Tabel : 1. Nukleosida dan Nukleotida.................................................................
Hal. 12
2. Gangguan Pada Metabolisme Pirimidin..............................................
13
BAB I PENDAHULUAN 4
1.1 Latar Belakang
Pirimidin merupakan komponen utama DNA, RNA, koenzim (NAD, NADP, ATP, UDPG). Inti pirimidin adalah inti dari senyawa komponen molekul nukleotida asam nukleat RNA dan DNA. Contoh Pirimidin: (sitosin, urasil, timin) dimetabolisme jadi CO2 dan NH3. Pirimidin merupakan unsur yang nonesensial secara dietetik artinya manusia dapat mensintesis nukleotida secara denovo (dari senyawa intermediet anfibolik), meskipun tidak mengkonsumsi asam nukleat. Sintesis dari pirimidin kurang kompleks dibandingkan dengan purin, karena dasar jauh lebih sederhana. Basis menyelesaikan pertama adalah berasal dari 1 mol glutamin, salah satu mol ATP dan satu mol CO
(yang
merupakan karbamoilfosfat) dan satu mol aspartate. Sebuah mol tambahan
glutamin dan ATP yang diperlukan dalam konversi UTP untuk CTP adalah. Jalur biosintesis pirimidin yang digambarkan di bawah ini. Karbamoilfosfat digunakan untuk sintesis nukleotida pirimidin berasal dari glutamin dan bikarbonat, dalam sitosol, yang bertentangan dengan siklus karbamoil fosfat urea berasal dari amonia dan bikarbonat dalam mitokondria. Reaksi siklus urea dikatalisis oleh sintetase karbamoilfosfat I (CPS-I) sedangkan prekursor nukleotida pirimidin disintesis oleh CPS-II. karbamoilfosfat kemudian kental dengan aspartat dalam reaksi dikatalisis oleh enzim yang membatasi laju biosintesis nukleotida pirimidin, transcarbamoylase aspartate (ATCase). 1.2 Rumusan Masalah Berdasrkan latar belakang diatas maka dapat dirumuskan suatu masalah, yaitu a. Apakah pengertian dari pirimidin? b. Bagaimana struktur pirimidin? c. Bagaimana metabolisme pirimidin? d. Bagaimana biosintesis nukleotida pirimidin? e. Bagimana katabolisme pirimidin? f. Bagimana kelainan pirimidin? 1.3 Tujuan Penulisan Makalah a. Mengetahui pengertian dari pirimidin. b. Mengetahui struktur pirimidin. c. Mengetahui metabolisme pirimidin. d. Mengetahui biosintesis nukleotida pirimidin. e. Mengetahui katabolisme pirimidin. f. Mengetahui kelainan pirimidin. 1.4 Manfaat Penulisan Makalah
a. b. c.
Memenuhi tugas mata kuliah Biokimia II
Menambah khasanah ilmu pengetahuan mengenai pirimidin Memperoleh data-data ilmiah mengenai struktur pirimidin, metabolisme pirimidin, biosintesis serta kelainan-kelainan pada biosintesis pirimidin.
BAB II PEMBAHASAN 2.1 Pengertian Pirimidin Pirimidin merupakan komponen utama DNA, RNA, koenzim (NAD, NADP, ATP, UDPG). Inti pirimidin adalah inti dari senyawa komponen molekul nukleotida asam nukleat RNA dan DNA. Contoh Pirimidin: (sitosin, urasil, timin) dimetabolisme jadi CO2 dan NH3. Pirimidin merupakan unsur yang nonesensial secara dietetik artinya manusia dapat mensintesis nukleotida secara denovo (dari senyawa intermediet anfibolik), meskipun tidak mengkonsumsi asam nukleat. 2.2 Struktur Kimia Pirimidin Pirimidin merupakan senyawa organik heterosiklik aromatik yang mirip dengan piridin. Salah satu dari tiga Diazine (heterocyclics beranggota enam dengan dua atom nitrogen di atas ring), ia memiliki nitrogen pada posisi 1 dan 3 di atas ring. Diazine lain pyrazine (nitrogen 1 dan 4) dan piridin 6
(nitrogen 1 dan 2). Dalam asam nukleat, tiga jenis nucleobases adalah turunan pirimidin: sitosin (C), timin (T), dan urasil (U).
Gambar 1. Struktur Pirimidin
2.3 Metabolisme Pirimidin
Nukleoprotein asam nukleat + protein
Asam nukleat gabungan nukleotida
Nukleotida nukleosida + asam fosfat
Nukleosida basa purin/pirimidin + pentosa
Hidrolisis nukleoprotein protein, asam fosfat, pentosa, basa purin atau
basa pirimidin
2.3.1
Biosintesis Pirimidin Umumnya biosintesis pirimidin dan purin memerlukan bahan pembentukan
yang sama misalnya PRPP, glutamin, CO2, asam aspartat, koenzim
tetrahidrofolat (FH4). Tetapi ada satu perbedaan yang jelas sekali yaitu pada saat terjadinya penambahan gugus ribosa-P (pada biosintesis purin), penambahan gugus ribosa-P tersebut sudah berlangsung ditahap awal. Sedangkan pada biosintesis pirimidin berlangsung setelah perjalanan beberapa tahap lebih jauh.
