(33)

Patogenesis penyakit virus.

Patogenesis virus dapat didefinisikan sebagai metode yang menghasilkan penyakit
virus di host. Mayoritas cepat infeksi virus subklinis (tanpa gejala) dan pergi hampir
tidak dikenali, Satu individu dapat menyerah pada penyakit dengan infeksi oleh
virus, sementara yang lain mungkin sama sekali tanpa gejala saat terinfeksi oleh
strain virus yang sama, faktor genetik, imunitas, nutrisi dan faktor lain mempengaruhi
hasil infeksi.Studi tentang patogenesis virus dapat dipertimbangkan pada dua
tingkat. Pertama, pada tingkat virus (parasit) dan, kedua, pada tingkat dari tuan
rumah.
Masuknya infeksi virus.
Seperti dalam infeksi bakteri, virus mendapatkan masuk ke host dengan:
Inokulasi (melalui kulit dan mukosa)
Inhalasi (melalui saluran pernapasan)
Penelanan (melalui saluran gastrointestinal).
Lihat gambar 5.1. (Catatan: meskipun dalam bagian ini virus dianggap secara
terpisah, mekanisme pertahanan tuan rumah sangat mirip beroperasi untuk
mencegah masuknya semua patogen lain melalui portal ini.)

Gambar 5.1
Kulit dan mukosa.
Kulit merupakan penghalang yang efektif terhadap infeksi virus sebagai selsel mati dari stratum korneum tidak dapat mendukung replikasi
virus. Pelanggaran integritas kulit terjadi:
Selama lecet disengaja atau luka jarum suntik (Selama vaksinasi, virus
diinokulasikan ke dalam kulit)
Melalui gigitan vektor arthropoda, misalnya nyamuk dan kutu (ini
menginfeksi host baik karena air liur mereka yang terinfeksi sebagai akibat
dari multiplikasi virus di dalam virus demam kuning pada arthropoda,
misalnya nyamuk, atau karena mulut mereka terkontaminasi dengan virus)

 Sebagai hasil dari inokulasi jauh ke dalam jaringan subkutan dan otot, yang
dapat mengikuti suntikan jarum suntik, tattoing, akupunktur, tindik telinga atau
gigitan hewan.Sekali virus telah mencapai dermis yang memiliki akses ke
pembuluh darah dan limfatik serta makrofag, sehingga infeksi dapat
menyebar dengan mudah (Gambar 5.2).
Orofaring dan saluran usus.
Mekanisme pertahanan alami mulut dan saluran pencernaan yang mencegah
virus masuk adalah:
Terus menerus deskuamasi epitel
Kehadiran air liur, lendir lapisan usus, asam lambung, empedu dan enzim
proteolitik, yang semuanya menghambat masuknya virus nonspesifik
Mekanis gerakan lidah, pipi, peristaltik, dll
Mekanisme kekebalan tubuh (lihat Bab. 10).
Saluran pernapasan.
Sejumlah mekanisme pertahanan beroperasi untuk mencegah masuknya
virus melalui saluran pernapasan. Ini termasuk:
Sekresi lendir oleh sel goblet, hal ini, didorong oleh aksi sel epitel bersilia,
membersihkan bahan asing dihirup (eskalator mukosiliar)
IgA hadir dalam sekresi pernapasan
Fagositik sel alveolar.
Untuk mendapatkan akses ke saluran respiatory, virus perlu terutama dalam
bentuk partikel aerosol atau tetesan. Faktor-faktor lain yang mempengaruhi
infeksi virus pernapasan meliputi kelembaban dan suhu udara (misalnya
influenza lebih sering terjadi pada bulan-bulan musim dingin) dan sifat fisik
dan kimia dan struktur partikel virus.
Saluran kemih.
Vagina dan uretra dapat portal untuk masuknya infeksi virus. Faktor tuan
rumah yang dapat mempengaruhi masuknya virus melalui rute ini meliputi:
Alam deskuamasi mukosa
Sekresi vagina dan lendir serviks, yang mengandung baik spesifik dan nonspesifik faktor pertahanan
Intermiten pembilasan tindakan urin.
Aktivitas seksual dapat menyebabkan air mata atau lecet epitel vagina atau
trauma pada uretra, yang memungkinkan masuknya virus. Virus menular
seksual termasuk HIV pada manusia, virus herpes, papillomavirus, dan
kebanyakan virus hepatitis.

Gambar 5.2
(34)
Mekanisme penyebaran virus dalam tubuh
Virus, tidak seperti beberapa bakteri, benar-benar tidak memiliki organel transportasi, dan
mereka menyebar ke seluruh tubuh oleh sejumlah rute. Ini termasuk:
langsung lokal tersebar di permukaan epitel dan subepitelial. limfatik menyebar menyebar
viraemic. sistem saraf pusat dan menyebar saraf perifer.
Lokal tersebar di permukaan tubuh
Sejumlah virus penyebab penyakit pada permukaan epitel tanpa penyebaran
sistemik.Infeksi tersebut ditandai dengan:
mereka lokal alam
langsung virus shedding ke eksterior atau lumen (misalnya saluran pernapasan dan infeksi
saluran pencernaan dengan rhinovirus dan rotavirus, masing-masing).
Setelah virus menyerang mengatasi penghalang epitel itu terkena baris kedua dari

pertahanan tubuh dalam bentuk sel-sel fagositik, terutama histiosit dari seri makrofag.Ketika
virus ini phagocytosed akan hancur tidak hanya oleh kondisi pH rendah dalam vesikel
fagositik tetapi juga oleh enzymes.in phagolysosome tersebut.
Beberapa virus telah mengembangkan mekanisme untuk menghindari jenis pertahanan dan,
memang, meniru dalam makrofag.

Limfatik menyebar
Partikel virus phagocytosed dan bebas bersembunyi di bawah epitel dengan cepat
memasuki jaringan subepitelial / mukosa limfatik kapiler dan dibawa ke kelenjar getah
bening regional (Gambar 5.2). Kelenjar getah bening melayani dua fungsi utama:
mereka bertindak sebagai filter mikroba asing yang mendapatkan akses
ke sistem limfatik
mereka adalah situs di mana respon imun yang dihasilkan.
Segera setelah memasuki kelenjar getah bening, virus yang terkena makrofag yang melapisi
sinus marjinal. Jika virus ini phagocytosed, antigen disajikan ke sel-sel limfoid yang
mendasari untuk membangkitkan respon kekebalan, pada keberhasilan yang tergantung
hasil infeksi. Jika virus tidak aktif infeksi sembuh. Namun, organisme dapat menginfeksi
makrofag dan limfosit jika respon imun pada tahap ini tidak memadai (misalnya, virus
herpes, campak). Partikel virus yang lolos dari 'nodal menyaring kemudian dapat memasuki
aliran darah melalui limfatik eferen dan duktus toraks (Gambar 5.2).
(35)
Ada gerakan dua arah konstan makrofag dan limfosit dari darah ke kelenjar getah bening
dan sebaliknya. Jadi jika virus menginfeksi sel-sel di kelenjar getah bening tanpa merusak
mereka, sel-sel dapat bertindak sebagai kendaraan penyebaran virus. Kadang virus
menginfeksi dan berkembang biak di endothelium limfatik, lebih meningkatkan beban virus
mencapai node dan karenanya sistem limfatik. Virus tampaknya tidak masuk ke pembuluh
darah lokal secara langsung, kecuali mungkin saat ini rusak oleh trauma mekanis (luka
jarum misalnya, gigitan).
Peristiwa-peristiwa ini diikuti oleh respon inflamasi lokal yang mengubah hasil akhir dari
infeksi virus, seperti dijelaskan dibawah.
Viremia dan menyebar ke organ
Masuknya virus ke dalam darah dan menyebar selanjutnya disebut viraernia. Setelah virus
mencapai aliran darah, secara efektif disebarluaskan dalam hitungan menit. Episode
pertama dari entrv virus ke dalam darah disebut viremia primer (Gambar 5.2). Virus ini
kemudian dapat menjadi unggulan dalam berbagai organ jauh, setelah itu ada replikasi lebih
lanjut di situs ini dan gelombang kedua dari masuknya virus ke dalam aliran darah - sebuah
viremia sekunder. Hal ini biasanya lebih besar daripada viremia primer dan virus lebih
mudah dideteksi dalam sampel darah. Para viremia sekunder sering menyebabkan infeksi

