Anda di halaman 1dari 16

 

     

Electrical impedance 
tomography of human brain 
function usingreconstruction 
algorithms based on the finite 
element method
 Teknik Pencitraan TF – 4111

Putry Purwanti 
13306025 
 
Electrical impedance tomography of human brain function using 

reconstruction algorithms based on the finite element method 

Andrew P. Bagshaw,  Adam D. Liston, Richard H. Bayford, Andrew Tizzard, 

Adam P. Gibson, A. Thomas Tidswell, Matthew K. Sparkes, Hamid Dehghani, 

  Colin D. Binnie, and David S. Holder   

Abstract 

Electrical  impedance  tomography  merupakan  teknik  yang  sedang  dikembangkan  untuk  mencitrakan 

konduktifitas  internal  dari  suatu  objek  menggunakan  eksternal  elektroda.  Rekonstruksi  algoritma  yang 

sederhana  adalah  dengan  memodelkan  kepala  sebagai  sebuah  lingkaran  homogen.  Studi  terbaru  yang 

dilakukan  untuk  pengembangan  dan  validasi  rekonstruksi  algoritma  adalah  dengan  menggabungkan 

realistic geometry dan distribusi konduktivitas menggunakan finite element method. 

Data  hasil  simulasi  komputer  dan  spherical  atau  head‐shaped  saline‐filled  tank  phantoms  (yang 

merepresentasikan  real  human  skull)  akan  direkonstruksi  menjadi  gambar  atau  citra.  Penggabungan 

geometri  yang  akurat  dengan  lapisan  extracerebral  menghasilkan  peningkatan  kualitas  citra  EIT  dan 

menjanjikan sebuah scanner fungsi system otak yang murah dan portable di masa yang akan datang. 

Electrical Impedance Tomography 

Electrical  impedance  tomography  (EIT)  merupakan  suatu  teknik  untuk  menghasilkan  gambar 

menggunakan  electrical  property  dari  suatu  objek.  EIT  memungkinkan  mencitrakan  konduktifitas 

internal suatu objek menggunakan eksternal elektroda yang biasanya dipasang pada pinggiran material.  


 
Beberapa keuntungan menggunakan EIT adalah sebagai berikut : 

• Murah 

• Praktis untuk digunakan 

• Cocok untuk memonitoring 

• Pengukuran tidak merusak media 

• Tidak berbahaya apabila digunakan sebagai alat kesehatan karena EIT tidak mengionkan radiasi 

elektromagnet 

  Tabel 1 : Imaging modalities comparison 

 
Gambar 1 : Sistem konfigurasi pengukuran 
 

 

 
Teknik injeksi arus / teknik koleksi data pada EIT 

• EIT Neighboring Method 

• Cross Method 

• Multireference Method 

• Opposite Method 

Gambar 2 : Teknik injeksi arus pada EIT 
 

EIT image reconstruction 

Secara garis besar, image reconstruction pada EIT digambarkan pada blok diagram dibawah ini : 


 
 

Gambar 3 : Image reconstruction algorithm 
 

Image reconstruction dibagi menjadi dua proses. 

1. Forward model 

Forward model digunakan untuk memprediksi 

aliran arus . Forward model  akan memberikan 

representasi dari geometri kepala / tengkorak 

dan  dapat  menggabungkan  konduktivitas 

beberapa  bagian  seperti  kulit  kepala, 

tengkorak,  cerebro‐spinal  fluid  (CSF),  warna 

otak  (putih/abu‐abu),  ketidakbersambungan 

antar  tengkorak  seperti  bekas  jahitan  atau 

kantung mata. 

Gambar 4 : Pendekatan model lapisan otak 


 
Jika  bentuk  benda  yang  sederhana  seperti  lingkaran,  maka  perhitungan  geometri  dapat  dilakukan 

secara  analitik.  Namun,  jika  bentuk  benda  yang  lebih  komplek  maka  diperlukan  sebuah  metode 

numeric menggunakan finite element method (FEM). 

