Estrutura primria: seqncia de aminocidos. Estrutura secundria: estrutura regular local, formada por diferentes regies da seqncia de aminocidos.

Estrutura terciria: empacotamento dos elementos de estrutura secundria em uma ou mais unidades globulares compactas (domnios). Estrutura quaternria: empacotamento de elementos de estrutura terciria.

Os 20 aminocidos Alanina (Ala, A) Arginina (Arg, R) Asparagina (Asn, N) Aspartato (Asp, D) Cistena (Cys, C) Glutamina (Gln, Q) Glutamato (Glu, E) Glicina (Gly, G) Histidina (His, H) Isoleucina (Ile, I) Leucina (Leu, L) Lisina (Lys, K) Metionina (Met, M) Fenilalanina (Phe, F) Prolina (Pro, P) Serina (Ser, S) Treonina (Thr, T) Triptofano (Trp, W) Tirosina (Tyr, Y) Valina (Val, V)

Protenas so compostas por aminocidos, unidos por ligaes peptdicas em uma cadeia polipeptdica.

A ligao peptdica C(i)-C(i)-N(i+1)-C(i+1) sempre planar, ou quase planar (=~180).

Os grupos SH de cistenas podem formar ligaes de dissulfeto.

Na cadeia polipeptdica dois graus de liberdade so permitidos por unidade peptdica: (phi): ngulo torcional C(i-1)-N(i)-C (i)-C(i) (psi): ngulo torcional N(i)-C (i)-C(i)-N(i+1) Podemos representar a conformao da cadeia principal de cada resduo pelos ngulos ( i,i), que representam um ponto em um sistema de coordenadas cujos eixos so e . Esse diagrama chamado de Diagrama de Ramachandran.

Somente certas combinaes de ngulos torcionais (,) so permitidas (impedimentos estereoqumicos).

Hlice-: ngulos e so repetidos ao longo da cadeia.

Dipolo da hlice: os dipolos de cada unidade peptdica esto alinhados na hlice.

Fitas-b se alinham adjacentemente umas s outras, formando folhas que podem ser paralelas, antiparalelas ou mistas. Essas folhas no so exatamente planas, possuindo sempre uma toro (twist).

Folha-b antiparalela

Folha-b paralela