Tugas 2 Kelompok 1 : 1. Rifalatul Isnaini 2.

Yohana Wulandari Resume Plasmid dan Episom "enurut #ardner $1 0 %& 'lasmid merupakan molekul ()* ekstrakromosomal +ang mampu melakukan replikasi sendiri dari sel induk. *da 3 tipe induk dari plasmid antara lain 1% 'lasmid ,& faktor , +ang -ertanggung .a/a- terhadap transfer ()* selama kon.ugasi& 2% 'lasmid R $RT,%& molekul ()* +ang mem-a/a gen dari resisten kepada ma0am anti-iotik dan -akteri o-at& 3% 'lasmid 0ol $0oli0inogeni0%& plasmid +ang mengkode protein +ang dise-ut 0oli0in +ang sensitif mem-unuh sel 1. 2oli. (alam #arner $1 1% diterangkan -ah/a plasmid merupakan replicon $se-uah unit dari materi genetik +ang mampu melakukan replikasi se0ara mandiri% +ang di/ariskan se0ara sta-il $dipertahankan tanpa seleksi tertentu% dan -erada di luar kromosom $e3tra40hromosomal%. 'lasmid tidak dapat -erga-ung dengan ()* kromosom inang namun selalu mengikuti ()* inang. 1pisom merupakan elemen genetik +ang mampu mereplikasi 2 -agian& +aitu 1% pada -agian integrasi& pemasukan sekumpulan kromosom untuk melekat pada kromosom -akteri& dan 2% pada -agian autonomi atau -agian ekstrakromosomal akan menggandakan diri dan dipindahkan tanpa -ergantung kepada kromosom -akteri. *ntara plasmid dan episom tidaklah sama& terdapat se-uah per-edaan mendasar diantara keduan+a. 'lasmid merupakan molekul ()* ekstra kromosom& plasmid tidak dapat -erga-ung dengan ()* kromosom& dan plasmid -erisi informasi genetik +ang diperlukan untuk replikasi plasmid itu sendiri. 5edangkan episom adalah setiap .enis ()* ekstra4 kromosom +ang dapat -erhu-ungan dengan ()* kromosom. 1pisom -iasan+a le-ih -esar dari ()* ekstra4kromosom lainn+a. 2ontoh episom adalah 6irus& karena mereka mengintegrasikan materi genetik mereka ke dalam ()* kromosom inang dan -ereplikasi -ersama dengan replikasi ()* kromosom inangn+a. 5e-agai komponen genetik e3trakromosomal& plasmid memiliki -e-erapa peranan +ang 0ukup penting& -aik -agi -akteri +ang memiliki plasmid itu sendiri maupun -agi penelitian di -idang genetika. (ale dan 'ark $2004% men+e-utkan -ah/a plasmid men+ediakan se-uah dimensi ekstra +ang penting terhadap fleksi-ilitas respon organisme terhadap peru-ahan lingkungan& -aik peru-ahan itu -ersifat antagonis atau -erla/anan 120341400031 120341421 !3

Tugas 2 $misaln+a kehadiran anti-iotik% maupun +ang -erpotensi menguntungkan atau -aik& misaln+a ketersediaan su-strat -aru. 7e-erapa kegunaan plasmid +ang lain -agi -akteri seperti: produksi protein +ang -erfungsi se-agai 8at antimikro-ial untuk mela/an organisme -akteri +ang saling -erdekatan misaln+a Colicin +ang diproduksi oleh E. Coli strain tertentu untuk mem-unuh -akteri E. Coli +ang lain9 plasmid mem-a/a sifat 6irulensi -agi -akteri9 -akteri4-akteri tertentu seperti Agrobacterium tumefaciens mem-a/a plasmid +ang dise-ut TI $Tumor Inducing% +ang -ersifat patogen +ang men+e-a-kan tumor pada tum-uhan dan Rhizobium +ang mem-entuk nodul pada akar ka0ang4ka0angan +ang -erguna untuk fiksasi nitrogen dikontrol oleh gen4gen +ang di-a/a oleh plasmid. 5elain itu .uga& plasmid mem-a/a gen4gen +ang digunakan oleh -e-erapa -akteri dalam akti6itas meta-olisme seperti fermentasi laktose dan proses -iodegradasi dan -ioremidiasi. 5e0ara umum& plasmid memiliki peran penting di dalam mem-erikan kemampuan adaptif +ang kuat -agi -akteri. 5esuai dengan sifat plasmid +ang dapat keluar atau masuk ke dalam sel -akteri& hal ini memungkinkan -akteri dapat memiliki sifat4sifat genetik dan .uga sifat4sifat meta-olis +ang menguntungkan pada kondisi lingkungan +ang -aru. (ari segi penelitian genetika& plasmid telah lama dikenal se-agai 6ektor dalam teknik reka+asa genetika. 2ontoh +ang 0ukup popular adalah -akteri penghasil insulin& -akteri ini dihasilkan dengan menanamkan plasmid +ang telah di modifikasi dengan disisipi gen pengkode insulin& dengan memiliki plasmid ters-ut& -akteri itu mampu memproduksi insulin. 5elain itu masih -an+ak 0ontoh40ontoh lain terkait manfaat plasmid di -idang penelitian genetika. 5edikit -er-eda dengan pada plasmid& umumn+a episom .ustru merugikan sel inang& terutama .ika episome terse-ut merupakan 6irus. 5e-agaimana kita ketahui pada daur replikasi 6irus& saat materi genetik 6irus terse-ut masuk ke dalam sel inang dan segera men+isip pada kromosom inti kemudian mengam-il kendali sel inang sehingga akhirn+a mem-entuk 6irion46iron -aru. Tentu sa.a proses ini merugikan -agi sel inang& apalagi .ika daur terse-ut -erakhir dengan lisisn+a sel inang. )amun -e-erapa episom 6irus tern+ata diketahui dapat -erada dalam kondisi dorman $viral episomal latency%& +aitu merupakan kondisi dimana materi genetik 6irus +ang telah masuk ke dalam sel inang& han+a mela+ang4la+ang $floating% di dalam sitoplasma sel inang. (alam kondisi ini episom 6irus terse-ut tidak mem-erikan -aha+a +ang serius -agi sel inang. (alam -idang reka+asa genetika& episome mem-erikan manfaat +ang 0ukup -esar. 5eperti haln+a plasmid episom seringkali digunakan untuk men+untikkan gen4gen tertentu ke

