Estimasi volume otak dari post-mortem yang baru lahir dan MRI janin

Abstrak
Tujuan: otopsi minimal invasif menggunakan post-mortem magnetic resonance imaging
(MRI) adalah alternatif yang valid untuk otopsi konvensional pada janin dan bayi. Estimasi
berat otak merupakan bagian integral dari otopsi, namun segmentasi manual volume organ
pada MRI adalah padat karya dan rentan terhadap kesalahan, oleh karena itu tidak cocok
untuk praktek klinis rutin. Dalam tulisan ini kami bertujuan untuk menunjukkan bahwa
pengukuran volumetrik dari janin post-mortem dan otak neonatal dapat diperkirakan secara
akurat dengan menggunakan teknik semi-otomatis dan korelasi yang tinggi dapat ditemukan
dengan
bobot
diukur
dari
hasil
otopsi
konvensional.
Metode: Dari 17 subjek otak pada bayi baru lahir, bagian of Magnetic Resonance Imaging
Otopsi Studi (Marias), yang tersegmentasi dari post-mortem MR gambar ke otak, otak kecil
dan batang otak menggunakan tersedia untuk umum atlas otak neonatus dan algoritma
segmentasi semi-otomatis. Hasil segmentationwere yang rata-rata untuk membuat atlas baru,
yang kemudian digunakan untuk otomatis segmentasi subjek 17MaRIAS janin atlas berbasis.
Sebagai validasi, kita tersegmentasi secara manual gambar MRI dari 8 subjek masing-masing
kelompok dan membandingkannya dengan yang otomatis. Estimasi semi-otomatis berat otak
dibandingkan
dengan
hasil
otopsi
konvensional.
Hasil: The Dice tumpang tindih antara manual dan otomatis segmentasi adalah 0,991 dan
0,992 untuk otak, 0,873 dan 0,888 untuk otak dan 0,819 dan 0,815 untuk batang otak, untuk
bayi yang baru lahir dan janin, masing-masing. Unggul Kesepakatan diperoleh antara jumlah
taksiran bobot MR dan emas otopsi yang standar: berarti mutlak perbedaan 5 g dan 2%
kesalahan maksimum untuk kohort janin dan berarti perbedaan mutlak 20 g dan 11%
kesalahan
maksimum
untuk
yang
baru
lahir.
Kesimpulan: korelasi yang tinggi antara segmentasi yang diperoleh dan bobot otopsi
memperkuat ide menggunakan post-mortem MRI sebagai alternatif untuk otopsi
konvensional otak.
1. Pendahuluan
Hilangnya janin, bayi atau anak yang trauma dan menghancurkan untuk orang tua.
Mengetahui alasan yang tepat mengapa anak mereka tewas dan jika ada adalah resiko untuk
kehamilan lanjut atau anak-anak yang ada menghibur dan dapat membantu orang tua
mengatasi kehilangan mereka. Melakukan otopsi penting untuk menetapkan penyebab
kematian dan kemajuan dalam pengobatan dan penelitian. Pada sekitar 14-46% dari
pemeriksaan post-mortem perinatal dan bayi, Informasi ditemukan di luar apa yang dikenal
sebelum pemeriksaan, mempengaruhi konseling dan perkiraan risiko kekambuhan
(Thayyil et al., 2011). Banyak penelitian sebelumnya telah menunjukkan bahwa ada
lowconcordance antara pra-mortem dan post-mortemdiagnosis (Ornelas-Aguirre et al, 2003;..
Combes et al, 2004), mempertahankan perlu untuk otopsi yang akan dilakukan. Selama satu
dekade terakhir, persetujuan Tingkat otopsi pada bayi baru lahir telah kurang dari 20% dan
kurang dari 50% di stillborns di Inggris (Centre for Maternal dan Anak Pertanyaan
(CMACE), 2011). Alasan utama penolakan orangtua adalah agama, sifat invasif otopsi dan
keterlambatan pemakaman. Praktek otopsi otak yang biasa terdiri dari penghapusan dan

perlengkapan dari otak sebelum pembedahan, sebuah proses yang bisa memakan waktu
hingga 3 minggu (Thayyil et al., 2011). Bahkan ketika terpaku memadai, air yang tinggi isi
otak yang belum matang membuat penanganannya sulit (Huisman, 2004). Orang tua biasanya
meminta agar semua organ diganti sebelum pemakaman, piknik` yang berarti bahwa jaringan
otak harus diperiksa setelah Periode fiksasi suboptimal, membuat analisis struktur rinci otak
berkembang bahkan lebih menantang (Huisman, 2004).
