Nama : Muntaufiqoh

NIM

: 4311413058

Prodi : Kimia
Rombel: 2/ 2013
Tugas Kimia Komputasi
Bab 2
1. Untuk menentukan perhitungan sifat-sifat molekul air dengan menggunakan
perangkat lunak Hypercamp
a. Metode kimia yang cocok untuk perhitungan sifat-sifat molekul air dengan
menggunakan perangkat lunak Hypercamp adalah metoe mekanik molekuler.
Karena metode ini dapat digunakan untuk menghasilkan struktur molekul 3D,
dengan pilihan 4 metode mekanika molekul, teknik optimasi geometri untuk
mendapatkan struktur stabil, dan mteknik dinamika molekular untuk
mendapatkan pencarain konformasi dan menginvestigasi perubahan struktur.
Metode semiempirik digunakan untuk senyawa organik dan senyawa ugus utama,
untuk senyawa transisi, dan untuk simulasi spektra sehingga kurang tepat untuk
perhitungan sifat-sifat molekular air.
Metode ab initio digunakan untuk fungsi basis ekstra (s, p, d, sp, spd) dapat
ditambahkan ke atom-atom tanpa data eksperimen.
b. Parameter perhitungan yang harus dimasukkan sebagai input Hypercamp adalah
perhitungan energi konformasi, struktur yang mendekati realitas untuk
perhitungan dengan metode kimia kuantum, kebolehjadian efek sterik, panjang
ikatan, momen dipol, energi molekul, sudut torsi dan sudut ikatan.
2. Menganalisis suatu senyawa organik sederhana. Data yang ingin didapatkan adalah
muatan atom, momen dipol, dan energi total sistem. Pernyataan:
a. Metode mekanika molekul dapat digunakan untuk maksud tersebut adalah
pernyataan yang salah, karena metode ini digunakan untuk molekul bukan
organik.
b. Metode semiempiris merupakan metode yang tepat adalah pernyataan yang benar,
karena metode ini digunakan untuk senyawa organik dan senyawa gugus utama,
untuk senyawa transisi dan simulsi spektra. Dari perhitungan dapat diketahui
fungsi gelombang elektronik yang baik sehingga sifat elektronik seperti momen
dipol dan muatan atom dapat diketahui.
c. Metode ab initio memerlukan waktu yang terlalu lama adalah pernyataan yang
benar, karena metode ini menyelesaikan semua persamaan secara eksak dan
semua elektron yang ada diperhitungkan.
3. Bedasarkan persamaan Schrodinger dari operator Hamilton yang berkaitan dengan
energi suatu molekul secara umum
a. Suku pertama merupakan energi total dalam model Born Oppenheimer
Suku kedua menyatakan interaksi elektrostatik antara elektron dan inti
Suku ketiga menyatakan tolakan elektrostatik antar elektron
Suku keempat menyatakan enrgi kinetik inti

Suku kelima merupakan energi kinetik elektron

b. Jika menggunakan pendekatan Born-Oppenheimer suku pertama dan keempat
dianggap tetap karena pendekatan ini diterapkan dengan pemisahan fungsi
gelombang untuk inti dan elektron. Fakta yang mendasari adalah elektron yang
begitu ringan relatif terhadap inti sehingga gerakan elektron mudah mengikuti
gerakan inti.
4. Pengguanan metode mekanika molekul dalam menentukan pelaksanaan docking obat
dengan suau reseptor adalah dengan menghasilkan peta potensial elektrostatk yang
dapat memberikan gambaran trayektori dalam penerapannya.
5. Metode semiempiris dapat dioptimasikan untuk keperluan yang berbeda. Metode
MNDO, AMI, dan PM3 dirancang untuk memproduksi panas pembentukan dan
struktur dari sejumlah besar molekul organik. Metode semiempiris yang lain
dioptimasikhusus untuk spektroskopi misalnya INDO,ZINDO, ata CNDO yang
melibatkan perhitungan CI dan cukup baik dalam memprediksi keadaan transisi
elektronik dalam daerah spektra UV-Vis.