BIOINFORMTICA

Biologia Marinha e Biotecnologia/ESTM

3Ano

15 TP + 30 P + 6 OT

Patrcia Abrantes
patricia.abrantes@estm.ipleiria.pt
Gabinete 18
Segunda-feira: 11h00-12h00
Quinta-feira: 11h00 13h00

Programa da Unidade Curricular

1.

Bases de dados biolgicos: bases de sequncias de cidos

nuclecos e protenas. Ferramentas e bases de dados da EBI e
NCBI, entre outras.

2.

Ferramentas de anlise de sequncias e prospeco de dados.

3.

Alinhamento de sequncias, sequncias homlogas, programas

BLAST e FASTA.

4.

Identificao de motivos.

5.

Predio de genes e anotao genmica.

6.

Anlise estatstica de sequncias protecas.

Avaliao
CONTNUA

Terico-prtica 60% da nota final

teste final nota mnima superior a 9,5 valores
Prtica 40% da nota final
Participao e assiduidade s aulas 40%
Elaborao de relatrios/exerccios - 40%

Nota mnima
superior a 9,5
valores

Discusso de artigos cientficos 20%

Nota Final = 60%(Nota do Teste) + 40%(componente prtica)

Avaliao
EXAME

Terico-prtica 60% da nota final (nota mnima superior a 9,5 valores)

Prtica 40% da nota final

Avaliao escrita e oral (nota mnima superior a 9,5 valores)

Nota Final = 60% Exame + 40% Avaliao escrita e oral

Bibliografia
Lesk, A. (2005). Introduction to Bioinformatics, Oxford, Oxford
University Press.
Baxevanis, A. & Ouellette, B. (2004). Bioinformatics: A Practical
Guide to the Analysis of Genes and Proteins, 3rd edition, WileyInterscience.
Jones, N. & Pevzner, P. (2004). An Introduction to Bioinformatics
Algorithms, Cambridge, The MIT Press.
Mount, D. (2004). Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis,
2nd edition, New York, Cold Spring Harbor Laboratory Press.
Pevsner, J. (2003). Bioinformatics and Functional Genomics, John
Wiley & Sons.

Calendarizao das aulas

FEVEREIRO
I

17 20

TP N.1

II

23 27

CARNAVAL

CARNAVAL
MARO

III
IV
V
VI

26
9 13
16 20
23 27

TP N.2
TP N.3
TP N.4
TP N.5

VII
VIII
IX
X
XI

30 3
68
13 17
20 24
27 1

TP N.6
TP N.7
FRIAS
TP N.8
TP N.9

XII
XIII
XIV
XV

48
11 15
18 22
25 29

TP N.10
SEMINRIO
TP N.11
TP N.12

Aula Prtica N.1

Aula Prtica N.2
Aula Prtica N.3
Aula Prtica N.4
ABRIL
Aula Prtica N.5
Aula Prtica N.6
FRIAS
Aula Prtica N.7
Aula Prtica N.8
MAIO
Aula Prtica N.9
SEMINRIO
Aula Prtica N.10
Aula Prtica N.11
JUNHO

XVI
1 5
XVII
8 12
XVIII
15 19
Avaliao UC

TESTE
FRIAS
TP N.13

TESTE
FRIAS
Aula Prtica N.12