organ lain. Saya

Virus mungkin bebas dalam plasma, dalam sel darah, atau keduanya (Gambar 5.3).Mereka
dalam plasma dapat relatif mudah dibersihkan, tetapi virus dalam leukosit tidak mudah
hancur. Jika leukosit yang terinfeksi tetap sehat itu mungkin menyebarkan infeksi ke bagian
tubuh yang jauh. Setelah virus mencapai organ, lokalisasi tergantung pada kemampuan
untuk menempel dan tumbuh dalam sel-sel endotel vaskular, dan pada fagositosis oleh sel
retikuloendotelial.
Sistem saraf pusat dan menyebar saraf perifer
Selama viraemia, virus yang beredar menyerang sistem saraf pusat oleh lokalisasi dalam
pembuluh darah:

HIV
Gambar. 5.3 Pengangkutan beberapa virus penting dalam kompartemen yang berbeda dari
darah. CMV, sitomegalovirus, EBV, virus Epstein-Barr, HIV, human immunodeficiency virus;
HTLV-1, human T-cell leukemia virus tipe 1.

Gambar. 5.4 Para kemungkinan efek-efek virus pada sel inang.

meninges dan koroid pleksus, dengan bagian berikutnya melalui cairan cerebrospinal ke
dalam jaringan saraf (misalnya virus gondok)
sumsum tulang belakang atau otak, dengan infeksi langsung berikutnya (misalnya virus
polio).
Proses lokalisasi ditingkatkan bila ada fokus inflamasi terkait. Saraf perifer bertindak sebagai
jalur efektif transmisi untuk beberapa virus, seperti virus herpes simpleks. Bagian virus dapat
berupa sentripetal (dari ke dalam permukaan tubuh) seperti pada rabies, atau sentrifugal
seperti di reaktivasi herpes simple'x (herpes labialis) atau varicella-zoster, modus
transportasi ini adalah suatu proses yang lambat (mm / jam) dibandingkan denganviraemic
menyebar. Empat rute kemungkinan trarismission virus pada saraf perifer yang dikenal:
akson
endoneural sel (e.g, sel Schwann)
jaringan ikat ruang antara saraf
perincural limfatik,

Virus dan sel inang interaksi

Setelah virus memasuki sel inang dapat berinteraksi dengan yang terakhir dalam dua cara
utama:
1. Infeksi permisif, di mana ada sintesis
virus komponen, perakitan mereka dan melepaskan.
2. Non-permisif infeksi, di mana infeksi dapat mengakibatkan transformasi sel, seringkali
dengan integrasi DNA yang vital ke dalam genom inang.
Permisif infeksi
Infeksi sel oleh virus mungkin memiliki satu atau lebih gejala sisa (Gambar 5.4). Sekuel yang
paling umum adalah untuk virus untuk bereplikasi dalam sebuah lirik atau infeksi cytocidal,
menyebabkan sel-sel mati dan menghasilkan penyakit akut. Sebuah sel yang terinfeksi virus
dapat mati sebagai akibat dari:
'menutup-down' protein sel inang dan sintesis asam nukleat
lisis sel, dengan pelepasan virion progeni,
(36)

pelepasan enzim intraseluler lvsosomal

kerusakan membran sel.

Konsekuensi seluler merugikan dari infeksi virus, terutama yang diamati pada sel
yang terinfeksi virus pada kultur jaringan, disebut efek sitopatik (lihat Bab.
7). Selama fase awal infeksi, sebelum kematian sel, perubahan karakteristik dalam
membran sel yang terinfeksi dapat terjadi. Haernadsorption dan pembentukan sel
raksasa adalah dua contoh.
Haemadsorption. Dalam virus yang meninggalkan sel oleh tunas melalui membran
plasma, glikoprotein virus (ditakdirkan untuk amplop) yang pertama dimasukkan ke
dalam membran. Sebuah protein amplop umum adalah hemaglutinin; protein ini
memungkinkan sebuah sel yang terinfeksi untuk menarik sel darah merah di
permukaan, sebuah fenomena yang disebut haemadsorption. Haemadsorption
dapat digunakan di laboratorium untuk mendeteksi sel-sel yang terinfeksi dengan
virus tertentu (misalnya orthoviruses dan paramyxoviruses).
Pembentukan sel raksasa. Beberapa virus, seperti herpes simplex dan HIV,
mempromosikan fusi sel di mana membran sel yang berdekatan bergabung untuk
menghasilkan sel raksasa multinuklear (polykaryons, syncytia). Penanda infeksi
virus lainnya termasuk badan inklusi intranuklear atau sitoplasma.
Non-permisif infeksi
Kematian sel tidak iringan tak terelakkan dari replikasi virus. Kadang-kadang infeksi
persisten mungkin terjadi di mana mungkin ada replikasi virus dalam sel, tetapi sel
tetap hidup. Banyak virus dapat menghasilkan infecions persisten. Beberapa contoh

yang relevan adalah virus hepatitis B, papillomaviruses, herpesvirus dan

retrovirus. Faktor-faktor yang mendukung kegigihan meliputi:
rendahnya patogenisitas virus
tidak efektif atau tidak ada antibodi-mediated atau sel-media, ed tuan
respon imun
cacat atau tidak ada produksi interferon
infeksi limfosit dan macropliages oleh virus.
Ada empat kategori infeksi persisten, laten, kronis, onkogenik dan lambat (Gambar,
5,5).
Laten infeksi virus. Ini terjadi ketika asam nukleat virus bertahan dalam sel, biasanya
diintegrasikan ke dalam DNA inang sebagai provirus (misalnya HIV, herpes
simpleks, varicella-zoster). Infeksi herpes simpleks Seperti dapat dianggap sebagai
klasik
contoh infeksi laten, mekanisme ketekunan dijelaskan. Setelah infeksi akut virus
herpes simplex perjalanan sepanjang serabut saraf sensorik (intra-aksonal
transportasi) ke ganglion akar dorsal yang sesuai (misalnya herpes mulut
virus perjalanan ke ganglion trigerninal). Selama latency,
virus yang menular tidak terdeteksi, tetapi virus dapat sembuh dengan fragmen
ganglion tumbuh dalam kultur jaringan. Munculnya kembali virus dicegah, mungkin
karena menjadi tuan rumah imunitas yang diperantarai sel tetapi, saat ini berkurang,
mungkin ada kambuhnya dan penumpahan virus dalam cairan dari daerah
tersebut. Demikian pula, varicelia-zoster tetap laten selama bertahun-tahun dan
secara spontan dapat muncul kembali sebagai zoster (shingles) pada dermatom
yang diberikan oleh ganglion sensorik tertentu di mana
virus laten. Infeksi virus laten yang diaktifkan kembali terutama pada pasien
immunocompromised, yang kemudian
menderita infeksi dan mengeluarkan virus (lihat Bab. 30).

Gambar. 5.5 Mode infeksi virus, sebagai fungsi waktu

(Infeksi onkogenik tidak ditampilkan).