MRI adalah alat yang ampuh yang dapat digunakan sebagai teknik pencitraan postmortem dengan akurasi tinggi dan tingkat kinerja yang tinggi untuk menggambarkan lesi
jaringan lunak (Ross et al., 2012). MRI telah terbukti menjadi alternatif yang kredibel untuk
otopsi invasif terutama dalam kasus kematian non-mencurigakan, dengan perjanjian
diagnosis 87% (Bisset et al., 2002). Griffiths et al. (2003) meneliti neuropatologi dalam janin
dan neonatus meninggal dan menemukan kesepakatan yang baik dari alasan yang
menyebabkan kematian antara MRI dan otopsi di 28 dari 32 kasus, menyimpulkan bahwa
MR menyediakan rinci informasi tentang semua sistem organ, kecuali jantung (Griffiths et
al., 2003). Cohen et al. (2008) juga menemukan korelasi yang baik untuk mendeteksi otak
dan tulang belakang anomali, tetapi menyimpulkan bahwa itu harus dikombinasikan dengan
hasil otopsi dalam kebanyakan kasus untuk hasil yang tepat (Cohen et al., 2008). Angin et al.
(2006) ditentukan nilai kappa (ukuran statistik kesepakatan antar-penilai) untuk menilai
kesepakatan antara otopsi dan MRI untuk organ yang berbeda dan menemukan nilai sangat
tinggi untuk otak (0.83).
Thayyil et al. (2013) mengusulkan perlunya otopsi aminimally invasif prosedur,
menggunakan MRI ditambah dengan pengambilan sampel darah melalui jarum tusukan.
Untuk yang terbaik dari pengetahuan kita, penelitian ini menyajikan database yang paling
luas sampai sekarang, yang mengandung lebih dari 400 post-mortem T1, T2, dan / atau difusi
MRI scan janin dan bayi baru lahir (Thayyil et al., 2013). Spesialis dalam saraf, jantung,
paru-paru dan digestif dipanggil untuk mempelajari hasil theMRI untuk diagnostik
dari penyebab kematian di 400 kasus, juga whichwas didirikan fromconventional otopsi.
Perjanjian antara otopsi minimal invasif dan otopsi konvensional dari 89,3%, sementara
menggunakan MRI saja memiliki perjanjian 55,5%.
Estimasi yang akurat dari berat otak merupakan bagian integral dari otopsi, karena setiap
penyimpangan dari rentang normal bisa menjadi indikator. Perubahan patologis pada organ
dan karena itu membantu dalam membangun penyebab kematian. Rapid prototyping organ
mungkin berguna juga dalam menjelaskan patologi kepada orang tua dan juri dalam kasus
forensik (Addison et al., 2014). Selama otopsi konvensional, otak kecil dan batang otak
biasanya dipisahkan dari otak besar dan ditimbang secara terpisah. Demikian pula kemudian,
hal ini berguna untuk segmen otak, otak kecil dan batang otak dari otak MRI. Segmentasi
manual volume organ pada MRI adalah padat karya (Breeze et al., 2008) dan cocok untuk
praktek klinis rutin.
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk: 1) Bandingkan baru semi-otomatis pasca- mortem
segmentation dengan segmentasi pengguna untuk bayi yang baru lahir (35-46 minggu usia
kehamilan setara); 2) Buat post-mortem baru atlas otak untuk bayi yang baru lahir (35-46

minggu usia kehamilan setara); 3) Bandingkan hasil dari kelompok janin segmentasi pascamortembrain (29-44 GW) menggunakan atlas otak post-mortem baru untuk bayi yang baru
lahir versus atlas neonatal tersedia untuk umum; dan 4) Bandingkan perkiraan bobot otak
yang diperoleh dari segmentasi semi-otomatis dengan yang otopsi pasca-mortemconventional
di kedua bayi dan janin. Ini adalah studi pertama, untuk yang terbaik dari pengetahuan kita,
untuk segmen kedua post-mortem MRI otak janin dan neonatus menggunakan semi-otomatis
teknik.
