PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}

LAPORAN BIOLOGI
SIMULASI SINTESIS PROTEIN
Di susun oleh kelompok 3 {XI IPA 5} :
Ketua kelompok : Muhammad Arifin
Anggota : 1 !ia Adeka"anti #asin
$ %im" Motalisa Putra
3 Ar"a A&idmurs"id
' I(a Infanastas"a )iratika
5 Anind"a Purnamasari
PEMERINTAH KABUPATEN SUMBAWA
DINAS PENDIDIKAN NASIONAL
SEKOLAH MENENGAH ATAS NEGERI 1 SUMBAWA BESAR
TAHUN AJARAN 2009/2010
Simulasi Biologi Page 1
PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}
1. PENDAHULUAN
A. Latar Belaa!"
*am&aran tentang sintesis protein dapat dii&aratkan seperti saat kita memasak
makananProtein kita i&aratkan se&agai makanan+ agar dapat diperoleh makanan
dengan (ita rasa "ang le,at maka diperlukan &ahan dan proses "ang tepat Demikian
-uga dalam sintesis protein+ &ahan dan rangkaian prosesn"a tertentu dan urut .intesis
protein ter-adi di dalam ri&osom dan pengaturan sintesis protein dilakukan oleh D/A
dan !/A di dalam inti
0erkaitan dengan hal di atas+ maka kami melakukan praktikum "ang di&im&ing
oleh guru mata pela-aran &iologi untuk memahami &ah1a proses sintesis protein
&erlangsung di dalam sel
B. Pe!"ert#a!
.intesis protein+ "aitu proses pen"usunan sen"a1a protein dengan mem&entuk
rangkaian rantai polipeptida
.en"a1a2sen"a1a se&agai &ahan dan pelaksana sintesis protein antara lain D/A
3!antai .ense dan !antai Antisense4+ !/A duta+ !/A transfer+ !/A ri&osom
5ahapan proses sintesis protein antara lain seperti &erikut
a. Tra!$r#%$#
5ranskripsi adalah pen(etakan m!/A 3kode4 oleh D/A 3D/A
template6D/A sense4 dengan menggunakan en,im !/A polimerase Adan"a
en,im !/A polimerase ini akan men"e&a&kan rangkaian double helix se&agian
akan mem&uka+ aki&atn"a &asa2&asa pasangann"a men"usun Adenin 3A4 pada
m!/A dan seterusn"a 7asil pen"usunan m!/A "ang sudah -adi akan
meninggalkan inti untuk melekat pada ri&osom+ "ang merupakan organela
pelaksana sintesis protein
&. Tra!$la$#
Kode pada m!/A akan ter&a(a oleh ri&osom dengan di&antu oleh t!/A
"ang terdapat di dalam sitoplasma t!/A akan datang untuk mem&a1a asam
amino "ang sesuai dengan kode "ang di&a1a m!/A terse&ut Kemudian t!/A
akan &erga&ung dengan m!/A "ang sesuai dengan kode pasangan &asa 0agian
pada t!/A "ang terli&at ini dise&ut antikodon+ "ang &erhu&ungan dengan tiga
&asa pada pita m!/A "ang dise&ut dengan kodon Asam amino akan &er-a-ar2
-a-ar dalam urutan "ang sesuai dengan koden"a Dari hal ini akan ter&entuk
protein "ang &erfungsi se&agai en,im+ dalam mengatur meta&olisme sel dan
reproduksi
Simulasi Biologi Page
PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}
. *
A 5
A 8
. *
Ket : . 9 sitosin
8 9 urasil
* 9 guanine
A 9 adeni
5 9 tinin
2. TUJUAN PRAKTIKUM
Memahami &agaimana proses sintesis protein dapat &erlangsung di dalam sel
'. METODELOGI SIMULASI
Praktikum 0iologi "ang kami lakukan dapat kami pertanggung-a1a&kan karena
telah dilakukan praktikum dengan (ara kualitatif+ dengan langkah2langkah se&agai
&erikut :
a Men"iapkan alat2alat dan &ahan2&ahan
!" Melakukan simulasi
( Men-a1a& pertan"aan
d Mem&uat laporan
(. Alat )a! Ba*a!
