Anda di halaman 1dari 21

PrinciplesofbioenergeticsPrinciplesofBiochem

istryPrinciplesofbioenergeticsPrinciplesofbioe
Prinsip
nergeticsPrinciplesofbioenergeticsPrincipleso
Bioenerget
fbioenergeticsPrinciplesofbioenergeticsBioch
ika
emistryPrinciplesofbioenergeticsPrinciplesofb
ioenergeticsPrinciplesofbioenergeticsPrincipl
Resume Biokimia
esofbioenergeticsPrinciplesofbioenergeticsBi
Principles Of Bioenergetics
Ch. 13 ; Lehningar Ed. 4

ochemistryPrinciplesofbioenergeticsPrinciple
sofbioenergeticsBiochemistryBiochemistryPri
Diajukan Untuk Memenuhi Tugas
Mata Kuliah
nciplesofbioenergeticsPrinciplesofbioenergeti
“BIOKIMIA”
csPrinciplesofbioenergeticsPrinciplesofbioene
rgeticsBiochemistryPrinciplesofbioenergetics
PrinciplesofbioenergeticsBiochemistryPrincipl
esofbioenergeticsPrinciplesofbioenergeticsPri
nciplesofbioenergeticsPrinciplesofbioenergeti
csPrinciplesofbioenergeticsBiochemistryPrinc
iplesofbioenergeticsPrinciplesofbioenergetics
PrinciplesofbioenergeticsPrinciplesofbioenerg
eticsBiochemistryPrinciplesofbioenergeticsPri
Disusun Oleh:
nciplesofbioenergeticsPrinciplesofbioenerg
• Ogi Nurhari
eti
cspasdfghjklzPrinciplesofbioenergeticsx
• Bi
ochemistryPrinciplesofbioenergeticsPrincip

lesofbioenergeticsPrinciplesofbioenergetic


sPrinciplesofbioenergeticsPrinciplesofbioe
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

BAB 13

PRINSIP BIOENERGETIKA

13.1BIOENERGETIKA DAN TERMODINAMIK


13.2GRUP PHOSPORIL TRANSFER DAN ATP
13.3REAKSI OKSIDASI-REDUKSI BIOLOGI

Sel hidup dan organisme harus melakukan pekerjaan untuk tetap hidup, tumbuh,
dan bereproduksi. Kemampuan untuk memanfaatkan energi dan menyalurkannya ke
kerja biologis adalah properti fundamental dari semua makhluk hidup; itu pasti diperoleh
selular sangat awal dalam evolusi. Organisme modern melaksanakan berbagai energi
yang luar biasa transductions, konversi dari satu bentuk energi yang lain. Mereka
menggunakan energi kimia sebagai bahan bakar untuk membawa sintesis kompleks,
sangat teratur dari makromolekul menjadi prekursor sederhana. Mereka juga
mengkonversi energi kimia sebagai bahan bakar menjadi konsentrasi gradien gradien
dan listrik, menggerakkan panas.

Pada abad ini, biokimia studi telah mengungkapkan banyak kimia yang mendasari
bahwa "obor kehidupan." Transduksi energi hayati fisik yang sama mematuhi hukum
yang mengatur semua proses alam lainnya. Oleh karena itu penting bagi seorang
mahasiswa biokimia untuk memahami hukum-hukum ini dan bagaimana mereka berlaku
untuk aliran energi di biosfer. Dalam bab ini pertama-tama kita meninjau hukum
termodinamika dan kuantitatif hubungan antara energi bebas, entalpi, dan entropi. Kami
kemudian menjelaskan peran khusus ATP dalam biologi pertukaran energi. Akhirnya,
kami mempertimbangkan pentingnya reaksi oksidasi-reduksi dalam sel-sel hidup,
energetika reaksi transfer elektron, dan pembawa elektron biasa digunakan sebagai
kofaktor dari enzim yang mengkatalisis reaksi-reaksi ini.

13.1BIOENERGETIKA DAN TERMODINAMIK

Bioenergetika adalah studi kuantitatif transductions energi yang terjadi dalam sel
hidup dan sifat dari fungsi proses kimia yang mendasari transduksi ini. Meskipun banyak
prinsip termodinamika telah diperkenalkan dalam bab-bab sebelumnya dan mungkin
akrab bagi Anda, sebuah tinjauan dari aspek kuantitatif prinsip-prinsip ini sangat berguna
di sini.

Transformasi Energi Biologis menurut Hukum Termodinamika

Hukum pertama adalah prinsip kekekalan energi: untuk setiap fisik atau perubahan
kimia, jumlah total energi di alam semesta tetap konstan; energi dapat berubah bentuk

2
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

atau dapat diangkut dari satu daerah ke daerah lain, tetapi tidak dapat dibuat atau
hancur.