2. Metode
2.1 Subject
Kami melakukan pre-otopsi bedah mayat MRI otak menggunakan 1,5 Tesla Siemens
Avanto MR scanner di 17 janin (scan ex utero) dan 17 bayi baru lahir, sebagai bagian dari
Magnetic Resonance Imaging otopsi Studi (Marias) (Thayyil et al., 2013). Pemilihan ini
khusus subyek didasarkan pada kenyataan bahwa mereka disajikan tidak ada lesi besar atau
pendarahan otak dan scan mereka memiliki resolusi yang lebih tinggi, lebih baik Sebaliknya,
dan tidak ada artefak utama. Bayi yang baru lahir sebagian besar jangka lahir dan berusia
antara 35 dan 46 minggu (usia kehamilan (GA) ditambahkan dengan usia setelah lahir). Janin
memiliki GA antara 29 dan 44 kehamilan minggu (GW), semua dihitung berdasarkan
mother3s menstruasi terakhir buah kurma.
2.2 MR acquisition
Scan diperoleh di Great Ormond Street Hospital untuk Anak-anak (GOSH) dan
University College Hospital London (baik di London, Inggris Raya) antara 1 Maret 2007 dan
30 September 2011 (Thayyil et al., 2013). Untuk studi ini, kami menggunakan 3D T2
tertimbang Konstruktif Gangguan dalam Steady State (CISS) MR gambar yang memiliki
Ukuran voxel 0,6 0,6 0,6 mm3, waktu akuisisi 13,5 menit, relaksasi waktu (TR) dari
9,2ms, waktu echo (TE) dari 4,6 ms, dan sudut lain dari 70 dengan 4 rata-rata sinyal.
2.3 Recruitment
Para studywas disetujui oleh GOSH dan Institut Kesehatan Anak (ICH) komite etik
penelitian (04 / Q0508 / 41) (Thayyil et al., 2011). Itu National Health Service (NHS)
formulir persetujuan standar (diproduksi oleh Departemen Kesehatan) yang mencakup
menyetujui untuk penggunaan postmortem pencitraan untuk penelitian digunakan (Thayyil et
al., 2011). Penelitian perawat mendekati orang tua melalui telepon dan jika persetujuan verbal
naik untuk MR, amplop pra-bayar dengan formulir persetujuan dan informasi Selebaran
dikirim ke orang tua sebelum post-mortem MRI dilakukan (proses menyetujui telah
dijelaskan sebelumnya) (Thayyil et al., 2009). Autopsywas konvensional dilakukan sesuai
dengan pedoman ditetapkan oleh Royal College of Patolog (Inggris) (Thayyil et al., 2011), di
mana berat otak diukur.
2.4 Image preprocessing
Semua gambar menjalani Bias koreksi lapangan menggunakan N3 algorithmof
FreeSurfer (Sled et al., 1998). Ini diperlukan untuk meminimalkan pendaftaran Kesalahan
yang disebabkan oleh intensitas non-keseragaman sebagai akibat dari MR akuisisi. Masker
dari volume intrakranial untuk kedua kelompok itu resampled dari atlas otak neonatus
tersedia untuk umum (Kuklisova- Murgasova et al., 2011) 1 setelah pendaftaran non-kaku
antara masing-masing gambar dan template atlas. Semua topeng diperiksa dan manual
dikoreksi untuk mengecualikan jaringan non-otak yang dapat menghasilkan disalahartikan
voxel dalam segmentasi selanjutnya menggunakan ITK-SNAP (Yuskevic, et al., 2006).

