RESUME
Untuk Memenuhi Tugas Matakuliah Genetika Lanjut
Yang Dibina oleh Prof. Dr. A.D. Corebima, M.Pd
Disusun Oleh:
OFFERING D
NURIL MAGHFIROH
(140341807614)
RACHMAYANI ARDIANSYAH
(140341807566)
Struktur Antibodi
Antibodi merupakan kelas protein yang disebut
dengan
Immunoglobulin.
Masing-masing
antibodi
Gambar 2. Struktur
Antibodi
disebut Domain. Masing masing antibodi memiliki dua sisi pengikatan antigen
atau domain, masing-masing membentuk daerah variabel yang terdiri dari satu
rantai terang dan satu rantai berat. Daerah konstan berisi dua rantai berat yang
berinteraksi untuk membentuk domain ketiga disebut efektor function domain,
yang bertanggung jawab untuk interaksi dari antibodi dengan komponen lain
sistem imun.
Terdapat 5 kelas antibodi (IgM, IgD, IgM, IgE, dan IgA). Kelima kelas
antibodi fungsinya ditentukan oleh sturktur dari rantai berat daerah konstan.
Contohnya: IgD antibodi biasanya menyisakan ikatan di permukaan sel dan
disekretkan di aliran darah. Rantai terang memiliki dua tipe lamda dan kappa.
Antibodi memiliki pengikatan antigen yang spesifik sebagai penentu daerah
variabel dari empat rantai tetapi fungsinya berbeda.
Rantai Terang Kappa
Sintesis kappa dikontrol oleh 3 segmen gen yang berbeda. 1) V k segmen
gen, mengkode N0 terminal 95 asam amino daerah variabel, 2) J k segmen gen,
mengkode, 13 asam amino terakhir dari daerah variabel. 3) C k segmen gen
mengkode C-terminal daerah konstan. Selama perkembangan Limfosit B, gen
khusus rantai terang kappa akan diekspresikan di dalam sel yang dirakit dari satu
segmen Lk - Vk satu Jk segmen dan satu Ck segmen oleh proses rekombinasi
somatik.
struktur stem and loop yang membawa gen Vk dan Jk untuk bergabung.
Penggabungan hanya akan terjadi ketika sekuen sinyal mengandung 12 pasang
basa spacer dan yang lainnya mengandung 22 pasang basa spacer
Keragaman Antibodi: Tempat Bergabung dan Mutasi Somatik
Adanya keanekaragaman sekuen asam amino pada molekul antibodi dengan
sekuen segmen gen yang diprediksi mengkode antibodi tersebut menunjukkan
bahwa terdapat lebih banyak variasi sekuen asam amino pada V-J junction
dibanding dengan prediksi melalui sekuen nukleotida. Banyaknya keragaman ini
ditunjukkan melalui variasi dalam tapak rekombinasi selama penggabungan V-J.
Contoh adanya interaksi alternasi tapak penggabungan segmen gen Vk dan
segmen gen Jk pada tikus.
Selama segmen gen VK41 dan J5 bergabung, menunjukkan rekombinasi yang
berlangsung antara empat posisi nukleotida yang berdekatan di situs junction.
Selama asam amino 96 bergabung di daerah rantai antibodi yang terlibat dalam
ikatan antigen. Dengan demikian, penggunaan situs alternatif selama peristiwa
rekombinasi yang terlibat dalam kumpulan gen antibodi dewasa menyediakan
sebuah mekanisme tambahan untuk menghasilkan keanekaragaman antibodi.
Regulasi dari Transkripsi: Sebuah jaringan-Khusus
Dalam kasus gen rantai berat nampak bahwa proses penataan kembali
membawa promotor yang terletak di upstream dari segmen gen LH - VH
berpengaruh ke berbagai elemen enhancher yang terletak di intron antara segmen
gen JH dan segmen gen CH. Setiap segmen gen LV - VH mengandung promotor
upstream. Namun, sebelum peristiwa penataan kembali genomik yang mengarah
pada sintesis rantai berat, enhancher ini terdiri dari lebih 100.000 pasang
nukleotida. Enhancher ini dapat langsung mengaktifkan transkripsi dari promotor
yang terletak di upstream dari segmen gen LH - VH. Enhancher yang terlibat dalam
aktivasi sintesis rantai berat adalah jaringan tertentu; yang akan mengaktifkan
transkripsi hanya terdapat dalam limfosit dan tidak memiliki efek pada sel yang
berasal dari jaringan lain.