Hukum kedua termodinamika, yang dapat dinyatakan dalam beberapa bentuk,


mengatakan bahwa alam semesta selalu cenderung ke arah peningkatan gangguan:
dalam semua proses alam, entropi alam semesta bertambah. Organisme hidup terdiri dari
molekul koleksi terorganisasi jauh lebih tinggi daripada bahan-bahan dari mana mereka
dibangun sisekitarnya, dan organisme memelihara dan menghasilkan ketertiban,
tampaknya tidak sadar akan hukum kedua termodinamika. Sistem yang bereaksi adalah
kumpulan materi yang sedang menjalani kimia tertentu atau proses fisik; itu mungkin
suatu organisme, sel, atau dua senyawa bereaksi. sistem yang bereaksi dan sekitarnya
bersama-sama membentuk alam semesta. Di laboratorium, beberapa bahan kimia atau
proses fisik dapat dilakukan di tempat terpencil atau sistem tertutup, di mana tidak ada
materi atau energi dipertukarkan dengan lingkungannya. Sel-sel hidup dan organisme
Namun, sistem terbuka, bertukar baik materi dan energi dengan lingkungannya; sistem
kehidupan tidak pernah pada kesetimbangan dengan lingkungan sekitar, dan terus-
menerus transaksi antara sistem dan sekitarnya menjelaskan bagaimana organisme
dapat menciptakan keteraturan dalam diri mereka sendiri ketika beroperasi di dalam
hukum kedua termodinamika.

kita mendefinisikan tiga besaran termodinamika yang menggambarkan terjadi


perubahan energi dalam reaksi kimia:

Energi bebas Gibbs, ∆G, mengungkapkan jumlah energi yang mampu melakukan
pekerjaan selama reaksi pada suhu dan tekanan konstan. Ketika seorang Reaksi tersebut
berjalan dengan pelepasan energi bebas (yaitu, ketika perubahan sistem sehingga
kurang memiliki energi bebas), maka perubahan energi bebas, ∆G, memiliki nilai negatif
dan reaksi dikatakan eksergonik. Dalam reaksi endergonik, keuntungan sistem energi
bebas dan ∆G adalah positif.

Entalpi, ∆H, adalah konten panas dari sistem bereaksi. Hal ini mencerminkan
jumlah dan jenis ikatan kimia di reaktan dan produk. Ketika rilis reaksi kimia panas, itu
dikatakan eksotermik; konten panas dari produk yang kurang dari reaktan dan memiliki
∆H, dengan konvensi, sebuah nilai negatif. Sistem Bereaksi dengan mengambil panas
dari lingkungan, mereka adalah endotermik dan memiliki nilai-nilai positif ∆H.

Entropy, ∆S, adalah ekspresi kuantitatif untuk keacakan atau gangguan dalam
suatu sistem. Ketika produk reaksi kurang kompleks dan lebih teratur daripada reaktan,
reaksi dikatakan bisa untuk melanjutkan dengan memperoleh entropi.

Di bawah kondisi yang ada di biologi sistem (termasuk suhu dan tekanan konstan),
perubahan energi bebas, entalpi, dan entropi terkait satu sama lain kuantitatif dengan
persamaan:

∆G = ∆H – T ∆S

3
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Keperluan energi bebas sel

Sel-sel sistem isotermal-mereka pada dasarnya berfungsi pada temperatur


konstan (mereka juga berfungsi pada tekanan konstan). Aliran panas bukan merupakan
sumber energi bagi sel, karena panas dapat melakukan kerja hanya pada saat melalui ke
zona atau objek pada suhu yang lebih rendah. Sel energi dapat dan harus menggunakan
energi bebas, yang digambarkan oleh energi bebas Gibbs fungsi G, yang memungkinkan
prediksi arah reaksi kimia, kesetimbangan tepat sel, dan jumlah pekerjaan yang mereka
lakukan dalamteori suhu konstan dan tekanan. Heterotrophic sel memperoleh energi
bebas dari gizi molekul, dan sel-sel fotosintetik memperolehnya dari radiasi matahari
yang diserap. Kedua jenis sel mengubah energi bebas ini menjadi energi lain ATP dan
senyawa yang kaya energi mampu memberikan biologis bekerja pada temperatur
konstan.

Perubahan standar Energi bebas Langsung Terkait dengan konstanta


kesetimbangan

Konsentrasi reaktan dan produk pada kesetimbangan menentukan konstanta


kesetimbangan, Keq pada reaksi umum aA + bB ↔ cC + dD, dimana a, b, c, dan d, adalah
jumlah dari molekul A, B, C, dan D yang berpartisipasi.

Keq = Cc [D]dAa [B]b

Dimana [A], [B], [C], dan [D] adalah konsentrasi dari reaktan pada konstanta
kesetimbangan.

Ketika sebuah sistem tidak bereaksi pada kesetimbangan, kecenderungan untuk


bergerak ke arah ekuilibrium merupakan motor penggerak, besarnya yang dapat
dinyatakan sebagai perubahan energi bebas untuk reaksi, ∆G. Di bawah kondisi standar
(298 K 25 C), ketika reaktan dan produk yang awalnya hadir pada 1 M konsentrasi atau,
untuk gas, pada tekanan parsial 101,3 kilopascals (kPa), atau 1 atm, gaya mengemudi ke
arah ekuilibrium sistem didefinisikan sebagai standar perubahan energi bebas, ∆G.