Infeksi kronis. Ini terjadi ketika virus bertahan dalam jumlah di dalam tubuh dalam
jangka waktu lama, dengan atau tanpa riwayat penyakit. Individu-individu yang
terinfeksi kronis, yang sering tanpa gejala, disebut 'operator' dan merupakan sumber
potensial yang penting infeksi bagi orang lain. Operator membuat proporsi yang
signifikan tetapi tidak diketahui dari pasien yang diobati dengan gigi petugas
kesehatan (lihat Bab. 36).Perbedaan utama antara infeksi kronis dan laten adalah
bahwa virus terus terdeteksi di bekas tapi tidak di yang terakhir,
Infeksi onkogenik. Infeksi persisten di mana faktor genetik dan perkembangan yang
penting dalam menentukan apakah virus onkogenik tertentu dalam host yang
diberikan (misalnya virus Epstein-Barr yang menyebabkan karsinoma nasofaring
dan lymphonia Burkitt).
Lambat infeksi virus. Ini adalah jarang, dengan bulan incubations abadi atau tahun,

menyebabkan cacat berat dan akhirnya kematian (misalnya subakut sclerosing

panencephalitis, konsekuensi terlambat campak).
Transmisi infeksi virus dan pengendalian infeksi
Lihat Bab 36.
Tuan penentu infeksi virus
Hasil dari 'infeksi virus di host tidak hanya tergantung pada jenis dan virulensi dari
virus tetapi juga pada faktor tuan rumah, termasuk:
Status kekebalan - lihat Bab 10.
konstitusi genetik. Faktor genetik sekarang diketahui mempengaruhi kerentanan
terhadap infeksi oleh virus herpes, myxoviruses dan poxvirus. Kerentanan juga
dapat dikaitkan dengan kehadiran reseptor sel inang yang sesuai pada sel target.
(37)

Usia. Beberapa virus (seperti gondong, polio, EBV atau hepatitis) cenderung
menghasilkan lebih sedikit infeksi berat pada bayi, sedangkan yang lain (seperti
respiratory syncytial virus dan rotavirus) lebih parah pada anak-anak. Dasar untuk
jenis ketergantungan usia infeksi virus tidak jelas.
Lain-lain faktor. Status hormonal dan gizi dapat mempengaruhi hasil dari infeksi
virus, seperti yang ditunjukkan oleh fakta bahwa sejumlah infeksi virus (misalnya
polio, hepatitis A dan B) sering lebih parah selama kehamilan, dan kekurangan gizi
protein secara dramatis memperburuk tingkat keparahan infeksi campak. Kebiasaan
pribadi (misalnya merokok) dapat mempengaruhi hasil dari infeksi virus seperti
influenza - mungkin karena gangguan bersihan mukosiliar di saluran
pernapasan. Selanjutnya, diketahui bahwa olahraga berat dapat sebelumnya
menonjolkan keparahan serangan berikutnya polio.

Patogenesis penyakit jamur

Lihat Bab 22.

Postulat Koch
Sebuah spektrum yang luas dari mikroba mendiami tubuh manusia. Beberapa
penduduk tetap hidup sebagai commensals, lain
adalah organisme sementara dan masih ada lainnya yang commensals yang
berperilaku sebagai patogen dalam kondisi yang cocok (patogen oportunistik). Oleh
karena itu ketika supervenes infeksi adalah penting untuk membedakan komensal
dari patogen dalam rangka untuk mengidentifikasi dan menghilangkan yang
terakhir. Masalah ini ditemui oleh Robert Koch, seorang dokter umum Jerman, pada
tahun 1877 ketika ia mencoba untuk menentukan penyebab dari infeksi yang disebut

antraks pada sapi dan tuberkulosis pada manusia. Koch mendefinisikan kriteria
untuk menghubungkan organisme sebagai penyebab penyakit yang spesifik. Kriteria
ini, yang disebut postulat Koch, adalah sebagai berikut:
1. Organisme harus diisolasi dari setiap pasien dengan penyakit dan distribusi dalam
tubuh sesuai dengan yang diamati lesi.
2. Organisme harus diisolasi dan berbudaya di luar
tubuh (in vitro) dalam kultur murni.
3. Organisme yang murni harus menyebabkan penyakit pada sehat, susterhadap upaya hewan.
4. Organisme harus pulih dari diinokulasi
hewan.
Saat ini keempat postulat dilengkapi dengan yang lain:
5. Antibodi untuk organisme harus terdeteksi di
serum pasien.
Jelas, ini adalah kriteria ideal dan tidak selalu dicapai dalam praktek (misalnya M.
leprae, basil kusta, tidak dapat dikultur secara in vitro), tetapi mereka memberikan
suatu kerangka kerja untuk membangun peran actiological organisme dalam
penyakit menular.
Daftar Pustaka
FURTHER READING

Inglewski, BH, and Clark, LV (eds) (1990). The bacteria. Molecular

basis of bacterial pathogenesis, %of. xi. Academic Press, London,

Minas, C, Dininiock, N, Nash, A, and Stephen j (1995). Mints'

Pathogenesis ofinfectious disease (4th edn). Academic Press, London.
Minis, C, Playfair, J, Roitt, 1, Wakelin, D, and Williams, R (1998).
Pathologic consequences of infection. In Aledical microbiology (2nd
edn), Ch. 12. Mosby, London.

Scully, C, and Samaranayake, IT (1992). Clinical virology in oral ?nedicine and dentistry, Ch. 3.
Cambridge University Press, Cambridge.

Taussig, Mj (1984). Infection: bacteria. In Processes in pathology and mcrobiology (2nd edn), sect. 4.
Blackwell, Oxford.
(38)

Mikrobologi Diagnosis
Mikrobiologi diagnosis melibatkan studi spesimen yang diambil dari pasien yang
diduga menderita infeksi. Hasil akhirnya adalah laporan, yang harus membantu
dokter dalam mencapai diagnosis definitif dan keputusan tentang terapi
antimikroba. Oleh karena itu dokter harus berkenalan dengan teknik mengambil
spesimen, dan memahami prinsip-prinsip dan teknik belakang analisis laboratorium.
Diagnosis penyakit menular memerlukan sebuah nomor dari
keputusan dan tindakan oleh banyak orang. Siklus diagnostik dimulai ketika dokter
mengambil sampel miciobiological dan berakhir ketika dokter menerima laporan
laboratorium dan menggunakan informasi untuk mengelola kondisi (Gambar 6.
1).Langkah-langkah dalam siklus diagnostik:
Saya. Klinis permintaan dan penyediaan informasi klinis.
2. Pengumpulan dan transportasi spesimen yang tepat (s).
3. Laboratorium analisis.
4. Interpretasi laporan mikrobiologi dan penggunaan
informasi.

Klinis permintaan
Tahap pertama dalam siklus diagnostik terdiri dari spesimen dan formulir permintaan
yang menyertainya. Berikut, yang mempengaruhi kualitas spesimen, perlu dicatat:
Kondisi klinis pasien: jika pasien tidak menderita infeksi mikroba patogen sampling
untuk kemudian akan sia-sia (misalnya tumor, trauma),
Terapi antibiotik akan mengubah kualitas dan kuantitas organisme. Oleh karena itu
spesimen harus dikumpulkan sebelum terapi antibiotik, jika mungkin; pengecualian
adalah di mana pasien sakit parah, kekebalannya terganggu, atau tidak menanggapi
antibiotik tertentu, dalam hal perlunya memperoleh laporan sementara sebagai
panduan untuk pengelolaan selanjutnya membenarkan seperti tindakan.
Penyediaan * informasi klinis
Tes yang sesuai untuk setiap spesimen harus dipilih oleh ahli mikrobiologi sesuai
dengan informasi klinis yang diberikan dalam formulir permintaan yang

menyertainya. Oleh karena itu informasi seperti usia, kondisi klinis utama, tanggal
onset penyakit, terapi antibiotik terbaru / saat ini, alergi antibiotik dan sejarah
spesimen sebelumnya semua penting untuk rasionalisasi investigasi dan harus
disertakan dengan spesimen.

