Mikrobiologi merupakan bagian ilmu dari biologi, tersusun banyak disiplin ilmu, sedikitnya ada 21 disiplin atau subbidang

mikrobiologi. Mikrobiologi lingkungan merupakan bagian dari mikrobiologi yang mempelajari bentuk, sifat, dan peranan mikrooorganisme di dalam lingkungan (air, tanah, udara). Beberapa bahasan utama dari mikrobiologi lingkungan antara lain mikrobiologi akuatik, mikrobiologi limbah, mikrobiologi tanah, dan mikrobiologi udara. Peranan bahasan tersebut sering dipakai dalam bidang kesehatan, bidang pertanian, bidang peternakan, bidang perikanan, bidang industri, bidang pengairan, dan bidang ruang angkasa. Peranan mikrobe telah dikembangkan sebagai jasad yang secara langsung atau secara tidak langsung mempengaruhi lingkungan; dan sebagai jasad yang secara langsung maupun secara tidak langsung dipengaruhi oleh lingkungan. Penggunaan mikroorganisme sebagai jasad parameter alami (indikator alami) terhadap perubahan di dalam lingkungan telah banyak digunakan, khususnya akibat pencemaran domestik atau pencemaran non domestik. Dalam buku ajar ini, dikemukakan beberapa hal baru antara lain bioremidiasi, biodegradasi, air kemasan, biotransformasi logam, dan bio treatment. Diharapkan, uraian dalam buku ajar ini membantu memecahkan permasalahan lingkungan yang semakin rumit dan pelik dewasa ini. Pemecahan permasalahan lingkungan dituntut dari berbagai bidang ilmu, salah satunya mikrobiologi lingkungan. Penggunaan mikroorganisme untuk mengatasi pencemaran lingkungan dipakai sebagai salah satu alternatif karena bersifat aman, akrab, dan ramah terhadap lingkungan dan manusia. Uraian buku ini mudah-mudahan dapat dipergunakan sebagai salah satu literatur mahasiswa, pendidik, peneliti, dan siapa saja berminat dan atau sedang mempelajari mikrobiologi terapan, khususnya mikrobiologi lingkungan. Pembahasan perbab dalam buku ini adalah : BAB I PENGANTAR MIKROBIOLOGI LINGKUNGAN A. Ruang Lingkup dan Peranan B. Sejarah Mikrobiologi Lingkungan MIKROBIOLOGI AKUATIK A. Lingkungan Mikrobe Akuatik 1. Pengaruh Faktor Abiotik pada Mikroorganisme Akuatik a. Cahaya b. Temperatur c. Tekanan d. Turbiditas e. Konsentrasi Ion Hidrogen dan Potensial Redoks f. Salinitas g. Bahan-bahan Anorganik h. Bahan-bahan Organik i. Gas-gas Terlarut 2. Pengaruh Faktor Biotik pada Mikroorganisme Akuatik a. Kompetisi Nutrien b. Bakteri dan Fungi sebagai Makanan Organisme Lainnya........................................................ c. Bakteri dan Fungi yang Diparasit oleh Mikroorganisme Lainnya d. Vitamin, Enzim, dan Antibiotika B. Kelompok Mikrobe dalam Air 1. Bakteri a. Bakteri pada Perairan Dalam b. Bakteri pada Danau-danau Bergaram

BAB 2

C. D.

E.

F. BAB 3

c. Bakteri Laut 2. Cyanophyta .. a. Cyanophyta pada Perairan Dalam b. Cyanophyta pada Danau Bergaram c. Cyanophyta Laut 3. Fungi a. Fungi pada Perairan dalam b. Fungi pada Danau Bergaram c. Fungi Laut 4. Virus Kehidupan Dalam Air 1. Mikrobe pada Air Jernih 2. Mikrobe pada Air Kotor Distribusi Mikrobe pada Perairan 1. Distribusi pada Mata Air dan Sungai 2. Distribusi pada Danau 3. Distribusi pada Laut 4. Distribusi pada Sedimen Perairan Dalam 5. Distribusi pada Sedimen Laut Peran Mikrobe Air dalam Siklus Unsur dalam Air 1. Produksi Bahan Organik 2. Substrat Mikroorganisme Heterotrofik 3. Pemecahan Bahan Organik 4. Siklus Karbon 5. Siklus Nitrogen 6. Siklus Belerang 7. Siklus Fosfor 8. Siklus Besi dan Mangan Mikrobe dalam Ekosistem Perairan

