi t
Tt x Tt TT 2Tt

Rasio fenotip Rasio genotip

Tt tt tinggi Tt pende k : 3 Tinggi : 1 pendek

: 1 (TT) : 2 (Tt) : 1 (tt)

!!!!!!!!!! TT X tt : 100 % Tt Tt x tt : 50% Tt, 50% tt Tt x Tt : Tt, 2Tt, tt TT/tt: jenis gamet 1 (T/t)

Latihan 1
1. Berapa jumlah jenis gamet yang dihasilkan? TT Tt AAbbCCdd: AABbCcDd: 2. Berapa jumlah jenis genotip yang dihasilkan? AaBb x AaBB AABbCcDd x AAbbCcdd AABBCCDD x aabbCCdd

Dihibrid

game t

(ingat konsep persilangan monohibrid)

Tumbuhan biji bulat, warna Kuning

Tumbuhan biji kisut, warna hijau

BBKK
BK, BK

bbkk bk, bk

F1

BbKk
Biji bulat, warna kuning

BbKk
gamet BK, Bk, bK, bk

BbKk
BK, Bk, bK, bk

F2 ?

Rasio fenotip?, Rasio genotip?, Homozigot dominan? Homozigot resesif? Heterozigot?

Intermediet
P

Tumbuhan berbunga merah

MM

Tumbuhan berbunga putih mm

Gamet F1

? 100% Merah Jambu Mm

F2 ?

Rasio Fenotip? Rasio Genotip ?

Penentuan jenis kelamin

Dalam suatu individu terdapat sepasang kromosom yang bentuknya berbeda menentukan jenis kelamin kromosom seks/ kromosom kelamin Drosophila XY, XX Manusia XY, XX Burung/kupu-kupu ZZ, ZW Lebah haploid, diploid Apakah kromosom Y mutalk menentukan jenis kelamin

Perhatikan pasangan kromosom di bawah ini!

Drosophila

X(mandul) XXY (fertil)

Pada beberapa serangga tertentu XO (tidak mempunyai kromosm Y)

Beberapa Penyakit Menurun yang terpaut pada kromosom Seks

Mengapa penyakit menurun fenotipnya lebih banyak ditemui pada laki-laki? gen untuk penyakit menurun bersifat resesif Contoh

buta warna

normal

P : XbwY F1: Carier XbwX XY

XX normal

XX XY Normal

normal

Golongan Darah

Rhesus Faktor Genotip golongan (Rh) darah A : I AI A atau Rh : resus positif penduduk benua Asia : 99% I AI O Ras kulit putih : 85% B: IBIB atau rh : resus negatif I BI O Ibu rh rh x ayah RhRh O: IOIO Bayi 1 Rhrh (resus positif) A B AB: I I hidup

Bayi 2 dst

Rhrh (resus positif) meninggal

Latihan 2
1.

2.
3. 4. 5. 6. 7.

Laki-laki normal x perempuan carier Laki-laki buta warna x perempuan buta warna laki-laki buta warna x perempuan normal Laki-laki normal x perempuan buta warna Laki-laki golongan darah O dengan wanita golongan darah AB Laki-laki golongan AB dengan perempuan golongan AB Seorang anak dengan golongan AB dilahirkan dari seorang ibu dengan golongan B dan ayah O. ayah si bayi curiga bahwa bayi tersebut bukan anaknya, benarkah dugaan ayah si bayi ?

Materi Genetik

Kromosom : DNA bersama protein DNA: merupakan rantai double heliks yang terdiri atas nukleotidanukleotida Gen : satu atau lebih segmen DNA yang mengkode protein

Dimensi DNA

DNA sel manusia = 3 x 10 9 basa 1 n basa = 3.4 x 10 -10 meter Panjang DNA per sel = 2 meter Jumlah sel per manusia = 75 biljard (10 12 ) Panjang DNA pada manusia = 150 miljard kilometer Jarak bumi-matahari = 150 million kilometer So 500 x to the sun and back is the length of DNA per human

kromosom

sentrom er

Nukleoprotein (protein inti)

protein As. Nukleat polinukleotida Mononukleotida ( basa-gula-fosfat) Nukleosida (basa-gula) Basa nitrgen fosfat

Gula (pentosa) Ribosa, deoksiribosa Pirimidin Sitosin (S/C) Timin (T) Urasil (U)

Purin
Guanin (G) Adenin (A)

amino Mengapa harus Triplet ?

Ada 20 macam asam amino yang disusun dari 4 macam basa nitrogen Purin : Guanin (G), Adenin (A) Pirimidin : Cytosin (C), Timin(T) b. Bila dua kode (doublet)

A A G T C

AA AG AT AC AG GG GT GC AT GT TT CT CA CG CT CC

a. Bila hanya satu kode

AGTC hanya 4
asam amino yang terkode, 16 asam amino tidak kebagian tidak

Hanya 16 asam amino yang terkode, 4 asam amino tidak terkode tidak mungkin

c. bila 3 kode (triplet)

64 asam amino dapat dikode. Dengan demikian satu asam amino ada yang mempunyai beberapa buah kode triplet paling memungkinkan

Replikasi DNA

DNA Transkripsi Transkripsi balik

Pengeditan RNA

RNA

Replikasi RNA

Translasi Protein

replikasi

Antisense Sense : bagian dari gen yang diekspresikan / ditranskripsi Antisense : bagian dari gen yang tidak diekspresikan/ di transkripsikan merupakan lawan dari sense Kodon : mRNA (hasil transkripsi)

sense

Kodogen (sense)

(mRNA)

Latihan 3

Urutan nukleotida di bawah ini merupakan bagian yang mengkode dari genom:5 ....AGGAGGTAGCACCTTTATGGGGAATGCATTAAACA...3 . ATG yang digarisbawahi merupakan kodon inisiasi (kodon start) dari gen pada lokus tersebut. Diantara urutan-urutan nukleotida di bawah, mana yang merupakan hasil transkripsi (mRNA) dari lokus tersebut ?
A. B. C. D. 5 AGGAGGUAGCACCUUUAUGGGGAAUGCAUUAAACA 3 5 UCCUCCAUCGUGGAAAUACCCCUUACGUAAUUUGU 3 5 ACAAAUUACGUAAGGGGUAUUUCCACGAUGGAGGA 3 5 UGUUUAAUGCAUUCCCCCAUAAAGGUGCUACCUCCU 3