Anda di halaman 1dari 75

Asam amino adalah biomolekul yang sangat kecil dengan bobot molekul rata-rata sekitar

135 daltons.

ASAM AMINO 1. Merupakan "building Blocks" tubuh kita. Selain membangun sel baru dan memperbaiki jaringan yang rusak, mereka juga membentuk antibodi untuk melawan serangan bakteri & virus. 2.Bagian dari sistim enzim & hormonal.

3.Membangun nukleoprotein (RNA & DNA)

4.Membawa oksigen keseluruh tubuh dan berpartisipasi dalam aktifitas otot. Protein yang

pecah pada proses pencernaan akan

menghasilkan 22 asam amino. Delapan diantaranya adalah esensial dan lainnya non- esensial.

Secara

umum

asam

amino

mempunyai kerangka gugus

asam karboksilat dan gugus amino yang terikat kepada

atom karbon jenuh.

RUMUS UMUM ASAM

AMINO

RUMUS UMUM ASAM AMINO R = rantai samping

R = rantai samping

REAKSI PROTOLISIS ASAM AMINO DALAM LARUTANNYA

DAPAT DITULISKAN SBB :

H 2 N C COOH

REAKSI PROTOLISIS ASAM AMINO DALAM LARUTANNYA DAPAT DITULISKAN SBB : H N – C – COOH

BENTUK MOLEKUL

+ H 3 N C COO -

BENTUK ION DIPOLAR (ION ZWITTER)

dimana asam karboksilatnya dalam keadaan berair terionisasi dan gugus basanya (gugus amino) terprotonkan.

H

REAKSI PROTOLISIS ASAM AMINO DALAM LARUTANNYA DAPAT DITULISKAN SBB : H N – C – COOH

C

H

 

O

O C

C

 
O

O -

H 3 N +
H 3 N +
REAKSI PROTOLISIS ASAM AMINO DALAM LARUTANNYA DAPAT DITULISKAN SBB : H N – C – COOH

Anggota yang paling sederhana dari

asam amino adalah glisin. Atom karbon jenuhnya tidak tersubstitusi,

dengan demikian dia tidak optis

aktiv.

Substituen pada atom karbon alfa :

  • - Gugus alkil rantai lurus/bercabang atau aromatik.

  • - Alkil amina/amina aromatik

  • - Alkil alkohol/alkohol aromatik.

  • - Tiol (belerang)

Substituen pada atom karbon alfa

tersebut diberi singkatan R (rantai

samping)

Rantai samping ada yang bersifat Asam, basa dan netral.

PEMBAGIAN GOLONGAN

ASAM AMINO

Berdasarkan sifat kepolaran dari R:

Asam amino

R = NON POLAR

PEMBAGIAN GOLONGAN ASAM AMINO • Berdasarkan sifat kepolaran dari R: Asam amino R = NON POLAR
  • R = POLAR

Pada prinsipnya asam amino merupakan building blocks untuk pembentukan protein

dan enzim.

20 Asam Amino

20 Asam Amino

The genetic code

Glisin: asam amino yang paling sederhana.

Dalam protein dengan coded (codon) :

GGU, GGC, GGA dan GGG. Sifat : neorotransmiter antagonis.

Glisin: asam amino yang paling sederhana. Dalam protein dengan coded (codon) : GGU, GGC, GGA dan

Glisin adalah asam amino

untuk biosintesa : asam

nukleat, asam empedu, porfirin, kreatin posfat dan asam - asam amino lain.

Glisin mengalami degradasi melalui tiga alur

1. Alur pertama : Umumnya terjadi pada hewan, yakni meliputi katalisis oleh enzim

Glisin + tetrahidrofolat + NAD + → CO2 + NH4 + + N5,N10- Metilen tetrahidrofolat + NADH + H +

2. Alur kedua : glisin didegradasi dalam dua tahap. Tahap I merubah glisin menjadi serin dengan enzim serin hidroksimetil transferase. Tahap II, Serin dirubah menjadi piruvat melalui serin dehidratase.

3. Alur ketiga : glisin dirubah menjadi glioksilat dengan bantuan D-asam amino oksidase. Glioksilat kemudian

dioksidasi oleh hepatik laktat dehidrogenase menjadi oksalat dalam adanya NAD +

Alanin Asam amino yang banyak berguna

<a href=Alanin – A sam amino yang banyak berguna dalam protein. isomer L-nya adalah satu dari 20 asam amino yang proteinogenik . Codonnya adalah GCU, GCC, GCA, dan GCG. " id="pdf-obj-16-7" src="pdf-obj-16-7.jpg">

dalam protein. isomer L-nya adalah satu dari 20 asam amino yang proteinogenik. Codonnya adalah GCU, GCC, GCA, dan GCG.

