MAKALAH PRESENTASI

MATA KULIAH FISIOLOGI MIKROBIA

Pengendalian Gen secara Menyeluru!
Disusun oleh :
Asokawati DM
Nawang Wulandari
Nila Rezha Diyestia Rakhma
Hayu Purbaningsih 12!!
Rizka Wira Pertiwi 12!"
Muhammad #armawy 12$
Riska %uaebatul Hasanah 12"&
Mei'ita (kta'iani Wayangkau 12&1
Ayuni Dwi Rakhmawati 12&2
)intang Arya*i
Ayu Ashari A+hmad 12,-
Aditya Hanes .ntanto 12$!1
Dosen Pengam/u : Pro01 .r1 %ebastian Margino2 Ph1 D
FAKULTAS PERTANIAN
UNI"ERSITAS GA#$AH MA#A
%OG%AKARTA
&'()
PEN#AHULUAN
A* La+ar Bela,ang
%emua organisme2 baik organisme /rokariotik mau/un eukariotik memiliki materi
genetik yang mengandung asam nukelat beru/a DNA dan atau RNA1 (rganisme uniseluler
mau/un multiseluler memiliki ribuan gen yang menyusun DNA1 3en4gen mengatur eks/resi
si0at tertentu bergantung susunannya1 Akan teta/i2 tidak semua sel beker*a untuk karakter
yang sama walau/un memiliki gen4gen yang sama karena tidak semua gen dieks/resikan
/ada le'el yang sama /ada tia/ sel1 5ks/resi gen ini dikendalikan oleh regulasi ek/resi gen1
Pengendalian gen ini bertu*uan untuk mengatur waktu eks/resi yang te/at dalam
suatu kondisi lingkungan1 Proses ini da/at menge0isienkan /enggunaan energi untuk
melangsungkan transkri/si dan translasi gen1 %elain itu da/at menginakti0kan gen yang
menghasilkan /roduk bertentangan dan menghentikan /roses ek/resi gen a/abila sudah tidak
dibutuhkan1 %uatu sel mungkin hanya mengeks/resikan gen yang yang dibutuhkan /ada
lingkungan tertentu2 sel sangat e0esien sehingga tidak membuang energi untuk membuat
mRNA yang tidak dibutuhkan /ada waktu tersebut1 6ontohnya yaitu kemam/uan suatu
bakteri dalam menghentikan sintesis tri/to0an saat berada di lingkungan dengan su/lai
tri/to0an yang melim/ah1 A/abila tri/to0an tidak ada di lingkungannya maka gen se+ara
otomatis mengakti0kan gen yang mensintesis enzim /embentuk tri/to0an1 %el da/at
menginakti0kan gen yang menghasilkan /roduk yang bertentangan7menghambat /roses lain
yang berlangsung dalam sel /ada waktu tersebut2 +ontohnya yaitu gen resisten hanya
dieks/resi ketika antibiotik ada di lingkungannya1
Proses /engendalian eks/resi gen tidak berlangsung se+ara serta merta teta/i terda/at
/roses yang mengatur1 Regulasi koordinat dari kelom/ok gen bersamaan dengan regulasi
/roduksi dari mRNA /olisistronik 8misalnya mRNA /an*ang yang mengandung bebera/a
in0ormasi untuk bebera/a gen91 :adi2 bakteri da/at menyesuaikan lingkungannya dan
mengeks/resi /erangkat gen yang sesuai keadaan lingkungannya serta dibutuhkan dan
diregulasi /ada transkri/si dari gen4gen tersebut1 Makalah ini kami susun guna
mendeskri/sikan lebih detail mengenai /roses /engendalian eks/resi gen yang sebenarnya
ter*adi1
B* Tu-uan
;u*uan /embuatan makalah ini adalah untuk mengetahui /roses /engendalian gen
se+ara menyeluruh beserta mekanisme regulasi gen1 Pengetahuan mengenai /roses
/engendalian gen men*adi dasar da/at dikendalikannya suatu organisme se+ara 0isiologis
yang ter*adi di taha/ selan*utnya2 karena gen suatu organisme mem/engaruhi /roses
0isiologis suatu organisme1
PEMBAHASAN
3en adalah satuan deskret in0omrasi herediter genetik yang terdiri atas sekuens
nukleotida s/esi0ik dalam DNA 8atau RNA2 /ada bebera/a 'irus91 5ks/resi gen 8gene