Sama seperti eq K adalah sebuah konstanta fisika khas untuk setiap reaksi,
demikian juga adalah ∆G yang konstan. Seperti yang kita lihat dalam Bab 6, ada
hubungan yang sederhana antara K eq dan ∆G:

∆G = - RT ln K’eq

Standar perubahan energi bebas dari reaksi kimia hanyalah matematika alternatif
cara mengungkapkan kesetimbangan konstan.

4
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Perubahan Aktual energi bebas tergantung pada reaktan dan Produk Konsentrasi

Kita harus berhati-hati untuk membedakan antara dua kuantitas yang berbeda:
energi bebas berubah, ∆G, dan standar perubahan energi bebas, ∆G’0. Setiap reaksi
kimia memiliki standar karakteristik perubahan energi bebas, yang dapat bernilai positif,
negatif, atau nol , tergantung pada konstanta kesetimbangan reaksi. perubahan standar
energi bebas menunjukan kepada kita ke arah mana dan sejauh mana reaksi tertentu
harus pergi untuk mencapai keseimbangan ketika konsentrasi awal masing-masing
komponen adalah 1,0 M, pH 7.0, suhu adalah 25 C, dan tekanan 101,3 kPa. Jadi ∆G
adalah konstan: ia memiliki karakteristik, nilai berubah untuk suatu reaksi. Tapi
sebenarnya perubahan energi bebas, ∆G, adalah fungsi dari konsentrasi reaktan dan
produk dan suhu yang berlaku selama reaksi, yang belum tentu akan cocok dengan
kondisi standar sebagaimana didefinisikan.

Dalam sel hidup, reaksi yang akan sangat lambat jika dilanjutkan tanpa katalis,
bukan dengan memberikan panas tambahan tetapi dengan menurunkan energi aktivasi
dengan enzim. Enzim menyediakan alternatif jalur reaksi dengan energi aktivasi yang
lebih rendah daripada reaksi tanpa katalis, sehingga pada suhu kamar sebagian besar
molekul substrat memiliki energi panas yang cukup untuk mengatasi penghalang aktivasi,
dan laju reaksi meningkat secara dramatis. Secara Bebas perubahan energi untuk reaksi
tidak bergantung pada jalur di mana reaksi terjadi; itu tergantung hanya pada sifat dan
konsentrasi awal reaktan dan produk akhir. Enzim tidak bisa berekasi, karena itu,enzim
hanya mengubah konstanta kesetimbangan, tetapi mereka bisa dan dapat meningkatkan
laju reaksi agar berlangsung dalam arah yang ditentukan oleh termodinamika.

5
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Kesimpulan bioenergetika dan termodinamik :

• Sel-sel hidup terus-menerus melakukan pekerjaan. Mereka membutuhkan energi


untuk mempertahankan struktur yang sangat terorganisasi, sintesis komponen sel,
menghasilkan arus listrik, dan banyak proses-proses lain.
• bioenergetika adalah studi kuantitatif hubungan energi dan konversi energi dalam
sistem biologi. Transformasi energi biologis menunjukan keterkaitan dengan hukum-
hukum termodinamika.
• Semua reaksi kimia dipengaruhi oleh dua kekuatan: kecenderungan untuk mencapai
ikatan yang paling stabil antar bagian (untuk entalpi, H, adalah ekspresi yang
berguna) dan kecenderungan untuk mencapai tingkat tertinggi keserampangan ,
dinyatakan sebagai entropi, S. kekuatan pendorong dalam suatu reaksi adalah ∆G,
perubahan energi, yang mewakili efek dari dua faktor:
∆G = ∆H – T ∆S
• standar perubahan energi bebas, ∆G’o, adalah fisik konstanta yang merupakan
karakteristik untuk reaksi tertentu dan dapat dihitung dari konstanta kesetimbangan
untuk reaksi:
∆G = - RT ln K’eq
• sebenarnya perubahan energi bebas, ∆G, merupakan variabel yang bergantung
pada ∆G’o dan pada konsentrasi reaktan dan produk:
∆G = ∆G’o + RT ln ([Produk] / [reaktan]).
• Bila ∆G adalah besar dan negatif, reaksi cenderung pergi ke arah depan; ketika ∆G
adalah besar dan positif, reaksi cenderung pergi ke arah sebaliknya; dan ketika ∆G =
0, sistem pada kesetimbangan.
• perubahan energi bebas untuk reaksi tidak bergantung pada jalur di mana reaksi
terjadi. perubahan energi bebas aditif; reaksi kimia yang dihasilkan dari reaksi
berturut-turut berbagi menengah secara umum memiliki keseluruhan perubahan
energi bebas yang merupakan jumlah dari nilai-nilai ∆G untuk reaksi individu.

