SOAL BIOMED

1. Untuk
membuktikan
proses
ekstraksi . . . hingga proses . . . . . target
dari suatu sampel berjalan dengan baik
menggunakan . . . . .
a. Kontrol positif
b. Kontrol DNA marker
c. Kontrol amplifikasi
d. Kontrol . . .
e. Kontrol buffer TAE
2. Untuk menghitung jumlah sel punca
dalam sampel sumsum tulang dapat
menggunakan alat :
a. Thermal cycle
b. Gel . . .
c. UV . . .
d. ELISA marker
e. Flow cytometer
3. Ratio 260/280 yang menunjukkan
bahwa sampel DNA kita kemungkinan
tercemar protein :
a. 1,7
b. 1,8
c. 1,9
d. 2,0
e. 2,1
4. Dalam 1 mikro molar primer PCR yang
memiliki panjang 30 bp terdapat
a. 6,022 x 1014 kopi primer
b. 6,022 x 1019 kopi primer
c. 6,022 x 1020 kopi primer
d. 6,022 x 1023 kopi primer
e. 6,022 x 1026 kopi primer
5. Salah satu penyebab reaksi positif palsu
PCR konvensional :
a. Suhu annealing terlalu tinggi
b. Fase denaturasi terlalu lama
c. Siklus PCR terlalau sedikit
d. Pasangan
primer
saling
melakukan hibridisasi
e. Terdapat struktur sekunder pada
asam nukleat target
6. Bahan di bawah ini tidak boleh ada
dalam ruangan untuk ekstraksi DNA :
a. Spesimers klinis
b. Buffer TAE
c. DEPC
d. Isopropanol
e. DNase
7. Yang terjadi pada fase denaturasi PCR
konvensional :
a. Penambahan
produk
PCR
secara eksperimental

8.

9.

10.

11.

12.

b. Enzim
polymerase
DNA
mengkopi cetakan DNA
c. Hibridisasi primer pada sekuens
komplementernya
d. Pemisahan untai ganda DNA
menjadi untai tunggal
e. Terjadi pemanjangan untai
DNA
Pada Real-Time PCR penghitungan
konsentrasi awal target dilakukan
berdasarkan data yang dilakukan pada
fase :
a. Awal
b. Denaturasi
c. Eksperimental
d. Annealing
e. Plateau
Penyebab RNA mudah rusak
a. Adanya gugus OH pada
pentose ribose atom C no. 2
dan 3
b. Adanya 3 gugus fosfat pada
pentosa ribose atom C no. 4
c. Adanya urasil pada basa
pirimidinnya
d. Adanya gugus CH3 pada basa
pirimidinnya
e. Adanya gugus fosfat yang
berikatan pada karbon 5
Bahan dibawah ini dapat digunakan
untuk mempresipitasi asam nukleat :
a. EtoH
b. MgCl2
c. TE
d. MEq
e. NaCl
Suatu plasmid DNA dengan panjang
5000bp dimasukkan ke dalam tabung
mikrosentifus bersama dengan enzim
EcoRI yang akan memotong DNA
tersebut di posisi no. 500 dan 2000.
Setelah ditambahkan buffer untuk
EcoRI dan diinkubasi selama beberapa
waktu, pada visualisasi DNA fragmen
terpendek berukuran
a. 500 bp
b. 1000 bp
c. 1500 bp
d. 2000 bp
e. 2500 bp
Suatu plasmid DNA dengan panjang
5000bp dimasukkan ke dalam tabung
mikrosentifus bersama dengan enzim
Page 1 of 5

EcoRI yang akan memotong DNA

tersebut di posisi no. 500 dan 2000.
Setelah ditambahkan buffer untuk
EcoRI dan diinkubasi selama beberapa
waktu, pada visualisasi DNA akan
terdapat
a. 1 pita
b. 2 pita
c. 3 pita
d. 4 pita
e. 5 pita
13. Bahan dibawah ini dibutuhkan untuk
menghilangkan RNase :
a. PBS
b. IPTG
c. SDS
d. PEG
e. DEPC
14. Cara menyimpan DNA agar dapat
disimpan lebih dari 20 tahun :
a. Dalam TE
b. Dalam etanol
c. Dalam air bebas DNase
d. Dalam bentuk kering
e. Dalam larutan formalin

18.

19.

20.

Soal no. 15 16
Dalam lemari bahan kimia terdapat
bahan-bahan sebagai berikut :
Larutan A 1 M
Larutan B 5 %
Larutan C 10X
ddw
15. Jika kita akan membuat buffer sebanyak
50 ml yang mengandung 200 mM
larutan A, 0,6 % larutan B, dan 1x
larutan C, maka larutan 10x yang
dibutuhkan sebanyak :
a. 1 ml
b. 5 ml
c. 10 ml
d. 15 ml
e. 20 ml
16. Larutan ddw yang dibutuhkan . . .
a. 29 ml
b. 39 ml
c. 40 ml
d. 44 ml
e. 45 ml
17. Kegiatan di bawah ini dapat dilakukan
di ruangan bersih untuk PCR :
a. Memasukkan DNA kedalam
tabung PCR

21.

