Lapisan-lapisan pada trakea meliputi lapisan mukosa, lapisan submukosa dan lapisan

tulang rawan trakeal dan lapisan adventitia. Lapisan mukosa meliputi lapisan sel-sel epitel
respirasi dan lamina propria. Lamina proprianya banyak mengandung jaringan ikat longgar
dengan banyak serabut elastik,

yang selanjutnya membentuk membran elastik yang

menghubungkan lapisan mukosa dan submukosa. Pada submukosa terdapat kelenjar mukoserous yang mensekresikan sekretnya menuju sel-sel epitel.
Tulang rawan pada trakea berbentuk huruf C yang terdiri dari tulang rawan hialin.
Ujung-ujung dorsal dari huruf C dihubungkan oleh otot polos dan ligamentum fibroelastin.
Ligamentum mencegah peregangan lumen berlebihan, dan kontraksi otot polos menyebabkan
tulang rawan saling berdekatan. Hal ini digunakan untuk respon batuk. Tulang rawan trakea
dapat mengalami osifikasi dengan bertambahnya umur.
Lapisan adventitia terdiri dari jaringan ikat fibrous. Trakea bercabang dua yaitu dua
bronkus utama