biología molecular
Autor de la versión en línea: M. Gonzalo Claros Díaz
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http://www.biorom.uma.es/contenido/Glosario/
0123
3’splice site : sitio de empalme 3’, sitio de ayuste 3’.
SPLICE SITE.
3’UTR: 3’UTR.
TRAILER SEQUENCE.
5’UTR: 5’UTR.
LEADER SEQUENCE.
A
ABC domain: dominio ABC.
ATP-BINDING DOMAIN.
abzyme: aczima.
Anticuerpo con actividad catalítica (por ejemplo, actividad de ribonucleasa).
Observación: el término abzyme —por antibody enzyme— se debería verter al español respetando la abreviatura
española de anticuerpo y no la inglesa; es decir, la ab de antibody debería convertirse en la ac de anticuerpo.
activator: activador.
1. Biol. Mol. Proteína con función reguladora que aumenta la frecuencia de transcripción de un gen. Por lo general
se trata de un factor de transcripción que reconoce y se une a una secuencia nucleotídica breve cerca del promotor
del gen que regula, al promotor mismo o a un potenciador de la transcripción.
2. Enzimol. Compuesto que aumenta la velocidad de la reacción enzimática, distinto de un catalizador o de su
sustrato.
Observación: en los organismos procariotas, un activador (acepción 1.ª) posee dos dominios separados
característicos, el primero es un dominio de unión a una región específica del ADN situada generalmente cerca del
promotor del gen y el segundo es un dominio de interacción con la ARN-polimerasa. En estos casos, la activación se
realiza 1) al facilitar la unión de la polimerasa al promotor (el activador se une por un dominio al ADN y por el otro a
la ARN-polimerasa, como en el caso del operón lac; la activación en estos casos ocurre incluso en presencia de un
represor transcripcional), o bien 2) al interaccionar con el complejo cerrado (es decir, con la ARN-polimerasa ya
unida a la doble hélice ADN) de modo que se produce un cambio conformacional en la ARN-polimerasa o el ADN, el
complejo cerrado pasa al estado abierto y se inicia la transcripción. Un activador también puede ejercer su efecto a
distancia. En estos casos, el activador (p.ej., NtrC) se une a segmentos de ADN que pueden estar situados a unos
pocos cientos de pares de bases del promotor (en dirección 5’), y la interacción con la ARN-polimerasa sólo es
posible si el ADN se pliega y los sitios de unión del activador al ADN y de la ARN-polimerasa al ADN quedan
próximos entre sí.
En los organismos eucariotas, los activadores también poseen dos dominios separados, pero rara vez interactúan
con la ARN-polimerasa de forma directa. Más bien promueven la unión de la ARN-polimerasa al ADN (y la formación
de complejos de iniación) de forma indirecta por dos vías distintas: 1) el activador interacciona únicamente con
proteínas o complejos proteicos que forman parte del aparato transcripcional, distintos de la ARN-polimerasa (p.ej.:
un coactivador o el factor de transcripción TFIID), y éstos a su vez se unen a la ARN-polimerasa que se fija al ADN
para formar el complejo de iniciación transcripcional correspondiente en el promotor; 2) el activador atrae
modificadores de los nucleosomas (p.ej.: histona-acetilasas o factores de remodelado de la cromatina) que
producen un cambio conformacional en la región de la cromatina cercana al gen en cuestión para que la ARN-
polimerasa pueda unirse al ADN y formar el complejo de iniciación transcripcional correspondiente. El activador que
es capaz de interaccionar de forma directa con la polimerasa, sin el auxilio de coactivadores, recibe el nombre de
«transactivador».
acyl- : acil-.
Nombre genérico del grupo funcional que resulta de la eliminación de un grupo hidroxilo de los ácidos orgánicos
tales como los aminoácidos.
AFLP: AFLP.
AMPLIFIED FRAGMENT-LENGTH POLYMORPHISM.
allele : alelo.
Cada una de las posibles formas en las que existe un gen a consecuencia de una o más mutaciones.
Observación: la palabra allele se ha formado por apócope y cambio de la vocal «o» por «e» a partir de la
voz allelomorph, que William Bateson había acuñado a comienzos del siglo xx (y que significa literalmente «forma
alternativa»). Los alelos (o genes alélicos) están situados en loci idénticos en cromosomas homólogos.
Véase HOMOLOGOUS CHROMOSOME y LOCUS.
allelomorph : alelomorfo.
ALLELE.
amplicon: amplicón.
Conjunto de moléculas de ADN idénticas que resulta de una reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Es
esencialmente un clon molecular. Véase CLONE y PCR.
annotation: anotación.
Descripción de la localización precisa, el tamaño y la función (o las funciones) de las secuencias de nucleótidos
(genes, regiones reguladoras y otros elementos) de un genoma (ADN o ARN) o de las secuencias de aminoácidos de
una proteína, y asignación de una función biológica probable a dichas secuencias por comparación con otras
secuencias homólogas descritas en los bancos de datos. Esta tarea supone, además, un trabajo de edición
informática —que algunos distinguen de la annotation propiamente dicha con el nombre de curation—, así como la
inclusión de cualquier otra información pertinente sobre la secuencia descrita. Véase CURATION.
antibody: anticuerpo.
Glucoproteína plasmática producida por un linfocito B al entrar en contacto con un antígeno específico. Recibe
también el nombre de inmunoglobulina. Se trata de la forma soluble del receptor de antígeno presente en la
membrana plasmática del linfocito B, cuya síntesis se induce tras el reconocimiento específico del ligando (el
antígeno). Todos los anticuerpos presentan la misma estructura básica (véase la figura), pero la región de unión con
el antígeno, conocida como parátopo, es extremadamente variable y característica de cada uno de ellos.
Figura: Estructura básica de un anticuerpo
Una molécula de anticuerpo está formada por cuatro polipép-
tidos; dos polipéptidos idénticos de tamaño mayor (cadenas
polipeptídicas pesadas o heavy chains, en verde oscuro) y
dos polipéptidos idénticos de tamaño menor (cadenas
polipeptídicas livianas o light chains, en verde claro), unidas
por puentes disulfuro (s-s) y otros enlaces covalentes y no
covalentes. El contacto con el epítopo del antígeno
(señalado con un círculo) se establece en un punto de unión
específico: el parátopo o antigen binding site (señalado
en color fucsia) ubicado en la región variable de cada
anticuerpo (sombreada en color celeste), formada por los
extremos N de las cadenas pesadas y ligeras (VH, VL).
Existen dos regiones variables y dos parátopos por molécula
de anticuerpo. El resto de la molécula presenta una
estructura constante, común a todas las inmunoglobulinas
(sombreada en color gris). El punto de bifurcación de la Y,
donde existen dos puentes disulfuro, constituye la región de
la bisagra (hinge). Tanto las cadenas livianas como las
pesadas contienen una serie de unidades repetidas de unos
110 aminoácidos cada una que se pliegan de forma
independiente y forman un motivo estructural globular
denominado dominio Ig (regiones con forma de herradura).
Figura extraída de
http://privat.hihm.no/robertw/molbio/5BI37Web/LabExercise5
b-filer/image004.jpg
Anticalin®: Anticalin®
Marca registrada de un método de obtención de lipocalinas humanas artificiales consistente en modificar las asas
lipocalínicas por ingeniería genética de modo que funcionen como las regiones hipervariables de los anticuerpos. Se
usa tambien en plural para designar la nueva clase de proteínas (Anticalins®).
Observación: en principio, tanto Anticalin® son marcas registradas de los laboratorios Pieris AG y como tales no
deben traducirse. No obstante, en ocasiones se escriben en minúscula como cualquier nombre común, a veces entre
comillas, y entonces admiten traducción (anticalin, anticalina; anticalins anticalinas). Véase LIPOCALIN.
anticodon : anticodón.
Triplete de nucleótidos de un ARNt que se aparea con un codón específico del ARNm por complementariedad de
bases a través de puentes de hidrógeno. El apareamiento es antiparalelo, de modo que el extremo 5' de una
secuencia coincide con el extremo 3’ de la otra, por ejemplo:
5’-ACG-3’ (codón)
3’-UGC-5’ (anticodón).
No obstante, para mantener la convención de escritura de las secuencias de nucleótidos en la dirección de 5’ a 3’
suele escribirse el anticodón al revés, con una flecha en dirección opuesta arriba.
antigen: antígeno.
1 Cualquier sustancia que, al ingresar en un organismo inmunocompetente, estimula la producción de una o varias
series de anticuerpos específicos que se unen a ella a través de unos sitios denominados epítopos o determinantes
antigénicos. Un mismo antígeno puede contener múltiples epítopos, algunos de los cuales pueden estar repetidos, y
cada epítopo es específico de un anticuerpo. En esta acepción, antígeno es sinónimo de inmunógeno.
