Fosforilasi oksidatif adalah proses dimana elektron dari pengurangan

kofaktor NADH dan ubiquinol tersebut disalurkan secara bertahap untuk

oksigen. Elektron mengalir seperti listrik melalui sebuah sirkuit, dengan
energi bebas yang dilestarikan melalui pembentukan seiring gradien proton.
Pada akhirnya investasi dikurangi hasil kofaktor dalam produksi ATP.

Ingat bahwa pembawa elektron berkurang NADH dan ubiquinol dihasilkan

selama glikolisis dan siklus asam sitrat, serta jalur oksidasi asam lemak.
Selama proses respirasi seluler, fosforilasi oksidatif memanfaatkan energi
kimia ini mengurangi molekul untuk menghasilkan ATP. Dalam hampir semua
eukariota, akseptor elektron paling dalam serangkaian reaksi oksidasireduksi oksigen dalam mitokondria.

ANATOMI Mitokondria

Anatomi mitokondria yang mencerminkan perannya dalam proses fosforilasi

oksidatif. Klik pada bagian organel untuk belajar tentang fitur-fiturnya.

Mitokondria terdiri dari dua membran yang dipisahkan oleh ruang

antarmembran. Selama fosforilasi oksidatif, proton dipompa ke dalam
kompartemen ini.
Membran luar berpori dan memungkinkan untuk difusi bebas dari molekul
kecil karena adanya protein yang disebut saluran porins. Topologi dari
membran luar menyerupai membran luar bakteri, sesuai dengan asal
mitokondria sebagai simbion bakteri.
Membran dalam yang kedap kebanyakan zat, termasuk ion, dan
membungkus ruang disebut sebagai matriks. Membran bagian dalam
berbelit-belit dalam struktur, sehingga memberikan area permukaan besar
untuk kompleks protein dari rantai fosforilasi oksidatif.
SISTEM SHUTTLE

Karena membran mitokondria bagian dalam kedap kebanyakan molekul,

NADH yang dihasilkan dari glikolisis dalam sitosol harus diimpor melalui
reaksi biokimia dari pesawat ulang-alik malat-aspartat. Proses ini merupakan
bentuk pertukaran mata uang antara satu wilayah sel yang lain. ATP, ADP,
dan fosfat juga memerlukan protein transportasi untuk impor dan ekspor
mereka di membran dalam.

PENDAHULUAN ATAS ANGKUTAN CHAIN

Membran dalam mengandung banyak protein, termasuk tiga kompleks

elektron-transportasi utama. Elektron dari NADH dan ubiquinol shuttled
antara kompleks dengan cara yang bijaksana langkah yang berhubungan
dengan potensi pengurangan mereka. Kelompok prostetik dalam setiap
kompleks mengandung ion logam yang memfasilitasi transfer elektron.

Satu Vs. Dua Carriers Elektron

Beberapa kelompok dalam kompleks protein dapat langsung menerima dua

elektron pada suatu waktu, sementara yang lain hanya dapat menerima
satu. Keadaan pengurangan ini operator satu-elektron harus dipulihkan
sebelum elektron kedua dapat ditransfer.

KOMPLEKS I

Elektron dari NAD berkurang memulai perjalanan mereka di Kompleks I.

Kompleks I transfer sepasang elektron dari NADH ke ubiquinone, dengan
beberapa pusat redoks bertindak sebagai akseptor menengah.

Pertama, dua elektron yang disumbangkan untuk kelompok flavin

mononukleotida. Dari sini, elektron kemudian shuttled satu per satu melalui
serangkaian situs besi-sulfur. Akhirnya, ubiquinone menerima dua elektron,

pada gilirannya, untuk menjadi sepenuhnya berkurang. Ubikuinon adalah

pembawa elektron mobile yang bebas didifusi dalam bilayer lipid.

Untuk setiap pasangan elektron ditransfer, kompleks saya bersamaan

translocates empat proton dari matriks ke ruang antarmembran. Sebuah
kawat proton terbentuk sebagai proton dengan cepat disampaikan melalui
asam amino berikatan hidrogen dalam Kompleks I. Dengan cara ini, sebuah
diferensial proton, dan karenanya gradien pH, mulai terbentuk melintasi
membran dalam. Energi yang dilepaskan dari disipasi proton gradien ini pada
akhirnya akan digunakan untuk membentuk ATP.

KOMPLEKS II

Dua hal lain berkontribusi elektron rantai transportasi. Yang pertama adalah
suksinat dehidrogenase dari siklus asam sitrat, kadang-kadang disebut
sebagai kompleks II dalam rantai transportasi. Yang kedua adalah pesawat
ulang-alik gliserol fosfat. Ini tidak dibahas dalam buku Anda sebagai bagian
dari rantai transpor elektron karena mereka tidak langsung berkontribusi
terhadap gradien proton.