Pengumpulan dan transportasi spesimen

Selalu mengumpulkan spesimen yang sesuai.
Spesimen harus sesegar mungkin: banyak organisme (anaerob misalnya, virus yang
paling) tidak bertahan lama dalam spesimen pada suhu kamar. Lainnya, seperti
coliform dan staphylococci, dapat berkembang biak pada suhu kamar dan analisis
berikutnya dari spesimen tersebut akan memberikan hasil yang menyesatkan.
Transportasi spesimen dalam media yang sesuai (lihat di bawah), jika tidak dehidrasi
dan / atau paparan organisme untuk kondisi aerobik terjadi, dengan kematian yang
dihasilkan dan pengurangan dalam jumlah mereka. Media transportasi harus
kompatibel dengan organisme yang diyakini hadir dalam sampel klinis (misalnya
spesimen virus harus diangkut dalam media transportasi virus, yang tidak cocok
untuk sampel bakteriologis).Transportasi spesimen di aman, wadah yang kuat untuk
menghindari kontaminasi.

Laboratorium analisis
Sebuah beragam spesimen yang diterima dan dianalisis oleh sejumlah metode di
laboratorium mikrobiologi diagnostik. Proses analisis spesimen nanah dari abses gigi
diberikan di bawah ini, sebagai ilustrasi (Gambar 6.2).
1. Buatlah smear spesimen, Pewarnaan Gram dan memeriksa dengan
mikroskop.(Smear adalah dibuat dengan menyebarkan sejumlah kecil nanah pada
slide kaca yang bersih dan memperbaiki panas.)
2. Menyuntik spesimen pada dua piring darah agar untuk kebudayaan di bawah
kondisi aerobik dan anaerobik (lempengan-lempengan ini disebut sebagai pelat
primarv).
3. Menetaskan pelat agar darah selama 2-3 hari pada 370C (karena kebanyakan
patogen oral tumbuh lambat anaerob; untuk mengisolasi aerob masa inkubasi 18jam adalah memadai).
4. Periksa piring untuk pertumbuhan. Perhatikan bentuk dan ukuran jenis koloni
yang berbeda untuk subkultur. Infeksi dapat disebabkan oleh satu organisme
(monomicrobial) atau lebih dari satu organisme (polymicrobial), seperti dalam kasus
mayoritas infeksi dentoalveolar, dimana sampel biasanya menghasilkan campuran
dari dua atau tiga organisme.
(39)

Gambar 6.1
5. Isolasi patogen putatif (s) dengan subkultur pada agar darah pelat segar (s) (budaya
organisme tunggal) dan inkubasi pada 370C selama 24-48 jam.
6. Panen budaya murni dan mengidentifikasi patogen menggunakan reaksi biokimia, media
selektif atau reaksi antibodi spesifik (lihat di bawah).
7. Tes sensitivitas antibiotik dapat dilakukan pada pertumbuhan campuran yang diperoleh
dari nanah (tes antibiotik primer) atau pada organisme murni (s) yang diperoleh pada
langkah 6 (tes antibiotik sekunder) (lihat di bawah).
Akhirnya, harus dicatat bahwa mikrobiologi dapat mengeluarkan laporan sementara setelah
2 hari tetapi laporan akhir mungkin membutuhkan waktu lebih lama (Gambar 6.2),
Interpretasi laporan mikrobiologi dan penggunaan informasi
Sementara interpretasi laporan mikrobiologi yang paling mungkin langsung, ada Situasi di
mana harus menghubungi dokter mikrobiologi, misalnya untuk bimbingan dalam kaitannya
dengan terapi antibiotik dan kebutuhan untuk pengambilan sampel lebih lanjut. Kerjasama

yang baik antara dokter dan ahli mikrobiologi sangat penting untuk mencapai terapi yang
optimal.
METODE LABORATORIUM
Sejumlah metode dan teknik yang digunakan dalam diagnosis laboratorium infeksi, mereka
dapat dikategorikan ke dalam luas:
- Non-budaya metode. Ini adalah banyak dan bervariasi, dan
termasuk
- Metode mikroskopis (mikroskop cahaya, elektron
mikroskop)
- Deteksi mikroba dengan menyelidik untuk gen mereka.
- Budaya metode. Klasik metode diagnosis, di
yang
- Media padat atau cair yang digunakan untuk bakteri dan jamur
pertumbuhan
- Sel kultur yang berasal dari hewan dan manusia
digunakan untuk pertumbuhan virus.
- metode imunologi. Ini digunakan untuk mengidentifikasi organisme
- Mendeteksi antibodi dalam cairan tubuh pasien (misalnya serum, air liur), terutama
ketika. organisme tidak dapat dibiakkan dalam media laboratorium.

Metode mikroskopis
Cahaya mikroskop
Terang-lapangan atau mikroskop standar). Secara rutin digunakan dalam diagnostik
mikrobiologi), noda noda dari lesi yang diperiksa dengan tujuan minyak imersi (x100)
menggunakan mata x10-sepotong, menghasilkan perbesaran x1000. Film basah diperiksa
dengan tujuan kering (X40) (misalnya untuk menunjukkan motilitas bakteri).
Gelap-tanah mikroskop. Spesimen diterangi miring oleh kondensor khusus sehingga sinar
cahaya tidak masuk tujuan langsung. Sebaliknya organisme tampak terang, seperti sinar
cahaya memukul mereka, terhadap latar belakang gelap.
Mikroskop fase kontras. Meskipun jarang digunakan dalam diagnostik mikrobiologi, teknik ini
dapat digunakan untuk menentukan Struktur rinci mikroba tak bercacat.
Fluoresensi mikroskop. Teknik fluoresensi secara luas digunakan, terutama dalam

imunologi. Metode ini menggunakan prinsip emisi panjang gelombang cahaya yang berbeda
ketika
(40)

Gambar 6.2

cahaya dari satu panjang gelombang pemogokan objek neon. Sinar

ultraviolet biasanyadigunakan, dan bakteri atau sel yang diwarnai dengan pewarna
fluorescent sepertiauramine, misalnya, untuk
mendeteksi antigen mikroba dalam spesimen yang terakhiradalah 'ternoda' dengan antibodi
spesifik ditandai dengan pewarna fluorescent(immunefluorescence, lihat di bawah).
mikroskop elektron
Dalam gelombang cahaya mikroskop elektron digantikan oleh sinar elektron, yang
memungkinkan resolusi organisme yang sangat kecil
seperti virion, misalnya 0,001 lim.Mikroskop elektron dapat digunakan dalam
diagnostik virologi, misalnya untukpemeriksaan langsung
dari spesimen (misalnya rotavirus, virus hepatitis A). Sekitar satu juta partikel virus yang
diperlukan untuk visualisasi tersebut. Gumpalan partikel virustersebut
dapat diperoleh dengan mereaksikan sampel
dengan mikroskop antibodiantivirus immunoelectron.
Cahaya mikroskop dan noda
Dalam mikroskop cahaya noda bakteri yang digunakan:
untuk memvisualisasikan bakteri jelas
untuk mengkategorikan mereka sesuai dengan sifat pewarnaan.
(41)