Pemilihan Klonal
Seleksi klonal merupakan mekanisme yang
dilakukan oleh suatu organisme untuk melalukan
inisiasi sintesis antibodi spesifik terhadap antigen
yang belum pernah diketahui sebelumnya. Semua
antibodi dihasilkan oleh limfosit B tunggal yang
mempunyai spesifikasi sisi pelekatan antigen
yang sama, tetapi sel tersebut akan mengalami
penyusunan genomik yang berbeda sehingga
menghasilkan produksi antibodi yang berbeda
pula. Teori seleksi klonal menyatakan bahwa
pengikatan antigen asing khusus pada suatu
antibodi
di
permukaan
limfosit
akan
B. Fenomena ini disebut dengan penyimpangan pada alel karena satu alel
menyimpang dari yg diekspresikan.
Variasi Reseptor Sel T
Limfosit T memperantarai respon imun seluler. Sel-sel T mengenali
antigen pada permukaan sel dan membunuh sel yang membawa antigen. Sel-sel T
menghasilkan membran-terikat reseptor yang sangat mirip dengan antibodi yang
diproduksi oleh limfosit B. Selain itu, keragaman spesifisitas reseptor sel T yang
diproduksi oleh penyusunan ulang genom analog dengan mereka yang terlibat
dalam produksi antibodi. Reseptor sel T terdiri atas dua rantai polipeptida, dan
, masing-masing dikodekan oleh L-V, D, J, dan segmen gen C seperti rantai
antibodi. - dan -polipeptida, seperti rantai antibodi, mengandung daerah
variabel yang membentuk situs pengikatan antigen dan daerah konstan agar
pembawa berita reseptor ada di permukaan sel (Gambar 4a).
Daerah variabel dari reseptor sel T dikode oleh beberapa segmen gen L-V,
D, dan J; daerah konstan dikode oleh sejumlah kecil segmen gen C. Gen reseptor
sel T disusun oleh penyusunan kembali genom yang terjadi selama dferensiasi
oleh limfosit T oleh stem sel seperti pada kasus gen antibodi pada perkembangan
limfosit beta. Protein reseptor alpha dan beta, dikode oleh segmen gen yang
berbaris pada kelompok pada masing-masing kromosom 14 dan 7.
Struktur dari kelompok gen reseptor sel T pada manusia sangat mirip
dengan tikus. Organisasi alur penyakit pada segmen gen yang mengkode beta
polipeptida reseptor sel T ditunjukkan pada gambar 5a. Organisasi fungsional
penyusunan kembali beta polipeptida gen ditunjukkan pada gambar 5b. Urutan
pensinyalan heptamer dan nonamer yang sangat mirip tersebut sama pada kontrol
penyusunan kembali gen antibodi yang juga hadir secara esensial pada lokasi
yang sama pada kelompok gen reseptor sel T. Kehadiran kedua kelompok gen
memberi kesan bahwa mekanisme yang sama pada penggabungan segmen gen
yang dipekerjakan selama penyusunan kembali, baik gen antibodi maupun gen
reseptor sel T. Ada kemungkinan bahwa variabilitas pada reseptor sel T agak
kurang daripada antibodi. Daerah variabel gen reseptor sel T dikode oleh sekitar
30 segmen gen V, sedangkan ada sekitar 300 segmen gen V baik pada rantai
ringan Kappa maupun rantai berat antibodi.
Gen-gen MHC mengkode tiga kelas yang berbeda dari protein yang
terlibat dalam berbagai aspek dari respon imun. Struktur lokus MHC manusia
(HLA) dan lokasi relatif gen yang menyandikan kelas yang berbeda dari antigen
histokompatibilitas ditunjukkan pada Gambar 6. Protein MHC kelas I
merupakan antigen yang bertanggung jawab untuk rejeksi jaringan asing pada
transplan jaringan dan organ. Seperti diilustrasikan dalam Gambar 6, antigen
memainkan peran kunci dalam pengenalan dan kerusakan sel yang membawa
antigen asing oleh limfosit T sitotoksik. Sebuah reseptor T tunggal sel mengenali
antigen asing dan antigen histokompatibilitas kelas I selama respon imun sel T
sitotoksik.
