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a comprensión de la relevancia y de la compleja no-

L
específicos o la utilización de diferentes compuestos como
menclatura de los centenares de bacterias «importante» fuente de carbono para poder proliferar; presencia de protea-
puede constituir un considerable desafío. Sin embargo, sas, lipasas o nucleasas específicas; o presencia de enzimas
la clave de esta tarea depende de la organización sistemática del hidrolíticas específicas como lipasas y nucleasas). El empleo
desconcertante conjunto de diferentes microorganismos en de ciertas pruebas bioquímicas permite identificar con un
unas relaciones lógicas (es decir, de una clasificación taxonó- alto grado de precisión la mayoría de las cepas clínicamente
mica de los microorganismos). significativas. Además, estos métodos se han empleado para
subdividir los grupos de microorganismos más allá del nivel
de especie, principalmente con fines epidemiológicos (p. ej.,
Clasificación fenotípica para determinar si un grupo de microorganismos pertene-
cientes al mismo género y especie comparten un origen co-
Las morfologías microscópica y macroscópica de las mún o bien proceden de fuentes distintas). Estas técnicas son
bacterias fueron las primeras características utilizadas para conocidas como determinación del biotipo o biotipado.
identificarlas y aún constituyen unos elementos fundamen- Dado que numerosas bacterias poseen antígenos caracte-
tales en la mayoría de los algoritmos de identificación utiliza- rísticos, los anticuerpos utilizados para su detección consti-
dos actualmente (cuadro 2-1). Por ejemplo, las bacterias se tuyen una potente herramienta diagnóstica (serotipado).
pueden clasificar según su capacidad de retención de la tin- Estas pruebas serológicas se realizan con el fin de identificar
ción de Gram (microorganismos grampositivos y gramnega- microorganismos que son inertes frente a las pruebas bio-
tivos) y por la forma de cada célula (cocos, bacilos, espirilos). químicas (p. ej., Francisella, el microorganismo causante de
Además, el aspecto macroscópico de las colonias bacteria- la tularemia), cuyo cultivo es difícil o imposible (p. ej., Trepo-
nas (p. ej., las propiedades hemolíticas en un medio de agar nema pallidum, el microorganismo responsable de la sífilis),
sangre, la pigmentación, el tamaño y la forma de las colo- asociados a síndromes específicos (p. ej., el serotipo 0157
nias y el olor de las colonias) también se emplea en la identifi- de Escherichia coli, responsable de la colitis hemorrágica) o
cación de las bacterias. Streptococcus pyogenes es una bacteria deben identificarse de forma rápida (p. ej., S. pyogenes, res-
grampositiva que forma largas cadenas de cocos y aparece ponsable de la faringitis estreptocócica). Por otra parte, la
en forma de pequeñas colonias hemolíticas de color blanco en determinación de los serotipos se emplea también con fines
las placas de agar sangre. Las características morfológicas se epidemiológicos.
utilizan para realizar una identificación provisional del mi- Otros ejemplos de los métodos fenotípicos utilizados en la
croorganismo y poder seleccionar otros métodos de clasifica- clasificación de las bacterias son el estudio de los patrones de
ción con un mayor poder de discriminación, ya que muchos sensibilidad del microorganismo frente a distintos antibióti-
microorganismos pueden presentar un aspecto muy similar cos (antibiograma) y el lisotipado (susceptibilidad a deter-
en el examen macro y microscópico. minados virus que infectan a las bacterias). Las técnicas
Los métodos más frecuentes y que todavía se utilizan en la de susceptibilidad a los antibióticos tienen un menor poder de
identificación de las bacterias consisten en determinar la pre- discriminación. El lisotipado es una técnica engorrosa, por lo
sencia o la ausencia de unos marcadores bioquímicos especí- que actualmente ha sido sustituida por técnicas genéticas
ficos (p. ej., capacidad de fermentación de hidratos de carbono con mayor sensibilidad.

