SATUAN ACARA PERKULIAHAN

FAKULTAS FARMASI UGM

2008

MATA KULIAH : BIOLOGI MOLEKULER

KODE MATA KULIAH :
PRASYARAT : BIOKIMIA
SEMESTER/ SKS : III/ 2
PROGRAM : Klas C
DOSEN : 1. Prof.Dr. Sismindari, SU., Apt. (Koord) 3.Dr. Edy Meiyanto. 5. Prof.Dr. Kuswandi
2. Dr. Puji Astuti, MSi.,Apt. 4. Muthi Ikawati Msi.,Apt 6. Prof.Dr.Sudjadi MS.,Apt
Hari : Selasa jam 07.00-08.40 Selasa jam 15.00 – 16.40 Kamis jam 9.00 – 10.40

TIU : Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa dapat mengenal dan mengerti sistem biologi pada level molekuler

Pert.e Tanggal/ Hari/

muan Jam Dosen TIK Pokok Sub PB
Bahasan
1 Tatap muka (1) C. Prof.Dr. 1. Mahasiswa dapat menerangkan Pengenalan Peranan Biologi Molekuler dalam Farmasi,
Sismindari dogma sentral dalam sistem Biologi - materi genetik : Genom, kromosom, gena, DNA,
Selasa 24-8-010 biologi molekuler RNA, protein.
Kamis 26-8-010 B. Muthi Ikawati - Perbedaan genom prokariot dan mamalia, lokasi
Msi. 2. dapat menyebutkan aplikasi biologi centromer, telomere, dan origin replikasi, human
molekuler dalam kehidupan genom project
A. A. Prof.Dr. - Dogma sentral ekspresi gen:replikasi,
B. Kuswandi transkripsi, translasi
-Contoh perkembangan dalam Biologi Molekular :
kloning domba Dolly dan terapi sel induk

2 Tatap muka (2) Mahasiswa dapat menuliskan struktur asam Struktur dan - DNA sebagai pembawa informasi genetik,
nukleat, membandingkan struktur DNA sifat-sifat asam - Struktur DNA( model Watson dan Crick) dan
Selasa 31-8-010 dengan RNA dan dapat menerangkan sifat- nukleat RNA, base-pairing DNA, Sifat DNA dan RNA,
Kamis 02-9- 010 sifat asam nukleat - denaturasi dan renaturasi DNA, suhu leleh DNA,
senyawa2 yang berpengaruh pada denaturasi
DNA, dan jenis-jenis RNA serta fungsinya
- Polimorfisme

3 Tatap muka (3) 1. Mahasiswa dapat menyebutkan Replikasi - Reaksi polimerisasi, Proses replikasi DNA:
enzim-enzim yang berperan dalam DNA konservatif dan semikonservatif, inisiasi,
Selasa 21-9-010 proses replikasi elongasi replikasi,
Kamis 23-9-010 2. dapat menjelaskan proses replikasi - Garpu replikasi, fragmen Okazaki, peran
telomere, peran enzim topoisomerase, mekanisme
1
 proofreading, mutasi karena triple repeat.
- Obat yang bekerja pada tahap replikasi:
penghambat topoisomerase, basa analoh sebagai
obat antivirus
- Penggunaan PCR

IDUL FITRI
4 Tatap muka (4) Mahasiswa dapat menyebut dan menjelaskan Mutagenesis, - Definisi, fenotip, genotip, Arti istilah mutan,
proses reparasi DNA menjelaskan proses mutasi mutasi, mutan mutasi, mutagen; jenis-jenis mutasi, jenis-jenis
Selasa 28-09-010 dan reparasi DNA dan menyebutkan macam dan mutagen mutan, jenis-jenis mutagen (kimia, fisika dan
Kamis30-09-010 macam mutasi dan reparasi DNA Reparasi DNA biologi), mutasi pada level gen, pada level
organisme.
- Stabilitas genetik dan kerusakan DNA, macam-
macam kerusakan DNA: deaminasi, depurinasi,
metilasi, timin dimmer, interkalasi, proses
umum reparasi DNA, repair mismatch,
nucleotide excision repair, respon sel terhadap
kerusakan DNA, penyakit yang disebabkan oleh
adanya mutasi