<a href=Alanin – A sam amino yang banyak berguna dalam protein. isomer L-nya adalah satu dari 20 asam amino yang proteinogenik . Codonnya adalah GCU, GCC, GCA, dan GCG. " id="pdf-obj-16-14" src="pdf-obj-16-14.jpg">
<a href=Alanin – A sam amino yang banyak berguna dalam protein. isomer L-nya adalah satu dari 20 asam amino yang proteinogenik . Codonnya adalah GCU, GCC, GCA, dan GCG. " id="pdf-obj-16-16" src="pdf-obj-16-16.jpg">

Alanin adalah asam amino

non-esensial yang terlibat

pada metabolisme triptofan

dan vitamin piridoksin.

Peranan alanin cukup penting pada terapi terhadap manusia,

salah satunya adalah kemampuannya menurunkan

kadar kolesterol dan virus HIV

beta-Alanin secara alami terdapat sebagai beta pada asam amino. Formula: C 3 H 7 NO 2

H
H

Arginin - asam amino yang berguna pada sisi aktif dari enzim.

Arginin - asam amino yang berguna pada sisi aktif dari enzim.

Asam aspartat - intermediet

Asam <a href=aspartat - intermediet penting pada siklus asam sitrat. " id="pdf-obj-21-6" src="pdf-obj-21-6.jpg">

penting pada siklus asam sitrat.

Asam <a href=aspartat - intermediet penting pada siklus asam sitrat. " id="pdf-obj-21-10" src="pdf-obj-21-10.jpg">

Asam aspartat adalah satu dari

dua asam amino (lainnya adalah asam glutamat) yang

mempunyai muatan negatif

yakni dari gugus karboksilat

pada rantai samping.

Asam aspartat adalah asam amino non-esensial, dia ikut

berperan dalam metabolisme pembuatan asam amino lain dan secara biokimia dalam siklus asam sitrat.

Secara biokimia yang

disintesa dari asam aspartat

adalah asparagin, arginin,

lisin, metionin, treonin,

isoleusin, dan beberapa

nukleotida.

Asparagin turunan amide dari asam aspartat.

<a href=Asparagin – turunan amide dari asam aspartat. " id="pdf-obj-25-7" src="pdf-obj-25-7.jpg">

Sistein asam amino yang mengandung tiol dan terlibat

<a href=Sistein – asam amino yang mengandung tiol dan terlibat pada sisi aktif dan menentukan struktur protein tersier. " id="pdf-obj-26-6" src="pdf-obj-26-6.jpg">

pada sisi aktif

dan menentukan struktur

protein tersier.

<a href=Sistein – asam amino yang mengandung tiol dan terlibat pada sisi aktif dan menentukan struktur protein tersier. " id="pdf-obj-26-14" src="pdf-obj-26-14.jpg">
<a href=Sistein – asam amino yang mengandung tiol dan terlibat pada sisi aktif dan menentukan struktur protein tersier. " id="pdf-obj-26-16" src="pdf-obj-26-16.jpg">

Sistin produk oksidasi dari

<a href=Sistin – produk oksidasi dari sistein, yang mengikat protein bersama- sama. " id="pdf-obj-27-6" src="pdf-obj-27-6.jpg">

sistein, yang mengikat protein

bersama- sama.

Asam glutamat asam amino yang tidak bermuatan ditemukan pada permukaan protein.

Asam <a href=glutam at – asam amino yang tidak bermuatan ditemukan pada permukaan protein. " id="pdf-obj-28-8" src="pdf-obj-28-8.jpg">
Asam <a href=glutam at – asam amino yang tidak bermuatan ditemukan pada permukaan protein. " id="pdf-obj-28-10" src="pdf-obj-28-10.jpg">

Glutamin satu satunya asam amino dengan dengan mudah

melakukan perlintasan antara

darah dan

jaringan otak.

<a href=Glutamin satu – satunya asam amino dengan dengan mudah melakukan perlintasan antara darah dan jaringan otak. " id="pdf-obj-29-14" src="pdf-obj-29-14.jpg">
<a href=Glutamin satu – satunya asam amino dengan dengan mudah melakukan perlintasan antara darah dan jaringan otak. " id="pdf-obj-29-16" src="pdf-obj-29-16.jpg">

Histidin asam amino yang dapat merespon biosintesa

histamin.

<a href=Histidin – asam amino yang dapat merespon biosintesa histamin. " id="pdf-obj-30-9" src="pdf-obj-30-9.jpg">

Prolin asam amino siklik

<a href=Prolin – asam amino siklik alipatik berguna pada sintesa kolagen. " id="pdf-obj-31-6" src="pdf-obj-31-6.jpg">

alipatik berguna pada sintesa kolagen.