Véase IMMUNOGEN.
2 Cualquier sustancia que es capaz de unirse de forma específica a un anticuerpo o a un receptor localizado en la
superficie de los linfocitos T. Los antígenos que se unen a anticuerpos son de naturaleza extremadamente diversa
(pueden ser desde sustancias relativamente sencillas, como los lípidos y las hormonas, hasta macromoléculas más
complejas, como los ácidos nucleicos y las proteínas, e incluso virus o un fragmento de célula, por citar unos
ejemplos); en cambio, los que se unen con el receptor de superficie de los linfocitos T son únicamente de naturaleza
proteínica. En esta acepción, antígeno no es necesariamente sinónimo de inmunógeno. Véase, por ejemplo, la
entrada HAPTEN.
Observación: el término antigen proviene de la contracción del inglés antibody generator (generador de
anticuerpos).
antiporter: antiportador.
Transportador de dos solutos en direcciones opuestas. Véase PORTER.
antisense-RNA control : regulación por ARN complementario, regulación por ARN antiparalelo, regulación por ARN
antisentido.
1 Mecanismo de regulación génica común a los tres reinos de la naturaleza, observado solo recientemente en los
organismos eucariotas. Los ARN monocatenarios reguladores se unen, por complementariedad total o parcial de
bases, a uno o varios ARN monocatenarios efectores o mensajeros específicos (sense RNA) y, tras formar el híbrido
correspondiente, logran impedir el desempeño de la función del ARN efector o la traducción en proteína del ARN
mensajero.
2 Por extensión, técnica de laboratorio que se basa en la utilización de ARN monocatenarios complementarios para
reducir la expresión de un gen específico.
Observación: los ARN complementarios naturales suelen ser moléculas de 35 a 150 nucleótidos de largo, de
estructura terciaria compleja (que facilita el reconocimiento y la unión al ARN específico) y con capacidad de difundir
a otros compartimentos celulares. Pueden estar codificados en cis (es decir, se transcriben de un promotor
localizado en la hebra opuesta de la misma molécula de ADN) o, más raramente, en trans. Desde el punto de vista
metabólico algunos son estables (la mayoría de los codificados en cromosomas y unos cuantos de origen fágico o
transposónico), pero otros son inestables (los implicados en la regulación del número de copias de plásmidos).
Véase ANTISENSE RNA y SENSE RNA.
antizymes: antizimas.
Familia de proteínas pequeñas que se unen y desestabilizan a la enzima ornitina-descarboxilasa (ODC). La antizima
se induce en presencia de poliaminas y se une a la ODC para formar heterodímeros que carecen de actividad
enzimática. No son «antienzimas».
AP-PCR: AP-PCR.
ARBITRARILY PRIMED PCR.
apoenzyme: apoenzima.
Porción proteica inactiva de una enzima, que sólo adquiere capacidad catalítica cuando se combina con el cofactor
correspondiente (ión metálico, grupo prostético, coenzima). La enzima íntegra (la apoenzima unida al cofactor) se
denomina «holoenzima» o «proteína conjugada». La apoenzima es la que determina la especificidad de la reacción
biológica. Véase CONJUGATED PROTEIN.
aptamer: aptómero.
Ácido nucleico sintético de unos 70-80 nucleótidos capaz de reconocer y unirse a una gran variedad de moléculas.
Observación: Los aptómeros fueron descubiertos en 1990, y desde entonces han cobrado una gran importancia en
el ámbito de las técnicas diagnósticas por su capacidad de plegarse y de reconocer y unirse a dianas muy variadas
(desde proteínas hasta iones metálicos, pasando por colorantes orgánicos, aminoácidos y péptidos, cofactores,
aminoglucósidos, antibióticos y otros fármacos, análogos de base, nucleótidos, etc.). Se unen con una afinidad y
especificidad semejantes a las que presentan los anticuerpos hacia sus antígenos, de hecho, pueden discriminar
ligandos sobre la base de diferencias estructurales tan pequeñas como la presencia o la ausencia de un grupo metilo
o hidroxilo, e incluso los enantiómeros de una misma sustancia. Son resistentes a endonucleasas o exonucleasas si
se fabrican con nucleótidos modificados o se recubren sus extremos con ligandos específicos, y a ciclos consecutivos
de desnaturalizaciones y renaturalizaciones por acción del calor u otros factores, característica poco frecuente en las
proteínas, salvo las de los organismos termófilos. Se pueden marcar con cromóforos específicos (como la biotina o
la fluoresceína). Hoy día es posible reemplazar los conjugados anticuerpo-enzima utilizados en el diagnóstico por
conjugados aptómero-enzima, aunque todavía se desconoce la naturaleza de la interacción que tiene lugar entre
estas moléculas y sus ligandos.
aRNA : ARNa.
ANTISENSE RNA.
array: matriz.
Distribución ordenada de moléculas o de muestras biológicas sobre un soporte sólido.
Observación: según la naturaleza de las moléculas o las muestras biológicas inmovilizadas sobre el soporte en
cuestión, destacan distintos tipos (p. ej.: DNA arrays, protein arrays, tissue arrays). Por lo general, si la matriz
admite miniaturización o contiene una gran densidad de muestras de tamaño muy pequeño, se antepone el
prefijo micro- (microarray, micromatriz), y si no la admite o contiene un menor número de muestras de tamaño
mayor, se antepone el prefijo macro- (macroarray, macromatriz). Otras veces, el prefijo micro- se coloca de forma
arbitraria para destacar el tamaño relativamente pequeño del soporte, sin que se haya establecido a partir de qué
tamaño se debe hablar ya de micromatriz. Sin más especificación, la mayoría de las veces es una
micromatriz (microarray). En México y la Argentina se traduce generalmente por «microarreglo» o
«microordenamiento»(microarray). Es sinónimo de biochip o chip (en su primera acepción).
assortment: distribución.
En la meiosis, es la repartición hacia polos celulares opuestos de los miembros de cada par de cromosomas
homólogos en la anafase I y de los miembros de cada par de cromátides hermanas en la anafase II.
Observación: en algunos diccionarios de bioquímica y biología molecular figura como sinónimo
de reassortment. Se trata de la acción y efecto del verbo to sort en su acepción de ordenar o separar en grupos
(«to arrange or separate into classes or groups»). En los libros de genética en castellano este concepto se expresa
de diversas maneras, según se trate de la meiosis propiamente dicha o de las leyes de Mendel. Por ejemplo, en la
meiosis, se habla de «emigración», «separación» o «segregación» («emigración a cada polo de n cromosomas
[segregación sintélica]»; «separación a cada polo de n cromátides [segregación anfitélica]»), o bien, en relación con
el tercer principio de la herencia mendeliana, de «distribución», «combinación» o «segregación». Véase INDEPENDENT
ASSORTMENT.
B
backbone : esqueleto.
a) Pentose-phosphate backbone, sugar-phosphate backbone (esqueleto de pentosas y fosfatos): serie
concatenada de anillos de desoxirribosas o ribosas de una hebra de ácido nucleico, enlazados entre sí por sus
posiciones 5’ y 3’ a través de un grupo fosfato. Los azúcares y fosfatos confieren las propiedades estructurales al
ácido nucleico, en cuyas bases nitrogenadas, que no forman parte del esqueleto, se almacena la información.
b) protein backbone, peptide backbone (esqueleto proteico): estructura básica de todos los polipéptidos
formada por la serie de enlaces peptídicos que conectan los aminoácidos de una cadena polipeptídica entre sí, con
exclusión de los grupos radicales (-R) asociados a estos aminoácidos.
c) carbohydrate backbone (esqueleto glucídico): serie concatenada de monosacáridos unidos entre sí por enlaces
glucosídicos entre el carbono anomérico de uno de los monosacáridos y uno de los carbonos del otro monosacárido,
distinto del anomérico.
bacteriophage: bacteriófago.
Virus que infecta y se multiplica en una bacteria. Consta de una molécula lineal o circular de ácido nucleico (ADN
mono o bicatenario o ARN monocatenario) protegida por una cubierta de proteínas, que recibe el nombre de
cápside, en la que se distingue una porción más globular o cabeza y una más filamentosa o cola, mediante la cual
se fija a la membrana celular de la bacteria con objeto de inyectar su ácido nucleico. En su día, los bacteriófagos de
la serie T (T2, T3, T4, T7, etc.) contribuyeron en gran medida a dilucidar las bases de la biología molecular; en la
actualidad, los más importantes por sus aplicaciones biotecnológicas son el bacteriófago o fago λ (lambda) y el
bacteriófago M13 (que ha dado derivados fagómidos), muy utilizados como vectores de clonación. Véase LAMBDA
PHAGE y PHAGEMID.
bacteriophage vector: vector fágico.