Noda yang paling umum digunakan dalam diagnostik mikrobiologi adalah Gram
noda.
Teknik pewarnaan gram
1. Setelah panas-memperbaiki film kering (dengan lembut melewati nyala api), banjir
dengan kristal violet selama 15 detik. Kemudian mencuci kelebihan.
2. Banjir dengan iodin Lugol selama 30 detik (untuk memperbaiki noda),
mencuci kelebihan.
3. Langkah penting. Membuat tdk berwarna dengan aseton atau alkohol selama
sekitar 5 detik. Bila tidak ada warna biru datang dari Pap itu, segera cuci dengan air.
4. Counterstain dengan carbolfuchsin encer selama 30 detik (atau
netral merah selama 2 menit).
5. Wash.with air, dan noda kering.
Karakteristik pewarnaan. Menurut hasil pewarnaan Gram, bakteri dapat berupa
Gram-positif atau Gram-negatif:

 bakteri Gram-positif mempertahankan noda ungu dengan menolak

penghilangan warna dan noda biru-hitam.
bakteri Gram-negatif kehilangan selama penghilangan warna ungu noda dan
karena itu counterstained dengan pink, warna carbolfuchsin.
Teknik pewarnaan Ziehl-Neelsen
Beberapa bakteri, seperti basil tuberkulum, sulit untuk noda dengan metode Gram
karena mereka memiliki dinding, lilin tebal sel luar. Sebaliknya, teknik pewarnaan
Ziehl Neelsen-digunakan. Organisme yang terkena panas, carbolfuchsin
terkonsentrasi selama sekitar 5 menit, decolorized dengan asam dan alkohol (maka
asam dan alkohol jangka-cepat-basil), dan akhirnya counterstained dengan metilen
biru atau hijau perunggu. Basil ini akan berwarna merah dengan latar belakang biru.
Lain noda
Sejumlah noda lain digunakan dalam mikrobiologi untuk menunjukkan flagella,
kapsul dan butiran, dan untuk pewarnaan bakteri di bagian jaringan.
Deteksi mikroba dengan menyelidik untuk gen mereka
Polymerase chain reaction
Nomor bakteri sangat kecil (10-100) dalam spesimen pasien dapat dideteksi dengan
menggunakan reaksi rantai polimerase standar (PCR) teknik (Bab 3), sementara
teknik yang lebih canggih dapat mendeteksi satu urutan DNA HIV provirus dalam
106 sel.Keuntungan utama dari metode ini adalah kecepatan nya (beberapa jam
dibandingkan dengan hari banyak teknik budaya konvensional). Namun, reaksi PCR
dapat menghasilkan non-spesifik data dan seleksi maka peradilan primer dan
perilaku hati-hati terhadap tes (untuk mencegah kontaminan sehingga menimbulkan
hasil positif palsu) yang penting. Untuk alasan ini teknik PCR yang tidak umum di
laboratorium diagnostik, tetapi dengan perkembangan baru tersebut sebagai
teknologi microarray dan PCR bersarang hanya masalah 'waktu sebelum teknik ini
menjadi lebih populer.
Probe asam nukleat
Dalam teknik ini,, berlabel beruntai tunggal molekul asam nukleat digunakan untuk
mendeteksi urutan DNA komplementer dari patogen dalam sampel pasien, dengan
hibridisasi untuk itu.
Probe diperoleh dalam contoh pertama dari alami DNA dengan kloning fragmen
DNA ke dalam vektor plasmid yang sesuai dan kemudian mengisolasi DNA
kloning. Namun, jika urutan gen target (dalam patogen) diketahui, probe
oligonukleotida dapat disintesis dan diberi label dengan isotop radioaktif atau
dengan senyawa yang memberikan reaksi warna di bawah kondisi yang sesuai.
Teknik ini tidak sensitif untuk mendeteksi sejumlah kecil organisme (yaitu menyalin
nomor beberapa gen) dalam sampel klinis. Namun, kombinasi dari teknik PCR
(untuk menghasilkan menyalin nomor tinggi) dan hibridisasi dengan probe

oligonukleotida kemungkinan menjadi metode pilihan dalam mengidentifikasi

organisme yang lambat atau sulit untuk tumbuh di laboratorium.
Budaya metode
Bakteri tumbuh baik pada media buatan, tidak seperti virus yang membutuhkan sel
hidup untuk pertumbuhan. Agar darah adalah media yang paling banyak digunakan
kultur bakteri. Ini adalah contoh dari media non-selektif seperti banyak organisme
dapat tumbuh di atasnya.
Namun, ketika bahan kimia yang dimasukkan ke dalam media untuk mencegah
pertumbuhan spesies bakteri tertentu dan untuk mempromosikan pertumbuhan
orang lain, media selektif dapat dikembangkan (misalnya penambahan garam
empedu membantu isolasi enterobacteria
dari sampel tinja dengan menekan pertumbuhan usus commensals yang
paling).Beberapa contoh media selektif dan penggunaannya
diberikan dalam Tabel 6. 1.
Bakteriologis Media
Konstituen utama media bakteriologi adalah:
air
agar-agar: karbohidrat diperoleh dari rumput laut (agar-agar mencair sebagai
di 90'C dan membeku di 40'C, peka panas nutrisi dapat
ditambahkan ke dasar agar-agar sebelum menengah mengeras)
pertumbuhan memperkaya konstituen: misalnya ekstrak ragi, daging
ekstrak (ini mengandung karbohidrat, protein, anorganik
garam dan faktor pertumbuhan untuk pertumbuhan bakteri)
darah: kuda darah atau darah domba defibrinated.
Persiapan media padat dan prosedur inokulasi
Ketika semua bahan yang diperlukan telah ditambahkan ke agar-agar cair, adalah
ditiadakan, saat masih hangat, ke dalam plastik atau kaca piring petri. Agar-agar
secara bertahap akan dingin dan ditetapkan pada suhu kamar, menghasilkan piring
siap untuk inokulasi spesimen. Tujuan dari inokulasi spesimen atau budaya bakteri
pada media padat untuk mendapatkan koloni organisme diskrit setelah inkubasi
yang tepat. Oleh karena itu teknik standar (Gambar 6.3) harus digunakan. Media
padat lebih berguna daripada media cair karena mereka memfasilitasi:
pembentukan koloni Diskrit, memungkinkan tunggal, koloni murni diambil dari pelat
utama untuk subkultur di piring sekunder. Pertumbuhan murni dari budaya sekunder
kemudian dapat digunakan untuk identifikasi organisme menggunakan tes biokimia,
dll
Observasi karakteristik kolonial membantu dalam identifikasi organisme.

 Kuantifikasi organisme sebagai unit pembentuk koloni (CFU). Ini sangat berharga
baik dalam penelitian dan diagnostik mikrobiologi (misalnya jika sebuah spesimen
urin menghasilkan lebih dari
(42)
Media

Agen yang
dipilih

Faktor
Pembed
a
Lactose

Tipe Koloni 1

Tipe Koloni 2

MacConkey

Bile salts

FERMENTER/RED
Escherichia coli

Tellurite,
crystal violet

Sucrose

BIG > 2 mm
Streptococcus
salivarius

NON-FERMENTER
Salmonella
pseudomonas
SMALL < 1 mm

Mitis
salivarius

Mannitol
salt

7,5% NaCl

Mannitol

BIG/Yellow
Staphylococcus
aureus

SMALL/PINK
Staphylococcus
epidermis

Lowenstein
-lensen

Malachite

SMOOTH/PIGMENTED
Atypical mycobacteria

TCBS

Thiosulphat
e

Sucrose

ROUGH
Mycobacterium
tuberculosis
FERMENTER(YELLOW
)

