Anda di halaman 1dari 24

Soal Perhitungan 4

Biokat
Chandra Dwi Prakoso
1206212445
Soal 3.1
Penentuan nilai Km dan vmax. Laju awal reaksi katalisis
enzim untuk konsentrasi substrat yang berbeda pada tabel
3P1.1 (dibawah)
a) Evaluasi nilai vmax dan Km menggunakan plot Lineweaver-
Burk
b) Menggunakan plot Eadie-Hofstee, evaluasi Vmax dan Km
c) Hiunglah standar deviasi kemiringan dan intersept pada setiap
metode

s, mol/L V, mol/(L.min) x 10
6
4.10E-03 1.77E+02
9.50E-04 1.73E+02
5.20E-04 1.25E+02
1.03E-04 1.06E+02
4.90E-05 8.00E+01
1.06E-05 6.70E+01
5.10E-06 4.30E+01
Jawaban soal 3.1
a) Membuat plot grafik dengan 1/v sebagai nilai y dan 1/S
sebagai nilai x, berdasarkan persamaan berikut
1

+
1


1/s 1/v
2.44E+02 5649.718
1.05E+03 5780.347
1.92E+03 8000
9.71E+03 9433.962
2.04E+04 12500
9.43E+04 14925.37
1.96E+05 23255.81
m
b
Jawaban soal 3.1
Berdasarkan perhitungan pada ms.excell, nilai dari standar
deviasi (R) kemiringan grafik adalah 0,9578 dan intersepnya
adalah 7624,9. (jawaban c)
Nilai vmax = 1/ intersep = 1/7624,9 = 1,31 E-04 mol/L min
Nilai Km= m* vmax = 0,0808*vmax = 0,0808*1,31 E-04 = 1,05
E-05 mol/L

y = 0.0808x + 7624.9
R = 0.9174
0
5000
10000
15000
20000
25000
0.00E+00 5.00E+04 1.00E+05 1.50E+05 2.00E+05 2.50E+05
1
/
v

1/s
Plot Lineweaver-Burk
Series1
Linear (Series1)
Jawaban soal 3.1
b) Membuat plot grafik dengan v sebagai nilai y dan v/s
sebagai nilai x, berdasarkan persamaan berikut
=


v/s v
4.32E-02 1.77E-04
1.82E-01 1.73E-04
2.40E-01 1.25E-04
1.03E+00 1.06E-04
1.63E+00 8.00E-05
6.32E+00 6.70E-05
8.43E+00 4.30E-05
b
m
Jawaban soal 3.1
Berdasarkan perhitungan pada ms.excell nilai standar deviasi
(R) kemiringan grafik adalah 0,8327 dan intersepnya adalah
0,0001. (jawaban c)
Nilai vmax = intersep = 1,0 E-4 mol/L min
Nilai Km = -m = -(-1 E-05) = 1 E-05 mol/L
y = -1E-05x + 0.0001
R = 0.6934
0.00E+00
2.00E-05
4.00E-05
6.00E-05
8.00E-05
1.00E-04
1.20E-04
1.40E-04
1.60E-04
1.80E-04
2.00E-04
0.00E+00 2.00E+00 4.00E+00 6.00E+00 8.00E+00 1.00E+01
v

v/s
Plot Eadie-Hofstee
Series1
Linear (Series1)
Soal 3.2
Reaksi enzim tumpak. Sebuah enzim den Km sebesar 1 x 10
-3

M diuji menggunakan konsentrasi awal substrat sebesar 3 x
10
-5
M. Setelah 2 menit, 5 persen substrat terkonversi. Berapa
banyak substrat akan terkonversi setelah 10, 30, dan 60 menit
?
Jawaban soal 3.2
Dengan mengetahui persamaan enzimatis Michaelis-Menten

=
.
+

Lalu mengintegralkan persamaan diatas dengan batas 0 - t dan
s
0
-s, didapatkan hasil seperti berikut
. =
0
+