MIKROBE DAN PENCEMARAN AIR A. Pencemaran terhadap Badan Air 1. Sumber Pencemar Badan Air 2. Dampak Pencemaran terhadap Badan Air 3. Kelompok Kehidupan dalam Air a. Mikrobe yang Menguntungkan b. Mikrobe yang Merugikan B. Penyebaran Mikrobe Lewat Air 1. Jenis Mikrobe Pencemar Air 2. Penyebaran Mikrobe Pencemar Air 3. Mekanisme Spesifik Penyebaran Penyakit Melalui Air a. Water-borne Mechanism b. Water-washed Mechanism c. Water-based Mechanism d. Insect-vector Mechanism 4. Mikrobe Pencemar Air Minum 5. Pentingnya Sanitasi Lingkungan PENYEDIAAN AIR BERSIH DAN AIR MINUM A. Sumber-sumber Air 1. Air Permukaan 2. Air Tanah ..... 3. Air Atmosfir/ Air Meteriologik/ Air Hujan 4. Air Laut B. Kriteria Kualitas Air 1. Persyaratan Bakteriologik

BAB 4

BAB 5

2. Persyaratan Kimia 3. Persyaratan Radioaktifitas 4. Persyaratan Fisik C. Perlindungan Kualitas Air 1. Perlindungan Sumber-sumber dan Sarana Air 2. Perbaikan Kualitas Air dengan Pengolahan Air 3. Perbaikan Kualitas Air dengan Perbaikan Lingkungan D. Kualitas Air Kemasan dan Air Isi Ulang 1. Prospek Produk Air Kemasan dan Air Isi Ulang 2. Produk Air Kemasan dan Air Isi Ulang di Indonesia 3. Ozonisasi Air Mineral 4. Memilih Air Kemasan 5. PROSES PENGOLAHAN AIR A. Pengertian Pengolahan Air 1. Pengolahan Lengkap 2. Pengolahan Sebagian B. Cara-cara Perbaikan Kualitas Air 1. Netralisasi pH 2. Sedimentasi dan Koagulasi (Flokulasi) a. Sedimentasi b. Koagulasi/Flokulasi 3. Aerasi 4. Filtrasi 5. Beberapa Contoh Penggunaan Metode Pengolahan Air Minum secara Tradisional 6. Disinfeksi a. Pengertian dan Tujuan b. Jenis-jenis Disinfeksi c. Aspek-aspek Disinfeksi: Kecepatan dan Keampuhan Disinfektan d. Proses Klorinasi 7. Pelunakan Air Sadah a. Pengertian b. Jenis-jenis Kesadahan c. Kegunaan dan Proses Pelunakan Air Sadah C. Pengolahan Air Buangan 1. Bagan Umum dan Tahap-tahap dalam Proses Pengolahan Air Buangan 2. Pengolahan Air Buangan Rumah Tangga a. Air Buangan Rumah Tangga Kecil (Rumah Tinggal) b. Air Buangan Rumah Tangga Besar 3. Pengolahan Air Buangan Industri Rumah Tangga a. Pra Pengolahan b. Pengolahan Primer c. Pengolahan Sekunder d. Pengolahan Tertier 4. Pengolahan Air Buangan Pemotongan Hewan 5. Pengolahan Air Buangan Tapioka 6. Pengolahan Air Buangan Industri Tahu dan Tempe 7. Pengolahan Air Buangan Industri Kecap ANALISIS MIKROBE AIR A. Analisis Utama

BAB 6

B. C.

D.

E.

1. Total Count .. 2. Penentuan Indeks Pencemar Biologis (IPB) 3. Perhitungan Nilai Jumlah Perkiraan Terdekat (JPT) Analisis Tambahan Quality Assurance Analisis Mikrobe Air 1. Petunjuk Kontrol Kualitas secara Intralaboratorium a. Fasilitas dan Personil b. Instrumentasi dan Peralatan Laboratorium 2. Kontrol Kualitas secara Interlaboratorium Prosedur Pemeriksaan Air secara Mikrobiologik 1. Prosedur Saringan Membran 2. Prosedur Tabung Fermentasi a. Uji Pendugaan b. Uji Penegasan c. Uji Lengkap Pedoman Pengambilan Sampel Air 1. Teknik Pengambilan Sampel Air untuk Pemeriksaan Bakteriologik a. Prosedur Mensterilkan Botol Sampel b. Klasifikasi Teknik Pengambilan Sampel Air c. Alat-alat yang Diperlukan untuk Pengambilan Sampel 2. Pengepakan Alat dan Pengiriman Botol Sampel a. Pengepakan Botol Sampel b. Pengiriman Sampel Air untuk Pemeriksaan Bakteriologik