e</ression9 adalah /roses DNA yang mengarahkan sintesis /rotein 8atau2 dalam bebera/a
kasus2 hanya RNA91 5ks/resi gen yang mengodekan /rotein men+aku/ dua taha/: trankri/si
dan translasi 86am/bell et. al., 2--&91
=ontrol eks/resi gen ter*adi baik /ada eukariot mau/un /rokariot2 hanya sa*a kontrol
eks/resi gen yang ter*adi /ada eukariot bersi0at lebih kom/leks1 Di dalam sel /rokariot ada
bebera/a gen struktural yang dieks/resikan se+ara bersama4sama dengan menggunakan satu
/romoter yang sama1 =elom/ok gen ma+am ini disebut o/eron1 3en4gen se/erti ini /ada
umumnya adalah gen4gen yang terlibat dalam suatu rangkaian reaksi metabolisme yang sama2
misalnya metabolisme laktosa2 arbinosa2 dan lain4lain1 Pengelom/okan gen sema+am ini
membuat sel men*adi lebih e0isien di dalam melakukan /roses eks/resi gen1 %ebaliknya2 di
dalam sistem *asad eukariot2 sistem organisasi o/eron sema+am ini tidak ada karena setia/
gen 8struktural9 di atur oleh satu /romoter tersendiri1
%e+ara umum dikenal dua sistem /engendalian eks/resi gen yaitu /engendalian /ositi0
dan /engendalian negati01 Pengendalian 8regulasi9 /ada suatu gen atau o/eron melibatkan
akti'itas suatu gen regulator1 Pengendalian /ositi0 suatu o/eron artinya o/eron tersebut da/at
diakti0kan oleh /roduk gen regulator1 %ebaliknya2 /engendalian negati0 berarti o/eron
tersebut dinon4akti0kan oleh /roduk eks/resi gen regulator1 Produk gen regulator ada dua
ma+am yaitu akti'ator2 yang ber/eran dalam /engendalian se+ara /ositi0 dan re/resor yang
ber/eran dalam /engendalian se+ara negati01 Akti'ator atau re/resor beker*a dengan +ara
menem/el /ada sisi /engikatan /rotein regulator /ada daerah /romoter yang diaturnya1
Pengikatan akti'ator atau re/resor /ada /romoter ditentukan oleh keberadaan suatu molekul
e0ektor yang biasanya beru/a molekul ke+il2 misalnya asam amino2 gula2 atau metabolit
seru/a lainnya1 Molekul e0ektor yang da/at mengakti0kan eks/resi suatu gen disebut induser2
sedangkan yang menekan eks/resi suatu gen disebut re/resor1 6ontoh /engendalian /ositi0
ada /ada o/eron la+ oleh /rotein akti'ator katabolit 86AP92 dan /engendalian negati0 ada
/ada o/eron la+ /ada E. coli1
Ga./ar (* K0n+r0l 10si+i2 01er0n lac 0le 1r0+ein
a,+i3a+0r ,a+a/0li+ 45AP6* RNA /olimerase
memiliki a0initas tinggi terhada/ /romoter lac hanya
saat /rotein akto'ator katabolit 86AP9 terikat ke situs
DNA /ada u*ung hulu /romoter1 6AP melekat ke
situs DNA4nya hanya saat berasosiasi dengan AMP
siklik 8+AMP92 yang kadarnya dalam sel naik ketika
kadar glukosa turun1 =etika terda/at glukosa2 bahkan
*ika laktosa tersedia2 sel lebih memilih untuk
mengatabolisme glukosa dan membuat enzim4enzim
/eman0aatan laktosa dalam *umlah yang sangat
sedikit 86am/bell et. al., 2--&91
>ila bakteri telah mengkon'ersi laktosa men*adi glikmosa2 dan bila kuantitas glukosa
sudah men+uku/i maka harus ?4galaktosidase harus dihentikan sintesisnya1 Regulasi oleh
glukosa ini disebut re/resi katabolit atau re/resi glukosa1 Proses regulasi ini melibatkan tiga
kom/onen yaitu glukosa2 +AMP 8+y+li+ AMP92 dan 6AP1 6AP meru/akan /rotein yang
mengakti0kan enzim trans+ri/tase2 /rotein ini disandikan oleh regulator gen +ar/1 Asosiasi
