JENIS, KELIMPAHAN DAN PATOGENISITAS BAKTERI PADA THALLUS

RUMPUT LAUT Kappaphycus alvarezii YANG TERSERANG ICE-ICE DI

PERAIRAN PULAU PARI, KEPULAUAN SERIBU, JAKARTA

Oleh :
ONNY
C14103066

SKRIPSI
Sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar
Sarjana Perikanan pada Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan
Institut Pertanian Bogor

PROGRAM STUDI TEKNOLOGI DAN MANAJEMEN AKUAKULTUR

FAKULTAS PERIKANAN DAN ILMU KELAUTAN
INSTITUT PERTANIAN BOGOR
2008

41

Judul

Nama

Jenis, Kelimpahan dan Patogenisitas Bakteri pada

Thallus Rumput Laut Kappaphycus alvarezii Yang
Terserang Ice- Ice Di Perairan Pulau Pari, Kepulauan
Seribu, Jakarta
Onny

NRP

C14103066

Menyetujui,

Pembimbing I

Pembimbing II

Dr. Dinamella Wahjuningrum

NIP : 132 234 940

Irzal Effendi, MSi

NIP : 131 841 732

Mengetahui,
Dekan Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan

Dr. Ir. Indra Jaya, M.Sc

NIP. 131 578 799

42

Tanggal Lulus :

DAFTAR ISI

Halaman
DAFTAR TABEL .............................................................................................. i
DAFTAR GAMBAR .......................................................................................... ii
DAFTAR LAMPIRAN ....................................................................................... iii
I. PENDAHULUAN ........................................................................................... 1
1.1 Latar Belakang ...................................................................................... 1
1.2 Tujuan Penelitian .................................................................................. 2
II. TINJAUAN PUSTAKA ................................................................................
2.1 Perkembangan Rumput Laut di Indonesia.............................................
2.2 Biologi Rumput Laut Kappaphycus alvarezii .......................................
2.3 Penyakit Ice-Ice pada Rumput Laut ....................................................
2.4 Patogenisitas Bakteri..............................................................................
2.5 Faktor Lingkungan yang Mempengaruhi Pertumbuhan
Kappaphycus alvarezii...........................................................................

3
3
6
8
10

III. BAHAN DAN METODE .............................................................................

3.1 Waktu dan Tempat ................................................................................
3.2 Pengambilan Sampel .............................................................................
3.3 Isolasi, Identifikasi dan Penghitungan Bakteri ......................................
3.3.1 Teknik Isolasi Bakteri dan Penghitungan Kelimpahan Bakteri....
3.3.2 Teknik Identifikasi Bakteri...........................................................
3.4 Uji Patogenisitas ....................................................................................
3.5 Pengukuran Kualitas Air........................................................................
3.6 Analisa Data...........................................................................................

16
16
16
17
17
19
20
21
21

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ....................................................................

4.1 Kondisi Rumput Laut.............................................................................
4.2 Isolasi, Identifikasi dan Kelimpahan Bakteri Pada Rumput Laut
yang Terserang Ice-Ice dan Air Budidaya ..............................................
4.3 Uji Patogenisitas .....................................................................................
4.4 Kualitas Perairan Budidaya Rumput Laut ..............................................

23
23

13

24
32
35

43

V. KESIMPULAN DAN SARAN ..................................................................... 37

5.1 Kesimpulan ........................................................................................... 37
5.2 Saran ..................................................................................................... 37
DAFTAR PUSTAKA ......................................................................................... 38
LAMPIRAN ........................................................................................................ 41

DAFTAR TABEL

Halaman

44

1. Peluang pasar rumput laut penghasil karaginan di pasar global

berdasarkan kebutuhan dunia, produksi rumput laut Indonesia
dan luar Indonesia........................................................................

2. Lokasi budidaya rumput laut di Kepulauan Seribu.....................

3. Perkembangan budidaya rumput laut di Kepulauan Seribu

tahun 1997 s/d 2002.....................................................................

4. Perbedaan fungsi dan anatomi antara thallus yang terserang

ice-icedan thallus sehat................................................................

5. Bobot rumput laut pada masing masing akuarium......................

17

6. Ciri-ciri morfologi dan kelimpahan bakteri dari Thallus yang

Terserang Ice-ice.............................................................................

18

7. Bobot awal dan akhir rumput laut Kappaphycus alvarezii pada

uji patogenisitas .............................................................................

23

8. Kelompok, ciri- ciri, bakteri yang ditemukan pada rumput laut

yang terserang ice-ice...................................................................

24

9. Hasil analisa sidik ragam pertambahan bobot rumput laut

Kappaphycus alvarezii..................................................................