6
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

13.1GRUP PHOSPORIL TRANSFER DAN ATP

Setelah mengembangkan beberapa prinsip-prinsip dasar perubahan energi dalam


sistem kimia, sekarang kita bisa mengkaji siklus energi dalam sel dan peran khusus ATP
sebagai energi yang menghubungkan rantai katabolisme dan anabolism. sel heterotropik
memperoleh energi bebas dalam bentuk kimia oleh katabolisme molekul gizi, dan
mereka menggunakan energi untuk membuat ATP dari ADP dan Pi. ATP kemudian
menyumbangkan sebagian dari energi kimia untuk proses endergonik seperti sintesis dari
metabolisme intermediet dan makromolekul dari prekursor lebih kecil, pengangkutan
bahan melintasi membran terhadap konsentrasi gradien, dan gerakan mekanis.
sumbangan energi dari ATP umumnya melibatkan partisipasi kovalen ATP dalam reaksi
yang didorong, dengan akibat bahwa ATP akhirnya dikonversi ke ADP dan Pi atau, dalam
beberapa reaksi, untuk AMP dan 2 Pi. Kita bahas di sini dasar besar perubahan kimia
energi bebas yang menyertai hidrolisis ATP dan senyawa fosfat energi tinggi lainnya,
dan menunjukkan bahwa kebanyakan kasus energi ATP donasi oleh kelompok
melibatkan transfer, hidrolisis ATP tidaklah sederhana. Untuk menggambarkan kisaran
energi transductions di mana ATP menyediakan energi, kami mempertimbangkan sintesis
makromolekul kaya informasi, pengangkutan zat terlarut melintasi membran, dan gerakan
yang dihasilkan oleh kontraksi otot.

Perubahan energi bebas untuk hidrolisis ATP adalah besar dan negatif

Pembelahan yang hidrolitik terminal anhidrida ikatan asam fosfat


(phosphoanhydride) dalam ATP memisahkan salah satu dari tiga fosfat bermuatan negatif
dan dengan demikian mengurangi beberapa tolakan elektrostatik di ATP; perilisan Pi
(HPO4 2) adalah pembentukan stabil oleh resonansi dari beberapa bentuk, tidak mungkin
dalam ATP dan ADP2, yang lain produk langsung dari hidrolisis, segera mengionisasi,
melepaskan H menjadi media yang sangat rendah [H] (~ 10-7 M). Karena konsentrasi
produk langsung hidrolisis ATP, di dalam sel, jauh di bawah konsentrasi pada
kesetimbangan, aksi massa terdapat pada reaksi hidrolisis dalam sel.

7
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Dasar kimia besar perubahan energi bebas yang berkaitan dengan hidrolisis ATP: 1
muatan pemisahan yang dihasilkan dari hidrolisis mengurangi tolakan elektrostatik di
antara empat muatan negatif pada ATP. 2 produk fosfat anorganik (Pi) yang distabilkan
oleh resonansi pembentukan hibrida, di mana masing-masing dari empat fosfor-oksigen
obligasi memiliki derajat yang sama-ikatan ganda karakter dan ion hidrogen tidak
selamanya berhubungan dengan salah satu dari oxygens . (Beberapa tingkat stabilisasi
resonansi juga terjadi di fosfat terlibat dalam anhidrida ester atau keterkaitan, namun
lebih sedikit bentuk resonansi yang mungkin daripada Pi.) 3 Produk segera mengionisasi
ADP2, melepaskan sebuah proton menjadi media yang sangat rendah [H] (pH 7 ). Faktor
keempat (tidak ditampilkan) bahwa bantuan hidrolisis ATP yang lebih besar derajat
solvation (hidrasi) dari produk-produk relatif Pi dan ADP menjadi ATP, yang menstabilkan
lebih lanjut produk-produk relatif terhadap reaktan.

8
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Senyawa terfosforilasi lain dan Thioesters juga memiliki Energi Bebas yang besar
dari Hidrolisis

Phosphoenolpyruvate (Gambar 13-3) berisi ikatan ester fosfat yang mengalami


hidrolisis untuk menghasilkan bentuk enol piruvat, dan produk langsung ini dapat segera
ter-tautomerize ke yang lebih stabil dalam bentuk keto piruvat. Karena reaktan
(phosphoenolpyruvate) hanya memiliki satu bentuk (enol) dan produk (piruvat) memiliki
dua kemungkinan bentuk, produk ini relatif stabil terhadap reaktan. Ini adalah faktor
terbesar yang tinggi energi bebas standar hidrolisis phosphoenolpyruvate: ∆G’o = 61,9
kJ / mol.

Thioesters, di mana atom belerang biasa menggantikan oksigen dalam ikatan ester,
juga memiliki standar energi bebas hidrolisis besar, negatif. Asetil-koenzim A, atau asetil-
KoA (Gambar 13-6), adalah salah satu dari banyak thioesters penting dalam
metabolisme. Kelompok yang asil dalam senyawa ini diaktifkan untuk transacylation,
kondensasi, atau reaksi reduksi-oksidasi.

