Anda di halaman 1dari 4

Soal Pretes Biologi Sel Molekuler

A. P1 1. Bagaimana prinsip dari isolasi DNA? Prinsip isolasi DNA adalah memecahkan sel yang dilanjutkan dengan memisahkan DNA dari komponen-komponen lain, seperti protein, RNAS, dan mengendapkan DNA. 2. Sebutkan komposisi dari RBCLB pH 7,4! 1550 mM NH4Cl 8,gr 10 mM KCO3 1,0gr 10 mM EDTA 0,37 gr Aquades ad 100 ml 3. Sebutkan 3 lapisan yang terbentuk setelah disentrifugasi! Lapisan atas, transparan mengandung DNA Lapisan tengah yang berwarna seperti susu, mengandung protein Lapisan bawah transparan 4. Apa fungsi dari fenol dan kloroform? Fenol dan kloroform untuk menghilangkan pengotor DNA 5. Apa yang ditambahkan untuk melisiskan sel darah merah? Buffer lisis (RBCLB)

B. P2A 1. Apa maksud dari A260nm=1? A260nm=1 setara dengan 50g/ml DNA untai ganda 2. Apa rumus untuk menghitung konsentrasi DNA? Konsentrasi DNA (g/ml)= 3. 1A 260 DNA untai ganda setara sama dengan konsentrasi berapa? 50g/ml 4. Bagaimana prinsip dari senyawa dapat diukur dengan spektrofotometri UV? Adanya ikatan rangkap terkonjugasi 5. Apa yang dilakukan jika rasionya kurang dari 1,8?

Dimurnikan kembali dengan melakukan ekstraksi kloroform-isoamilalkohol (24:1) dan dilanjutkan dengan presipitasi menggunakan Na Asetat 3M pH 4,8 dan etanol abolut (2 kali volume)

C. P2B 1. Sebutkan komponen utama dari PCR? a. DNA cetakan, target DNA yang akan diamplifikasi b. Primer (15-25 basa), untuk mengawali sintesis DNA c. dNTP, meliputi dCTP, dTTP, dGTP d. polymerase DNA yang merupakan enzim yang berfungsi sebagai katalis dalam sintesi DNA 2. Jelaskan suhu-suhu pada 3 step pada proses PCR? 1. Denaturasi DNA pada suhu 950 2. Annealing (penempelan primer) pada suhu 550 3. Sintesis DNA pada suhu 720 3. Apa yang dimaksud dengan polimorfik? Gen-gen yang mengkode GSTM 4. Sebutkan 2 manfaat dari polimorfisme! - mempelajari popoulasi dan migrasi antar populasi hewan - mengetahui komposisi makanan 5. Apa yang dimaksud dengan reverse dan forward? Forward= primer yang beradaa sebelum daerah target Reverse= primer yang berada setelah daerah target

D. P3 1. Apa yang dimaksud dengan elektroforesis gel agarosa? Metode untuk memisahkan dan memvisualisasikan fragmen DNA yang dihasilkan dari digesti DNA. 2. Apa fungsi dari etidium bromide? untuk mendeteksi adanya DNA

3. Sebutkan factor yang mempengaruhi kecepatan migrasi DNA? Ukuran (panjang) DNA, konformasi DNA, konsentrasi agarosa, dan besaran tegangan yang digunakan. 4. Apa fungsi dari DNA marker? Untuk mendeteksi DNA yang sudah diketahui ukurannya 5. Apa fungsi dari buffer sampel? Untuk sebagai tanda yang menunjukan sudah sampai mana elektroforesis

E. P4 1. Sebutkan bagian-bagian dari mikroskop! Lensa okuler, lensa objektif, stage, glass objek, coverslip, diafragma, base, 2. Jelaskan yang dimaksud dengan nilai apetura? Ukuran daya pisah suatu lensa objektif yang akan menentukan daya pisah spesimen 3. Apa fungsi dari Xylol? Untuk membersihkan lensa objektif yang terkena minyak imersi 4. Organ tumbuhan yang bagaimana yang dipilih pada praktikun ini? Yang bersifat meristematik 5. Sebutkan proses-proses terjadinya mitosis! Profase, metaphase, anaphase, telofase

F. P5 1. Apa kepanjangan dari NCBI? National Centre for Biotechnology Information 2. Sebut dan jelaskan program-program BLAST! 1. Blastn :membandingkan suatu sekuen nukletida yang kita miliki dengan database sekuen nukleotida 2. Blastp : membandingkan suatu sekuen asam amino yang kita miliki dengan database sekuen protein 3. Blastx : membandingkan produk translasi konsep 6-frame sebuah sekuen

nukleotida yang kita miliki dengan database sekuen nukleotida

4. Tblastn

: membandingkan suatu sekuen protein yang kita miliki dengan database

sekuen nukleotida yang secara dinamis ditranslasi pada semua pembacaan 6 frame 5. Tblastx : membandingkan suatu translasi dari 6 frame dari nukleotida 3. Apa yang dimaksud dengan homologi? Kemiripan urutan (sekuen) basa DNA 4. Jelaskan perbedaan dari Blastn dan Blastp? Blastn : mengidentifikasi suatu sekuen nukleotida meragukan yang kita miliki dengan database nukleotida. Blastp : mencari protein homolog dari protein yang kita miliki 5. Sebutkan tujuan dari praktikum ini!

G. P6 1. Sebutkan prosedur dari western blot! Penyiapan sampel protein, elektroforesis gel, transfer, blocking, deteksi 2. Apa yang ditambahkan untuk bloking? Bovine Serum Albumin 3. System deteksi apa yang digunakan pada praktikum ini? Chemiluminescene 4. Variabel apa yang dioptimasi pada western blot? 1. Jumlah list protein yang dipisahkan dengan elektroforesis, dengan

mempertimbangkan jumlah dari protein target yang terkandung didalam lisat tersebut 2. Pengenceran yang sesuai terhadap antibody primer, berdasarkan pengalaman empirik 5. Apa kepanjangan dari SDS-PAGE? Sodium deosesil sulfat polyacrylamide gel electrophoresis