(extrado de 1995, an nternational ystem for uman ytogenetic omenclature)
Cariotipo: arreglo sistematizado de los cromosomas. Se estudia usualmente en la metafase celular.
Nmero y morfologa de los cromosomas
Tcnicas sin bandeo:
Cuando se construye el cariotipo los autosomas se numeran del 1 al 22 en orden decreciente de tamao y los cromosomas sexuales se llaman X e Y. Los smbolos p y q designan el brazo corto y largo de cada cromosoma. Cuando los cromosomas se tien mediante tcnicas que no producen bandas, se pueden ordenar en 7 grupos claramente diferentes por su tamao y la posicin del centrmero:
Grupo 1-3 (A): cromosomas grandes, que se distinguen entre s por su tamao y la posicin del centrmero.
Grupo 4-5 (B): submetacntricos grandes, difciles de distinguir entre s.
Grupo 6-12-X (C): de tamao mediano, difciles de distinguir entre s.
Grupo 13-15 (D): acrocntricos de tamao mediano, con satlites.
Grupo 16-18 (E): relativamente cortos metacntricos (N 16) o submetacntricos (Nos. 17 y 18).
Grupo 19-20 (F): metacntricos cortos.
Grupo 21-22-Y (G): acrocntricos cortos con satlites (el cromosoma Y es de tamao similar pero no tiene satlites).
Tcnicas de bandeo cromosmico:
Producen patrones de bandas en los cromosomas metafsicos.
Banda: parte de un cromosoma, que es claramente distinguible de los segmentos adyacentes, por aparecer ms clara o ms oscura con una o ms tcnicas de bandeo. Las bandas que se tien oscuras con un mtodo, pueden aparecer claras con otro.
Tipos de bandas
Banda Mtodo Caractersticas Q Tincin con quinacrina Bandas fluorescentes brillantes.
G
Tincin con Giemsa, luego de pre- tratamiento del cromosoma
Las bandas G oscuras corresponden a las Q brillantes
R
Varias tcnicas Patrn inverso al de las Q y G, tiles para definir los extremos de los cromosomas.
T
Varias tcnicas
Resaltan las regiones telomricas.
C
Extraccin de DNA/protenas, tincin con Giemsa
Resaltan las regiones centromricas.
NOR
Tincin con plata Tien las regiones organizadoras del nuclolo (acrocntricos en el hombre)
Cromatina del X y del Y: los cromosomas X inactivos , as como los cromosomas Y, pueden mediante tinciones adecuadas, verse como corpsculos bien definidos en el ncleo en interfase. Es lo que se conoce como cromatina del X y cromatina del Y.
Nomenclatura de bandas cromosmicas:
Las tcnicas de bandeo fluorescente, permitieron la completa individualizacin de los cromosomas humanos, y se pudo comprobar que el cromosoma 21 asociado al sndrome de Down, en realidad es ms pequeo que el 22, pero ambos mantuvieron el nmero que primitivamente se les haba asignado.
Cada cromosoma en las clulas somticas humanas est formado por una serie de bandas continuas. Las bandas se ubican en regiones a lo largo de los brazos cromosmicos y las regiones tienen lmites definidos que pueden ser los extremos de los brazos, los centrmeros y ciertas bandas.
Las regiones y las bandas se numeran desde el centrmero hacia el telmero del brazo correspondiente. Una banda considerada como lmite pertenece en su totalidad a la regin distal a ese lmite y es la banda 1 de esa regin. Para definir una banda en particular se requiere: nmero del cromosoma, smbolo del brazo, nmero de la regin y nmero de la banda dentro de la regin. Ej.: 1p33 indica banda 3, de la regin 3, del brazo corto del cromosoma 1.
La coincidencia de los patrones observados con bandeo Q ,G y R , permiti la construccin de un diagrama nico representativo de las tres tcnicas.
Las tcnicas de bandeo de alta resolucin permiten descubrir sub- bandas y stas tambin se nombran con un nmero (creciente de centrmero a telmero) que se coloca despus de un punto decimal que sigue al nmero de la banda. Ej.: 1p33.1 indica sub-banda 1, de la banda 3, de la regin 3, del brazo corto del cromosoma 1.
Nomenclatura:
En la descripcin del cariotipo (frmula cromosmica), se registra el nmero de cromosomas (incluidos los sexuales) seguido de una coma, luego de la cual se escriben los cromosomas sexuales. Si existen aberraciones numricas o estructurales de los autosomas, stas se escriben a continuacin, luego de otra coma.
Ejemplos:
46,XX cariotipo femenino normal.
46,XY cariotipo masculino normal.
Aberraciones numricas:
47,XXY cariotipo anormal, con cuarenta y siete cromosomas, dos cromosomas X y un cromosoma Y.
45,X cariotipo anormal, con 45 cromosomas y un cromosoma X.
