ARN

Structura ARN
Transcriere

Structura ARN
ARN sunt produi de policondensare a
ribonucleotidelor
Cantitatea de ARN variaz att de la o celul la alta
ct i n cadrul aceleiai celule, n funcie de
intensitatea procesului de biosintez a proteinelor
la momentul dat
n funcie de rolul pe care l au n biosinteza
proteinelor se clasific:
ARN
ARN
ARN
ARN

ribozomal ARNr
de transport ARNt
mesager ARNm
de mici dimensiuni - ARNsn

Structura ARN
Structura primar asemntoare cu cea a
ADN, cu deosebirea c pentoza este riboza iar
n locul T avem U; coninutul n A de cel de U
(U formeaz 2 legturi de hidrogen cu A) i de
G de cel de C
Structura secundar ARN este
monocatenar; pe anumite poriuni, unde
permite complementaritatea bazelor, se
organizeaz n structuri dublu helicoidale;
poriunile de baze necomplementare sunt
expulzate ca bucle n afara zonelor helicoidale

Structura secundar a ARNt

Structura ARN
Structura teriar ARNt adopt o
structur n forma literei L; braul care
leag aminoacidul i braul TC se afl pe
o latur iar anticodonul i braul DHU pe
cealalt latur

ARNr
Molecule flexibile, deformabile, heterogene ca
mrime i form avnd zone dublu catenare
ntrerupte de zone monocatenare
Este cel mai stabil metabolic
Reprezint 80% din totalul ARN
n funcie de coeficientul de sedimentare (1 S =
10-13 sec ; depinde de forma i mrimea
moleculei) la procariote se ntlnesc 3 tipuri
de ARNr: 23 S, 16 S i 5 S
iar la eucariote 4 tipuri de ARNr:
28 S,
18 S, 5,8 S i 5 S

ARNr
Nucleotidele din ARNr au metilat
gruparea 2-OH din riboz ceea ce le
confer rezisten la antibiotice
Intr n constituia ribozomilor avnd
rol catalitic (ARNr 23 S reprezint centrul
activ al formrii legturii peptidice)
Ribozomii reprezint sediul
biosintezei proteinelor i sunt
complexe ribonucleoproteice
Dup valoarea constantei de
sedimentare, la bacterii ribozomii

Ribozomii

Permit conlucrarea ARNm, ARNt i ARNr n

vederea desfurrii biosintezei proteice

Ribozomii
Pe suprafaa fiecrui ribozom exist 3 situsuri:
situsul aminoacid (A) care leag ARNt purttor
al unui aminoacid, situsul peptid (P) care leag
ARNt purttor al unui peptid i situsul de
eliminare (E) de pe care este eliberat ARNt liber
La ARNm se leag subunitatea mic a
ribozomului astfel nct locusul P s se afle n
dreptul codonului ce specific aminoacidul
iniiator; legarea subunitii mari la acest
complex determin formarea ribozomului
funcional

ARNt
Reprezint 15% din ARN total i conine
aprox. 75 -90 nucleotide
Procentul de baze complementare este
mare; raportul A+G / U+C este aprox.1
Are aspect de foaie de trifoi, avnd 4 zone
de perechi complementare i 3
necomplementare, expulzate ca bucle
Molecula de ARNt are cel mai mare coninut
de baze minore: dihidrouridin (DHU),
ribotimidin (T), pseudouridin (etc

ARNt
La captul 3 toi ARNt maturi au secvena CCA
la care se leag aminoacidul iar la captul 5
un rest guanilic.
n partea opus braului aminoacid se afl braul
anticodon care conine o secven de 3 nucleotide
numit anticodon, care variaz cu natura ARNt
Braul DHU are rol n recunoaterea i legarea
aminoacil-ARNt-sintetazei, braul TC asigur
legarea la ribozom a complexului aminoacil-ARNt (pe
aceste brae se afl baze azotate minore); braul
variabil cuprine 4-21 nucleotide
n soluie adopt forma literei L