<a href=Prolin – asam amino siklik alipatik berguna pada sintesa kolagen. " id="pdf-obj-31-10" src="pdf-obj-31-10.jpg">

Hidroksiprolin - asam amino

penting yang berguna dalam

struktur protein seperti

kolagen.

<a href=Hidroksiprolin - asam amino penting yang berguna dalam struktur protein seperti kolagen. " id="pdf-obj-32-11" src="pdf-obj-32-11.jpg">

Isoleusin asam amino hidropobik yang berguna selama konstruksi

protein dan enzim.

<a href=Isoleusin – asam amino hidropobik yang berguna selama konstruksi protein dan enzim. " id="pdf-obj-33-9" src="pdf-obj-33-9.jpg">

Lisin asam amino esensial

<a href=Lisin – asam amino esensial dengan muatan positif pada rantai samping alifatis. " id="pdf-obj-34-6" src="pdf-obj-34-6.jpg">

dengan muatan positif pada rantai samping alifatis.

<a href=Lisin – asam amino esensial dengan muatan positif pada rantai samping alifatis. " id="pdf-obj-34-10" src="pdf-obj-34-10.jpg">

Metionin asam amino esensial yang membantu meberikan inisial

sintesa protein.

<a href=Metionin – asam amino esensial yang membantu meberikan inisial sintesa protein. " id="pdf-obj-35-9" src="pdf-obj-35-9.jpg">

Fenilalanin asam amino aromatik yang terdapat pada protein.

<a href=Fenilalanin – asam amino aromatik yang terdapat pada protein. " id="pdf-obj-37-7" src="pdf-obj-37-7.jpg">

Serin asam amino alkohol

<a href=Serin – asam amino alkohol ditemukan pada sisi aktif dari serin protease. " id="pdf-obj-38-6" src="pdf-obj-38-6.jpg">

ditemukan pada sisi aktif dari

serin protease.

<a href=Serin – asam amino alkohol ditemukan pada sisi aktif dari serin protease. " id="pdf-obj-38-12" src="pdf-obj-38-12.jpg">

Taurin adalah sisa produk dari metabolisme sistein.

Taurin terkonyugasi pada asam kolat membentuk taurokolat, yaitu garam empedu.

Garam empedu terbentuk dari asam

empedu yang berikatan dengan kation seperti asam amino. Contoh glikocholat dan taurocholat. (garam empedu adalah zat semacam detergen yang dikeluarkan dari kantong empedu (gallbladder) untuk

membantu mencernakan atau menyerap

lipid.

Treonin asam amino alkohol yang terlibat dalam

metabolisme porfirin.

<a href=Treonin – asam amino alkohol yang terlibat dalam metabolisme porfirin. " id="pdf-obj-42-9" src="pdf-obj-42-9.jpg">

SUMBER

Makanan yang mengandung treonin meliputi : keju, unggas, ikan, daging dan biji-bijian.

Metabolisme

Treonin dimetabolis dalam dua cara:

Pertama : Dirubah menjadi piruvat melalui treonin dehidrogenase. Bentuk antara pada pathway ini mengalami tiolisis dengan CoA

untuk menghasilkan asetil-CoA dan glisin.

Kedua : Pada manusia treonin dirubah menjadi α-ketobutirat menggunakan enzim serin dehidratase dan selanjutnya

dimasukkan ke dalam pathway yang akan

menghasilkan suksinil-CoA.

Triptofan asam amino aromatik berguna sewaktu- waktu pada protein.

<a href=Triptofan – asam amino aromatik berguna sewaktu- waktu pada protein. " id="pdf-obj-46-7" src="pdf-obj-46-7.jpg">

Beberapa fakta tentang L-triptofan.

Singkatan

: Trp.

Kode satu huruf : W,

Masa molekul Kategori pK a

: 204 daltons. : hidropobik ; aromatik.

: tidak ada.

Tirosin asam amino

<a href=Tirosin – asam amino hidroksifenil yang berguna untuk membangun neurotransmiter dan hormon. " id="pdf-obj-48-6" src="pdf-obj-48-6.jpg">

hidroksifenil yang berguna

untuk membangun

neurotransmiter dan hormon.

<a href=Tirosin – asam amino hidroksifenil yang berguna untuk membangun neurotransmiter dan hormon. " id="pdf-obj-48-14" src="pdf-obj-48-14.jpg">

Valin asam amino

<a href=Valin – asam amino hidropobik alifatik yang berguna untuk mengikat protein secara bersama-sama. " id="pdf-obj-49-6" src="pdf-obj-49-6.jpg">

hidropobik alifatik yang

berguna untuk mengikat

protein secara bersama-sama.

