Ligand : Setiap bahan kimia endogen atau eksogen yang mengikat reseptor
Endogenous molecule :
Agonist: Obat-obatan yang mengikat reseptor dan memberikan respon yang sama
dengan yang ada pada ligan endogen
Antagonist : obat yang berikatan dengan reseptor tetapi tidak menyebabkan respon
First messenger : Ligan yang mengaktifkan atau menonaktifkan (menghambat)
reseptor
Secondary messenger : menyebabkan serangkaian reaksi biokimia yang dapat
mengakibatkan pelepasan obat
untuk menghasilkan utusan sekunder. Para cyclases adenilat yang perifer protein tertanam di
permukaan bagian dalam membran sel. Mereka mengkatalisis konversi ATP ke utusan sekunder
adenosine monofosfat siklik (cAMP). Adenilat siklase (AC) bertindak sebagai penguat, salah
satu diaktifkan molekul AC catalysing yang konversi sekitar 10 000 molekul ATP menjadi
cAMP. cAMP mampu mengaktifkan sejumlah protein kinase yang berbeda (Gambar. 8.11) yang
mengontrol berbagai fungsi sel, seperti
metabolisme energi dan pembelahan sel. cANP dinonaktifkan oleh phosphodiesterase, yang
mengkatalisis konversi ke adenosin monofosfat (AMP), yang inturn yang dikonversi oleh
serangkaian langkah-langkah untuk ATP. Sangat menarik untuk dicatat bahwa kedua kafein dan
teofilin menghambat phosphodiesterase.
10.
.
Pendekatan yang biasa untuk merancang obat baru untuk melakukan studi SAR
menggunakan serangkaian senyawa dengan struktur mirip dengan baik ligan
endogen atau pharmacophore nya Pendekatan ini didasarkan pada asumsi bahwa
agonis baru yang lebih mungkin efektif jika strukturnya mengandung gugus
mengikat yang sama dan memiliki beberapa kemiripan dengan ligan endogen.
Harus diingat bahwa kelompok-kelompok yang terlibat dalam mengikat ligan
endogen untuk reseptor bertanggung jawab untuk mengendalikan kedua
pengikatan ligan endogen pada reseptor dan kemudahan dari reseptor setelah
pesannya telah diterima oleh reseptor. Dengan kata lain, sifat kelompok mengikat
mengontrol lamanya waktu ligan tetap terikat reseptor. Akibatnya, menggunakan
terutama kelompok mengikat yang sama di obat memastikan bahwa ia memiliki
peluang bagus untuk memenuhi kebutuhan ini.
Sifat dari kelompok yang mengikat bukan satu-satunya faktor struktural yang
mempengaruhi aktivitas agonis. Obat juga harus dari ukuran yang benar dan
bentuk untuk mengikat dan mengaktifkan reseptor. Sekali lagi pendekatan awal
adalah dengan menggunakan struktur ligan endogen sebagai model. Dalam contoh
pertama ukuran pharmacophore obat potensial harus mendekati dengan yang ada