1

COVER

KATA PENGANTAR

Segala puji bagi Tuhan YME atas segala rahmat-Nya yang dilimpahkan sehingga
buku ini dapat diselesaikan. Selain itu, terima kasih kami ucapkan kepada Ibu Asri
Peni Wulandari Ph.D yang telah memberikan arahan kepada kami dalam proses
diskusi tutorial.
Buku ini disusun untuk menambah pengetahuan dalam bidang Biologi mengenai
system sel, khususnya tentang organel dalam sel. Selain itu buku ini diajukan untuk
memenuhi tugas mata kuliah Biologi Kedokran, Fakultas Kedokteran Gigi
Universitas Padjadjaran.
Penulis menyadari bahwa buku ini masih memiliki kekurangan. Penulis
mengharapkan masukan yang dapat memperbaiki tulisan ini. Namun demikian,
penulis berharap makalah ini dapat bermanfaat bagi pembaca dan masyarakat.

Sumedang, 18 Mei 2015

Penulis (Kelas A )

DAFTAR ISI

Table of Contents
MEMBRAN PLASMA.................................................................................................1
DINDING SEL..............................................................................................................9
Fungsi Dinding Sel...............................................................................................9
Struktur Dinding Sel.........................................................................................13
NUKLEOLUS.............................................................................................................16
DNA
.1

(DEOKSIRIBONUKLEAT)........................................................................24
Fungsi biologi...................................................................................................25

Penggunaan DNA Dalam Teknologi...........................................................................28

.1

Kerusakan DNA...............................................................................................31

MITOKONDRIA.........................................................................................................32
2.1. Membran Luar...........................................................................................35
2.2. Membran Dalam.........................................................................................35
2.3. Ruang Antar Membran..............................................................................36
2.4. Matriks........................................................................................................36
KLOROPLAS..............................................................................................................40
1.

Membran Luar kloroplas...........................................................................43

2.

Ruang Antar Membran..............................................................................43

3.

Membran Dalam Kloroplas.......................................................................43

4.

Stroma.......................................................................................................44

5.

Grana.........................................................................................................44

RETIKULUM ENDOPLASMA.................................................................................46
Jenis-jenis Retikulum Endoplasma......................................................................47
1.

RE kasar....................................................................................................47

2.

RE halus...................................................................................................48

3.

RE sarkoplasmik.......................................................................................48

_Toc419919397
Fungsi Retikulum Endoplasma............................................................................48
RETIKULUM ENDOPLASMA HALUS................................................................50
1.

Sintesis Karbohidrat dan Lipid.....................................................................52

2.

Transportasi Protein.......................................................................................52

3.

Detoksifikasi....................................................................................................52

4.

Fungsi penting lainnya...................................................................................53

RIBOSOM...............................................................................................................56
VAKUOLA..................................................................................................................62
APPARATUS GOLGI.................................................................................................67
LISOSOM....................................................................................................................75
MIKROBODI..............................................................................................................89
1.1 Pengertian......................................................................................................89
1.3.1 Peroksisom..................................................................................................90
1.4 Fungsi Mikrobodi..........................................................................................92
SITOSKELETON........................................................................................................94
Pengertian Sitoskeleton.....................................................................................94
SENTRIOL................................................................................................................103
CILLIA DAN FLAGELLA.......................................................................................107
Perbedaan struktur Flagela Prokariotik dan Eukariotik.........................................108
DAFTAR PUSTAKA.................................................................................................116
LAMPIRAN..............................................................................................................118

MEMBRAN PLASMA

MEMBRAN SEL

Membran sel adalah membran yang dimiliki oleh semua jenis sel yang berupa
lapisan yang disebut membran plasma yang memisahkan sel dengan lingkungan di
luar sel. Fungsinya adalah untuk melindungi inti sel dan sistem kelangsungan hidup
yang bekerja di dalam sitoplasma.
1. Fungsi Membran Sel
Membran sel menjaga komponen-komponen sel tetap terisolasi dari
lingkungan luar. Membran sel mengelilingi sitoplasma sel hidup, secara fisik
memisahkan komponen intraseluler dari lingkungan ekstraseluler. Jamur, bakteri, dan
tumbuhan juga memiliki dinding sel yang menyediakan dukungan mekanik untuk sel
dan menghalang bagian dari molekul-molekul yang lebih besar. Membran sel juga
berperan dalam penahan sitoskeleton yang memberikan bentuk sel dan membantu selsel untuk membentuk jaringan. Protein yang ada pada membran sel dapat berfungsi
sebagai enzim.
Membran sel juga berfungsi sebagai media komunikasi antara sel dengan
lingkungan. Membran sel bersifat selektif permeabel dan mampu mengatur apa yang
masuk dan keluar sel, sehingga memudahkan pengangkutan bahan-bahan yang
diperlukan untuk bertahan hidup. Gerakan zat di membran sel dapat menjadi pasif

dan menjadi aktif ketika terdapat energi. Membran juga mempertahankan sel yang
potensial. Membran sel bekerja seperti filter yang mencegah virus masuk ke dalam
sel.
2. Struktur Membran Sel
Bahan penyusun utama membran adalah lipid dan protein.Terdapat dua populasi
utama protein membran. Protein integral umumnya merupakan protein transmembran
dengan daerah hidrofobik yang seluruhnya membentang sepanjang interior hidrofobik
membran tersebut. Daerah hidrofobik protein integral terdiri atas satu atau lebih
rentangan asam amino nonpolar yang biasanya bergulung menjadi heliks-. Ujung
hidrofilik molekul ini dipaparkan ke larutan aqueous pada kedua sisi membrane.
Protein peripheral tidak tertanam dalam lipid bilayer. Protein ini terikat secara
longgar pada permukaan membrane atau pada bagian protein integral yang terpapar.
Komponen penyusun membran sel antara lain adalah fosfolipid, protein,
oligosakarida, glikolipid, dan kolesterol.
2.1. Model Mosaik Fluida
Pada tahun 1972, Seymour Jonathan Singer dan Garth Nicholson
mengemukakan model mosaik fluida yang disusun berdasarkan hukum-hukum
termodinamika untuk menjelaskan struktur membran sel. Pada model ini, protein
penyusun membran dijabarkan sebagai sekelompok molekul globular heterogenus
yang tersusun dalam struktur amfipatik, yaitu dengan gugus ionik dan polar
menghadap ke fase akuatik, dan gugus non-polar menghadap ke dalam interior
membran yang disebut matriks fosfolipid dan bersifat hidrofobik. Himpunanhimpunan molekul globular tersebut terbenam sebagian ke dalam matriks fosfolipid
tersebut. Struktur membran teratur membentuk lapisan ganda fluida yang diskontinu,
dan sebagian kecil dari matriks fosfolipid berinteraksi dengan molekul globular

tersebut sehinggal struktur mosaik fluida merupakan analogi lipoprotein atau protein
integral di dalam larutan membran ganda fosfolipid.
2.2. Lapisan Ganda Fosfolipid
Umumnya, membran sel memiliki bagian kepala polar hidrofilik dengan daya
ikat gliserofosforilester yang terdiri dari gliserol, fosfat, dan gugus tambahan seperti
kolina, serina, dll; dengan dua rantai hidrofobik asam lemak yang membentuk ikatan
ester. Pada rantai primer, ditempati oleh asam lemak jenuh dan pada rantai sekunder
ditempati oleh asam lemak tak jenuh. Bagian kepala dapat berinteraksi dengan air
maupun larutan fase akuatik, sedangkan bagian rantai akan berhimpit membentuk
matriks fosfolipid yang disebut fase internal. Antara fase internal dan fase akuatik
terjadi tegangan potensial antara 220-280 mV yang disebut tegangan potensial dipol,
atau potensial membran.
Penamaan dan sifat bagian kepala fosfolipid bergantung pada jenis gugus tambahan
yang dimilikinya, antara lain terdapat sebutan fosfokolina (pc), fosfoetanolamina
(pe), fosfoserina (ps), dan fosfoinositol (pi); dan masing-masing nama senyawa
fosfolipid terkait yang terbentuk pada membran sel adalah fosfatidil kolina, fosfatidil
etanolamina, fosfatidil serina, dan fosfatidil inositol. Membran juga dapat terbentuk
dari senyawa lipid seperti sfingomielin, sardiolipin, atau ikatan dengan senyawa
kolesterol, dan glikolipida.
2.3. Protein integral membran
Protein integral memiliki domain membentang di luar sel dan di sitoplasma.
Protein intregral juga berfungsi untuk memasukkan zat-zat yang ukurannya lebih
besar.
2.4. Protein Transmembran

Protein ini terintegrasi pada lapisan lipid dan menembus 2 lapisan lipid /
transmembran. Bersifat amfipatik, mempunyai sekuen helix protein, hidrofobik,
menembus lapisan lipida, dan untaian asam amino hidrofilik. Banyak diantaranya
merupakan glikoprotein, gugus gula pada sebelah luar sel. Di sintesis di RE, gula
dimodifikasi di badan golgi.
2.5. Kerangka Membran
Kerangka membran atau disebut juga sitoskeleton mempunyai tiga macam
jenis yaitu mikrotubulus, mikrofilamen, dan filamen intermediet.
3. Komposisi Kimia Membran Sel
Membran sel terdiri dari berbagai molekul, terutama lipid (lemak) dan protein yang
diikat oleh ikatan nonkovalen. Molekul tersebut masuk dan keluar melalui beberapa
mekanisme.

3.1. Lipid
Lipid pada membran tersusun atas fosfolipid (lemak yang bersenyawa dengan
fosfat). Struktur lapisan ganda lipid menjelaskan fungsinya sebagai penghalang. Lipid
adalah lemak, seperti minyak, yang larut dalam air. Ada dua wilayah penting dari
lipid yang menyediakan struktur lapisan ganda lipid. Setiap molekul lipid berisi
daerah hidrofilik, juga disebut kepala daerah kutub, dan hidrofobik, atau daerah ekor
nonpolar.
Fosfolipid merupakan suatu molekul amfipatik yang berarti bahwa molekul ini
memiliki daerah hidrofilik maupun daerah hidrofobik. Daerah hidrofilik tertarik pada
kondisi air berair sementara wilayah hidrofobik ditolak dari kondisi seperti itu.
Karena molekul lemak mengandung daerah baik polar dan nonpolar, mereka disebut

molekul amphipathic. Molekul lipid paling banyak ditemukan di membran sel

fosfolipid. Kelompok kepala molekul fosfolipid polar mengandung gugus fosfat.
3.2. Karbohidrat
Membran plasma juga mengandung karbohidrat terutama gilikoprotein, tetapi
denan beberapa gilikolipid. Untuk sebagian besar, gilikosilasi tidak terjadi pada
membran dalam sel, bukan juga terjadi pada permukaan ekstraseluler membran
plasma. Sebagian besar karbohidrat berikatan kovalen dengan protein dan
membentuk gilikoprotein.
Pengenalan sel dilakukan dengan cara memberi kunci pada molekul permukaan.
Molekul tersebut seringkali berupa karbohidrat pada membrane plasma. Karbohidrat
membran biasanya berupa oligosakarida bercabang dengan kurang dari 15 satuan
gula. Beberapa oligosakarida secara kovalen terikat dengan lipid dan membentuk
glikolipid. Sebagian besar oligosakarida terikat secara kovalen dengan protein dan
disebut glikoprotein.
3.3. Protein
Membran sel memiliki sebagian besar terdiri dari protein, biasanya sekitar
50% dari volume membran. Protein penting untuk sel karena mereka bertanggung
jawab untuk berbagai kegiatan biologis.
Membran sel yang terhubung dengan lingkungan ekstraseluler, adalah lapisan yang
penting untuk menghubungkan antar sel. Dengan demikian, berbagai macam protein
seperti antigen, terdapat pada permukaan membran. Fungsi protein dalam membran
sel adalah untuk memanggil sitoskeleton, mengatur aktivitas enzim, dan
pengangkutan zat di dalam membran.

Kebanyakan protein masuk ke dalam membran dalam beberapa cara. N-terminus

asam amino mengarahkan protein menuju endoplasma, yang menyisipkan protein ke
lipid bilayer. Setelah disisipkan, protein kemudian diangkut ke vesikula.
4. Macam-Macam Membran Sel
Membran sel dapat dibedakan berdasarkan perbedaan komposisi lipid dan
protein. Berikut adalah macam-macam membran sel:
Sarkolema yang terdapat di dalam sel otot (miosit)
Oolema yang terdapat di dalam oosit
Aksolema yang terdapat di dalam akson
Secara historis, membran plasma juga dirujuk sebagai plasmalemma.
5. Sistem Transpor Membran
Salah satu fungsi dari membran sel adalah sebagai lalu lintas molekul dan ion
secara dua arah. Molekul yang dapat melewati membran sel antara lain ialah molekul
hidrofobik (CO2, O2), dan molekul polar yang sangat kecil (air, etanol). Sementara itu,
molekul lainnya seperti molekul polar dengan ukuran besar (glukosa), ion, dan
substansi hidrofilik membutuhkan mekanisme khusus agar dapat masuk ke dalam sel.
5.1. Transpor Pasif
Transpor pasif merupakan suatu perpindahan molekul menuruni gradien
konsentrasinya. Transpor pasif ini bersifat spontan. Difusi dan osmosis merupakan
contoh dari transpor pasif. Contoh molekul yang berpindah dengan transpor pasif
ialah air dan glukosa. Transpor pasif air dilakukan lipid bilayer dan transpor pasif
glukosa terfasilitasi transporter. Ion polar berdifusi dengan bantuan protein transpor.

Difusi adalah gerakan molekul dari suatu daerah dengan konsentrasi yang tinggi ke
daerah lain dengan konsentrasi lebih rendah yang disebabkan oleh energi kinetik
molekul-molekul tersebut. Kecepatan difusi melalui membran sel tergantung pada
perbedaan konsentrasi, ukuran molekul, muatan, daya larut partikel-partikel dalam
lipid dan suhu.
Osmosis adalah difusi dari tiap pelarut melalui suatu selaput yang permeabel
secara diferensial. Pelarut universal adalah air. Jadi, dapat dikatakan bahwa osmosis
adalah difusi air melalui selaput yang permeabel secara diferensial dari pelarut
berkonsentrasi tinggi (banyak air) ke pelarut yang berkonsentrasi rendah (sedikit air).
Proses osmosis akan berhenti jika konsentrasi di dalam dan di luar sel telah seimbang.
5.2. Transpor Aktif
Transpor aktif merupakan kebalikan dari transpor pasif dan bersifat tidak
spontan. Arah perpindahan dari transpor ini melawan gradien konsentrasi. Transpor
aktif membutuhkan bantuan dari beberapa protein. Contoh protein yang terlibat dalam
transpor aktif ialah channel protein dan carrier protein, serta ionofor. Ionofor
merupakan antibiotik yang menginduksi transpor ion melalui membran sel maupun
membran buatan.
Molekul gula dan asam amino diangkut secara aktif ke dalam sel
menggunakan energi. Energi ini di peroleh dari gradien konsentrasi Na+ yang terjadi
pada pengangkutan natrium-kalium. Dengan bantuan suatu protein transpor khusus,
molekul glukosa dan ion natrium masuk ke dalam sel bersama-sama.

6. Permeabilitas Membran Sel

Permeabilitas membran adalah tingkat pasif difusi molekul melalui membran.

Molekul-molekul yang dikenal sebagai permeant molekul. Permeabilitas bergantung
terutama pada muatan listrik dan polaritas molekul dan pada tingkat lebih rendah
massa molar molekul. Karena sifat hidrofobik membran sel, molekul kecil bermuatan
netral. Ketidakmampuan molekul yang dibebankan untuk melewati membran sel hasil
pH partisi zat seluruh kompartemen cairan tubuh.

10

DINDING SEL

Dinding sel adalah lapisan kaku dan kuat yang mengelilingi beberapa jenis sel
merupakan fitur karakteristik sel tanaman, bakteri, jamur, alga dan beberapa archaea.
Daerah ini terletak di luar membran sel. Fungsi utama dari dinding sel adalah untuk
memberikan kekakuan, kekuatan, dukungan struktural, perlindungan terhadap stres
mekanik dan infeksi. Dindung sel juga membantu dalam difusi gas masuk dan keluar
dari sel. Komposisi dinding sel bervariasi pada tiap spesies dan juga tergantung pada
tahap pengembangan organisme. Protozoa dan hewan tidak memiliki dinding sel.

Fungsi Dinding Sel

Di bawah ini adalah fungsi dinding sel:

11

Memberikan struktur dan bentuk sel yang pasti.

Memberikan dukungan struktural.

Perlindungan terhadap infeksi dan stres mekanik.

Memisahkan bagian dalam sel dari lingkungan luar.

Dinding sel memungkinkan transportasi zat dan informasi dari bagian dalam
sel ke eksterior.

Juga membantu dalam regulasi osmotik.

Mencegah kehilangan air.

Kegiatan fisiologis dan biokimia dari dinding sel membantu dalam

komunikasi sel-sel.

Dinding sel mencegah sel tidak pecah karena tekanan tugor.

Membantu difusi gas masuk dan keluar dari sel.

Juga memberikan perlindungan mekanik dari serangga dan patogen.

12

Fungsi Dinding Sel pada Tumbuhan

Bentuk, Kekuatan, dan Penyokong

Dinding sel berperan sebagai rangka dan bertanggung jawab untuk menjaga
bentuk sel. Dinding sel terbentuk atas selulosa, yang terdiri atas ribuan molekul Dglukosa. Molekul-molekul ini terikat satu sama lain dengan ikatan hidrogen yang
membuat sel bersifat rigid/kaku. Ini membantu tumbuhan berdiri tegak meski tidak
memiliki kerangka tulang.

Mengendalikan Tekanan Turgor

Tekanan atau turgiditas adalah tekanan yang diberikan oleh komponenkomponen sel terhadap dinding sel. Fungsi penting dari dinding sel adalah menjaga
tekanan turgor. Tekanan turgor ini ditentukan dari jumlah air yang ada di dalam
vakuola, yang secara langsung berhubungan dengan tekanan osmotik.Gaya yang
diberikan terhadap dinding sel dikembalikan ke dalam sel karena dinding sel bersifat
kaku, ini menyebabkan tumbuhan bersifat kaku dan dapat berdiri tegak.

13

Akan tetapi, perlu ada keseimbangan antara tekanan yang diberikan terhadap
dinding sel dan kekakuan dinding sel, karena tekanan yang berlebihan dapat
menyebabkan pecahnya sel, sedangkan tekanan yang kurang akan menyebabkan sel
menjadi lembek.

Lewatnya Zat-Zat
Fungsi ini berkaitan erat dengan sifat semi-permeable yang dimiliki dinding
sel. Dinding sel membantu difusi materi melalui apoplas. Ciri yang dimiliki dinding
sel ini memungkinkan pertukaran zat-zat seperti molekul-molekul kecil dan protein,
masuk dan keluar dari sel. Selain itu dinding sel juga membantu menyaring molekulmolekul besar. Zat penting lain seperti air dan karbon dioksida juga didistribusikan ke
tiap-tiap sel tumbuhan dengan menempelnya dinding sel satu sel dengan yang
lainnya. Karena itu menjaga homeostasis adalah salah satu fungsi dari dinding sel.

Pelindung
Tumbuhan tidak dapat bergerak, karena itulah tumbuhan-tumbuhan perlu
perlindungan lebih untuk mengatasi berbagai bahaya yang ada. Dinding sel adalah

14

garis pertahanan pertama terhadap serangan patogen-patogen dan mikroorganismemikroorganisme. Sifat kaku yang dimiliki sel mencegah masuknya patogen dan benda
asing lain yang berbahaya. Dinding sel juga melindungi sel terhadap tekanan
mekanis.

Penyimpanan Karbohidrat
Dinding sel merupakan cadangan karbohidrat (terutama bagi biji-bijian) yang
dapat digunakan sel dalam situasi-situasi genting.