24

10. Karakterisasi fisiologi dan biokimia bakteri yang terdapat pada

thallus rumput laut K. alvarezii yang terserang ice-ice di Pulau Pari,
Kepulauan Seribu, Jakarta.......................................................

25

11. Karakterisasi fisiologi dan biokimia bakteri yang terdapat pada

air media rumput laut K. alvarezii yang terserang ice-ice di Pulau Pari,
Kepulauan Seribu, Jakarta...........................................................

26

12. Bakteri yang terdapat pada thallus K. alvarezii yang

terserang ice-ice dan yang terdapat di perairan
budidaya Pulau Pari, Kepulauan Seribu, Jakarta............................

29

13. Nilai parameter kualitas air pada media budidaya rumput laut
K. alvarezii di Pulau Pari, Kepulauan Seribu, Jakarta dan pada
akuarium pemeliharaan...............................................................

35

14. Nilai Total Organic Matter pada media Budidaya rumput laut
Kappaphycus alvarezii di Pulau Pari, Kepulauan Seribu, Jakarta..

36

DAFTAR GAMBAR
Halaman

45

1. Morfologi rumput laut Kappaphycus alvarezii yang dibudidayakan

di perairan Pulau Pari, Kepulauan Seribu, Jakarta.................................

2. Rumput Laut K. alvarezii yang sehat (a) dan terserang ice-ice(b)

yang ditemukan di perairan Pulau Pari, Kepulauan Seribu,
Jakarta...................................................................................................

10

3. Ilustrasi interaksi terjadinya penyakit (D) ; patogen (P), inang

atau rumput laut (I) dan lingkungan (L).................................................

11

4. Bentuk dan warna koloni bakteri yang diisolasi dari rumput laut
K. alvarezii yang terserang ice-ice dan air media di Pulau Pari,
Kepulauan Seribu, Jakarta ....................................................................

25

5. Jenis dan kelimpahan bakteri pada thallus Kappaphycus alvarezii

yang terserang ice-ice di perairan Pulau pari, Kepulauan Seribu,
Jakarta ...................................................................................................

27

6. Jenis dan kelimpahan bakteri di Perairan Pulau Pari,

Kepulauan Seribu, Jakarta ....................................................................

27

7. Jenis dan kelimpahan bakteri pada thallus yang terserang ice-ice yang
disuntikan bakteri Vibrio sp. pada media akuarium..............................

32

8. Jenis dan kelimpahan bakteri pada thallus yang terserang ice-ice yang
disuntikan bakteri Flavobacterium sp.pada media akuarium...............

33

9. Jenis dan kelimpahan bakteri pada thallus yang terserang ice-ice yang
disuntikan bakteri Branhamella sp. pada media akuarium .................

34

DAFTAR LAMPIRAN

Halaman
1. Kondisi rumput laut Kappaphycus alvarezii pada awal

46

penelitian sebelum disuntikan bakteri.................................................... 41

2. Alat, bahan dan metode penyuntikan bakteri pada rumput laut
Kappaphycus alvarezii............................................................................

43

3. Kondisi thallus rumput laut Kappaphycus alvarezii setelah dilakukan uji

patogenisitas............................................................................................ 43
4. Komposisi dan cara pembuatan media Sea Water Complete agar
(SWC) dan Thiosulphate Citrate Bile-salt Sucrose (TCBS) agar ......... 44
5. Morfologi koloni bakteri pada thallus rumput laut Kappaphycus
alvarezii yang terserang ice-ice dan media budidaya di Pulau Pari,
Kepulauan Seribu, Jakarta ...................................................................... 45

I PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Salah satu komoditas perikanan budidaya yang layak untuk dikembangkan
adalah rumput laut. Sayangnya, Indonesia belum memanfaatkan potensi itu secara
maksimal. Indonesia belum mampu menjadi produsen utama rumput laut di dunia.
Saat ini urutan produsen utama penghasil rumput laut terbesar di dunia adalah Chili,
Maroko dan Filipina. Indonesia hanya berada di posisi keempat dengan skala ekspor
sebanyak 96 ribu ton. Hingga saat ini, luas efektif lahan budidaya rumput laut baru
sekitar 220.180 hektar atau baru berkisar 20% dari luas lahan yang mencapai