5 Tatap muka (5) Mahasiswa dapat menerangkan proses Ekspresi gen: Transkripsi pada prokanat :
transkripsi pada prokariot Transkripsi RNA polimerase : inisiasi (TATA Box,
Selasa 5-10-010 pada prokariot promoter), elongasi, terminasi.
Kamis7-10-010 Fenomena transkripsi pada prokariot :
polisistronik, polisom, repressor, aktivator dan
induser

6 Tatap muka (6) Mahasiswa dapat menerangkan regulasi Regulasi Sistem operon, Lac repressor dan Catabolic
Selasa 12-10-010 pada transkripsi inisiasi transkripsi activator protein (CAP), Histidin dan triptofan
Kamis14-10-010 prokariot operon, Lambda dan cropressor, dan operon
gal.

7 Tatap muka (7) Mahasiswa dapat menerangkan proses Translasi Translasi : inisiasi, elongasi, dan terminasi
Selasa 19-10-010 translasi Perbedaan proses translasi pada prokariot dan
Kamis21-10-010 eukariot.
Pasca translasi : modifikasi asam amino.
MID SEMESTER 20 s/d 31 Oktober 08
8 Tatap muka (1) C.Dr Puji A Mahasiswa dapat menerangkan proses Transkripsi Transkripsi pada eukariot : RNA polimerase,
Selasa 09-11-010 B. Dr. Eddy M transkripsi pada eukariot pada eukariot proses maturasi mRNA dan alasannya, proses
Kamis11-11-010 A. Prof.Dr. Sudjadi splicing intron, waktu hidup mRNA,
monosistronik

2
 9 Tatap muka (2) Mahasiswa dapat menerangkan konsep Sistem Peran factor transkripsi, signal transduksi
system regulasi ekspresi gen melalui signal regulasi sederhana (hormone steroid), signal transduksi
Selasa 16-11-010 transduksi system kinase ekspresi gen kompleks (jalur MAP-K dan ras protein)
Kamis18-11-010 eukariot

10 Tatap muka (3) Mahasiswa dapat menerangkan konsep Regulasi G-protein signaling : jalur cAMP, jalur PKC
Selasa 23-11-010 system regulasi ekspresi gen melalui second melalui second
Kamis25-11-010 messenger messenger

11 Tatap muka (4) Mahasiswa dapat menerangkan regulasi Regulasi cell- Overviev : tahapan pembelahan sel dan daur
Daur Sel pada sistem eukariot cycle sel (G1-S-G2-M-phases),
Selasa 30-11-010 Kontrol daur sel pada G1-phase (peran cyclin-
Kamis 2-12-010 cdk dan pRb), pengaturan sistem checkpoint
pada daur sel

12 Tatap muka (5) Regulasi cell- Kontrol daur sel pada S-G2-M-phase (peran
cycle cyclin-cdk dan tumor supresor protein).
Ganti hari
Kamis 9-12-010

13 Tatap muka (6) Mahasiswa dapat menyebutkan jenis-jenis Transformasi - Jenis transposon: transposon, viral
transposon dan mampu menjelaskan genetic oleh retrotransposon dan non-viral retrotransposon.
Selasa 14-12-010 terjadinya Transposisi transposon - Model transposisi dan reproduksi transposon
Kamis16-12-010

14 Tatap muka (7) Diskusi

Selasa 21-12-010
Kamis23-12-010

Pustaka

1. Lodish, H., Berk, A., Zipursky, SL., Matsudaira, P., Baltimore, D., and Darnel, J., 2000, Molecular Cell
Biology, the Fourth Edition, W.H. Freeman and Co., New York
2. Elliot W.H., and Elliot D.C., 1996, Biochemistry and Molecular Biology
3. Lewin B., 2000, Genes VII, Oxford University Press,
4. Alberts, B., et al., 1994, Molecular Biology of the Cell, Third Edition, Garland Publishing, US
5. Sumber terbaru lain yang terkait (internet dll)