Pemberi Isyarat
Dinding sel mengandung oligosakarida yang berperan sebagai hormon.
Oligosakarida ini menstimulir sintesis etilena, kitinase, dan enzim-enzim lain.
Pelepasan enzim-enzim ini mengakibatkan oxidative burst ataurespiratory burst,
menghasilkan peroksida, superoksida, dan senyawa oksigen lain yang menyerang
patogen dan membuat dinding sel lebih kaku & sulit ditembus.
Struktur Dinding Sel
Komposisi dinding sel bervariasi pada tiap spesies. Dalam dinding sel bakteri
terdiri dari peptidoglikan. Dinding sel Arkean terbuat dari glikoprotein dan
polisakarida. Dalam jamur dinding sel terbuat dari glukosamin dan kitin. Dalam alga
terdiri dari glikoprotein dan polisakarida. Dinding sel tanaman terutama terdiri dari
selulosa, hemiselulosa, glikoprotein, pektin dan lignin.

15

Kehadiran dinding sel adalah perbedaan utama antara sel tumbuhan dan sel
hewan.
Dinding sel tanaman melakukan fungsi penting seperti menyediakan bentuk,
kekuatan tarik dan perlindungan dan juga membantu sel mengalami tekanan tugor
untuk mempertahankan tekanan isi sel.
Dinding sel tanaman terutama terdiri dari selulosa. selulosa adalah makromolekul yang paling melimpah di Bumi.
Dinding sel tanaman terdiri dari tiga lapisan: dinding sel primer, dinding sel
sekunder dan lamella tengah.
Lamella tengah adalah lapisan pertama yang terbentuk selama pembelahan
sel. Lapisan ini kaya akan pektin. Ini adalah lapisan terluar, bergabung bersama selsel tanaman yang berdekatan dan memegang mereka bersama-sama.

16

Dinding sel primer dibentuk setelah lamella tengah. Dinding sel primer terdiri
dari senyawa pektin, hemiselulosa dan glikoprotein. Lapisan ini terdiri dari kerangka
selulosa mikro-fibril, dalam matriks gel. Dinding sel primer adalah lapisan fleksibel
tipis dan lapisan yang dapat diperluas.
Dinding sel sekunder adalah lapisan tebal yang terbentuk di dalam dinding sel
primer. Dinding sel sekunder sangat kaku dan memberikan kekuatan. Dinding sel
sekunder terdiri dari selulosa, hemiselulosa dan lignin.
Dalam dinding sel tumbuh karbohidrat adalah selulosa, hemiselulosa dan
pektin serta lignin, protein dan enzim. Bagian luar dari dinding sel utama epidermis
tumbuhan biasanya membentuk penghalang permeabilitas dan dikenal sebagai
kutikula tanaman. Dinding sel sekunder mengandung selulosa, xylan dan lignin.
Dinding sel tanaman juga mengandung enzim seperti hidrolase, esterase, peroksidase
dan transglycolases. juga mengandung protein struktural dan kristal silika.

17

NUKLEOLUS

A.

Sejarah penemuan nukleus

Nukleus pertama kali di identifikasikan oleh Robert Brown pada tahun 1931.

Selanjutnya banyak penelitian penelitian yang di lakukan untuk meneliti nukleus.

Tahun 1910 Koosel meneliti komposisi kimianya, tahun 1942 R. Fulgen dan H.
Rossenbeak menemukan cara mengetes DNA, J.D.Watson dan Crick menemukan
struktur DNA pada tahun 1953, tahun 1957 A.R.Todd menemukan adanya nukleotida
pada nukleus. Robert Brown menyatakan bahwa nukleus merupakan bagian yang
penting dari sel.

Pentingnya nukleus itu dalam menentukan apa yang dilakukan sitoplasma telah
diperagakan oleh biologiawan Jerman theodor Boveri. Dengan mengguncangkan
keras-keras, ia berhasil mengeluarkan nucleus dari telur suatu spesies hewan laut
genus Spaerechinus. Kemudian telur telur tanpa nucleus itu di buahi dengan
sperma binatang laut Echinus. Sel sperma jauh lebih kecil daripada sel telur.

18

Di dalamnya ada nucleus dan ekor untuk bergerak. Dalam proses pembuahan,
nucleus menembus telur. Jadi, pembuahan telur tanpa nucleus Spherechinus oleh
sperma Echinus menghasilkan penambahan satu macam nucleus bagi yang lain.
Rangsangan pembuahan itu menyebabkan telur mengalami pembelahan sel dan
tumbuhlah menjadi larva baru urkin laut.
B.

Struktur Inti Sel (Nukleus)

Secara garis besar, membran inti terdiri atas tiga bagian, yaitu membran luar,

ruang

perinuklear,

dan

membran

dalam.

Membran

luar

dari

nukleus

berkesinambungan dengan retikulum endoplasma (RE) kasar yanh bertaburan dengan

ribosom. Sifat membran inti yang tak permeabel terhadap sebagian besar molekul
membuat nukleus memerlukan pori inti agar molekul dapat bergerak melintasi
membran. Pori nukleus bagaikan terowongan yang terletak pada membran nukleus
yang berfungsi menghubungkan nukleoplasma dengan sitosol. Fungsi utama dari pori
nukleus adalah untuk sarana pertukaran molekul antara nukleus dengan sitoplasma.
Di dalam nukleus terdapat matriks yang disebut nukleoplasma, nukleolus, RNA, dan
kromosom. Kromosom tersusun atas protein dan DNA.
Setiap nukleus tersusun atas beberapa bagian penting sebagai struktur halus,
yaitu sebagai berikut:
1.

Membran Nukleus (Selaput Inti)

Bagian ini merupakan bagian terluar inti yang memisahkan nukleoplasma
dengan sitoplasma. Selaput inti terdiri atas dua lapis membran (bilaminair), setiap
lapis merupakan lapisan bilayer. Ruang antara membran disebut perinuklear atau
sisterna. Pada membran ini terdapat porus yang berfungsi untuk pertukaran molekul
dengan sitoplasma. Berdasarkan ada tidaknya selaput inti, dibedakan dua tipe sel
yaitu sel prokariotik (tidak memiliki selaput inti) dan sel eukariotik (memiliki selaput
inti). Selaput inti tebalnya 7 8 nm dan mengandung berates ratus pori pori (3
40 pori pori/ mikro meter persegi luas permukaan). Pori inti diameternya 60 nm dan
terdiri atas 8 sub unit. Makromolekul besar 9 misalnya mRNA, rRNA ) lewat dari inti
ke sitoplasma melalui pori inti. Membran luar selaput inti sering kontinyu dengan

19

membran reticulum endoplasma kasar. Membran dalam selaput inti mempunyai

sejumlah filament yang melekatkan kromatin dan struktur lainnya untuk mengatur
2.

diameter pori terhadap matriks nukleoplasma sisi membrane dalam.

Selubung Inti (Nukleus)
Membran atau selubung inti merupakan membran ganda. Kedua selubung ini
masing-masing merupakan bilayer lipid dengan protein yang terkait. Membran ini
dilubangi oleh beberapa pori yang berdiameter sekitar 100 nm. Pada bibir setiap pori
membran dalam dan membran luar selubung nukleus menyatu. Pori-pori ini
memungkinkan hubungan antara nukleoplasma (cairan inti) dengan sitoplasma
(cairan sel). Selain pori, sisi dalam selubung ini dilapisi lamina nukleus dengan mirip
jaring yang terdiri dari filamen protein yang mempertahankan bentuk susunan
nukleus.
Selubung nukleus terdiri dari dua lembar selaput yang saling berhimpitan.
Keduanya dipisahkan oleh ruangan sempit yan disebut perinukleus. Lembaran yang
disebelah dalam disebut selaput dalam atau selaput nukleoplasma sedangkan
lembaran yang disebelah luar disebut selaput luar atau selaput sitosol. Membran
nukleus berpori. Pori nukleus ini terbentuk akibat menyatunya dwilapis lipid dari
selaput nukleoplasma dan selaput sitosol. Jumlah pori kira-kira 10% dari permukaan
inti.
Struktur membran nukleus yang sedemikian rupa tersebut ternyata berkaitan
dengan fungsinya. Fungsi membran nukleus sangat rumit,disatu pihak selubung
nukleus merupakan suatu pembatas, dipihak lain karena berpori maka berfungsi
sebagai sarana pengangkutan antar kompartemen (ruangan).
Berdasarkan strukturnya terdapat tiga cara pengangkutan dari dan ke
sitoplasma. Cara pertama adalah dengan melewati pori nukleus. Cara kedua adalah
pengangkutan melalui selaput dalam menuju ke ruang perinukleus dan diteruskan ke
sisterna (lumen) reticulum endoplasma. Cara terakhir adalah dengan jalan pinositosis.
Sebagai pembatas membran nukleus akan menghalangi perpindahan molekul dari dan
ke sitoplasma. Air, ion-ion, dan mikromolekul senyawa organik misalnya gliserol dan

20

sukrosa dapat melewati membran nukleus dengan mudah dan cepat. Meskipun
demikian ternyata permeabilitas membran nukleus berbeda untuk setiap sel. Khusus
transport protein yang diperlukan untuk replikasi dan transkripsi DNA tidak ada
hambatan.
3.

Kromatin
Kromatin pada saat interfase tampak sebagai butir-butir yang tersebar pada

seluruh inti tanpa adanya benang-benang kromosom. Namun sebaliknya, jika inti sel
sedang bermitosis buti-butir kromatin tidak terlihat dan akan tampak benang-benang
kromosom. Istilah kromosom diperuntukan bagi kromatin yang membentuk
gambaran sebagai batang-bastang halus saat pembelahan sel. Kromosom tersusun
atas molekul DNA (16%), RNA (12%) dan nuclesoprotein (72%). Nukleoprotein
sendiri tersusun atas berbagai jenis protein, yaitu protamin, histon, nonhiston dan
berbagai enzim di antaranya polymerase DNA dan RNA.
Matriks nukleoplasma terdiri atas sejumlah besar bahan fibrosa yang disebut
kromatin. Butiran kromatin, yang terdapat di dalam nukleoplasma. Tampak jelas pada
saat sel tidak membelah. Pada saat sel membelah butiran kromatin menebal menjadi
struktur seperti benang yang disebut kromosom. Kromosom mengandung DNA (asam
dioksiribonukleat) yang berfungsi menyampaikan informasi genetik melalui sintesis
protein.
a.

serat-serat kromatin diameternya sekitar 20 nm dan terdiri atas daerah-daerah

DNA halus yang lurus diselingi oleh nekleosom.

b.
DNA berpilin erat dalam serat kromatin. Satu kromatin memanjang
mengandung 30 DNA memanjang.
4.
Nukleoplasma
Nukleoplasma adalah cairan inti (karyotin) yang bersifat transparan dan
semisolid (kental). Nukleoplasma mengandung kromatin, granula, nukleoprotein, dan
senyawa kimia kompleks. Pada saat pembelahan sel, benang kromatin menebal dan
memendek serta mudah menyerap zat warna disebut kromosom. Benang kromatin
tersusun atas protein dan DNA. Di dalam benang DNA inilah tersimpan informasi

21

kehidupan. DNA akan mentranskripsi diri (mengopi diri) menjadi RNA yang
selanjutnya akan dikeluarkan ke sitoplasma.
5.
Nukleolus
Nukleolus atau anak inti tersusun atas fosfoprotein, orthosfat, DNA, dan
enzim. Nukleolus terbentuk pada saat terjadi proses transkripsi (sintesis RNA) di
dalam nukleus. Jika transkripsi berhenti, nukleolus menghilang atau mengecil. Jadi,
nukleolus bukan merupakan organel yang tetap. Nukleolus (anak inti), berfungsi
mensintesis berbagai macam molekul RNA (asam ribonukleat) yang digunakan dalam
perakitan ribosom. Molekul RNA yang disintesis dilewatkan melalui pori nukleus ke
sitoplasma, kemudian semuanya bergabung membentuk ribosom. Nukleolus berentuk
seperti bola, dan memalui mikroskop elektron nukleolus ini tampak sebagai suatu
massa yang terdiri dari butiran dan serabut berwarna pekat yang menempel pada
bagian kromatin.
Berdasar jumlah nukleus, sel dapat dibedakan sebagai berikut:
a.
b.
c.

Sel mononukleat (berinti tunggal), misalnya sel hewan dan tumbuhan.

Binukleat (inti ganda), contohnya Paramaecium.
Multinukleat (inti banyak), misalnya Vaucheria (sejenis alga) dan beberapa

jenis jamur.

Gambar 1. Strutrur nukleus

22

C.

Fungsi Inti Sel (nukleus)

Nukleus memiliki arti penting bagi sel karena mempunyai beberapa fungsi

berikut.
1. Pengatur pembelahan sel. Nukleus berperan mengatur proses pembelahan sel.
2. Pengendali seluruh kegiatan sel, misalnya dengan memasukkan RNA dan unit
ribosom ke dalam sitoplasma. Nukleus memiliki peran yang sangat vital dalam
kehidupan sebuah sel. Peranan nucleus dalam hal ini adalah untuk mengatur dan
mengontrol segala aktifitas kehidupan sel serta membawa informasi genetik yang
diturunkan ke generasi berikutnya. Informasi genetik ini disimpan dalam suatu
molekul polinukleutida yang disebut DNA (Deoxyribonucleic acid). DNA pada
umumnya tersebar di dalam nucleus sebagai matriks seperti benang yang disebut
kromatin. Ketika sel akan memulai membelah, kromatin akan berkondensasi
membentuk struktur histon. Struktur di dalam nucleus yang merupakan tempat
berkonsentrasinya molekul DNA yang lebih padat dan memendek yang selanjutnya
disebut kromosom. Kromosom tersusun atas molekul DNA dan protein adalah
nucleolus (anak inti.). Nucleolus berperan sebagai tempat terjadinya sintesis molekul
RNA (Ribonucleic acid) dan ribosom. RNA merupakan hasil salinan DNA yang akan
ditransfer ke sitoplasma untuk diterjemahkan menjadi rantai asam amino yang disebut
protein.
3. Pembawa infsormasi genetik, Molekul DNA dikenal sebagai materi genetik yang
menyimpan semua informasi penting tentang segala aktivitas sel yang harus
dilakukan melangsungkan sebuah kehidupan. DNA atau Deoxyribonucleic acid
diibaratkan sebagai perpustakaan besar yang didalamnya terdapat buku-buku penting
(gen) dan tersimpan rapi di dalam inti sel. Molekul DNA memiliki struktur berupa
dua untai polinukleutida (double strand) yang masing-masing untai polinukleutida
tersusun atas rangkain nukleutida dalam bentuk deoksiribonukleutida. Setiap molekul
nukleutida terdiri atas tiga gugus, yaitu gugus gula pentosa dalam bentuk deoksibosa,
gugus fosfat dan gugus basa nitrogen.
4. Merupakan tempat terjadinya replikasi dan transkripsi DNA.

23

Replikasi DNA, replikasi DNA adalah proses penggandaan DNA atau

pencetakan DNA yang merupakan suatu proses penyalinan urusan nukleotida DNA
oleh pasangan basa komplementer, misalnya adenine dengan timin atau guanine
dengan sitosin. Adapun mekanisme DNA adalah sebagai berikut:
- Pilinan dobel helix DNA di luruskan dan dibuka oleh enzim helikase DNA dan
membentuk garpu replikase.Protein pengikat memegang atau menahan strain
DNAyang sudah terbuka dan lurus.
- Kemudian enzim primase memulai membuat DNA baru. Enzim ini menempelkan
RNA primer pada rantai DNA agar DNA polymerase memperpanjang strain.
a.
Pada jalur utama polymerase DNA mempolimerasi nukleotida nukleotida
sehingga membentuk pasangan A T, G C.
b.
Pada jalur lambat, terbentuk pula pasangan pasangan nukleotida antara lain
oleh enzim polymerase DNZ dibantu dan primase DNA dan ligase. Protein pengikat
DNA jalin tunggal untuk menahan unit DNA agar tetap lurus.
Kemudian terbentuklah untaian DNA baru, untaian DNA dikemas dalam
bentuk nukleosom dan membentuk kromosom padat. Di dalam proses ini terlihat
beberapa jenis protein berupa enzim atau bukan enzim. Protein tersebut adalah:
1.

Polimerase DNA yaitu enzim yang digunaan untuk mempolimerasekan

nukleotida.
2.
Ligase DNA yaitu enzim yang digunakan untuk menghubungkan untaian
DNA pada jalur lamban.
3.
Primase DNA yaitu enzim yang digunakan untuk memulai polymerase DNA
di jal Helikase DNA yaitu enzim yang digunakan untuk membuka pilinan DNA.
4.
Protein pengikat DNA jalin tunggal (SSB= single strain) DNA dinding protein
an berfungsi untuk memegang atau menahan pilinan DNA yang telah terbuka oeh
enzim helikase.
Transkripsi DNA, transkripsi DNA merupakan sintesis RNA dengan
menggunakan cetakan DNA. Penyalinan DNA menghasilkan mRNA, rRNA, dan
tRNA. Adapun proses transkripsi terdapat 3 tahap, tahapan tersebut antara lain yaitu:
1.
Inisiasi, enzim polymerase RNA harus menyalin gen. Berarti pengikatan awal
dari enzim polymerase RNA ke molekul DNA harus terjadi pada daerah tepat di

24

depan atau sebelum gen yang akan disalin. Titik temu antara polymerase RNA dan
DNA disebut dengan daerah promoter. Sel terikat pada promoter, polymerase RNA
membuka pilinan ganda DNA untuk mendedahkan nukleotida pada DNA. Pilin DNA
yag terdedah berperan sebagai cetakan bagi pasangan basa komplemen dengan
monomer trifosfat ribonukleotida.
2.
Proses Pemanjangan (Elongasi), kelompok enzim polymerase RNA bergerak
sepanjang molekul DNA bereaksi dan membuka pilinan ganda DNA, sementara itu
secara berurutan mengikatkan ribonukleotida ke ujung 3` dari molekul RNA yang
sedang tumbuh. Salinan selalu lebih panjang daripada gen yang disalin karena terdiri
atas segmen pemandu, daerah sandian, dan yang terakhir segmen penutup.
3.
Tahap Penghentian (Terminasi), akhir Penyalinan ditandai

dengan

terdissosiasinya enzim polymerase RNA dari DNA dan lepasnya salinan RNA.
Molekul RNA yang dihasilkan dikelompokkan berdasarkan fungsinya. Molekul
molekul

tersebut

adalah

rRNA,

mRNA,

dan

tRNA.

rRNA dan tRNA merupakan hasil akhir dari proses ekspresi gen dan di dalam sel
berperan sebagai molekul RNA. Sebaliknya mRNA masih akan melakukan ekspresi
gen sekali lagi yaitu penerjemahan atau translasi.

DNA

(DEOKSIRIBONUKLEAT)

25

DNA, asam deoksiribonukleat, atau deoxyribonucleic acid dalam bahasa

Inggris, adalah sejenis asam nukleat yang tergolong biomolekul utama penyusun
berat kering setiap organisme. Atau pengertian sederhananya DNA adalah
perpustakaan yang menyimpan segala informasi makhluk hidup. Di dalam sel, DNA
umumnya terletak di dalam inti sel. Secara garis besar, peran DNA di dalam sebuah
sel adalah sebagai materi genetic, artinya DNA menyimpan cetak biru bagi segala
aktivitas sel. Ia mengandung perintah-perintah yang memberitahu sel bagaimana
harus bertindak. Ia juga menentukan bagaimana sifat organisme diturunkan dari suatu
generasi ke generasi berikutnya. Aelain itu DNA adalah resep, skema, sistematika,
manual, peta, cetak biru, rancangan, dan informasi biologis yang unik dari makhluk
hidup. Persis seperti setiap bangunan gedung yang ada cetak birunya masing-masing.
Jadi, pada intinya DNA adalah suatu asam nukleat yang menyimpan segala informasi
biologis yang unik dari setiap makhluk hidup dan beberapa virus. DNA dapat
mereplikasi yaitu membentuk salinan dirinya sendiri. Setiap untaian DNA berisi

26

sekuens basis tertentu. Setiap basis juga dihubungkan oleh molekul gula dan fosfat.
Bila basis membentuk anak tangga (horizontal), maka molekul gula dan fosfat
membentuk bagian vertikal dari tangga tersebut.
Molekul-molekul DNA di tubuh kita tersusun dalam paket-paket yang disebut
kromosom. Setiap manusia memiliki 23 pasang kromosom. Satu dari 23 pasang
kromosom itu, yang disebut kromosom seks, berbeda pada pria dan wanita. Wanita
memiliki dua kromosom X, laki-laki memiliki kromosom X dan Y. Setiap organisme
memiliki jumlah kromosom yang berbeda. Misalnya, simpanze memiliki 24 pasang,
pisang 11 pasang, dan lalat hanya 4 pasang. Selanjutnya, kromosom tersusun dalam
segmen-segmen pendek DNA yang disebut gen. Bila DNA adalah buku resep, maka
setiap gen adalah resepnya. Resep ini memberitahu sel-sel bagaimana menjalankan
fungsi dan mengekspresikan sifat tertentu. Manusia memiliki sekitar 25.000 gen. Gen
inilah yang menentukan warna rambut, jenis rambut, warna kulit, warna mata, dll.
Misalnya, seseorang memiliki rambut hitam keriting karena gen-gen yang diwarisi
dari orangtuanya menginstruksikan sel-sel folikel rambut untuk membentuk rambut
hitam dan keriting.
1
1.