47

1.110.900 hektar. Menurut Anggadiredja (2007) dalam Parenrengi, dkk (2007),

peluang pasar dunia yang belum terpenuhi terhadap produksi rumput laut masih
tinggi yaitu tahun 2007 sekitar 53.100 ton dan diperkirakan akan meningkat menjadi
72.510 ton pada tahun 2010.
Dua jenis rumput laut yang merupakan komoditas utama budidaya di
Indonesia adalah Gracilaria sp. di tambak dan Eucheuma cottonii di laut. Eucheuma
cottonii

yang kemudian diganti namanya

menjadi Kappaphycus alvarezii

(Largo et al.,1995) merupakan salah satu spesies yang paling banyak dibudidayakan
di perairan pantai Indonesia. Teknologi budidaya yang sederhana dan peluang pasar
yang tinggi menjadikan komoditas ini semakin banyak diminati oleh pembudidaya.
Dalam perkembangannya, terdapat kendalakendala yang mengakibatkan
produksi rumput laut menurun. Salah satu penyebab kegagalan budidaya rumput laut
adalah serangan penyakit yaitu penyakit ice-ice. Gejala penyakit ini adalah timbulnya
bercak putih pada sebagian thallus kemudian thallus tersebut menjadi pucat dan
membusuk.
Pada umumnya, studi penyakit ice-ice hanya mengarah pada faktor
lingkungan (Trono, 1974 dalam DKP, 2004a). Namun berdasarkan penelitian yang
dilakukan oleh Largo et al. (1995) bakteri berperan dalam pengembangan penyakit
ice-ice pada budidaya rumput laut K. alvarezii. Penelitian ini diharapkan dapat
menambah informasi mengenai jenis bakteri patogen pada rumput laut K. alvarezii
yang terserang ice-ice sehingga bermanfaat untuk mengendalikan infeksi bakteri
patogen yang akan merugikan pembudidaya rumput laut.

1.1 Tujuan
Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi, mengidentifikasi, menghitung
kelimpahan dan menguji patogenisitas bakteri pada rumput laut K. alvarezii yang
terserang ice-ice di perairan Pulau Pari, Kepulauan Seribu, Jakarta.

48

III BAHAN DAN METODE

3.1 Waktu dan Tempat

Penelitian ini dilaksanakan dari tanggal 8 Juli sampai dengan 20 0ktober
2007. Sampel rumput laut diambil dari petani rumput laut di Pulau Pari, Kepulauan
Seribu, Jakarta. Pembudidaya membudidayakan rumput laut dengan menggunakan
sistem long line. Lokasi budidaya berjarak 500 meter dari pantai, kedalaman perairan
sekitar 50 cm dengan substrat dasar perairan berupa pasir kasar bercampur dengan
pecahan karang. Pemeriksaan sampel, isolasi dan identifikasi bakteri dilakukan di

49

Laboratorium Kesehatan Ikan, Departemen Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan

dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor, Kampus Darmaga Bogor, sedangkan uji
patogenisitas bakteri dilakukan di Laboratorium Pusat Studi Ilmu Kelautan IPB,
Ancol, Jakarta Utara.

3.2 Pengambilan Sampel

Pengambilan sampel untuk isolasi dan identifikasi bakteri pada thallus
Kappaphycus alvarezii yang terserang ice-ice dan air laut di lokasi budidaya
dilakukan pada tanggal 13 Juli 2007. Sebanyak 10 sampel thallus yang terserang iceice diambil dari beberapa rumpun secara acak. Thallus dibersihkan dan dicuci dengan
air laut steril. Bunsen yang menyala diperlukan saat pencucian thallus dengan
maksud agar tidak ada kontaminasi bakteri dari udara sekitarnya. Setelah itu, thallus
dimasukkan ke dalam botol kaca yang telah berisi air laut steril. Untuk isolasi dan
identifikasi bakteri pada air budidaya rumput laut, sampel air diambil sebanyak 3 kali
ulangan dan dimasukkan kedalam botol steril. Seluruh sampel dimasukkan kedalam
ice box yang telah ditambahkan es batu. Lokasi pengambilan sampel thallus yang
terserang ice-ice, rumput laut sehat dan sampel perairan budidaya diambil dari 3 titik
lokasi yaitu 500 m, 600 m 700 m dari pantai.
Rumput laut yang terserang ice-ice memiliki ciri fisik yaitu thallus mudah
patah dan berwarna putih. Hampir seluruh permukaan thallus berlendir. Rumput laut
yang sehat memiliki ciri-ciri thallus utuh, tidak patah, berwarna coklat, tidak
berlendir, dan memiliki percabangan yang banyak.
Rumput laut sehat yang akan digunakan untuk uji patogenisitas, diaklimatisasi
terlebih dahulu selama 3 hari dalam bak yang terbuat dari beton berukuran 3x0,5x2m
dengan kedalaman air 1 meter. Selama aklimatisasi tidak dilakukan pergantian air.
Setelah itu rumput laut dengan bobot rata-rata 10 gram dipelihara dalam akuarium
selama 20 hari dan dilakukan ganti air 3 hari sekali (tabel 5.)
Tabel 5. Bobot rumput laut Kappaphycus alvarezii pada setiap akuarium
Kode akuarium

Bobot awal (gram)

50