Anda di halaman 1dari 11

TUGAS 4

Metode Penelitian Pemuliaan Tanaman


Semester Ganjil 2013/2014
(2 OKTOB! 2013"
AUGM#T$ $S%G#
Ole&'
(a&ratul Milla&
A2)3130021
Ma*or Pemuliaan dan Biote+nolo,i Tanaman
$e-artemen A,ronomi dan .orti+ultura
Se+ola& Pas/asarjana %nstitut Pertanian Bo,or
2013
0
Penda&uluan
Pada awal proses pemuliaan tanaman, masalah utama yang umumnya dihadapi
ketika akan melakukan evaluasi adalah keterbatasan benih yang tersedia, sehingga tidak
memungkinkan dilakukan percobaan dengan rancangan yang menggunakan ulangan.
Masalah ini dapat diatasi dengan rancangan lingkungan Augmented Design.
Augmented Design merupakan rancangan lingkungan yang tidak memerlukan adanya
pengulangan pada varietas yang diuji. Pengulangan hanya dilakukan pada varietas
pembanding yang digunakan. Rancangan ini merupakan rancangan baku, dapat berupa
Rancangan Acak Lengkap (RAL atau Rancangan !elompok Lengkap "eracak
(R!L". Pada Rancangan Augmented dalam R!L" denah percobaan dibagi manjadi
beberapa blok seperti rancangan lingkungan pada umumnya. "iap blok memuat dua
atau lebih varietas pembanding yang ditempatkan secara acak. #isanya adalah varietas
yang diuji yang ditempatkan secara acak dalam semua blok tanpa ulangan. $arietas
yang diuji tidak harus sama jumlahnya dalam tiap blok, namun rancangan dengan
jumlah varietas yang sama akan lebih e%isien. Augmented Design dilakukan dengan dua
tujuan, yaitu &
'. Memperkirakan besarnya galat percobaan dan cara yang objekti% untuk
membandingkan varietas yang diuji dengan varietas pembanding.
(. Menetapkan cara untuk menyesuaikan hasil dari tiap varietas baru dengan
meniadakan pengaruh perbedaan lingkungan antar blok.
Out-ut .asil Analisis Sidi+ !a,am
"abel '. #idik Ragam Perlakuan "erkoreksi
#umber !eragaman )b
*umlah
!uadrat
!uadrat
"engah
+ilai
, Pr(-,
block.unadj . '/(0.1( (/..20
Perlakuan .2 ((13.0. 4/.(4 (.(0'1 000312)3
Pembanding 3 3..12 ''.11 /.5211 /..2200
Pembanding
6Pembanding.$#.aug. .4 ((.2.00 4'.0'3 (.32/1 /./34/57
8alat '. (54..4 '2.535
Kode berbeda nyata: 0 *** 0.001 ** 0.01 * 0.05 . 0.1 1
1
"abel (. #idik Ragam 9lok (kelompok "erkoreksi
#umber !eragaman )b
*umlah
!uadrat
!uadrat
"engah +ilai , Pr(-,
trt.unadj .2 3'21.5 ...20(
block.adj . '43.( (0.533 '.5(35 /.('3151
Pembanding 3 35 ''.11 /.5211 /..2200
Augmented .3 3/'2.0 .5.14' 3.((05 00004421 33
Pembanding vs augmented ' '(..0 '(..20' 2.'3( 00014452 3
8alat '. (54.. '2.535
"abel 3. Rekapitulasi )ata Rata:rata 9obot '/// 9iji dari .4 Aksesi 8andum dan 4
$arietas Pembanding
8enotipe Rata:Rata
9obot '/// biji
8enotipe Rata:Rata
9obot '/// biji
8enotipe Rata:Rata
9obot '/// biji
;<:/(0.3 45.1
A9<)
;<:/5/11 (3.4 ;<:/0(33 (0.4
;<:/(055 4'.2
A9<
;<:/5314 (/.3 ;<:/0(34 (3.0
;<:/(051 33.3 ;<:/55.' (2 ;<:/0(3. (2.5
;<:/(024 4/.4
A<
;<:/23(/ ('.4 ;<:/0(3. (0.5
;<:/:(02 4'.2
A9<
;<:/23(' 32.4 ;<:/0(35 (1.0
;<:/(021 31.0
A<
;<:/2341 3..5 ;<:'/45/ 35..