Fungsi biologi
DNA adalah bahan genetik dalam organisme eukariotik lainnya, yang hadir
dalam bentuk kromosom linier, melingkar pada prokaryota.

2.

Informasi genetik yang dibawa oleh DNA pada urutan yang dikenal sebagai
gen.

3.

Set lengkap informasi dalam suatu organisme dikenal sebagai genotipe.

4.

Gen didefinisikan sebagai unit dasar keturunan.

5.

Ini adalah wilayah DNA yang mempengaruhi karakteristik tertentu dalam

suatu organisme.

6.

Urutan gen DNA mempengaruhi fenotipe suatu organisme.

27

7.

Urutan basa pada untai DNA mendefinisikan urutan messenger RNA yang
kemudian memberikan satu atau lebih urutan protein.

8.

Kode genetik merupakan urutan tiga nukleotida yang menentukan urutan

asam amino, protein.

9.

Pembelahan sel adalah proses oleh organisme untuk tumbuh, DNA direplikasi
dan setiap sel putri menerima genom sama seperti orangtua mereka.

10.

Untai ganda DNA membantu replikasi DNA.

11.

Helai dilepaskan untuk masing-masing untai dan, untai pelengkap diciptakan

Struktur DNA

DNA merupakan polimer yang terdiri dari tiga komponen utama, yaitu:
1.
2.
3.
-

gugus fosfat
gula deoksiribosa
basa nitrogen, yang terdiri dari:
Adenin (A)
Guanin (G)
Sitosin (C)
Timin (T)

Sebuah unit monomer DNA yang terdiri dari ketiga komponen tersebut dinamakan
nukleotida, sehingga DNA tergolong sebagai polinukleotida.

28

Rantai DNA memiliki lebar 22-24 , sementara panjang satu unit nukleotida 3,3 .
Walaupun unit monomer ini sangatlah kecil, DNA dapat memiliki jutaan nukleotida
yang terangkai seperti rantai.
Rangka utama untai DNA terdiri dari gugus fosfat dan gula yang berselangseling. Gula pada DNA adalah gula pentosa (berkarbon lima), yaitu 2-deoksiribosa.
Dua gugus gula terhubung dengan fosfat melalui ikatan fosfodiester antara atom
karbon ketiga pada cincin satu gula dan atom karbon kelima pada gula lainnya.
DNA terdiri atas dua untai benang polinukleotida yang saling berpilin
membentuk struktur heliks ganda. Seutas polinukleotida pada molekul DNA tersusun
atas rangkaian nukleotida. Setiap nukleotida tersusun atas:
1.

Gugusan gula deoksiribosa (gula pentosa yang kehilangan satu atom oksigen)

2.

Gugusan asam fosfat yang terikat pada atom C nomor 5 dari gula)

3.

Gugusan basa nitrogen yang terikat pada atom C nomor 1 dari gula
Ketiga gugus tersebut saling terkait dan membentuk tulang punggung yang

sangat panjang bagi heliks ganda. Strukturnya dapat diibaratkan sebagai tangga,
dimana ibu tangganya adalah gula deoksiribosa dan anak tangganya adalah susunan
basa nitrogen. Sedangkan fosfat menghubungkan gula pada satu nukleotida ke gula
pada nukleotida berikutnya untuk membentuk polinukleotida.
Basa nitrogen penyusun DNA terdiri dari basa purin, yaitu adenin (A) dan
guanin (G), serta basa pirimidin yaitu sitosin atau cytosine (C) dan timin (T). Ikatan
antara gula pentosa dan basa nitrogen disebut nukleosida. Ada 4 macam basa
nukleosida yaitu :
1. Ikatan

A-gula

disebut

adenina

atau

adenosin

deoksiribonukleosida

(deoksiadenosin)
2. Ikatan G-gula disebut

guanina

atau

guanosin

deoksiribonukleosida

(deoksiguanosin)
3. Ikatan C-gula disebut sitosina atau sitidin deoksiribonukleosida (deoksisitidin)

29

4. Ikatan

T-gula

disebut

timina

atau

timidin

deoksiribonukleosida

(deoksiribotimidin)
Ikatan asam-gula-fosfat disebut sebagai deoksiribonukleotida atau sering disebut
nukleotida. Ada 4 macam deoksiribonukleotida, yaitu adenosin deoksiribonukleotida,
timidin

deoksiribonukleotida,

sitidin

deoksiribonukleotida,

timidin

deoksiribonukleotida. Nukleotida-nukleotida itu membentuk rangkaian yang disebut

polinukleotida. DNA terbentuk dari dua utas poinukleotida yang saling berpilin.

Basa-basa nitrogen pada utas yang satu memiliki pasangan yang tetap dengan
basa-basa nitrogen pada utas yang lain. Adenin berpasangan dengan timin dan guanin
berpasangan dengan sitosin. Pasangan basa nitrogen A dan T dihubungkan oleh dua
atom hidrogen (A=T). Adapun pasangan basa nitrogen C dan G dihubungkan oleh
tiga atom hidrogen (CG). Dengan demikian, kedua polinukleotida pada satu DNA
saling komplemen.
Penggunaan DNA Dalam Teknologi
Banyak sekali manfaat DNA. Terutama dalam hal masalah pengidentifikasi
makhluk hidup. Seiring perkembangan teknologi, maka penggunaan DNA juga
semakin berkembang dan bermanfaat bagi kehidupan.
DNA Dalam Forensik
Ilmuwan forensik dapat menggunakan DNA yang terletak dalam darah, sperma,
kulit, liur atau rambut (intinya seluruh bagian tubuh) yang tersisa di tempat kejadian
kejahatan untuk mengidentifikasi kemungkinan tersangka, sebuah proses yang
disebut fingerprinting genetika atau pemrofilan DNA (DNA profiling). Dalam
pemrofilan DNA panjang relatif dari bagian DNA yang berulang seperti short tandem
repeats dan minisatelit.

30

Banyak yurisdiksi membutuhkan terdakwa dari kejahatan tertentu untuk

menyediakan sebuah contoh DNA untuk dimasukkan ke dalam database komputer.
Hal ini telah membantu investigator menyelesaikan kasus lama di mana pelanggar
tidak diketahui dan hanya contoh DNA yang diperoleh dari tempat kejadian (terutama
dalam kasus perkosaan antar orang tak dikenal).
Jadi, walaupun tubuh korban sudah hancur dan tidak bisa diidentifikasi lagi
seperti korban peledakan bom Bali dan kecelakaan pesawat. Kita masih bisa
mengenalinya dengan mengambil sampel DNA dari salah satu bagian tubuh korban.
Kita juga bisa mengetahui siapa keluarga korban, siapa yang membunuh atau siapa
yang pertama kali menganiaya korban bila tersangka lebih dari 1 orang.
Metode ini adalah salah satu teknik paling tepercaya untuk mengidentifikasi
seorang pelaku kejahatan, tetapi tidak selalu sempurna, misalnya bila tidak ada DNA
yang dapat diperoleh, atau bila tempat kejadian terkontaminasi oleh DNA dari banyak
orang. Maka dari itu, TKP harus steril dan dipasangi garis polisi.
DNA Dalam Komputasi
DNA memainkan peran penting dalam ilmu komputer, baik sebagai masalah riset
dan sebagai sebuah cara komputasi. Riset dalam algoritma pencarian string, yang
menemukan kejadian dari urutan huruf di dalam urutan huruf yang lebih besar,
dimotivasi sebagian oleh riset DNA, dimana algoritma ini digunakan untuk mencari
urutan tertentu dari nukleotida dalam sebuah urutan yang besar. Dalam aplikasi
lainnya seperti editor text, bahkan algoritma sederhana untuk masalah ini biasanya
mencukupi, tetapi urutan DNA menyebabkan algoritma-algoritma ini untuk
menunjukkan sifat kasus-mendekati-terburuk dikarenakan jumlah kecil dari karakter
yang berbeda.
Teori database juga telah dipengaruhi oleh riset DNA, yang memiliki masalah
khusus untuk menaruh dan memanipulasi urutan DNA. Database yang dikhususkan

31

untuk riset DNA disebut database genomik, dam harus menangani sejumlah tantangan
teknis yang unik yang dihubungkan dengan operasi pembandingan kira-kira,
pembandingan urutan, mencari pola yang berulang, dan pencarian homologi.
Tes DNA
Tes DNA adalah analisis terhadap pola DNA (profil genetik) seseorang. Untuk
keperluan tes DNA, sampel sel diambil dari jaringan tubuh (biasanya kulit). DNA
kemudian dimurnikan dari sel-sel tersebut dan pola variasinya dibaca dengan mesin
sekuensing DNA seperti pembacaan barcode. Hasil pembacaan barcode DNA ini
kemudian dianalisis.
DNA dari tubuh seseorang akan 100% sama, dari mana pun Anda mengambil
sampelnya. Setiap orang memiliki pola DNA yang unik, seperti halnya sidik jari.
Karena setengah dari pola DNA diwariskan dari ibu dan setengah diwariskan dari
ayah, setengah dari garis-garis dalam barcode DNA anak akan berderet seperti pada
DNA ayah, setengah lainnya seperti pada DNA ibu. Bila tidak ada hubungan
orangtua-anak, tidak akan terdapat 50% kesamaan tersebut. DNA di antara saudara
sekandung juga memiliki beberapa kesamaan, namun tidak seperti pada orangtuaanak.
Dalam tes DNA post-mortem seperti pada korban kecelakaan pesawat terbang,
hasil tes digunakan untuk mengidentifikasi pemilik tubuh korban dan menyatukan
bagian-bagian tubuhnya yang terpisah.
1

Kerusakan DNA
1. Kerusakan DNA dapat disebabkan oleh banyak macam mutagen yang
mengubah urutan DNA.

2.

Mutagen termasuk zat seperti agen pengoksidasi, agen alkilasi dan juga
radiasi berenergi tinggi seperti sinar uv dan sinar-X.

3.

Jenis kerusakan terjadi tergantung pada jenis yang tidak bisa diperbaiki.

32

4.

Sinar UV dapat menyebabkan kerusakan dengan memproduksi Timina

dimers.

5.

Dari kerusakan yang disebabkan karena oksidasi, bentuk paling berbahaya

mutasi yang memecah untai ganda, dengan mutasi-mutasi ini sulit untuk
perbaikan dan menghasilkan mutasi titik, Insersi dan penghapusan dari urutan
DNA dan juga translokasi kromosom.

6.

Kadang-kadang, untai ganda yang bermutasi dapat menyebabkan menjadi

kanker.

7.

Kerusakan DNA juga disebabkan oleh berbagai proses selular yang

menghasilkan oksigen reaktif.

8.

Sebagian besar kerusakan DNA dapat diperbaiki, tetapi dalam setiap sel
beberapa kerusakan DNA tetap ada meskipun terjadi proses perbaikan.

9.

Kerusakan DNA ini terakumulasi seiring bertambahnya usia pada jaringan

mamalia. Akumulasi ini dapat menjadi penyebab penting penuaan.

MITOKONDRIA

33

Mitokondria adalah organel sel yang berfungsi sebagai tempat respirasi sel
makhluk hidup. Secara garis besar, tahap respirasi pada tumbuhan dan hewan
melewati jalur yang sama, yang dikenal sebagai daur atau siklus Krebs. Mitokondria
kerap disebut sebagai pembangkit energi bagi sel karena mitokondria yang paling
banyak menghasilkan energi ATP untuk sel. Mitokondria berisi sejumlah enzim dan
protein yang membantu proses karbohidrat dan lemak yang diperoleh dari makanan
yang kita makan untuk melepaskan energi. Mitokondria mempunyai dua lapisan
membran, yaitu lapisan membran luar dan lapisan membran dalam.
Mitokondria dijumpai pada hampir semua sel eukariotik. Dalam beberapa
kasus, terdapat mitokondria besar tunggal, tetapi yang lebih sering ialah sel yang
memiliki ratusan atau bahkan ribuan mitokondria; jumlahnya berkolerasi dengan
tingkat aktivitas metabolisme selnya.

34

1. Sejarah Penemuan Mitokondria

Penelitian pertama tentang struktur yang mungkin mewakili mitokondroa
diterbitkan pada sekitar tahun 1840-an. Pada tahun 1894, Richard Altmann mengira
itu sebagai sel dan menyebutnya bioblas. Istilah mitokondria sendiri pertama kali
digunakan oleh Carl Benda pada tahun 1898. Pada tahun 1904, Friedrich Meves
membuat

sebuah

pengamatan

mitokondria

tercatat

pertama

dalam

tanaman Nymphaea alba.

2. Struktur Mitokondria
Mitokondria dikenal sebagai pusat tenaga sel. Mitokondria banyak terdapat
pada sel yang memilki aktivitas metabolisme tinggi dan memerlukan banyak ATP
dalam jumlah banyak, misalnya sel otot jantung. Mereka adalah organel yang
bertindak seperti sistem pencernaan yang mengambil nutrisi, dan menciptakan energi
untuk sel. Jumlah dan bentuk mitokondria bisa berbeda-beda untuk setiap sel.
Mitokondria berbentuk elips dengan diameter 0,5 m dan panjang 0,5 1,0 m.

35

Proses menciptakan energi sel dikenal sebagai respirasi sel. Sebagian besar reaksi
kimia yang terlibat dalam respirasi selular terjadi di mitokondria. Sebuah mitokondria
berbentuk sempurna untuk memaksimalkan kinerjanya.
Mitokondria adalah organel yang sangat kecil. Anda mungkin menemukan sel
dengan beberapa ribu mitokondria. Jumlahnya tergantung pada apa yang sel perlu
dilakukan. Jika tujuan dari sel adalah untuk mengirimkan impuls saraf, akan ada lebih
sedikit daripada di mitokondria sel otot yang membutuhkan banyak energi. Jika sel
merasa tidak mendapatkan energi yang cukup untuk bertahan hidup, banyak
mitokondria dapat dibuat. Kadang-kadang mereka bahkan bisa tumbuh, bergerak, dan
menggabungkan dengan mitokondria lainnya, tergantung pada kebutuhan sel.
Struktur mitokondria terdiri dari empat bagian utama, yaitu membran luar,
membran dalam, ruang antar membran, dan matriks yang terletak di bagian dalam
membran.

2.1. Membran Luar

36

Membran luar terdiri dari protein dan lipid dengan perbandingan yang sama
serta mengandung protein khusus yang disebut porin yang menyebabkan membran ini
bersifat permeabel terhadap molekul-molekul kecil yang berukuran 6000 Dalton.
Membran luar halus seperti membran dalam dan memiliki fosfolipid hampir dalam
jumlah yang sama sebagai protein. Dalam hal ini, membran luar mitokondria
menyerupai membran luar bakteri gram-negatif. Membran luar benar-benar
permeabel terhadap molekul nutrisi, ion, dan molekul ATP ADP. Selain itu, membran
luar juga mengandung enzim yang terlibat dalam biosintesis lipid dan enzim yang
berperan dalam proses transpor lipid ke matriks untuk menjalani -oksidasi
menghasilkan.

2.2. Membran Dalam

Membran dalam lebih kompleks dalam struktur daripada membran luar karena
mengandung kompleks dari rantai transpor elektron dan kompleks sintetase ATP.
Membran dalam yang kurang permeabel dibandingkan membran luar terdiri dari 20%
lipid dan 80% protein. Membran ini merupakan tempat utama pembentukan ATP.
Luas permukaan ini meningkat sangat tinggi diakibatkan banyaknya lipatan yang
menonjol ke dalam matriks, disebut krista. Stuktur krista ini meningkatkan luas
permukaan membran dalam sehingga meningkatkan kemampuannya dalam
memproduksi ATP. Membran dalam mengandung protein yang terlibat dalam reaksi
fosforilasi oksidatif, ATP sintase yang berfungsi membentuk ATP pada matriks
mitokondria, serta protein transpor yang mengatur keluar masuknya metabolit dari
matriks melewati membran dalam.
2.3. Ruang Antar Membran

37

Ruang antar membran yang terletak di antara membran luar dan membran
dalam merupakan tempat berlangsungnya reaksi-reaksi yang penting bagi sel, seperti
siklus Krebs, reaksi oksidasi asam amino, dan reaksi -oksidasi asam lemak. Di
dalam matriks mitokondria juga terdapat materi genetik, yang dikenal dengan DNA
mitkondria (mtDNA), ribosom, ATP, ADP, fosfat inorganik serta ion-ion seperti
magnesium, kalsium dan kalium.

2.4. Matriks
Matriks merupakan campuran kompleks enzim yang penting untuk sintesis
molekul ATP, ribosom mitokondria khusus, RNA dan DNA mitokondria. Selain itu, ia
memiliki oksigen, karbon dioksida dan intermediet daur ulang lainnya.
3. Fungsi Mitokondria
Peran utama mitokondria adalah sebagai pabrik energi sel yang menghasilkan
energi dalam bentuk ATP. Makanan yang kita makan dipecah menjadi molekul
sederhana seperti karbohidrat, lemak, dll, dalam tubuh kita. Metabolisme karbohidrat
akan berakhir di mitokondria ketika piruvat di transpor dan dioksidasi oleh
O2 menjadi CO2 dan air. Seluruh proses ini dikenal sebagai fosforilasi oksidatif.
Energi yang dihasilkan sangat efisien yaitu sekitar tiga puluh molekul ATP yang
diproduksi untuk setiap molekul glukosa yang dioksidasi, sedangkan dalam proses
glikolisis hanya dihasilkan dua molekul ATP. Proses pembentukan energi atau dikenal
sebagai fosforilasi oksidatif terdiri atas lima tahapan reaksi enzimatis yang
melibatkan kompleks enzim yang terdapat pada membran bagian dalam mitokondria.
Mitokondria dalam sel-sel hati memiliki enzim yang mendetoksifikasi amonia. Proses
pembentukan ATP melibatkan proses transpor elektron dengan bantuan empat
kompleks enzim, yang terdiri dari kompleks I (NADH dehidrogenase), kompleks II

38

(suksinat dehidrogenase), kompleks III (koenzim Q sitokrom C reduktase),

kompleks IV (sitokrom oksidase), dan juga dengan bantuan FoF1 ATP Sintase dan
Adenine Nucleotide Translocator (ANT). Selain itu, mitokondria juga membantu
dalam membangun bagian-bagian tertentu dari darah, dan hormon seperti testosteron
dan estrogen.
Jumlah mitokondira pada sel tumbuhan relatif sedikit karena fungsinya
banyak dilakukan oleh plastida. Mitokondria berfungsi dalam oksidasi zat makanan,
respirasi sel, dehidrogenasi, fosfolirasi oksidatif, dan rantai transfer elektron.
4. Siklus Hidup Mitokondria
Film yang dipaparkan dalam waktu lama pada sel hidup mengungkapkan
bahwa mitokondria ini bergerak berkeliling, berubah bentuk, dan membelah menjadi
dua, tidak seperti silinder statik yang terlihat dalam mikrograf elektron sel mati.
Mitokondria dapat melakukan replikasi secara mandiri (self replicating) seperti sel
bakteri. Replikasi terjadi apabila mitokondria ini menjadi terlalu besar sehingga
melakukan pemecahan (fission). Pada awalnya sebelum mitokondria bereplikasi,
terlebih dahulu dilakukan replikasi DNA mitokondria. Proses ini dimulai dari
pembelahan pada bagian dalam yang kemudian diikuti pembelahan pada bagian luar.
Proses ini melibatkan pengkerutan bagian dalam dan kemudian bagian luar membran
seperti ada yang menjepit mitokondria. Kemudian akan terjadi pemisahan dua bagian
mitokondria.