ARNt

ARNt
Funcii:
Asigur legarea aminoacizilor specifici,
activai, la restul adenilic din secvena
CCA i transportul lor la ribozomi; exist
cel puin 20 tipuri diferite de ARNt (un
aminoacid poate fi specificat de mai muli
codoni)
Adaptarea aminoacidului transportat n
dreptul codonului de pe ARNm corespunztor,
prin recunoaterea codon-anticodon (pe baza
complementaritii bazelor)

ARNm
Monocatenar, de lungimi variabile, sintetizat prin
transcriere utiliznd una din catenele ADN ca matri
Informaia depozitat n ARNm sub forma tripletelor de
nucleotide numite codoni este decodificat la nivelul
ribozomilor
La captul 3 se afl o secven netradus numit
leader iar la captul 5 o secven, deasemeni
netradus, numit trailer
ARNm procariot este monocistronic /monogenic
(conine informaia privind sinteza unui singur
polipeptid) sau policistronic /poligenic (conine
informaia privind sinteza mai multor proteine implicate
n aceeai cale metabolic)

ARNm
La procariote ntre gena transcris, ARNm i
protein exist o relaie de coliniaritate
(succesiunea de nucleotide dintr-o gen corespunde
exact celei de aminoacizi din protein)
ARNm eucariot este monocistronic i de cele
mai multe ori ARNm transcris este cu mult mai mare
dect ARNm citoplasmatic (matur)
La eucariote, gena este mult mai lung dect
proteina obinut; ea cuprinde secvene
codificatoare, exoni (expressed regions) i secvene
necodificatoare, introni (intervening sequences)

ARNsn
Exist n nucleu, citosol i mitocondrie
Se prezint sub forma mai multor specii
moleculare, bogate n uridin (U1-U6)
Asociate cu proteine formeaz particule
ribonucleoproteice (small nuclear
ribonucleoproteins), snRNP sau
snurps, cu rol n excizia intronilor din
transcriptele primare ale ARNm, controlul
traducerii sau recunoaterea proteinelor ce
urmeaz a fi exportate.

Transcrierea
Este procesul prin care se
sintetizeaz ARN pe matri de ADN
Acest proces are loc ori de cte ori
este nevoie n viaa unei celule

Elementele necesare transcrierii

Substraturi ATP, GTP, CTP, UTP
Matria una din cele dou catene ale
ADN, numit i catena necodificatoare
(catena codificatoare va fi cealalt i este
identic cu catena de ARN sintetizat, cu
excepia nlocuirii T cu U); transcrierea
este asimetric; dac pe molecula de
ADN se afl mai multe gene, catenele ADN
vor fi catene matri pentru unele gene i
catene codificatoare pentru altele

Elementele necesare
transcrierii
Enzime ARN polimeraze-ADN dependente
Nu necesit prezena primerului pentru c pot iniia
catene
Au aciune asemntoare cu a ADN polimerazelor
ADN dependente
Sintetizeaz catene cu direcia 53 (ca i ADN
polimerazele)
Nu au activitate de corector
La procariote exist o singur enzim
pentameric
Enzima miez - important n procesul de elongare
Subunitatea esenial pentru iniierea transcrierii

Elementele necesare
transcrierii
Enzime ARN polimeraze-ADN
dependente
La eucariote:
ARN polimeraza mitocondrial
localizat n matrixul mitocondrial,
sintetizeaz toate tipurile de ARN
mitocondrial
ARN polimeraza I n nucleoli, sintetizeaz
ARNr 45 S
ARN polimeraza II n nucleoplasm,
sintetizeaz ARNm, ARNsn
ARN polimeraza III n nucleoli,

Elementele necesare
transcrierii
Secvene promotor P orienteaz
corect polimeraza la situsul de iniiere;
punctul de start este notat +1, secvenele
situate n amonte se noteaz cu iar
secvenele n aval, cu +
La procariote sunt situai n amonte, pe
catena codificatoare; sunt foarte bine
conservate n evoluie
Caseta -10 = caseta Pribnow = 5 TATAAT- 3
Caseta -35 = 5 TTGACA- 3