;<:/(003 30.0
A<
;<:/2341 '1.1 ;<:'/45/ (.
;<:/(004 4..(
A9<)
;<:/21// (1.. ;<:'/45/ 31.2
;<:/(004 43.5
A9<)
;<:/21// (5.3 ;<:'/45/ 33.(
;<:/3502 (..' ;<:/21// (... ;<:'/45' (1.2
;<:/3502 (4.3 ;<:/21/( (/.. ;<:'/45' 3..3
;<:/3500 (5.( ;<:/21/3 ('.4 ;<:'/45' 4/.5
;<:/3500 (1.( ;<:/21/3 (5.. ;<:'/45' (4.4
;<:/3500 '2.( ;<:/21/4 (0.( ;<:'/45' 34.1
;<:/4'4/ (..3 ;<:/21/4 (2.0 6 1 31023
;<:/4(34 (5.4 ;<:/21/. (3.' 6 2 33015
;<:/4(4/ 35.0 ;<:/0(3( '1 6 3 31
;<:/4(4. (1.. ;<:/0(33 '1.( 6 4 350)
;<:/5/(' (3.2 ;<:/0(33 3'..
;<:/5/(( 34 ;<:/0(33 (1.5
Keterangan: angka yang diikuti huruf A, B, C, D maing!maing nyata "ebih
tinggi dari #arieta $embanding C1, C%, C&, C'
Pada "abel ' dapat dilihat bahwa hasil penjumlahan *! pembanding dengan *!
pembanding vs Augmented adalah sama dengan nilai *! perlakuan. )emikian juga
pada table ( dapat dilihat bahwa hasil penjumlahan *! pembanding, *! augmented dan
*! pembanding vs Augmented adalah sama dengan nilai *! perlakuan. =al ini dapat
disimpulkan bahwa nilai ragam perlakuan yang diperoleh dapat dipecah menjadi nilai
ragam pembanding dan nilai ragam pembanding vs augmented seperti pada tabel ',
%
atau nilai ragam perlakuan yang diperoleh dapat dipecah menjadi nilai ragam
pembanding, ragam augmented dan ragam pembanding vs aiugmented seperti pada
table (.
%nter-retasi .asil Sidi+ !a,am
=asil uji sidik ragam terhadap karakter bobot '/// biji gandum (>mgw pada tara%
.? menunjukkan tidak adanya perbedaan yang nyata diantara genotipe pembanding
yang diamati, namun terlihat adanya perbedaan diantara genotipe yang diuji ("abel '.
9erdasarkan hasil sidik ragam ("abel ( juga diketahui setidaknya terdapat satu
genotipe yang berbeda nyata lebih baik dari varietas pembanding. =asil uji L#; pada
tara% . ? terhadap data karakter berat '/// biji ("abel 3 memberikan hasil bahwa
genotipe ;<:/(0.3, ;<:/(004, dan ;<:/(004 nyata lebih baik terhadap keempat
pembanding , genotype ;<:/(055 dan ;<:/:(02 nyata lebih baik terhadap
pembanding '(<', pembanding ( (<( dan pembanding 3(<3, sedangkan genotype
;<:/(024, ;<:/(021 dan ;<:/(003 nyata lebih baik terhadap <' dan <3.