2.3.2 Tahapan Biosintesis Pirimidin
1. Biosintesis pirimidin diawali oleh reaksi pembentukan karbamoil-P yang dihasilkan dari reaksi antara glutamin, ATP dan CO2 yang dikatalisis oleh enzim karbamoil-P sintetase yang berlangsung didalam sitosol. Berbeda dengan enzim karbamoil-P sintase yang bekerja pada reaksi pembentukan urea, dimana reaksinya berlangsung bukan di dalam sitosol melainkan di dalam mitokondria. 2. Berikutnya karbamoil-P berkondensasi dengan asam aspartat menghasilkan senyawa karbamoil-aspartat. Reaksi ini dikatalisis oleh enzim aspartat transkarbamoilase. 3. Berikutnya terjadi reaksi penutupan rantai sambil membebaskan H2O dari molekul karbamoil-aspartat sehingga dihasilkan asam dehidroorotat (DHOA = Dihidroorotic Acid). Reaksi tersebut dikatalisis oleh enzim dihidroorotase. 4. Berikutnya melalui reaksi yang dikatalisis oleh enzim DHOA dehidrogenase dengan koenzim NAD+, DHOA menghasilkan asam orotat (OA = Orotic Acid). 5. Selanjutnya terjadi reaksi penambahan gugus ribosa-P pada asam orotat. Reaksi ini dikatalisis oleh enzim orotat fosforibosil transferase dan dihasilkan orotidilat OMP (Orotidin mono Posphate).
6. Enzim
orotidilat
dikarboksilase
mengkatalisis
reaksi
dikarboksilasi
orotidilat dan menghasilkan uridilat (uridin mono phosphate) yaitu produk
nukleotida pertama pada biosintesis pirimidin. 7. Pada reaksi (12) adalah satu-satunya reaksi biosintesis nukleotida pirimidin yang membutuhkan turunan tetrahidrofolat. Gugus metilen pada N5, N10 metilen-tetrahidrofolat direduksi menjadi gugus metal yang ditransfer dan tetrahidrofolat dioksidasi menjadi dihidrofolat. Agar sintesis pirimidin dapat berlangsung dihidrofolat harus direduksi kembali menjadi tetrahidrofolat, reaksi ini dikatalisis oleh dehidrofolatreduktase. Oleh karena itu, sel yang sedang membelah, yang harus mengasilkan TMP dan dihidrofolat.
Gambar 2. Skema Biosintesis Pirimidin.
10
2.3.3
Katabolisme Pirimidin Katabolisme pirimidin
terutama
terjadi
di
hati.
Ekskresi
aminoisobutirat meningkat pada leukemia dan radiasi sinar X akibat
peningkatan destruksi sel dan DNA nya. Ekskresi aminoisobutirat juga meningkat pada 25% orang normal dari etnis Cina dan Jepang. Untuk pseudouridin yang terdapat dalam tRNA, tidak ada mekanisme hidrolisa atau fosforilasi untuk nukleosida ini menjadi basa pirimidinnya (urasil), sehingga pseudouridin diekskresikan sebagai pseudouridin dalam urine manusia. Hasil akhir katabolisme pirimidin berupa CO2, ammonia, beta alanin dan propionat serta mudah larut dalam air.
Gambar 3. Skema Katabolisme Pirimidin.
11
Ciri katabolisme pirimidin
1.
Ekskresi asam amino isobutirat meningkat pada leukemia dan radiasi sinar
2.
X,akibat peningkatan destruksi sel dan DNA nya.
Ekskresi asam amino isobutirat juga meningkat pada 25% orang normal dari
3.
etnis Cina dan Jepang.