5. Gangguan pada Mitokondria

39

Kerusakan atau disfungsi pada mitokondria adalah faktor utama penyebab

berbagai penyakit manusia karena pengaruh mereka di dalam metabolisme sel.
Kelainan mitokondria sering hadir sebagai gangguan neurologis, tetapi dapat juga
berupa miopati, diabetes, endocrinopathy, atau berbagai penyakit lainnya. Penyakit
yang disebabkan oleh mutasi DNA termasuk Kearns-Sayre syndrome dan sindrom
MELAS. Dalam sebagian besar kasus, penyakit ini ditularkan oleh perempuan untuk
anak-anaknya, sebagai zigot berasal mitokondria yang dan karenanya yang DNA dari
sel telur.
6. DNA Pada Mitokondria
Mitokondria adalah organel istimewa karena memiliki DNA tersendiri. DNA
mitokondria disebut dengan mtDNA atau mitochondrial DNA. Struktur MtDNA
berpilin ganda, sirkular, serta tidak memiliki membran. MtDNA mirip dengan DNA
bakteri. Karena itulah timbul banyak hipotesis yang timbul, salah satunya menyebut
bahwa mitokondria dulunya merupakan makhluk hidup independen seperti bakteri,
yang kemudian bersimbiosis dengan organisme eukariotik. DNA pada mitokondria
berfungsi mengatur sintesis protein, baik dalam sitoplasma maupun dalam ribosom.
Teori tersebut dikenal dengan nama teori Endosimbion. Menurut teori
tersebut, pada makhluk tingkat tinggi atau eukariotik, DNA mitokondria yang
diturunkan kepada sel-sel anak hanya berasal dari induk betina saja atau dari
mitokondria sel telur. Sedangkan DNA mitokondria jantan tidak masuk ke dalam sel
telur, hal ini disebabkan karena letak DNA jantan yang berada di ekor sperma.
Padahal ekor sperma tidak ikut masuk sel telur. Jadi DNA mitokondria jantan tidak
diturunkan.
Mitokondria mampu mengambil energi dari zat-zat gizi yang terdapat di
dalam makanan. Mitokondria mengubah zat-zat tersebut menjadi suatu bentuk

40

senyawa yang dapat digunakan sebagai bahan bakar aktivitas sel. Karena itulah
mitokondria disebut juga dengan organel penghasil energi atau house power.
Pada mitokondria terdapat lengkungan yang disebut krista. Krista ditempeli
dengan protein-protein transportasi elektron. Masing-masing protein bertanggung
jawab untuk mengubah energi dalam makanan menjadi senyawa energi sel.
Sedangkan cairan seperti gel yang terdapat di dalam disebut dengan matriks. Matriks
berisi campuran ratusan enzim yang berbeda. Masing-masing enzim berfungsi
mempersiapkan molekul-molekul nutrien. Tujuannya supaya pengambilan akhir
energi yang terdapat di krista, berlangsung dengan lancar.

Mitokondria dengan jumlah melimpah terdapat pada sel yang memilki

aktivitas metabolisme tinggi dan memerlukan ATP dalam jumlah banyak. Salah satu
contohnya di sel otot jantung. Mitokondria memiliki berbentuk elips. Ukuran
diameter mitokondria sekitar 0,5 m, sedangkan panjangnya antara 0,5 hingga 1,0
m. Mitokondria tersusun atas empat bagian, yaitu membran luar, membran dalam,
ruang antar membran, dan matriks.

41

KLOROPLAS

Pengertian Kloroplas
Kloroplas adalah organel sel yang ditemukan di tumbuhan dan alga..
Kloroplas merupakan bagian dari plastida yang menjadi tempat penyimpanan
senyawa kimia penting.
Fungsi Kloroplas
Fungsi kloroplas adalah untuk menghasilkan energi yang berasal dari
sinar matahari menjadi energi kimia yang tersimpan dalam glukosa. Fungsi
kloroplas berhubungan dengan fotosintesis. Fotosintesis adalah suatu proses
biokimia pembentukan zat makanan atau energi yaitu glukosa yang dilakukan
tumbuhan, alga, dan beberapa jenis bakteri dengan menggunakan zat hara,
karbondioksida, dan air serta dibutuhkan bantuan energi cahaya matahari.
Semua bagian yang berwarna hijau pada tumbuhan, termasuk batang hijau dan
buah yang belum matang, memiliki kloroplas, tetapi daun merupakan tempat
utama berlangsung nya fotosintesis pada sebagian besar tumbuhan. Tilakoid
yang terdiri dari sistem foto, klorofil dan pigmen aksesori yang menyerap
cahaya yang dihasilkan dalam transfer elektron untuk membentuk faktor co
yang kompleks seperti NADP (Nikotin Amida dinukleotida fosfat) dan ATP
(Adenosin trifosfat) yang menyediakan molekul energi. Hal ini diikuti dengan
reaksi gelap dimana fiksasi karbon dan pembentukan karbohidrat berlangsung
menggunakan ATP dan NADP. Reaksi ini terjadi dalam stroma dan disebut
sebagai siklus Calvin.

42

Struktur Kloroplas
Jika Anda mengamati anatomi sel tumbuhan di bawah mikroskop,
Anda a kan melihat sejumlah kloroplas tersebar di dalam sel. Terdapat kirakira setengah juta kloroplas tiap mili meter persegi permukaan daun.

43

Kloroplas yang oval, dari ukuran diameter 2 sampai 10 mikrometer, dan tebal
1 mikrometer dan dibatasi oleh membran sel, membran luar sel dan membran
sel dalam. Ruang antara kedua disebut ruang antar membran dan membantu
memberikan bentuk untuk organel tersebut. Struktur batin cukup kompleks
dan sebagian besar terdiri dari dua bagian, stroma dan grana tersebut. Stroma
adalah cairan berair dengan kloroplas, mirip dengan sitosol sel. Ini adalah
tempat utama dimana reaksi gelap fotosintesis terjadi. Grana, di sisi lain, yang
terlihat dalam bentuk tilakoid diatur dalam bundel dan terlihat sebagai cakram
di bawah mikroskop. Ini terhubung satu sama lain dengan bantuan lamellae
intergranal.
Struktur kloroplas memiliki diameter 2 hingga 6 milimikron. Tebal
dari lensa tersebut adalah 0,5 sampai 1,0 milimikron. Plastida termasuk
kloroplas merupakan organel bermembran rangkap dengan bermacam bentuk
dan fungsi. Jika diamati dengan pembesaran paling kuat dari mikroskop
cahaya, kloroplas hanya terlihat terlihat seperti butiran-butiran. Namun
sebenarnya pada tumbuhan tingkat tinggi, plastida berbentuk cakram. Ukuran
masing-masing cakram adalah 2 x 5 mm, akan tetapi nilai ini relatif.
Kloroplas hanya terdapat pada organ-organ atau jaringan fotosintetik,
seperti daun atau batang yang berwarna hijau. Selain sebagai tempat
berlangsungnya fotosintesis, kloroplas juga menyintesis klorofil dan beberapa
protein dan lipid tertentu. Berdasarkan jenis tumbuhan, kloroplas mempunyai
bentuk yang bermacam-macam seperti bentuk mangkuk, cakram, spiral,
stelata, atau bentuk tak beraturan. Umumnya berukuran antara 2 - 20 mikron.
Kloroplas terdiri dari dua bagian utama, yaitu bagian amplop dan
bagian dalam. Berikut adalah bagian-bagian kloroplas

44

1. Membran Luar kloroplas

Seperti mitokondria, kloroplas dikelilingi membran ganda, yaitu
membran luar dan membran dalam. Membran luar bersifat sangat permeabel
yang berfungsi untuk melewatkan molekul-molekul kurang dari 10 kilodalton
tanpa selektivitas dan menutupi ruang intermembran antara membran dalam
dan bagian luar kloroplas. Permukaan membran luar rata karena memiliki
lipatan yang sangat sedikit bila dibandingkan dengan membran dalam. Fungsi
membran luar kloroplas adalah untuk mengatur keluar masuknya zat.
2. Ruang Antar Membran
Ruang antar membran adalah ruang yang memisahkan antara
membran luar dan membran dalam dengan ketebalan sekitar 10 nm.

45

3. Membran Dalam Kloroplas

Membran dalam kloroplas bersifat selektif permeabel serta merupakan
tempat protein transpor melekat. Fungsinya adalah untuk memilih molekul
yang keluar masuk dengan transpor aktif. Membran dalam permeabel
terhadap sukrosa, karbon dioksida, sorbitol, asam asetat, dan berbagai macam
anion. Membran dalam menutupi daerah yang berisi cairan yang disebut
stroma. Lipatan pada membran dalam membentuk struktur seperti tumpukan
piringan yang saling berhubungan.
4. Stroma
Stroma adalah cairan kloroplas yang berguna untuk menyimpan hasil
fotosintesis dalam bentuk pati dan sebagai tempat terjadinya reaksi gelap
(siklus calvin). Stroma berisi enzim, ribosom, dan DNA. Sintesis protein
dapat terjadi di ribosom dalam stroma.
5. Grana
Grana tersusun atas granum-granum yang terdiri dari membran
tilakoid sebagai tempat terjadinya reaksi terang dan ruang tilakoid yang
berada di antara membran tilakoid. Ukurannya sekitar 0,3-2,7 nm. Satu
kloroplas terdiri dari 40 hingga 60 grana yang tersebar di dalam matriks
kloroplas. Antara satu granum dengan granum yang lain dihubungkan oleh
lamela tilakoid. Sedangkan antara grana dan stroma dihubungkan oleh lamela
stroma.
Tilakoid
Tilakoid adalah pelipatan membran dalam membentuk seperti
tumpukan piringan yang saling berhubungan. Fungsi struktur tersebut adalah

46

untuk menangkap energi cahaya dan mengubahnya menjadi energi kimia.

Tilakoid yang berada di dalam stroma yang merupakan tempat terjadinya
fotosintesis. Membran tilakoid merupakan tempat terjadinya reaksi terang dan
berisi cairan mengandung klorofil. Jumlah tilakoid pada tiap spesies berbeda.

Kemiripan dengan Mitokondria

Kesamaan antara mitokondria dan kloroplas adalah bahwa mereka terlibat
dalam memicu sel karena keduanya memproduksi dan menyimpan beberapa
bentuk energi. Kesamaan lain adalah bahwa keduanya mitokondria dan kloroplas
mengandung beberapa jumlah DNA (meskipun sebagian DNA ditemukan dalam
inti sel). Yang penting, DNA mitokondria dan kloroplas tidak sama dengan DNA
dalam inti, dan DNA di dalam mitokondria dan kloroplas dalam bentuk
melingkar, yang merupakan bentuk DNA pada prokariota (organisme sel tunggal
tanpa inti). DNA dalam inti eukariot sebuah melingkar dalam bentuk kromosom.

47

RETIKULUM ENDOPLASMA

Retikulum Endoplasma (RE, atau endoplasmic reticula) adalah organel yang dapat
ditemukan pada semua sel eukariotik.

Gambar 1 Sistem endomembran sel

Retikulum Endoplasma merupakan bagian sel yang terdiri atas sistem
membran. Di sekitar Retikulum Endoplasma adalah bagian sitoplasma yang disebut
sitosol. Retikulum Endoplasma sendiri terdiri atas ruangan-ruangan kosong yang
ditutupi dengan membran dengan ketebalan 4 nm (nanometer, 109 meter). Membran
ini berhubungan langsung dengan selimut nukleus atau nuclear envelope.
Pada bagian-bagian Retikulum Endoplasma tertentu, terdapat ribuan ribosom
atau ribosome. Ribosom merupakan tempat dimana proses pembentukan protein

48

terjadi di dalam sel. Bagian ini disebut dengan Retikulum Endoplasma Kasar atau
Rough Endoplasmic Reticulum. Kegunaan daripada Retikulum Endoplasma Kasar
adalah untuk mengisolir dan membawa protein tersebut ke bagian-bagian sel lainnya.
Kebanyakan protein tersebut tidak diperlukan sel dalam jumlah banyak dan biasanya
akan dikeluarkan dari sel. Contoh protein tersebut adalah enzim dan hormon.
Sedangkan bagian-bagian Retikulum Endoplasma yang tidak diselimuti oleh
ribosom disebut Retikulum Endoplasma Halus atau Smooth Endoplasmic Reticulum.
Kegunaannya adalah untuk membentuk lemak dan steroid. Sel-sel yang sebagian
besar terdiri dari Retikulum Endoplasma Halus terdapat di beberapa organ seperti
hati.
Retikulum endoplasma memiliki struktur yang menyerupai kantung berlapislapis. Kantung ini disebut cisternae. Fungsi retikulum endoplasma bervariasi,
tergantung pada jenisnya. Retikulum Endoplasma (RE) merupakan labirin membran
yang demikian banyak sehingga retikulum endoplasma melipiti separuh lebih dari
total membran dalam sel-sel eukariotik. (kata endoplasmik berarti di dalam
sitoplasma dan retikulum diturunkan dari bahasa latin yang berarti jaringan).
Pengertian lain menyebutkan bahwa RE sebagai perluasan membran yang
saling berhubungan yang membentuk saluran pipih atau lubang seperti tabung di
dalam sitoplsma.
Lubang/saluran tersebut berfungsi membantu gerakan substansi-substansi dari
satu bagian sel ke bagian sel lainnya.

Jenis-jenis Retikulum Endoplasma

1. RE kasar

49

Di permukaan RE kasar, terdapat bintik-bintik yang merupakan ribosom.

Ribosom ini berperan dalam sintesis protein. Maka, fungsi utama RE kasar
adalah sebagai tempat sintesis protein.

2. RE halus
Berbeda dari RE kasar, RE halus tidak memiliki bintik-bintik ribosom di
permukaannya. RE halus berfungsi dalam beberapa proses metabolisme yaitu
sintesis lipid, metabolisme karbohidrat dan konsentrasi kalsium, detoksifikasi
obat-obatan, dan tempat melekatnya reseptor pada protein membran sel.

3. RE sarkoplasmik
RE sarkoplasmik adalah jenis khusus dari RE halus. RE sarkoplasmik ini
ditemukan pada otot licin dan otot lurik. Yang membedakan RE sarkoplasmik
dari RE halus adalah kandungan proteinnya. RE halus mensintesis molekul,
sementara RE sarkoplasmik menyimpan dan memompa ion kalsium. RE
sarkoplasmik berperan dalam pemicuan kontraksi otot.

Fungsi Retikulum Endoplasma

Jaring-jaring endoplasma adalah jaringan keping kecil-kecil yang tersebar bebas
di antara selaput selaput di seluruh sitoplasma dan membentuk saluran pengangkut
bahan. Jaring-jaring ini biasanya berhubungan dengan ribosom (titik-titik merah)
yang terdiri dari protein dan asam nukleat, atau RNA. Partikel-partikel tadi
mensintesis protein serta menerima perintah melalui RNA tersebut (Time Life, 1984).
Jadi fungsi RE adalah mendukung sintesis protein dan menyalurkan bahan
genetic antara inti sel dengan sitoplasma dan berfungsi sebagai alat transportasi zatzat di dalam sel itu sendiri.

50

Menjadi tempat penyimpan Calcium, bila sel berkontraksi maka calcium akan
dikeluarkan dari RE dan menuju ke sitosol

Memodifikasi protein yang disintesis oleh ribosom untuk disalurkan ke

kompleks golgi dan akhirnya dikeluarkan dari sel. (RE kasar)

Mensintesis lemak dan kolesterol, ini terjadi di hati (RE kasar dan RE halus)

Menetralkan racun (detoksifikasi) misalnya RE yang ada di dalam sel-sel hati.

Transportasi molekul-molekul dan bagian sel yang satu ke bagian sel yang
lain (RE kasar dan RE halus)

51

RETIKULUM ENDOPLASMA HALUS

Retikulum endoplasma (RE) adalah sistem yang luas dari tubulus yang saling
berhubungan dan cisternae (struktur rata seperti kantung), yang dapat ditemukan di
hampir semua sel eukariotik, kecuali sel darah merah mamalia. Retikulum
endoplasma kontinu dengan amplop nukleus. Retikulum endoplasma kasar dan
retikulum endoplasma halus pada dasarnya dari dua jenis retikulum endoplasma.

Perbedaan utama antara kedua jenis retikulum endoplasma adalah bahwa yang
kasar dipenuhi dengan ribosom terikat membran, sementara yang halus tidak
memiliki organel ini. Ribosom bertugas dalam sintesis protein. Retikulum
endoplasma kasar lebih menonjol dalam sel hati, karena mereka terlibat dalam

52

produksi protein. Jadi, sel-sel yang mengkhususkan diri dalam sintesis protein
memiliki retikulum endoplasma kasar yang lebih menonjol, sementara yang halus
lebih menonjol dalam sel-sel, yang memproduksi lipid.

Struktur Retikulum Endoplasma Halus

Retikulum endoplasma pada dasarnya adalah struktur dilipat terdiri dari
jaringan interkoneksi seperti kantung dan tubulus. Semua struktur (tubulus dan
kantung) yang diadakan di tempat mereka dengan sitoskeleton. Retikulum
endoplasma tetap dibatasi oleh membran fosfolipid. Di dalam membran, ada ruang
berisi cairan, yang dikenal sebagai ruang cisternal atau lumen. Lumen atau ruang
cisternal kontinu dengan ruang perinuklear. Sebuah bagian dari RE juga berlanjut
dengan amplop nukleus.
Perbedaan utama dalam struktur halus dan kasar adalah bahwa bagian yang
kasar mengandung ribosom pada permukaannya, yang memberikan penampilan yang

53

kasar. Retikulum endoplasma halus tidak mengandung organel sel ini, dan karenanya
nama retikulum endoplasma halus. Bagian RE halus terlihat seperti sekelompok
tubulus halus, dan lebih tubular dalam bentuk dari RE kasar. Tipe lain dari retikulum
endoplasma retikulum sarkoplasma adalah, yang merupakan jenis RE halus khusus
yang dapat ditemukan pada otot polos, serta otot lurik.

Fungsi Retikulum Endoplasma Halus

RE halus adalah organel penting yang ditemukan di kedua sel hewan dan
tumbuhan, di mana ia melakukan beberapa fungsi khusus. Fungsi RE halus dapat
bervariasi sampai batas tergantung pada jenis sel. Lebih umum, itu berkaitan dengan
melakukan proses metabolisme tertentu, yang dijelaskan di bawah ini.
1. Sintesis Karbohidrat dan Lipid
RE halus terutama berkaitan dengan sintesis karbohidrat dan lipid, dan kadangkadang, dengan metabolisme mereka. Hormon steroid yang diproduksi RE halus
terdapat dalam kelenjar adrenal dan endokrin. RE halus juga memproduksi
kolesterol dan membran fosfolipid, yang digunakan untuk pembentukan
membran.
Jadi, RE halus bertanggung jawab untuk sintesis dan perbaikan membran. Dalam
hati, RE halus memfasilitasi konversi glikogen yang disimpan untuk glukosa.
Enzim glukosa-6-fosfatase yang terdapat pada SER mengambil bagian dalam
glukoneogenesis dengan mengubah glukosa-6-fosfat menjadi glukosa.
2. Transportasi Protein

54

1 Meskipun RE halus tidak mengambil bagian dalam sintesis protein

seperti RE kasar, memainkan peran penting dalam transportasi protein. Ini
mengatur transportasi protein dengan bertindak sebagai daerah transisi
untuk vesikel yang mentransfer protein ke berbagai lokasi. RE halus juga
mengangkut produk dari RE kasar ke aparat Golgi dan bagian lain dari sel.
3. Detoksifikasi
2 Salah satu fungsi yang paling penting dari RE halus adalah untuk
detoksifikasi tubuh dari limbah metabolik dan obat-obatan. Obat
detoksifikasi, serta detoksifikasi limbah yang dihasilkan dalam proses
metabolisme terjadi pada RE halus yang terdapat dalam sel-sel hati. Ini
berisi enzim yang mengkatalisis sejumlah reaksi yang dapat membuat obat
larut lemak dan limbah metabolik yang larut dalam air, sehingga mereka
dapat dengan mudah dikeluarkan dari tubuh.
3 Ketika sejumlah besar obat-obatan atau alkohol masuk ke sistem
peredaran darah, produksi enzim detoksifikasi meningkat oleh sel-sel hati.
Untuk menjalankan fungsi detoksifikasi, RE halus menggandakan luas
permukaannya. Setelah obat atau racun tertentu telah dieliminasi dari
tubuh, kelebihan RE halus dihancurkan oleh proses yang disebut
autofagositosis.
4. Fungsi penting lainnya
4 Retikulum

endoplasma,

termasuk

RE

halus

menyediakan

luas

permukaan untuk tindakan dan penyimpanan enzim dan produk mereka.

