Memiliki spesifitas tinggi Sangat cepat dapat memberikan hasil yang sama pada hari yang sama Dapat membedakan varian mikroorganisme Mikroorganisme yang dideteksi tidak harus hidup Mudah di set up
KELEMAHAN PCR 1. Sangat mudah terkontaminasi 2. Biaya peralatan dan reagen mahal 3. Interpretasi hasil PCR yang positif belum tervalidasi untuk semua penyakit infeksi misalnya infeksi pasif atau laten 4. Teknik prosedur yang kompleks dan bertahap membutuhkan keahlian khusus untuk melakukannya.