BAB 7

MIKROBIOLOGI LIMBAH A. Pengantar B. Sampah dan Pengelolaannya 1. Penggolongan Sampah a. Penggolongan Sampah Berdasarkan Sumbernya b. Penggolongan Sampah Berdasarkan Bentuknya c. Penggolongan Sampah Berdasarkan Jenisnya d. Penggolongan Sampah Berdasarkan Sifatnya 2. Kandungan Bahan dalam Sampah 3. Manfaat Pengelolaan Sampah a. Manfaat Sampah b. Pengelolaan Sampah C. Pengolahan Limbah 1. Pengomposan a. Proses Dasar Pengomposan b. Proses Selanjutnya Pengomposan c. Populasi Mikrobe dalam Kompos d. Manfaat Pengomposan D. Pengolahan Limbah Infeksius 1. Pengertian Limbah Rumah Sakit 2. Area Penghasil Limbah Rumah Sakit dan Jenis Sampah yang Dihasilkan 3. Cara Pengolahan Limbah Infeksius a. Pengolahan secara Mekanis b. Pengolahan secara Kimiawi c. Pengolahan secara Biologis PENGOLAHAN BUANGAN SECARA MIKROBIOLOGIS A. Bioremidiasi

BAB 8

B. C. D. E. F. BAB 9

1. Metabolisme, Kometabolisme, dan Bioremidiasi 2. Bioremidiasi Pencemaran Minyak Tanah 3. Bioremidiasi Pencemaran Gas-gas Buangan 4. Bioremidiasi Limbah Sub Permukaan 5. Biotreatment Logam 6. Teknologi Enzim Biodegradasi Penguraian Materi Biogas Biofilter Tangki Septik.....

MIKROBIOLOGI TANAH A. Pengantar B. Kelompok Kehidupan dalam Tanah 1. Bakteri 2. Actinomycetes a. Karakteristik Actinomycetes b. Lingkungan dan Populasi c. Klasifikasi Actinomycetes d. Actinomycetes Penghasil Antibiotika 3. Fungi a. Karakteristik Fungi b. Tipe-tipe Fungi c. Peran Fungsional Fungi 4. Chromista (Algae) a. Peran Alga di dalam Tanah b. Dimanakah Alga dapat Ditemukan? c. Pengaruh Lingkungan terhadap Alga 5. Mikrofauna a. Morfologi dan Klasifikasi b. Populasi dan Pertumbuhan c. Makanan d. Ekologi 6. Mesofauna 7. Makrofauna a. Peran Makrofauna b. Klasifikasi dan Tipe-tipe Makrofauna 8. Mikrobiota (Mycoplasma, Virus, Viroid, dan Prion) C. Perkembangan Beberapa Mikrobe Spesifik dalam Tanah 1. Pembagian Mikrobe Tanah menurut Winogradsky 2. Sistem Penggolongan menurut Sistem Bergeys 3. Sistem Penggolongan Berdasarkan Kegiatan Fisiologis a. Bakteri Ototrof b. Bakteri Heterotrof 4. Cendawan Tanah D. Peranan Mikrobe Tanah dalam Siklus Mineral 1. Peranan Mikrobe dalam Siklus Sulfur 2. Peranan Mikrobe dalam Siklus Fosfor 3. Peranan Mikrobe dalam Siklus Besi dan Mangan a. Oksidasi dan Reduksi Besi b. Oksidasi dan Reduksi Mangan 4. Peranan Mikrobe dalam Siklus Nitrogen

a. Mineralisasi Nitrogen b. Nitrifikasi c. Imobilisasi Nitrogen d. Denitrifikasi dan Reduksi Nitrat e. Fiksasi Nitrogen 5. Peranan Mikrobe dalam Siklus Karbon a. Pemasukan Karbon Organik ke Tanah (Siklus Karbon) b. Mineralisasi dan Dekomposisi Residu (Siklus Karbon) c. Bahan-Bahan Organik Tanah dan Humus (Siklus Karbon) E. Pengaruh Mikrobe Tanah yang Asosiatif dan Antagonistik ...... 1. Populasi Mikrobe dalam Tanah 2. Pengaruh Asosiatif Mikrobe dalam Tanah 3. Pengaruh Antagonistik Mikrobe dalam Tanah F. Deteriorasi dan Korosi Mikrobiologik oleh Mikrobe Tanah .. 1. Kerusakan Mikrobiologik pada Benda-benda Tekstil 2. Kerusakan Mikrobiologik pada Benda-benda Logam BAB 10 MIKROBIOLOGI UDARA A. Kandungan Mikrobe Udara 1. Kandungan Mikrobe dalam Ruangan 2. Kandungan Mikrobe di Luar Ruangan (Atmosfer) B. Sumber Kontaminasi Mikrobe di Udara C. Pengendalian Penyakit yang Terbawa oleh Udara