RE halus menempel reseptor ke sel membran protein, dan menyimpan
kalsium dalam sel otot. Fungsi ini penting dilakukan oleh retikulum
sarkoplasma, yang merupakan jenis RE halus yang khusus terdapat dalam
sel-sel otot. Dengan melepaskan ion kalsium, RE halus juga mengatur
kontraksi otot.
5. Jadi, retikulum endoplasma halus memainkan peran penting dalam
berbagai proses metabolisme. Keberadaannya sangat penting untuk

55

beberapa proses mempertahankan hidup, seperti transportasi protein,

karbohidrat dan sintesis lipid, dan detoksifikasi obat.

56

Retikulum Endoplasma Kasar

Retikulum endoplasma kasar (RE kasar) adalah organel yang kompleks terikat
membran dan terlibat dalam transportasi protein yang dibuat oleh ribosom di
permukaannya. Ditemukan dalam sel eukariotik sel tumbuhan, hewan, dan manusia
retikulum endoplasma kasar mengalami perubahan sesuai dengan kebutuhan sel.
Ketika sel secara aktif membuat protein, RE kasar dapat membesar dan menjadi lebih
kompleks. Ribosom yang seperti titik bergerak di permukaannya ke membran ketika
mereka mulai membuat protein dan bergerak ketika mereka selesai. Fungsi retikulum
endoplasma kasar erat terikat pada produksi dan transportasi protein dalam sel.

Bentuknya seperti labirin yang kontinu tiga dimensi, RE kasar adalah sistem
membran yang membentang dari inti sel ke membran sel. Selama sintesis protein,
ribosom pada RE kasar adalah situs di mana asam ribonukleat utusan (mRNA)
membangun protein sesuai dengan kode tertentu yang dibawanya. Saat protein yang
dihasilkan, itu akan bergerak ke bagian dalam organel, di mana ia menunggu
transportasi. Setelah protein selesai, sedikit membran RE kasar terputus untuk

57

membentuk vesikel di sekitar protein. Jika protein yang dibutuhkan dalam sel,
mungkin diangkut dalam vesikel ke aparatus Golgi atau ditransfer ke organel lainnya.

Retikulum endoplasma

Protein yang dibutuhkan di luar sel bergerak melalui RE kasar ke membran

sel. Hormon adalah contoh dari protein yang sel-sel mensekresi melalui RE kasar.
Membran organel kontinu dengan membran sel, sehingga protein dapat melakukan
perjalanan langsung melalui RE kasar ke luar sel. Sel yang aktif memproduksi
hormon mungkin memiliki ER kasar yang diperbesar untuk mengakomodasi sintesis
protein ini.

Fungsi lain dari retikulum endoplasma kasar adalah modifikasi dari beberapa
protein yang diproduksi oleh ribosom. Setelah protein memasuki jalur di bagian
dalam RE kasar, enzim bisa menambahkan molekul lain untuk itu. Disini protein
diubah kemudian dipindahkan ke tempat yang membutuhkannya. Di dalam RE kasar,

58

beberapa protein mungkin disimpan sementara yang lain diurutkan. Protein yang
cacat diidentifikasi dan berhenti dari transportasi lebih lanjut.

59

RIBOSOM
1. Sejarah Penemuan Ribosom
Ribosom pertama kali diteliti pada pertengahan tahun 1950-an oleh
George Emil Palade, ilmuwan biologi sel yang berkebangsaan Romania,
dengan menggunakan mikroskop elektron. Kata ribosom pertama kali
digunakan oleh ilmuwan Richard B. Roberts pada tahun 1958. Istilah ribosom
berasal dari bahasa Yunani soma yang berarti badan dan ribonucleic acid
(asam ribonukleat). Albert Claude, Christian de Duve, dan George Emil
Palade bersama-sama mendapatkan Hadiah Nobel dalam bidang psikologi dan
kesehatan pada tahun 1974 karena penelitiannya tentang ribosom. Hadiah
Nobel dalam bidang kimia tahun 2009 didapatkan oleh Venkatraman
Ramakrishnan, Thomas A. Steitz, dan Ada E. Yonath karena berhasil
menjelaskan struktur rinci dan mekanisme ribosom.
2. Pengertian Ribosom
Ribosom merupakan partikel padat yang tidak dibatasi membran.
Ribosom merupakan partikel yang kompak/padat yang terdiri dari
ribonukleoprotein, melekat atau tidak pada permukaan external dari membran
RE, yang memungkinkan sintesa protein. Ribosom adalah komponen sel yang
membuat protein dari semua asam amino. Ribosom merupakan organel kecil
dan padat dalam sel yang berfungsi sebagai tempat sintesis protein. Ribosom
berdiameter sekitar 20 nm serta terdiri atas 65% RNAribosom (rRNA) dan
35% protein ribosom (disebut Ribonukleoprotein atau RNP). Organel ini
menerjemahkan mRNA untuk membentuk rantai polipeptida (yaitu protein)
menggunakan asam amino yang dibawa oleh tRNA pada proses translasi. Di
dalam sel, ribosom tersuspensi di dalam sitosol atau terikat pada retikulum
endoplasma kasar, atau pada membran inti sel. Ribosom dibagi menjadi dua

60

subunit, dimana sub unit yang satu lebih besar daripada yang lain. Mengikat
subunit kecil untuk mRNA, sedangkan mengikat subunit yang lebih besar
untuk tRNA dan asam amino.
3. Struktur Ribosom
Pemahaman mengenai struktur ribosom telah dikembangkan secara
berangsur-angsur lebih dari 50 tahun, dan semakin banyak struktur yang telah
diaplikasikan untuk masalah ini. Awalnya disebut microsom. Pada tahun 1940
dan 1950, mikroskop elektron pertama menunjukan bahwa ribosom bakteri
berbentuk oval dengan ukuran 29 nm x 21 nm, lebih kecil dari ribosom
eukariot, dan bermacam-macam ukuran kecil tersebut bergantung pada
spesiesnya dengan ciri-ciri sekitar 32 nm x 22nm. Dalam pertengahan 1950an
penemuan ribosom adalah pada daerah sintesis protein yang di stimulasi
percobaan untuk menggambarkan struktur partikel ini dengan lebih detail.
Awal proses kemajuan dalam memahami struktur ribosom secara
terperinci, tidak datang dari pengamatan dengan mikroskop elektron tetapi
dari analisis komponennya dengan ultrasentifugasi. Ribosom utuh memiliki
koefisien sedimentasi 80s untuk eukariot dan 70s untuk bacteria, dan masingmasing dapat dipecah atau dibagi dalam komponennya lebih kecil.
Masing-masing ribosom meliputi 2 subunit, pada prokariot subunit ini 60s dan
40s. Pada bakteria adalah 50s dan 30s, dengan catatan koefisien sedimentasi
tidak additive karena hal terebut tergantung pada bentuk seperti halnya
masa.Subunit terbesar berisi 3 rRNAs pada eukariot ( 285, 5.85 dan 55 rRNAs
) tapi hanya ada 2 pada bacteria ( 235 dan 53 rRNAs ).
Ribosom merupakan partikel yang padat terdiri dari ribonukleoprotein.
Ribosom ada yang tersebar secara bebas di sitoplasma dan ada yang melekat
pada permukaan external dari membran Retikulum Endoplasma. Ribosom ini
adalah organel yang memungkinkan terjadinya sintesa protein.
4. Sifat Ribosom
1) Bentuknya universal, pada potongan longitudinal berbentuk elips.

61

2) Pada teknik pewarnaan negatif, tampak adanya satu alur transversal,

tegak lurus pada sumbu, terbagi dalam dua sub unit yang memiliki
dimensi berbeda.
3) Dengan ultrasentrifugasi yang menurun pada kedua sub unit ribosom
tersebut dapat dipisahkan sehingga penyusunnya dapat dideterminasis.
Sub unit-sub unit berasosiasi secara tegak lurus pada bagian sumbu
dalam aiur yang memisahkannya.
4) Dimensi ribosom serta bentuk menjadi bervariasi. Pada prokariot,
panjang ribosom adalah 29 nm dengan besar 21 nm. Dan eukariot,
ukurannya 32 nm dengan besar 22 nm.
5) Pada prokariot sub unitnya kecil, memanjang, bentuk melengkung
dengan 2 ekstremitas, memiliki 3 digitasi, menyerupai kursi. Pada
eukariot, bentuk sub unit besar menyerupai ribosom E. coli.
5. Komposisi Kimia Ribosom
5.1 Asam nukleat ribosom
Sub unit besar dibentuk dari protein dan RNA dalam kuantitas yang
seimbang, mengandung 2 tipe rRNA, yakni:
1) Satu rRNA 28S
2) Satu rRNA SS
Sub unit kecil mengandung r RNA 18s.
Diketahui bahwa, dengan ketiadaan RNA 185, maka sub unit
besar tidak dapat berasosiasi pada sub unit kecil. Sedangkan RNA 28s
memungkinkan asosiasi tersebut. RNA SS melekat pada sequence asam
nukleat ini yaitu tRNA. Bilamana terbaca maka tRNA melekat pada site
yang merupakan bagian RNA 285. Perpindahan dari tRNA yang melekat
pada molekul mRNA menyebabkan pergerakan translasi mRNA masingmasing.
6. Fungsi Ribosom
Ribosom berfungsi sebagai tempat sintesis protein dan merupakan
contoh organel yang tidak bermembran. Organel ini terutama disusun oleh

62

asam ribonukleat, dan terdapat bebas dalam sitoplasma maupun melekat pada
RE. Proses jalannya sintesis protein
Sebelum pembelahan sel, DNA di dalam kromosom mengganda
sehingga

setiap

sel

anak

memiliki

kromosom

yang

sama.

DNA

bertanggungjawab untuk mengkode semua protein. Setiap asam amino di

kode oleh satu atau lebih triplet nukleotida. Kode ini dihasilkan dari satu untai
DNA melalui proses yang disebut dengan transkripsi. Proses ini menghasilkan
mRNA yang akan dibawa keluar dari inti untuk selanjutnya diterjemahkan
menjadi protein. Hal ini dapat dilakukan karena pada sitoplasma terdapat
kelompok ribosom yang disebut dengan poliribosom. Atau dapat dilakukan
pada ribosom yang menempel pada reticulum endoplasma.
Kode seperti yang disebut di atas diterjemahkan pada suatu struktur
yang disebut ribosom yang juga dibuat di dalam inti. Ribosom ini merupakan
tempat bagi mRNA di mana mRNA akan terikat. Asam amino untuk sintesis
protein akan di bawa ketempat ini oleh RNA transfer (tRNA). Setiap tRNA
memiliki triplet yang akan berikatan dengan urutan nuklotida yang sesuai
pada mRNA. Sebagai contoh fenil alanin yang terikat pada tRNA yang miliki
tiplet AAA (adenin-adenin-adenin) akan berikatan dengan urutan nukleotida
yang sesuai pada mRNA yaitu UUU (urasil, urasil, urasil).
Jenis dan rangkaian asam amino yang menyusun protein berbeda
antara protein yang satu dan protein yang lainnya. Mekanisme sintesis protein
terjadi melalui dua tahap, yakni transkripsi dan translasi.
1) Transkripsi
Tahap pertama dari sintesis protein adalah transkripsi. Proses ini
berlangsung di dalam inti sel. Transkripsi merupakan proses sintesis
langsung RNA dan DNA.
Pada saat inti sel memerintahkan perlunya sintesis protein, informasi
DNA di alihkan melalui RNA pembawa pesan yang disebut RNA
mesenger (mRNA). mRNA berisikan salinan langsung pasangan basa
dari DNA. Tahap inilah yang dinamakan dengan transkripsi. Transkrip
berarti salinan. Kode genetik disalin dari DNA untuk dibawa keluar

63

dari nukleus menuju lokasi pembuatan protein di ribosom yang berada

di sitoplasma. Urutan basa nitrogen yang di bawa ke luar nukleus
dalam mRNA ini dinamakan sebagai kodon. Dalam proses transkripsi,
banyak proses enzimatik yang terjadi, seperti pemutusan ikatan-ikatan
hidrogen pada rantai DNA serta pembacaan urutan basa nitrogen yang
prosesnya mirip dengan duplikasi DNA.

Gambar. Transkripsi
Tahap inisiasi dimulai dengan pengenalan daerah gen di DNA oleh
enzim RNA polimerase. Daerah ini dinamakan dengan promoter, yakni
tempat dimulainya dintesis pasangan DNA oleh RNA. Daerah DNA
yang disalin hanyala satu bagian rantai saja yang dinamakan dengan
sense (daerah template) dan rantai yang lainnya dinamakan rantai
antisense. Pembacaan DNA oleh RNA polimerase ini dimaulai dari
ujung 3 menuju ujung 5 dan tidak pernah sebaliknya. RNA
polimerase akan membuka iktan double helix pada bagian gen yang
dikenali kemudian akan menyalin urutan basa yang ada pada DNA
sense (template) sehingga terbentuk DNA baru dari arah ujung 5
menuju ujung 3. Proses ini dinamakan elongasi.

64

Proses transkripsi diakhiri jika gen di daerah rantai template telah

selesai dibaca (terdapat kodon stop). DNA memiliki mekanisme agar
RNA polimerase dapat mengenali akhir dari gen dengan kode basa
tertentu, daerah ini dikenal dengan nama terminator. Proses akhir dari
transkripsi ini dinamakan dengan terminasi. Selain itu, rantai mRNA
akan keluar dari DNA menuju ribosom di sitoplasma.
2) Translasi
mRNA mengandung urutan basa yang akan diterjemahkan menjadi
protein (asam amino). Kode genetik, yang dibawa di dalamnya
(kodon) dibaca dalam urutan tiga basa (triplet) menjadi protein. Proses
penerjemah kodon menjadi protein atau yang disebut dengan translasi.
Langkah-langkah transkripsi dan translasi dan transisi dapat
diperhatikan pada gambar.

Gambar. Proses sintesis protein melibatkan mRNA dan tRNA

65

VAKUOLA

Vakuola pada Sel Tumbuhan

Vakuola merupakan rongga yang berada di dalam sel. Vakuola dan vesikula
merupakan kantung terikat membran di dalam sel, tetapi vakuola lebih besar dari
vesikula. Vakuola dibatasi oleh selapis membran berisi cairan yang disebut cairan sel.
Sel tumbuhan dan sel hewan mempunyai vakuola. Akan tetapi pada sel hewan,
ukuran vakuola lebih kecil dan berjumlah lebih banyak daripada sel tumbuhan.

Vakuola sel tumbuhan bekembang dengan adanya penggabungan atau fusi dari
vesikula-vesikula dan vakuola yang berukuran lebih kecil. Pada sel tumbuhan yang
telah dewasa, umumnya terdapat vakuola tengah (vakuola sentral), yang berukuran

66

besar dan dikelilingi oleh membran. Membran tersebut disebut tonoplas yang
merupakan bagian dari sistem endomembrannya. Vakuola sentral biasanya
merupakan ruangan terbesar dalam sel tumbuhan, yang meliputi 80% atau lebih dari
sel dewasanya. Vakuola sentral berisi cairan yang mengandung banyak garam
mineral, asam organik, gula, oksigen, pigmen, CO2, dan zat-zat sisa metabolisme.
Fungsi vakuola termasuk penyimpanan, pembuangan limbah, dan pertumbuhan.
Vakuola sel tumbuhan merupakan ruangan yang serbaguna. Vakuola ini
merupakan tempat penyimpanan senyawa organik, seperti protein yang ditumpuk
dalam vakuola sel penyimpanan dalam benih. Vakuola ini juga merupakan tempat
penimbunan ion anorganik yang utama dari sel tumbuhan, seperti kalium dan klorida.
Banyak sel tumbuhan menggunakan vakuolanya sebagai tempat pembuangan produk
samping metabolisme yang akan membahayakan sel itu sendiri jika produk samping
ini terakumulasi dalam sitosol. Sebagian vakuola mengandung banyak pigmen yang
mewarnai sel tersebut, seperti pigmen merah dan biru dari mahkota bungan yang
membantu memikat serangga penyerbuk untuk datang ke bunga tersebut. Vakuola
dapat juga membantu melindungi tumbuhan melawan pemangsanya karena
mengandung senyawa beracun atau beraroma tidak sedap bagi hewan. (Campbell, et
al. 1987)
Menurut Oman Karmana (2008) fungsi vakuola secra umum antara lain;
1) Memasukkan air melalui tonoplas agar tegangan turgor sel tetap baik
2) Menyimpan makanan, seperti sukrosa, protei, garam-garam mineral, dan
senywa organik lainnya
3) Menyimpan sisa-sisa metabolisme, seperti alkaloid, kristal kalsium, oksalat,
tanin, dan getah.

Vakuola Hewan

67

Vakuola adalah membran-terikat organel penyimpanan, yang membantu

dalam mengatur

tekanan turgor dari sel tumbuhan. Dalam sel tumbuhan, bisa

terdapat lebih dari satu vakuola.

Namun,

daripada yang lain, yang menyimpan segala

vakuola memiliki bentuk lebih besar

macam senyawa kimia. Vakuola juga

membantu dalam pencernaan intraselular molekul

kompleks dan ekskresi

produk-produk sisa.
Vakuola pada hewan membantu dalam proses eksositosis dan endositosis.
Vakuola pada hewan berukuran lebih kecil daripada vakuola yang terdapat pada
tumbuhan tetapi jumlahnya

lebih

banyak. Ada juga sel-sel hewan yang tidak

memiliki vakuola. Selaput pembatas antara vakuola

Tonoplas vakuola.
Struktur Vakuola

dengan sitoplasma disebut

68

Sel tumbuhan sentral vakuola adalah kompartemen serbaguna Ini dapat

menahan resen'es senyawa organik yang penting, seperti protein ditimbun dalam
vakuola sel penyimpanan dalam biji. sekarang juga repositori utama sel tumbuhan
ion anorganik, seperti kalium dan klorida.
Vakuola terbagi menjadi dua, yaitu:
1. Vakuola kontraktil
Vakuola kontraktil disebut juga vakuola berdenyut. Vakuola kontraktil
memiliki fungsi sebagai osmoregulator yaitu mengatur nilai osmotik dalam sel.
2. Vakuola non-kontraktil
Vakuola nonkontraktil disebut juga vakuola makanan, yang berfungsi untuk
mencerna makanan dan mengedarkan hasil pencernaan makanan ke seluruh tubuh.
Berbagai zat maupun molekul yang mengisi vakuola, diantaranya adalah:
1. Berbagai macam gas seperti oksigen dan karbondioksida.
2. Asam amino, baik yang merupakan hasil metabolisme maupun sisa
metabolisme.
3. Garam-garam organik yang disimpan atau dibuang ke luar sel.
4. Glikosida.
5. Tanin atau z t penyamak.
6. Minyak atsiri, zat yang menimbulkan aroma pada tumbuhan seperti roseine
pada mawar dan zingiberine pada jahe.
7. Zat-zat alkaloid, seperti kafein yang terdapat pada biji kopi, nikotin dalam
daun

tembakau, tein yang ditemukan di kandungan daun teh, teobromin

69

pada biji coklat, solanin

yang terdapat pada umbi kentang, dan

sebagainya.
8. Berbagai enzim.
9. Dan sejumlah butir-butir pati.
Fungsi Vakuola
1. Memasukkan air melalui tonoplas yang bersifat diferensial permiabel untuk
membangun turgor sel.
2. Tempat penyimpanan zat cadangan makanan seperti amilum dan glukosa.
3. Mampu memfasilitasi proses sirkulasi zat dalam sel.
4. Vakuola ada yang berisi pigmen pada daun, bunga, dan buah dalam bentuk
larutan, seperti antosian, termasuk antosianin yang berwarna merah, biru, dan
lembayung, juga warna gading dan kuning. Antosian dapat memberi warna
pada bunga, buah, pucuk, dan daun. Hal ini, berguna untuk menarik
serangga, burung, dan hewan lain yang berjasa bagi penyerbukan atau
persebaran biji.
5. Tempat penyimpanan minyak atsirik (golongan minyak yang memberikan
bau khas seperti minyak kayu putih).
6. Vakuola tumbuhan, kadang-kadang mengandung enzim hidrolitik yang dapat
bertindak

sebagai lisosom waktu hidup. Setelah sel mati, tonoplas

kehilangan sifat diferensial permiabelnya sehingga enzim-enzimnya lolos

keluar menyebabkan autolisis (penghancuran diri).
7. Mengatur tirgiditas sel (tekanan osmotik sel).