Menggunakan nilai konversi pada menit ke 2 didapatkan nilai
vmax sebagai berikut
. 2 = 5% (310
5
) +10
3

100
95

= 0,02610
3
M/min
Jawaban soal 3.2
Jumlah substrat setelah t menit (s)adalah
. =
0
+
0
ln
0,02610
3
. = 310
5
+10
3
310
5
10
3

0,02610
3
. = 310
5
0,01 10
3

Persamaan diatas mempunyai dua variabel yang tidak
diketahu ( t dan s). Jika variabel t diketahu, maka nilai s dapat
diketahui pula secara analitik
(t=10 menit)
0,02610
3
. 10 = 310
5
0,01 10
3

(t=30 menit)
0,02610
3
. 30 = 310
5
0,01 10
3

(t=60 menit)
0,02610
3
. 60 = 310
5
0,01 10
3



Jawaban soal 3.2

Soal 3.3
Kinetika enzim multilokasi. Anggaplah bahwa sebuah enzim
memiliki dua sisi aktif sehingga substrat yang terkonversi menjadi
produk melalui rangkaian reaksi sebagai berikut

+


+


+

() +
Turunkan laju pembentukan P dengan mengasumsikan quasi-steady
state untuk (ES) dan (ESS)


k
1
K
-1
k
2
k
-2
k
3
k
4
Jawaban soal 3.3
1.

0 =
1

1

2
+
2
+

3

4

2.

0 =
2

2

3

3.

0 =
1

1

4

4.

=

1
+
4

1
=
5. =

2

2
+
3
=

2

2
(
2
+
3
)

6. = + + = +

+

2

2
(
2
+
3
)
=
[](1 +

+

2

2
(
2
+
3
)
)
7. =
[]
(1+

+

2

2
(
2
+
3
)
)

Jawaban soal 3.3

=
3
+
4

=
3

2

2
(
2
+
3
)
+
4

= [](
3

2

2

2
+
3
+
4

=

3

2

2

2
+
3
+
4

1+

+

2

2

2
+
3

=

3

2

2

2
+
3
+
4
[]
+[]+

2

2

2
+
3




Soal 3.6
Reaksi reversible. Untuk sebuah reaksi reversible

+ +
Tunjukan bahwa:
a) Reaksi akan berjalan jauh kekanan hanya jika k
1
k
2
>>k
-1
k
-2
b) Parameter vs, vp, Ks, dan Kp tidak independen
c) Dalam kondisi apakah plot Lineweaver-Burk dari persamaan
b) menghasilkan nilai yang berguna
d) Integrasi dp/dt persamaan diatas untuk mendapatkan p(t)
dalam bentuk t dan nilai p pada equlibrium
= +(1

)

e) Jika Ks=Kp, tunjukan bahwa B=0
k
1
k
-1
k
2
k
-2
Jawaban soal 3.6
1.

0 =
1

1

2
+
2

=

1
+
2

1
+
2
= [](

1
+
2

1
+
2
)
2. = + = +

1
+
2

1
+
2
=
1 +

1
+
2

1
+
2
= [](

1
+
2
+
1
+
2

1
+
2
)
3. = [](

1
+
2

1
+
2
+
1
+
2

)
4. =

=
2

2
=
2


1
+
2

1
+
2
+
1
+
2

2


1
+
2

1
+
2
+
1
+
2

= [](

1

2

1

1
+
2
+
1
+
2

)
Jawaban soal 3.6
Dengan menentukan bentuk parameter vs, vp, Kp dan Ks
sebagai berikut:
=
2
[] , =

1

2
, =

1
+
2

1
, =

1

2

Didapatkan persamaan:
=

2
[]

1
[]
+ +

2

1


=

[]
1 +
[]

+
[]



Jawaban soal 3.6
=

[]
1 +
[]

+
[]

(

1

1
)
1 +
[]

+
[]


a) Jika nilai k
1
k
2
>>k
-1
k
-2
maka persamaan v akan menjadi
=


1 +
[]

+
[]