1 Kertas karton putih : lem&ar digunting men-adi ;< lem&ar 3 ukuran = dari
kertas legal 4
$ Kertas karton 1arna 3 merah+ kuning+ hi-au+ &iru 4+
3 *unting+ >em+
' 0enang 1ol6 tali 3 ;? (m 4
5 penggaris+ Pensil+ .pidol ke(il+
; Printout ta&el &ahan simulasi sintesis protein 3dari guru pem&im&ing4
+. La!"a* &a*a! S#,-la$#
1. Me,&-at t/%# er-0-t
a Pertama menggunting kertas karton manila sesuai dengan pola &entuk topi keru(ut
se&an"ak ' &uah
!antai anti sense : topi merah
!antai sense : topi kuning
Simulasi Biologi Page #
$NA
RNA
PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}
!/A ri&osom :topi hi-au
!/A duta : topi &iru
& 0entuklah guntingan pola terse&ut men-adi se&uah topi keru(ut
( 5erakhir+ mengelem &agian pinggir topi 8ntuk merekatkan kertas agar tidak
mudah lepas
% Me,&-at %a%a! /)/!
a Pertama+ menggunting kertas karton manila putih se&esar = kertas legal se&an"ak
;' &uah
& Menulis daftar kodon di kertas karton manila "ang telah di gunting pada &agian
depan dan asam aminon"a pada &agian &elakang dengan &ersih dan teratur
&" Menggunting &enang 1ol se&an"ak ;' &uah dengan pan-ang masing @ masing
&enang 1ol "aitu ;? (m+
d Mengikatkan &enang 1ol "ang telah di gunting pada &agian atas kertas karton
"ang se&elumn"a telah dilu&angi pada sisi kiri dan kanan &agian atas
1. LANGKAH SIMULASI
1 Pilihlah ' orang sis1a kelas XII IPA 5 "ang akan ditun-uk men-adi D/A dan !/A :
a !antai anti sense : topi merah AA &erperan se&agai penerima a1al kodon
& !antai sense : topi kuning AA &erperan se&agai mener-emahkan kodon
&" !/A duta : topi &iru AA &erperan se&agai mener-emahkan kodon
Simulasi Biologi Page '

AAU
N
FRON
T
BAC
K
ASAM
AMINO
KODO
N
GAMBAR : PAPAN KODON
PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}
(" !/A ri&osom :topi hi-au AA &erperan se&agai mener-emahkan kodon dan
memanggil !/A transfer
$ .is1a lainn"a men-adi !/A transfer+ "ang mengenakan papan kodon6asam amino+
3 Kemudian ikutilah instruksi dari Pem&ina
' .etelah soal mengenai kode genetik di&erikan kepada rantai antisense maka rantai
sense akan menter-emahkan kode geneti( "ang di transfer oleh rantai antisense
5 .is1a "ang &erperan se&agai !antai sense mentransfer kode geneti( ke !/A duta
; .is1a "ang &erperan se&agai !/A duta menter-emahkan kode geneti( dari rantai
sense "ang kemudian di transfer lagi menu-u !/A ri&osom
: .is1a "ang &erperan se&agai !/A ri&osom menter-emahkan kode geneti( dari !/A
duta dan memanggil !/A transfer sesuai dengan kodon "ang telah diter-emahkan
< .is1a "ang &erperan se&agai !/A transfer akan datang memenuhi panggilan sesuai
dengan urutan kodon "ang diter-emahkan oleh !/A !i&osom 3 pers"artan: sesuai
aturan "ang &erlaku : -ika "ang dipanggil adalah kodon AA8 maka "ang akan datang
adalah kodon 88A 4
B .etelah !/A transfer dipanggil dan &erurutan dari kiri ke kanan kemudian masing @
masing !/A transfer &er&aris mem&entuk suatu susunan "ang teratur
1? .etelah itu !/A transfer mem&alik papan kodon sehingga akan ter&entuk suatu
susunan kata 3 misal : K8MA7A DAMA/*4 atau 3%8.5 )C! )8//# 4 .usunan
kata "ang men-adi kalimat inilah "ang di i&aratkan se&agai protein hasil proses
sintesis protein dalam sel 3papan kodon "ang memiki D.5CPE atau D.5A!5E akan
men-adi spasi pada susunan kalimat terse&ut4
2/!t/* Jala!!3a Pr/$e$ S#!te$#$ Pr/te#!