&
(am$iran 1. (angkah $engo"ahan data menggunakan
)rogram *
R Editor:
"ibrary+agri,o"ae-
. et direktori ker/a untuk memanggi" 0"e yang akan kita ker/akan
et1d+2D:33Data 4)B33materi 5&33K6(4A7 8))9338))9 A6:8;<9;D2-
. Ba,a data
dat =read.tab"e+2tuga'.t>t2, header=9-
dat
. (ihat truktur data?
tr+dat-
.ubah 2b"k2 men/adi @a,tor
datAb"k = a.fa,tor+datAb"k-
datA#ar = a.fa,tor+datA#ar-
tr+dat-
. Ana"ii ragam untuk ran,angan Augmented
mode" = DA6.tet+datAb"k, datAtrt, datABmg1, method=2"d2,
grou$=9*6;-
. 5e"eai
R Console
* #erion &.0.1 +%01&!05!1C- !! 2:ood 5$ort2
Co$yright +C- %01& 9he * @oundation for 5tatiti,a" Com$uting
)"atform: i&DC!1C'!ming1&%Ei&DC +&%!bit-
* i free oft1are and ,ome 1ith AB5F(69;(G <F HA**A<9G.
Gou are 1e",ome to reditribute it under ,ertain ,ondition.
9y$e I"i,ene+-I or I"i,en,e+-I for ditribution detai".
<atura" "anguage u$$ort but running in an ;ng"ih "o,a"e
* i a ,o""aborati#e $ro/e,t 1ith many ,ontributor.
9y$e I,ontributor+-I for more information and
I,itation+-I on ho1 to ,ite * or * $a,kage in $ub"i,ation.
9y$e Idemo+-I for ome demo, Ihe"$+-I for on!"ine he"$, or
Ihe"$.tart+-I for an 798( bro1er interfa,e to he"$.
9y$e IJ+-I to Juit *.
K "ibrary+agri,o"ae-
K . et direktori ker/a untuk memanggi" 0"e yang akan kita ker/akan
'
K et1d+2D:33Data 4)B33materi 5&33K6(4A7 8))9338))9 A6:8;<9;D2-
K . Ba,a data
K dat =read.tab"e+2tuga'.t>t2, header=9-
K dat
Lar b"k trt Bmg1
1 C!1 1 1 %D.1
% C!% 1 % %M.D
& C!& 1 & %'.5
' C!' 1 ' &C.%
5 4C!0%D5& 1 5 'C.M
C 4C!0%DCC 1 C '1.N
N 4C!0%DCM 1 N &&.&
D 4C!0%DN' 1 D '0.'
M 4C!0!%DN 1 M '1.N
10 4C!0%DNM 1 10 &M.D
11 4C!0%DD& 1 11 &D.D
1% 4C!0%DD' 1 1% '5.%
1& 4C!0%DD' 1 1& '&.C
1' C!1 % 1 %M.5
15 C!% % % &D.N
1C C!& % & &D.&
1N C!' % ' &C.C
1D 4C!0&CDN % 1' %5.1
1M 4C!0&CDN % 15 %'.&
%0 4C!0&CDD % 1C %C.%
%1 4C!0&CDD % 1N %M.%
%% 4C!0&CDD % 1D 1N.%
%& 4C!0'1'0 % 1M %5.&
%' 4C!0'%&' % %0 %C.'
%5 4C!0'%'0 % %1 &C.D
%C 4C!0'%'5 % %% %M.5
%N C!1 & 1 &'.0
%D C!% & % %5.N
%M C!& & & %%.0
&0 C!' & ' &C.D
&1 4C!0C0%1 & %& %&.N
5
&% 4C!0C0%% & %' &'.0
&& 4C!0C0MM & %5 %&.'
&' 4C!0C&M' & %C %0.&
&5 4C!0CC51 & %N %N.0
&C 4C!0N&%0 & %D %1.'
&N 4C!0N&%1 & %M &N.'
&D 4C!0N&'M & &0 &5.C
&M 4C!0N&'M & &1 1M.M
'0 C!1 ' 1 %M.%
'1 C!% ' % &1.'
