Pada dasarnya semua badan air merupakan tempat terakhirya kehidupan, dan oleh
karena itu produksi karbon organik dapat terjadi dalam lingkungan perairan dan
kelautan di manapun berada.
Kebanyakan batuan sedimen, bagaimanapun, mengandung bahan organik meskipun
hanya sedikit (pada level sepersekian persen).
Ini merupakan bukti adanya efisiensi kehidupan: hampir semua karbon organik yang
dihasilkan oleh autotroph selanjutnya dioksidasi oleh respirasi, yaitu proses yang
disebut remineralisasi.
Memang, sebagian besar karbon organik yang disintesis dalam badan air tidak pernah
mencapai sedimen: karena dikonsumsi dalam kolom air.
Karbon organik yang tidak berhasil mencapai bagian bawah dikonsumsi oleh
organisme hidup pada dan dalam sedimen.
Meskipun makrofauna berperan dalam remineralisasi, bakteri bertanggung jawab
untuk sebagian besar remineralisasi (dalam tanah, sebaliknya, jamur sering
merupakan konsumen dominan bahan organik).
Konsentrasi bakteri di lapisan permukaan sedimen laut biasanya di kisaran 10 8 - 1010
sel per gram berat kering (Deming dan Baross, 1993).
Peran bakteri dalam siklus karbon, nitrogen, dan belerang yang diringkas dalam
Gambar 14.33.
The availability of oxidants, and particularly oxygen, is, as one might expect, among the
most important factors in the survival of organic matter.
Simply put, the preservation of significant amounts of organic matter in sediment
requires that the burial flux of organic matter exceed the flux of oxidants.
The flux of oxidants depends on sedimentation rate, bioturbation, and diffusion, and
their availability in the overlying water.
Where the burial flux of organic carbon exceeds the downward flux of oxygen, the
latter will ultimately be completely consumed and conditions will become reducing.
At that point aerobic respiration must cease.
This may occur either within the sediment, or within the water column itself.
Situations where deep water becomes anoxic are rare in the modern ocean (indeed, in
most of the deep ocean conditions do not become anoxic even in the sediment); it
occurs only in a few basins where circulation of deep water is restricted, such as the
Black Sea.
However, anoxicity appears to have been more common at certain times in the
geologic past, such as the Cretaceous, when ocean circulation was different. Anoxicity
is perhaps more common in lakes, where the abundance of nutrients is higher than in
the open ocean.
Diagenesis of Marine
Diagenesis dalam konteks bahan organik mengacu pada perubahan
Sediments
komposisi bahan organik yang diinduksi secara biologis yang terjadi
Sebagian besar bahan organik dalam sedimen ada dalam bentuk padat,
namun hanya senyawa terlarut dapat menyeberangi membran sel dan menjadi
sumber yang berguna untuk gizi bagi mikroba.
Untuk alasan ini, bakteri melepaskan exoenzymes yang pertama memecah
molekul organik kompleks menjadi yang tidak larut sedikit.
Molekul organik kompleks biasanya tidak dapat dioksidasi sepenuhnya oleh
organisme tunggal, karena tidak ada organisme tunggal yang kemungkinan
akan menghasilkan semua enzim yang diperlukan.
Sebaliknya, makromolekul dipecah oleh konsorsium bakteri.
Dalam setiap langkah, beberapa energi dilepaskan dan molekul yang lebih
kecil diproduksi sebagai limbah, ini selanjutnya diserang oleh bakteri lain.
Dengan demikian protein, karbohidrat, dan lipid dipecah menjadi asam amino,
gula sederhana, dan rantai panjang asam lemak.
Molekul-molekul yang lebih kecil dapat diserang oleh bakteri fermentasi yang
menghasilkan asam asetat, asam karboksilat rantai pendek lainnya, alkohol,
hidrogen, dan CO2.
Pada langkah terakhir, ini dikonversi menjadi metana (CH4) oleh bakteri
metanogen.
Selama proses ini, sisa-sisa bakteri itu sendiri bisa menjadi bagian penting dari
sedimen materi organik.
Apa molekul yang bertahan? Seperti yang kita harapkan, molekul organik
sederhana seperti asam amino, gula, dan pendek-dirantai asam karboksilat
dengan cepat terurai oleh bakteri (skala waktu untuk hari dan minggu).
Molekul yang lebih kompleks, seperti polisakarida dan asam lemak
tampaknya membusuk selama beberapa bulan sampai beberapa tahun
(Henrichs, 1993).
Kelas tertentu dari senyawa, terutama senyawa yang berfungsi sebagai
bahan struktural seluler (misalnya, komponen dari dinding sel), tampaknya
sangat tahan terhadap dekomposisi bakteri dan membentuk sebagian besar
bahan organik yang bertahan/tidak berubah.
Contoh bahan-bahan yang tahan adalah algaenans, yang ditemukan di
dinding sel ganggang laut, dan phlorotannins (De Leeuw dan Largeau, 1993).
