ISOLASI DAN IDENTIFIKASI FUNGI ENDOFIT PADA JARINGAN

MUDA TANAMAN GAHARU (Aquilaria malaccencis Lamk.)

SKRIPSI





Oleh :
RETNO RATIH WAHYUNINGTIAS
081202040
BUDIDAYA HUTAN






PROGRAM STUDI KEHUTANAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
MEDAN
2013
Universitas Sumatera Utara
ISOLASI DAN IDENTIFIKASI FUNGI ENDOFIT PADA JARINGAN
MUDA TANAMAN GAHARU (Aquilaria malaccencis Lamk.)

SKRIPSI
Oleh:
RETNO RATIH WAHYUNINGTIAS
081202040
BUDIDAYA HUTAN

Skripsi sebagai salah satu syarat untuk memperoleh
Gelar sarjana di Fakultas Pertanian
Universitas Sumatera Utara



PROGRAM STUDI KEHUTANAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
MEDAN
2013
Universitas Sumatera Utara
LEMBAR PENGESAHAN
J udul Penelitian : Isolasi dan Identifikasi Fungi Endofit pada J aringan
Muda Tanaman Gaharu (Aquilaria malaccencis Lamk.)
Nama : Retno Ratih Wahyuningtias
NIM : 081202040
Program Studi : Budidaya Hutan




Disetujui oleh
Komisi Pembimbing





Nelly Anna S.Hut, M.Si Dr. Ir. Edy Batara Mulya Siregar, M. S
Ketua Anggota




Mengetahui,





Ketua Program Studi Kehutanan
Siti Latifah, S. Hut, M.Si, Ph.D
Universitas Sumatera Utara
ABSTRACT
RETNO RATIH WAHYUNINGTIAS. Isolation and Identifying of Endophytic
Fungi from Plant Tissues of Agarwood (Aquilaria malaccencis Lamk.). Under
guidance of NELLY ANNA and EDY BATARA MULYA SIREGAR.


Endophytic fungi represent a group of fungi which can live in plant
tissues with the have symbiosis of mutualism with their host. Research about
endophytic fungi of agarwood have never been done previously in Indonesia.
Intention of this research is to isolation, identifying, and comparing fungi endofit
which live in plant tissues of agarwood ( A. malaccensis Lamk.). Sample which is
to used is leaves, small branch, and root which is taken away from Desa
Penungkiran Dusun II Durin J angah Pancur Batu. Isolation and identifying has
been done in Laboratorium Bioteknologi Hutan Fakultas Pertanian Universitas
Sumatera Utara, which is conducted from October December 2012.
The result of this research showed that there are six isolat of endophytic
fungi from root, that is Cladosporium sp1., Aspergillus sp1., Cladosporium sp3.,
Aspergillus sp2., Aspergillus sp3., dan Aspergillus sp4.; four isolat from leaves,
that is Fusarium sp., Acremonium sp., Cladosporium sp4., dan Aspergillus sp5.;
and one isolat from small branch, that is Cladosporium sp2. Marga Cladosporium
has found in each plant tissues of agarwood which is isolated and Acremonium
used to induce the agarwood is only found in just isolate leaf.

Keywords: Endophytic fungi, Sandalwood, Isolation, Identifying
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
RETNO RATIH WAHYUNINGTIAS. Isolasi dan Identifikasi Fungi Endofit pada
J aringan Muda Tanaman Gaharu (Aquilaria malaccencis Lamk.). Di bawah
bimbingan NELLY ANNA dan EDY BATARA MULYA SIREGAR.


Fungi endofit merupakan sekelompok fungi yang dapat hidup di dalam
jaringan tanaman dengan bersimbiosis mutualisme dengan tanaman inangnya.
Penelitian tentang fungi endofit pada gaharu belum pernah dilakukan sebelumnya
di Indonesia. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi,
mengidentifikasi, dan membandingkan fungi endofit yang hidup pada jaringan
muda tanaman gaharu (A. malaccensis Lamk.). Sampel yang digunakan adalah
daun, ranting muda dan akar yang diambil dari Desa Penungkiran Dusun II Durin
J angah Pancur Batu. Isolasi dan identifikasi dilakukan di Laboratorium
Bioteknologi Hutan Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara, yang
dilaksanakan pada bulan Oktober Desember 2012.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa ditemukannya enam isolat fungi
endofit pada akar, yaitu Cladosporium sp1., Aspergillus sp1., Cladosporium sp3.,
Aspergillus sp2., Aspergillus sp3., dan Aspergillus sp4.; empat isolat pada daun,
yaitu Fusarium sp., Acremonium sp., Cladosporium sp4., dan Aspergillus sp5.;
dan satu isolat pada ranting muda, yaitu Cladosporium sp2. Genus Cladosporium
ditemukan pada setiap jaringan muda A. malaccensis Lamk. yang diisolasi dan
Acremonium yang digunakan untuk menginduksi gaharu hanya ditemukan pada
isolat daun saja.


