Anda di halaman 1dari 23

Pengantar Biokimia

Tujuan Mata Kuliah:


Memberikan pengetahuan dan pemahaman
tentang prinsip-prinsip serta proses-proses
biokimia yang berhubungan dengan struktur
dan fungsi pada makhluk hidup, serta
kemampuan menggunakan pemahamannya
tentang substansi dan proses biokimia yang
terdapat pada mahluk hidup.

Materi perkuliahan:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.

Pendahuluan
Susunan Kimia Sel
Karbohidrat
Lipid
Protein
Asam nukleat
Enzim dan koenzim

Materi perkuliahan:
8. Metabolisme karbohidrat
9. Metabolisme lipid
10. Metabolisme asam amino dan protein
11. Hormon
12. Darah

DAFTAR PUSTAKA
Segel, IH., Biochemical Calculations, New York
Murray, RK, et.al, Biokimia Harper ed. 25, EGC Jakarta
Horton, H.R., et.al, Principles of Biochemistry, 3rd ed. Prentice Hall. 2002
Day, RA dan Underwood AL., Analisis Kimia Kuantitatif, ed. 6. Erlangga, Jakarta,
2002
Murray, RK., et.al, Harpers Illustrated Biochemistry, 26th ed. McGraw Hill, 2003
Conn, EE., et.al, Outline of Biochemistry, John Wiley and Sons, 1997
Greenspan, FS. And Gardner, DG., Basic and Clinical Endocrinology, 7th ed.
McGraw Hill, 2004
Montgomery, R., Conway, TW. And Spector, AA., Biokimia. Berorientasi pada Kasus
Klinik. Ed. 5. Jilid 1. Binarupa Aksara, 1993
Holme, DJ and Peck, H., Analytical Biochemistry, 2nd ed. Longman, New York, 1993
Kresno, SB., Imunologi Diagnosis dan Prosedur Laboratorium, FKUI, 2001
Hardjasasmita, P., Ikhtisar Biokimia Dasar A, FKUI, 2002
Hardjasasmita, P., Ikhtisar Biokimia Dasar B, FKUI, 2002
Achmad, H., Kimia Larutan, Citra Aditya Bakti, 2001
Bodansky, M., Kimia Peptida, ITB, 1998
Bellaart, AC., Ikhtisar ringkas Vitamin dan Hormon penting, Djambatan, 1983

DAFTAR PUSTAKA
Achmad, H dan Tupamahu, Struktur Atom, Struktur Molekul dan Sistem Periodik, Citra
Aditya Bakti, 2001
Koolman, J., dan Rohm, KH., Atlas Berwarna dan Teks Biokimia, Hipokrates, 2001
Wirahadikusumah, M., Biokimia, metabolisme energi, karbohidrat dan lipid, ITB, 1985
Toha, AHA., Biokimia, Metabolisme Biomolekul, Alfabeta, 2005
Sadikin, M., Biokimia Darah, Widya Medika, 2001
Wahab, AS., dan Julia, M., Sistem Imun, imunisasi dan penyakit imun, Widya Medika,
2002
Jusuf, M., Gentika I, Sagung Seto, 2001
Sadikin, M., Biokimia Enzim, Widya Medika, 2002
Wirahadikusumah, M., biokimia protein, enzim dan asam nukleat, ITB, 2001
Gropper, SS., Smith, JL. And Groff, JL., Advanced Nutrition and Human Metabolism,
4th ed, Wadsworth, 2005
Linder, MC, Biokimia Nutrisi dan Metabolisme, UI-Press, 1992
Schumm, DE., Intisari Biokimia, Binarupa Aksara, 1992
Rastogi, SC., Biochemistry, 2nd ed, McGraw Hill, 2003
Brody, T., Nutritional Biochemistry, Academic Press, 1994

PENILAIAN

Kehadiran
UTS
UAS
TUGAS/LAP. PR.

5%
35%
40%
20%

(10%)
(25%)
(50%)
(15%)

Pendahuluan
Pada makhluk hidup senantiasa terjadi
aktivitas dan perubahan-perubahan.
Proses-proses yang terjadi pada makhluk
hidup berhubungan dengan reaksi-reaksi
kimia dalam sel
Proses-proses serta seluruh aktivitas dalam
makhluk hiudp bisa dipelajari dari aspek
biokimia

Definisi
the science concerned with the chemical basis of life.
The science concerned with the chemical constituentof
living cells and with the reactions and process they
undergo.
Biokimia merupakan studi tentang susunan kimia sel,
senyawa-senyawa yang menunjang aktivitas makhluk
hidup serta energi yang diperlukan atau dihasilkan
Jadi kajian biokimia mencakup: struktur kimia serta
reaksi-reaksi kimia yang terjadi pada organisme hidup

Ruang lingkup kajian Biokimia


1.
2.
3.
4.