 
Gambar 5 : forward problem flow diagram 
 

2. Reconstruction process (inverse solution) 

Data  yang  diperoleh  dari  forward  model  yang  memberikan  perhitungan  tegangan  dari  kulit  kepala 

merupakan representasi konduktivitas di dalam otak. Data tersebut akan digunakan  ke dalam solusi 

invers  untuk  mendapatkan  perkiraan  distribusi  konduktivitas  internal  dari  perhitungan  tegangan 

boundary. Hubungan antara pengukuran tegangan boundary dan konduktivitas internal, ditentukan 

oleh forward model dan dapat ditampilkan dalam bentuk matrik sensitivitas. 

 
Gambar 6 : inverse problem flow diagram 
 

Masalah  yang  sering  muncul  dalam  menggunakan  EIT  adalah  kesulitan  untuk  menghitung  posisi 

konduktivitas  dari  perhitungan  permukaan  objek.  Pada  umumnya  nilai  potensial  tidak  linear  dengan 

fungsi  konduktivitas.  Namun  pada  paper  ini  dianggap  perubahan  konduktivitas  di  otak  sangat  kecil 


 
(kurang  dari  20%),  sehingga  gambar  dari  perubahan  konduktivitas    dapat  dihasilkan  dari  perubahan 

potensial  pada  permukaan.  Sehingga  dapat  diasumsikan  bahwa  hubungan  antara  potensial  dan 

konduktivitas adalah linear.  

∆V  = perubahan impedansi permukaan 

A  = matrik sensitivitas 

∆σ  = perubahan konduktivitas  

  = pseudo matrik 

Matrik  sensistivitas  merupakan  ill‐conditioned,  maka  harus  dilakukan  regularisasi  terlebih  dahulu 

sehingga  dapat  diinverskan.  Matrik  sensitivitas  ini  didapatkan  dari  hasil  perhitungan  setiap  node  pada 

elemen untuk semua kombinasi injeksi arus dan dari perhitungan voltase electrode. Untuk semua kasus 

eletroda  utama  (point  electrode)  diasumsikan  berada  pada  posisi  terdekat  dengan  posisi  aktual  setiap 

elektroda. 

Pada  paper  ini,  digunakan  beberapa  metode  untuk  memodelkan  bentuk  kepala  manusia.  Pertama, 

kepala manusia dimodelkan sebagai suatu lingkaran yang homogen kemudian dengan bentuk lingkaran 

berlapis  yang  merepresentasikan  lapisan  otak,  CSF,  tengkorak  dan  kulit  kepala.  Selanjutnya  untuk 

mendapatkan  geometri  yang  lebih  spesifik  digunakan  simulated  data  yang  berasal  dari  Spherical  tank 

dan realistic head‐shaped tank.  


 
 

  Gambar 7 :  finite element nodes of homogeneous spherical mesh, the four‐shell and the homogeneous 

head‐shaped mesh
 

Pada model homogeneous sphere, matrik sensitivitas yang dihasilkan dari solusi analitik digunakan untuk 

menentukan  akurasi  dari  solusi  numerik.  Interior  potensial  dari  homogeneous  sphere  didapat  dengan 

menggunakan solusi Neumann. Sensitivitas setiap node dihitung dari potensial dengan cara yang sama 

dengan solusi numerik. 

Semua  finite  elemen  pada  percobaan  ini  dihasilkan  /  dibuat  dengan  bantuan  software  I‐DEAS.  I‐DEAS 

sangat cocok untuk membuat  bidang dan memungkinkan  untuk mengatasi forward problem pada EIT 

untuk kepala manusia. Medan elektrik tiap node pada element dihitung menggunakan solusi linear finite 

element pada MATLAB. Sedangkan sensitivitas tiap node dihitung menggunakan teorema Geselowitz. 


 
 

Gambar 8 : The element faces on the surfaces of the four parts of the full 
 

Generation of simulated data 

Dua jenis simulated data yang digunakan : 

1. Forward  model  dengan  realistic  geometry  (bentuk  kepala)  tapi  memilki  konduktivitas  yang 

homogen 

2. Forward  model  dengan  spherical  shape,  tapi  menggunakan  empat  lapisan  yang  mendekati 

konduktivitas brain, CSF, skull dan scalp.  


