Variasi genetik dari Gen IGF1 dan OPN dalam Sapi Perah Holstein - Friesian Kembar Sejarah dan

Non - Sejarah

Tujuan
Penerapan teknik molekuler DNA dapat digunakan untuk menentukan kasus mutasi pada fragmen DNA yang berkaitan dengan ciri-ciri kesuburan pada sapi . Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi varian genetik dari gen Insulin Like Growth Factor 1 ( IGF - 1 ) dan Osteopontin ( OPN ) yang dianggap sebagai gen yang mengendalikan sifat fertilitas pada sapi HF kembar sejarah ( 27 ekor) dan kembar non sejarah ( 15 ekor ) dari Jawa Barat , Indonesia. Hasil dan Pembahasan Amplifikasi dan genotipe dari IGF1 Gene Fragment Amplifikasi fragmen gen IGF - 1 berhasil untuk memperkuat fragmen 249 bp yang terletak di intron 1 dari gen IGF-1 . Polimorfisme genetik dari gen IGF-1 dideteksi dengan metode PCR - RFLP oleh Siadkowska et al . (2006 ) melalui pemeriksaan adanya basa transisi C / T pada posisi nukleotida 472 di wilayah non - codign dari gen IGF-1 pada Bos taurus. Substitusi C ke T menghasilkan restriksi SnaBI baru ( IGF - 1 | SnaBI ). Hewan dengan homozigot TT ditunjukkan dengan adanya dua fragmen yaitu 223 dan 26 bp , sedangkan genotipe homozigot CC ditandai dengan tidak adanya restriksi SnaBI dan menunjukkan hanya satu fragmen yaitu 249 bp . CT heterozigot ditunjukkan oleh adanya tiga fragmen yaitu 249 , 223 dan 26 bp . Sampel analisis RFPL menunjukkan bahwa genotipe HF sapi adalah homozigot CC . Alel yang ditemukan adalah alel C. Hasil ini menyebabkan frekuensi genotipe CC diperoleh 100 % , terlepas dari genotype CT dan TT 0 % . Hasil ini kontras

dengan orang-orang dari beberapa penelitian sebelumnya dengan mendeteksi adanya polimorfisme genetik pada sapi gen IGF-1. Amplifikasi dan genotipe dari Gene Fragment OPN Amplifikasi dari intron 4 gen OPN yang terletak di chromose 6 ( BTA6 ) diselidiki di HF sapi menghasilkan panjang fragmen 290 bp . Produk amplifikasi kemudian dibatasi oleh enzim BsrI untuk mendeteksi keberadaan titik mutasi pada gen OPN intron 4 . Polimorfisme genetik dari gen OPN dalam penelitian ini mengikuti metode Leonard et al . (2005 ) yang meneliti transisi C / T di 5 'daerah non - kode dalam intron 4 dari gen OPN Bos Taurus. Substitusi C ke T menghasilkan restriksi BsrI baru ( OPN | BsrI ). Hewan dengan homozigot CC ditunjukkan dengan adanya dua fragmen yaitu 200 dan 90 bp , sedangkan genotipe homozigot TT ditandai dengan tidak adanya restriksi BsrI dan hanya menunjukkan satu fragmen yaitu 290 bp . CT heterozigot ditunjukkan oleh kehadiran tiga fragmen yaitu 290 , 200 dan 90 bp. Untuk hewan kembar sejarah lokasi ini ditemukan hewan tidak memiliki genotipe TT ( 0 % ) , sehingga orangsapi kembar sejarah hanya memiliki dua genotipe CC ( 40 % ) dan CT ( 60 % ) masing-masing.

kesimpulan
Genotip pada wilayah intron 1 gen IGF-1 dalam BTA5 di HF ternak kembar historis dan non -historis mengakibatkan tidak ada polimorfisme genetik ( monomorfik ) sebagai fragmen DNA yang mewakili hanya genotipe CC . Hal ini sebagai indikasi dari substitusi C / T dalam intron 1 gen IGF1 mungkin tidak muncul, sehingga gen ini tidak dapat difungsikan sebagai gen dalam mempelajari sifat kembar di HF ternak . Genotip pada intron 4 dari gen OPN pada ternak HF dengan kembar sejarah dan kembar non -historis menghasilkan tiga varian genetik , memberikan CC , CT , dan

TT genotipe , tapi frequensi bervariasi . Hasil ini membuktikan bahwa transisi C / T di daerah non - kode pada intron 4 gen OPN dapat digunakan sebagai indikator awal sebagai kandidat gen untuk mempelajari kontrol pada sekresi susu Rahim untuk menengahi kelahiran kembar di HF sapi