70

8. Menjadi tempat penyimpanan zat makanan terlarut yang sewaktu-waktu

dapat

digunakan oleh sitoplasma. Misalnya, sukrosa, gilikogen, dan

garam mineral.
9. Tempat penimbunan sisa metabolisme dan metabolik sekunder seperti getah
karet, alkaloid, tanin, dan kalsium oksalat.

71

APPARATUS GOLGI
A. STRUKTUR BADAN GOLGI
Badan Golgi adalah sebutan terhadap kantong-kantong khas yang terdapat
hampir di semua sel eukariotik. Nama ini diberikan pertama kali oleh seorang
sitologiawan Italia bernama Camillo Golgi, yang pertama-tama menjelaskan organel
ini pada akhir abad sembilan belas. (Salisbury dan Ross, 1995). Badan Golgi
terbentuk oleh susunan lempengan kantong-kantong yang khas dikelilingi membran.
Lempengan kantong ini disebut sisterna. Dalam sel tumbuhan, badan Golgi terdiri
atas susunan dari beberapa sisterna. Pada penghujung kantong terdapat kantongkantong bulat kecil atau vesikula yang menempel dan yang seolah-olah terjentik dari
ujung kantong yang berukuran lebih besar (Sheeler and Bianchi, 1987). Badan Golgi
mempunyai bentuk yang berbeda pada sel eukariotik yang berlainan. Perbedaan ini
terlihat terutama dari bentuk susunan kantong-kantong pipih yang masing-masing
dikelilingi membran tunggal yang disebut sisterna. Dalam sel tumbuhan, badan Golgi
terdiri atas susunan dari beberapa sisterna. Pada umumnya badan Golgi mempunyai 4
6 sisterna yang berjarak sekitar 10 nm antara satu sama lain. Pada tanaman tertentu
badan Golgi ini terbentuk dalam jumlah yang lebih besar kadang-kadang 20 atau
lebih. Lebar masing-masing sisterna bervariasi antara 500 1000 nm (Lehninger,
1993).

72

Sisterna yang sedang tumbuh berada pada posisi terbawah dengan pinggiran
kantong yang mulai menggelembung disebut sebagai permukaan cis badan Golgi.
Sisterna yang sudah melalui pertumbuhan dengan pinggiran kantong yang
menggelembung lebih besar berada pada posisi teratas yang disebut permukaan
trans. Sisterna yang berada diantara permukaan cis dan trans merupakan kantongkantong yang sedang tumbuh dan bergerak hingga mencapai permukaan trans.
Bentuk badan Golgi dalam proyeksi tiga dimensi dapat dilihat pada Gambar 2.

73

B. PEMBENTUKAN BADAN GOLGI

Pembentukan intraselular badan Golgi telah lama menjadi topik yang hangat
diperdebatkan. Diantara berbagai pendapat mengatakan bahwa badan Golgi berasal
dari :
1.

Vesikula-vesikula yang melepas dari membran luar pembungkus (yang

menyelubungi) inti.

2. Vesikula yang dikirim dari retikulum endoplasma

3. Vesikula-vesikula yang dibentuk oleh tonjolan ke dalam dari membran
plasma.
4. Pembelahan badan Golgi yang terdapat di dalam sel.
Dari beberapa pendapat di atas, pendapat yang diterima secara luas ialah pendapat
yang mengatakan bahwa badan Golgi berasal dari vesikula yang dikirim dari
Retikulum Endoplasma. Vesikula ini disebut vesikula transisi (Sheeler and Bianchi,

74

1987). Vesikula transisi yang dikirim dari Retikulum Endoplasma (RE) bermigrasi
dan lalu melebur dengan membran sisterna yang ada sedemikian rupa untuk
membentuk badan Golgi dan mewujudkan pertumbuhan organel.
Agregasi vesikula transisi dalam sel terdapat pada daerah tertentu dalam
cytoplasma yang disebut zona ekslusi yang bebas dari ribosom. Zona ini sering
dikelilingi oleh membran Retikulum Endoplasma. Badan Golgi berukuran kecil
diduga muncul dan berkembang pada zona ini. Perkembangan badan Golgi dapat
terlihat terutama pada pembelahan sel-sel tumbuhan dan hewan, di mana jumlah
badan Golgi dalam sel meningkat sehingga jumlah badan Golgi pada masing-masing
sel hasil pembelahan lebih kurang adalah sama dengan jumlah badan Golgi pada
induk sebelumnya. Pembentukan badan Golgi yang lengkap diperkirakan berlangsung
dengan cara seperti yang ditunjukkan pada gambar 3.

75

C. FUNGSI BADAN GOLGI DALAM METABOLISME SEL

Badan Golgi sebagai organel sel eukariotik mempunyai fungsi yang beragam, antara
lain:
1. mengemas bahan-bahan sekresi yang akan dibebas-kan dari sel
2. memproses protein-protein yang telah disintesa oleh ribosom dari retikulum
endoplasma
3. mensintesa polisakarida tertentu dan glycolipids
4. memilih protein untuk berbagai lokasi di dalam sel
5. memperbanyak elemen membran yang baru bagi membran plasma

76

6. memproses kembali komponen-komponen membran plasma yang telah

memasuki sitosol selama endositosis.
Badan Golgi berperan dalam banyak proses selular yang berbeda tetapi yang utama
adalah dalam hal sekresi (Sheeler and Bianchi, 1987). Badan Golgi menerima produk
sel tertentu dari RE dan membawa produk ini ke dalam vesikula sekretori yang akan
meneruskan lintasannya menuju ke bagian luar membran plasma sel, dan berdiffusi
dengan membran. Bagian ini dapat terbuka untuk membebaskan isi vesikula keluar.
Proses ini disebut eksositosis (Lehninger, 1993). Protein yang disintesis oleh RE
dipindahkan ke dalam badan Golgi. Disini karbohidrat tambahan dapat dibubuhkan
kepadanya. Protein-protein ini terkumpul di dalam vesikula tadi sampai penuh.
Vesikula-vesikula ini dapat berpindah ke permukaan sel dan mengeluarkan isinya ke
bagian luar. Vesikula-vesikula berprotein yang lain pada badan Golgi dapat disimpan
di dalam sel sebagai lisosom (Kimbal, 1983). Pemrosesan protein dimulai pada RE
dan dilanjutkan di dalam sisterna badan Golgi. Protein ditransfer ke bagian cis
diktiosom. Semua glycoprotein dari RE yang sampai pada cis badan Golgi memiliki
cincin oligosakarida. Sebelum melewati satu sisterna Golgi ke sisterna berikutnya,
protein akan mengalami pemrosesan. Misalnya di dalam sisterna cis, kelompok fospat
ditambahkan pada akhir cincin oligosakarida dari protein untuk lisosom, sekresi
protein dan protein untuk membran plasma yang akan menjalani pengolahan ekstensif
(Sheeler and Bianchi, 1987). Di samping peranannya di dalam sekresi, badan Golgi
berperan dalam mempersiapkan elemen-elemen membran untuk organel seperti
lisosom dan membran plasma. Protein yang ditujukan sebagai komponen membran
lisosom atau membran plasma ditambatkan pada membran RE. Pada saat sintesis,
protein kemungkinan bergerak dari RE ke bagian cis, dan dari bagian cis melalui
sisterna medial ke bagian trans sebagai komponen membran. Membran dari
pembuluh ini keluar dari permukaan trans yang mengandung protein. Pembuluh ini
mengandung protein sekresi yang digabungkan dengan membran plasma dan

77

mengosongkan isinya diluar sel (Sheeler and Bianchi, 1987). Gambaran proses ini
disajikan pada gambar 4 berikut.

Beberapa vesikula yang berada di dekat membran plasma yang bersebelahan dengan
dinding sel, melebur antara vesikula dengan membran plasma hingga menambah luas
permukaan membrane sewaktu sel tumbuh (Salisbury and Ross, 1995). Badan Golgi
juga bertindak memilih protein. Protein yang ditujukan untuk granular sekresi,
lisosom dan membran plasma dikirimkan ke cis dari diktiosom sepanjang adanya
kelebihan protein membran RE. Protein RE diyakini kembali ke reticulum

78

endoplasma oleh pembuluh kecil yang dibebaskan dari cis sisterna Rothman (Dalam
Sheeler and Bianchi, 1987) menyatakan bahwa diktiosom terdiri dari tiga
kompartemen, yaitu kompartemen cis, kompartemen medial dan kompartemen trans.
Kompartemen cis menyortir dan melepaskan protein RE serta menambahkan phosfat
pada terminal gula dari protein lisosom. Kompartemen medial (bagian tengah
sisterna) adalah tempat dimana N-acetyglucosamine ditambahkan. Penambahan
galaktosa terminal dan asam N-acetylneuraminik terjadi dalam kompartemen trans
dan juga di mana berbagai protein akan diurutkan berdasarkan tujuan akhir. Peranan
lainnya dari badan Golgi selain mempersiapkan elemen-elemen membran plasma
yang baru, juga terlibat dalam pemrosesan kembali membran plasma yang memasuki
sitosol selama endositosis
Komponen-komponen membran yang memasuki badan Golgi menyusul endositosis
dapat diproses dan digunakan kembali dalam sekresi, dan pada pembentukan lisosom
atau perbaikan membrane plasma itu sendiri (Sheeler and Bianchi, 1987).

KESIMPULAN
1) Badan Golgi adalah salah satu organel dengan fungsi dan peranan yang khas
dalam sel eukariotik.

79

2) Badan Golgi berbentuk tumpukan (stack) dari sejumlah lempengan atau

sisterna dengan pinggiran yang menggelembung dikelilingi kantong-kantong
bulat kecil atau vesikula.
3) Pembentukan badan Golgi baru berawal dari terbentuknya sisterna hasil
penggabungan vesikula yang berasal berbagai sumber dalam sel. Sumber yang
lebih diyakini secara luas adalah retikulum endoplasma.
4) Fungsi dan peranan badan Golgi ialah untuk mengangkut material ke berbagai
tujuan selular, terutama dalam hal sekresi.

LISOSOM

Lisosom merupakan terikat membran dari enzim hidrolitik yang digunakan

oleh sel untuk mencerna makromolekul. Organel ini bermembran bulat, dengan
diameter yang begitu kecil (hanya 0,2 m sampai 0,4 m) sehingga sukar dilihat
dalam mikroskop. Jumlah lisosom dalam sangat bervariasi menurut jenis selnya.
Namun ciri paling mencolok pada organel khusus ini adalah bahwa ia mengandung
sejumlah besar enzim hidrolase asam yang aktivitas enzimnya akti pada keadaan pH
kurang lebih 5. Lisosom berasal dari kata lyso = pencernaan dan soma = tubuh.

80

Lisosom merupakan kantong yang berbentuk agak bulat dikelilingi membrane

tunggal

yang

digunakan

sel

untuk

mencerna

makromolekul.

Gambar 1. Lisosom berbentuk agak bulat yang dikelilingi membran tunggal dan
berisi enzim hidrolitik.

2.1 Sejarah Penemuan Lisosom

Lisosom ditemukan pada tahun 1950 oleh Christian de Duve dan

dipostulatkan olehnya pada tahun 1955 dari data biokimia. Sebelumnya de Duve dan
kawan-kawannya mencoba meneliti kandungan enzim dari fraksi-fraksi yang
dipisahkan dari homogenate sel hati tikus melalui pemusingan atau sentrifugasi
deferensial. Hal menarik perhatian mereka adalah penelitian tentang enzim dan fraksi
yang dikandung oleh mitokondria. Mereka mencoba memperhalus prosedur
pemusingan, dan mereka berhasil mendapat fraksi yang kompleks, walau serupa

81

dengan mitokondria dan sifat-sifat sedimentasinya, tetapi ada enzim yang berbeda
dengan apa yang ada pada mitokondria.

Dalam fraksi ini mereka secara tidak sengaja mendapat sejumlah enzim hidrolitik,
termasuk fosfatase asam. Mereka kemudian melakukan eksprimen biokimia yang
menghasilkan postulat bahwa enzim hidrolik akan tertampung dalam vasikel
berukuran 0,4 m, dan bahwa setiap vesikel akan dibatasi membran yang mencegah
enzim ini bereaksi dengan substrat dalam sitoplasma. Menyadari bahwa badan-badan
kecil dalam fraksi ini bukan mitokondria tetapi,malahan sejenis organel sitoplasma
baru. Akhirnya mereka pun mengusulkan nama lisosom untuk organel sel ini.

Lisosom ditemukan setelah mempelajari distribusi beberapa jenis enzim yang terlibat
di dalam metabolisme karbohidrat. Salah satu enzim yang terlibat di dalam
metabolisme karbohidrat. Salah satu enzim yang dipelajari adalah fosfatase asam
yang memecah gugus fosfat pada beberapa fosfat yang mengandung ester fosfat.

82

Gambar 2. Foto mikrograf electron kelompok lisosom dekat mitokondria (Sheeler

dan Bianchii, 1983)

Lisosom adalah vesikula yang berbatas membran dimana di dalamnya

terkandung enzim hidrolase. Suatu organel dapat didefinisikan sebagai lisosom
bilamana memenuhi beberapa kriteria, yaitu:

1.

Organel

yang

bersangkutan

berbatas

membran;

2.

Mengandung dua atau lebih enzim-enzim hidrolase yang semuanya adalah

asam
hidrolase;
3.

Memiliki sifat kelatenan enzim.

Lisosom dibatasi oleh membran tunggal dan di dalamnya terkandung kurang

lebih 40 jenis enzim yang semuanya adalah enzim hidrolase seperti protease,
nuklease, glikosidase, lipase, fosfolipase, fosfatase, dan sulfatase. Enzim-enzim
hidrolase bekerja dengan baik pada pH kurang lebih 5. Untuk mempertahankan pH
tersebut, maka secara terus menerus terjadi pemompa- an ion hidrogen ke dalam
lumen lisosom dengan melibatkan hidrolisis ATP sebagai sumber energi. Lisosom
memiliki protein maker yang disebut sebagai Docking-marker acceptor. Dengan
demikian, lisosom akan dapat berfusi dengan vesikula-vesikula target dengan tepat.

83

Beberapa molekul sederhana dapat menembus membran lisosom, misalnya

quinakrin. Quinakrin dapat meningkatkan pH di dalam lisosom jika diberikan ke
dalam sel. Quinakrin digunakan di laboratorium sebagai inhibitor fungsi lisosom.
Lisosom memiliki fungi pencernaan intra sel yang sangat luas meliputi pencernaan
bahan-bahan intra dan ekstra sel, mikroorganisme yang telah difagositosis dan
program

kematian

sel

selama

organogenesis.

Enzim-enzim hidrolase memiliki kemampuan untuk memecahkan berbagai

jenis molekul organik seperti polisakarida, protein, lipida, fosfolipida, dan asam-asam
nukleat.

2.2 Macam-macam Lisosom

Jika ditinjau dari segi fisiologis, lisosom terdiri dari dua kategori yaitu
lisosom primer yang berisi enzim-enzim hidrolase dan lisosom sekunder yang selain
berisi hidrolase juga terdapat substrat yang sedang dicerna. Kategori yang terakhir
adalah vakuola pencernaan yang berasal dari fusi antara fagosoma atau endosoma
dengan

lisosom

primer

pada

beberapa

macam

sel

hewan.

Lisosom berasal dari pembentukan tunas sisterna Aparatus Golgi pada sisi
trans. Lisosom primer pada umumnya adalah vesikuli yang bersalutkan protein yang
disebut klatrin. Klatrin akan lepas begitu vesikuli juga lepas.

2.3 Enzim-enzim Lisosom

84

Ada banyak macam enzim yang terkandung dalam lisosom. Jika dikelompokkelompokkan, maka ada kelompok enzim fosfatase, nuclease, protease, dan enzim
pemecah lipid. Dari semua kelompok enzim ini, enzim fosfatase asam adalah yang
terbanyak.substratnya sebagian besar adalah ester dan lisosomnyasendiri berasal dari
jaringan-jaringan hewan, tumbuhan maupun protista. Enzim fosfatase yang lain
adalah monofosfat dan fosfodiesterase asam yang substratnya oligonukleotida dan
diester fosfat.

Enzim yang tergolong dalam nuclease adalah RNA ase substratnya RNA, dan
DNA ase substratnya DNA. Asal lisosom keduanya sama yaitu berasal dari jaringan
hewan, tumbuhan, dan protista.

Untuk menyediakan pH asam bagi enzim hidrolitik, membrane lisosom

mempunyai pompa H+, yang menggunakan energy dari hidrolisis ATP. Membrane
lisosom juga sangat terglikosilasi yang dikenal dengan lysosomal-associated
membrane proteins (LAMP). Sampai saat ini sudah terdeteksi LAMP-1, LAMP-2,
dan CD63 atau LAMP-3. LAMP berguna sebagai reseptor penerimaan kantong
vesikel pada lisosom.

85

Enzim hidrolase terdiri dari (1) -galaktosidase substratnya galaktosida asal

lisosomnya adalah jaringan hewan, tumbuhan, dan protista. (2) -glukosidase
sustratnya glikogen. (3) -manosidase substratnya manosida, (4) -glukoronidase
substratnya

polisakarida

dan

mukopolisakarida.

Enzim berikutnya adalah enzim yang termasuk ke dalam golongan enzim protease
yakni enzim katepsin substratnya protein, asal lisosomnya adalah sel hewan.
Berikutnya adalah enzim kolagenase, substratnya kolagen, asal lisosomnya adalah sel
tulang. Enzim terakhir dalam kelompok protease adalah peptidase, substratnya
peptide, asal lisosomnya adalah jaringan hewan, tumbuhan, dan protista.
Berikutnya adalah enzim-enzim perombak lipid yang terdiri dari esterase
substratnya ester asam lemak, asal lisosomnya adalah jaringan hewan, tumbuhan, dan
protista. Enzim fosfolipase dengan substratnya fosfolipid, lisosomnya juga berasal
dari

jaringan

tumbuhan.

86

2.4 Fungsi Lisosom

Peranan fisiologi lisosom umumnya berhubungan dengan pencernaan

intraseluler. Misalnya pencernaan makanan yang berlangsung pada protozoa dimana
bahan-bahan yang berasal dari luar dicerna secara intraseluler atau heterofagi.
Endositosis merupakan persyaratan bagi pencernaan intraseluler bahan eksogen
dengan molekul tinggi. Bukti menunjukkan bahwa vakuola makanan dihasilkan dari
fusi

antara

endosom

dengan

lisosom

primer.

Dalam darah, terdapat banyak sel-sel fagosit yang bekerja sebagai penghalang yang
efektif dari invasi mikroorganisme atau benda-benda asing lainnya. Ada empat tipe
fagosit darah, yaitu (i) Polymorpho Nuclear Neutrofic Leukocytes (PMNs), (ii)
Eosinofil, (iii) Basofil, dan (iv) Monosit. Meskipun keempat tipe tersebut bersirkulasi
di dalam darah, neutrofil dan manosit memiliki kemampuan untuk meninggalkan
aliran darah dan mengembara di seluruh jaringan untuk menghilangkan bahan-bahan
asing

dalam

jaringan

dengan

cara

memfagositosisnya.