<a href=Valin – asam amino hidropobik alifatik yang berguna untuk mengikat protein secara bersama-sama. " id="pdf-obj-49-14" src="pdf-obj-49-14.jpg">

asam amino hasil dekarboksilasi yang membantu kita keluar dari rasa dingin.

Taurin asam amino yang mengandung mercaptan terlibat secara biokimia pada asam empedu.

<a href=Taurin – asam amino yang mengandung mercaptan terlibat secara biokimia pada asam empedu. Taurin adalah sisa produk dari metabolisme sistein . Taurin terkonyugasi pada asam kolat membentuk taurokolat , yaitu garam empedu . " id="pdf-obj-51-8" src="pdf-obj-51-8.jpg">

Taurin adalah sisa produk dari metabolisme sistein. Taurin terkonyugasi pada asam kolat membentuk taurokolat, yaitu garam empedu.

Ornitin salah satu anggota dari asam amino pada siklus urea.

<a href=Ornitin – salah satu anggota dari asam amino pada siklus urea. " id="pdf-obj-52-8" src="pdf-obj-52-8.jpg">

Sitrulin suatu asam amino yang bekerja untuk menghilangkan racun dan mengeliminasi amonia yang tidak

diinginkan.

Karnitin - asam amino yang tidak umum yang membawa asam lemak kedalam mitokondria.

Struktur Kimia : L-Karnitin, Asetil-L-Karnitin dan Propionil L-Karnitin

butirat)
butirat)

trimetil-amino-

KARNITIN (Asam-

Beta-hidroksi-gama-

DNA strand 1 berbeda dari DNA strand 2

pada lokasi pasangan basa tunggalnya(C/T polimorfisme).

DNA strand 1 berbeda dari DNA strand 2 pada lokasi pasangan basa tunggalnya(C/T polimorfisme).

Aturan dari International Union of Pure and

Applied Chemistry (IUPAC) :

A = adenine; C = cytosine; G = guanine; T = thymine; R = G A (purine); Y = T C

(pyrimidine); K = G T (keto); M = A C

(amino); S = G C (strong bonds); W = A T (weak bonds); B = G T C (all but A); D = G A T (all but C); H = A C T (all but G); V = G

C A (all

but T); N = A G C T (any)

The table shows the 64 codons and the amino acid for each. The direction of

the mRNA is 5' to 3'. 2nd

baseUCAG1st

UUU (Phe/F) Phenylalanine UUC (Phe/F)Phenylalanine

UCU (Ser/S) Serine UCC (Ser/S)Serine

UAU (Tyr/Y) Tyrosine UAC (Tyr/Y)Tyrosine

UGU (Cys/C) Cysteine UGC (Cys/C)Cysteine

UUA (Leu/L) Leucine UCA (Ser/S) Serine UAA Ochre (Stop) UGA Opal (Stop)

UUG (Leu/L) Leucine UCG (Ser/S) Serine UAG Amber (Stop) UGG (Trp/W) Tryptophan

CUU (Leu/L) Leucine CUC (Leu/L) Leucine

CCU (Pro/P) Proline CCC (Pro/P)Proline

CAU (His/H) Histidine CAC (His/H)Histidine

CGU (Arg/R) Arginine CGC (Arg/R)Arginine

CUA (Leu/L) Leucine CUG (Leu/L) Leucine

CCA (Pro/P) Proline CCG (Pro/P)Proline

CAA (Gln/Q) Glutamine CAG (Gln/Q)Glutamine

CGA (Arg/R) Arginine CGG (Arg/R)Arginine

AUU (Ile/I) Isoleucine AUC (Ile/I)Isoleucine

ACU (Thr/T) Threonine ACC (Thr/T)Threonine

AAU (Asn/N) Asparagine AAC (Asn/N)Asparagine

AGU (Ser/S) Serine AGC (Ser/S) Serine

AUA (Ile/I) Isoleucine ACA (Thr/T) Threonine AAA (Lys/K) Lysine AGA (Arg/R) Arginine

AUG (Met/M) Methionine, Start[1] ACG (Thr/T) Threonine

AAG (Lys/K) Lysine AGG (Arg/R) Arginine

GUU (Val/V) Valine GUC (Val/V) Valine

GCU (Ala/A) Alanine GCC (Ala/A) Alanine

GAU (Asp/D) Aspartic acid GAC (Asp/D) Aspartic acid

GGU (Gly/G) Glycine GGC (Gly/G) Glycine

GUA (Val/V) Valine GUG (Val/V) Valine

GCA (Ala/A)Alanine GCG (Ala/A) Alanine

GAA (Glu/E) Glutamic acid GAG (Glu/E) Glutamic acid

GGA (Gly/G) Glycine GGG (Gly/G) Glycine