9
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

ATP Memberikan Energi oleh Group Transfer, Bukan oleh Simple Hidrolisis

Sepanjang buku ini, Anda akan menemukan reaksi atau proses yang persediaan
energi ATP, dan kontribusi ATP reaksi ini biasanya ditunjukkan seperti pada Gambar 13-
8a, dengan satu panah yang menunjukkan konversi ATP menjadi ADP dan Pi (atau,
dalam beberapa kasus, ATP ke AMP dan pirofosfat, PPI). Ketika ditulis dengan cara ini,
reaksi ATP ini tampak sederhana reaksi hidrolisis di mana air menggusur Pi (atau PPI),
dan orang tergoda untuk mengatakan bahwa reaksi ATP-dependent adalah "didorong
oleh hidrolisis ATP." Ini bukan hal tersebut. Hidrolisis ATP per se biasanya tidak
menyelesaikan apa-apa kecuali pembebasan panas, yang tidak dapat mengendarai
proses kimia dalam sistem isotermal. Sebuah panah reaksi seperti yang pada Gambar
13-8a hampir selalu mewakili dua langkah proses (Gambar 13-8b) di mana bagian dari
molekul ATP, sebuah phosphoryl atau kelompok atau pyrophosphoryl adenilat separoh
(AMP), adalah pertama-tama ditransfer ke molekul substrat atau ke residu asam amino
dalam sebuah enzim, menjadi kovalen menempel pada substrat atau enzim dan
meningkatkan energi yang bebas konten. Kemudian, pada langkah kedua, mengandung
fosfat separoh ditransfer pada langkah pertama tersebut dipindahkan, menghasilkan Pi,
PPI, atau AMP. Jadi ATP berpartisipasi secara kovalen dalam enzim-reaksi yang
dikatalisis yang menyumbangkan energi bebas.

10
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

ATP Menyumbangkan Phosphoryl, Pyrophosphoryl, dan adenilil Groups

Reaksi ATP umumnya SN2 perpindahan nukleofilik , di mana mungkin nukleofil,


misalnya, oksigen dari alkohol atau karboksilat, atau nitrogen dari creatine atau rantai
samping atau arginin histidin. Masing-masing dari tiga fosfat ATP rentan terhadap
serangan nukleofilik (Gambar 13-10), dan setiap posisi serangan menghasilkan jenis
produk yang berbeda.

Serangan nukleofilik oleh alkohol pada fosfat (Gambar 13-10a) menggusur ADP
dan menghasilkan ester fosfat yang baru. Studi dengan reaktan telah menunjukkan
bahwa jembatan oksigen dalam senyawa baru berasal dari alkohol, bukan dari ATP;
kelompok dipindahkan dari ATP adalah phosphoryl (OPO3 2), bukan fosfat (OOPO3 2).
Grup Phosphoryl ATP untuk transfer dari glutamat (Gambar 13-8) atau glukosa
melibatkan serangan pada posisi molekul ATP. Attack pada memindahkan fosfat ATP
AMP dan transfer yang pyrophosphoryl (tidak pyrophosphate) kelompok untuk
menyerang nukleofil (Gambar 13-10b).

11
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Misalnya, pembentukan 5-phosphoribosyl-1-pirofosfat perantara kunci dalam


sintesis nukleotida, hasil dari serangan dari Ooh dari ribosa pada fosfat. Serangan
nukleofilik pada posisi menggusur ATP PPI dan transfer adenilat (5-AMP) sebagai
sebuah kelompok adenilil (Gambar 13-10c); reaksiny adalah adenylylation.

Energi ATP mengaktifkan Transer dan Kontraksi otot

ATP dapat memasok energi untuk pengangkutan ion atau molekul melintasi
membran ke berair lain kompartemen dimana konsentrasi yang lebih tinggi (lihat Gambar.
11-36). Proses transportasi konsumen utama energi; dalam ginjal dan otak manusia,
misalnya, sebanyak dua-pertiga dari energi yang dikonsumsi pada sisanya dipakai untuk
pompa Na+ dan K+ melintasi membran plasma melalui Na+ K+ ATPase.

Transportasi Na+ dan K+ didorong oleh fosforilasi siklik dan dephosphorylation dari
transporter protein, dengan ATP sebagai kelompok donor phosphoryl (lihat Gambar. 11-
37). Na-tergantung fosforilasi dari Na+ K+ ATPase kekuatan perubahan dalam konformasi
protein itu, dan K-tergantung bantuan dephosphorylation kembali ke konformasi asli.
Setiap siklus dalam proses transportasi hasil dalam konversi ATP ke ADP dan Pi, dan ini
merupakan perubahan energi bebas hidrolisis ATP yang mendorong perubahan-
perubahan siklik konformasi protein yang menghasilkan pemompaan electrogenic Na+
dan K+. Catatan bahwa dalam kasus ini ATP berinteraksi secara kovalen oleh kelompok
phosphoryl transfer ke enzim, bukan substrat.