Monosit di dalam jaringan akan berkembang menjadi dewasa dan menjadi sel-sel
makrofag. Berbagai jenis makrofag antara lain histiosit dalam jaringan pengikat,
makrofag alveolar di dalam paru-paru, sel-sel kuffer di dalam jaringan hati, makrofag
pelural di dalam peritoneal, osteoklas di dalam tulang, sel mikroglia di dalam sistim
saraf pusat, sel schwann di dalam serabut saraf perifer, sel sinvial tipe A di dalam
ruang sendi, dan makrofag di dalam jaringan limfoid dan jaringan ikat (Subowo,
1990). Lisosom memainkan peranan yang sangat penting dalam resorbsi tulang yang
dilakukan

oleh

osteoklas.

Selain itu, lisosom memegang peranan penting di dalam sekresi kelenjar tiroid
oleh sel-sel epitel dari folikel tiroid. Lisosom memainkan peranan yang sangat
penting selama berlangsungnya fertilisasi pada berbagai jenis hewan termasuk

87

manusia, terutama selama berlang-sungnya reaksi akrosom. Enzim-enzim yang

dilepaskan dari vesikula akrosom melakukan pencernaan terhadap selaput selaput
pelindung telur sehingga memungkinkan sel pronuklei jantan masuk menembus
membran

telur

untuk

berfusi

dengan

pronuklei

betina.

Selain itu, fungsi dan peranan lisosom meliputi:

A.

Endositosis ialah pemasukan makromolekul dari luar sel ke dalam sel melalui

mekanisme endositosis, yang kemudian materi-materi ini akan dibawa ke vesikel

kecil dan tidak beraturan, yang disebut endosom awal. Beberapa materi tersebut
dipilah dan ada yang digunakan kembali (dibuang ke sitoplasma), yang tidak dibawa
ke endosom lanjut. Di endosom lanjut, materi tersebut bertemu pertama kali dengan
enzim hidrolitik. Di dalam endosom awal, pH sekitar 6. Terjadi penurunan pH (5)
pada endosom lanjut sehingga terjadi pematangan dan membentuk lisosom.

B. Autofagi

Proses autofagi digunakan untuk pembuangan dan degradasi bagian sel sendiri,
seperti organel yang tidak berfungsi lagi. Mula-mula, bagian dari retikulum
endoplasma kasar menyelubungi organel dan membentuk autofagosom. Setelah itu,
autofagosom berfusi dengan enzim hidrolitik dari trans Golgi dan berkembang
menjadi lisosom (atau endosom lanjut). Proses ini berguna pada sel hati, transformasi
berudu
C.

menjadi

katak,

dan

embrio

manusia.

Fagositosis

Fagositosis merupakan proses pemasukan partikel berukuran besar dan

88

mikroorganisme seperti bakteri dan virus ke dalam sel. Pertama, membran akan
membungkus

partikel

atau

mikroorganisme dan membentuk fagosom. Kemudian, fagosom akan berfusi dengan

enzim hidrolitik dari trans Golgi dan berkembang menjadi lisosom (endosom lanjut).

Gambar

4.

Autofagi

dan

Fagositosis

2.5 Cara Kerja Lisosom

Perusakan sel terprogram oleh enzim lisosomnya sendiri penting dalam

perkembangan

organisme. Misal, pada waktu kecebong berubah menjadi katak,

ekornya diserap secara bertahap. Sel-sel ekor yang kaya akan lisosom mati dan hasil
penghancuran digunakan di dalam pertumbuhan sel-sel baru yang berkembang. Pada
perkembangan tangan embrio manusia yang semula berselaput hingga lisosom
mencerna jaringan diantara jari- jari tangan tersebut sehingga terbentuk jari yang
terpisah

seperti

yang

kita

punyai

sekarang.

Proses pencernaan yang terjadi secara enzimatis di lisosom terdiri dari berbagai
macam tergantung dari jenis dan asal bahan yang akan dicerna. Bila bahan yang

89

dicerna berasal dari luar sel proses pencernaanya disebut heterofagi, sedangkan bila
bahannya berasal dari dalam disebut autofagi. Kedua proses pencernaan ini banyak
dijumpai misalnya pada mekanisme pertahanan tubuh, nutrisi, dan pengaturan
sekresi.

Selain kedua proses pencernaan tersebutyang sifatnya intraseluler, enzim lisosom

dapat pula disekresikan ke luar dari sel atau disebut pencernaan ekstra sel misalnya
yang terjadi pada jaringan ikat hewan dan juga pada jenis jamur.
Proses pencernaan ekstra seluler yang dilakukan oleh lisosom dilakukan dengan
mencurahkan isi lisosom ke dalam daerah ekstra seluler. Jadi pada proses ini yang
dicerna adalah substabsi antar sel, misalnya pencernaan ekstra sel yang
mengakibatkan perubahan tulang dan tulang rawan.

2.6 Pembentukan dan Kelainan Akibat Lisosom

Asal dan pembentukan lisosom telah dipelajari dengan sangat intensif. Dari berbagai
hasil temuan, ada dua pendapat yang berkenaan dengan asal dan pembentukan
lisosom,
1.

yaitu:

Berbagai bukti telah ditemukan bahwa protein-protein hidrolitik dibentuk oleh

ribosom
yang terdapat pada retikulum endoplasma. Dari retikulum endoplasma kasar,
selanjutnya protein tersebut ditranslokasikan menuju permukaan pembentukan badan
golgi untuk diproses lebih lanjut. Setelah itu, protein-protein hidrolitik dikemas dan
dibungkus dalam bentuk vesikula-vesikula untuk selanjutnya dilepaskan sebagai
lisosom

primer.

90

2.

Protein-protein hidrolitik dibentuk pada ribosom yang terdapat pada retikulum

endoplasma kasar, selanjutnya ia dilepaskan dalam bentuk vesikula menuju daerah

GERL (Golgi associated Endoplasmic Reticulum giving rise to Lisosom) yang
berdekatan dengan daerah permukaan matang badan golgi. Dari GERL, selanjutnya
dilepaskan vesiula-vesikula yang disebut lisosom primer.

Lisosom yang pertama dibentuk oleh sel dan belum terlibat dalam aktivitas
pencernaan sel disebut lisosom primer. Sedangkan lisosom sekunder adalah lisosom
yang merupakan hasil fusi berulang antara lisosom primer dengan berbagai substrat
yang berbatas membran (Albert et al., 1983).

Dengan demikian, lisosom sekunder telah terlibat dalam aktivitas pencernaan sel dan
di dalam lumennya terdapat substrat dan enzim-enzim hidrolitik. Lisosom sekunder
memiliki dua fungsi yang berbeda, yaitu:
1) Heterolisosom, yaitu bila substrat yang dicerna berasal dari luar sel.
Dengan demikian, heterolisosom dibentuk dari hasil fusi antara lisosom primer
dengan fagosom atau endosom. Heterolisosom sering disebut sebagai
vakuolapencerna.
Albert et al. (1983) membagi heterolisosom menjadi dua tipe, yaitu:
a) Vakuola pencerna, yaitu hasil fusi antara fagosom (partikel-partikel yang
difagositosis seperti bakteri) dengan lisosom primer.
b) Badan-badan multivesikula, yaitu hasil fusi antara beberapaendosom (substrat
yang masuk secara endositosis dan bukan dalam bentuk partikel) dengan
lisosom primer.
Dengan demikian, badan-badan multivesikula merupakan kantung-kantung
berbatas membran dimana di dalamnya mengandung banyak vesikula- vesikula

91

kecil

dengan

diameter

berkisar

50

nm.

2) Vakuola autofagi atau autolisosom, yaitu lisosom yang mengandung dan mungkin
mencerna substrat-substrat intraseluler yang berbatas membran (sitosegresom),
misalnya organel-organel intraseluler seperti mitokondria. Autolisosom dibentuk
dari

hasil

fusi

antara

sitosegresom

dengan

lisosom

primer.

Gambar 5. Pembentukan dan fungsi lisosom pada heterofagi dan autofagi

seluler

(Sheeler

dan

Bianchii,

1983).

Di dalam sel, sesungguhnya terdapat kerjasama yang erat antara heterolisosom

dengan autolisosom. Selama heterofagi berlangsung, protein- protein ditempatkan
di dalam vesikula-vesikula endosom, kemudian berfusi dengan lisosom primer
dan selanjutnya mengalami hidrolisis. Selama auto- fagi, sitosegresom berfusi
dengan lisosom primer membentuk autolisosom dan memasuki siklus pencernaan

92

intrasel.

Gambar

6.

Siklus

pencernaan

intrasel

(Thorpe,

1984)

Tergantung pada keadaan fisiologisnya, vakuola pencerna atau vakuola autofagi

pada akhirnya mengalami satu dari tiga kemungkinan yang terjadi, yaitu :
1. Mengosongkan kandungannya dengan cara eksositosis atau defekasi seluler
2. Menjadi

bahan

residu

tanpa

bahan

hidrolase;

3. Menghidrolisis kandungannya secara sempurna untuk dapat berdifusi dan

selanjutnya siap untuk siklus aktivitas yang baru

Tentang pembentukan sitosegresom, ada beberapa pandangan yang

diusulkan,
1.

yaitu

Sitosegresom dibentuk dari suatu membran sisterna yang melingkupi

mitokondria secara sempurna dan selanjutnya diikuti dengan berdegenerasinya

93

membran
2.

dalam;

Sitosegresom dibentuk dari suatu membran yang melingkupi mitokondria

secara
3.

sempurna.

Sitosegresom dibentuk dari vesikula endosom yang melingkupi mitokondria

secara sempurna yang selanjutnya diikuti dengan berdegenerasinya membran

dalam;
4.

Sitosegresom dibentuk dari vesikula endosom, dimana mitokondria

memasuki

vesikula

endosom

melalui

suatu

celah

Bentuk akhir heteroslisosom dan autolisoson disebut telolisosom atau postlisosom

atau badan residu. Bahan-bahan yang terkandung di dalam telo- lisosom sewaktuwaktu dapat dilepaskan. Proses pelepasannya dinamakan defekasi seluler. Bahanbahan yang telah dicerna di dalam lisosom dapat kembali dilepaskan ke dalam
sitoplasma dan selanjutnya terlibat di dalam proses katabolisme atau anabolisme.

94

Gambar 6. Pembentukan Lisosom

Enzim lisosom adalah suatu protein yang diproduksi oleh ribosom dan kemudian
masuk ke dalam Retikulum Endoplasma. Dari Retikulum Endoplasma enzim
dimasukkan ke dalam membrane kemudian dikeluarkan ke sitoplasma menjadi
lisosom. Selain ini ada juga enzim yang dimasukkan terlebih dahulu ke dalam
golgi. Oleh golgi, enzim itu dibungkus membrane kemudian dilepaskan di dalm
sitoplasma. Jadi proses pembentukan lisosom ada dua macam, pertama dibentuk
langsung oleh Retikulum Endoplasma dan kedua oleh golgi.

MIKROBODI

1.1 Pengertian
Mikrobodi merupakan organel dengan struktur yang mirip dengan lisosom.
Contoh mikrobodi adalah peroksisom dan glioksisom. Mirobodi mempunyai struktur

95

mikro, bulat, diameter 0,2 1,5 m. Bagian matriksnya adalah amorf atau granuler.
Pada setiap jaringan, matriks mikrobodi mengandung crystalline nucleoid atau bentuk
kristalin dari urat oksidase, satu dari jenis enzim yang terdapat pada matriks. Pada
jaringan hewan, mikrobodi tersebar pada seluruh bagian sel. Namun biasanya
terdapat disekitar retikulum endoplasma. Pada sel tumbuhan, mikrobodi biasanya
berdekatan dengan kloroplas. Hal ini disebabkan karena adanya hubungan kerja
antara kedua organel tersebut, khususnya pada jalur reaksi-reaksi daur glioksilat. Dua
macam mikrobodi: Glioksisom dan Peroksisom. Glioksisom ditemukan pada sel
tumbuhan dan Peroksisom terdapat pada sel hewan juga tumbuhan.
1.2 Komposisi Kimia Mikrobodi.
Membran mikrobodi utamanya terdiri atas fosfatidilkolin, fosfatidiletanolamin,
fosfatidilinositol, fosfatidilserin dan dan kardiolipin. Membran mikrobodi bersifat
permeabel terhadap sejumlah substansi-substansi seperti asam amino, asam alfa
hidroksi, tetapi tidak permeabel terhadap nukleotida-nukleotida pirimidin, NADH,
dan NADPH.
Menurut Thorpe (1984) enzim-enzim yang terkandung di dalam mikrobodi antara
lain: Katalase, NAD malat dehidrogenase, Hidrogen piruvat reduktase, Seringlioksilat

aminotransferase,

aminotransferase,

Glikolat

Glutamat-glioksilat

oksidase,

Glutamat-okslaoasetat

aminotransferase,

NADP-

isositratdehidrogenase, Urat oksidase, Xantin dehidrogenase, NAD gliserol fosfat

dehidrogenase, Malat sintetase, Sitrat sintetase, Acinitase, Isositrat liase, Asam lemak
KoA sintetase, Enzim-enzim oksidasi, Thiolase dan Allantoinase
Asam amino oksidase, Peristiwa regenerasi koenzim pada

mikrobodi

berlangsung melalui peristiwa shuttle sehingga NAD dalam bentuk tereduksi dapat
kembali melintasi membran. Terdapat dua jalu shuttle yaitu:
1. Jalur oksaloasetat-malat, berlangsung pada glioksisom

96

2. Jalur dihidroksi-asetonfosfat-gliserol-3-fosfat, berlangsung pada peroksisom.

1.3 Macam-macam Mikrobodi
1.3.1 Peroksisom

Struktur Peroksisom
Peroksisom adalah organel yang mengandung banyak enzim katalase. Enzim
katalase berfungsi menguraikan senyawa beracun peroksida (H2O2). Hasil
penguraian peroksida berupa air (H2O) dan oksigen(O2). Pada hewan, peroksisom
banyak terdapat di dalam hati dan ginjal. Sebuah Peroksisom adalah jenis mikrobodi
yang berfungsi untuk membantu tubuh memecah molekul besar dan detoksifikasi zat
berbahaya. Ini berisi enzim seperti oksidasi, yang dapat membuat hidrogen peroksida
sebagai produk sampingan dari reaksi enzimatik. Dalam Peroksisom, hidrogen
peroksida kemudian dapat dikonversi ke air oleh enzim katalase dan peroksidase
1.3.2 Glioksisom

97

Struktur glioksisom

Peroksisom yang hanya terdapat pada tumbuhan disebut glioksisom.

Glioksisom berfungsi mengoksidasi asam lemak. Organel ini banyak ditemukan di
dalam jaringan lemak pada biji yang sedang berkecambah. Glyoxysomes adalah
peroksisom khusus ditemukan pada tumbuhan dan jamur, yang membantu untuk
mengkonversi lemak yang disimpan menjadi karbohidrat sehingga mereka dapat
digunakan untuk pertumbuhan tanaman. Dalam glyoxysomes asam lemak yang
terhidrolisis menjadi asetil-CoA oleh enzim -peroxisomal oksidasi. Selain fungsi
peroxisomal, glyoxysomes juga memiliki enzim kunci dari siklus glioksilat.
1.4 Fungsi Mikrobodi
Mirobodi mengandung enzim yang berpartisipasi dalam tahap persiapan atau
menengah reaksi biokimia dalam sel. Ini memfasilitasi pemecahan lemak, alkohol
dan asam amino. Berbagai jenis microbodies memiliki fungsi yang berbeda.
Sebuah Peroksisom adalah jenis mikrobodi yang berfungsi untuk membantu tubuh
memecah molekul besar dan detoksifikasi zat berbahaya. Ini berisi enzim seperti
oksidasi, yang dapat membuat hidrogen peroksida sebagai produk sampingan dari
reaksi enzimatik. Dalam Peroksisom, hidrogen peroksida kemudian dapat dikonversi
ke air oleh enzim katalase dan peroksidase.

98

1.4.1 Daur glioksilat

Molekul asetil Ko A yang pertama berkondensasi dengan oksaloasetat
membentu asam itrat. Asam sitrat selanjutnya secara bertahap diubah menjadi
isositrat. Enzim isositral liase mengkatalisis perubahan isositrat menjadi suksinat dan
glioksilat. Reaksi glioksilat dengan molekul asetil Ko A yang kedua menghasilkan
malat dan selanjtnya malat diubah menjadi oksaloasetat. Di dalam mitokondria,
suksinat diubah menjadi malat dan pada akhirnya di dalam sitosol, malat diubah
menjadi fosfoenolpiruvat melalui oksaloasetat untuk digunakan dalam pembentukan
glukosa baru.

daur glioksilat
1.4.2 Daur glikolat
Daur glikolat merupakan suatu rangkaian reaksi yang berlangsung di dalam
peroksisom daun tumbuhan sehubungan dengan daur karbon di dalam kloroplas. Jalur
ini merupakan jalur gabungan antara kloroplas, peroksisom, mitokondria, dan sitosol.
Daur

glikolat

melaksanakan

perubahan-perubahan

senyawa-senyawa

tidak

terfosforilasi menjadi glisin, serin, dan senyawa C1, dan dalam keadaan tersebut
berperan sebagai penghasil pra zat bagi biosintesis asam nukleat.

99

100

SITOSKELETON

Pengertian Sitoskeleton
Sitoskeleton atau

kerangka sel adalah jaring berkas-berkas protein yang

menyusun sitoplasma dalam sel. Setelah lama dianggap hanya terdapat di sel
eukariota, sitoskeleton ternyata juga dapat ditemukan pada sel prokariota. Dengan
adanya sitoskeleton, sel dapat memiliki bentuk yang kokoh, berubah bentuk, mampu
mengatur posisi organel, berenang, serta merayap di permukaan. Sitoskeleton adalah
kerangka internal sel, yang merupakan kumpulan serabut atau filamen globular,
serabut protein yang menyusun sitoplasma sel eukariota. Sitoskeleton terdiri atas:
a) Mikrofilamen (struktur mirip rod yang berupa protein globular),
monomernya adalah tubulin
b)

Filamen intermediate (protein serabut), monomernya adalah fibrous (protein)

c)

Mikrotubul (tabung berlubang terdiri atas protein globular) , monomernya adalah

actin.
Ketiga macam serabut itu dihubungkan dan dilekatkan ke organel-organel oleh
tipe filamen ke empat yang disebut filamen trabekula dan membentuk kisi-kisi
mikrotrabekula (microtabecular lattice). Penempatan ke tiga serabut penyusun
sitoskeleton didalam sel adalah:
a) Mikrotubul: Tersusun acak, memanjang radial dari pusat sel, melekat dan
mengelilingi batas sel, tersebar di korteks sel dan tempat terjadinya gerakan

101

b) Mikrofilamen: Terorientasi secara paralel di seluruh bagian dalam sel atau

berkelompok dekat perifer sel
c) Filamen intermediet: Menyebar di seluruh sel, dekat permukaan sel. Pola
jalinan seperti sarang laba-laba, keberadaannya dalam tumbuhan belum jelas.

Sitoskeleton eukariota. Aktin digambarkan dengan warna merah dan mikrotubulus

dengan warna hijau. Struktur berwarna biru ialah inti sel.