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CUADRO 2-1. Clasificación fenotípica de las bacterias CUADRO 2-3. Clasificación genotípica de las bacterias

Morfología microscópica Serotipo Relación guanina citosina


Morfología macroscópica Patrones de antibiograma
Biotipo Fagotipo Análisis de la secuencia del ácido nucleico
Análisis de plásmidos
Ribotipifícación
Fragmento de ADN cromosómico
CUADRO 2-2. Clasificación analítica de las bacterias

Análisis de los ácidos grasos de la pared celular


Análisis de los lípidos celulares totales identificación directa de microorganismos en muestras clínicas,
Análisis de las proteínas celulares totales lo cual evita la necesidad de cultivarlos. La hibridización del
Electroforesis enzimática tipo multifocus locus
ADN también constituye una valiosa herramienta diagnósti-
ca para la rápida detección e identificación de microorganismos
de crecimiento lento, como micobacterias y hongos.
Clasificación analítica Una ampliación del método de hibridación es el llamado
análisis de secuencias de ácidos nucleicos. Se utilizan
Las características analíticas de las bacterias se han utili- sondas para localizar unas secuencias específicas en los ácidos
zado también para clasificarlas en géneros, especies y subes- nucleicos que son características de un género, especie o
pecies (cuadro 2-2). El patrón cromatográfico de los ácidos subespecie determinado. Estas secuencias se amplifican hasta
micólicos de la pared celular es característico de un gran producir millones de copias, tras lo cual se secuencia el ma-
número de especies de micobacterias, por lo que durante terial genético amplificado con el propósito de definir la identi-
muchos años se ha utilizado en la identificación de las espe- dad exacta de la cepa. La aplicación más frecuente de este
cies aisladas con mayor frecuencia. El análisis de los lípidos método es el análisis de secuencias de ADN ribosómico, pues-
presentes en la totalidad de la célula también es un método to que existen tanto secuencias de ADN muy conservadas (es-
útil para la descripción de numerosas especies bacterianas y pecíficas de familia o de género) como secuencias muy variables
de levaduras. Otras técnicas empleadas para la caracteriza- (específicas de especie o de subespecie). Esta técnica también
ción, fundamentalmente a nivel de subespecie y con fines epi- se ha empleado para definir la relación evolutiva existente en-
demiológicos, son el análisis de las proteínas celulares (aná- tre distintos microorganismos, así como para identificar mi-
lisis proteómico mediante espectroscopia de masas) y las croorganismos de crecimiento difícil o imposible. La mayor
enzimas celulares (electroforesis enzimática tipo multi- parte de los cambios recientes introducidos en la nomencla-
loci). Sin embargo, y pese a que estos métodos analíticos son tura taxonómica se han relacionado con la aplicación del
precisos y reproducibles, requieren un gran trabajo y una análisis de secuencias de ácidos nucleicos. Una ampliación de
instrumentación muy cara. Por tal motivo, estos análisis se este método es la secuenciación del genoma completo de una
emplean principalmente en los laboratorios de referencia. bacteria, la cual es ya posible desde el punto de vista técnico,
aunque aún no se haya utilizado con fines diagnósticos.
Otros métodos utilizados fundamentalmente para clasifi-
Clasificación genotípica car los microorganismos a nivel de subespecie y con fines epi-
demiológicos son el análisis de plásmidos, el ribotipado y
El método más preciso de clasificación de las bacterias es el el análisis de fragmentos del ADN cromosómico. A lo
análisis de su material genético (cuadro 2-3). Aunque inicial- largo de los últimos años se han simplificado los aspectos téc-
mente los microorganismos se clasificaron según la relación nicos de todos estos métodos hasta lograr que la mayor parte
guanina/citosina, este procedimiento se ha abandonado de los laboratorios clínicos utilicen diferentes variaciones en
en gran medida a favor de otros métodos con mayor poder su práctica habitual.
de discriminación. Aunque la hibridación del ADN (ácido En los cuadros 2-4 a 2-8 se ofrece un esquema de clasifica-
desoxirribonucleico) se utilizó en un principio para esta- ción de gran utilidad para organizar las numerosas bacterias
blecer la relación existente entre las cepas bacterianas (es de- que se describirán en los capítulos posteriores del texto. Sin
cir, para determinar si dos cepas pertenecían al mismo género embargo, es preciso destacar que la lista de microorganismos
o especie), más recientemente esta técnica se ha empleado no es exhaustiva. De este modo, se han omitido muchos gé-
para conseguir una rápida identificación de los microorga- neros que suelen aislarse en las muestras clínicas con el fin de
nismos mediante el uso de sondas moleculares. Se extrae simplificar la presentación. Los microorganismos incluidos
el ADN del microorganismo a identificar y se expone a unas en estos cuadros de resumen son aquellos que se estudiarán en
sondas moleculares específicas de unas especies concretas. La los capítulos posteriores. Asimismo, debe tenerse en cuenta
fijación de la sonda al ADN permite confirmar la identidad del que la organización exacta de las bacterias en familias, gé-
microorganismo. Esta técnica también se ha utilizado para la neros y especies continúa cambiando.

