ENZYME

TIANING NI WAYAN BIOKIMIA FK UNUD

DEFINISI
1. ENZYME (Yunani): En and Zyme Didalam ragi YANG BERADA DI DLM SEL 2. PROTEIN YG BERSIFAT KATALIS MAMPU MENGAKTIFKAN SENYAWA LAIN SECARA SPESIFIK

 PROTEIN
Semua ciri dan sifat protein berlaku bagi enzim

KATALIS
Kemampuan mengubah suatu senyawa

AKTIF Senyawa yg dikenali diaktifkan sehingga mengalami perubahan kimia SPESIFIK Hanya bekerja untuk satu reaksi saja

ENZIM DAN KATALIS BUKAN ENZIM

ENZIM KATALIS BUKAN ENZIM Ion organik/logam Reaktor kimia Tinggi Asam/Basa Rendahsedang

Sifat kimia
Tempat kerja Suhu Keasaman Laju reaksi

Protein
Sel/lingkungan biotik Rendah~sel ~Netral Sangat tinggi

Spesifisitas

Sangat spesifik

Kurang spesifik

SPESIFISITAS ENZIM
- S. ISOMER: L-asam amino, asam lemak cis-trans - S. IKATAN KIMIA: memutus ikatan kovalen (hidrolase) memutus ikatan peptida (peptidase) - S. GUGUS: hanya bekerja untuk substrat yang mempunyai gugus tertentu (trombin: memecah ikatan peptida dg residu arginin-glisin)

NOMENKLATUR DAN KLASIFIKASI ENZIM

TAK BERATURAN: PTYALIN, TRIPSIN DITAMBAH ASE DIBELAKANG SUBSTRAT PROTEASE = ENZIM PEMECAH PROTEIN SISTEM INTERNASIONAL I.U.B.S

(International Union of Biochemistry System)

KETENTUAN IUBS
1. 2. ENZIM TERDIRI DARI 6 KELAS UTAMA. NAMA ENZIM TERDIRI DARI 2 BAGIAN, - I MENYATAKAN SUBSTRATNYA, - II DIAKHIRI ASE MENYATAKAN JENIS REAKSI YG DIKATALISANYA : LAKTAT DEHYDROGENASE. 3. ADA KETERANGAN TAMBAHAN (DALAM KURUNG) 4. SETIAP ENZIM PUNYA NOMER KODE SENDIRI2. E.C (ENZYME CODE) YG TERDIRI DARI 4 DIGIT

 Berdasarkan Substrat: laktase, maltase, nukleotidase, proteinase Berdasarkan Jenis Ikatan: peptidase, esterase, fosfatase Berdasarkan Jenis Reaksi: oksidase, dehidrogenase, transferase, hidrolase

6 klas utama enzim :

Klas
1 2 3 4 5 6

Enzim

Reaksi yg dikatalisis

Oksidoreduktase Reaksi oksidasi & reduksi Transferase Transfer atom/gugus Hidrolase Liase Isomerase Ligase Reaksi hidrolisis Melepas gugus pd substrat Reaksi isomerasi Reaksi sintesis

DISTRIBUSI ENZIM DLM SEL

Komponen enzim rantai respirasioksidasi fosforilasi: membran mitokondria sebelah dalam. Enzim Siklus Krebs: matrix mitokondria Enzim pencernaan terdapat dlm lisosom. Enzim untuk sintesis protein tdp di ribosom

KOENZIM, APOENZIM, PROENZIM

Koenzim: molekul organik non protein spesifik (tahan panas dan dpt didialisa) yg membantu sifat katalisa enzim (= kofaktor = ggs prosthetik)

Apoenzim : bagian protein enzim Apoenzim + koenzim = holoenzim Proenzim : enzim dlm bentuk belum aktif (=zimogen)

KOENZIM
Sebagian besar mengandung vitamin yg tergolong kompleks Vitamin B
Vitamin B1 (tiamin) B2 (riboflavin) Niasin (Nikotinamid) Asam panthotenat Koenzim TPP FAD/FMN NAD/NADP KoA Enzim dekarkoksilase Dehidrogenase aerob Dehidrogenase anaerob transasilase

B6 (piridoksin) Biotin
Asam folat B12

Pyridoksal fosfat Biotin

a.Tetrahidrofolat Kobamide koE

transaminase karboksilase
Transformilase, transmetilase Transmetilase, Isomerase

KOENZIM YG TIDAK TERGOLONG DLM VIT. B KOMPLEK Vitamin C hidroksilase Vitamin K karboksilase KOENZIM BUKAN VITAMIN: Koenzim Q (Ubikinon) transfer elektron dan sistesis ATP di dalam mitokondria Hem katalase, peroksidase ATP Logam (Ca, Mg, Cu, Co, Mn, Zn, K, Na, dll)

MEKANISME KERJA ENZIM

1. IKATAN E + S TERJADI PADA ACTIVE SITE/TAPAK AKTIF/CATALYTIC SITE 2. EMIL FISCHER LOCK AND KEY THEORY - Kaku
3. KOSHLAND - lebih fleksibel

Lock and Key Theory

Each enzyme is specific for one and ONLY one substrate (one lock - one key) active site: part of the enzyme that fits with the substrate Note that the active site has a specific fit for this particular substrate and no other. This theory has some weaknesses, but it explains many basic things about enzyme function.

