10/02/2014

Dosen :
Dr. Aline Puspita K, M.Si
Dr. Nuniek Herdyastuti, M.Si
Mirwa Adi Prahara, M.Si

Standar Kompetensi :
Memahami dan mendeskripsikan : metabolisme biomolekul,
hubungan antar metabolisme biomolekul, dan pengolahan
informasi genetika
Materi :
Konsep Dasar Metabolisme
Metabolisme Karbohidrat
Transport elektron, Fosforilasi oksidatif dan
Pengaturan ATP
Fotosintesis
Metabolisme Lipida
Metabolisme Asam Amino & Nukleotida
Pengolahan Informasi Genetika

10/02/2014

Referensi :
Lehninger, 1988, Dasar-dasar Biokimia, jilid
1,2,3, Jakarta, Erlangga
Mathews,C.K and Van Holde K.E, 2000,
Biochemistry, second ed., The Benjamin
Cumming company, Inc.
Mayes, P.A, dkk, 1991, Biokimia Harper, Jakarta
: EGC Penerbit Buku Kedokteran
Nelson D.L., and Cox M.M., 2003, Lehninger
Principle of Biochemistry, 4th edition, University
of Winconsin-Madison
Stryer, L., 1988, Biochemistry, third ed., New
York : W.H. Freeman ans company

PENILAIAN
Partisipasi (P)
Tugas (T)
UTS (UT)
UAS (UA)
Nilai akhir =
{(2xP)+(3xT)+(2xUT)+(3xUA)}

10/02/2014

TUGAS
Buat tulisan secara berkelompok (max = 3 orang)
Materi :
Konsep metabolisme
Katabolisme Karbohidrat
Anabolisme Karbohidrat
Transport elektron
Fotosintesis
Katabolisme Lemak
Anabolisme Lemak
Katabolisme Protein
Anabolisme Protein
Metabolisme purin dan pirimidin
Replikasi
Transkripsi
Translasi
Email ke : nuniekherdyastuti@gmail.com hari sabtu (15
Februari 2014) sebelum jam 09.00

By : Nuniek Herdyastuti
Februari - 2014

10/02/2014

Memahami beberapa aspek metabolisme

dan perannya dalam sel hidup

Konsep Dasar Metabolisme :

Aspek makro dan mikro metabolisme,
siklus energi

Metabolism &
Bioenergetica

Information
Genetics

Structure Function
Macromolecul

10/02/2014

METABOLISME
Metabolism is the sum of the chemical
reactions in an organism

Fungsi :
Memperoleh energi kimia dari hasil degradasi sari
makanan
Mengubah molekul nutrien menjadi prekursor unit
pembangun bagi makromolekul
Menggabungkan unit-unit pembangun menjadi
makromolekul (protein, lemak, polisakarida, asam nukleat
dan komponen sel lain)
Membentuk dan mendegradasi biomolekul yang
diperlukan dalam fungsi tertentu dari sel

METABOLISME
Reaksi kimia di dalam tubuh organisme
Membutuhkan sistem multienzim
Ada 2 :

KATABOLISME
ANABOLISME
Aspek makro : daur CO2, O2 dan N2

10/02/2014

METABOLIC PATHWAYS ARE ENZYMATICALLY

CHEMICAL REACTION IN THE CELL
Jalur

metabolik ditentukan oleh adanya enzim

Enzim-enzim dikode oleh gen-gen tertentu
A

E1

E1

E2

C
E3

B
E2

E4

D
E3

E4

LINEAR

CIRCULAR

10/02/2014

Perbedaan anabolisme & katabolisme

ANABOLISME

Sintesis
Membutuhkan energi
Reaksi reduksi
Hasil akhir : senyawa
awal katabolisme

KATABOLISME

Degradasi
Melepaskan energi
Reaksi oksidasi
Senyawa awal mrpkn
hasil akhir anabolisme

10/02/2014

Lemak

Karbohidrat

Protein

MULUT
Polisakarida ,
Oligosakarida, Disakarida

Polisakarida, Oligosakarida,
Disakarida

Glukosa, fruktosa,
galaktosa

Lemak

LAMBUNG
Lemak Trigliserida

USUS HALUS
Gliserol, as.lemak, as.fosfat

Protein

Oligopeptida
Proteosa, Pepton

Asam
amino

DINDING USUS HALUS

ALIRAN DARAH & LIMPA
ekskresi

Hati

Jaringan otot

10/02/2014

10/02/2014

Three Stages of Catabolism

10

10/02/2014

Autotrof
Misal : sel hijau daun, cyanobacteri
Heterotrof
Misal : hewan tingkat tinggi,
mikroorganisme (hampir semua)

Organisme Heterotrof :
Aerob
Anaerob : organisme dlm tanah, di dasar
lautan
Fakultatif : ragi

11

10/02/2014

Metabolic Diversity Among Organisms

Photoautotroph

Energy
source
Light

Carbon
source
CO2

Photoheterotroph

Light

Organic
compounds

Chemoautotroph

Chemical

CO

Chemoheterotroph

Chemical

Organic
compounds

Nutritional type

Example
Oxygenic:
Cyanobacteria
plants.
Anoxygenic: Green,
purple bacteria.
Green, purple
nonsulfur bacteria.
Iron-oxidizing
bacteria.
Fermentative
bacteria.
Animals, protozoa,
fungi, bacteria.

Daur CO2 dan O2

12

10/02/2014

N2 CYCLES

Hubungan Energi
diantara lintas
Katabolisme &
Anabolisme

13

10/02/2014

Energi Kimia
Pada
Metabolisme

Siklus ATP dan Bioenergetika Sel

Bentuk energi : Energi bebas (G)
Termodinamika : G = H T S
aA + bB
Keq =

[C]c [D]d
[A]a [B]b

cC + dD
G = -2,303 RT log Keq

Energi bebas (G) khas bagi reaksi yang berbeda

Misal :
a. Glukosa-1P
glukosa-6P
G = -1,74 kkal/mol
b. As. palmitat + 23 O2 + 16 CO2 + 16 H2O

G = -2338 kkal/mol

G : energi kimia = ATP

14

10/02/2014

Hydrolysis of ATP

High energy
ATP
ADP
AMP

ADP + Pi
AMP + Pi
A + Pi

G = -7.3 kcal/mole (exergonic, spontaneous)

G = -7.3 kcal/mole
G = -3.4 kcal/mole (not high energy)

15

10/02/2014

ATP : senyawa fosfat

dengan energi tinggi

Derajad ionisasi ATP &

produksinya
Produk : 4 muatan negatif
yg saling tolak menolak
Terjadi hibrid resonansi

Daur ATP
ATP
CO2
H2O

Biosintesis
Katabolisme

Kontraksi & motilitas

Transport aktif
Pemindahan inf.genetik

O2

ADP + Pi
Bahan
bakar

16

10/02/2014

Nicotinamid adenosin dinucleotida phosphat

(NADPH)

Flavin adenosin dinucleotida (FADH)

17

10/02/2014

Daur NADP/NADPH
Katabolisme

NAD+ /NADP+
(bentuk oksidasi)

NADH/NADPH
(bentuk reduksi)

Anabolisme
(reaksi reduksi
biosintesis)

18

10/02/2014

PENGATURAN LINTAS
METABOLIK

Enzimatis : enzim
alosterik
Pengaturan hormon
Pengaturan konsentrasi
enzim (induksi)

19