III KOMPLEKS DAN sitokrom C

Mengurangi ubiquinone berikutnya angkutan elektron untuk mobile operator

sitokrom c melalui aksi Kompleks III. Sitokrom adalah protein yang
mengandung gugus heme karakteristik.

Anggota keluarga sitokrom mengandung gugus heme karakteristik yang

terdiri dari cincin porfirin yang mengelilingi atom besi pusat. Siklus besi
antara teroksidasi dan mengurangi negara sebagai elektron dilewatkan ke
sitokrom.

Beberapa sitokrom merupakan bagian dari kompleks protein besar, namun

sitokrom c adalah protein membran perifer yang bertindak sebagai pembawa
elektron mobile.

Kompleks III ekstrak elektron dari ubiquinone dalam proses dua-langkah rinci
dikenal sebagai siklus Q. Satu elektron akan diteruskan ke sebuah protein
besi-sulfur, untuk sitokrom c1, dan kemudian ke sitokrom c. Elektron kedua
mengikuti rute yang berbeda, melewati sitokrom b dan kemudian kembali ke
kuinon untuk menghasilkan semiquinone a. Ubiquinol lain menyumbangkan
dua elektron untuk Complex III. Satu elektron melewati protein besi-sulfur
dan sitokrom c1, untuk sitokrom c, dan elektron lainnya melewati sitokrom b
ke semiquinone tunggu. Hasil akhirnya adalah bahwa dua elektron
dilewatkan ke sitokrom c dan empat proton dipompa ke ruang
antarmembran untuk berkontribusi pada gradien proton.

IV KOMPLEKS

Langkah terakhir dalam rantai transpor elektron adalah pengurangan

molekul oksigen oleh elektron yang berasal dari sitokrom c. Sitokrom c feri
elektron Kompleks IV, yang mengandung baik heme kelompok prostetik dan
ion tembaga. Pada akhirnya, empat elektron harus ditransfer melalui IV
kompleks untuk menghasilkan pengurangan penuh oksigen ke dua molekul
air. Hasil akhirnya adalah empat proton dipompa melintasi membran dalam
per molekul oksigen berkurang, atau dua proton per pasangan elektron.

REVIEW kemiosmotik

Kami telah menunjukkan bagaimana elektron mengangkut dari NAD dan

ubiquinol oksigen, dengan pembentukan ditambah dari gradien proton. Tapi
bagaimana gradien ini energi bebas dipanen untuk menghasilkan ATP?

Proton yang telah terakumulasi dalam ruang antarmembran analog dengan

air yang terbentuk di belakang bendungan. Proton ini akan secara spontan
mengalir kembali ke dalam matriks berikut gradien konsentrasi mereka jika
membran dalam yang permeabel terhadap mereka.

Sebuah protein saluran kompleks yang dikenal sebagai ATP synthase

memungkinkan aliran dikontrol proton kembali ke saat matriks, pada saat
yang sama, memanfaatkan energi bebas dari aliran proton untuk mengubah
ADP dan fosfat dalam ATP. ATP dapat dianggap sebagai bentuk energi bebas
portabel, atau mata uang energi, yang dapat digunakan untuk energi yang
membutuhkan reaksi di tempat lain dalam sel. Hal ini analog dengan air
yang mengalir melalui turbin bendungan untuk menghasilkan listrik.

Proses ini dikenal sebagai teori kemiosmotik. Rincian fungsi synthase

bagaimana ATP pada tingkat molekuler akan dieksplorasi dalam latihan
berikutnya pada ATP sintase.

Siklus Asam Sitrat

PENDAHULUAN

Siklus asam sitrat merupakan jalur metabolisme utama yang melengkapi

degradasi oksidatif asam lemak, asam amino, dan monosakarida. Selama
katabolisme aerobik, biomolekul ini dipecah menjadi molekul yang lebih kecil
yang pada akhirnya berkontribusi terhadap kebutuhan energik atau molekul
sel.

Awal langkah metabolik, termasuk glikolisis dan aktivitas dehidrogenase

kompleks piruvat, menghasilkan fragmen dua karbon yang disebut gugus
asetil, yang terkait dengan kofaktor besar yang dikenal sebagai koenzim A
(CoA atau). Hal ini selama siklus asam sitrat yang asetil-KoA dioksidasi
menjadi produk limbah, karbon dioksida, bersama dengan pengurangan
kofaktor + NAD dan ubiquinone.