Keterangan : 1 pertemuan setara dengan 2 x 50menit

3
 SATUAN ACARA PERKULIAHAN
FAKULTAS FARMASI UGM

MATA KULIAH : BIOLOGI MOLEKULER

KODE MATA KULIAH :
PRASYARAT : BIOKIMIA
SEMESTER/ SKS : III/ 2
PROGRAM : PST/CCP
DOSEN : 1. Dr. Sismindari, SU., Apt. (Koordinator)
2. Dr. Kuswandi, M.Phil., SU., Apt.
3. Dr. Edy Meiyanto, M.Si., Apt.
TIU : Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa dapat mengenal dan mengerti sistem biologi pada level molekuler

Pert.e Tanggal/ Hari/

muan Jam Dosen TIK Pokok Sub PB
Bahasan
1 Rabu 31-8-05 (1) Prof.Dr. 1. Mahasiswa dapat menerangkan Pengenalan Materi genetik : Genom kromosom, gen,
Jam 7-8.50 Sismindari dogma sentral dalam sistem Biologi DNA, RNA, protein.
biologi molekuler
Jum’at 9-9-05(1) Dogma sentral ekspresi gen : replikasi,
Jam 15 – 16.40 2. Mahasiswa dapat menyebutkan transkripsi, translasi
metode-metode yang diperlukan
dalam mempelajari biologi Sistem dan metode analisis dalam biologi
molekuler molekuler : Elektroforesis, northen-southern-
western blot, microarray
2 Rabu 7-9-05 (2) Prof.Dr. Mahasiswa dapat menuliskan struktur asam Struktur dan Struktur DNA dan RNA
Sismindari nukleat, membandingkan struktur DNA sifat-sifat asam Sifat DNA dan RNA ; jenis-jenis RNA serta
Slasa 13-9-05 dengan RNA dan dapat menerangkan sifat- nukleat fungsinya, dan hibridisasi asam nukleat
(2) jam 14.00 sifat asam nukleat
3 Rabu 14-9-05 (3) Prof.Dr. 1. Mahasiswa dapat menyebutkan Replikasi Proses replikasi DNA :
Sismindari enzim-enzim yang berperan dalam DNA Replication forks, inisiasi, elongasi,
Jumat 16-9-05 proses replikasi mekanisme proofreading, peran enzim
(3) 2. Mahasiswa dapat menjelaskan topoisomerase
proses replikasi
4 Rabu 21-9-05 (4 Prof.Dr. 1. Mahasiswa dapat menyebutkan Reparasi DNA Stabilitas genetik dan kerusakan DNA, respon
Sismindari macam-macam reparasi DNA sel terhadap kerusakan DNA, proses umum
Jumat 23-9-05 (4 2. Mahasiswa dapat menjelaskan reparasi DNA, Base excision repair,
proses reparasi DNA nucleotide excision repair