102

Fungsi dari skeleton adalah memberikan kekuatan mekanik pada sel, menjadi
kerangka sel, membantu gerakan substansi dari satu bagaian sel ke bagian lain, peran
sitoskeleton secara rinci di dalam sel adalah sebagai berikut:
1. Menentukan bentuk dan ketahanan sel
2. Penempatan berbagai organel dalam sel
3. Pergerakan materi-materi dan organel-organel dalam sel
4. Pergerakan sel
5. Tempat untuk anchoring mRNA dan membantu translasi mRNA menjadi
poplipeptida
6. Komponen penting dalam proses pembelahan sel
7. Memberikan kekuatan mekanik pada sel
8. Menjadi kerangka sel
Sitoskeleton juga penting untuk beberapa jenis motilitas sel, seperti: perubahan
tempat sel dan pergerakan sel yang lebih terbatas. Motilitas sel membutuhkan
interaksi sitoskeleton dengan protein, pada umumnya untuk melihat fungsi
sitoskeleton secara langsung, dilakukan pengamatan fungsi mikrotubul dengan
mengamati gerak pada Paramaecium dan Chlamydomonas. Paramaecium dipelajari
untuk melihat gerak silia, sementara Chlamydomonas diamati untuk melihat gerak
pada flagela. Silia bisanya terdapat dalam jumlah banyak pada permukaan sel,
sedangkan flagela hanya satu atau beberapa sel saja. Silia bergerak maju mundur,
dengan kibasan yang saling bergantian, sementara flagela geraknya berombak-ombak
yang mirip dengan ular yang menggerakan sel dalam arah yang sama. Mikrotubula

103

atau mikrotubulus adalah tabung yang disusun dari mikrotubulin. bersifat lebih kokoh
dari aktin, mikrotubulus mengatur posisi organel di dalam sel. Mikrotubulus memiliki
dua ujung: ujung negatif yang terhubung dengan pusat pengatur mikrotubulus, dan
ujung positif yang berada di dekat membran plasma.
Organel dapat meluncur di sepanjang mikrotubulus untuk mencapai posisi yang
berbeda di dalam sel, terutama saat pembelahan sel.Mikrotubulus merupakan serabut
penyusun sitoskeleton terbesar.
Ada dua macam mikrotubulus di dalam sel yang dibedakan atas stabilitasnya,
yaitu mikrotubulus stabil dan mikrotubulus labil. Contoh mikrotulus stabil adalah
pembentuk silia dan flagela. Sedangkan mikrotubulus labil contohnva mikrotubulus
pembentuk gelendong pembelahan.
Mikrotubulus sitoplasmik didalam sel berfungsi sebagi kerangka dalam yang
menetukan bentuk sel dan untuk transfer molekul di dalam sel. Mikrotubulus ini
berbentuk serabut tunggal dengan diameter lebih kurang 25 nanometer. Beberapa
organel yang tersusun dari mikrotubulus adalah sentriol, silia dan flagella.
Ciri-ciri mikrotubul, antara lain:

Mikrotubulus tersusun atas bola-bola molekul yang disebut tubulin.

Diameter mikrotubulus kira-kira 25 nm, panjangnya 200 nm.

Dindingnya terdiri dari 13 kolom molekul tubulin.

Setiap molekul tubulin terdiri atas dua subunit polipeptida yang serupa, alpha
tubulin dan betha tubulin. Mikrotubula memanjang dengan menambah
molekul tubulin diujung-ujungnya.

104

Mikrotubula dapat dibongkar dan tubulinnya digunakan untuk membangun

mikrotubula dimana saja di dalam sel.

Di bawah ini adalah gambar struktur dari mikrotubul:

Fungsi mikrotubul antara lain:

1. Membantu dalam pembelahan mitosis dengan mengendalikan gerakan
kromosom dari daerah equator ke kutub masing-masing pada anaphase
2. Penyusun sentriol, flagel dan silia sehingga berperan dalam pergerakan sel
3. Mengarahkan gerakan komponen-komponen sel
4. mempertahankan bentuk sel dan sebagai rangka sel.
Mikrofilamen adalah rantai ganda protein yang saling bertaut dan tipis,
terdiri dari protein yang disebut aktin. Mikrofilamen berdiameter antara 5-6 nm.
Karena kecilnya sehingga pengamatannya harus menggunakan mikroskop elektron.
Ciri-ciri mikrofilamen:

Mikrofilamen adalah rantai ganda protein yang bertaut dan tipis.

Mikrofilamen tersusun atas dua macam protein, yaitu aktin dan miosin.

105

Mikrofilamen banyak terdapat pada sel-sel otot.

Mikrofilamen mempunyai diameter 7 nm sehingga pengamatannya harus

menggunakan mikroskop elektron.

Fungsi mikrofilamen adalah:

Motilitas, perubahan bentuk sel, sitokinesis
Membantu pergerakan : kontraksi otot, pembelahan sel
Support mekanik : pengait protein membran sel, mikrovili

Filamen intermediet

106

Berbentuk serat mirip tali, filamen intermediet memberi kekuatan mekanis

pada sel sehingga sel tahan terhadap tekanan dan peregangan yang terjadi pada
dinding sel. Filamen ini juga memberi kekuatan pada dinding sel. Disebut serabut
intermediar karena ukurannya di antara ukuran mikrofilamen dan mikrotubulus.
Fungsi filamen intermediet adalah:

Penyokong sel dan inti sel

Pada sel epitel, filamen intermediet membentuk anyaman yang berfungsi

untuk menahan tekanan dari luar. Contoh filamen entermediet antara lain
adalah kertin, vimentin, neurofilamen, lamina nuclear, dan keratin.

Ciri-ciri filamen intermediet antara lain:

Filamen intermediet memiliki diameter antara 8-10 pm

Berbentuk pembuluh, tersusun atas 4-5 protofilamen yang tersusun melingkar

Bersifat liat, stabil, dan tersusun atas protein fibrosa

Letak filamen inibiasanya terpusat disekitar inti.

rantai protein yang berbentuk untaian yang salin melilit tersusun atas protein
yang disebut fimetin, tetapi tidak semua sel filamen intermediarnya tersusun
atas fimentin.

Misalnya sel kulit filamennya tersusun atas protein keratin. Lihat gambar
dibawah:

107

gambar filamen intermediet

Berikut adalah gambar dari sitoskeleton dan serabut-serabutnya:

108

SENTRIOL

109

Sentriol merupakan organel yang berperan dalam pembelahan sel. Sentriol

berfungsi menarik kromosom ke arah kutub yang berlawanan. Sentriol merupakan
perkembangan dari sentrosom, yaitu pusat sel, daerah dari sitoplasma yang dekat
dengan nukleus. Sentriol berupa kumpulan mikrotubulus strukturnya berbentuk
bintang yang berperan sebagai kutub-kutub pembelahan sel secara mitosis atau
meiosis. Struktur ini hanya dapat dilihat dengan menggunakan mikroskop elektron
(Campbell, et.al., 2000).
Hanya ditemukan pada sel hewan, organel-organel dipasangkan biasanya
terletak dekat bersama-sama inti dalam sentrosom, massa granular yang berfungsi
sebagai pusat penyelenggara mikrotubulus. Dalam Sentrosom tersebut, sentriol
diposisikan sehingga mereka tegak lurus satu sama lain, seperti yang diilustrasikan
pada Gambar 1. Setiap sentriol terbuat dari sembilan bundel mikrotubulus (tiga per
bundel) diatur dalam cincin.

110

Struktur Sentriol
Sentriol memainkan peran penting dalam pembelahan sel. Selama interfase
dari sel hewan, sentriol dan komponen lain dari Sentrosom tersebut digandakan,
meskipun para ilmuwan belum yakin bagaimana duplikasi ini terjadi. Pada awalnya
dua pasang sentriol tetap dekat satu sama lain, tetapi sebagai inisiat mitosis, membagi
Sentrosom asli dan pasangan yang berpisah sehingga satu set sentriol terletak di
masing-masing

pusat

mikrotubula-pengorganisasian

baru.

Pusat-pusat

baru

memancarkan mikrotubulus dalam kelompok berbentuk bintang yang dikenal sebagai

aster. Sebagai aster pindah ke kutub yang berlawanan dari sel, mikrotubulus, dengan
bantuan dari sentriol, menjadi disusun dalam formasi berbentuk gelendong yang
membentang sel (lihat Gambar 2). Serat gelendong ini bertindak sebagai panduan
untuk penyelarasan kromosom karena mereka memisahkan kemudian selama proses
pembelahan sel.
Meskipun sentriol berperan dalam mitosis sel hewan, sel tumbuhan dapat
mereproduksi tanpa mereka. Para peneliti telah, oleh karena itu, sangat tertarik untuk
menentukan persis betapa pentingnya organel sebenarnya. Penelitian telah
menunjukkan bahwa sel-sel hewan tertentu, terutama gamet betina (oosit), berhasil
dapat membagi bahkan ketika sentriol mereka hancur. Beberapa peneliti juga
menemukan, bagaimanapun, bahwa tidak adanya sentriol pada sel hewan dikaitkan
dengan peningkatan jumlah kesalahan divisi dan keterlambatan substansial dalam
proses mitosis, terutama sebelum segregasi kromosom. Akibatnya, telah menyarankan

111

bahwa sentriol berkembang sebagai penyempurnaan dari sel, membuat mitosis proses
rawan kesalahan jauh lebih efisien dan kurang.

Dalam sel-sel yang menampilkan silia atau flagela, tubuh basal, yang
menunjukkan bentuk struktur yang sama dengan sentriol, hadir. Majelis ini berada,
namun, di dekat permukaan sel di dasar masing-masing silia atau flagela, bukan di
Sentrosom dekat inti. Badan basal yang berlabuh di lokasi sitoplasma mereka dengan
apa yang disebut sistem akar kecil dalam sel. Dalam beberapa organisme, seperti
Chlamydomonas uniseluler, tubuh basal mengubah lokasi mereka dan secara
fungsional dikonversi ke sentriol sebelum proses mitosis.

CILLIA DAN FLAGELLA

112

FLAGELLATA

1. Pengertian

Flagellata (tunggal: flagellum) dalam bahasa Latin flagell yang berarti

cambuk). Flagella merupakan filamen yang terdiri dari subunit rantai protein
flagelin yang tersusun berpilin. Flagel pada prokariota merupakan suatu berkas
kosong tanpa membran, panjangnya 312 mikrometer dan diameternya 1020
mikrometer. Flagella memperoleh energi dari kekuatan proton motiv. Flagella
terlibat dalam respon kemotaksis oleh sel.

Gambar 2. Anatomi Flagel pada Bakteri Gram Positif dan Gram

Negatif

2. Peranan dan Fungsi Flagel

1) Sebagai alat gerak (motile organ) dari sel prokariotik dan eukariotik.
Flagel memiliki struktur tubular dari permukaan luar. Flagela bertindak

113

sebagai baling-baling, berputar berlawanan ketika mereka mendorong sel

ke depan.
2) Flagela adalah struktur semi kaku digunakan untuk memindahkan sel-sel
mikroba
3) Flagella menyebabkan sel dapat bergerak rotasi, akibat kekuatan motif
proton.
3. Struktur Flagel
1) Lebar flagel kurang dari 0,1 m
2) Flagel merupakan benang-benang protoplasma yang berpangkal pada titik
tepat di bawah membran sel
3) Pangkal flagel dinamakan Rizoblast
4) Flagel terdiri dari protein yang disebut flagelin semacam myosin
5) Dalam medium cair, vibro dimana vibro ini bergerak dengan kecepatan 20
cm perdetik atau 0,3 km/menit atau 18 km/jam.
Perbedaan struktur Flagela Prokariotik dan Eukariotik
a) Flagela prokariotik
Flagela prokariotik secara struktural sangat sederhana dan terdiri
dari serat tunggal dari protein flagellin, yang memiliki subunit 53
kDa. Flagela bakteri biasanya hanya terlihat di bawah mikroskop
elektron dan terletak seluruhnya di luar dari membran plasma.
b) Flagela eukariotik
Struktur flagela eukariotik yang kompleks, dan memiliki struktur 9
+ 2 mikrotubulus. Flagel eukariota biasanya dikelilingi oleh
membran sel dan terdiri dari tubulin. Sel sperma adalah contoh
untuk sel eukariotik flagellated, dan bergerak dengan cara flagel
tunggal.
4. Jenis-Jenis Flagel

114

Gambar 2. Jenis Flagel

1)
2)
3)
4)

Monotrikh
Ditrikh
Pentrikh
Lopotrik

: mempunyai satu flagel.

: mempunyai dua flagel
: mempunyai banyak flagel pada permukaan tubuh.
: mempunyai flagel pada salah satu ujung tubuh bakteri
yang berjumlah lebih dari dua buah.
5) Amfitrikh
: mempunyai flagel pada sisi tubuh yang berlawanan.
6) Atrikh
: tidak memiliki flagel.
5. Perbedaan Flagel pada Sel Prokariotik dan Sel Eukariotik

Meskipun fungsinya adalah sama terdapat beberapa perbedaan antara

flagela eukariotik dan prokariotik. Mereka terutama berbeda dalam komposisi
protein, struktur, dan mekanisme operasinya.

Gambar 3. Flagela

prokariotik dan

eukariotik
1.

Flagela prokariotik lebih kecil dan sederhana dalam

struktur, sedangkan flagela eukariotik lebih besar dan kompleks dalam
struktur.

115

2.

Flagella prokariotik terdiri dari protein flagellin

sementara flagela eukariotik terdiri dari tubulin.

3.

Pergerakan flagela prokariotik adalah didorong proton,

sedangkan gerakan flagella eukariotik didorong ATP.

4.

Flagela

prokariotik

memiliki

gerakan

rotator,

sedangkan flagela eukariotik memiliki gerakan campuran.

5.

Tidak seperti flagela prokariotik, flagela eukariotik

memiliki 9 + 2 susunan mikrotubulus.

6.

Flagella prokariotik yang terletak di luar membran

plasma, sedangkan flagela pada eukariota ditutupi dengan membran
plasma.

SILIA
Silia dan flagela merupakan tambahan serupa cambuk yang terdapat di
permukaan luar dari berbagai macam sel eukariot. Jika hanya ada satu atau beberapa
struktur, disebut flagela. Jika terdapat dalam jumlah banyak, disebut silia. Silia dan
flagela memiliki sumbu yang disebut aksonema. Struktur aksonem sangat kompleks
karena tersusun atas mikrotubulus dan protein. Silia dan flagela dibungkus oleh
membran, membran silia dan flagela merupakan perluasan dari membran sel. Silia
dan flagela tumbuh dan tetap melekat pada sebuah badan basal tertanam di dalam
sitoplasma. Badan basal identik dengan sentriol dan diproduksi oleh silia dan flagela.
Silia adalah benang tipis setebal 0,25 m dengan bundel mikrotubulus di bagian
intinya. Dinding dari silia terdiri dari 9 dublet mikrotubula. Dublet-dublet tersebut
tersusun melingkar dan radier terhadap dua buah singlet mikrotubula, oleh karena
susunan ini dinyatakan memiliki susunan mikrotubula 9+2 (9 dublet dan 2 singlet).

116

Setiap dublet saling berhubungan dengan perantaraan protein penghubung yang

disebut neksin. Pada bagian bebas dari subdublet terdapat sepasang molekul protein
yang disebut dynein. Dinein ini memiliki gugus yang berperan sebagai ATP ase,
sehingga dapat dikatakan bahwa dynein bertanggung jawab pada terjadinya hidrolisis
ATP. Setiap dublet dihubungkan ke sepasang singlet pusat oleh molekul-molekul
protein yang berbentuk ruji-ruji.
Silia dapat ditemukan pada beberapa hewan avertebrata misalnya pada Dugesia.
Permukaan tubuh bagian ventral Dugesia memiliki silia yang berfungsi untuk
pergerakan. Sistem eksresi Dugesia terdiri dari saluran bercabang-cabang yang
disebut protonefridia, memanjang dari pori-pori pada permukaan tubuh bagian dorsal
sampai ke sel-sel api dalam tubuhnya. Sel-sel api yang berbentuk seperti bola lampu
dan memiliki silia di dalamnya. Pergerakan silia berfungsi untuk menggerakkan air
dalam sel menyerupai nyala api sehingga sel tersebut dinamakan sel api.
Secara garis besar mekanisme gerakan silia ada dua yang perlu diketahui yaitu:
a.

Sembilan tubulus ganda dan dua tubulus tunggal satu sama lain saling dihubungkan

b.

oleh kompleks protein yang menggandakan ikatan silang.

Diduga bahwa energi yang dilepaskan dari ATP yang berhubungan dengan lengan
ATPase, menyebabkan lengan bergerak sepanjang permukaan tubulus yang
berdekatan. Bila tubulus depan dapat bergerak keluar seaakan tubulus belakang tetap
diam, jelas ini akan menyebabkan pembengkokan. Karena banyak silia pada
permukaan sel yang berkontraksi serentak seperti gelombang, diduga bahwa beberapa
isyarat yang disinkronisasi mungkin suatu isyarat elektrokimia di atas permukaan sel
yang dipindahkan dari silia kesilia.

117

Organisme yang memiliki alat gerak berupa rambut getar (silia) menurut
system klasifikasi dikenal sebagai Ciliata yang berasal dari filum Protozoa.
Organisme yang tergolong dalam Ciliata diantaranya :
1. Paramaecium

118

2. Vorticella

3. Didinium

119

4. Stentor

5. Balantidium coli

120

DAFTAR PUSTAKA

Budisma.net. Struiktur dan Fungsi DNA. 8 February 2015.

http://budisma.net/2014/11/struktur-dan-fungsi-dna-asamdeoksiribonukleat.html

Campbell, Reece Mitchell. Alih bahasa oleh Wasmen, Manalu. 2000. Biologi jilid 3.
Jakarta: Penerbit Erlangga.

121

Campbell, Neil A., dkk. 2002. Biologi. Edisi ke-5. Jakarta : Erlangga.
http://budisma.net/2015/01/struktur-dan-fungsi-dinding-sel-padatumbuhan.html.

Larasati

Aqila.

Fungsi

dan

Struktur

Sentriol.

10

Mei

2015.

http://hikmat.web.id/biologi-klas-xi/fungsi-dan-struktur-sentriol/.
Purnomo, Sudjiono, T. Joko, dan S. Hadisusanto. 2009. Biologi Kelas XI untuk SMA
dan MA. Pusat Perbukuan, Departemen Pendidikan Nasional, Jakarta.
Sasrawan, Hedi.DNA. http://hedisasrawan.blogspot.com/2012/08/dna-asamdeoksiribonukleat-artikel.html

LAMPIRAN

Membran Sel
Safitri Bellinda

160110140039

Yuyun Qurrota A

160110140041

Dwita Kemala

160110140048

Dinding Sel
Sheilla Fauzia M

160110140004

Piolina Wiwin G

160110140006

122

Sianny Surya Putri

160110140012

Sentriol
Sarasti Laksmi A

160110140015

Regyana Oktavaria E

160110140017

Nabilla Ikhwani

160110140032

Badan Golgi
Annisa Ghea Faruchy

160110140011

Sitta Zahratunnisa

160110140014

Dina Purnamasari

160110140023

Sundus Maysun

160110140034

Ramzy Ramadhan

160110140055

DNA
R.AJ. Aulia Maharani

160110140019

Riandi Verdi

160110140029

Shela Melyana

160110140036

Lisosom
Hilda Hindasah

160110140018

Kamila Washfanabila

160110140026

123

Sinta Sondari

160110140031

Flagel dan Silia

Ranadhiya Maitsa

160110140020

Dwinda Sandyarini S

160110140024

Laurensius Randy

160110140049

Amatillah

160110140058

Alveolannisa Cintani B

160110140059

Kloroplas
Dita Amalia

160110140001

Muthi Larasmita

160110140042

Sita Aulia A

160110140045

Mikrobodi
Muhammad Rizki W

160110140008

Ratu Ira Setyawati

160110140010

Fitri Ramadhanti

160110140022

Nadya Amalia

160110140025

124

Najib Hendri Purnomo

160110140040

Mitokondria
Fitria Lesmana

160110140003

Puspitasari

160110140035

Novianti

160110140044

Nukleus
Muthmainna I

160110140002

Cahya Wulanda

160110140005

Sausane Abdul Wadud

160110140020

Dwi Wahyuningsih

160110140027

Celine Hestiana

160110140057

Retikulum Endoplasma
Putri Sundari

160110140021

Zuleika Fadiah P

160110140038

125

Adzkannisa Shalihah

160110140047

Ribosom
Hanna Widyawati

160110140007

Dwi Afuan

160110140016

Yuyun Syaadah

160110140052

Regi Taufik Firdaus

160110140053

Silvyara Ayu Pratiwi

160110140054

Sitoskeleton
Shinta Dewi

160110140009

Raden Roro Larasati

160110140033

Ali Alfatsyah J

160110140037

Ulfa Nadya Arifin

160110140056

Vakuola
Jelita Permatasari

160110140013

Hanifa Mardhiyyah S

160110140043

Nadya Oktarina H

160110140050

Miftahul Jannah

160110140051

126