Mata Kuliah Biokimia - MKK4213

METABOLISME:
KONSEP DASAR
STF MUHAMMADIYAH

Pengertian metabolisme
Asal kata: metabolism dr Bahasa Latin berarti perubahan
(change).
Metabolisme:
Serangkaian reaksi kimia yang saling terkait (terintegrasi) di
dalam sel untuk untuk mengubah senyawa dasar (raw
materials) menjadi energi dan produk kimia yang diperlukan
oleh sel agar tetap hidup.

Pengertian metabolisme
Fakta umum metabolisme:
Jumlah reaksi banyak, namun jenis reaksinya relatif sedikit
Mekanisme reaksi terkadang sangat sederhana
Hanya k.l. 100 molekul punya peranan sentral dari semua
bentuk kehidupan
Alur metabolik mempunyai pola umum

Pertukaran energi dalam metabolisme

Energi bebas dalam rx metabolisme
A + B

G = Go + RT log

C + D

(1)

Dari Eq 1:
G ditentukan oleh:
- Sifat alami reaktan (enegi bebas standard, Go )
- Konsentrasi
- Energi bebas standard pada pH 7 ditulis Go
G = Go + RT log

(2)

Pertukaran energi dalam metabolisme

Bagaimana rx yang secara termodinamik tdk spontan (G
positif) terjadi pada rx metabolisme?
Reksi yang secara termodinamik tdk spontan (G positif) dpt
dipacu oleh reaksi lain yang secara termodinamik spontan,
yang berpasangan dengan reaksi bersangkutan:

Pada reaksi di atas, reaksi A menjadi C dan D dimediasi oleh

senyawa perantara umum B

Pertukaran energi dalam metabolisme

Peranan ATP dalam metabolisme
ATP adalah perantara/pembawa universal dari energi bebas
dalam sistem biologi

Pertukaran enegi dalam metabolisme

Sel hidup memerlukan input energi bebas yang terus

menerus untuk 3 tujuan utama:
1. Pergerakan
Kontraksi otot dan pergerakan sel lainnya
2. Transport aktif
Molekul dan ion melewati membran
3. Biosintesis
sintesis makromolekul dan biomolekul lainnya dari
molekul sederhana

Dari mana energi berasal?

Bagaimana organisme mengekstraksi energi dari

lingkungan? Chemotroph? Phototroph?

Pertukaran enegi dalam metabolisme

ATP : nukleotida terdiri dari: sebuah adenine, sebuah ribose

dan sebuah unit triphosphate

Bentuk aktif ATP biasanya dalam bentuk kompleks dengan

Mg2+ atau Mn2+

ATP molekul berenergi tinggi karena unit triphosphate berisi

2 ikatan phosphoanhydride

Enegi tinggi dibebaskan ketika ATP dihidrolisis menjadi ADP

dan Pi atau menjadi AMP dan PPi

ATP, AMP dan ADP dapat saling bertukar. Enzim: adenylate

kinase (=myokinase)

Pertukaran enegi dalam metabolisme

Oksidasi fuel molecules pada

chemotroph atau absorpsi cahaya
pada phototroph: energi yg
dihasilkan utk mengubah ADP
dan Pi menjadi ATP

ATP dibentuk dan dipakai secara

terus menerus oleh sel hidup

ATP meningkatkan rasio

kesetimbangan produk : reaktan
dengan faktor 108

Siklus ATP-ADP adalah bentuk

paling mendasar dari pertukaran
energi dalam sistem biologi

Pertukaran elektron dalam metabolisme

Peranan NADH dan FADH2 dalam oksidasi fuel molecules

Pada chemotroph: energi bebas dr oksidasi fuel molecules (ex.

glukosa dan asam lemak)

Penerima elektron akhir (the ultimate electron acceptor): O2

namun, elektron tdk tidak ditransfer lsg ke oksigen

Substrate mentransfer elektron kepada pembawa (carrier)

khusus: NAD dan FAD

NAD+ adalah akseptor elektron utama dalam oksidasi fuel

molecules bagian reaktif adalah cincin nicotinamide

Pertukaran elektron dalam metabolisme

Cincin nikotinamide

Pertukaran elektron dalam metabolisme

Akseptor dan pembawa elektron

utama lainnya: FAD

Oksidized form = FAD

Reduced form = FADH2

Pertukaran elektron dalam metabolisme

FAD menerima elektron dalam reaksi:

Pertukaran elektron dalam metabolisme

Peranan NADPH reductive biosintesis

NADPH mengandung gugus phosphate

NADH dan NADPH sama2 membawa elektron, namun NADPH

hanya digunakan dalam reaksi2 reductive biosynthesis, misal
sintesis asam2 lemak, sedangkan NADH digunakan terutama
utk membangkitkan ATP

Gugus extra (phosphate) berguna untuk mengarahkan agen

pereduksi ini mengenali enzym2 biosintesis

Pertukaran gugus fungsi dlm metabolisme

CoA adalah pembawa universal gugus acyl

Berperan dlm rx asetilasi

CoA = coenzyme A
(A=acetylation)

Bagian reaktif pembwa ggs

acyl: gugus sulfhydryl

Ggs acyl terikat ke CoA melalui

ikatan thio-ester, disebut acylCoA

Gugus acyl yang sering terikat:

acetyl, disebut acetyl CoA

Energi bebas hydrolysis acetyl

CoA: negatif

Pertukaran gugus fungsi dlm metabolisme

Molekul2 pembawa gugus aktif dalam reaksi metabolisme:

THANK YOU