--title: "proteine&pib_europe"

author: "Zoghlami Alaeddine"

date: "15 avril 2016"
output: html_document
--Pour les 9 premires variables c'est la consommation de proteine en gramme par
habitant par jour.
PIBH : c'est le Produit intrieur brut par habitant en mille dollar.
VR:viande rouge , VB : viande blance , Frt.Lgm :fruits & lgumes
J'ai choisi ce jeu de donnes pour montrer que le niveau de consommation des protin
es animales ou vgetales est li au niveau de revenu des pays (en Europe)
```{r}
x=read.table("C:/Users/Aladdin/Desktop/PROT.csv",header=T,row.names=1,sep=";")
head(x)
```

on explore un peu ce jeu de donnes :

```{r}
(summary(x))
```

1-Importance des composantes :

On voit que les 4 premires composantes expliquent 84 % de l inertie totale.

```{r}
library(factoextra)
```
```{r}
library(FactoMineR)
```
```{r}
res.pca=PCA(x,scale.unit=T, graph=F)
fviz_screeplot(res.pca)
```
```{r}
res.pca$eig
```

Les valeurs propres associes aux 3 premires composantes sont suprieurs 1 ce qui m amne
retenir les 3 premiers axes avec 74% d inertie explique.

REPRESENTATION DES INDIVIDUS

plan factoriel(1,2)
```{r}
fviz_pca_ind(res.pca, geom = "text", col.ind="cos2")+scale_color_gradient2(low =
"grey", mid = "orange", high = "blue", midpoint = 0.55) + theme_minimal()
```
REPRESENTATION DES VARIABLES
```{r}
fviz_pca_var(res.pca, col.var = "cos2")+scale_color_gradient2(low = "grey", mid
= "orange", high = "blue", midpoint = 0.55) + theme_minimal()
```
***Les variables bien reprsentes sont celles qui sont proches du cercle :
celles qui sont proches de l origine sont mal reprsentes.
```{r}
fviz_pca_biplot(res.pca,col.var="cos2")+scale_color_gradient2(low = "grey", mi
d = "orange", high = "blue", midpoint = 0.55) + theme_minimal()
```
****L axe 1 oppose les pays ayant une forte
consommation de protines animales comme l Irlande aux pays qui
consomment plutt des noix, graines et crales
****** L axe 2 caractrise les pays
consommant beaucoup de poisson

****
interprtation du graph d individus (villes) :
La projection
des individus sur
le premier plan
principal
. On
pourra diviser les
villes en 3
groupes:
Le premier groupe: situ dans le quadrant gauche du graph au dessus de
l axe1, constitu principalement par les pays de l Ouest de l'europe , telles
que les villes portugal , espagne caractris par un Produit intrieur brut(par habit
ant) moyen par rapport l'europe
Le second groupe : situ dans le la partie gauche au dessus de l axe 1,

contenant les pays Albanie,Bulgarie,Yougoslavie et Romanie, ce sont les pays

des balkans qui presentet un PIB faible par habitant par rapport aux autres pay
s de l'Europe ayant une importante
consommation de graines (source de protines vgetales )
Enfin le troisime, situ dans la partie droite ,
comporte les pays avec un PIB/habitant important comme l'Allemagne , France et
les pays nordiques , on constate que ces pays ont une forte consommation de pro
tines animales.

contribution des individus aux deux premiers axes factoriels. interpretation sui
vant les individus

```{r}
contind1=(1/nrow(x))*((res.pca$scores[,1]/res.pca$sdev[1])^2)
contind1=contind1[which(contind1>(1/nrow(x)))]
contind1
```
```{r}
contv1=(loadings(res.pca)[,1])^2
contv1=contv1[which(contv1>(1/ncol(x)))]
contv1
```
```{r}
fviz_pca_contrib(res.pca, choice = "var", axes = 1)
```
```{r}
contind2=(1/nrow(x))*((res.pca$scores[,2]/res.pca$sdev[2])^2)
contind2=contind2[which(contind2>(1/nrow(x)))]
contind2
```
```{r}
fviz_pca_contrib(res.pca, choice = "var", axes = 2)

```

info utile (hors acp):

Le Portugal, c est la Mditerrane dans l assiette.
Le Portugal est un pays pauvre au sein de l Union Europenne. Son revenu par habitan
t est trois fois infrieur celui de la France, mais la surface cultive par habitant
y est gale.
Le modle est base de tubercules (pomme de terre) et de crale. Le poisson et les lgum
es secs apportent les protines. La consommation de fruits et lgumes et la cuisine
faite l huile d olive sont satisfaisantes pour la sant. Voil un bon modle pour les nutr
itionnistes.
Traditionnellement, le plat national est le Bacalhau (morue sche), mais le Portuga
l a su diversifier sa consommation.
l Par exemple, le rendement d une culture dpend de la fertilisation, du climat,
etc. Dans ce cas, le calcul des composantes principales se fera sans la variable
rendement