Kata kunci: Fungi endofit, Gaharu, Isolasi, Identifikasi
Universitas Sumatera Utara
RIWAYAT HIDUP
Retno Ratih Wahyuningtias. Dilahirkan di Medan pada tanggal 19 J uni
1989, anak pertama dari pasangan Sugiwahono dan M. Ningrum.
Pada tahun 2001 penulis menyelesaikan pendidikan di SD Al-Washliyah
Medan, pada tahun 2004 menyelesaikan pendidikan di SMP Negeri 16 Medan dan
pada tahun 2007 menyelesaikan pendidikan di SMA Negeri 12 Medan. Pada
tahun 2008 penulis terdaftar sebagai mahasiswa Universitas Sumatera Utara,
Fakultas Pertanian, Program Studi Kehutanan, minat Budidaya Hutan melalui
jalur Ujian Masuk Bersama (UMB).
Selama mengikuti perkuliahan, penulis pernah mengikuti organisasi
Himpunan Mahasiswa Syiva (HIMAS) USU sebagai anggota, penulis juga
mengikuti Organisasi Badan Kenaziran Musholah (BKM) sebagai anggota seksi
publikasi dan dokumentasi. Penulis pernah menjadi asisten Praktikum
Bioteknologi Hutan pada tahun 2012. Penulis melaksanakan Praktek Pengenalan
Ekosistem Hutan (PEH) di Hutan Dataran Tinggi Gunung Sinabung dan Taman
Wisata Alam (TWA) Deleng Lancuk pada J uli 2010. Penulis melaksanakan
Praktek Kerja Lapang (PKL) di KPH Banyumas Barat dari tanggal 1 Februari
sampai 1 Maret 2012.
Penulis melaksanakan penelitian pada bulan OktoberDesember 2012 di
Laboratorium Bioteknologi Hutan dengan judul Isolasi dan Identifikasi Fungi
Endofit pada J aringan Muda Tanaman Gaharu (Aquilaria malaccencis Lamk.) di
bawah bimbingan Nelly Anna, S. Hut, M. Si dan Dr. Ir. Edy Batara Mulya S, MS.
Universitas Sumatera Utara
KATA PENGANTAR
Alhamdulillah, puji dan syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT
atas segala karuniaNya sehingga skripsi ini berhasil diselesaikan. Adapun judul
dari skripsi ini adalah Isolasi dan Identifikasi Fungi Endofit pada Jaringan
Muda Tanaman Gaharu (Aquilaria malaccencis Lamk.).
Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi jenis-jenis
fungi endofit yang hidup pada jaringan muda tanaman gaharu (A. malaccensis
Lamk.) serta membandingkan fungi-fungi tersebut. Skripsi ini diajukan untuk
melengkapi salah satu syarat menyelesaikan perkuliahan pada Program Studi
Kehutanan Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara.
Dengan segenap keikhlasan dan kerendahan hati penulis mengucapkan
terima kasih yang sebesar-besarnya kepada:
1. Kedua orangtua tercinta, Ayahanda Sugiwahono dan Ibunda M. Ningrum
yang telah membesarkan penulis dengan segenap cinta kasih, pengertian,
pengorbanan serta doa yang tiada terputus kepada penulis. Serta kepada
adik-adik tersayang (Ridho A. Kusuma, Rahma P. Kusuma, Raghilya P.
Kusuma dan Nila A. Nabila) atas dukungan moril kepada penulis.
2. Ibu Nelly Anna, S. Hut, M. Si dan Bapak Dr. Ir. Edy Batara Mulya S, MS
selaku Dosen Pembimbing yang telah memberikan bimbingan, arahan,
waktu, perhatian dan saran dalam penyelesaian penelitian dan
penyempurnaan skripsi ini.
3. Sahabat-sahabatku Eka Sri Mulyani, Lisdayani, Sri Wulandari, Deane P.
Besty, Itonamy Boru Tonga , Hasbi Nurainun, yang telah banyak membantu
dan memberi dukungan moril kepada penulis.
Universitas Sumatera Utara
4. Teman-teman senasib seperjuangan di Laboratorium Bioteknologi Hutan
Mega B. Sianturi, Melva Gultom, Romasli Nadeak, J uliance Munthe,
Wahman Saragih dan Vera Wati Manullang, atas semua semangant dan canda
tawanya selama pelaksanaan penelitian.
5. Rekan-rekan stambuk 2008, terkhusus Budidaya Hutan 2008, atas
kebersamaannya selama mengikuti kegiatan perkuliahan dan praktikum yang
menyenangkan.
6. Seluruh pihak yang membantu penulis dalam menyelesaikan skripsi ini yang
tidak dapat disebutkan satu persatu.
Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih jauh dari kesempurnaan baik
dari segi materi maupun tehnik penulisannya. Oleh karena itu, penulis sangat
mengharapkan kritik dan saran yang membangun demi penyempurnaan skripsi
ini. Semoga hasil penelitian ini berguna bagi kita semua, sebagai dasar penelitian
selanjutnya dan menyumbangkan ilmu pengetahuan bagi kemajuan dunia
pendidikan khususnya dalam bidang kehutanan.