Transphosphorylations antara Nukleotida Terjadi di Semua Jenis Cell

12
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Meskipun telah berfokus pada ATP sebagai energi sel donor muatan dan kelompok
phosphoryl, semua nukleosida trifosfat (GTP, UTP, dan CTP) dan semua
deoxynucleoside trifosfat (dATP, dGTP, dTTP, dan dCTP) yang penuh sama dengan
ATP. Perubahan yang terkait dengan freeenergy hidrolisis phosphoanhydride hubungan
mereka sangat hampir identik dengan yang ditunjukkan pada Tabel 13-6 untuk ATP.

Dalam persiapan untuk berbagai peran biologis, nukleotida lain tersebut dihasilkan
dan dipelihara sebagai nukleosida trifosfat (NTP) bentuk-bentuk kelompok phosphoryl
transfer ke nukleosida difosfat yang sesuai (NDPs) dan monophosphates (NMPs). ATP
utama energi tinggi senyawa fosfat diproduksi oleh katabolisme, dalam proses glikolisis,
fosforilasi oksidatif, dan, di sel-sel fotosintetik, fotofosforilasi. Beberapa enzim kemudian
membawa kelompok ATP phosphoryl dari nukleotida yang lain.

Anorganik Polyphosphate berPotensi menjadi Group Donor Phosphoryl

Anorganik polyphosphate (polip) adalah polimer linear yang terdiri dari puluhan atau
ratusan Pi residu phosphoanhydride terhubung melalui obligasi. Polimer ini, hadir dalam
semua organisme, dapat terakumulasi tingkat tinggi dalam beberapa sel.

Salah satu peran potensial untuk polip adalah untuk bertindaki sebagai
phosphagen, sebuah kelompok phosphoryl cadangan yang dapat digunakan untuk
menghasilkan ATP, seperti fosfat kreatin digunakan dalam otot. Polip memiliki sekitar
kelompok yang sama transfer phosphoryl potensi sebagai PPi.

Kesimpulan Group Phosporil Transper Dan ATP :

• ATP kimia antara katabolisme dan anabolism. Ini adalah muatan energi sel hidup.
konversi eksergonik ATP menjadi ADP dan Pi, atau untuk AMP dan PPI,
digabungkan ke banyak reaksi endergonik dan proses.
• hidrolisis langsung ATP adalah sumber energi dalam perubahan konformasi yang
menghasilkan kontraksi otot tetapi, secara umum, itu bukan ATP hidrolisis tetapi
transfer dari phosphoryl, pyrophosphoryl, atau kelompok adenilil dari ATP ke molekul
substrat atau enzim yang keduanya energi ATP dipisahkan pada transformasi
endogonic dari substrat.
• grup ini mentransfer reaksi, ATP menyediakan energi bagi reaksi anabolik , termasuk
informasi sintesis molekul, dan untuk pengangkutan molekul dan ion melintasi
membran melawan gradien konsentrasi dan gradien potensial listrik.
• Sel mengandung metabolit lain yang besar, negatif, energi bebas dari hidrolisis,
termasuk phosphoenolpyruvate, 1,3-bisphosphoglycerate, dan phosphocreatine.
senyawa energi tinggi Ini , seperti ATP, memiliki grup phosphoryl mentransfer

13
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

potensial tinggi; mereka donor baik dari kelompok phosphoryl. Thioesters juga
memiliki energi bebas tinggi dari hidrolisis.
• Inorganic polyphosphate, hadir di semua sel, dapat berfungsi sebagai kelompok
reservoir phosphoryl dengan kelompok transfer potensial tinggi.

13.1REAKSI OKSIDASI-REDUKSI BIOLOGI

Pemindahan kelompok phosphoryl adalah ciri utama dari metabolisme. Tak Kalah
pentingnya adalah jenis lain transfer, transfer elektron dalam reaksi oksidasi-reduksi.
Reaksi-reaksi ini melibatkan hilangnya elektron oleh satu spesies kimia, yang dengan
demikian teroksidasi, dan penambahan elektron oleh yang lain, yang dikurangi. Aliran
elektron dalam reaksi oksidasi-reduksi bertanggung jawab, langsung atau tidak langsung,
untuk semua pekerjaan yang dilakukan oleh organisme hidup. Dalam nonphotosynthetic
organisme, sumber elektron berkurang senyawa (makanan); dalam organisme
fotosintetik. Jalan aliran elektron dalam metabolisme yang kompleks. Elektron bergerak
dari berbagai metabolisme intermediet untuk khusus pembawa elektron dalam reaksi
katalis-enzim. Para operator pada gilirannya menyumbang kepada akseptor elektron
dengan elektron yang lebih tinggi kedekatannya, dengan pelepasan energi. Sel
mengandung berbagai energi molekuler transduser, yang mengubah aliran energi
elektron menjadi bermanfaat.