Siklus asam sitrat melayani dua tujuan utama:

Untuk meningkatkan potensi ATP-memproduksi sel dengan menghasilkan

berkurang pembawa elektron seperti NADH dan mengurangi ubiquinone; dan
Untuk memberikan sel dengan berbagai prekursor metabolik.
Setelah menyelesaikan latihan ini, Anda harus:

Dapat menjelaskan sumber-sumber kelompok asetil yang memasuki siklus

asam sitrat;
Melacak konversi substrat untuk produk melalui masing-masing asam sitrat
siklus delapan reaksi dan memahami bagaimana fluks melalui siklus diatur;
Memahami output energik dari siklus asam sitrat;

Jelaskan peran pembawa elektron berkurang dan peran mereka dalam

kopling siklus asam sitrat untuk reaksi hilir yang menghasilkan ATP;
Menggambarkan karakter amphibolic dari siklus asam sitrat; dan
Memahami reaksi yang mengisi sitrat intermediet siklus asam.
LOKASI SELULER

Kedua sel prokariotik dan eukariotik menggunakan siklus asam sitrat untuk
membantu memenuhi kebutuhan energik dan molekul. Dalam bernapas
prokariota, siklus asam sitrat berlangsung di sitosol. Pada sel eukariotik,
seperti sel-sel tubuh manusia, siklus berlangsung dalam matriks mitokondria.

KATABOLISME

Reaksi dari siklus asam sitrat mengoksidasi gugus asetil asetil-CoA untuk dua
molekul karbon dioksida. Selama siklus reaksi, elektron ditransfer dari asetilCoA untuk elektron operator. Setelah pembawa elektron menerima elektron,
ini disebut sebagai "berkurang." Pada akhirnya, mengurangi pembawa
elektron berpartisipasi dalam jalur reaksi hilir yang menghasilkan ATP, mata
uang energi sel.

Perhatikan bahwa satu-energi tinggi nucleoside triphosphate dihasilkan

langsung dari siklus reaksi.

Karena asetil-CoA dipecah ke molekul yang lebih kecil selama siklus asam
sitrat, siklus asam sitrat digambarkan sebagai katabolik.

Anabolisme dan katabolisme

Selain catabolizing molekul untuk memenuhi kebutuhan energik selular,

siklus asam sitrat adalah kunci dalam menyediakan berbagai jalur biokimia
dengan prekursor diperlukan untuk sintesis molekul. Reaksi yang melibatkan
"bangunan" molekul dari bagian yang lebih kecil yang disebut sebagai
anabolik. Reaksi Anabolic menggunakan sitrat intermediet siklus asam
sebagai prekursor untuk asam lemak, asam amino, dan sintesis karbohidrat.
Proses-proses anabolik juga mungkin memerlukan berkurang kofaktor.

Banyak intermediet siklus asam sitrat berfungsi sel baik sebagai prekursor
reaksi dan hasil reaksi. Sebagai contoh, sebuah-ketoglutarat dapat bertindak
sebagai prekursor untuk asam amino dalam jalur anabolik, atau mungkin
dikatabolisme menjadi karbon dioksida selama reaksi dari siklus asam sitrat.
Dengan demikian, siklus asam sitrat yang tidak murni anabolik atau
katabolik murni. Reaksi yang memiliki karakter ganda ini bangunan dan
merendahkan molekul dianggap amphibolic. Amphi adalah awalan Yunani
yang berarti keduanya.

SUMBER ASETIL-COA

Gambar-gambar kerangka dari glukosa monosakarida, asam palmitat asam

lemak, dan asam amino lisin dan glutamat digambarkan. Molekul-molekul ini
terdegradasi menjadi senyawa umum yang disebut asetil-CoA, inisiator dari
siklus asam sitrat. Pilih berbagai molekul untuk mempelajari bagaimana
masing-masing senyawa akhirnya memasuki siklus asam sitrat sebagai
asetil-CoA. Kemudian mempertimbangkan bagaimana efisiensi metabolisme
akan berubah jika produk umum karbohidrat, asam lemak, dan asam amino
katabolisme tidak ada.

Asam Lemak

Banyak asam lemak yang berbeda ada, meskipun struktur mereka dapat
digeneralisasi sebagai asam karboksilat dengan, ekor hidrokarbon panjang.
Palmitat adalah contoh dari asam lemak enam belas karbon.

Ketika metabolisme sel kebutuhan meningkat, asam lemak bebas memasuki

mitokondria di mana reaksi degradatif disebut b oksidasi terjadi. Sebuah
asam lemak disingkat oleh dua atom karbon ditambah asetil-CoA bebas hasil
molekul dari setiap putaran b oksidasi. Asetil-CoA memulai siklus asam sitrat.