Promotorii la procariote

Elementele necesare
transcrierii
Secvene promotor P
La eucariote sunt diferite pentru fiecare polimeraz
n parte; pentru ARN polimeraza I i II se afl n
amonte iar pentru polimeraza III n aval fa de
punctul start al transcrierii
Caseta TATA, asemntoare casetei Pribnow, centrat la
25-35 perechi de baze de start responsabil de acurateea
iniierii transcrierii
Casetele CAAT i GC responsabile de frecvena
transcrierii

Factorii de iniiere:
La procariote factorul
La eucariote 6 factori diferii

Promotorii la eucariote

Etapele transcrierii
Iniierea
subunitatea orienteaz corect enzima fa de
punctul de start, recunoscnd regiunea -35; se
formeaz complexul nchis
Deschiderea ADN pe o poriune de aprox. 10 perechi
de baze i formarea, datorit subunitiia unei
bucle care se ntinde pn la punctul de iniiere a
transcrierii; se formeaz complexul deschis
Formarea primei legturi fosfat diesterice dintre
nucleotidul +1 (ntotdeauna purinic) i nucleotidul +2
Dup legarea a 10 nucleotide subunitatea se
disociaz ( se poate asocia cu alte ARN polimeraze
miez i ncepe o nou rund de transcriere)

Etapele transcrierii
Elongarea
are loc n bucla de transcriere (12-17
perechi de baze); ADN se desface n faa
buclei de transcriere i se renatureaz n
spatele buclei
Pe msur ce se sintetizeaz catena de
ARN, are loc disocierea ei din duplexul
hibrid ADN-ARN permind refacerea
ADN dublu catenar
Viteza de elongare nu este constant,
depinznd de secvenele de ADN

Animaie transcriere

Animaie transcriere

Etapele transcrierii
Terminarea la procariote
Rho independent catena matri de ADN conine
secvene stop = secvene palindromice bogate n
perechi GC, urmate de o zon bogat n perechi AT; prin
transcrierea acestei zone se formeaz o structur n ac
de pr a transcriptului ARN care se termin cu o coad
poli U; din cauza mprecherii mai sumare cu catena de
ADN, are loc disocierea ARN din hibridul rezultat la
transcriere
Rho dependent n cazul n care nu avem secvene
stop; factorul proteic rho () se leag la o secven
specific a ARN monocatenar si gliseaz pe el spre
bucla de transcriere (proces care necesit hidroliza
ATP), desprinzndu-l de catena matri i de enzim

Terminarea rhoindependent

Terminarea rho-dependent

Modificarea transcriptelor primare

(prelucrri post-transcriere)
Eliminarea exo- i endonucleazic a unor
fragmente polinucleotidice
Adugarea unor fragmente
polinucleotidice la capetele 3 i 5
Modificri covalente la nivelul unor resturi
de nucleotide

Prelucrri post-transcriere
Eliminarea intronilor
Intronii au dimensiuni mult mai mari dect
exonii; doar 5-10% din genom reprezint
secvene codificatoare
Se realizeaz n nucleu pentru toate
tipurile de ARN
Enzime specifice recunosc jonciunea intronexon, taie intronul i leag apoi exonii rezultai
La ARNr se face autocatalitic (molecule de
ARN au activitate catalitic)

Prelucrri post-transcriere
Eliminarea intronilor
La ARNm este realizat de un
complex asemntor ribozomului, numit
splicozom format din snurps i
transcriptul primar ARNm
La ARNt este realizat de un complex
multienzimatic care prezint activitate
endonucleazic i de ligaz

Eliminarea intronilor n ARNt

Prelucrri post-transcriere
Modificri suplimentare
La ARNm eucariot (ARNm procariot se
nate matur)
formarea captului 5 = adugarea unui
rest de 7-metil guanozin (acesta protejeaz
moleculele de aciunea 53 exonucleazelor
i este recunoscut de ribozomi ca semnal de
iniiere a sintezei proteinelor
formarea unei cozi poli A de 200-300
nucleotide la captul 3- ajut la
stabilizarea moleculei de ARNm