2.5 Newborn brain segmentation

Pipa segmentasi untuk otak bayi yang baru lahir terdiri dari dua tahap utama. Pada tahap
pertama, kami melakukan pendaftaran non-kaku dari gambar otak bertopeng dengan template
dari atlas tersedia untuk umum (Kuklisova-Murgasova et al., 2011). Transformasi yang
diperoleh adalah kemudian digunakan untuk resample, dari atlas ini, anatomi sesuai prior
untuk 4 daerah yang berbeda dari otak: otak, otak kecil, batang otak dan cairan serebrospinal
(CSF). Kelas otak mengandung kedua putih dan graymatter, karena tidak mungkin untuk
segmen secara terpisah mungkin karena perbedaan antara T1 dan T2 nilai menurun secara
signifikan setelah kematian akibat pembusukan otak (Thayyil et al., 2012). Menggunakan
berasal prior anatomi dan neonatus tertentu Ekspektasi-Maksimalisasi (EM) algoritma
segmentasi dengan relaksasi sebelum dan Markov Acak Lapangan untuk menegakkan
kelancaran spasial (beradaptasi) (Cardoso et al., 2013) tersedia di NiftySeg2, kami
tersegmentasi otak ke dalam 4 kelas jaringan / daerah yang disebutkan di atas. Tahap kedua
terdiri dari menggabungkan bersama-sama cerebrumand yang Kelas CSF. Thiswas
diperlukan karena, karena T1 tersebut dan T2 meningkatkan nilai post-mortem, CSF dan otak
sulit untuk memisahkan terutama di parietal dan frontalis lobus. Namun, memiliki kelas ini
pada awal diperlukan untuk mendapatkan kuat segmentasi otak kecil dan batang otak, yang
pada bayi baru lahir dan janin, dikelilingi oleh cairan. Setelah menerapkan pipa, otak bayi
yang baru lahir yang tersegmentasi menjadi tiga wilayah: cerebrumplus CSF (termasuk spasi
aksial ekstra dan ventrikel), otak kecil dan batang otak.
2.6. Post-mortem atlas rata bayi yang baru lahir
Sebuah gambar rata-rata dan segmentationwere rata dibuat untuk kohort bayi
menggunakan semua 17 gambar. Sebuah rata-rata GroupWise (Ashburner, 2000) ini dibuat
menggunakan NiftyReg3 dengan melakukan urutan registrationswith Meningkatnya jumlah
derajat kebebasan, setiap kali mendaftar gambar ke ruang rata-rata baru. Kami melakukan
satu kaku (Translasi dan rotasi), empat affine (translasi, rotasi, skala dan geser) (Ourselin et
al., 2001) dan empat non-kaku (-bentuk bebas deformasi model yang didasarkan pada kubik
B-splines) (Rueckert et al., 1999; Modat et al., 2010) pendaftaran langkah. Untuk semua
langkah pendaftaran disebutkan kami menggunakan parameter default. Jumlah pendaftaran
langkah-langkah dalam GroupWise yang biasanya tergantung pada keragaman gambar.
Perhatikan bahwa setelah empat pendaftaran non-linear langkah transformasi dari ruang
gambar asli ke ruang gambar rata-rata tidak ubah. Transformasi yang diperoleh fromeach
ruang asli dengan rata-rata ruang yang digunakan untuk menyebarkan segmentasi individu
dan membuat segmentasi rata-rata untuk semua daerah otak yang disebutkan, seperti serta
masker rata-rata.
2.7. Segmentasi otak janin
Kami tersegmentasi kohort janin dalam otak ditambah cerebrospinal cairan, otak kecil
dan batang otak dengan menggunakan segmentasi dua tahap yang sama pipa, satu-satunya
perbedaan yang terdiri dari prior anatomi digunakan pada tahap pertama. Dalam hal ini,
gambar otak janin yang nonrigidly terdaftar baru dibuat post-mortem atlas baru lahir
dan transformasi yang diperoleh digunakan untuk resample anatomi prior dari atlas ini. Kami
membandingkan segmentasi menggunakan prior ini dengan yang diperoleh dengan
menggunakan atlas otak neonatus yang tersedia (Kuklisova Murgasova et al., 2011).