Gen MHC kelas II mengkode polipeptida yang terletak dekat pada
permukaan limfosit B dan makrofag. Protein MHC kelas II menyediakan tipe
khusus T limfosit yang disebut "sel T helper" dengan kapasitas untuk pengenalan
diri dan memfasilitasi komunikasi antara berbagai jenis sel yang terlibat dalam
respon imun. Akhirnya, gen MHC kelas III mengkode protein komplemen yang
berinteraksi dengan kompleks antigen-antibodi dan menginduksi lisis sel.
Antigen MHC kelas I dan kelas II yang berada di membran sel memiliki
struktur yang sangat mirip dengan struktur reseptor sel T (lihat Gambar 6).
Namun, keragaman antigen MHC jauh lebih sedikit dibandingkan dengan antibodi
dan reseptor sel T, dan tidak ada penyusunan kembali genom yang terlibat dalam
kontrol genetik keragaman antigen MHC.
Rantai ringan dan berat paada antibody dikode oleh lokus yang berbeda
dalam genom. Pada manusia, ada dua lokus rantai pendek, lokus kappa () pada
kromosom 2 dan lokus lambda () pada kromosom 22, dan ada satu rantai berat
lokus, terletak pada kromosom 14. Setiap dari lokus ini terdiri dari serangkaian
gen segmen yang panjang.
Kappa polipeptida dikodekan oleh tiga jenis gen segmen:
1. segmen gen Lk Vk, yang mengkode peptida utama dan amino terminal 95
daerah asam amino rantai ringan kappa; peptida utama akan dihapus dari rantai
ringan kappa oleh pembelahan kemudian membawa polipeptida yang baru
melalui membran endoplasma dalam sintesis antibodi sel plasma.
2. Jk segmen gen, yang mengkode asam amino terakhir 13 daerah rantai ringan
kappa; simbol Jk digunakan untuk segmen gen ini karena peptida itu encode
DAFTAR RUJUKAN
Gardner, E.J., Snustad, D. P. dan Simmons, M. J. 1991. Principles of Genetics,
Eigth Edition. Canada: John Wiley and Sons, Inc.
Snustad, D. Peter dan Michael J. Simmons. 2012. Principle of Genetiks Sixth
Edition. United State of America. Aptara Inc.
diekspresikan dengan sekuen segmen-segmen gen germ line, serta sekuensekuen asam amino yang sebenarnya dari rantai antibodi dengan sekuensekuen asam amino yang diprediksikan dari sekuen-sekuen nukleotida gen.
2. Apa saja segmen gen yang mengkode kappa polypeptide, dan bagaimana
proses fusi segment anti bodi kappa pada manusia?
Jawab: Kappa polipeptida dikodekan oleh tiga jenis gen segmen:
a. segmen gen Lk Vk, yang mengkode peptida utama dan amino terminal 95
daerah asam amino rantai ringan kappa; peptida utama akan dihapus dari
rantai ringan kappa oleh pembelahan kemudian membawa polipeptida
yang baru melalui membran endoplasma dalam sintesis antibodi sel
plasma.
b. Jk segmen gen, yang mengkode asam amino terakhir 13 daerah rantai
ringan kappa; simbol Jk digunakan untuk segmen gen ini karena peptida itu
encode bergabung amino-terminal peptida yang dikodekan oleh segmen L k
Vk untuk peptida karboksi-terminal yang dikodekan oleh jenis segmen gen
berikutnya.
c. Ck gen segmen, yang mengkode wilayah konstan rantai ringan kappa.
Lokus kappa berisi 76 Lk Vk segmen gen (walaupun hanya 40 fungsional),
lima Jk gen segmen, dan segmen gen Ck tunggal. Jk segmen gen terletak antara
segmen gen Lk Vk dan Ck gen segmen. Dalam sel grem-line, segmen Jk lima
dipisahkan dari segmen Lk Vk dengan urutan panjang noncoding, dan dari
segmen gen Ck oleh panjang urutan noncoding kira-kira 2 kb (gambar 2).
Selama pengembangan sel B, rantai ringan kappa gen yang akan dinyatakan
dikumpulkan dari segmen satu Lk Vk, satu Jk segmen, dan segmen Ck tunggal