antara 6AP dengan trans+ri/tase menyebabakan trans+ri/tase men*adi akti0 dan mam/u
mengkatalis /roses transkri/si1 ;an/a 6AP maka trans+ri/tase men*adi tidak akti01
Mekanisme regulasi oleh +r/ dan glukosa adalah glukosa mengatur akti0itas 6AP melalui
/engaturan +AMP1 Antara 6AP dan +AMP da/at terbentuk asosiasi2 dan asosiasi ini akan
menyebabkan 6AP akti0 ber/eran sebagai a+ti'ator@ 6AP yang terbebas dari +AMP tidak
ber/eran sebagai a+ti'ator1 =uantitas 6am/ berbanding terbalik dengan glukosa1 %aat glukosa
di dalam sel ber*umlah ke+il +AMP ditemukan berada dalam *umlah besar2 dan bila kuantitas
glukosa dalam sel meningkat maka +AMP akan menurun1 Dalam keadaan kuantitas rendah2
+AMP tidak da/at berasosiasi dengan 6AP2 akibatnya 6AP tidak da/at men*adi akti'ator1
:adi /ada saat glukosa rendah 6am/ berada dalam *umlah besar dan membentuk
asosiasi 6am/46AP yang ber/eran men*adi a+ti'ator enzim traskri/tase2 sehingga ter*adi
transkri0si o/eron laktosa1 =etika glukosa meningkat sam/ai *umlah tertentu +AMP menurun
sehingga tidak terbentuk asosiasi +AMP46AP dan 6AP tidak da/at ber/eran sebagai
a+ti'ator dan transkri/si o/eron laktosa tidak berlangsung1
(* K0n+r0l E,s1resi Gen 1ada Pr0,ari0+
Pada bakteri terda/at gen /olisistronik yaitu kum/ulan bebera/a gen yang diatur oleh
satu gen regulator1 Hal ini menyebabkan saat /roses +rans,ri1si akan langsung dihasilkan
bebera/a /rotein1 Amumnya2 kontrol eks/resi gen /ada /rokariot diatur /ada inisiasi
transkri/si dan diatur oleh dua sekuen yaitu sekuen /ada basa 4! yang sekuennya ;;3A6A
dan sekuen /ada /osisi basa 41- yang sekuennya ;A;AA;1 %ekuen ini ber/eran sebagai
/romotor1 =ontrol eks/resi yang ter*adi da/at beru/a re/resi dan atenuasi1 %ebagai +ontoh
kontrol eks/resi gen yang ter*adi dengan re/resi /ada o/eron la+ /ada Escherichia coli1 Pada
o/eron ini2 gen la+. akan mengkodekan /rotein rese/tor dan menem/el /ada daerah o/erator
sehingga transkri/si terhenti1 Namun a/abila terda/at induser beru/a laktosa dalam *umlah
banyak2 laktosa mam/u berikatan dengan re/resor sehingga re/resor terle/as dari daerah
o/erator dan RNA /olimerase da/at melakukan transkri/si1

Ga./ar &* O1er0n lac 1ada E. Coli: sintesis teregulasi dari enzim4enzim yang da/at
diinduksi1 E. Coli menggunakan tiga enzim untuk mengambil dan memetabolisme laktosa1
3en4gen untuk ketiga enzim ini tergugus dalam o/eron lac1 %alah satu gen2 lacZ,
mengkodekan ?4galaktosidase2 yang menghidrolisis laktosa men*adi glukosa dan galaktosa1
3en kedua2 la+B2 mengkodekan /remease2 /rotein membran yang mentrans/or laktosa ke
dalam sel1 3en ketiga la+A2 mengodekan enzim yang disebut transasetilase2 yang 0ungsinya
belum *elas dalam metabolisme laktosa1 3en untuk re/resor lac, lacI, terletak bersebelahan
dengan o/eron lac. %ituasi yang *arang ter*adi 86am/bell et. al., 2--&91
)aktosa adalah gula bisakarida yang tersusun atas glukosa dan galaktosa1 )aktosa
da/at diuraikan men*adi glukosa dan galaktosa dengan bantuan enzim ?4galaktosidase1
>akteri E. coli dalam hidu/nya da/at meman0aatkan baik laktosa mau/un glukosa tergantung
gula mana yang tersedia di lingkungan1 >akteri 51 +oli mem/unyai kemam/uan mensintesis
?4galaktosidase sehingga bila laktosa yang diman0aatkan sebagai sumber karbon maka