Menggunakan atlas baru dibuat, daripada tersedia untuk umum satu, diharapkan untuk
memberikan yang lebih akurat dan tepat segmentasi karena janin post-mortem gambar MR
lebih mirip dengan yang pasca-mortemnewborn sebagai hasil menjalani sama perubahan
kontras jaringan yang muncul setelah kematian. Pipa algoritma menggambarkan propagasi
segmentasi ditunjukkan pada Gambar. 1.

2.8. Pengesahan
Untuk melakukan evaluasi kuantitatif dari segmentasi otomatis, kami (E. Orasanu)
tersegmentasi manual gambar MR dari 8 acak subyek yang dipilih menggunakan ITK-SNAP
(Yuskevic et al., 2006) dari masing-masing kohort menjadi tiga wilayah yang menarik: otak
dan CSF, otak kecil dan batang otak. Penyidik itu buta ke semi-otomatis Hasil segmentasi dan
memiliki keahlian analisis citra besar tetapi keahlian neuroanatomical terbatas. Kami
kemudian dihitung skor Dice tumpang tindih (didefinisikan di sini sebagai jumlah label
voxel yang setuju antara dua gambar, dibagi dengan jumlah rata-rata voxel dengan label di
gambar-gambar), antara segmentasi otomatis dan manual.
2.9. Menghilangkan cairan dari segmentasi otak
Segmentasi wilayah yang menarik untuk kedua kelompok terdiri dari Otak dan CSF,
karena mereka tidak bisa dipisahkan. Kami manual pengambangan segmentasi untuk benar
menghilangkan cairan yang melakukan tidak memberikan kontribusi terhadap berat otak yang
diperoleh selama otopsi (Blatter et al., 1995). Nilai ambang batas cairan diambil secara
individual untuk masing-masing Pasien dari dana Bias lapangan dikoreksi gambar dan
voxelswith nilai yang lebih tinggi dari ambang batas dikeluarkan dari volume.
2.10. Post-mortem bobot otak
Kami dihitung volume otak besar sebagai jumlah biner dari semua piksel dalam
segmentasi daerah bunga dikalikan dengan Dimensi voxel (disediakan oleh pemindai). Otak
berat dapat diperkirakan bymultiplying buku ini dengan kepadatan literatur yang diturunkan
nilai otak dari 1,08 g / mL (Breeze et al., 2008). Kami membandingkan bobot diperkirakan
dengan bobot otopsi, yang tersedia selama 15 bayi dan 13 mata pelajaran janin.
3. Hasil
3.1. Segmentasi otak berbasis Atlas
Contoh segmentasi ditunjukkan pada Gambar. 2. Rata-rata Dice tumpang tindih antara
segmentasi otomatis dan manual termasuk dalam Tabel 1.
Bila dibandingkan dengan segmentasi manual, segmentasi janin diperoleh dengan
menggunakan prior berasal dari atlas publik memiliki lebih rendah Nilai skor dadu daripada
yang diperoleh dengan menggunakan bayi yang baru dibuat atlas untuk semua tiga struktur.
Peningkatan segmentasi dengan menggunakan atlas baru dibuat sebagai template juga dapat
diamati pada Gambar. 3.
3.2. Volume otak pasca-mortem
Kami memperkirakan cerebrumvolumes andweights dari dana segmentasi gambar MR
untuk bayi yang baru lahir (Tabel 2) dan janin (Tabel 3) kohort setelah thresholding untuk
menghapus CSF.We membandingkan perkiraan Otak berat untuk kohort bayi dan janin
dengan tersedia bobot otopsi (15 bayi yang baru lahir dan 13 janin). The Bland-Altman
Plot membandingkan berat MRI dan berat otopsi ditunjukkan untuk kohort bayi yang baru
lahir pada Gambar. 4 dan untuk kelompok janin pada Gambar. 5.