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CLASIFICACIÓN DE LAS BACTERIAS CAPÍTULO 2

CUADRO 2-4. Cocos grampositivos aerobios CUADRO 2-6. Cocos, cocobacilos y bacilos gramnegativos aerobios

Cocos catalasa-positivos Cocos catalasa-negativos Cocos y cocobacilos Helicobacteriaceae


Micrococcus Aerococcus Branhamella Helicobacter
Staphylococcus Alloiococcus Moraxella Pseudomonadaceae
Enterococcus Neisseria Pseudomonas
Lactococcus Pasteurellaceae
Leuconostoc Bacilos Actinobacillus
Pediococcus Enterobacteriaceae Haemophilus
Streptococcus Citrobacter Pasteurella
Enterobacter
Escheríchia Otros géneros
Ktebsiella Acinetobacter
Morganella Bartonella
Plesiomonas Bordetella
Proteus Brucella
Salmonella Burkholdería
CUADRO 2-5. Bacilos grampositivos aerobios
Serratia Capnocytophaga
Actinomicetos con ácidos micólicos en la pared celular Shigella Cardiobacteríum
Corynebacterium Yersinia Eikenella
Gordonia Vibrionaceae Francisella
Nocardia Vibrio Kingella
Rhodococcus Aeromonadaceae Legionella
Tsukamurella Aeromonas Stenotrophomonas
Mycobacteríum Campylobacteriaceae Streptobacillus
Arcobacter
Campylobacter
Actinomicetos sin ácidos micólicos en la pared celular
Actinomadura
Dermatophüus
Nocardiopsis
Oerskovia
Rothia
Streptomyces CUADRO 2-7. Bacterias grampositivas y gramnegativas anaerobias
Actinomicetos termofílicos
Saccharomonospora Cocos grampositivos Bacilos grampositivos
Saccharopolyspora Anaerococcus Actinomyces
Thermoactinomyces Finegoldia Bifidobacteríum
Tropheryma Micromonas Clostrídium
Peptostreptococcus Eubacterium
Otros bacilos grampositivos Schleiferella Lactobacillus
Arcanobacteríum Mobiluncus
Bacillus Cocos gramnegativos Propionibacterium
Brevibacterium Veillonella
Erysipetothrix Bacilos gramnegativos
Gardnerella Bacte mides
Listeria Fusobacterium
Turícelía Porphyromonas
Prevotella

CUADRO 2-8. Bacterias diversas con importancia médica

Mycoplasmataceae Chlamydiaceae
Mycoplasma Chlamydia
Urea plasma Chlamydophila
Spirochaetaceae Otras bacterias
Borrelia Coxiella
Treponema Ehrlichia
Leptospiraceae Oríentia
Leptospira Rickettsia

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CAPÍTULO 2 CLASIFICACIÓN DE LAS BACTERIAS

PREGUNTAS Bibliografía
1. Cite tres ejemplos de las características fenotípicas, Balows A et al, editors: The prokaryotes, ed 2, New York, 1992,
analíticas y genotípicas utilizadas en la clasificación de Springer-Verlag.
las bacterias.
Murray PR et al, editors: Manual of clinícal micwbiology, ed 8,
2. Describa la morfología microscópica (p. ej., característi-
Washington, 2003, American Society for Microbiology.
cas de la tinción de Gram, forma del microorganismo) de las
siguientes bacterias: Staphylococcus, Escherichia, Neis- Murray PR, Shea Y: Pocket guide to clinícal microbiology, ed 3,
sería, Clostrídium, Enterococcus y Pseudomonas. Washington, 2004, American Society for Microbiology.
3. ¿Cuál de los siguientes microorganismos posee ácidos
micólicos en su pared celular: Staphylococcus, Nocardia,
Mycobacteríum o Klebsiella?