bakteri tersebut akan mam/u mengubah laktosa men*adi galaktosa1 Namun bila tersedia
laktosa dan glukosa maka bakteri akan memilih glukosa sebagai sumber karbon2 karena
glukosa meru/akan gula yang lebih langsung diman0aatkan dalam /roses metabolisme1
Pengaturan eks/resi o/eron laktosa dilakukan oleh suatu /rotein regulator yang akan
berinteraksi dengan /romoter2 yang akan menentukan ber*alan atau inisiasi trankri/si yang
dilakukan oleh trans+ri/tase1 Protein /engatur dihasilkan oleh gen regulator2 yaitu gen yang
/roduk eks/resinya ber/eran mengatur eks/resi gen lain1 Dalam kasus o/eron laktosa
terda/at dua gen regulator yaitu gen la+4. dan +r/1 3en la+4i berhubungan dengan kehadiran
laktosa2 sedangkan +r/ berhubungan dengan kehadiran glukosa1 3en yang diatur tersebut
dinamakan gen struktural1 %ebagai +ontoh gen la+C2 la+B dan la+A /ada o/eron laktosa1 :adi
gen regulator ber/eran mengatur eks/resi gen struktural1
3en la+4. akan menghasilkan suatu /oli/e/tida2 yang kemudian setia/ em/at
/oli/e/tida akan membentuk satu molekul /rotein tetramer yang ber/eran sebagai regulator1
Dalam /roses regulasi2 /rotein tetramer ini akan menem/el /ada suatu wilayah /romotor
yang disebut o/eron1 Penem/elan itu ter*adi karena ada ke+o+okan tertentu antara runtunan
basa o/erator dengan /rotein regulator2 akibat adanya /rotein regulator yang menem/ati
wilayah o/erator maka trankri/tase tidak da/at melakukan inisiasi traskri/si2 sehingga gen4
gen terda/at dibelakang /romoter men*adi tidak tereks/resi1 Protein regulator se/erti diatas
bersi0at menghalangi atau menekan ter*adinya traskri/si2 maka disebut re/ressor1 )awan dari
si0at re/ressor disebut akti'ator2 yaitu yang bersi0at mendorong ter*adinya eks/resi gen1
=ehadiran laktosa /ada media tumbuhnya akan mendorong ter*adinya eks/resi o/eron
laktosa atau ter*adi sintesis ?4galaktosidase1 >erarti kehadiran laktosa harus mele/askan
/rotein regulator dari /romotor agar ter*adi eks/resi gen la+C untuk menghasilkan ?4
galaktosidase1 Dalam sisten regulasi ini2 laktosa yang diambil oleh bakteri da/at berinteraksi
dengan /rotein regulator dan asosiasi tersebut akan mengubah kon0igurasi molekul /rotein
regulator1 Perubahan kon0igurasi /ada /rotein re/resor menyebabkan /rotein tersebut
men*adi tidak mam/u berasosiasi dengan o/erator1 Dengan tidak adanya inhibitor /ada
/romoter maka trans+ri/tase men*adi tidak terhalang untuk melakukan inisiasi transkri/si2
dan ter*adi eks/resi gen4gen /ada o/eron laktosa1
6ontoh kontrol eks/resi gen dengan atenuasi /ada o/eron tri/to0an1 A/abila tri/to0an
banyak2 maka translasi oleh ribosom akan ter*adi dengan +e/at sehingga terbentuk loop yang
akan menahan RNA /olimerase untuk berhenti1 =etika tri/to0an telah men*adi sedikit2
ribosom akan ber*alan lambat dan RNA /olimerase akan melakukan transkri/si dengan +e/at
sehingga banyak hasil transkri/si dan tri/to0an1

Ga./ar )* O1er0n trp 1ada E. coli: sintesis terregulasi dari enzim4enzim yang
tere/resikan1 ;ri/to0an adalah asam amino yang dihasilkan oleh sebuah *alur anabolik yang
dikatalisis oleh enzim4enzim yang tereks/resikan1 8a9 =elima gen yang mengodekan sub4unit
/oli/e/tida dari enzim4enzim dalam *alur ini akan berkelom/ok2 bersama4sama dengan