Tugas 2 dalam kromosom sel target sehingga& dengan demikian sel target akan memiliki sifat4safat +ang di-a/a gen tadi. (alam hal ini& penggunaan episom mem-erikan hasil +ang sedikit -er-eda dengan plasmid& dimana gen +ang disuntikkan akan -erg-ung -ersama pada ()* utama pada sel target.

Pertanyaan : 1. 7agaimana plasmid R dapat -ersifat resisten terhadap anti-iotik:

;a/a- : ,aktor R pertama kali ditemukan di ;epang pada strain -akteri enterik +ang mengalami resistensi terhadap se.umlah anti-iotik $multipel resisten%. dengan meningkatn+a penggunaan anti-iotik untuk "un0uln+a pengo-atan resistensi pen+akit -akteri terhadap -e-erapa anti-iotik& sangat -erarti dala dunia kedokteran dan dihu-ungkan infeksi. 5e.umlah per-edaan gen4gen resisten anti-iotik dapat di-a/a oleh faktor R. Resisten terhadap anti-iotik ini tampak perlahan lahan mulai -erkem-ang pada strain strain -akteri patogen tertentu. 7e-erapa gen terse-ut mengkode en8im +ang spesifik menghan0urkan -e-erapa anti-iotik tertentu& seperti tetrasiklin atau ampisilin.

2.

7agaimana proses replikasi pada plasmid: ;a/a- : 0ontoh -akteri +ang mengalami replikasi plasmid +aitu E.Coli, +ang terdiri atas dua tipe +aitu tipe 2ol11 -erukuran relatif ke0il $kurang dari 10 k-% dan terdapat dalam kopian -erganda di dalam sel. Kelompok plasmid kedua digolongkan ke dalam plasmid , +ang -erukuran le-ih -esar $le-ih -esar dari 30 k-9 plasmid , sendiri -erukuran 100 k-%. 'lasmid ini han+a memiliki satu atau dua kopian per sel. 'lasmid ini .uga dikenal dengan plasmid kon.ugatif. Replikasi plasmid tipe pertama tidak -erhu-ungan dengan proses replikasi kromosomal dan pem-elahan sel $oleh se-a- itu memiliki .umlah kopian +ang -an+ak%& meskipun ada -e-erapa pengontrol dalam replikasi plasmid. 5edangkan plasmid tipe kedua& replikasin+a dikontrol dengan 0ara +ang sama seperti pada kromosom. Karenan+a& ketika kromosom diinisiasi untuk -ereplikasi& maka replikasi plasmid ini pun akan ter.adi. <leh karena itu plasmid tipe ini tidak -isa diamplifikasi $per-an+akan%.

Tugas 2

#am-ar 5truktur plasmid 2ol11. imm: gen untuk memproduksi 0oli0in 11 dan imunitasn+a9 mob: gen +ang mengkode nuklease untuk mo-ilisasi9 rom: gen +ang mengkode protein +ang di-utuhkan untuk efekti6itas .umlah kopian9 oriT: origin of 0on.ugal tansfer9 ori : origin of repli0ation. $#utman& 2004%

#am-ar 'lasmid tipe 1& plasmid dengan .umlah kopian -erganda dengan pem-agian a0ak.

#am-ar 'lasmid tipe 2& plasmid dengan .umlah kopian sedikit dengan pem-agian terarah. "odel replikasi plasmid sama dengan kromosom. 7an+ak plasmid direplikasi se-agai molekul sirkular untai ganda. Replikasi dimulai dari titik +ang dise-ut ori $6egetati6e origin& +ang mem-edakann+a dengan titik transfer kon.ugati6e +aitu oriT% dan prosesn+a -erasal dari titik ini dalam satu maupun dua arah se0ara simultan sampai seluruh lingkaran dikopi.

Tugas 2

#am-ar "odel replikasi plasmid untai ganda. Replikasi dimulai dari titik a/al replikasi +aitu ori I dan diakhiri pada titik akhir replikasi +aitu oriT. Replikasi pada plasmid untai tunggal ter.adi pada -e-erapa -akteri seperti -akteri gram positif +ang memiliki plasmid untai tunggal. "odel replikasi plasmid untai tunggal dapat dilihat pada gam-ar -erikut.

#am-ar "odel replikasi plasmid untai tunggal. 7era/al dari untai tunggal +ang dise-ut untai $=% disitensis untai komplementer +aitu untai $4% mem-entuk untai ganda $formasin+a dise-ut R,%. (ari -entuk R, kemudian disintesis kopian plasmid untai tunggal. 5iklus -erlan.ut dan mem-entuk untai tunggal -erikutn+a.

Tugas 2 (aftar ru.ukan #ardner& 1.;.& dkk& 1 0 . !rinciple of "enetics. 1ngle <ffs )e/ ;erse+: 'renti0e >all In0. #ardner& 1.;.& dkk& 1 1. !rinciple of "enetics. 1ngle <ffs )e/ ;erse+: 'renti0e >all In0.