Dengan melihat persamaan diatas terbukti bahwa v hanya
dipengaruhi konsentrasi [S] yang bergerak jauh ke arah produk
(kanan reaksi)
Jawaban soal 3.6
Pada kondisi equilibrium laju reaksi reversible adalah nol.
Sehingga persamaan v menjadi
=

[]

[]

1 +
[]

+
[]

= 0

[]

[]

= 0

=
[]

[]

=



Dengan adanya bentuk persamaan keserimbangan diatas
keempat parameter kinetik tersebut terbukti saling terkait
(tidak independen)

Jawaban soal 3.6

Soal 3.9
Kinetika Inhibitor. Pestisida menginhibisi aktivitas sebagian
enzim A, yang dapat diuji dalam mencari tahu keberadaan
pestisida dalam sampel yang tidak diketahui
a) Dalam laboratorium, data laju awal ditampilkan dalam tabel
3.P91. Apakah pestisida inhibitor kompetitif atau
nonkompetitif? Evaluasi nilai Ki, vmax, dan Km
b) Setelah 50 mL larutan enzim bagian (a) dicampurkan dengan
50 mL 8x10
-4
M substrat dan 25 mL sampel, laju inisial reaksi
didapatkan sebesar 18 mol/min. Berapa konsentrasi
peptisida dalam sampel dengan mengasumsikan tidak ada
inhibitor lain atau substrat dalam sampel?
Jawaban soal 3.9
Untuk mengevaluasi parameter kinetika, hubungan antara S
dan V diplot terlebih dahulu menggunakan persamaan
Lineweaver-Burk
1

+
1



S, mol/L
V, mol/(L .min) x 10
6
Tanpa inhibitor 10
-5
M inhibitor
3.30E-04 5.60E-05 3.70E-05
5.50E-04 7.10E-05 4.70E-05
6.70E-04 8.80E-05 6.10E-05
1.65E-03 1.29E-04 1.03E-04
2.21E-03 1.49E-04 1.25E-04
Jawaban soal 3.9
Dengan Inhibitor

1/s 1/v
3.03E+03 2.70E+04
1.82E+03 2.13E+04
1.49E+03 1.64E+04
6.06E+02 9.71E+03
4.52E+02 8.00E+03
Tanpa Inhibitor
1/s 1/v
3.03E+03 1.79E+04
1.82E+03 1.41E+04
1.49E+03 1.14E+04
6.06E+02 7.75E+03
4.52E+02 6.71E+03
y = 7.5165x + 5357.3
R = 0.9724
y = 4.3628x + 5097.1
R = 0.982
0.00E+00
5.00E+03
1.00E+04
1.50E+04
2.00E+04
2.50E+04
3.00E+04
0.00E+00 5.00E+02 1.00E+03 1.50E+03 2.00E+03 2.50E+03 3.00E+03 3.50E+03
1
/
v

1/s
Plot Lineweaver-Burk
Dengan Inhibitor
Tanpa Inhibitor
Linear (Dengan Inhibitor)
Linear (Tanpa Inhibitor)
Jawaban soal 3.9
Secara grafis, terlihat bahwa kedua garis tersebut mempunyai
nilai intersep yang sama sehingga dapat dianggap inhibisi yang
terjadi merupakan inhibisi kompetitif
Secara perhitungan didapatkan parameter kinetika sebagai
berikut
1) =
1

=
1
5097,1
= 1,96 04
2) = . = 1,96 04 4,36 = 8,55 04
3)

= . = 1,96 04 7,52 = 1,47 03


4) =

1
=
10
5
(
1,4703
8,5504
1)
= 1,39 05

Jawaban soal 3.9
Konsentrasi substrat setelah pengenceran adalah

=
8. 10
4
. 50
50 +50 +25
= 3,2.10
4

Menggunakan persamaan laju dengan inhibitor kompetitif total
=
.


+(1 +

)

Didapatkan persamaan i sebagai berikut
=
.

1
= 1,39 05
1,96 04.3,2 04
18 06
3,2 04

8,55 04
1
= 3,75 05