Arus Elektron yang Dapat melakukan Kerja Biologi

Sel-sel hidup memiliki "sirkuit" biologis dengan senyawa yang relatif berkurang
seperti glukosa sebagai sumber elektron. Seperti glukosa teroksidasi enzimatik, aliran
elektron yang dilepaskan secara spontan melalui serangkaian perantara elektron-carrier
jenis kimia lain, seperti O2. Aliran elektron ini eksergonik, karena O2 memiliki afinitas
elektron lebih tinggi daripada elektron pembawa gabungannya. Gaya gerak listrik yang
dihasilkan energi menyediakan berbagai transduser energi molekuler (enzim dan protein
lain) yang melakukan kerja biologis. Dalam mitokondria, misalnya, enzim yang terikat
pada membran beberapa aliran elektron untuk menghasilkan sebuah perbedaan pH
transmembran, mencapai osmotik dan pekerjaan listrik. Gradien proton sehingga
terbentuk energi potensial, kadang-kadang disebut proton-motif dengan analogi dengan
gaya gerak listrik. Enzim lain, ATP sintase di bagian dalam membran mitokondria,
menggunakan kekuatan untuk melakukan protonmotive kerja kimia: sintesis ATP dari
ADP dan Pi sebagai aliran proton melintasi membran secara spontan. Demikian pula,
membran-lokal E. coli mengubah gaya gerak listrik menjadi kekuatan proton pendorong,
yang kemudian digunakan untuk flagellar daya gerak.

oksidasi biologis Sering Melibatkan Rx. Dehidrogenasi

Dalam sistem biologis, oksidasi sering identik dengan dehidrogenasi, dan banyak
enzim yang mengkatalisis reaksi oksidasi dehydrogenases. Perhatikan bahwa semakin

14
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

berkurang senyawa dalam Gambar 13-13 (atas) lebih kaya hidrogen dari oksigen,
sedangkan senyawa yang lebih teroksidasi (bawah) memiliki lebih kurang oksigen dan
hidrogen. Namun tidak semua reaksi reduksi-oksidasi biologis malibatkan carbon, seperti

pada

Ukuran Affinitas Potensial reduksi Elektron

Ketika dua pasangan redoks conjugate


bersama-sama dalam larutan, transfer elektron dari
donor elektron dari satu pasangan ke akseptor
elektron yang lain dapat berlanjutkan secara
spontan. Kecenderungan untuk reaksi seperti
tergantung pada afinitas relatif akseptor elektron dari
masing-masing pasangan redoks untuk elektron.
Potensial reduksi standar, E, ukuran (dalam volt)
afinitas ini, dapat ditentukan dalam percobaan
seperti yang dijelaskan dalam Gambar 13-14.
Electrokimia telah dipilih sebagai standar acuan
setengah-reaksi

Elektroda di mana setengah-reaksi ini terjadi


(yang disebut setengah-sel) adalah standar yang
ditetapkan secara umum

15
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Potensi pengurangan setengah-sel tidak hanya tergantung pada jenis bahan kimia
yang ada, tetapi juga pada kegiatan yang dilakukan, diperkirakan oleh konsentrasinya

16
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

pula. Walther Nernst meturunkan suatu persamaan yang berhubungan dengan potensi
pengurangan standar (E) ke potensial reduksi (Eo) pada setiap konsentrasi jenis senyawa
teroksidasi dan tereduksi dalam sel :

mana R dan T mempunyai arti mereka yang biasa, n adalah jumlah elektron yang
ditransfer per molekul, dan J adalah konstanta Faraday (Tabel 13-1). At 298 K (25 C),
persamaan ini diturunkan menjadi :

Standar Potensial Reduksi Dapat Digunakan untuk menghitung perubahan energi


bebas

Energi disediakan oleh aliran elektron spontan ini (perubahan energi bebas untuk
reaksi oxidationreduction) adalah sebanding dengan ∆E:

17
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Oksidasi Selular Glukosa menjadi Karbon Dioksida Memerlukan Specialized


Electron Carriers

Prinsip-prinsip reduksi-oksidasi energetika yang dijelaskan di atas berlaku pada


banyak reaksi metabolik yang melibatkan transfer elektron. Sebagai contoh, dalam
banyak organisme, oksidasi glukosa memasok energi untuk produksi ATP. Rx
berlagsung:

18
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Energi bebas yang diperlukan lebih besar daripada yang diperlukan untuk sintesis
ATP (50-60 kJ / mol; lihat Kotak 13-1). Sel mengkonversi glukosa untuk CO2,
melepaskan energi-reaksi tinggi, melainkan dalam serangkaian reaksi terkendali,
beberapa di antaranya oksidasi. Energi bebas dilepaskan pada langkah oksidasi ini
adalah urutan yang sama besarnya seperti yang diperlukan untuk sintesis ATP dari ADP,
dengan beberapa energi untuk cadangan. Elektron dihapus dalam langkah oksidasi lalu
akan ditransfer ke koenzim khusus untuk membawa elektron, seperti NAD dan FAD.

beberapa Jenis Koenzim dan Protein bertindak sebagai Universal Electron Carriers

Banyaknya enzim yang mengkatalisis oksidasi selular saluran elektron dari ratusan
substrat yang berbeda ke dalam beberapa jenis pembawa elektron universal. reduksi dari
carrier ini dalam hasil proses katabolik dalam konservasi energi bebas dilepaskan oleh
oksidasi dari substrat. NAD, NADP, FMN, dan FAD merupakan koenzim yang larut dalam
air yang mengalami oksidasi reversibel dan reduksi dalam banyak reaksi electrontransfer
metabolisme.

