NAMA

NIM

: FALAH FARIKHATIN
: 15/386943/PBI/1342
MEKANISME KERJA RNA interference

RNA interference (RNAi) merupakan strategi pertahanan kuno yang dimiliki oleh
tumbuhan dan invertebrata tingkat rendah untuk melawan infeksi virus dan kerusakan
genomik akibat menyisipnya materi genetic asing. RNAi dapat menghambat ekspresi gen pada
urutan yang spesifik dengan memutus mRNA. Mekanisme kerja RNAi melibatkan suatu
intermediet aktif yang disebut small interfering RNA (siRNA). Molekul siRNA berukuran
kecil yaitu hanya 21-25 nukleotida dengan dua nukleotida pada kedua ujung tidak berpasangan
(untaian residu 3). Molekul ini dihasilkan dari hasil kerja suatu enzim Dicer, yaitu suatu
ribonuclease dengan energi ATP, yang mengenali dan memotong RNA yang membentuk
dupleks untai ganda menjadi potongan kecil fragmen untai ganda RNA. siRNA juga
dihasilkan dari suatu short hairpin RNA, yaitu untai dupleks RNA yang terbentuk dari suatu
untai tunggal yang membentuk hairpin (seperti jepit rambut, dengan lengkungan melipat pada
salah satu ujungnya) yang juga dipotong oleh Dicer. Oleh enzim helicase, siRNA akan dibuka
ikatan hidrogennya sehingga untai antisense dari siRNA yang terbebas dapat bergabung
dengan protein membentuk suatu kompleks protein - RNA-induced silencing complex (RISC).
Kompleks tersebut akan mengaktifkan RISC yang semula inaktif, dan kemudian bekerja
memutus mRNA pada bagian yang mengandung urutan homolog dengan siRNA.
Mekanisme kerja RNAi:
1. Enzim RNAse-III memotong untaian panjang dsRNA (long dsRNA) melalui mekanisme
Dicer menjadi fragmen-fragmen kecil yang panjangnya sekitar 19-23 nukleotida dengan 24 nukleotida overhang pada ujung 3. Fragmen-fragmen kecil hasil potongan (small
interfering RNA-siRNA) akan memicu terjadinya RNAi pada sel target. ATP tidak
diperlukan untuk proses pemotongan dsRNA oleh RNAse-III namun oleh aktivitas enzim
nuclease.
2. Komplek protein RISC (RNA-induced silencing complex) akan berikatan dengan beberapa
fragmen siRNA, kemudian ikatan tersebut akan memandu mengenal mRNA yang berisi
sekuen homolog, selanjutnya kedua sekuen ini akan berkomplemen. Kemudian, enzim
nuklease yang ada pada komplek RISC akan mendegradasi mRNA.

3. Ekspresi gen secara spesifik menjadi inaktif setelah mRNA terdegradas, kemudian masuk
pada tahap post-transkripsi. Inaktifnya ekspresi gen ini dapat bersifat permanen ataupun
transien.