 
Tank phantom construction 

• Spherical tank 

Berdiameter  187  mm,  berisi  calcium  sulfat  dengan 

konduktivitas  0.25  Sm‐1,  yang  dibuat  sama  dengan 

konduktivitas jaringan otak. 

• Realistic head‐shaped tank 

Terbuat dari silicon yang di cover dengan tanah liat. Tank 

diisi dengan 0.2% saline untuk menggambarkan otak 

Data simulasi (simulated data) diambil dari kedua tank dengan 

dan  tanpa  adanya  tengkorak.  Hal  ini  bertujuan  untuk 

memperlihatkan efek yang ditimbulkan dari rangka sendiri dan 

dari  kombinasi  rangka  dengan  lapisan  otak  yang 

konduktivitasnya  berbeda.  Data  dari  homogeneous  tank 

direkonstrusi  dengan  asumsi  head‐shaped  forward  geometry 


Gambar 9 : The tank phantom
dan spherical geometry adalah benar. 

Hasil rekonstruksi citra 

Berikut  adalah  kombinasi  perbandingan  tank  phantom  yang  digunakan,  termasuk  reconstruction 

method, sensitivity matrix notation serta tujuan perbandingan tank phantom tersebut. 

10 
 
 
Tabel 2 : Tank phantom combination 

Parameter  yang  digunakan  sebagai  perbandingan  gambar  rekonstruksi  adalah  localisation  accuracy, 

resolusi dan kualitas gambar. 

Dari hasil perbandingan, dapat terlihat bahwa tidak ada perbedaan yang signifikan baik dari localization 

accuracy  maupun  dari  resolusi  gambar  yang  dihasilkan  dari  matrik  sensitifitas  pada  accurate  forward 

model ataupun pada homogeneous sphere. 

 
Tabel 3 : The result of simulated, tank and human data 

 
11 
 
 
Gambar 10 : hasil rekonstruksi citra
 

12 
 
Reconstruction of human data 

 
Gambar 11 : respon konduktivitas otak
 

Gambar di atas merupakan hasil rekonstruksi citra untuk melihat respon konduktivitas otak dari stimulus 

yang diberikan. Gambar 1 (pasien 1), terlihat bahwa konduktivitas bertambah pada bagian otak kanan. 

Sedangkan pada gambar 2 (pasien 2) konduktivitas bertambah pada bagian otak kiri. 

Stimulus yang diberikan berupa gerakan motorik tubuh, yaitu bagian tubuh kanan dan bagian tubuh kiri 

secara bergantian ( kaki, lengan atau telapak tangan ). Hal ini bertujuan untuk melihat otak bagian mana 

yang aktif (konduktivitas meningkat) jika bagian tubuh tertentu digerakkan. 

Kesimpulan 

Penggabungan  realistic  conductivity  distribution  dan  realistic  geometry  pada  forward  model  dapat 

menambah atau memperbaiki resolusi dan kualitas gambar, serta dapat menjelaskan tentang perbaikan 

pada localization accuracy.   

13 
 
Dengan  membandingkan  beberapa  model  (spherical  shape,  spherical  tank,  dan  realistic  head‐shaped 

tank),  tidak  terdapat  perbedaan  yang  signifikan  baik  dari  localization  accuracy  maupun  dari  resolusi 

gambar yang dihasilkan dari matrik sensitivitas. 

Gambar  yang  dihasilkan  hanya  menunjukkan  kenaikan  konduktivitas  pada  otak  (dari  warna  kuning  ke 

warna  biru)  dan  tidak  menjelaskan  dimana  terdapat  kelain  atau  penyakit  pada  otak.  Kenaikan 

konduktivitas ini dikarenakan adanya peningkatan suplai darah menuju bagian otak yang aktif saat diberi 

stimulus. Pada saat pasien menggerakkan tubuh bagian kanannya maka, suplay dari meningkat ke otak 

bagian  kiri  yang  berarti  konduktivitas  pada  otak  bagian  kiri  meningkat.  Hal  ini  terlihat  pada  gambar, 

bahwa otak bagian kiri dominan berwarna biru dan sebaliknya jika bagian tubuh sebelah kiri digerakkan.  