22.

b. Memasukkan
primer
ke
dalam tabung PCR
c. Memasukkan sampel ke dalam
tabung PCR
d. Memasukkan produk PCR ke
dalam tabung PCR
e. Memsaukkan plasmid ke dalam
tabung PCR
Yang paling ideal untuk membersihkan
meja laboratorium dari kontaminan
aerosol di ruangan bersih untuk PCR
adalah
a. mEq water
b. Bayclean
c. Fenol
d. HCl
e. Detergen
Bahan dibawah ini tidak boleh berada di
dalam ruangan bersih untuk PCR :
a. PCR tube
b. Bolpoin
c. Amplikon
d. Primer
e. mEq water
Alat di bawah ini dibutuhkan untuk
sintesis cDNA :
a. Vortex
b. Flow cytometer
c. LN linker
d. Incubator shaker
e. Thermal cycler
Jika panjang template A 5000bp, primer
forward merupakan komplementer basa
no. 500 621 dan primer backward
merupakan komplementer basa no. 2026
2000, maka ukuran produk PCR-nya
sebesar :
a. 1379 bp
b. 1380 bp
c. 1405 bp
d. 1526 bp
e. 1527 bp
Elektroforesis gel DNA
a. DNA yang berikatan dengan
Etibr akan berwarna merahorange
b. Plasmid DNA superkoil akan
bergerak
lebih
lentur
dibandingkan DNA linier
c. Elektroforesis menggunakan gel
agarose 0,5 % tegangan 100v
selama 30 menit digunakan

Page 2 of 5

23.

24.

25.

26.

27.

untuk memisahkan fragmen

DNA berukuran 100 200 bp
d. DNA bergerak dari kutub
negative ke kutub positif
e. Kecepatan pergerakan DNA
berbanding terbalik dengan
tegangan yang digunakan
Tahap dibawah ini harus menggunakan
filter Hp5 :
a. Memasukkan RNA ke dalam
tabung PCR
b. Memasukkan EtBr ke dalam
buffer TAE
c. Memasukkan presipitat DNA ke
dalam tabung 1,5 ml sentrifus
d. Memasukkan DNA marker ke
dalam sumuran agarose
e. Memasukkan loading dye ke
dalam sumuran agarose
Bahan kimia di bawah ini digunakan
untuk membersihkan asam dari sisa
fenol dan garam :
a. mEq water
b. TE
c. PBS
d. TAE
e. Etanol
Sifat umum enzim taq polymerase DNA
adalah sebagai berikut ;
a. Memiliki
aktivitas
endonuklease
b. Membutuhkan konsentrasi 100
200 nM per reaksi
c. Membutuhkan
penyimpanan
dalam suhu kamar
d. Membutuhkan suhu 64 72o
C untuk bekerja secara
optimum
e. Bertugas mengawali reaksi PCR
Pasangan primer PCR yang baik
biasanya memenuhi criteria sbg berikut
a. Panjangnya 10 nukleotida
b. Memiliki struktur sekunder
c. Perbedaan suhu hibridisasi 10
derajat celcius
d. Memiliki daerah yang saling
berkomplementari
e. Kandungan GC nya sekitar
50 %
Untuk meningkatkan sensitivitas dan
spesifisitas PCR dapat dilakukan dengan
cara :
a. Melakukan PCR nested

28.

29.

30.

31.

32.

b. Melakukan PCR multiplek

c. Melakukan PCR degenerasi
d. Melakukan PCR kompetitif
e. Melakukan PCR 2 langkah
Kegiatan di bawah ini dapat dilakukan
di ruangan bersih untuk PCR :
a. Mengekstraksi
DNA
dari
specimen klinis
b. Memasukkan
primer
ke
dalam tabung PCR
c. Memasukkan template ke dalam
tabung PCR
d. Mengambil produk PCR dari
tabung PCR
e. Menambahkan
enzim
endonuklease restriksi ke dalam
tabung yang berisi plasmid
Penentu terpenting aktivitas enzim
endonuklease restriksi
a. Kandungan TRIS
b. Kandungan MgCl2
c. Kaandungan NaCl
d. Kandungan DTT
e. Kandungan BSA
Elektroforesis gel DNA
a. DNA yang berikatan dengan
Etbr akan berwarna merahorange
b. DNA superkoil akan bergerak
lebih lambat dibandingkan
DNA linier
c. Gel agarose digunakan untuk
memisahkan fragmen DNA <
100 bp
d. DNA bergerak dari kutub
positive ke kutub negative
e. Kecepatan pergerakan DNA
berbanding lurus dengan
tegangan yang digunakan
Bahan dibawah ini dapat digunakan
untuk mempresipitasi asam nukleat :
a. EDTA
b. MgCl2
c. TE
d. Isopropanol
e. HCl
Di bawah ini tidak termasuk detergen
yang dapat digunakan untuk ekstraksi
DNA :
a. Tween
b. PBS
c. Nonideth
d. Triton
e. Laureth
Page 3 of 5