/romoter2 membentuk o/eron trp1 (/erator trp 8situs /engikatan4re/resor9 terletak dalam
/romoter tr/ situs /engikatan4RNA /olimerase1 8b9 Akumulasi tri/to0an2 /roduk akhir *alur
tersebut2 mere/resi transkri/si o/eron trp2 sehingga memblok sintesis semua enzim dalam
*alur itu 86am/bell et. al., 2--&91
&* K0n+r0l E,s1resi Gen 1ada Eu,ari0+
=ontrol eks/resi gen yang ter*adi /ada eukariot diawali /ada taha/:
a1 .nisiasi +rans,ri1si
Dengan adanya /engaruh enhancer yang akan berikatan dengan daerah /romotor
untuk meningkatkan akti'itas RNA /olimerase1
b1 Proses transkri/si dan modi0ikasi
Hal ini beru/a adanya /roses intron s/li+ing sehingga hanya tersisi bagian ekson1
+1 =estabilan transkri/si
%aat hasil transkri/si dibawa dari inti sel menu*u sitosol akan ter*adi /emendekan ekor
/oli4A oleh enzim 8DAN9 /ada !D ke D yang berasosiasi dengan D+a/1
d1 Modi0ikasi +ranslasi
Modi0ikasi ini ter*adi dalam bentuk modi0ikasi ko'alen disebabkan adanya modi0ikasi
kimia se/erti asetilasi2 metilasi2 dan disul0ida bond 0ormation1 6ontoh2 molekul
insulin dihasilkan dalam bentuk inakti0 yang terdiri dari satu /oli/e/tida dan untuk
akti'asinya /oli/e/tida tersebut akan di/otong men*adi dua bagian dan dihubungkan
dengan *embatan disul0ida1
Ga./ar 7* Taa18+aa1 e,s1resi gen yang da1a+ diregulasi
dala. sel8sel eu,ari0+i,* Pada diagram ini2 kotak4kotak berwarna
mengindikasikan /roses4/roses yang /aling sering diregulasi1 %etia/
warna mengindikasikan ti/e molekul uang di/engaruhi 8biruEDNA2
*inggaERNA2 unguE/rotein91 %elubung nukleus yang memisahkan
transkri/si dari translasi dalam sel4sel eukariotik menawarkan
kesem/atan untuk kontrol /as+a4transkri/si dalam bentuk /emrosesan
RNA yang tidak terda/at /ada /rokariota1 %elain itu2 eukariota
memiliki 'ariasi mekanisme kontrol yang lebih banyak sebelum
transkri/si dan melibatkan setia/ taha/ yang ditun*ukkan1 Misalnya2
stidak setia/ /oli/e/tida di/otong4/otong 86am/bell et. al., 2--&91
Ga./ar 9* Se/ua gen eu,ari0+i, dan +rans,ri1nya* %etia/ gen eukariotik memiliki
sebuah /romoter2 yaitu sekuens DNA tem/at RNA /olimerase berikatan dan memulai
transkri/si2 berlan*ut Fke arah hilirG1 %e*umlah unsur kontrol 8warna emas9 terlibat dalam
meregulasi inisiasi transkri/si1 Ansur ini meru/akan sekuens DNA yang terletak di dekat
8/roksimal terhada/9 atau *auh dari 8distal terhada/9 /romoter1 Ansur kontrol distal bisa
dikelom/okkan sebagai enhaser2 yang salah satunya /oliadenasi 8/oli4A9 dalam ekson
terakhir gen ditranskri/sikan men*adi sekuens RNA yang memberi sinyal di tem/at transkri/
di/otong dan ekor /oli4A ditambahkan1 ;ranskri/si mungkin berlan*ut sebanyak ratusan
nukleotida setelah sinyal /oli4A sebelum terminasi1 Pemrosesan RNA terhada/ transkri/
/rimer men*adi mRNA 0ungsional melibatkan tiga langkah: /enambahan tudung G1
Penambahan ekor /oli4A dan /enggabungan ekson1 Dalam sel2 tudung G ditambahkan segera
setelah transkri/si dimulai1 Penyuntingan dan /enambahan /oli4A *uga mungkin ter*adi saat
transkri/si masih berlangsung 86am/bell et. al., 2--&91
KESIMPULAN
#AFTAR PUSTAKA
6am/bell2 N1 A12 :1 >1 Ree+e2 )1 A1 Arry2 M1 )1 6ain2 %1 A1 Wasserman2 P1 H1 Minorsky2 R1
>1 :a+kson1 2--&1 >iologi1 5disi =edela/an1 :ilid 11 5rlangga2 :akarta1