Asam Amino

Periksa struktur glutamat dan lisin. Ingat bahwa asam amino terdiri dari
amino dan gugus karboksil di ujung-ujung, ditambah rantai samping
terpasang.

Dalam kasus kelaparan, peningkatan degradasi protein dan asam amino

bebas yang dihasilkan dapat digunakan sebagai sumber bahan bakar
metabolik. Atau, jika asupan organisme asam amino bebas melebihi nya
kebutuhan protein-bangunan, asam amino bebas dimetabolisme, karena
tidak ada mekanisme penyimpanan untuk asam amino berlebih.

Biasanya, gugus amino dari asam amino dihapus dalam reaksi deaminasi.
Rangka karbon yang tersisa dipecah ke berbagai produk tergantung pada
mana dari dua puluh asam amino mengalami katabolisme. Dalam beberapa
kasus, kerangka karbon yang tersisa dipecah menjadi asetil-CoA atau
piruvat, yang kemudian diubah menjadi asetil-CoA. Atau, siklus asam sitrat
menengah seperti-ketoglutarat mungkin terjadi. Dalam semua kasus, siklus
asam sitrat memainkan peran besar dalam mogok kerangka asam amino
menjadi karbon dioksida.

Sebagai contoh, katabolisme lisin yeilds karbon dioksida dan asetil-CoA,

sedangkan glutamat rusak ke-ketoglutarat, karbon dioksida, dan asetil-CoA.
Asetil-CoA memulai siklus asam sitrat.

Monosakarida

Glukosa monosakarida
lebih tinggi, sel paling
memecah karbohidrat
memobilisasi glukosa
glukosa.

adalah gula enam karbon. Dalam kasus eukariota

sering memperoleh glukosa dalam dua cara-dengan
kompleks menjadi gula sederhana dan dengan
dari glikogen, sistem penyimpanan tubuh untuk

Dalam sitosol, glukosa dipecah menjadi dua, molekul 3-karbon selama

glikolisis. Molekul tiga karbon yang dihasilkan disebut piruvat. Piruvat
diangkut melintasi membran mitokondria di mana itu dipecah menjadi
senyawa 2-karbon yang disebut asetil-CoA ditambah karbon dioksida. AsetilCoA memulai siklus asam sitrat

Reaktan dan produk

Asetil-CoA selanjutnya teroksidasi dalam siklus asam sitrat. Ketika Anda

belajar setiap langkah dalam siklus reaksi, perlu diingat bahwa substrat
tambahan yang diperlukan untuk menyelesaikan satu putaran penuh dari
siklus reaksi, termasuk satu GDP, satu fosfat anorganik, tiga NAD +, dan satu
ubiquinone, sering disebut sebagai, T.

Produk yang muncul dari satu putaran siklus asam sitrat adalah dua molekul
karbon dioksida, satu CoA, satu GTP, tiga NADH, dan satu dikurangi
ubiquinone, disebut sebagai QH2.

SIKLIS REAKSI JALUR

Kita sekarang akan memeriksa masing-masing dari delapan reaksi yang

membentuk siklus asam sitrat. Pertimbangkan layar ini "home base" untuk
siklus reaksi sebagai Anda mempelajari masing-masing dari delapan reaksi
secara lebih rinci. Menyelidiki setiap reaksi dengan mengklik nomor
reaksinya.

NASIB ASETIL-COA KARBON

Anda telah belajar bahwa asetil-CoA dan intermediet reaksi lainnya

kehilangan elektron dalam serangkaian reaksi oksidasi selama siklus asam
sitrat. Untuk setiap molekul asetil-CoA yang memasuki siklus asam sitrat,
total empat pasang elektron yang hilang untuk elektron operator selama
oksidasi dari dua atom karbon. Dua atom karbon teroksidasi ini dirilis
sebagai dua molekul karbon dioksida.

Dua atom karbon dilepaskan sebagai karbon dioksida selama satu putaran
siklus asam sitrat. Atom karbon ini tidak berasal dari molekul asetil-CoA yang
dimulai siklus reaksi. Asetil karbon yang dilepaskan selama putaran
berikutnya dari jalur melingkar.

Melacak nasib atom karbon asetil-CoA melalui dua putaran siklus asam
sitrat, memberikan perhatian khusus yang atom karbon teroksidasi, dan
kapan.