33. Cara menyimpan DNA agar dapat

disimpan lebih dari 10 tahun :
a. Dilarutkan dalam TE, disimpan
dalam suhu kamar
b. Dalam
bentuk
kering,
disimpan dalam suhu kamar
c. Dilarutkan
dalam
etanol,
disimpan dalam suhu kamar
d. Dilarutkan dalam air bebas
DNase, disimpan dalam suhu
kamar
e. Tetap dalam specimen klinis,
disimpan dalam suhu kamar
34. Bahan di bawah ini tidak boleh ada
dalam ruangan untuk ekstraksi RNA :
a. Spesimers klinis
b. Buffer TAE
c. DEPC
d. RNase
e. etanol
35. Ratio 260/280 yang menunjukkan
bahwa sampel DNA kita kemungkinan
tercemar RNA :
a. 1,6
b. 1,7
c. 1,8
d. 1,9
e. 2,0
36. Enzim endonuklease restriksi
a. Dapat menyambung 2 untai
ganda DNA
b. Dapat
digunakan
untuk
mengamplikasi cetakan DNA
c. Umumnya
membutuhkan
o
suhu 37 C untuk bekerja
secara optimum
d. akan memotong nukleotida
paling luar dari suatu sekuens
DNA
e. Jika tertulis satu unit per uL,
berarti untuk 1 ug DNA
referensi dalam 1 jam pada suhu
37o C hanya membutuhkan 1 ml
enzim
37. Pada Real time PCR, analisis produk
PCR dilakukan pada fase
a. Awal
b. Denaturasi
c. Eksponensial
d. Annealing
e. Plateau

38. Untuk menganalisis perubahan yang

terjadi pada membrane sel dapat
menggunakan alat sebagai berikut :
a. Thermal cycler
b. Gel doc
c. UV linker
d. ELISA reader
e. Flow Cytometer
39. Template untuk PCR sebaiknya
a. Mengandung DNA binding
protein
b. Berupa RNA
c. Memiliki aktivitas eksonuklease
d. Memiliki kandungan MgCl2
yang sangat tinggi
e. Memiliki konsentrasi yang tidak
terlalu tinggi, namun masih
dalam ambang batas deteksi
40. Salah satu kemungkinan penyebab
reaksi negatif palsu PCR :
a. Suhu annealing terlalu rendah
b. Adanya kontaminasi produk
PCR
c. Siklus PCR terlalau banyak
d. Primer
yang
digunakan
berhibridisasi pada lebih dari
satu tempat dalam DNA target
e. Struktur sekunder pada asam
nukleat target
41. Yang terjadi pada fase elongasi PCR
konvensional :
a. Penambahan
produk
PCR
secara eksponensial
b. Enzim
polymerase
DNA
mengkopi cetakan DNA
c. Hibridisasi primer pada sekuens
komplementernya
d. Pemisahan untai ganda DNA
menjadi untai tunggal
e. Pelepasan primer dari sekuens
komplementernya
42. Dalam 1 mol suatu senyawa terdapat
a. 6,022 x 1020 kopi primer
b. 6,022 x 1021 kopi primer
c. 6,022 x 1022 kopi primer
d. 6,022 x 1023 kopi primer
e. 6,022 x 1024 kopi primer
43. Penyebab RNA sangat labil
a. Adanya gugus OH pada
pentose ribose atom C no. 2
dan 3
b. Adanya 3 gugus fosfat pada
pentosa ribose atom C no. 4
Page 4 of 5

c. Adanya urasil pada basa

pirimidinnya
d. Adanya gugus CH3 pada basa
pirimidinnya
e. Adanya gugus fosfat yang
berikatan pada karbon 5
44. Suatu DNA linier dengan panjang
1000bp dimasukkan ke dalam tabung
mikrosentifus bersama dengan enzim
EcoRI yang akan memotong DNA
tersebut di posisi no. 500 dan 200.
Setelah ditambahkan buffer untuk
EcoRI dan diinkubasi selama beberapa
waktu, pada visualisasi DNA akan
terdapat
a. 1 pita

b. 2 pita
c. 3 pita
d. 4 pita
e. 5 pita
45. Jika panjang template A 3500bp, primer
forward
(sense)
merupakan
komplementer basa no. 600 621 dan
primer
backward
(anti-sense)
merupakan komplementer basa no. 1626
1600, maka ukuran produk PCR-nya
sebesar :
a. 1000 bp
b. 1001 bp
c. 1006 bp
d. 1027 bp
e. 1028 bp

Page 5 of 5