ThayerMartin

Antibiotics

Charcoal
yeast
extract
Sabouraud

Cysteine

Low pH (5.6)
+ Antibiotik

GREY COLONIES
Neisseria
gonorrhoeae
Neisseria
meningitidis.
CUTGLASS COLONIES
Legionella sp
CREAM COLONIES
Fungi

Organis
me
Inhibitor
Hampir
seluruh
kokus
Staphylo
cocci
enteric
bacili
Streptoc
occi
enteric
bacili
Kokus

NON-FERMENTER
Vibrio
parahaemolyticus
GREY COLONIES
Neisseria gonorrhoeae
Neisseria meningitidis

Kokus,
enteric
bacilli
Kokus
gram
positif

CUTGLASS COLONIES
Legionella sp

Kokus
gram
positif
Kebanya
kan
bakteri

CREAM COLONIES
Fungi

105 CFU / ml pasien dianggap memiliki infeksi saluran kemih; a. sampel dicampur
dengan air liur lebih dari 106 CFU / ml menunjukkan adanya aktivitas Streptococcus
mutans kariogenik tinggi).
Media cair
Media cair yang digunakan dalam mikrobiologi untuk:
0 Mempromosikan pertumbuhan sejumlah kecil bakteri hadir
dalam spesimenterkontaminasi dengan antibiotik. Antibiotik diencerkan dalam
medium cairan, sehingga meningkatkan pertumbuhan organisme.

Gambar. 6.3 Metode inokulasi sebuah plate agar untuk

memperoleh koloni bakteri diskrit(setelah inkubasi semalam).
0 preferentially meningkatkan pertumbuhan bakteri tertentu
saat menekan commensalsbacteriall lain yang hadir dalam sampel. Ini disebut
media pengayaan (misalnya kalduSelenite F digunakan untuk kultur tinja).
0 kegiatan Uji biokimia bakteri untuk tujuan identifikasi.
Beberapa contoh media padat dan cair yang diberikan. dalam tabel 6.2.
Media untuk kultur darah
Ketika agen infeksi yang beredar dalam darah (misalnya di septikemia, endokarditis,
pneumonia) yang terakhir harus aseptik ditarik oleh venepuncture dan berbudaya. Kultur
darah harus dilakukan pada media cair khusus, baik dalam kondisi aerobik dan
anaerobik. Darah aseptik ditransfer ke medium pertumbuhan yang kaya (misalnyaotakjantung kaldu infus) mengandung antikoagulan (Gambar 6.4). Budaya diperiksa
untukkekeruhan dan produksi gas harian, tip untuk seminggu (di banyak laboratorium proses
inisekarang otomatis dan mesin yang digunakan untuk mendeteksi pertumbuhan
bakteri).Budaya positif sampel dan organisme (s) diisolasi dan diidentifikasi.
Media transportasi

Spesimen klinik diangkut ke laboratorium depan dalam media transportasi, yang membantu
untuk menjaga kelangsungan hidup organisme dalam perjalanan.
Bakteriologi transportasi media. A, non-gizi semipadat agar seperti media
transportasiStuart secara luas digunakan. Ini
(43)
Medium
Media padat
Agar nutrien
Agar darah
Agar coklat
Agar CLED
Antibiotik sensitif
Media cair
Pepton
Broth nutrien
Gandum Robertson
Selenite F

Bahan

Keaangu

Agar
Agar nutrien, 5-1-% darah kuda
Agar darah yang dihangatkan
Pepton, laktosa, dll.
Pepton, & medium semisintetik

Tujuan utama
Pada umumnya
Isolasi Haemophilus
Kultur coliforms
Test sensitivitas antibiotik

Pepton, NaCl, air

Air pepton, ekstrak gandum
Nutrien brorh
Air pepton, sodium selenite

Kegunaan utama
Kultur umum
Kultur anaerobik
Medium untuk Salmonella sp.

juga mengandung asam thioglycolic sebagai agen mengurangi, dan elektrolit.

Viral transportasi menengah. Ini adalah istilah umum yang menggambarkan suatu larutan
yang mengandung protein dan garam seimbang yang menstabilkan virus selama
transportasi. Agen antimikroba juga ditambahkan untuk membunuh bakteri yang hadir dalam
sampel.
Atmosfer persyaratan dan inkubasi
Setelah diinokulasi piring agar-agar dapat diinkubasi:
aerobik: tapi penambahan karbon dioksida 10% meningkatkan pertumbuhan patogen
manusia yang paling.
anaerobik: sebagian besar bakteri, khususnya patogen oral, anaerob ketat dan tumbuh
hanya dalam ketiadaan oksigen. Kondisi anaerobik dapat diproduksi dalam stoples tertutup
atau dalam inkubator anaerobik besar. Dalam kedua kasus lingkungan oksigen digantikan
oleh nitrogen dioksida, hidrogen dan karbon,
Pada suhu tubuh: 370C (beberapa bakteri tumbuh baik pada suhu yang lebih tinggi atau
lebih rendah; jamur biasanya tumbuh pada suhu ambien).
Ng. 6,4 botol kultur darah: botol di kiri berisi

IDENTIFIKASI BAKTERI
Ketika patogen putatif dari spesimen klinis adalah diisolasi sebagai kultur murni adalah
penting untuk mengidentifikasi organisme (s). Identifikasi bakteri (Gambar 6.5) pada
awalnya memerlukan:
1. Pemeriksaan karakteristik kolonial: ukuran, bentuk, elevasi (datar, cembung, umbonate),
margin (keseluruhan, berombak-ombak, berserabut), warna, bau dan tekstur; efek pada
darah (-a, -, atau non-hemolitik).
2. Pemeriksaan karakteristik morfologi dan pewarnaan mikroskopis: sebuah film ternoda
koloni membantu identifikasi.
3. Identifikasi kondisi pertumbuhan: aerobik, anaerobik, capnophilic (yaitu tumbuh baik di
kelebihan karbon dioksida), pertumbuhan pada media selektif dan pengayaan.
Hal tersebut di atas akan menunjukkan kelompok utama yang dimiliki organisme (misalnya
streptokokus, enterobacteria, Clostridia) Namun, identifikasi definitif untuk tingkat spesies
membutuhkan tes biokimia.

Tes biokimia
Setiap spesies bakteri memiliki profil biokimia karakteristik yang berharga untuk
identifikasi. Ini termasuk:
fermentasi Gula dan profil asimilasi. Budaya murni diinkubasi dengan gula tertentu dan
diperiksa untuk produksi asam dan gas atau keduanya.

0 Enzim profil. Organisme ini diinkubasi dengan Enz sesuai) rne substrat. Jika erinme yang
disekresikan oleh organisme ini akan bereaksi dengan substrat dan menyebabkan
perubahan warna. Selain itu, beberapa bakteri dapat diidentifikasi terutama oleh produksi
enzim yang khas. Jadi, koagulase diproduksi oleh gumpalan Staphylococcus aureus (atau
menggumpal) plasma dan merupakan enzim khusus untuk organisme ini. Contoh lain
adalah lecithinase diproduksi oleh Clostridium perfringes (lihat Bab. 13).

Komersial identifikasi kit

Identifikasi definitif organisme membutuhkan pengujian untuk spektrum enzim serta
kemampuannya untuk fermentasi (pemecahan anaerob) atau mengasimilasikan
(pemecahan aerobik) sejumlah karbohidrat. Hal ini difasilitasi oleh komersial
(44)

kit yang tersedia, seperti API dan sistem AnIdent, perusahaan

yang berbagai tessebelumnya (biasanya 20) dalam sistem kit tunggal (Gambar 6.6).

metode
Sebuah budaya murni dari organisme genteng uji diinokulasi ke setiap sumur kecil (cupule)
yang mengandung karbohidrat yang sesuai atau kimia dan diinkubasi semalam.Warna yang
dihasilkan atau mengubah kekeruhan untuk setiap tes ini kemudiandibandingkan
dengan grafik warna standar (yang disediakan oleh produsen genteng) dan
mencetak. Profil numerik sehingga diperoleh untuk organisme dibandingkan dengan profil
yang disusun dari budaya jenis, dan mdegree konkordansi antara profil dari
duaorganisme memungkinkan identifikasi bakteri uji.
Kadang-kadang proses identifikasi organisme harus diperpanjang lebih jauh
darispesiasi (yaitu mengidentifikasi bakteri melebihi tingkat spesies) yang dijelaskan di atas,

ini disebut bakteri mengetik.