47,XY,+21 el signo (+) o (-), colocado delante del n del autosoma, indica ganancia o prdida de ese cromosoma completo. Aqu se lee: cariotipo anormal masculino con 47 cromosomas y un cromosoma 21 adicional.
45,X/46,XY mosaico: dos o ms poblaciones celulares diferentes, se escriben separadas por una barra. Primero se escribe la que tiene menor nmero de cromosomas y luego sucesivamente las de mayor nmero. Aqu, por ejemplo, se lee mosaico con dos lneas celulares, una con 45 cromosomas y un nico X y otra con 46 cromosomas, un X y un Y.
Disoma uniparental:
La disoma uniparental (upd) es una aberracin en la que ambos miembros de un par cromosmico (los dos homlogos) provienen de un solo progenitor y el del otro progenitor est ausente. Ejemplo:
46,XY,upd(15)mat cariotipo masculino anormal con 46 cromosomas y disoma uniparental del cromosoma 15 materno.
Aberraciones estructurales:
46,XY,1q+ el signo (+) o (-), colocado detrs del smbolo del brazo indica ganancia o prdida de material gentico en ese brazo. Puede leerse: cariotipo anormal masculino, con 46 cromosomas, que muestra un aumento de la longitud del brazo largo en un cromosoma 1.
47,XY,+14p+ cariotipo anormal, masculino con 47 cromosomas, que incluye un cromosoma 14 adicional, que tiene un incremento de la longitud de su brazo corto.
46,XX,r(16) cariotipo anormal, con 46 cromosomas, femenino, que incluye un cromosoma 16 en anilllo.
mar marcador dmin cromosoma diminuto doble upd disoma uniparental ish hibridacin in situ
Especificacin de los rearreglos y de los puntos de quiebra
Rearreglo: luego del smbolo que identifica el rearreglo, se coloca entre parntesis el nmero del cromosoma involucrado. Ej.: inv(7), se lee inversin en el cromosoma 7. Si dos cromosomas estn involucrados, se colocan los dos separados por punto y coma. Ej.: t(8;14) Se lee translocacin ocho catorce.
Puntos de quiebra: se especifica lo ms precisamente posible el lugar donde las quiebras han ocurrido y se colocan entre parntesis, separadas entre s por punto y coma, inmediatamente a continuacin del rearreglo. Ej.: t(8;14)(q12;q22) se lee translocacin ocho catorce, con puntos de quiebra en la banda 2, regin 1, del brazo largo del cromosoma 8 y en la banda 2 de la regin 2 del brazo largo del cromosoma 14. (Siempre va en primer trmino el cromosoma nmero menor).
Hibridacin in situ (ish)
Esta tcnica ha establecido un puente entre los niveles de resolucin microscpico y molecular, permitiendo detectar secuencias especficas de DNA y localizarlas en un sitio cromosmico preciso, mediante sondas de secuencias complementarias de ADN marcadas con fluorocromos (tcnica de FISH).
Nomenclatura: la aberracin estructural detectada por esta tcnica se expresa mediante la sigla ish seguida por el smbolo de la anomala estructural seguida en parntesis separados por el n del/de los cromosoma/s, punto/s de quiebra, y locus/loci para la/s sonda/s usada/s designada de acuerdo a GDB (Genomic Data Base) ordenada de pter a qter. El signo + - que sigue al locus indica presencia o ausencia respectivamente.
Ejemplos:
1.- Si se ha hecho un estudio citogentico standard, como los arriba mencionados, se agrega el resultado de ish a continuacin, separndolos por un punto:
46,XY.ish del(22)(q11.2q11.2)(D22S75-)
Se lee cariotipo masculino normal por citogentica, que por ish muestra una delecin en el cromosoma 22 identificada mediante una sonda para el locus D22S75.
2.- Si no se ha hecho un estudio citogentico standard, pero se localiz mediante ish esa aberracin se escribe simplemente el resultado de la ish:
ish del(22)(q11.2q11.2)(D22S75-)
Hibridacin in situ en interfase nuclear (ish nuc):
La ish tambin permite localizar secuencias especficas en ncleos en interfase. En ese caso lo que se expresa es el nmero de seales observadas de la sonda utilizada de la siguiente manera: la abreviatura nuc ish es seguida por la banda cromosmica donde est el locus, seguida entre parntesis por la designacin del locus segn GDB, luego un signo de multiplicacin y finalmente el n de seales.
Ejemplos:
nuc ish 21q22(D21S65x2) Dos copias del locus D21S65
nuc ish 21q22(D21S65x3) Tres copias del locus D21S65
nuc ish Xcen(DXZ1x3) Tres copias del locus DXZ1
Nota: esta es una versin bsica de la nomenclatura. Para interpretar frmulas complejas debe consultarse: 1995. An nternational ystem for uman ytogenetic omenclature (1995). Ed. Mitelman,F, Karger Ed. and Cytogenetics and Cell Genetis, Basel,1995.