'% C!& ' & &&.%
'& C!' ' ' &5.5
'' 4C!0NM00 ' &% %M.5
'5 4C!0NM00 ' && %C.&
'C 4C!0NM00 ' &' %5.5
'N 4C!0NM0% ' &5 %0.5
'D 4C!0NM0& ' &C %1.'
'M 4C!0NM0& ' &N %C.5
50 4C!0NM0' ' &D %D.%
51 4C!0NM0' ' &M %N.D
5% 4C!0NM05 ' '0 %&.1
5& C!1 5 1 &5.1
5' C!% 5 % &C.'
55 C!& 5 & &1.&
5C C!' 5 ' &N.C
5N 4C!0D%&% 5 '1 1M.0
5D 4C!0D%&& 5 '% 1M.%
5M 4C!0D%&& 5 '& &1.5
C0 4C!0D%&& 5 '' %M.C
C1 4C!0D%&& 5 '5 %D.'
C% 4C!0D%&' 5 'C %&.D
C& 4C!0D%&5 5 'N %N.C
C' 4C!0D%&5 5 'D %D.C
C5 4C!0D%&C 5 'M %M.D
CC C!1 C 1 &1.5
CN C!% C % &C.M
C
CD C!& C & &C.N
CM C!' C ' &0.M
N0 4C!10'C0 C 50 &C.5
N1 4C!10'C0 C 51 %5.0
N% 4C!10'C0 C 5% &M.N
N& 4C!10'C0 C 5& &&.%
N' 4C!10'C1 C 5' %M.N
N5 4C!10'C1 C 55 &5.&
NC 4C!10'C1 C 5C '0.C
NN 4C!10'C1 C 5N %'.'
ND 4C!10'C1 C 5D &'.M
K
K . (ihat truktur data?
K tr+dat-
Idata.frameI: ND ob. of ' #ariab"e:
A #ar : @a,tor 1E &D "e#e" 2C!12,2C!%2,2C!&2,..: 1 % & ' C N D M 5 10 ...
A b"k : int 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
A trt : int 1 % & ' 5 C N D M 10 ...
A Bmg1: num %D.1 %M.D %'.5 &C.% 'C.M '1.N &&.& '0.' '1.N &M.D ...
K .ubah 2b"k2 men/adi @a,tor
K datAb"k = a.fa,tor+datAb"k-
K datA#ar = a.fa,tor+datA#ar-
K tr+dat-
Idata.frameI: ND ob. of ' #ariab"e:
A #ar : @a,tor 1E &D "e#e" 2C!12,2C!%2,2C!&2,..: 1 % & ' C N D M 5 10 ...
A b"k : @a,tor 1E C "e#e" 212,2%2,2&2,2'2,..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
A trt : int 1 % & ' 5 C N D M 10 ...
A Bmg1: num %D.1 %M.D %'.5 &C.% 'C.M '1.N &&.& '0.' '1.N &M.D ...
K . Ana"ii ragam untuk ran,angan Augmented
K mode" = DA6.tet+datAb"k, datAtrt, datABmg1, method=2"d2,
grou$=9*6;-
A<A(G545 DA6: datABmg1
C"a "e#e" information
B"o,k: 1 % & ' 5 C
N
9rt : 1 % & ' 5 C N D M 10 11 1% 1& 1' 15 1C 1N 1D 1M %0 %1 %% %& %' %5
%C %N %D %M &0 &1 &% && &' &5 &C &N &D &M '0 '1 '% '& '' '5 'C 'N 'D
'M 50 51 5% 5& 5' 55 5C 5N 5D
<umber of ober#ation: ND
A<FLA, 9reatment Ad/uted
Ana"yi of Larian,e 9ab"e
*e$one: datABmg1
Df 5um 5J 8ean 5J @ #a"ue )r+K@-
b"o,k.unad/ 5 10%D.M% %05.ND'
trt.ad/ 5N %%M&.D5 '0.%'& %.%D1M 0.0&MDC *
Contro" & &5.MN 11.MM0 0.CNMM 0.5NNDD
Contro" O ,ontro".L5.aug. 5' %%5N.DD '1.D1& %.&N0M 0.0&'0C *
*eidua" 15 %C'.5' 1N.C&C
!!!