Dengan  terus  dilakukannya  perbaikan‐perbaikan,  EIT  dengan  harga  yang  murah  sangat  menjanjikan 

untuk dijadikan portable neuroimaging system di masa depan.  

Komentar dan Saran 

Pemodelan bentuk kepala dan otak serta lapisan‐lapisannya menggunakan spherical tank, dan realistic 

head‐shaped tank merupakan suatu hal yang sangat kretif. Sebab dengan menggunakan model tersebut 

di atas, kita dapat melakukan berbagai simulasi pada otak tanpa harus mencoba langsung pada manusia. 

Misalnya  saja  kita  dapat  mensimulasikan  bagaimana  rekonstruksi  gambar  yang  dihasilkan  jika  otak 

kelebihan cairan (saline), atau terjadi retakan pada tengkorak. 

Pada paper lain yang saya baca (Margaret Cheney,David Isaacson, Jonathan C. Newel), pemodelan organ 

tubuh manusia dapat menggunakan sebuah bejana  atua cawan silinder yang  di dalamnya  diisi dengan 

bentuk organ tubuh yang ingin dicitrakan, seperti gambar di bawah ini. 

14 
 
 

  Gambar 12 : contoh tank pemodelan

Akan lebih baik jika paper ini dilengkapi dengan 

gambar  diagram  alir  (flow  chart  diagram)  yang 

menggambarakan  urutan  percobaan  yang 

dilakukan,  sehingga  pembaca  lebih  mudah 

untuk memahami alur pemikiran dan percobaan  

penulis pada paper ini.  

Selain  itu  akan  lebih  baik  juga  jika  penulis 

membandingkan  bagaimana  respon  otak 


Gambar 13 : flow chart diagram
terhadap  stimulus  yang  diberikan  pada  pasien 

yang  normal  (sebab  pasien  1  dan  pasien  2  memilki  kelainan/penyakit  pada  otaknya).  Sehingga  dapat 

15 
 
dilihat apakah terdapaat persamaan
n atau perbed dengan yang  tidak. 
daan antara  respon otak  yang sehat d

mbah  output  dari  percobaan  yang  dilakukan,  yaittu  selain  meelihat  respon  otak 
Hal  ini  dapat  menam

terhadap stimulus yang diberikan (ggerakan tubu
uh bagian kiri atau kanan) jjuga dapat m
melihat respon
n otak 

yang berkkelainan jika d
dibandingkan dengan otakk normal. 

Dengan  prinsip  yang  samaa,  sangat  besar 

kemu
ungkinannya  jika  dilakukaan  percobaan
n  lain 

untukk  meniliti  fun


ngsi  otak  kirii  dan  otak  kanan, 
k

bukan
n hanya respo
on gerak tubu
uh pada otak..  

Misalnya saja, otak kanan yangg kuat pada b
bidang 

estetiika atau seni (gambar, music,n imajinassi dan 

sebaggainya). Munggkin saja jika pasien jika seedang 

bernyyanyi  atau  menggambar  kita 


k dapat  melihat 

bagian  otak  man n  menonjol.  Atau 


na  yang  akan

sebaliknya, jika paasien melakukkan hal‐hal seeperti 

G
Gambar 14 : f
fungsi otak m
manusia berhittung,  menuliis  atau  berbiicara,  munkin
n  kita 

akan meliihat bahwa ottak kirinya lah
h yang akan b
bekerja lebih dominan. 

Referenssi  

GAO  Nuo
o  ,  ZHU  Shan dance  tomography 
n‐an,  HE  Bin.  Use  of  3‐D  magnetic  reesonance  elecctrical  imped
indetectin
ng human cerrebral stroke: a simulation study. 2005

Kuo‐Sheng Cheng, Ph.D
D. Electrical Im
mpedance To
omography an
nd Its Medica
al Applicationss.  

W. Stacey. Elecctrical Impeda
Robert W ance Tomogra
aphy. 2006 

Margaret Cheney,David Isaacson, Jo
onathan C. Neewel. Electriccal Impedancee Tomograpyy. 1999 

16