KODE GENETIK

Hamim Thohari M

Bagaimana Gen Bisa Menentukan sifat Organisme ?

Gen warna bunga

Gen

Mempengaruhi sifat organisme Reaksi kimia dalam sel beragam

menyebabkan

Membawa kode genetik

berupa

contoh

Cara pengkodean urutan basa nukleotida pada DNA

Menentukan urutan asam amino

Berbagai Protein

Enzim dan Hormon

Apa saja asam amino yang dikode gen?

Basa kedua

Keterangan: Basa ketiga

Phe: Fenilalanin Thr: Treonin Leu: Leusin Asn: Asparagin Ser: Serin Lys: Lisin Tyr: Tirosin Cys: Sistein Gly: Glisin Val: Valin Ala: Alanin Asp: Asam aspartat Glu: Asam Glutamat

Trp: Triptofan
Pro: Prolin His: Histidin Gln: Glutamin Arg: Arginin Ile: Isoleusin Met: Metionin

Basa pertama

Tahukah kamu penyakit sickle cell anemia?

sickle cell anemia : disebabkan mutasi pada gen yang mengkode rantai b-globin dan menyebabkan substusi asam amino 1 dari 146 asam amino dalam rantai tersebut
Rantai b-globulin Normal
DNA mRNA Asam amino ---TGA-GGA-CTC -CTC-----ACU-CCU-GAG-GAG--Thr 4 Pro 5 Glu 6 Glu 7

Apa penyebabnya?
Rantai a

Rantai b-globulin Mutan (sickle cell anemia) Besi Heme Rantai b DNA mRNA Asam amino ---TGA-GGA-CAC -CTC-----ACU-CCU-GUG-GAG--Thr 4 Pro 5 Val 6 Glu 7

Hemoglobin

Bagaimana Gambaran Umum Pembentukan Protein?

DNA

NUKLEUS SITOPLASMA

Bagaimana Gambaran Umum Pembentukan Protein?

DNA Transkripsi

RNA NUKLEUS

SITOPLASMA

1. Transkripsi : Proses penyelinan DNA cetakan (template) menjadi satu rantai molekul RNA

Bagaimana Gambaran Umum Pembentukan Protein?

DNA
Transkripsi

RNA
NUKLEUS SITOPLASMA

Translasi

Protein

2. Translasi (penerjemahan): proses sintesis polipeptida dengan urutan asam amino spesifik berdasarkan rantai RNA yang terbentuk saat transkripsi.

Molekul DNA

Bagaimana Gambaran Umum Pembentukan Protein?

Gen 2

Gen 1

Gen 3

DNA
A A A C C G G C A A A A

Transkripsi RNA Translasi Polipeptida Asam amino

U U U G G C C G U U U U

Kodon

Untai DNA akan ditranskrips (DNA sense/ cetakan) DNA Sense

T A C T

C A A A A T T T

A T G A A G T

T A G

Untai komplementer (DNA antisense)

Untai DNA akan ditranskrips (DNA sense/ cetakan)

DNA Sense

T A C T

C A A A A T T T

A T G A A G T
Transkripsi

T A G

Untai komplementer (DNA antisense)

RNA

A U G A A G U U U U A G

Untai DNA akan ditranskrips (DNA sense/ cetakan) DNA Sense

T A C T

C A A A A T T T

A T G A A G T
Transkripsi

T A G

Untai komplementer (DNA antisense)

RNA

A U G A A G U U U U A G
Kodon start Kodon stop

Translasi

Polipeptida

Met

Lys

Phe

Bagaimana Transkripsi terjadi?