Prelucrri post-transcriere
Modificri suplimentare
La ARNt
Transcriptul primar este multimeric i este
tiat de ribonucleaze, rezultnd mai muli
ARNt monomerici
Formarea captului 5 cu ajutorul
ribonucleazei P = un ARN de cteva sute
de nucleotide, avnd rol catalitic, i o
protein bazic
Formarea captului 3 (CCA) la
procariote este relevat de ctre o enzim cu
activitate exonucleazic; la eucariote este
adugat

Prelucrri post-transcriere
Modificri suplimentare
La ARNr
La eucariote - are loc clivarea unui
transcriptul primar 45 S rezultnd toate
ARNr mature(fr ARNt 5 S, care se obine
dintr-un alt transcript)
La procariote dintr-un transcript 30 S se
obin prin clivare ARNr 23 S, 16 S i ARN t
iar ARNr 5 S (dintr-un alt transcript)

Modificri suplimentare la
ARNr

Inhibitorii transcrierii
Antibioticul - actinomicina D i colorantul acridina se intercaleaz ntre perechile de
GC i distorsioneaz molecula de ADN
mpiedicnd replicarea i transcrierea
-amanitina - din ciupercile otrvitoare
este inhibitor al ARN polimerazei
Antibioticele din clasa rifamicinelor - inhib
iniierea transcrierii la bacterii prin legarea
la subunitatea a ARN polimerazei

Reglarea transcrierii la
procariote
Enzime constitutive enzime la care Ks =Kd; ele
catalizeaz procese fundamentale pentru existena
celulei. Se gsesc n celule n cantiti relativ
constante. Nu sufer fluctuaii semnificative n raport
cu factorii de mediu.
Enzime inductibile sunt enzimele pentru care Ks>Kd;
sunt implicate n general n ci catabolice. Enzima este
sintetizat numai dac exist substratul asupra cruia
s acioneze. Substratul acioneaz ca inductor,
accelernd sinteza enzimei
Enzime represibile sunt enzimele pentru care Ks<Kd;
pot fi implicate n procese de sintez a unor constitueni
celuari (ci anabolice). Sinteza lor este ncetinit de
produsul final al reaciei catalizate.

Reglarea transcrierii la
procariote
Jacob i Monod au propus teoria operonului
pentru a explica inducia i represia genelor
Operonul lac = un grup de gene reglate
coordonat ai cror produi au rol n
metabolizarea lactozei
Gene structurale (x, y i z) conin informaia
pentru sinteza a 3 enzime (cele 3 gene sunt
adiacente i au un singur promotor)
Gena reglatoare (i) conine informaia pentru
sinteza proteinei represor
Operatorul (o) permite transcrierea genelor
structurale atunci cnd este liber

Operonul lac
n absena glucozei E.Coli poate utiliza lactoza ca
surs alternativ de energie
n absena lactozei (inductorul), represorul se
leag la operator blocnd transcrierea genelor
structurale
n prezena lactozei, aceasta se leag la represorul
ataat de operator i inducnd o tranziie
alosteric, i schimb conformaia, acesta
desprinzndu-se de operator; n aceast situaie
ARN polimeraza poate face transcrierea celor 3
gene; ca urmare se sintetizeaz cele 3 enzime
necesare bacteriei pentru a utiliza lactoza

Operonul lac

Operonul triptofanului
Operonul conine 5 gene care codific enzime
necesare biosintezei triptofanului, promotorul,
operatorul i gena reglatoare
n absena triptofanului, represorul sintetizat este
inactiv, permitnd transcrierea genelor i deci
sinteza triptofanului
La concentraii mari de triptofan, acesta va
funciona ca un corepresor, se leag la represor, i
determin schimbarea conformaiei ceea ce va
favoriza legarea sa la operator; ca urmare genele
structurale nu mai pot fi transcrise, prevenind
acumularea n exces a triptofanului

Operonul triptofan