4
5 Rabu 28-9-05 (5) Prof.Dr. 1. Mahasiswa dapat menjelaskan arti Mutagenesis, Arti istilah, jenis-jenis mutasi, jenis-jenis
Sismindari mutan , mutagenesis, mutasi dan mutagen mutasi, mutan mutan, jenis-jenis mutagen (kimia, fisika dan
Jum’at 30-9-05 2. Mahasiswa dapat menyebutkan dan mutagen biologi) dan proses terjadinya mutasi
(5) macam-macam mutagen
3. Mahasiswa dapat menjelaskan terjadinya
mutasi
6 Rabu 5-10-05 (1) Dr. Kuswandi Mahasiswa dapat menerangkan proses Ekspresi gen Transkripsi pada prokanat :
Jam 7-8.50 Apt. transkripsi pada prokariot RNA polimerase : inisiasi (TATA Box,
promoter), elongasi, terminasi.
Jum’at 7-10-05 Fenomena transkripsi pada prokariot :
(1) polisistronik, polisom, repressor, aktivator dan
Jam 15 – 16.40 induser
7 Rabu 12-10-05 Dr. Kuswandi Mahasiswa dapat menerangkan proses Transkripsi pada eukariot : RNA polimerase,
(2) Apt transkripsi pada eukariot proses maturasi mRNA dan alasannya, proses
Jum’at 14-10-05 splicing intron, waktu hidup mRNA,
(2) monosistronik
MID SEMESTER
8 Rabu 9-11-05 Dr. Kuswandi Mahasiswa dapat menerangkan regulasi pada Sistem operon, Lac repressor dan Catabolic
(3) Apt transkripsi inisiasi activator protein (CAP), Histidin dan triptofan
Jum’at 11-11-05 operon, Lambda dan cropressor, dan operon
(3) gal.
9 Rabu 16-11-05 Dr. Kuswandi Mahasiswa dapat menerangkan proses Translasi : inisiasi, elongasi, dan terminasi
(4) Apt translasi Perbedaan proses translasi pada prokariot dan
Jum’at 18-11-05 eukariot.
(4) Pasca translasi : modifikasi asam amino.
10 Rabu 23-11-05 Dr. Edy Mahasiswa dapat menerangkan konsep Pertumbuhan Molekul signaling dan respon seluler
(1) Meiyanto Apt transmisi signal intraseluler sel eukariot (hormon, faktor pertumbuhan,
Jam 7-8.50 neurotransmitter), regulasi, reseptor membran
(2xtatap muka) dan proses transmisi signal,
Jum’at 25-11-05
Jam 15 – 16.40 Beberapa contoh model transmisi signal : G-
(1) protein signal, Jalur ras protein, ion chnnel
dan reseptor intra seluler (interferon gamma,
estrogen, dsb)
11 Rab 30-11-05 Dr. Edy Mahasiswa dapat menerangkan regulasi Daur Overviev : tahapan pembelahan sel dan daur
(2) Meiyanto Apt Sel pada sistem eukariot sel (G1-S-G2-M-phases),
Kontrol daur sel pada sel mamalia (peran
Jum’at 2-9-05 2xtatapmuka cyclin-cdk dan pRb), pengaturan sistem
(2) checkpoint pada daur sel.

12 Rabu 7-12-05 Dr. Edy Mahasiswa dapat menerangkan konsep Transformasi Rekombinasi genetik :
(3) Meiyanto Apt rekombinasi genetik genetik Pengertian dan perannya pada deversitas
genetik,

5
 Jum’at 9-12-05
(3) Inisiasi oleh pemutusan double-strand DNA,
model holliday recombination, rekombinasi
pada E. Coli,
Konversi gen akibat rekombinasi DNA
13 Rabu 14-12-05 Dr. Edy Mahasiswa dapat menyebutkan jenis-jenis Dua golongan transposon : Transposon dan
(4) Meiyanto Apt transposon dan mampu menjelaskan retrotransposon, transposon pada bakteri,
terjadinya Transposisi Mekanisme transposisi : replikatif dan non-
Jum’at 16-12-05 (1xtatapmuka) replikatif
(4)
14 Tatap muka 5 Mahasiswa dapat menerangkan perihal Daur reproduktif retrovirus dan retroposons,
transposisi genetik oleh retrovirus dan transposisi retrovirus,
retroposon
Reverse transkripsi pada virus, Oncogenesis
oleh virus, jenis-jenis retroposon dan proses
transposisinya

Merah  tidak dipakai

Pustaka

6. Lodish, H., Berk, A., Zipursky, SL., Matsudaira, P., Baltimore, D., and Darnel, J., 2000, Molecular Cell
Biology, the Fourth Edition, W.H. Freeman and Co., New York

7. Elliot W.H., and Elliot D.C., 1996, Biochemistry and Molecular Biology

8. Lewin B., 2000, Genes VII, Oxford University Press,

9. Alberts, B., et al., 1994, Molecular Biology of the Cell, Third Edition, Garland Publishing, USA

Keterangan : 1 pertemuan setara dengan 2 x 50menit