Untuk kohort bayi yang baru lahir, themeanweight memperkirakan byMRI dan
konvensional otopsi adalah 418 berbanding 434 g. Perbedaan mutlak berarti (Rata-rata dari
semua perbedaan mutlak antara theMRI dan konvensional autopsyweights) adalah 20 g dan
interval kepercayaan 95% (CI) adalah [-32, 65] g. Untuk kohort janin, berat estimasi oleh
MRI dan konvensional berarti otopsi adalah 310 berbanding 312 g. Perbedaan mutlak berarti
adalah 5 g dan 95% CI adalah [-7, 12] g.

4. Diskusi
Kami semi-otomatis tersegmentasi otak dan CSF, cerebellumand gambar
brainstemfromthe T2-weightedMR (CISS) dari 17 bayi baru lahir dan 17 subyek janin bagian
dari studi Marias menggunakan algoritma didasarkan pada proses Ekspektasi-Maksimalisasi
dikombinasikan dengan sebelumnya Skema relaksasi (beradaptasi) (Cardoso et al., 2013).
Kami membandingkan diperkirakan berat otak untuk bayi baru lahir dan kohort janin
dengan bobot otopsi yang tersedia. Kedua kelompok menunjukkan bahwa bobot otak MRI
yang diturunkan adalah akurat. Namun, hasil dari kelompok janin muncul lebih akurat,
mungkin karena variasi yang lebih kecil antara subyek yang dihasilkan dari perbedaan
mereka lebih kecil usia, bentuk, ukuran atau struktur.
Perselisihan antara bobot MRI diturunkan dan otopsi bisa disebabkan oleh kehilangan
cairan. Dalam perhitungan berat otak MRI, kita berusaha untuk mengecualikan kontribusi
cairan yang didasarkan pada asumsi bahwa sebagian kebocoran dalam proses otopsi dan
karena hilang sebelum berat. Namun, beberapa cairan mungkin masih berada di jaringan,
kontribusi dengan bobot otopsi. Perselisihan lebih lanjut antara dua nilai juga bisa datang dari
nilai kerapatan otak digunakan dari dana sastra, tidak whichmay akurat untuk mata pelajaran
kami. Fiksasi proses otak juga dapat memperkenalkan kesalahan dalam konvensional Berat
otak otopsi dan menyebabkan perselisihan dengan otak MRI berat badan.
The Dice rata tumpang tindih antara semi-otomatis dan manual segmentasi
menunjukkan kesepakatan rata-rata baik untuk semua struktur. Itu Rata dadu dipengaruhi
oleh ukuran struktur (Dice, 1945), sehingga menjelaskan skor Dice rendah di otak kecil dan
batang otak bila dibandingkan dengan otak dan CSF. Dalam segmentasi jaringan, pilihan atlas
sangat penting. Setelah atlas berdasarkan mata pelajaran yang mengalami proses post-mortem
yang sama akan meningkatkan hasil. Jika dibandingkan dengan segmentasi manual,
segmentasi janin yang diperoleh menggunakan prior berasal dari atlas publik telah lebih
rendah Dice nilai skor dari yang diperoleh dengan menggunakan atlas baru lahir yang baru
dibuat (Tabel 1 dan Gambar. 3). Meskipun kontras antara otak janin dan baru lahir satu,
bagian dari studi yang sama, mungkin lebih besar, kontras antara graymatter, whitematter dan
CSF ismuch lebih rendah pada kedua kohort. Perbedaan yang rendah ini berpotensi
menjelaskan segmentasi janin yang lebih baik bila menggunakan atlas dibuat selama satu
tersedia untuk umum.