Bacteriófago que se utiliza como vector de clonación. Véase BACTERIOPHAGE.
base : base.
1. Quím. Cualquiera de una amplia gama de compuestos tales como los óxidos y los hidróxidos de los metales que
poseen por lo menos una de las propiedades siguientes: sabor amargo, son ‘resbaladizos’ en solución, tienen
capacidad de volver azul el tornasol y de cambiar el color de otros indicadores, y pueden reaccionar con los ácidos
para formar sales.
2. Quím. Especie química o entidad molecular con un par de electrones disponibles para aceptar un ión hidrógeno o
protón (definición de base según Brønsted ) o para compartir con el orbital vacante de alguna otra especie química
(definición de base según Lewis).
3. Biol. Mol. Forma abreviada para referirse a una base nitrogenada y, a veces, a un nucleótido.Véase NITROGEN
BASE.
4. Biol. Mol. Unidad de medida que sirve para determinar tanto la longitud como la masa de un ácido nucleico. La
longitud de los ácidos nucleicos extensos se expresa en kilobases (símbolo: kb, 1 kb equivale a 1x103bases) o en
megabases (símbolo: Mb, 1 Mb equivale a 1x106 bases). La longitud de los ácidos nucleicos bicatenarios se expresa
usualmente en «pares de bases» (símbolo pb o, en inglés, bp). La masa de un ácido nucleico, expresada en daltons
(Da), se obtiene multiplicando el número de bases por 309 (o el número de pares de bases del ácido nucleico por
618).
biochip: biochip.
1 Matriz. Véanse array y DNA array.
2 Circuito integrado (chip) cuyas funciones lógicas y electrónicas son realizadas por moléculas de proteína
manipuladas convenientemente.
Observación: a mediados de 1980 esta palabra se utilizaba sobre todo en su segunda acepción, aunque por
entonces también tenía el significado médico de microchip implantable («implantable solid-state devices used as
neurological or physiological prostheses»). Desde finales de 1990 hasta la actualidad, en el ámbito de la biología
molecular se utiliza casi siempre como sinónimo de array (matriz). Sin otro calificativo normalmente se refiere a
una micromatriz de ADN.
bioethics: bioética.
Estudio sistemático de los aspectos éticos (incluidas la percepción, las decisiones, la conducta y las políticas
morales) de las ciencias biológicas en sentido amplio y de la asistencia sanitaria, utilizando una variedad de
métodos éticos en un marco interdisciplinar.
Observación: de las numerosas definiciones de «bioética» que figuran en fuentes acreditadas, hemos escogido la
que consta en la Encyclopaedia of Bioethics (dirigida por Warren T. Reich; 3.ª edición, 1995), que reza textualmente
así: «The systematic study of the moral dimensions (including moral vision, decisions, conduct and policies) of the
life sciences and health care, employing a variety of ethical methodologies in an interdisciplinary setting».
biotechnology: biotecnología.
Utilización de organismos vivos (usualmente microorganismos) o de algunos de sus constituyentes (generalmente
enzimas) con fines industriales; ello incluye desde las tradicionales técnicas de fermentación industrial hasta, en los
últimos tiempos, la utilización de plantas y animales transgénicos para producir proteínas recombinadas con fines
alimentarios o terapéuticos.
bioinformaticist: bioinformático.
Persona con los conocimientos necesarios de biología e informática para comprender un problema de índole
medicobiológica y luego diseñar, someter a prueba y poner en marcha estrategias basadas en técnicas informáticas
para resolverlo. Véase BIOINFORMATICS.
bioinformatics: bioinformática.
Informática aplicada a la recolección, al almacenamiento y al análisis de datos biológicos. En su artículo «What is
bioinformatics?» Nicholas M. Luscombe define los principales objetivos de esta disciplina del modo siguiente: 1)
organizar los datos biológicos de forma que los investigadores tengan acceso a la información existente y puedan a
su vez enviar información a medida que obtienen datos experimentales nuevos (p. ej.: bancos de datos sobre
estructuras tridimensionales de proteínas, como el Protein Data Bank); 2) crear las herramientas y los recursos
necesarios para efectuar análisis específicos (p. ej.: programas, como FASTA y PSI-BLAST, que permiten comparar
las secuencias de aminoácidos de proteínas desconocidas con las secuencias de aminoácidos de proteínas ya
caracterizadas); 3) utilizar dichas herramientas para analizar los datos de forma global e interpretar los resultados a
fin de extraer su significado biológico (p. ej.: análisis global de un sistema biológico en particular y su comparación
con otros sistemas relacionados a efectos de revelar los principios comunes por los que se rigen y poner de
manifiesto propiedades propias de alguno de ellos o nuevas).
Observación: varias fuentes coinciden en que el término bioinformatics se concibió, a mediados de 1980, para
referirse únicamente al análisis de datos procedentes de secuenciaciones biológicas (la fecha de su entrada en
circulación se puede constatar mediante una búsqueda en la base de datos HighWire Press, de la Universidad de
Stanford). En la actualidad, como acabamos de ver, su significado es un poco más amplio, aunque hasta hoy
todavía no existe una definición consensuada. Por una parte, según John M. Hancock (Dictionary of bioinformatics
and computational biology, 2004), los términos bioinformatics y computational biology pueden considerarse
sinónimos; el primero es más frecuente en el Reino Unido y Europa, y el segundo, más utilizado en los EE. UU. Por
otra, también según Hancock, algunos atribuyen a la bioinformática un significado un poco más restringuido:
«[bioinformatics can be considered] the computational storage and manipulation (but not analysis) of biological
information and computational biology as a more biology-oriented discipline aimed at learning new knowledge about
biological systems». Incluso cuando se establece alguna diferencia entre ambas, los límites son muy difusos, y no
hay concordancia estricta entre las definiciones que se ofrecen; véanse, por ejemplo, las que recogen Benfey y
Protopapas en su libro Essentials of Genomics: «computational biology is a term to describe the development of
algorithms to solve problems in biology. [...] Bioinformatics is the application of computational biology to real data
for the purposes of analysis and data management.», o el catedrático David M. Glick en su Glossary of Biochemistry
and Molecular Biology: «[Bioinformatics is t]he management, manipulation and use of DNA nucleotide sequences,
and consequent protein amino acid sequences, that are known from sequencing of genomes and cDNA libraries»
(esta definición es algo antigua; se basa en un artículo de Andrade y Sander publicado en 1997, y el glosario no
incluye computational biology como entrada separada).
Por último, en el tesauro de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos (MeSH, Medical Subject
Headings), elaborado en colaboración con especialistas de las esferas respectivas, la expresión computational
biology figura como sinónimo estricto de bioinformatics, con la siguiente definición: «A field of biology concerned
with the development of techniques for the collection and manipulation of biological data, and the use of such data
to make biological discoveries or predictions. This field encompasses all computational methods and theories
applicable to Molecular Biology and areas of computer-based techniques for solving biological problems including
manipulation of models and datasets».
blueprint: juego completo de genes (genoma), material hereditario (ADN o ARN), información genética (contenida
en la secuencia nucleotídica del genoma), constitución genética (genotipo), según el contexto.
→ GENETIC BLUEPRINT
box: caja.
Secuencia de aminoácidos o de nucleótidos. Por lo general, se trata de una secuencia conservada entre distintas
especies (consenso).
Observación: numerosas secuencias aminoacídicas o nucleotídicas que desempeñan una función reguladora
reciben el nombre de caja (box) precedida de un nombre generalmente derivado de la secuencia consenso en
cuestión, a saber, CAAT box (pronunciada «cat»: 5’GGCCATCT3’), TATA box (5’TATAAT3’), GC box
(5’GGGCGG3’), destruction box, homeobox, etc. Según varios autores, entre ellos Lodish y cols., el
término box (caja) proviene de la costumbre de diagramar dentro de un recuadro la secuencia conservada de ADN
en el momento de comparar secuencias génicas diferentes.Véase CONSENSUS SEQUENCE.
bridge: puente.
Enlace, átomo o cadena no ramificada de átomos que conectan dos partes de una molécula o dos moléculas
adyacentes entre sí. Son ejemplos de puentes químicos el «puente disulfuro» (disulfide bridge, disulfide bond: —S—
S—), enlace covalente que se establece en las proteínas como resultado de la oxidación de dos grupos sulfhidrilo (–
SH) de sendos residuos de cisteína, y el «puente de hidrógeno» (hydrogen bridge, hydrogen bond, hydrogen
bonding: —O—H....N—), enlace más débil que el anterior o interacción electrostática que se establece entre un
átomo electronegativo (por ejemplo, de flúor, nitrógeno, azufre u oxígeno) y un átomo de hidrógeno, él mismo
covalentemente unido a un átomo electronegativo como los del ejemplo.
call, to (a base, a trace, a peak): designar o identificar (leer) un nucleótido; interpretar o descifrar (leer) un
cromatograma o un máximo del cromatograma.