PERATURAN: INHIBISI

Fungsi tubuh seperti mesin tersetel karena kegiatan internal dikoordinasikan

dan diatur. Misalnya, setelah Anda selesai makan berat, membengkak perut
dan peregangan reseptor lapisan perut mengirim pesan ke otak Anda antrian
Anda, "berhenti makan!" Pada skala yang lebih kecil, setelah penumpukan
produk siklus asam sitrat dan intermediet menumpuk , senyawa ini
mempengaruhi aktivitas enzim dekat dan jauh, untuk lebih mengurangi
bersepeda dari reaksi asam sitrat.

Kemajuan melalui siklus asam sitrat diilustrasikan. Perhatikan bahwa dengan

setiap siklus berturut-turut, tingkat senyawa peraturan kunci meningkat.
Senyawa peraturan kunci yang bertindak untuk menurunkan tingkat aktivitas

siklus asam sitrat adalah sitrat, NADH, dan suksinil-CoA. Secara kolektif,
senyawa peraturan ini berfungsi sebagai inhibitor dari siklus asam sitrat.

PERATURAN: AKTIVASI

Berbeda dengan kontrol penghambatan dijelaskan sebelumnya, regulator

positif, yang disebut aktivator, fungsi up-mengatur aktivitas siklus asam
sitrat ketika kebutuhan energik atau molekul sel tidak terpenuhi. Aktivator
utama meliputi Ca2 + dan ADP, yang sinyal untuk meningkatkan aktivitas
dehidrogenase isocitrate dan-ketoglutarat dehidrogenase. Ca2 + dan ADP
umumnya menandakan kebutuhan untuk menghasilkan energi bebas selular.

Energetika

Selama 1860-an, Louis Pasteur melakukan serangkaian percobaan untuk

menentukan apakah tingkat metabolisme glukosa tergantung pada ada atau
tidak adanya oksigen. Eksperimental set-up mirip dengan yang ditampilkan
pada layar Anda, dan temuan yang menciptakan efek Pasteur.

Lihatlah dua sel ragi digambarkan. Salah satunya adalah hidup dalam
lingkungan aerobik, yang lain dalam lingkungan anaerobik.

Anaerobik

Ketika sel hidup di bawah kondisi anaerobik bekerja untuk memenuhi

kebutuhan metabolik, reaksi glikolisis diaktifkan. Untuk setiap molekul
glukosa yang dikonsumsi, sel menghasilkan bersih dua ATP dan dua
dikurangi pembawa elektron NADH selama glikolisis. Dengan tidak adanya
oksigen, namun fosforilasi oksidatif dapat tidak terjadi. Oleh karena itu jalur
metabolisme ini sebagian besar bertanggung jawab untuk mentransfer
elektron dari NADH ke molekul oksigen untuk menghasilkan ATP tidak ada.

Oleh karena itu, dalam kondisi anaerob, energi berasal semata-mata dari ATP
yang dihasilkan selama glikolisis.

Erobik

Dalam sel hidup dalam kondisi aerobik, ATP yang dihasilkan oleh tiga jalur
metabolik: glikolisis, siklus asam sitrat, dan fosforilasi oksidatif. Pembawa
elektron berkurang yang muncul dari glikolisis dan siklus asam sitrat yang
disalurkan ke rantai transpor elektron, di mana mereka berpartisipasi dalam
serangkaian reaksi oksidasi dan reduksi. Ini menetapkan gradien proton yang
membentang membran mitokondria bagian dalam, yang pada akhirnya
mendorong fosforilasi oksidatif ADP menjadi ATP. Oleh karena itu, dalam
kondisi aerobik, NADH dan mengurangi ubiquinone, atau QH2, melayani sel
dengan meningkatkan potensi ATP-nya memproduksi.

REAKSI ANAPLEROTIC

Bayangkan sebuah sel otot yang mulai menguras toko energi karena
olahraga berat. Tingkat kenaikan konsumsi glukosa bersama dengan
penyatuan produk glikolitik, piruvat. Jika molekul oksigen tetap tersedia,
piruvat diubah menjadi asetil-CoA, sehingga mengaktifkan siklus asam sitrat.
Kegiatan enzim asam sitrat yang up-diatur, sebagian besar, oleh
peningkatan kadar aktivator, ion kalsium, dan ADP.

Reaksi ada untuk mengisi sel dengan asam sitrat intermediet siklus, yang
sangat penting saat meningkatkan aktivitas metabolik, seperti dalam kasus
olahraga berat. Katabolisme tiga jenis senyawa "pakan" siklus asam sitrat
pada titik-titik yang berbeda. Reaksi yang "umpan" siklus asam sitrat dengan
intermediet disebut anaplerotic.