Anda di halaman 1dari 5

TUGAS BIOKIMIA

STRUKTUR PROTEIN

Pilih suatu protein (terutama protein globular) yang telah diketahui struktur 3D-nya dan
jawablah pertanyaan berikut:
1. Apa nama lengkap protein tersebut?
Jawab: Enzim Phosphoglycerate Mutase pada manusia.
2. Protein tersebut termasuk ke dalam golongan protein sederhana atau konjugasi?
Jawab: Protein konjugasi, karena mengikat Cl
-
dan asam sitrat.

3. Apakah struktur protein tersebut termasuk struktur protein tersier atau kuarterner?
Jawab: Struktur protein kuarterner, karena terdiri dari 2 subunit.
4. Berapakah jumlah asam amino dari masing-masing subunitnya?
Jawab:
Jumlah asam amino pada subunit 1 adalah 246, sedangkan pada subunit 2 adalah 243.
Subunit 1:

Subunit 2:

5. Tunjukkan segmen-segmen struktur sekundernya dan tentukan jumlahnya masing-masing!
Jawab:

Subunit 1
: coils (2, 12-31, 49-52, 60, 75-78, 86-98, 108, 117-155, 170, 179, 199-200, 209-214, 222-
229, 234-235, dan 245-246)
: -helix (32-48, 61-74, 99-107, 109-116, 156-169, 171-178, 187-198, 201-208, dan 236-
244)
: -sheet (3-11, 53-59, 79-85, 180-186, 215-221, dan 230-233)

Coils
-sheet
-helix
Subunit 2
: coils (2, 12-31, 49-52, 60, 75-78, 86-98, 108, 117-155, 170, 179, 199-200, 209-214, 227-
229, 234, dan 245-246)
: -helix (32-48, 61-74, 99-107, 109-116, 156-169, 171-178, 187-198, 201-208, dan 235-
243)
: -sheet (3-11, 53-59, 79-85, 180-186, 215-226, dan 230-233)

6. Tentukan ujung N dan ujung C dari masing-masing subunitnya!
Jawab:
Subunit 1:

Ujung N

Subunit 2:

Ujung C
Ujung N

7. Tentukan bentuk permukaan dari protein tersebut!
Jawab: Globular, karena terdiri dari rantai-rantai polipeptida yang melipat sehingga
membentuk bola. Protein terdiri dari 2 subunit, dimana 2 subunit tersebut dibedakan atas
warna biru dan merah muda.

Ujung C