Anda di halaman 1dari 24

STRUKTUR DNA DAN RNA

ENDRINALDI

ASAM NUKLEAT

Asam nukleat polimer yang dibentuk oleh mononukleotida Fungsi menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsi informasi genetika

NUKLEOSIDA
Merupakan seny. N-glikosida dr bs purin dan pirimidin yg dihubungkan oleh ikt glikosida antara atom karbon 1 dr pentosa dg atom nitrogen 1 (N-1) dr pirimidin atau nitrogen 9 (N -9) dr purin

BASA PURIN DAN PIRIMIDIN

NUKLEOSIDA
NH2 N N
5

(Adenin)

HOCH2
4 3

Basa : Adenin Guanin Sitosin Urasil

Adenosin Guanosin Sitidin Uridin

O
1 2

OH

OH

diganti dg H (deoksi) Adenin 2-deoksiadenosin Guanin 2-deoksiguanosin Sitosin 2-deoksisitidin Timin 2-deoksitimidin

NUKLEOTIDA
Nukleotida (nukleosida fosfat) adl ester asam fosfat dr nukleosida merupakan nukleosida yg terfosforilasi. Berperan serta dlm sejumlah besar proses biokimiawi peran yg paling dikenal adl sbg prekursor monomer RNA dan DNA
O HO P O NH2

N
N
5

N N

Basa (adenin)

OCH2
4 3

O
1 2

OH

OH

AMP

H3C

Timin

Subunit Nukleotida dari DNA

Subunit Nukleotida dari RNA

POLINUKLEOTIDA
Polimer

mononukleotida Asam deoksiribonukleat (DNA) Asam ribonuklaet (RNA)

DNA
DNA merupakan struktur yang dibangun oleh KH pentosa (deoksiribosa), fosfat dan suatu basa dalam bentuk polimer dan berkombinasi membentuk helix ganda. Blok pembangun DNA adalah 5-carbon sugar deoxyribose yang saling dihubungkan oleh ikatan fosfodiester sehingga terbentuk dua untai ganda dengan tulang punggungnya dibentuk dari ikatan KH-fosfat pada bagian luar helix.

STRUKTUR DNA

Kedua strand dari helix saling merupakan komplemeternya masing-masing.


Setiap pentosa-nya juga terikat pada salah satu dari keempat basa yang terdiri dari adenine (A), guanine (G), cytosine (C) atau thymine (T).

Gula deoksiribosa dan fosfat yg menyusun DNA terletak dibgn luar molekul, sdgkan bs purin dan pirimidin tletak di sebelah dlm untaian (heliks)

Strand yang berlawanan diikat oleh suatu ikatan non kovalen diantara dua basa yang selalu berpasangan G dengan C oleh tiga ikatan hidrogen dan A dipasangkan dengan T oleh dua ikatan hidrogen. Terdapat dua posisi dari pentosa yang terikat pada gugus fosfat yaitu pada ujung 5-P dan ujung 3-OH.

Menurut James Watson & Francis Crick


Ukuran jarak antara pasangan basa 0,34 nm (3,4 oA) Setiap putaran untaian td 10 ps basa dan jarak satu putar heliks 3,4 nm Diameter untaian DNA 2,0 nm

Bentuk Fisik Struktur DNA


Bdsrkan jml ps basa bbrp tipe (bentuk)
Tipe A B C D E Z Pasangan bs/putaran 11 10 9,33 8 7,5 12 Diameter heliks (nm) 2,3 1,9 1,9 1,8

Untaian (strand) DNA td dua lekukan (groove)

lekukan besar (major groove) lekukan kecil (minor groove)


lekukan pada tipe B lebih mudah mikat protein drpd tipe A ( lebih dalam)

DNA (Gen) terdiri dari tiga struktur penting yaitu :

Bagian yang disebut gene regulatory segment mngdung srtuktur yang terlibat pada proses inisiasi dan pengaturan proses transkripsi. Exon bagian yang mengandung codon untuk ditranslasikan oleh mRNA menjadi protein. Intron bagian struktur yang tidak mengandung codon (intervening sequence).

KROMOSOM

KROMATIN

NUKLEOSOM

RNA
Spt pd DNA molekul RNA dibentuk oleh nukleotida yang saling dihubungkan menjadi satu rantai KH pada DNA deoksiribosa. Sedangkan RNA KH-nya adalah ribosa. Basa timin diganti oleh urasil pada RNA

STRUKTUR RNA
DNA terdiri dari dua untai yang

saling komplementer membentuk helix ganda, ttp RNA hanya terdiri dari satu untai tunggal, akan tetapi dapat melipat lipat dirinya dalam suatu aturan tertentu.

Basa pada RNA sama spt DNA, kecuali timin diganti oleh urasil.

3 macam RNA penting


mRNA (messenger-RNA) yg melakukan tranfer

informasi mengenai deretan asam amino pada protein yang akan dibangun sesuai dengan urutan kode pada DNA asal. rRNA (ribosomal-RNA) yang membangun ribosom bersama dengan protein mesin biologis pembuat protein
tRNA (transfer-RNA) yang mentransfer asam amino ke ribosom untuk sintesis protein.

FAKTOR YANG MEMPENGARUHI KESTABILAN DNA Kestabilan struktur DNA Tumpukan (stacking) basa nukleotida pd rantai DNA interaksi hidrofobik antara pasangan basa nukleotida Ikatan hidrogen antara basa-basa yg berpasangan pd rantai ganda terutama pada ps antara C dan G makin >> ps C-G, makin stabil struktur

Denaturasi DNA
Pecahnya ikatan hidrogen antara ps basa pada rantai ganda rantai tunggal (single Stranded)

Penyebab Denaturasi
Panas (termal) ikt hidrogen stacking struktur DNA tdk teratur (denaturasi) dapat diamati melalui tjd serapan cahaya

Zat Kimia Urea CO(NH2)2 Formamid COHNH2 Merusak ikt hidrogen denaturasi Pengaruh alkali (basa) deprotonasi pd ggs N dr G dan C perubahan struktur dari btk keto ke btk enolat terputusnya ikt H denaturasi

Tingkat denaturasi DNA tgantung pd tinggi suhu


pubahan tk denaturasi DNA suhu btingkat absorban 260 makin > pgeseran str, mk makin > nilai absorban cahaya efek hiperkromik denaturasi lengkap DNA suhu > 90oC

Renaturasi
Proses pbentukan kembali str untai ganda dr keadaan terdenaturasi