NAD+ dan NADP+ nukleotida bergerak mudah dari satu enzim ke yang lain,
sedangkan flavin FMN dan FAD nukleotida biasanya sangat erat terikat pada enzim, yang
disebut flavoproteins, mereka bertindak sebagai kelompok prostetik. lemak-quinones larut
seperti ubiquinone dan plastoquinone bertindak sebagai pembawa elektron dan proton
donor dalam lingkungan membran tak berair. Besi-sulfur protein dan sitokrom, yang telah
terikat erat kelompok prostetik reversibel yang mengalami oksidasi dan pengurangan,
juga berfungsi sebagai pembawa elektron dalam banyak reaksi oksidasi-reduksi.
Beberapa dari protein ini larut dalam air, tetapi yang lain adalah periferal atau protein
integral membran.

NADH dan NADPH bertindak dengan Dehydrogenases sebagai elektron Carriers


yang Larut

Nikotinamid adenin dinukleotida (NAD+ dalam bentuk teroksidasi) dan analog dekat
nikotinamida adenin dinukleotida fosfat (NADP) terdiri dari dua nukleotida bergabung
melalui gugus fosfat dengan ikatan phosphoanhydride (Gambar 13-15a). Karena
menyerupai cincin nikotinamida piridina, senyawa ini kadang-kadang disebut piridina
nukleotida. Vitamin niasin adalah sumber dari separoh nikotinamida di nikotinamida
nukleotida.

Kedua koenzim mengalami pengurangan reversibel nikotinamida cincin (Gambar


13-15). Sebagai molekul substrat mengalami oksidasi (dehidrogenasi), menyerahkan dua
atom hidrogen, bentuk teroksidasi nukleotida (NAD atau NADP) menerima sebuah ion
hidrida (:H+, setara dengan sebuah proton dan dua elektron) dan ditransformasikan
menjadi bentuk (NADH atau NADPH). Proton kedua dihapus dari substrat dilepaskan ke
pelarut berair. Setengah-reaksi untuk tiap jenis nukleotida Oleh karena itu reduksi NAD
atau NADP mengubah benzenoid nikotinamida cincin dari sebagiannya (dengan tetap
muatan positif pada cincin nitrogen) ke bentuk quinonoid (tanpa dikurangi di nitrogen).

19
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

Ketika NAD+ atau NADP+ berkurang, ion hidrida pada prinsipnya dapat ditransfer ke
salah satu sisi cincin nikotinamida: bagian depan (sisi A) atau bagian belakang (sisi B),
sebagaimana ditunjukkan pada Gambar 13-15a. Isotopically Studi dengan substrat
berlabel telah menunjukkan bahwa sebuah enzim mengkatalisis baik tipe A atau tipe B-
transfer, tetapi tidak keduanya.

20
Prinsip Bioenergetika Resum
e
BIOKIM
IA

KESIMPULAN REAKSI OKSIDASI-REDUKSI BIOLOGI

• Dalam banyak organisme, pusat proses konservasi energi adalah oksidasi glukosa
bertahap untuk CO2, di mana sebagian energi dari oksidasi disimpan dalam ATP
sebagai elektron yang dilewatkan ke O2.
• reaksi Biologi oksidasi-reduksi dapat digambarkan dalam istilah-istilah dari dua
setengah-reaksi, masing-masing dengan karakteristik potensi pengurangan standar,
E’’0.
• Ketika dua setengah sel elektrokimia, masing-masing berisi komponen-komponen
dari setengah-reaksi, dihubungkan, elektron cenderung mengalir ke setengah-sel
dengan potensial reduksi yang lebih tingg. kecenderungan Kekuatan ini sebanding
dengan perbedaan antara dua potensi reduksi (∆E) dan merupakan fungsi dari
konsentrasi jenis teroksidasi dan tereduksi.
• standar perubahan energi bebas untuk reaksi reduksi-oksidasi berbanding lurus
dengan perbedaan dalam potensi pengurangan standar dari dua setengah-sel:

• Banyak reaksi oksidasi biologis adalah dehydrogenations di mana satu atau dua
atom hidrogen (H+ + e-) ditransfer dari substrat ke akseptor hidrogen. Oksidasi-reaksi
pengurangan dalam khusus melibatkan sel-sel hidup pembawa elektron.
• FAD dan FMN, flavin nukleotida, berfungsi sebagai perekat erat kelompok prostetik
flavoproteins. Mereka dapat menerima satu atau dua elektron. Flavoproteins juga
berfungsi sebagai reseptor cahaya di cryptochromes dan photolyases.

21