Promoter 5 3 Unit transkripsi DNA 3 5

Titik awal (Start point) RNA polymerase 1 Inisiasi

Elongasi

DNA antitemplate Nukleotida RNA RNA polymerase

5 3 DNA Tak terikat Untai RNA

3 5 DNA template/ cetakan/ sense 3

2 Elongasi

3 end

DNA kembali terikat

5 3 3 5 5 Arah transkripsi (downstream) RNA yang baru terbentuk

5 3

5 Untai RNA
3 Terminasi

Untai DNA template

5 3 5 Untai RNA yang lengkap 3

3 5

Promoter
5 3

Unit transkripsi
DNA 3 5

Titik awal (Start point) RNA polymerase

Fig. 17-7a-2

Promoter
5 3

Unit transkripsi
DNA 3 5

Titik awal (Start point) RNA polymerase 1 Inisiasi

5 3
DNA yang Tidak terikat Untai RNA DNA template

3 5

Fig. 17-7a-3

Promoter
5 3

Unit transkripsi
DNA 3 5

Titik awal (Start point) RNA polymerase 1 Inisiasi

5 3
DNA yang Tidak terikat Untai RNA DNA template

3 5

2 Elongasi

DNA yang terikat kembali 5 3 3 5 Untai RNA

3 5

Promoter
5 3

Unit trankripsi 3 5

Start point RNA polymerase

DNA
1

Inisiasi

5 3
DNA yang Tidak terikat Untai RNA DNA template

3 5

2 Elongasi

DNA yang terikat kembali 5 3 3 5 Untai RNA

3 Terminasi

3 5

5 3 5

3 5

Untai RNA yang lengkap

Fig. 17-7b

Elongasi

DNA antitemplate Nukleotida RNA

RNA polymerase

3 end

Arah transkripsi (downstream) DNA template

RNA yang Baru tertentuk

Bagaimana struktur ribosom?

Growing polypeptide tRNA molecules

Exit tunnel

EP A

Large subunit Small subunit

mRNA

(a) Computer model of functioning ribosome

P site (Peptidyl-tRNA binding site) E site (Exit site) mRNA binding site

A site (AminoacyltRNA binding site) E P A Large subunit Small subunit

(b) Schematic model showing binding sites

Amino end

Growing polypeptide Next amino acid to be added to polypeptide chain

mRNA 5

E Codons

tRNA 3

(c) Schematic model with mRNA and tRNA

Bagaimana Translasi terjadi?

Polipeptide

Asam amino

tRNA dengan asam Amino yang melekat Ribosom

tRNA

Antikodon

Kodon

mRNA

Bagaimana RNAt tertentu dapat mengikat asam amino spesifik?

Asam amino
P
Adenosine

Aminoacyl-tRNA synthetase (enzyme)

ATP

Fig. 17-15-2

Asam amino
P P P
Adenosine

Aminoacyl-tRNA synthetase (enzyme)

ATP

P P Pi Pi P

Adenosine

Fig. 17-15-3

Asam amino
P P P
Adenosine

Aminoacyl-tRNA synthetase (enzyme)

ATP

P P Pi Pi P

Adenosine

tRNA Aminoacyl-tRNA synthetase

tRNA

Adenosine

AMP Computer model

Fig. 17-15-4

Amino acid
P P P
Adenosine

Aminoacyl-tRNA synthetase (enzyme)

ATP

P P Pi Pi P

Adenosine

tRNA Aminoacyl-tRNA synthetase

tRNA

Adenosine

AMP Computer model

Aminoacyl-tRNA (charged tRNA)

Bagaimana proses inisiasi translasi?

Large ribosomal subunit

3 UAC5 5 A U G3 Initiator tRNA

P site

GTP

GDP E A 3

mRNA 5
Start codon mRNA binding site

3
Small ribosomal subunit

Translation initiation complex

Fig. 17-18-1

Amino end of polypeptide

E mRNA 5
P A site site

Bagaimana proses elongasi translasi?

Amino end of polypeptide

E mRNA 5
P A site site

GTP

GDP

P A

Fig. 17-18-3

Amino end of polypeptide

E mRNA 5
P A site site

GTP

GDP

P A

E P A

Fig. 17-18-4

Amino end of polypeptide

E mRNA Ribosome ready for next aminoacyl tRNA 5

P A site site

GTP

GDP

E P A

P A

GDP
GTP

E P A

Fig. 17-19-1

Release factor

3 5 Stop codon (UAG, UAA, or UGA)

Bagaimana proses terminasi translasi?

Release factor

Free polypeptide

3 5 Stop codon (UAG, UAA, or UGA) 5

3 2

GTP

2 GDP

Fig. 17-19-3

Release factor

Free polypeptide 5

3 5 Stop codon (UAG, UAA, or UGA) 5

3 2

GTP

2 GDP

Ribosome mRNA Signal peptide

Signalrecognition particle (SRP)

Signal peptide removed

Translocation complex

ER membrane
Protein

CYTOSOL
ER LUMEN
SRP receptor protein