Medan, J anuari 2013

Penulis
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR ISI
Halaman
ABSTRACT ....................................................................................................... i
ABSTRAK ......................................................................................................... ii
RIWAYAT HIDUP ........................................................................................... iii
KATA PENGANTAR ....................................................................................... iv
DAFTAR ISI ..................................................................................................... vi
DAFTAR GAMBAR ........................................................................................ vii
DAFTAR TABEL ............................................................................................ viii

PENDAHULUAN
Latar Belakang .......................................................................................... 1
Tujuan Penelitian ...................................................................................... 3
Manfaat Penelitian .................................................................................... 3
TIJAUAN PUSTAKA
Fungi Endofit ............................................................................................. 4
Beberapa J enis Fungi Endofit .................................................................... 6
Interaksi Fungi Endofit dengan Tanaman .................................................. 8
Medium ...................................................................................................... 11
Karakteristik Gaharu .................................................................................. 13

METODOLOGI PENELITIAN
Waktu dan Tempat Penelitian ................................................................... 15
Bahan dan Alat Penelitian ......................................................................... 15
Pelaksanaan Penelitian .............................................................................. 15
Pengambilan Sampel ............................................................................ 15
Pembuatan Media PDA ........................................................................ 16
Isolasi, Pemurnian dan Identifikasi Fungi Endofit ............................... 13
Dokumentasi ......................................................................................... 17

HASIL DAN PEMBAHASAN
Isolasi Fungi Endofit .................................................................................. 18
Identifikasi Fungi Endofit .......................................................................... 22
Perbandingan Fungi Endofit dan Interaksinya dengan Tanaman .............. 25

KESIMPULAN DAN SARAN
Kesimpulan ............................................................................................... 28
Saran .......................................................................................................... 28
DAFTAR PUSTAKA ........................................................................................ 29
LAMPIRAN ....................................................................................................... 31
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR GAMBAR
No. Halaman
1. Koloni Aspergillus sp5. setelah berumur 3 hari pada
media PDA (A) dan bentuk mikroskopik (B),
konidia (a), konidiofor (b), spora (c) ........................................................ 18
2. Kolo
ni Aspergillus sp2. setelah berumur 5 hari pada
media PDA (A) dan bentuk mikroskopik (B), konidia (a),
konidiofor (b), spora (c) ........................................................................... 19
3. Koloni Cladosporium sp2. setelah berumur 5 hari pada
media PDA (A) dan bentuk mikroskopik (B), spora (a),
konidiofor (b) ........................................................................................... 20
4. Koloni Fusarium sp. setelah berumur 7 hari pada
media PDA (A) dan bentuk mikroskopik (B),
konidiofor (a), makrokinidia (b) .............................................................. 20
5. Koloni Acremonium sp. setelah berumur 7 hari pada
media PDA dan bentuk mikroskopik (B),
konidiofor (a), spora (b) ........................................................................... 21

Universitas Sumatera Utara
DAFTAR TABEL
No. Halaman
1. Hasil identifikasi makroskopis dan mikroskopis isolat
fungi endofit dari jaringan daun, ranting muda dan akar
dari tanaman A. Malaccensis Lamk. ........................................................ 23
2. Kecepatan pertumbuhan dari isolasi fungi endofit pada
jaringan daun, ranting muda, dan akar. .................................................... 24
Universitas Sumatera Utara