Untuk pseudouridin yang terdapat dalam tRNA, tidak ada mekanisme hidrolisa atau fosforilasi untuk nukleosida ini menjadi basa pirimidinnya (urasil),
sehingga
pseudouridin diekskresikan
sebagai
pseudouridin
dalamurine manusia
2.4 Nukleosida dan Nukleotida
Tabel 1. Nukleosida dan Nukleotida
2.5 Kelainan Metabolisme Pirimidin Dikarenakan produk katabolisme pirimidin yang larut sehingga hanya sedikit gangguan akibat kelebihan tingkat sintesis atau katabolisme. Dua kelainan bawaan yang mempengaruhi biosintesis pirimidin adalah hasil dari kekurangan dalam bifunctional enzim mengkatalisis langkah-langkah terakhir dua sintesis UMP, orotate transferase phosphoribosyl dan dekarboksilase OMP. Hasil ini kekurangan dalam aciduria orotic yang menyebabkan pertumbuhan terbelakang, dan anemia parah yang disebabkan oleh eritrosit hipokrom dan sumsum tulang megaloblastik. Leukopenia juga umum di acidurias orotic. Kelainan dapat diobati
12
dengan uridin dan atau cytidine, yang mengarah ke produksi UMP meningkat melalui aksi kinase nukleosida. UMP kemudian menghambat CPS-II, sehingga menghaluskan produksi asam orotic. Gangguan Metabolisme Pirimidin Nama Kerusakan aciduria Orotic, Tipe I
Enzim yang Rusak
transferase
Keterangan menyebabkan pertumbuhan
phosphoribosyl dan
terbelakang, dan anemia parah
dekarboksilase OMP
yang disebabkan oleh eritrosit
hipokrom dan sumsum tulang
Orotic aciduria, Tipe II
OMP dekarboksilase
megaloblastik karena defisiensi orotidilat
Orotic untuk aciduria
enzim siklus urea,
dekarboksilase meningkat fosfat keluar
karenakekurangan
transcarbamoylase
karbamoil mitokondria dan
OTC
ornithine, kekurangan
biosintesis pirimidin
(Tidak ada komponen
menambah; ensefalopati
hematologi) -aminoisobutyric
transaminase,
aciduria
mempengaruhi fungsi
hepatic sering terjadi pada orang Timur
siklus urea selama
deaminasi of-amino obat aciduria orotic
asam ke-keto asam
OMP dekarboksilase
allopurinol dan-azauridine perawatan 6 menyebabkan acidurias orotic tanpa komponen hematologi; katabolik-produk mereka dengan menghambat dekarboksilase OMP
Tabel 2. Gangguan pada Metabolisme Pirimidin
BAB III PENUTUP
13
3.1 Kesimpulan Pirimidin merupakan komponen utama DNA, RNA, koenzim (NAD, NADP, ATP, UDPG). Inti pirimidin adalah inti dari senyawa komponen molekul nukleotida asam nukleat RNA dan DNA. Contoh Pirimidin: (sitosin, urasil, timin) dimetabolisme jadi CO 2 dan NH3. Pirimidin merupakan unsur yang nonesensial secara dietetik artinya manusia dapat mensintesis nukleotida secara denovo (dari senyawa intermediet anfibolik), meskipun tidak mengkonsumsi asam nukleat.
14
DAFTAR PUSTAKA Anonim. 2015. Pirimidin. http://en.wikipedia.org/wiki/Pyrimidine .(Diakses pada tanggal 19 April 2015 pukul 16.49 WIB). Ansori, Paisal. 2011. Purin dan Pirimidin. http://purindanpirimidin.blogspot.com/. (Diakses Pada tanggal 22 April 2015; pukul 20.15). Dermawan,
Fadil.
2013.
Metabolisme
Purin
dan
Pirirmidin.
http://fadlidermawan12.blogspot.com/2013/02/metabolisme-purin-danpirimidin.html. (Diakses pada tanggal 19 April 2015 pukul 17.09 WIB).
Harper. 2001. Biokimia Edisi Ke-27. Jakarta: Buku Kedokteran (EGC) Husada,
Dian.
2012.
Primidin
dan
Purin.
http://arientcwiitz.blogspot
.com/p/pirimidin-dan-purin.html (diakses pada tanggal 19 April 2015
pukul 16.48 WIB). Imun,
Rifki.
2012.
Metabolisme
Purin
dan
Pirimidin.
http://www.slideshare.net/rifkiimun/metabolisme-purin-dan-pirimidin. (Diakses Pada tanggal 22 April 2015; pukul 21.23). Ningsih,
Nur
Karsiyah.
2010.
Biokimia
Gizi.
http://nurkarsiyahningsih.blogspot.com/. (Diakses Pada tanggal 22 April
2015; pukul 20.25). Pamungkas,
Sigit.
2014.
Makalah
Purin
dan
Pirimidin.
http://sigitpamungkaschand.blogspot.com/2014/12/makalah-purin-danpirimidin.html. (Diakses Pada tanggal 22 April 2015; pukul 20.11).
Robby,
Nugraha.
2012.
Pirimidin.
http://krishnaufalanugrahrobby.
blogspot.com/2012/05/pirimidin.html. (Diakses pada tanggal 19 April
2015 pukul 16.53 WIB). Rusdin,
Rahma.
2011.
Struktur
Asam
Nukleat.
http://rachmakimhunter.blogspot.com/. (Diakses Pada tanggal 22 April
2015; pukul 20.09). Shafaddin, Muhammad Amirulhaq. 2013. Metabolisme Purin dan Pirimidin. http://materikesehatankita.blogspot.com/2013/10/metabolisme-purin-danpirimidin.html. (Diakses Pada tanggal 22 April 2015; pukul 20.44).
15
Dokumen Serupa dengan Makalah Metabolisme Pirimidin Kel 3