MODEL KOSHLAND

FAKTOR-2 YG MEMPENGARUHI KECEPATAN KATALISA ENZIM 1. 2. 3. 4. 5. KONSENTRASI SUBSTRAT SUHU pH KONSENTRASI ENZIM INHIBISI

1. Konsentrasi substrat
Penambahan [S] akan meningkatkan V s/d Vmax. Konstante Michaelis

Hk. Michaelis Menten

Vi= Vmax.[S] Km+[S]

2. Suhu
Suhu optimal: Bekerja optimal Suhu 0o C: Enzim tak aktif Di atas 70o C: Enzim terdenaturasi 100o C (Taq polimerase) dalam PCR Praktikum enzim, harus memperhatikan suhu ruangan.

3. pH
Grafik pH sama bentuknya dgn grafik suhu. pH optimal umumnya sekitar 6,8 Juga tergantung dari lokasinya. Di lambung pH optimal 2-3. Akan dikerjakan dalam praktikum

4. Konsentrasi enzim
Konsentrasi enzim = aktivitas katalitiknya Enzim mengurangi jumlah substrat, dan menambah konsentrasi produk E + S ES E + P
Berarti S P, dipengaruhi oleh jumlah E

Laju reaksi diukur dg pengukuran [S] atau kenaikan [P] dalam dua waktu yang berbeda

5. Inhibisi
Bahan penghambat kerja enzim (Reversible dan Irreversible) Inhibisi Reversible: - Dpt hilang dg penambahan substrat (Kompetitif dan non kompetitif) - Kompetitif tjd pada sisi aktif - Non kompetitif tjd di luar sisi aktif

Kompetitif Inhibitor (KI): Terjadi pd sisi aktif

K.I. disebut juga substrat analog inhibitor Berkompetisi dg substrat pd sisi aktif dari enzim 5 syarat kompetisi:
- harus jelas apa yang dipersaingkan - ruang dan waktu yang sama - harus ada persamaan - harus ada perbedaan - asas kekerapan/frekuensi reaksi

Inhibisi reversible
Pengaruh thd V reaksi Contoh:
Penghambatan suksinat dehidrogenase oleh asam malonat Penghambatan PABA oleh Sulfa Penghambatan asam folat oleh Metotreksat (MTX)

Inhibisi
Irreversible Inhibitor:
- Terjadi ikatan kovalen antara enzim dan inhibitor - Enzim tidak dapat mengikat dan mengolah substrat Disebut juga racun enzim misalnya HCN racun pd sitokrom oksidase

Non Kompetitip Inhibitor

Tidak ada kompetisi Tidak pada sisi aktif Bisa dikembalikan dgn menambah banyak substrat Berpengaruh thd V reaksi

ENZIM SERUM
DEFINISI: Enzim yang terdapat di dalam serum terdiri dari: ENZIM SERUM FUNGSIONAL ENZIM SERUM NON FUNGSIONAL: DAPAT MEMBANTU KITA DALAM MENEGAKKAN DIAGNOSA.

NON FUNGSIONAL ENZIM

ENZIM PANKREAS (LIPASE, AMILASE, TRIPSIN.) ENZIM LIVER (SGPT,SGOT,ALK.POSFATSE) ENZIM PROSTAT (ACID FOSFATASE) ENZIM JANTUNG (CK,LDH,SGOT, SGPT) CHOLIN ESTERASE : MENINGKAT PD KERACUNAN POSFAT INORGANIK)

ISOZIM
BAHAN YG PUNYA SIFAT FISIK DAN KIMIA BERBEDA TAPI SIFAT KATALITIK SAMA. CK :3 ISOZIM (MM,MB,BB) LDH : 5 ISOZIM( I1,I2,I3,I4, I5), MASING2 BERBEDA DALAM JARINGAN HATI DAN JANTUNG

 TEORI DNA REKOMBINAN: BANYAK MENGGUNAKAN ENZIM ENZIM ENDONUKLEASE RESTRICTION (RFLP) DPT MENEGAKKAN PENYAKIT GENETIK JUGA KASUS-KASUS PATERNALITY