Observación: en relación con los cromatogramas de secuenciación, el verbo to call se utiliza al menos con dos
sentidos distintos: a) designar o identificar el nucleótido correspondiente a un máximo del cromatograma (to call a
base) y b) interpretar o descifrar un máximo del cromatograma o el cromatograma de secuenciación (to call a peak,
to call a trace). Esto mismo se expresa a veces con el verbo to read (leer). Veamos algunos ejemplos:
«The reading of raw sequence traces, or base-calling, is now routinely performed using automated software that
reads bases, aligns similar sequences, and provides an intuitive platform for editing.» (La lectura de los
cromatogramas de secuenciación originales —base-calling en inglés— ahora se efectúa sistemáticamente con ayuda
de un programa informático automatizado que lee los nucleótidos, alinea secuencias similares y suministra una
interfaz adecuada para la edición.
«The phred software reads DNA sequencing trace files, calls bases, and assigns a quality value to each called base.»
(El programa Phred lee los archivos del cromatograma de secuenciación del ADN, identifica los nucleótidos y asigna
un valor cualitativo a cada nucleótido identificado.)
«This results in the basecalling software being unable to clearly discern the start and stop of the peaks in the trace,
resulting in the software being unable to call a peak (nucleotide) with any certainty.» (Ello hace que el programa de
lectura de nucleótidos sea incapaz de discernir con claridad dónde empiezan y terminan los máximos del
cromatograma, de modo que no puede leer los máximos [nucleótidos] con certitud).
cassette: casete.
1. Locus de secuencias de nucleótidos de función relacionada ubicados en serie o en tándem, que al sustituirse uno
por otro determinan un cambio de fenotipo; p.ej., en el «modelo del casete determinante del tipo sexual de la
levadura» (cassette model for mating type) ocurre un reemplazo unidireccional del locus o casete activo MAT –locus
receptor– por uno de los locus o casetes silenciosos denominado HML o HMR –locus donador–, lo cual determina un
cambio del tipo sexual (mating type) de la levadura.
2. Secuencia o dominio de aminoácidos. Se habla así de «casetes (dominios) de unión a ATP» (ATP-binding
cassettes), «hidrólisis de ATP mediante esos casetes (dominios)» («hidrolysis of ATP by those cassettes»), «casete
(secuencia) de 11 aminoácidos» («11-residue cassette»), etc. Véase DOMAIN.
3. Segmento de ADN que se escinde en bloque del fragmento de ADN que lo contiene y se inserta en un ADN
homólogo u heterólogo de forma natural o artificial.
Véanse CASSETTE MUTAGENESIS, EXPRESSION CASSETTE y GENE CASSETTE.
cDNA: ADNc.
COMPLEMENTARY DNA.
centimorgan: centimorgan.
Unidad de distancia arbitraria entre marcadores genéticos equivalente a una frecuencia de recombinación del 1 %.
Se utiliza en los mapas de ligamiento (o genéticos), donde la distancia entre locus se mide a través de la frecuencia
de recombinación (o porcentaje de gametos recombinados o «recombinantes»). Su símbolo es «cM» (1 cM = 1 %
de recombinantes). Fue concebida en honor al genetista y premio nobel Thomas Hunt Morgan (18661945).
«In Huntington disease, for example, a probe has been identified which is 3-5 centimorgans away from the
Huntington disease locus.» (Por ejemplo, en la enfermedad de Huntington, se ha identificado una sonda situada a
unos 3 a 5 centimórgans de distancia del locus génico de dicha enfermedad.)
Observación: es sinónimo de genetic map unit o Morgan’s unit. La idea que llevó a Alfred Sturtevant a sentar sus
bases —cuando todavía era un estudiante de genética que trabajaba en estrecha colaboración con Thomas Hunt
Morgan— fue el principio de que cuanto mayor es la distancia entre dos genes ligados (situados en un mismo
cromosoma), mayor es la probabilidad de que se produzca un entrecruzamiento (crossing-over) en el segmento
cromosómico que los separa y tanto mayor la proporción de gametos recombinados que se producirán. Si el
ligamiento es muy estrecho, la frecuencia de recombinación se reduce drásticamente (es significativamente inferior
al 50 %). En cambio, una frecuencia de recombinación cercana al 50 % indica que los genes se distribuyen
independientemente unos de otros (assort independently) en los gametos, con lo que se presupone que ambos
genes se encuentran en distintos pares cromosómicos (lo cual no siempre es el caso). Según Lacadena, esta unidad
se definió así desde los inicios de la genética, pero el prefijo centi-está mal aplicado, pues nunca indicó la centésima
parte de otra cosa. Por otro lado, los diccionarios especializados también recogen como unidad el morgan, definido
como 100 centimorgan, que apenas se usa en la práctica. En cuanto al plural de la voz «morgan», de todas las
posibilidades que cabe imaginar, a saber: diez centimorgan, diez centimorgans, diez centimórgans, diez
centimórganes y diez centimorganios, las únicas que se utilizan en la práctica en los textos de genética en
castellano son las dos primeras (diez centimorgan o diez centimorgans). No obstante, el plural habitual a la inglesa,
«centimorgans», es contrario a la formación de plurales en español y a la ortografía española general, que obliga a
acentuar las palabras llanas terminadas en «s» precedida de otras consonantes (es decir, que de escribirlo
correctamente debería ser «centimórgans», como en el caso de «bíceps», aunque también se puede dejar en inglés
y en cursiva: centimorgans).
chimaera: quimera.
CHIMERA.
chimera: quimera.
1.Gen. Organismo compuesto de una mezcla de tejidos o de células de genotipo distinto, derivados de cigotos
diferentes. No es exactamente lo mismo que un mosaico. Véase MOSAIC.
2.Bot. Organismo mixto formado por vía vegetativa a expensas de otros dos concrescentes por injerto. Las
quimeras proceden de los tejidos de soldadura entre un injerto (por ejemplo, S. nigrum) y un patrón (por
ejemplo,S. lycopersicum), cuando en los tejidos soldados se forma una yema de constitución celular mixta. Estos
híbridos también reciben el nombre de «híbridos quiméricos».
chip: chip.
1 Matriz. Véanse ARRAY y DNA ARRAY.
2 Circuito integrado que cumple numerosas funciones en ordenadores y otros dispositivos electrónicos.
chondriome: condrioma.
1 Conjunto de todas las mitocondrias de una célula.
2 Genoma de una mitocondria.
chromatid: cromátide.
Unidad citogenética indivisible del cromosoma constituida por una fibra de cromatina (es decir, por una molécula
lineal continua de ADN bicatenario y proteínas). El cromosoma puede existir en forma de una sola cromátide (como
sucede en la anafase y la telofase mitóticas y en el período gap 1 o G1 de la interfase) o en estado de dos
cromátides (como sucede en el período gap 2 o G2 de la interfase y en la profase y metafase mitóticas), en este
último caso, como resultado de la duplicación del ADN en el período de síntesis de la interfase celular. Las dos
cromátides que componen un mismo cromosoma reciben el nombre de «cromátides hermanas».
Observación: es sinónimo de half chromosome. En los libros de texto especializados figura asimismo como
«cromátida» o «cromatidio». Según Navarro, la mayoría de los vocablos médicos que incorporan la terminación «–
id» en inglés adoptan en español la desinencia «-ide». En bioquímica y biología molecular ello también se cumple en
casos como diploid, diploide; solenoid, solenoide; capsid, cápside (muchísimo más frecuente incluso que la variante
«cápsida»), pero existen notables excepciones a la
regla: lipid, lípido; hybrid, híbrido; acid, ácido; plasmid, plásmido; cosmid, cósmido; fluid, fluido.
chromatin: cromatina.
Fibras de ADN y de proteína presentes en el núcleo de la mayoría de las células eucariontes que están en interfase.
Cada fibra consta de una única y larga molécula de ADN genómico asociado a histonas, otras proteínas y ARN; está
organizada en subunidades llamadas nucleosomas, más o menos condensadas en estructuras de 30 o 10 nm de
diámetro (véase la figura). En la metafase de las células en división mitótica o meiótica, la fibra en forma de
solenoide de 30 nm ya duplicada se pliega y enrolla adicionalmente para formar supersolenoides de mayor diámetro
(400-600 nm) que conforman un cromosoma de dos cromátidas unidas por el centrómero. La cromatina, como
sustancia que constituye el núcleo interfásico, fue clasificada en un principio en dos categorías distintas según su
reacción a la tinción. La cromatina mayoritaria se denominó eucromatina y la que se teñía de forma distinta se
llamó heterocromatina. Hoy día se distinguen por otras propiedades: la heterocromatina consta de fibras de
nucleoproteína muy condensadas, casi como los cromosomas en la mitosis (lo cual impide la transcripción de
genes), se duplica de forma desfasada de la eucromatina y puede contener secuencias extremadamente repetidas;
la eucromatina consta de fibras menos condensadas que un cromosoma mitótico. Los genes se transcriben siempre
a partir de la eucromatina.
