RECUADRO 16-1 162 Reacciones del ciclo del Acido citrico 613 BIOQUIMICA PRACTICA Sintasas y sintetasas; ligasas y llasas; quinasas, fosfatasas y fosforilasas: jsf, una nomenclatura confusa! La citrato sintasa es uno de los smachos envimas que catali- zan reacciones de condensaci6n, dando un praducto mas complejo deste el punto de vista quimico que gus precurso- res, Las sintasas catalizan reacciones de condensacién en que no se requicra ningtin nucleéside trifosfato (ATP, GIP, cle.) como fuente energética, Las simtetasas catalizan condensaciones que sf utilizan ATP u otro nucledside trifos- fato como fuente de enerala para la reacci6n de sintesis, La succinil-CoA sintetasa es un ejemplo de estos enzimas. Las Tigasas (del latin ligave, “uniz) son. enzimes que catalizan reacciones de condensacién en las que dos toms son uni- dos utilizando la energia del ATP w otra fuente energética. (Asi pues, las sintetasas son ligasas.) La DNA ligasa, por ‘ejemplo, ume los cortes que encuentra en moléculas de DNA. ‘con la ener proporeionada por el ATP 0 el NAD“; es art- pliamente utilizada en la union de fragmentos de DNA en in- genieria genética. Las ligasas no deben ser confundidas con las Tiasas, que catalizan rupturas (o en el sentido inverso, adiciones) en las que tienen lugar reordenamientos elec- trénicos. El complejo de la piruvato deshidrogenasa, que escinde oxidativamente COs a partir de -pirwvato, es un miem- bro de esta gran Lamailia de enzimas. Elnombre quinasa se aplica. a enzimas que transfieren, lun grupo fosforilo desde un nucledsido trifosfato tal como el ATP a una molécula aceptora —un aziicar (como en la hexo- quittasa y en la ghucoquinasa), una proteina (como en la glu- cogéno fosforilasa quinasa), otro nueleétide (como en la rucledsido difosfato quinasa) o un intermediario metabélico ‘como el oxalacetato (en la PEP carboxiquinasa)~. La reae- ceién cstalizada por una quinasa es una fosforilacién, Por otro lado, la fosfordlisis es una reacciOn de desplazamiento cen la que el fosfato es la especie atacarite que se une cova- Jentemente al punto de ruptura de enlace. Estas reacciones: estén catalizadas por fosforilasas. La gluedgeno fosforilasa, por ejemplo, cataliza Ia fosfordlisis del glucégeno, produ- iendo glucosa 1-fosfato. La desfosforilactén, eliminacion de un grupo fosforilo de un éster fosfato en Ja que el agua es la especie atacante, esti catalizacia por Fosfatasas. La fruc- tosa bisfosfatasa-1 convierte la fructosa 1,6-bisfosfato en fructosa 6-fosfato en la gluconeogénesis, y la fosforilass a fosfatasa elimina grupos fosforilo de las fosfoserinas de la _ghucégeno fosforilasa fosforilada. Caraimbal Desiraciadiamente, estas descripciones de las clases de enzimas se solapan y muchos son denominados por dos 0 ‘mds norabres. La succinil-CoA sintetasa, por ejemplo, es ¢o- nocida también como succinate tioquinasa; el enzima es una. sintetasa en el ciclo del cide effrico y una quinasa cuando actiia en la direceién de la sftesis de succinil-CoA. Esto ori- gina una nueva fuente de confusion en la nomenclatura de Jos enzimas. Un encima puede haber side descubierto gracias a un ensayo enizimitico en el que, por ejemplo, A se convierte enB, Blenzima resibe enlorces un nombre por dicka reac- cién. Sin embargo, se puede Megar a demostrar en trabajos pposteriores que en la célula el enzima acita mayoritariamente convirtiendo B en A. Normalimente, contimia utllizéndose el nombre inieial aun cuando el papel metabélico del enzima estaria mejor descrito si lo lamiramos en virtud de la reac- cion opuesta. Bl enzima glucolltico piruvato quinasa iustra cesta situacién (p, 522). Para un prineipiante en el camipo de Ja bioquimica, esta duplicacién de la nomenclatura pucde ser desconcertante. Comités internacionales han hecho es- Tueraos heroicos pare sistematizar la nomenclatura enzimd- tica (véase Tabla 6-8 para un breve resumen del sistema), pero algunos nombres sistemticos han demostrado ser de- musiado largos, de diffell manejo y de uso no muy frecuente en conversaciones bioquimicas. Hemos intentado a lo largo de este libro utilizar para cada enzima el nombre mis frecuentemente utilizaco entre los bioquimicos y seftalar aquellos casos en los que recibe més de un nombre contin. Para informacién mas actua- lizada sobre la nomenclatura enzimatica dirfjase a las re- comendaciones de The Nomenclature Committee of the Intemational Union of Biochemistry and Molecular Biology Goww.chem qmvae.ukiubmbinomenclature/), ——_— sw pero en oélulas intacta el oxalaeetato es elrinado continua- "mens parla reac atamente eergénica de la irate sintasa (etapa () de a Fig. 16-7). Bsto mantione ta concentracin in- tt lar de oxalacetato extrernadamente baja (<10~¢ w), 10 «que emp la rearcién dela malato deshidregenasa hacia la formacisn de oxalaceato Aunque las reatciones individualles del ciclo del Acido ettrieo fueron deducidas iniciakmente in vilro utilizando tejide muscu- Jar desmenuradio, la via y su regulacién han sido también esta- diadas extensamente in vivo . Utilizando precursores mares dos radiactivamente, tales come el {!4C]piruvato y ['C]ace- tato, los investigadores hun trazado el destino de los atomnos de carbono individuales a través del cielo del dcido eftrico, Al- ‘unos de los primeros experimentos con isétopos produjeron sin embargo un resultado inesperado y conllevaron una consi- derable controversia sobre la via y el mecanismo del cielo del Acide citrico. De hecho estos experimentos parectan confirmar al principio que ¢l citrato no era el primer cido tricarboxilicn formado. £l Recuadro 16-2 da algunos detalles sobre este epi-