Mengetik bakteri
Adalah penting untuk menyadari bahwa bakteri dari spesies yang sama mungkin
memilikikarakteristik yang berbeda (hanya sebagai anggota individu dari
Homo sapiens gentengspesies bervariasi dalam karakteristik seperti warna kulit, tinggi
badan, dll). Hal initerutama penting ketika menelusuri

(45)
penyebaran epidemi organisme baik di masyarakat atau di bangsal rumah sakit (seperti
melacak penjahat pada populasi yang luas). Tracing seperti organisme dapat dilakukan oleh
diferensiasi regangan menggunakan prosedur mengetik perintah berikut:
serotipe: membedakan bakteri menurut antigen
struktur
biotyping: membedakan bakteri sesuai dengan bioreaktivitas kimia
phagetyping: membedakan bakteri berdasarkan kerentanan terhadap sebuah panel yang
dikenal bakteriofag (virus yang membunuh bakteri)
bakteriosin mengetik: bakteriosin adalah protein ampuh bakteri yang menghambat
pertumbuhan anggota lain dari spesies kelas yang sama, sebuah panel bakteriosin dapat
digunakan untuk menguji kerentanan organisme uji, dan profil yang diperoleh digunakan
untuk mengetik
mengetik genetik: sejumlah novel metode mengetik genetik seperti yang dijelaskan dalam
Bab 3 sekarang tersedia dan ini menghasilkan sangat akurat 'sidik jari' dari bakteri.

METODE imunologi
Metode imunologi berguna dalam diagnostik mikrobiologi untuk mengidentifikasi organisme
dan untuk mendeteksi antibodi dalam cairan tubuh pasien (misalnya serum, air liur),
terutama ketika organisme tidak dapat dibiakkan dalam media laboratorium.

Identifikasi organisme menggunakan

teknik imunologi
Pengelompokan
Slide aglutinasi. Antibodi terhadap serritypes spesifik dari organisme (misalnya Salmonella
dan Shigella spesies) dapat digunakan dalam identifikasi. Ketika suspensi organisme dan
beberapa tetes antibodi spesifik dicampur pada slide kaca, terlihat aglutinasi
(penggumpalan) dari organisme indicatcs reaksi positif.
Aglutinasi lateks. Di sini aglutinasi lateks manik-manik
dilapisi dengan antibodi spesifik ditujukan terhadap organisme diketahui digunakan, seperti
di atas (misalnya Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, ragi Cryptococcus
neoformans) (Gambar 6.7).
Imunofluoresensi
Jika organisme terkena antibodi spesifik ditandai dengan pewarna fluoresen, maka
organisme mengikat antibodi dan dapat divisualisasikan melalui mikroskop ultraviolet.Asas
langsung (satu langkah) dan tidak langsung (dua langkah) teknik imunofluoresensi
ditunjukkan pada Gambar 6.8.
Enzyme-linked immunosorbent assay
Uji enzyme-linked immunosorbent (ELISA) adalah modifikasi dari tes di atas di mana
pewarna fluoresen antibodi ditandai untuk digantikan oleh enzim. Organisme mengikat
antibodi dan enzim tag, dan jumlah enzim yang terikat kemudian dapat ditunjukkan oleh
reaksi dengan substrat enzim. Ini adalah tes yang sangat populer.

Deteksi antibodi dalam serum pasien

Sebuah contoh dari teknik ini adalah tes serologis untuk sifilis. Agen sifilis, Treponema
pallidum, tidak tumbuh dalam media laboratorium. Oleh karena itu tes serologis yang
berguna. Ini adalah:
Tes (non-treponemal) VDRL, di mana sebuah cardiolipin, lesitin dan kolesterol campuran
digunakan sebagai antigen. Cardiolipin penggumpalan terjadi dengan adanya antibodi,
untuk T palliduni. (Catatan:. Ini adalah tes non-spesifik, dan, jika positif, tes konfirmasi harus
dilakukan)

 Tes treponermal, di mana non-T pallidum layak digunakan sebagai antigen (misalnya tes
antibodi treponema neon diserap, FTA-ABS) (lihat Bab. 18).

PEMERIKSAAN LABORATORIUM UNTUK BERHUBUNGAN terapi antimikroba

Setelah diduga patogen telah diidentifikasi dari spesimen sensitivitas antimikroba yang
dapat diprediksi dengan beberapa tingkat akurasi, berdasarkan pengalaman sebelumnya
dan memanfaatkan

(46)

Data yang tersedia. Resep dengan cara ini disebut terapi empiris (misalnya berdasarkan pada
kepekaan staphylococci untuk flukloksasilin). Namun, adalah penting untuk dasar terapi rasional
pada hasil tes laboratorium antibiotik dilakukan pada patogen terisolasi. Kerentanan organisme
terhadap agen antimikroba Secara klinis mikrobiologi mikroba dianggap sensitif (atau sussceptible)
untuk agen antimikroba jika dihambat oleh konsentrasi obat biasanya diperoleh pada jaringan
manusia setelah dosis terapi standar. Sebaliknya adalah benar untuk organisme resisten. Organisme
dianggap kerentanan menengah jika konsentrasi menghambat agen antimikroba sedikit lebih tinggi
dari yang diperoleh dengan dosis terapeutik. Pengujian laboratorium untuk sensitivitas antimikroba
Aksi obat antimikroba terhadap organisme dapat diukur: kualitatif (disc tes difusi) kuantitatif

(konsentrasi penghambatan minimum atau minimal konsentrasi bakterisida tes). Sebuah teknik yang
disebut semikuantitatif tes break-point tidak dijelaskan di sini. Ini tes in vitro menunjukkan apakah
konsentrasi terapeutik yang diharapkan dari obat yang diberikan dalam dosis standar menghambat
pertumbuhan organisme diberikan dalam vivo. Hasil laboratorium hanya dapat memberikan indikasi
aktivitas obat in vitro, dan efeknya secara in vivo tergantung pada faktor-faktor seperti kemampuan
obat untuk mencapai tempat infeksi dan status kekebalan dari tuan rumah. Sebuah respon host yang
kuat pertahanan dapat memberikan kesan terapi 'sukses' obat, meskipun organisme penyebab
infeksi adalah 'tahan' terhadap obat tertentu ketika tes laboratorium yang digunakan. Disc uji difusi
Uji difusi disk adalah metode yang paling umum digunakan untuk menguji sensitivitas
mikroorganisme untuk agen antimikroba. Di sini, mengisolasi yang akan diuji adalah diunggulkan
atas seluruh permukaan pelat agar dan obat-diresapi cakram kertas filter diterapkan. Setelah
inkubasi semalam di 37C, zona inhibisi pertumbuhan diamati di sekitar masing-masing disk,
bergantung pada sensitivitas organisme tersebut. (Figs 6.9 and 6. 10).