Observación: la cromatina se definió a fines del siglo xix como «la sustancia que constituye el núcleo interfásico y
muestra ciertas propiedades de tinción» (Flemming, 1882).7 Hoy día esta denominación se utiliza mayoritariamente
en relación con la organización molecular del material hereditario de los organismos eucariontes.
Modelo esquemático de una fibra de cromatina en distintos estados de condensación.
Las histonas se han dibujado en verde y el ADN en naranja. En la parte superior de la
figura se ilustra una fibra de cromatina completamente condensada (estructura en
forma de solenoide de 30 nm de diámetro); en la central, una fibra parcialmente
condensada, y en la inferior, la misma fibra no condensada, con los nucleosomas
individuales unidos por el ADN conector (estructura de 10 nm de diámetro).
Reproducido por cortesía del Dr. Doug Lundberg, profesor de Ingeniería Genética de
la Air Academy High School
(<http://academy.d20.co.edu/kadets/lundberg/index.html>).
Sonda fluorescente de cytoTrend Biotech Engineering lTD que hibrida con ambos brazos
(1p y 1q) y con el centrómero del cromosoma 1 humano. (Imagen disponible en el
siguiente url de cytoTrend Biotech Engineering lTD:
<www.cytotrend.com/products.asp?classid=4>)
chromosome parachuting: «aterrizaje» en el cromosoma.
→ CHROMOSOME LANDING
cistron : cistrón.
1 Segmento de material
genético (ADN o ARN) que
codifica un polipéptido y dentro
del cual los pares de
mutaciones en configuración
trans originan una deficiencia o
anomalía estructural en la
correspondiente proteína o
enzima (véase el esquema).
2 Mínima unidad de ADN o de
ARN capaz de codificar un producto génico funcional. En los ARNm coincide con un marco de lectura abierto u ORF
(open reading frame). Es sinónimo de «gen» en su tercera acepción. Véase gene y open reading frame.
Observación: la palabra cistron fue acuñada por Seymour Benzer en 1957 cuando realizaba ensayos genéticos con
mutantes. En un ensayo cis-trans (cis-trans test), cuando dos mutaciones de un gen están en cis, el fenotipo es
silvestre (salvaje), mientras que cuando están en trans el fenotipo es mutante. De este análisis cis-trans procede la
voz cistrón. Hoy en día el nombre ha caído en desuso debido a que los análisis genéticos se realizan por
secuenciación y no por mutación. Nótese que cuando una proteína está constituida por un solo polipéptido (con
independencia de que éste se repita), el concepto «un gen, una enzima» coincide con el de «un cistrón, un
polipéptido».
clone: clon.
1 Conjunto de células o de organismos genéticamente idénticos, originados a partir de una única célula u organismo
por reproducción asexual, por división artificial de estados embrionarios iniciales o por transferencia artificial de
núcleos.
2 Conjunto de réplicas de un fragmento de ADN recombinado obtenido por técnicas de ingeniería genética.
Véase CLONING, GENETIC ENGINEERING y PCR.
Observación: son ejemplos de clones naturales las bacterias de una misma colonia, los gemelos humanos y los
esquejes o estacas de un solo pie en las plantas. El ejemplo más conocido de un clon de laboratorio es la oveja
Dolly, que se obtuvo por trasplante del núcleo de una célula de glándula mamaria de una oveja adulta a un óvulo al
que se le había extirpado previamente el núcleo. Dolly nació de ese óvulo implantado en una madre de alquiler
(surrogate mother).
cloning: clonación.
1 Producción de moléculas, células u organismos clónicos (idénticos entre sí). En la naturaleza se producen clones
naturales por procedimientos de reproducción asexual o agámica tales como la fisión, la mitosis, el injerto o la
partenogénesis, entre otros.
2 En biología molecular, por «clonación de ADN» se entiende el aislamiento y la multiplicación de fragmentos de
ADN específicos, lo cual se realiza en varias etapas. En primer lugar, el ADN de interés se purifica y digiere con
enzimas de restricción, y los fragmentos de ADN obtenidos se insertan luego en vectores apropiados. Cada uno de
estos fragmentos así recombinado (fragmento + vector) se introduce en células de bacterias o de levaduras que se
reproducen por fisión o mitosis, de suerte que a medida que lo hacen se multiplica asimismo la secuencia
recombinada que cada una alberga. Por otro lado, una célula puede contener múltiples copias del vector
recombinado. A continuación, es relativamente fácil separar las células bacterianas o de levadura diluyéndolas y
dejándolas crecer en placas de agarosa para que formen la colonia correspondiente. Cada colonia representa el
conjunto de descendientes de una misma célula y contiene, por consiguiente, una población homogénea de
moléculas de ADN recombinado (el «clon»).
Observación: en los libros de texto figuran asimismo las variantes «clonado», «clonamiento» y «clonaje». Hay
quienes desaconsejan el uso de esta última por tacharla de galicismo derivado del clonage francés (de hecho, la
terminación –aje es característica de muchas palabras que nos vienen del francés, como aterrizaje, coraje,
cortometraje, demarraje, etc.). De todas las variantes (clonación, clonado, clonamiento y clonaje) sólo la primera
está registrada en el diccionario académico. Dése preferencia, pues, a la voz «clonación».
coactivator: coactivador.
Factor de transcripción que aumenta la eficiencia de la transcripción de un gen sin unirse directamente al ADN.
Establece un puente de comunicación entre el activador y el aparato transcripcional básico o basal mediante
interacciones interproteicas.
Observación: se conocen diversos tipos de coactivadores compuestos de distintas subunidades peptídicas, los más
conocidos de este grupo son el complejo mediador (Mediator complex o MED) y otros complejos proteicos de
función semejante, como TRAP/SMCC, PC2, DRIP, CRSP, NAT y ARC. Otros coactivadores, como los de la familia
p160, constan de una sola subunidad peptídica, por ejemplo, SRC-1 (coactivador 1 del receptor de esteroides),
GRIP-1 (coactivador 1 del receptor de glucocorticoides) y NcoA-1 (coactivador 1 de los receptores hormonales
nucleares). Véanse ACTIVATOR y BASAL TRANSCRIPTION APPARATUS.
code for, to : codificar, cifrar, determinar.
Contener una secuencia de nucleótidos la información suficiente para la producción de una proteína o un ácido
nucleico funcional.
Observación: en castellano, el verbo codificar, en su acepción genético-molecular, tiende a conservar el carácter
transitivo; por consiguiente, se deben evitar las traducciones literales del estilo «codifica para» o «codifica a». Lo
correcto es decir, por ejemplo, «el gen X que codifica la proteína Y». Más dudoso es el uso del verbo cifrar en frases
tales como «el gen X que cifra la proteína Y», por cuanto «cifrar» es, según el diccionario académico: «Transcribir
en guarismos, letras o símbolos, de acuerdo con una clave, un mensaje cuyo contenido se quiere ocultar» y según
el nuevo DUE: «Escribir un mensaje en cifra (clave)». De seguir cualquiera de estas definiciones, la frase debería
construirse de otra forma, por ejemplo: «el mensaje para la fabricación de una proteína se halla cifrado [oculto,
secreto] en la secuencia de bases de un gen».
codon : codón.
Secuencia de tres nucleótidos consecutivos en una molécula de ARNm. Codifica un aminoácido específico o las
señales de iniciación o de terminación de la lectura de un mensaje. Véase START CODON y STOP CODON.
Observación: el DRAE recoge esta voz como palabra aguda y, por lo tanto, debe llevar acento prosódico (y
ortográfico) en la última «o» (codón). Se usa asimismo, de forma más laxa, para nombrar los tripletes de bases de
una cadena codificante o no codificante de un ácido nucleico genómico.
coenzyme: coenzima.
Cofactor orgánico de una enzima unido a la misma por enlaces débiles (suele ser un nucleótido o una vitamina
como NAD+, FAD, NADP+ y CoA). Participa en la reacción enzimática como aceptor o donador (disociable) de grupos
químicos o electrones. Véase COFACTOR.
cofactor: cofactor.