Ada beberapa keterbatasan penelitian ini. Pertama, kami menggunakan
bagian yang relatif kecil dari kelompok Marias, yang dapat membatasi generalisasi
kesimpulan kami. Kedua, mata pelajaran yang bagian dari studi ini tidak kerusakan otak
besar dan dengan demikian kita tidak bisa menyatakan bahwa algoritma estimasi otak akan
sesuai untuk mata pelajaran ofMaRIAS atau lainnya pasca-mortemstudieswho hadir lesi atau
pendarahan otak. Selain itu, mata pelajaran yang termasuk dalam Penelitian ini juga memiliki
resolusi yang baik dan kontras dan tidak ada pencitraan utama artefak. Meskipun estimasi
tersebut tidak diuji pada pasca-mortembrains bahwa patologi yang berbeda hadir atau
memiliki gambar berkualitas lebih rendah, Beradaptasi algoritma segmentasi mungkin bisa
berhasil segmen lesi otak karena telah terbukti segmen sangat bervariasi
kasus pada neonatus (Cardoso et al., 2013). Ketiga, seperti yang disebutkan, Otak dipisahkan
menjadi tiga bagian selama otopsi konvensional: otak, cerebellum dan batang otak, tapi kami
hanya disediakan dengan bobot otak. Jika otak atau batang otak berat yang juga tersedia
kita lebih bisa memvalidasi apakah estimasi yang baik dapat dibuat untuk semua struktur
otak. Terakhir, keterbatasan utama dari studi kami adalah bahwa kita tidak dapat memisahkan
CSF dari otak secara otomatis, karena pembusukan otak setelah kematian dan tingkat
relaksasi, T1 dan T2, meningkatkan dan konvergen ke nilai air bebas (Thayyil et al., 2012).
Kami berusaha untuk memisahkan otak / CSF dengan memilih secara manual ambang batas.
Kami melaporkan semua nilai CSF ambang batas untuk memastikan reproduksibilitas dan

bimbingan untuk studi masa depan. Masalah ini mungkin diselesaikan dalam masa depan
dengan menggunakan post-mortem atlas neonatal, yang harus mencakup kelas CSF, dibuat
dari segmentasi manual MR gambar seperti mata pelajaran. Solusi lain untuk membuat
pilihan ambang CSF otomatis mungkin menciptakan histogram intensitas otak-CSF
segmentasi. Dengan informasi lebih lanjut yang memadai, seperti post-mortem T2
relaxometry (Lally et al., 2014) maserasi otak pada janin dan bayi baru lahir juga bisa
bemodeled sehingga dimasukkan sebagai bagian dari segmentasi Proses.
Namun demikian, post-mortem MRI dapat memberikan estimasi yang baik dari Otak
berat untuk mata pelajaran neonatal, yang merupakan bagian penting dari otopsi. Hasil bagian
ini yang terkenal, karena mereka memperkuat ide untuk menggunakan MRI sebagai alternatif
untuk otopsi konvensional, alternatif yang dapat bemore diterima untuk orang tua dan
masyarakat pada umumnya. Hal ini juga tidak menunda pemakaman karena tidak
memerlukan proses fiksasi. Untuk pengetahuan kita ini adalah makalah pertama untuk
memperkirakan bobot otak dari MR gambar neonatus dan janin untuk tujuan otopsi.
Pengolahan pipa yang direproduksi karena semua perangkat lunak yang digunakan dalam
penelitian ini adalah publik tersedia. Kami menggunakan parameter pendaftaran default
untuk semua pendaftaran langkah yang disebutkan. Selanjutnya, atlas digunakan sebagai
informasi awal untuk segmentasi juga tersedia secara bebas (Kuklisova-Murgasova et al.,
2011) dan atlas post-mortem yang baru lahir dibuat akan dibuat tersedia. Kami berspekulasi
bahwa ketersediaan ini akan memungkinkan penelitian lebih lanjut dari post-mortem MRI
neonatus dan janin.
5. Kesimpulan
Kami tersegmentasi otak dan CSF, otak kecil dan batang otak dari post-mortem yang
baru lahir dan mata pelajaran janin dari Marias menggunakan atlas berbasis segmentasi dan
algoritma EM berbasis dengan prior relaksasi. Kita divalidasi segmentasi semi-otomatis
dengan menghitung Dice segmentasi overlapwithmanual. Para study3s aimwas perbandingan
Hasil segmentasi semi-otomatis dengan yang diperoleh selama otopsi konvensional.
Kesepakatan yang sangat baik dari segmentationderived bobot dengan yang otopsi adalah
sangat penting, karena mendukung penggunaan pasca-mortemMRI, saat bersama
otherminimally prosedur invasif, sebagai alternatif untuk otopsi konvensional
bayi dan janin.