5ignif. ,ode: 0 *** 0.001 ** 0.01 * 0.05 . 0.1 1
A<FLA, B"o,k Ad/uted
Ana"yi of Larian,e 9ab"e
*e$one: datABmg1
Df 5um 5J 8ean 5J @ #a"ue )r+K@-
trt.unad/ 5N &1NM.C 55.ND%
b"o,k.ad/ 5 1'&.% %D.C&& 1.C%&C 0.%1&MCM
Contro" & &C.0 11.MM0 0.CNMM 0.5NNDD0
Augmented 5& &01N.D 5C.M'1 &.%%DC 0.00NN%M **
Contro" # augmented 1 1%5.D 1%5.ND1 N.1&%0 0.01N'5D *
*eidua" 15 %C'.5 1N.C&C
!!!
5ignif. ,ode: 0 *** 0.001 ** 0.01 * 0.05 . 0.1 1
,oeP,ient of #ariation: 1&.C Q
datABmg1 8ean: &0.D'10&
Criti,a" DiReren,e +Bet1een-
5td ;rror DiR.
91o Contro" 9reatment %.'%'C0%
91o Augmented 9reatment +5ame B"o,k- 5.M&M0&D
91o Augmented 9reatment+DiRerent B"o,k- C.C'00'C
D
A Augmented 9reatment and A Contro" 9reatment '.M%'&M0
8ean 1ith the ame "etter are not igni0,ant"y diRerent.
:rou$, 9reatment and mean
a 5 50
ab 1% 'D.&
ab 1& 'C.N
ab, C ''.D
ab, M ''.D
ab,d D '&.5
ab,d 10 '%.M
ab,d 11 '1.M
ab,de %M '0.5%
ab,def 5C &M.&5
ab,def &0 &D.N%
ab,defg 5% &D.'5
ab,defgh %' &N.1%
b,defghi N &C.'
,defghi ' &5.C
,defghi/ 50 &5.%5
,defghi/k 55 &'.05
,defghi/k %1 &&.NN
,defghi/k 5D &&.C5
defghi/k % &&.15
defghi/k 5& &1.M5
efghi/k 1 &1.%&
efghi/k & &1
efghi/k" %N &0.1%
efghi/k" &% %M.M%
efghi/k" '& %M.15
efghi/k" &D %D.C%
efghi/k" 5' %D.'5
efghi/k"m &M %D.%%
efghi/k"m 'M %N.'5
efghi/k"m '' %N.%5
efghi/k"m &N %C.M%
fghi/k"m %& %C.D%
M
fghi/k"m && %C.N%
fghi/k"m %5 %C.5%
fghi/k"m %% %C.'N
fghi/k"m 'D %C.%5
fghi/k"m 1N %C.1N
fghi/k"m '5 %C.05
fghi/k"m &' %5.M%
fghi/k"m 'N %5.%5
ghi/k"m %D %'.5%
hi/k"m 51 %&.N5
hi/k"m '0 %&.5%
i/k"m %C %&.'%
i/k"m %0 %&.&N
i/k"m 1C %&.1N
i/k"m 5N %&.15
i/k"m &1 %&.0%
i/k"m 1M %%.%N
/k"m 1' %%.0N
/k"m &C %1.D%
/k"m 'C %1.'5
/k"m 15 %1.%N
k"m &5 %0.M%
"m '% 1C.D5
"m '1 1C.C5
m 1D 1'.1N
Com$arion bet1een treatment mean
SSS to ee the ob/e,t: ,om$arion and mean KKK
K dat
10