Compuesto de naturaleza no proteica, por lo general de peso molecular pequeño, necesario para la actividad de una
enzima. Puede ser un ión metálico (p.ej.: Fe2+ o Fe3+, Zn2+, Cu+ o Cu2+) o un compuesto orgánico. En este último
caso puede estar unido de forma más o menos fuerte a la proteína: si la unión es fuerte (covalente) se denomina
grupo prostético (p.ej.: grupo hemo) y si la unión es más débil se llama coenzima (con frecuencia un nucleótido o
una vitamina como, por ejemplo, NAD+, FAD, NADP+ y CoA).
Observación: algunos autores consideran que los cofactores son únicamente los iones inorgánicos. No incluyen los
grupos prostéticos ni las coenzimas dentro de este grupo. Tampoco es tan clara la distinción entre grupo prostético
y coenzima (por ejemplo, el FAD se considera ora una coenzima, ora un grupo prostético).
corepressor: correpresor.
1. Molécula que inhibe la síntesis de las enzimas responsables de sintetizarla. Por ejemplo, en el operón trp, el
triptofano funciona como correpresor de su síntesis: se une al represor e induce un cambio conformacional en esa
proteína, de suerte que el represor se vuelve activo, se une al operador y bloquea la transcripción de los genes del
operón.
2. Factor de transcripción que disminuye la frecuencia de transcripción de un gen sin necesidad de unirse al ADN.
Suele hacer de puente entre un represor (p.ej.: un receptor de hormonas esteroideas y tiroideas) y el complejo de
transcripción básico o basal. En esta acepción son ejemplos de correpresores el N-Cor (nuclear homone receptor
corepresor) y el SMRT (silencing mediator for retinoid and thyroid hormone receptors). Véase COACTIVATOR.
cosmid: cósmido.
Plásmido en el que se ha insertado la región Cos del fago λ (lambda). Es un vector de clonación especialmente útil
para clonar fragmentos de ADN (insertos) de tamaño relativamente grande, aunque inferior a 52 kb. La región Cos
confiere al plásmido la facilidad de encapsidarse in vitro como lo hace el bacteriófago b, siempre que exista un
inserto de 37 a 52 kb entre los extremos Cos, con el auxilio de un fago λ silvestre. Tras ser inyectado por el fago λ
en la bacteria, el cósmido se comporta como un plásmido.
co-suppression : cosupresión.
Inhibición postranscripcional conjunta de la expresión de un gen endógeno y de su copia transgénica. Es un
mecanismo esencialmente idéntico o similar al de la ribointerferencia (RNA interference), pero recibió este nombre
cuando fue descubierto inicialmente en plantas transgénicas del género Petunia. Véase POST-TRANSCRIPTIONAL GENE
SILENCING (PTGS) y RNA INTERFERENCE.
cotransport: cotransporte.
Traslado simultáneo de dos solutos de un lado a otro de una membrana biológica, bien en la misma dirección
(cotransporte unidireccional o simporte) o bien en direcciones contrarias (cotransporte bidireccional o antiporte).
Véase ANTIPORT y SYMPORT.
Observación: con frecuencia se utiliza como sinónimo de «cotransporte unidireccional» (simporte), pues, a menos
que se especifique otra cosa, se sobreentiende que el transporte simultáneo de dos solutos ocurre en la misma
dirección.
coverage: cobertura.
1 Cantidad de veces que se ha secuenciado teóricamente un nucleótido de un inserto en la genoteca genómica (por
ejemplo, un 10x sequence coverage o tenfold coverage significa que cada nucleótido del genoma fue secuenciado
teóricamente diez veces). Cuanto mayor sea el número de fragmentos clonados de ADN que se secuencian, tanto
mayor será la cobertura.
2 Cantidad de veces que un segmento genómico está representado en la genoteca.
cRNA: ARNc.
COMPLEMENTARY RNA.
crossing over: entrecruzamiento. Intercambio de segmentos de ADN entre cromosomas homólogos. Normalmente
ocurre en la meiosis (entre cromátides de cromosomas homólogos), pero también puede darse en la mitosis e
incluso puede haber entrecruzamiento entre cromátides hermanas (en cuyo caso usualmente no da por resultado
una recombinación genética).
Observación: se escribe asimismo crossing-over o crossover y en castellano también se conoce menos
frecuentemente como «sobrecruzamiento» (Lacadena). Suele usarse alternativamente como sinónimo de
«recombinación» (recombination) y «quiasma» (chiasma, cuyo plural es chiasmata en inglés y «quiasmas» en
castellano). No obstante, estrictamente hablando no son lo mismo. En la meiosis, por entrecruzamiento se entiende
el intercambio de segmentos de ADN entre cromosomas homólogos por medio de un proceso de escisión y reunión
de ADN que ocurre en la fase de paquinema de la profase I (que no se ve al microscopio). En cambio, el quiasma es
el punto de cruzamiento, en forma de cruz de San Andrés o de cruz griega —según explica el catedrático Juan
Ramón Lacadena—, que se visualiza posteriormente al microscopio entre las cromátides homólogas en la fase
siguiente (diplonema) de la profase I. Se considera la «expresión citológica» o manifestación visible del
entrecruzamiento. Como resultado del entrecruzamiento meiótico se obtienen cromátides que aportan una nueva
combinación de alelos a los descendientes, que es lo que se denomina «recombinación genética». La frecuencia de
aparición de cromátides recombinadas se puede utilizar para determinar la distancia que existe entre los alelos de
un mismo cromosoma y construir así un mapa de ligamiento (también llamado «genético» o «cromosómico»).
Téngase presente que el entrecruzamiento meiótico no da necesariamente por resultado una nueva combinación
alélica, pues podría ocurrir un doble entrecruzamiento entre dos locus que puede evitar la recombinación.
cross-linking: entrecruzamiento, interconexión.
1 Formación de una unión covalente entre una base nucleotídica de una hebra de ADN bicatenario y la base opuesta
de la hebra complementaria por medio de sustancias químicas, como la mitomicina C. De esa forma se inhibe tanto
la síntesis de ADN como la transcripción génica.
2 Enlace transversal entre dos cadenas de polímeros (o entre regiones de una misma cadena polimérica) que au-
menta la rigidez de éstos. Se establece naturalmente en la queratina, la insulina y otras proteínas, pero también se
puede formar artificialmente mediante la adición de una sustancia química (un agente de entrecruzamiento o
entrecruzador) al polímero y la exposición de la mezcla al calor, o sometiendo el polímero a una radiación de alta
energía.
Observación: respecto a la segunda acepción, en el caso concreto de los geles de poliacrilamida y en cualquier
situación en que se formen retículos como resultado del entrecruzamiento de moléculas debido a un agente
entrecruzador, también se puede traducir por «reticulación» (el agente se llama entonces «reticulante»). La
poliacrilamida es un polímero formado a partir de monómeros de acrilamida que se entrecruzan con bisacrilamida (u
otro agente entrecruzador).
curator: depurador.
Persona encargada de revisar las secuencias de nucleótidos o de aminoácidos que están anotadas en una base de
datos, de eliminar los errores de anotación que pueda haber y de completar la información sobre cada una de esas
secuencias añadiendo los datos que sean necesarios.
Observación: en lenguaje coloquial de los especialistas también se conoce como ‘curador’. Véase ANNOTATION.
D
data mining: prospección de datos.
Descubrimiento de relaciones o pautas existentes dentro de un grupo de datos experimentales mediante el uso de
técnicas analíticas semiautomatizadas o completamente automatizadas, y la consiguiente formulación de hipótesis.
Observación: es sinónimo de pattern analysis, intelligent data analysis, knowledge discovery, pattern
discovery y pattern recognition. Por «pauta» (pattern) se entiende en este caso cualquier relación que pueda existir
dentro de un conjunto específico de datos. Según Hiroaki Kitano (2002), constituye una de las dos ramas de la
bioinformática; la otra es el análisis basado en simulaciones (simulation-based analysis).
En castellano, se halla muy difundido en la práctica el calco «minería de datos» para traducir este concepto, pero el
gerundio mining del verbo to mine no tiene nada que ver con la minería en este caso. Más relación guarda con la
acepción 2.b que recoge el diccionario Merriam-Webster: «2.b: to extract from a source <information mined from
the files>». En cambio, nuestra «minería» tiene estos significados: «1. f. Arte de laborear las minas. | 2. f.
Conjunto de los individuos que se dedican a este trabajo. | 3. f. Conjunto de los facultativos que entienden en
cuanto concierne a ese trabajo. | 4. f. Conjunto de las minas y explotaciones mineras de una nación o comarca».
degenerate: redundante.
Que tiene redundancia. Suele utilizarse como calificativo del código genético (degenerate code) debido a la
existencia de codones sinónimos (que codifican un mismo aminoácido) o para referirse a una mezcla de cebadores
de composición básica similar, pero cuya secuencia nucleotídica varía en ciertas posiciones (degenerate primer).