Struktur kimia komponen-komponen sel


makhluk hidup
Hubungan antara fungsi biologi dengan
struktur kimia
Metabolisme, totalitas reaksi kimia yang
terjadi pada makhluk hidup
Proses-proses dan substansi kimia yang
berhubungan dengan informasi penurunan
sifat biologi

Sejarah
Istilah biokimia diperkenalkan oleh Neuberg ahli kimia Jerman pada tahun 1903
Para ahli biokimia harus membuktikan bahwa komponen kimia makhlukhidup dan
makhluk tak hidup sangat berbeda
Th 1500 1800 ; merupakan tahun dimana perkembangan biokimia prinsip dasar
kimia seperti reaksi kinetika dan komposisi molekul
Pada abad ke-18 ahli kimia Swedia Karl Wilhelm Scheele :analisis kimia jaringan
tumbuhan dan hewan
PadaAkhir abad 19 :
1828 Friedrich Wohler sintesis urea
1897 Eduard Buchner ekstrak ragi (enzim)

Pada abad ke-20 J.B. Sumner membuktikan enzim urease dapat dikristalkan
1950 s/d 1960 : John C. Kendrew dan Max Perutz ; struktur protein
1944 : Oswald Avery, Colin MacLeod, Maclyn McCarty ; DNA
1953 : James D Watson dan Francis H.C. Crick struktur 3D DNA

Pembentukan Urea

NH4NCO
amonium sianat

O
H2N - C - NH2
Urea

Hierarki organisasi molekul dlm sel


sel

Inti sel,
mitokondria,kloroplas

organ
el

Enzim, ribosom,
sistemkontraktil

Supramolekul
BM 106-109
Makromolekul

Asam nukleat

protein

mononukleoti
da

As amino

polisakarida

lipid

BM 103-109
Building block
(BM 100-350

Senyawa antara
(BM 50-250)

Seny kimia di sktr


(BM 18-44)

Ribosa,
karbamoilfosf
at

As alfa
keto

monosak
arida

Piruvat, malat

CO2, H2O,
N2

As
lemak,
gliserol
Asetat,
malonat

TINGKATAN ORGANISASI MAKHLUK


HIDUP DAN UKURANNYA

STRUKTUR ATOM YANG PENTING PADA


MATERI HIDUP

CONTOH STRUKTUR PROTEIN

STRUKTUR LIPID

Perkembangan biokimia
Perkembangan kimia tak lepas dari penemuan alat
bantu berupa mikroskop elektron, yang
mengungkap tabir reaksi-reaksi kimia dalam sel
Ditunjang pula oleh genetika : penemuan konsep
gen ---kromosom yang terdiri dari senyawa protein
dan asam nukleat
Pada tahun 1953 James Watson dan Francis Crick
menjelaskan struktur double helix DNA
Selanjutnya berkembang dengan penemuan
vitamin, enzim sebagai biokatalis serta struktur
kimia senyawa organik lain

Metode dan persiapan yang dilakukan di


laboratorium biokimia
fraksinasi garam (salt fraksinasi)
Metode pemisahan dan
kromatografi (kertas, pertukaran ion,
pemurnian biomolekuler
afinitas, lapis tipis, gas-cair, cair dg
tekanan tinggi, gel filtration
elektroforesis
ultrasentrifugasi

Metode penentuan struktur analisis elemental


spektrofotometri
biomolekuler
sekuensing

Persiapan proses biokimia

hewan coba; isolasi organ


Jaringan; sel homogenat
organel sel; isolasi gen

Contoh : Penyebab utama beberapa penyakit


(mekanisme biokimia dlm sel atau dlm tubuh)
agen fisik : trauma (mekanisme), suhu yang ekstrim,
perubahan tekanan atmosfir, radiasi dan kejutan listrik
agen kimia : obat, senyawa racun
agen biologi : virus, bakteria, jamur, parasit
kekurangan O2 : kehilangan darah, deplesi kapasitas darah
mengangkut O2, keracunan pada enzim oksidatif
gangguan genetik : kongenital, molekuler
reaksi imunologi : anafilaksis, penyakit autoimun
ketidakseimbangan gizi : defisiensi, kelebihan
ketidakseimbangan endokrin : defisiensi hormon, kelebihan

Manfaat Biokimia
Penerapan biokimia dalam bidang pertanian
dan kedokteran
Memecahkan masalah-masalah gizi
Penyakit akibat kekurangan gizi
Berperan dalam farmakologi obat

beberapa kegunaan investigasi biokimia dan


uji laboratorium yg berhubungan penyakit :
manfaat

Contoh

penyebab dan mekanisme


penyakit

Gangguan genetik sep cystic fibrosis

pengobatan

Diet rendah fenialaninutk PKU

membantu diagnosis penyakit


tertentu

Plasma enzim kreatin kinase utk


diagnosa myokard infark

skrining (diagnosa dini)

Pengukuran tiroksin (darah) atau TSH


pada neonatal (hipotiroid congenital)

membantu monitoring
kemajuan suatu penyakit

Plasma ALT utk melihat infeksi hati

membantu menilai respon


terapi suatu penyakit

Pengukuran CEA/carcinoembryonic
antigen darah (kanker kolon)