!A/5AI A/5I.F/.F
AAA TGT SSG
!A/5AI .F/.F
TTT ASA GGS
!/A D85A
AAA UGU SSG
!/A !I0C.CM
UUU ASA GGS
Simulasi Biologi Page 5
PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}
!/A 5!A/.)F!
AAA UGU SSG
DAFTAR KODON DAN ASAM AMINO
BASA
PERTAMA
BASA KEDUA
BASA
KETIGA
U S A G
KODON
A.
AMINO KODON
A.
AMINO KODON
A.
AMINO KODON
A.
AMINO
U
UUU B USU S UAU E UGU 2 U
UUS B USS S UAS E UGS 2 S
UUA D USA 4 UAA STOP UGA STOP A
UUG D USG 4 UAG STOP UGG U G
S
SUU L SSU P SAU H SGU K U
SUS L SSS P SAS H SGS K S
SUA L SSA P SAA J SGA M A
SUG L SSG P SAG J SGG M G
A
AUU I ASU T AAU N AGU 5 U
AUS I ASS T AAS N AGS 5 S
AUA I ASA T AAA O AGA R A
AUG START ASG T AAG O AGG R G
G
GUU 6 GSU A GAU W GGU G U
GUS 6 GSS A GAS 7 GGS G S
GUA 6 GSA A GAA 8 GGA G A
GUG 6 GSG A GAG 9 GGG G G
:. DATA HASIL SIMULASI
a. .oal 1 : mem&uat kalimat dari data kodon "ang di&erikan oleh Pem&ina6*uru
SGU TGG SGA GSS SAT GSA TGA TTA GSG SGG GSA AAS GGS
.ehingga akan menghasilkan asam amino "ang men"erupai kalimat+ "aitu
K8MA7A DAMA/*
!antai
Antisense !antai .ense !/A duta !/A ri&osom !/A transfer
Asam
Amino
.*8 *.5 .*8 *.A .*8 K
5** A.. 8** A.. 8** 8
.*A *.5 .*A *.8 .*A M
Simulasi Biologi Page )
PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}
*.. .** *.. .** *.. A
.A5 *5A .A8 *8A .A8 7
*.A .*5 *.A .*8 *.A A
5*A A.5 8*A A.8 8*A
55A AA5 88A AA8 88A D
*.* .*. *.* .*. *.* A
.** *.. .** *.. .** M
*.A .*5 *.A .*8 *.A A
AA. 55* AA. 88* AA. /
**. ..* **. ..* **. *
&. .oal $ : mem&uat kalimat dari data kodon "ang di&erikan oleh Pem&ina6*uru
TTG AAG TGA GAA AAA TGG AUG SGA ATT USS TST TAG SGG TAT
!antai
Antisense !antai .ense !/A duta !/A ri&osom !/A transfer
Asam
Amino
55* AA. 88* AA. 88* D
AA* 55. AA* 88. AA* C
5*A A.5 8*A A.8 8*A
*AA .55 *AA .88 *AA #
AAA 555 AAA 888 AAA C
5** A.. 8** A.. 8** 8
A8* 5A. A8* 8A. A8*
.*A *.5 .*A *.8 .*A M
A55 A88 A88 8AA A88 I
8.. A** 8.. A** 8.. .