«The genetic code is termed degenerate, which means that it contains redundancies.» (Se dice que el código
genético es redundante —degenerate en inglés—, es decir, que contiene información repetida o redundancias.)
Observación: su traducción por «degenerado» —que en castellano quiere decir «anormal» o «depravado»—,
extraordinariamente difundida en la práctica, es un calco paronímico (falso amigo), pues dicho adjetivo no tiene en
nuestro idioma el significado que se atribuye a degenerate en biología molecular. Idéntico problema plantea la
traducción de degeneracy o degeneration en expresiones como degeneracy of the genetic code o degeneration of
the genetic code, donde no se refiere a lo que en castellano entendemos por «degeneración» (depravación o
deterioro), sino a la redundancia de codones para ciertos aminoácidos.
deletion: deleción.
Pérdida de uno o más pares de bases en una molécula de ácido nucleico.
Observación: no debe escribirse con doble ce. Esta voz nos viene del inglés a través del latín deletio. Vertida al
castellano da «deleción» y no «delección».
denaturation : desnaturalización.
Desplegamiento total o parcial de la conformación nativa de un polipéptido, una proteína o un ácido nucleico. Las
proteínas con estructura terciaria, como lo son casi todas las enzimas y proteínas que desempeñan funciones de
regulación, se desnaturalizan o despliegan al ser calentadas o cuando varía el pH de la disolución en la que se
encuentran. Puede ser un proceso irreversible, que se acompaña de la pérdida de la actividad biológica y de la
solubilidad de la molécula. En el caso de los ácidos nucleicos, no se considera desnaturalización la pérdida de
superenrollamiento, pero sí la desaparición de los puentes de hidrógeno entre cadenas complementarias.
denature, to : desnaturalizar.
Perder un biopolímero (por ejemplo, una proteína o un ácido nucleico) su estructura original.
deoxyribonuclease: desoxirribonucleasa.
Nucleasa que hidroliza los enlaces fosfodiéster del ADN. Véase ENDONUCLEASE y EXONUCLEASE.
ddNTP: ddNTP.
→ DIDEOXYNUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE
Dicer : Dícer.
Enzima que interviene en los procesos de ribointerferencia (RNA interference) y de represión de la traducción
(translational repression). Consta de varios dominios, uno con actividad helicasa del ARN, dependiente de ATP (en
el extremo amino), un dominio PAZ, dos dominios contiguos con actividad endorribonucleasa III (ARNasa III) en
serie y un dominio de unión a ARNbc (en el extremo carboxilo). Desde el punto de vista evolutivo es una enzima
muy conservada. Actúa sobre moléculas de ácido ribonucleico de dos tipos:
a) ARNbc de 100 o más pares de bases. En este caso, la enzima divide el ARNbc en fragmentos regulares de 21 a
25 pares de bases conforme se va desplazando a lo largo de la molécula; este proceso requiere energía (ATP). Los
fragmentos resultantes se denominan «ARN interferentes pequeños» (small interfering RNA) y son indispensables
para la degradación de ARNm invasores o aberrantes en el fenómeno de la ribointerferencia. Véase RNA
INTERFERENCE y SMALL INTERFERING RNA.
b) ARN en forma de horquilla de aproximadamente 70 nucleótidos (ARNhc).
En este segundo caso, la enzima escinde la horquilla y las zonas no apareadas del ARN
horquillado, y libera un fragmento monocatenario de 21 a 23 nucleótidos (línea negra). Este
fragmento se denomina «ARN temporal pequeño» (small temporal RNA) y es indispensable
para la regulación postranscripcional de algunos ARNm endógenos. Véase MICRORNA, SHORT
HAIRPIN RNA, SMALL TEMPORAL RNA yTRANSLATIONAL REPRESSION.
dihemic: dihémica.
Calificativo que se aplica a cualquier proteína constituida por dos grupos hemo. En el caso del citocromo c-550,
también conocido como citocromo c-549, la proteína está formada por dos subunidades polipeptídicas y cada
subunidad tiene su correspondiente grupo hemo (como grupo prostético). Véase HEME.
DNA : ADN.
DEOXYRIBONUCLEIC ACID.
Se obtienen sondas complementarias de los genes de interés, se amplifican por PCR, se purifican y se siembran en un portaobjetos
de vidrio con ayuda de un robot. El ARN total extraído de las muestras de estudio o de referencia se convierte en ADNc fluorescente
mediante una reacción catalizada por la transcriptasa inversa en presencia de fluoróforos específicos (conjugados Cy3−dUTP o
Cy5−dUTP). Las dianas fluorescentes se juntan y luego se hibridan en condiciones rigurosas con las sondas de la matriz. Tras los
lavados respectivos, los híbridos retenidos en la matriz producen una emisión característica al ser excitados por un rayo láser, y
cada emisión característica es valorada de forma independiente por medio de un microscopio confocal de barrido láser. Luego, un
programa informático se encarga de normalizar e integrar los resultados en una misma imagen coloreada, resaltando los niveles de
expresión superiores o inferiores al de la muestra de referencia. (Imagen procedente de: Duggan DJ, Bittner M, Chen Y, Meltzer
P, Trent JM. Expression profiling using cDNA microarrays. Nat Genet 1999; 21:10-14. Reproducida con permiso de Nature
Publishing Group, <http://www.nature.com/>.)
domain: dominio.
1. Secuencia continua de aminoácidos de una proteína, que se dobla o pliega varias veces sobre sí misma hasta
formar una unidad globular o compacta. Se estima que cada dominio puede funcionar como una unidad o un
módulo estable en solución si se llega a escindir la cadena polipeptídica que los separa. Este tipo de dominio se
denomina dominio estructural.Las proteínas de tamaño superior a los 20 000 Da constan de dos o más dominios
de este tipo; por ejemplo, la cadena liviana (ligera) de un anticuerpo tiene dos dominios estructurales.
2. Cualquier región de una proteína asociada a una función específica, con independencia de su organización
estructural (p.ej., el dominio de unión a un receptor, a un sustrato –dominio catalítico–, a la membrana celular –
dominio transmembranario–, etc.). Este tipo de dominio se denomina dominio funcional. Cada dominio funcional
puede contener a su vez uno o más dominios estructurales.
3. Zona o región de la membrana plasmática formada por una determinada clase de componente (por ejemplo,
fosfolípidos).
4. Fragmento, área o región de ADN de tamaño concreto en el genoma de un organismo (p.ej.: «... the Arabidopsis
Adh gene and the GRF4 gene are contained on discrete domains in the genome», «... figure 4C illustrates that this
gene resides on a 100-kb domain—a domain clearly distinct from the fragment occupied by Adh1.»).
dsDNA : ADNbc.
DOUBLE-STRANDED DNA.
dsRNA : ARNbc.
DOUBLE-STRANDED RNA.
duplication: duplicación.
Repetición de una secuencia de bases en una molécula de ácido nucleico.
E
editing : corrección.
PROOFREADING.
EF-G: EF-G.
Factor de elongación de E. coli que promueve el desplazamiento, dependiente de trifosfato de guanosina (GTP), del
peptidil-ARNt del sitio A al sitio P del ribosoma. En E. coli se conoce asimismo con el nombre
de translocase(translocasa).
Observación: en la clasificación del Comité de Nomenclatura de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología
Molecular (NC-IUBMB) es una de las enzimas de la clase EC 3.6.1.48 de las hidrolasas. El nombre común de una
enzima de esta clase es protein-synthesizing GTPase (GTPasa sintetizadora de proteínas), y el nombre sistemático
es GTP phosphohydrolase (mRNA-translation-assisting) [GTP-fosfohidrolasa (auxiliar de traducción del ARNm)].
Véase TRANSLOCATION.
electroblotting: electrotransferencia.
→ BLOTTING
electropermeabilization: electroporación.
ELECTROPORATION.
electroporation: electroporación.
Método de transformación bacteriana o de transfección de células eucariotas que consiste en la administración de
pulsos rápidos de una corriente eléctrica de gran voltaje a fin de producir poros transitorios en la membrana
plasmática y volverla permeable al ingreso de un ADN recombinado.
Observación: recibe en inglés otros nombres, a saber, electropermeabilization, electrical breakdown y high voltage
electrical discharge.
endodeoxyribonuclease: endodesoxirribonucleasa.
DEOXYRIBONUCLEASE, ENDONUCLEASE.
endonuclease: endonucleasa.
Enzima que hidroliza los enlaces fosfodiéster internos de un ácido nucleico y lo fragmenta en oligonucleótidos.
Cuando el sustrato es el ADN se denomina «endodesoxirribonucleasa» y si es el ARN se llama «endorribonucleasa».