Materi Allochthonous yang berasal dari tumbuhan tingkat tinggi juga dapat
berkontribusi sejumlah senyawa kaya aromatik yang bertahan (lihat di
bawah) ke sedimen di lingkungan laut marjinal.
Namun demikian, sebagian kecil dari senyawa yang mudah dimetabolisme
juga dapat bertahan.
Diagenesis of Aquatic
Sediments
Secara keseluruhan, diagenesis dalam sedimen air tawar mirip dengan
diagenesis kelautan.
Seperti juga terjadi di sedimen laut, sebagian besar detritus organik di
lingkungan perairan berasal dari tumbuhan, hewan berkontribusi kurang
dari 10%.
Mungkin perbedaan utama dalam diagenesis antara danau besar dan
laut adalah konsentrasi sulfat jauh lebih rendah di danau.
Sulfat adalah penting baik sebagai oksidator dan karena sulfur dapat
dimasukkan ke dalam molekul organik (terutama lemak) selama
diagenesis awal, proses yang dikenal sebagai "vulkanisasi alami".
Karena air segar memiliki konsentrasi sulfat rendah, zona pengurangan
sulfat dibatasi dan vulkanisasi tidak terjadi.
Jika tidak, urutan yang sama dari penggunaan oksidan dan dekomposisi
terjadi, dan sebagian besar dari remineralisasi terjadi dekat antarmuka
sedimen-air.
Batubara terbentuk oleh pemadatan dan diagenesis sedimen kaya organik, yang disebut gambut,
disimpan di rawa-rawa.
Berbeda dengan minyak bumi, yang dapat terbentuk dalam sedimen yang mengandung hanya
beberapa persen bahan organik, bentuk batubara dari sedimen di mana konten organik adalah
konstituen yang dominan.
Ada banyak contoh lingkungan modern yang mengandung kaya akan bahan organik kini terakumulasi.
Produksi gambut dalam lingkungan merupakan konsekuensi dari sejumlah faktor. Yang pertama
adalah produktivitas.
Lahan basah umumnya ditunjukkan dengan produktivitas biologi yang tinggi, maka ada aliran bahan
organik dalam jumlah tinggi ke sedimen.
Faktor kedua adalah hidrologi.
Pembentukan gambut terjadi di mana ada kelebihan inflow dan outflow curah hujan dan penguapan
yang lebih.
Hal ini mempertahankan air terjebak dalam tanah sebagai gambut terakumulasi.
Kondisi air yang terjebak membatasi aliran oksigen dalam sedimen, yang menghasilkan kondisi anoksik
berada di bawah antarmuka sedimen-air.
Faktor ketiga adalah kelimpahan asam organik terlarut, yang sebagian dihasilkan dari
dekomposisi, dan yang lain dari pelepasan oleh lumut dan bakteri.
Asam ini menurunkan pH dan menghambat aktivitas bakteri pengurai.
Kerogen and
Bitumen
Kerogen didefinisikan sebagai bahan organik sedimen yang tidak
larut dalam air, alkali, asam non-oksidasi, dan pelarut organik
(seperti benzena / metanol, toluen, metilen klorida).
Kerogen ini biasanya disertai dengan sebagian kecil dari fraksi
bahan organik yang terlarut, yang disebut Bitumen.
Kerogen, agregat makromolekul homogen, merupakan 90 persen
atau lebih dari bahan organik dalam batuan sedimen (sebagian
besar sisa bitumen yang terdispersi).
Kerogen merupakan bentuk karbon organik yang paling melimpah di
Bumi; kelimpahannya tiga order lebih besar daripada batubara,
minyak bumi, dan gas, dan empat order lebih banyak daripada
biomassa hidup.
Kerogen memiliki sifat menarik dan penting, yaitu setelah
pemanasan di laboratorium, dengan prosedur yang dikenal sebagai
pirolisis, kemudian rusak menghasilkan berbagai hidrokarbon sama
dengan yang ditemukan dalam minyak bumi alami.
Namun, potensi kerogen sebagai minyak bumi sangat bervariasi.
Kerogen yang kaya akan senyawa alifatik, yang umumnya berasal dari
ganggang perairan dan laut, memiliki potensi minyak yang baik dan
disebut kerogen sapropelik.
Kerogen terutama yang berasal dari sisa-sisa tanaman tingkat tinggi
kaya senyawa aromatik, kadang-kadang disebut kerogen humat,
memiliki potensi minyak bumi yang buruk.
Karbon dan hidrogen adalah unsur utama dari kerogen. Konsentrasi
Hidrogen berkisar dari 5 sampai 18% (atom), tergantung jenis dan
tingkat konsentrasi evolution.
Oxygen biasanya berkisar 0,25-3%, sekali lagi tergantung pada jenis
dan tingkat evolusi.
Selain C, H, dan O, kerogen biasanya mengandung N 1-3% dan S 0,251,5% (meskipun yang terakhir dapat lebih tinggi).
Berbagai logam runut, terutama V dan Ni, juga ditemukan di kerogen.
Bitumen
Batu bara
Sapropelik
Humik
Evolusi batubara