5.5 A*A 8.8 A*A 8.8 .
5A* A5. 8A* A8. 8A*
.** *.. .** *.. .** M
5A5 A5A 8A8 A8A 8A8 F
.ehingga akan menghasilkan asam amino "ang men"erupai kalimat+ "aitu
DO 8OU MISS ME
0. Mem&uat kalimat menggunakan kodon pada !antai Antisense
Kalimat : LALA BAONG
Asam Amino !/A transfer !/A ri&osom !/A duta !antai .ense
!antai
Antisense
> .88 *AA .88 *AA .55
A *.8 .*A *.8 .*A *.5
> .8. *A* .8. *A* .5.
Simulasi Biologi Page *
PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}
A *.. .** *.. .** *..
A8* 8A. A8* 5A. A5*
0 888 AAA 888 AAA 555
A *.8 .*A *.8 .*A *.5
C AA* 88. AA* 55. AA*
/ AA8 88A AA8 55A AA5
* **8 ..A **8 ..A **5
Dan setelah dilakukan per(o&aan atau simulasi akan menghasilkan susunan kodon pada
!antai Antisense se&agai &erikut :
STT GST STS GSS STG TTT GST SSG SST GGT
;;< tapi dari hasil simulasi kelas "ang kami lakukan ter-adi mutasi6kekeliruan 4
). .oal ' : mem&uat kalimat dari kodon "ang di&erikan oleh Pem&ina6 guru
3Ket: dikarenakan kesalahan "ang kami lakukan+ Pak Iin selaku Pem&ina .imulasi
mem&erikan tugas &aru kepada kami untuk mem&uat kalimat dari kodon4
SAG TGG TST AST TAA TSA AAA AGA TAG TGA TGG AAS AAT GAA
!antai
Antisense !antai .ense !/A duta !/A ri&osom !/A transfer
Asam
Amino
.A* *5. .A* *8. .A* %
5** A.. 8** A.. 8** 8
5.5 A*A 8.8 A*A 8.8 .
A.5 5*A A.8 8*A A.8 5
5AA A55 8AA A88 8AA
5.A A*5 8.A A*8 8.A )
AAA 555 AAA 888 AAA C
A*A 5.5 A*A 8.8 A*A !
5A* A5. 8A* A8. 8A*
5*A A*5 8.A A*8 8.A )
5** A.. 8** A.. 8** 8
AA. 55* AA. 88* AA. /
AA5 55A AA8 88A AA8 /
*AA .55 *AA .88 *AA #
.ehingga akan menghasilkan asam amino "ang men"erupai kalimat+ "aitu :
JUST 4OR 4UNN8
=. Ke$#,%-la!
Dari simulasi "ang kami lakukan Dapat diketahui &ah1a proses sintesis protein
dimulai dari diteriman"a kode geneti( oleh !antai antisense "ang kemudian di transfer ke
Simulasi Biologi Page +
PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}
!antai sense !antai sense akan menter-emahkann"a kodon dari rantai antisense dan
mentransfer lagi ke !/A duta dan mener-emahkan kodon dari !antai sense+ kemudian
!/A duta mentransfer ke !/A ri&osom dan !/A ri&osom menter-emahkann"a+ dan
akan di&antu oleh !/A transfer !/A transfer akan datang dengan mem&a1a asam
amino "ang sesuai dengan kodon "ang diter-emahkan oleh !/A ri&osom Asam amino
akan &er-a-ar2-a-ar dalam urutan "ang sesuai dengan koden"a Dari hal ini akan ter&entuk
protein "ang &erfungsi se&agai en,im+ dalam mengatur meta&olisme sel dan reproduksi
Simulasi Biologi Page ,
PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}
Simulasi Biologi Page 1-