QUTE MOL

Pada pembahasan kali ini, saya akan membahas tentang aplikasi kimia yang dapat dijalankan
pada sistem operasi berbasis linux ini, salah satunya adalah aplikasi qutemol.
Qutemol merupakan salahsatu aplikasi kimia yang cukup menarik untuk dipelajari di linux.
Aplikasi ini merupakan aplikasi gratis dan open source yang yang cukup menarik dan interaktif
dalam menampilkan sistem visualisasi molekular.
Aplikasi ini menawarkan berbagai efek visual yang inovatif sesuai dengan keinginan serta
pilihan dimana teknik visualisasi ini ditujukan untuk meningkatkan kejelasan serta pemahaman
pada pengamatan struktur molekul secara luas sehingga kita akan lebih mudah dalam
memahami visual molekul yang akan diamati dalam bentuk 3D dengan bantuan aplikasi ini.
1. Dalam melakukan pengamatan visual pada aplikasi ini terlebih dulu kita harus mencari file
.pdb dan .vdb dari molekul yang akan kita amati. Hal ini dikarena aplikasi qutemol hanya dapat
bekerja dengan dua jenis ekstensi file ini (.pdb dan .vdb). sementara langkah-langkah
pengguanaan aplikasi ini adalah sebagai berikut :1. Buka aplikasi Qutemol. Pada tampilan awal,
aplikasi ini akan memberikan tampilan seperti pada gambar berikut:

2. Klik ikon browse seperti pada gambar dibawah ini untuk memasukkan file dengan format .pdb
yang merupakan file molekul yang akan diamati.

3. Pilih file yang akan diamati lalu klik OK. Sebagai contoh pada pembahasan kali ini saya akan
mengguna kan file H2O.pdb

4. Untuk melakukan pengamatan, bentuk molekul dapat dipilih dan disesuaikan dengan
keinginan untuk memperoleh visual yang benar-benar jelas untuk diamati yakni dengan memilih
beberapa opsi pada menu bagian kanan dari jendela aplikasi qutemol.

5. Pada tab preset kita dapat mengatur bentuk molekul yang kita amati sesuai dengan keinginan
untuk memperoleh visual yang benar-benar jelas untuk diamati. caranya adalah dengan memilik
(klik) menu-menu yang ada pada tab preset, maka bentuk molekul akan berubah-ubah sesuai
dengan pilihan. Berikut adalah beberapa contohnya yakni pada pilihan Molecule of the Month,
Direct Light Only, dan Simulated S.E.M. 1 .

6. Selanjutnya pada tab Geometry kita akan menemukan beberapa menu untuk merubah tampilan
molekul dengan pilihan Space Fill,Licorice, dan BallsnSticks.

7. Pada tab customize kita dapat menyesuaikan bentuk molekiul yang akan diamati dengan lebih
spesifik dimana pada tab ini kita dapat mengatur warna molekul, background, saturasi,
kecerahan, ketajaman dan pilihan lainnya.

8. Selanjutnya, selain berfungsi sebagai aplikasi visualisasi, aplikasi ini juga dapat untuk
mencapture gambar molekul yang diamati, yakni dengan cara klik ikon capture sepererti pada
gambar dibawah ini.

9. Pilih lokasi penyimpanan lalu tunggu dan molekul yang kita amati akan tersimpan dalam
bentuk file gambar .png
Semoga bermanfaat, selamat mencoba!