Tes kepekaan antimikrobial dapat dibagi menjadi dua, primer & sekunder. Tes primer dilakukan
dengan menginokulasi langsung, misalnya pus, langsung ke wadah. Keuntungan dari tes ini rata-rata

Gambar 6.9

Gambar 6.10
(47)

Gambar 6.11
sensitivitas organisme hasil untuk hadir dalam Nanah akan tersedia setelah inkubasi 24-48
jam (lihat Gambar. 6.2). Hal ini sangat berguna ketika merawat pasien dengan infeksi akut
lemah seperti abses dentoalveolar. Namun, karena ini adalah perkiraan kasar, tes
sensitivitas sekunder karena itu dilakukan pada kultur murni dari organisme terisolasi, tetapi

hasilnya tidak tersedia untuk setidaknya 2-4 hari setelah pengambilan sampel.
Penilaian MIC dan MBC
Menentukan konsentrasi penghambatan minimum (MIC dan konsentrasi bakterisida
minimum (MBC) memberikan penilaian kuantitatif potensi antibiotik.
(Gambar 6.11).
Metode. Berbagai pengenceran dua kali lipat dari agen antimikroba dapat dimasukkan ke
dalam kaldu yang cocok dalam serangkaian tabung (tabung teknik dilusi). Kaldu ini
diinokulasi dengan suspensi standar Dari organisme uji dan diinkubasi selama 18
jam.Konsentrasi minimum dari obat yang menghambat pertumbuhan organisme uji dalam
tabung dicatat sebagai MIC yaitu konsentrasi terendah yang akan menghambat
pertumbuhan in vitro terlihat. Selanjutnya, inokulum standar dari masing-masing tabung di
mana pertumbuhan tidak terjadi dapat disubkultur pada agar darah untuk menentukan
konsentrasi minimum dari drugrequired untuk membunuh organisme (MBC). MBC
didefinisikan sebagai konsentrasi minimum obat yang membunuh 99,9% dari
mikroorganisme uji dalam inokulum asli.
Tes ini tidak rutin dilakukan tetapi sangat berguna pada pasien dengan infeksi serius dimana
terapi antimikroba yang optimal sangat penting, misalnya untuk membangun sensitivitas
screptococci diisolasi dari kultur darah dari pasien dengan endokarditis infektif, dan bakteri
menyebabkan septicaernia pada pasien imunosupresi.
TEPAT FOSIL DI Medical Microbiology
SeeTable 6.3.

Sesuai spesimen untuk infeksi oral

Sampling untuk patogen dalam lingkungan mulut menimbulkan banyak masalah karena
banyak flora komensal adat yang berkembang di rongga mulut. Selanjutnya, banyak
patogen endogen berasal dan menyebabkan penyakit ketika kesempatan muncul (patogen
oportunistik). Selain itu, memperoleh sampel tidak tercemar dari situs seperti kedalaman
kantong-kantong periodontal dimana penyakit aktivitas dan karenanya jumlah
periodontopathogens yang cenderung tinggi sangat sulit. Untuk alasan ini, teknik sampling
peradilan dan tepat harus digunakan ketika mendiagnosis infeksi oral (Tabel 6.4).
Spesimen dikirimkan ke laboratorv mikrobiologi oral dapat dikategorikan sebagai orang yang
berguna untuk pengelolaan infeksi purulen, infeksi mukosa, dan infeksi periodontal dan
karies.
Purulen infetctions
Spesimen yang tepat adalah sampel disedot nanah, jika mungkin. Berhati-hatilah untuk
menghindari luka jarum suntik ketika kembali selubung tutup jarum, drainase nanah residual

dengan sayatan, setelah pengambilan sampel aspirasi, adalah wajib. Langkah-langkah

laboratorium dalam diagnosis infeksi bernanah yang ditunjukkan pada Gambar 6.2.
Infeksi mukosa
Sebuah infeksi umum mukosa oral kandidiasis oral. Di sini, lesi adalah sampel dengan swab
kering, dan Pap yang diambil
(48)
Jaringan
atau sistem
kulit

Spesimen

Keterangan

Menyeka
Menggores
Vesikel cairan
Serum

blood
(bacteraemi
a and
septicamia)
saluran
gastrointest
inal

kultur darah

memeriksa untuk bakteri dan ragi

memeriksa untuk jamur
memeriksa untuk virus (mikroskop elektron
dan budaya)
Serologi virus
pencegahan steril diperlukan.
Beberapa spesimen yang diperlukan

Saluran
urinari

saluran per
nafasan
atas
Saluran
pernapasan
bawah

Saluran
kelamin

abses

Feses

Serum
spesimen urin midstream / supr
apubik aspirat / kateter urin spes
imen (bukan
dari kantongmengumpulkan)
pernasal, usap tenggorokan dan
hidung; cucian tenggorokan air
liur atau hidung
dan tenggorokan aspirasi
Sputum

Serum
penyeka dalam
'Amies atau yang stuart media
transportasi
penyeka di klamidia dan media
transportasi virus
Pap debit
Serum
Nanah
Nanah atau penyeka
Jaringan

Lesi

Penyeka

budaya untuk bakteri dan

virus; deteksi toksin untuk Clostridium
difficile; misroscopy ketat untuk parasit dan
protozoa; mikroskop elektron untukvirus
tes serologis untuk demam enterik
untuk bakteriologi kuantitatif dan kualitatif

culture for bordella pertusis. culture for Bhaemolytic streatococci, other bacteria and
viruses
culture and immunoflourescent for virus
budaya untuk bakteri, virus, dan
jamur; mikroskop untuk banyak
virus,mycobacterium tuberkulosis dan legio
nella spp
Viral dan serologi virus
for bacteria and yeast culture and
microscopy for gonococci and tricomonas
spp. (wet film)
budaya klamidia dan virus

untuk mendeteksi gonokokus

tes serologi syphlilis
aspirasi untuk kultur dan identifikasi
menghindari kontaminasi dari
kulit; nanah disukai
kirim sampel kecil dalam
wadah steril kering untuk homogenisasi,
budaya dan mikroskop
menghindari kontaminasi dengan flora

mucosal

Smear
Serum

normal. menggunakan
media transportasi jika perlu;budaya untuk
bakteri, jamur, dan virus
neon mikroskop; berguna
untuk gonokokus dan ragi
tes serologi untuk
infeksi stafilokokus dan streptokokus dan
virus

Dimodifikasi dari Ross PW, Holibrook WP. Klinis dan mikrobiologi lisan. Oxford; Blackwell,1984

mediately sesudahnya (lihat bagian tentang infeksi candida rendah).

ketika mengevaluasi kereta lisan ragi (atau organisme lain seperti Enterobacteriaceae)
kemudian bilas lisan harus dikumpulkan. ini memerlukan meminta pasien untuk
membilassoulth selama 60 detik dengan 10 ml phosphate
buffered saline tehn espectorating bilasanke dalam wadah, yang diangkut ke laboratorium
untuk kuantifikasi pertumbuhan ragi (dalam hal CFUs)

infeksi periodontal
nilai sampling mikrobiologi untuk diagnosis karies dan penyakit periodontal
adalahterbatas. Dalam kasus karies gigi ludah lactobacili dan streptokokus mutans dapat
digunakan, dan untuk tujuan ini sampel air liur harus dikumpulkan (Bab 32)
diagnosis penyakit periodontal dengan cara mikrobiologis yang
bermasalah. Pap gingivadalam adalah berguna untuk
diagnosis akut gingivitis ulseratif nekrosis, sementara kertassampel titik muncul berguna
untuk analisis DNA bakteri periodontophatic. Namun, yang terakhir ini bukan tes konklusif.

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI LABORATORIUM DARI VIRUS

Teknik-teknik untuk isolasi dan identifikasi virus secara signifikan berbeda dari
teknikbakteriologi. Laboratorium prosedur untuk diagnosis infeksi virus dari empat
jenis utama.