Son endonucleasas las hidrolasas de ésteres de las subclases EC 3.1.21 a EC 3.1.31.
enhancer: potenciador.
Secuencia de ADN bicatenario de los organismos eucariotas a la que se unen activadores y otros factores que
aumentan la transcripción de un gen. Su localización con respecto al gen transcrito es muy variable, puede estar
situado antes del extremo 5’ del promotor (upstream), después del extremo 3’ del gen (downstream) o dentro de la
zona codificante del gen.
Observación: la mayoría de los potenciadores ejercerán sus efectos sobre cualquier promotor de la vecindad. Un
aislador restringe el radio de acción de un potenciador de modo que sólo afecte al promotor específico.
Véase ACTIVATOR, INSULATOR y PROMOTER.
envelop: envoltura.
Membrana fosfolipídica que protege la cápside de ciertos virus.
enzyme: enzima.
Catalizador biológico. Por lo general se trata de una proteína globular compuesta de una o varias cadenas
polipeptídicas que necesita un cofactor para ejercer su función, pero también puede ser una molécula de ARN con
actividad catalítica; en este último caso recibe el nombre específico de «ribozima». Cataliza usualmente sólo un tipo
de reacción (presenta especificidad reactiva) y actúa únicamente sobre un número limitado de sustratos (tiene
especificidad de sustrato), promoviendo transformaciones siempre en el mismo sitio (presenta especificidad
regional); en caso de que el sustrato tenga actividad óptica, reconoce de preferencia solo uno de los enantiómeros
de una mezcla de enantiómeros (presenta especificidad enantiomérica).
Observación: este sustantivo tiene género femenino desde su primera aparición en el diccionario académico en
1936; las formas «el enzima» o «los enzimas» que registran algunos diccionarios especializados y libros de texto
son incorrectas.
epitope: epítopo.
Porción específica de un antígeno macromolecular a la que se une un anticuerpo. Los antígenos que son
macromoléculas contienen, por lo general, múltiples epítopos, algunos de los cuales pueden estar repetidos, y cada
uno puede ser reconocido por un anticuerpo (los anticuerpos son específicos de un epítopo y no de la molécula de
antígeno entera). Es sinónimo de determinante antigénico.
Observación: la presencia de múltiples epítopos idénticos en un antígeno se conoce como ‘polivalencia’
(polyvalency) o ‘multivalencia’(multivalency).
EST: EST.
EXPRESSED SEQUENCE TAGS
eukaryon: eucarion.
Núcleo verdadero constituido por varias moléculas de ADN genómico organizadas en forma de cromosomas
envueltos por una membrana de fosfolípidos, la membrana nuclear. Véase PROKARYON.
exon : exón.
1 Secuencia de desoxirribonucleótidos intragénica que se transcribe y se conserva en la molécula de ARN madura
(ARNm, ARNr o ARNt).
2 En el transcrito primario, es la secuencia de ribonucleótidos que no se elimina durante el proceso de empalme o
ayuste, y que, por lo tanto, forma parte del transcrito maduro (ARNm, ARNr, ARNt). Véase SPLICING.
Observación: exon es una palabra formada por apócope y aféresis a partir de la expresión expressed region. Una
unidad de transcripción comienza y termina en un exón; los exones inicial y final corresponden a los extremos 5’ y
3’ del ARN, respectivamente
exonuclease: exonucleasa.
Enzima que hidroliza los enlaces fosfodiéster finales de los ácidos nucleicos, es decir, los de las posiciones 5’ o 3’ y
lo fragmenta en sus nucleótidos constituyentes. Cuando el sustrato es el ADN se denomina
«exodesoxirribonucleasa» y si es el ARN se llama «exorribonucleasa». Son exonucleasas las hidrolasas de ésteres
de las subclases EC 3.1.11 a EC 3.1.16.
exodeoxyribonuclease: exodesoxirribonucleasa.
RIBONUCLEASE, EXONUCLEASE.
• «A DNA plasmid, pGEZ, was constructed by inserting zeamatin-encoding cDNA into an expression cassette
containing the promoter, a truncated open reading frame, and the terminator sequence of the N.
crassaglucoamylase gene»;
• «An expression cassette consisting of the positive-regulator gene gadR, the chloride-inducible promoter
Pgad , and the translation initiation signals of gadC was amplified by PCR.»;
• «The expression cassette for human γ-globin included the ß promoter from -127 to the ß initiation codon,
which was connected in frame with the γ coding region partially deleted for intron 2. Transcription of the
γ-globin gene is terminated by the endogenous globin polyadenylation signal»;
• «We constructed replication deficient adenoviral (Ad) vectors containing an expression cassette with a
chimeric promoter comprised of five glucocorticoid response elements (GRE) and the chloram-phenicol
acetyltransferase reporter gene (AdGRE.CAT) or the murine thrombopoietin cDNA (AdGRE.mTPO)».
extein : exteína.
Secuencia de aminoácidos no eliminada de una proteína precursora recién traducida en la reacción de
transpeptidación que libera las inteínas. Véanse INTEIN y SPLICING.
Observación: las exteínas equivalen conceptualmente a los exones de los ácidos nucleicos.
F
FISH: FISH.
→ FLUORESCENT IN SITU HYBRIDIZATION
fluorochrome: fluorocromo.
Sustancia química que emite fluorescencia cuando se so-mete a una determinada radiación electromagnética.
«Molecules absorbing the energy of electromagnetic radiation (i.e. photons) will be elevated to a higher energy
level, or excited state. These excited molecules will return to the ground state and some molecules emit radiation
on their return to the ground state. This phenomenon is known as fluorescence and fluorescent molecules are
known as fluorochromes. Fluorochromes have distinct absorption spectra as well as emission spectra. The
wavelengths of the emitted radiation are longer than the absorbed wavelenghts (i.e., lower energy).» (Las
moléculas que absorben la energía de una radiación electromagnética [esto es, fotones] serán promovidas a un
nivel energético superior o estado excitado. Posteriormente regresarán al estado inicial y algunas emitirán radiación
al hacerlo. Dicha radiación se llama «fluorescencia» y las moléculas fluorescentes se denominan «fluorocromos».
Los fluorocromos tienen distintos espectros de absorción y de emisión. Las longitudes de onda de la radiación
emitida son mayores que las longitudes de onda absorbidas [es decir, son de menor energía].)
Observación: en citogenética molecular y biología molecular también se conoce como «colorante
fluorescente» (fluorescent dye), «marcador fluorescente» (fluorescent label, fluorescent tag) y
«fluoróforo» (fluorophore). A veces, incluso puede aparecer con el nombre de «sonda fluorescente» (fluorescent
probe), con el que también se conocen las sondas de ácido nucleico conjugadas con fluorocromos.
Hibridación in situ con sondas fluorescentes
Célula en metafase tras la hibridación con una sonda indicadora de una deficiencia
de esteroide-sulfatasa debida a una microdeleción en el cromosoma X. la sonda en
este caso concreto es una mezcla de dos sondas específicas del cromosoma X,
ambas visualizadas aquí de color rojo. la sonda «X cen» es un control interno y está
localizada en el centrómero del cromosoma X. permite identificar rápidamente
ambos cromosomas X. la sonda «Xp22.3» está ubicada en la región del gen de la
esteroidesulfatasa en el Xp22.3. puesto que hay dos cromosomas X y que sola-
mente uno muestra la señal del gen de la esteroide-sulfatasa, se trata de una mujer
portadora de la deficiencia. (Figura disponible en el siguiente url:
<http://members.aol.com/chrominfo/metafish.htm>)
fluorophore: fluoróforo.
→ FLUOROCHROME
G
gel reading: lectura del gel (de secuenciación).
→ READ
gene : gen.
Desde los albores de la genética clásica hasta la actualidad se ha definido de distintas maneras:
1 En genética clásica (mendeliana), cuando todavía se desconocían las bases moleculares de la herencia
(aproximadamente de 1910 a 1930), era la unidad hereditaria de un organismo que gobierna el desarrollo de un
carácter y puede existir en formas alternativas. Por entonces, esta unidad hereditaria o de transmisión (cada
gameto incluía una unidad de cada gen) era considerada asimismo la unidad más pequeña e indivisible de
recombinación, mutación y función.
2 El descubrimiento del ADN como material hereditario (Avery, McLeod y McCarty, 1944) y los experimentos de
Beadle y Tatum (1941) y de Horowitz y Srb (1944) llevaron a percibir la función de un gen individual como el
responsable de la síntesis de una única enzima. Un gen se transformó, pues, en el segmento de ADN que codifica
una enzima capaz de desempeñar funciones asociadas con la expresión fenotípica de ese segmento. Esta definición
se popularizó luego como la hipótesis «un gen, una enzima».
3 Pronto se juntaron pruebas de que el gen como unidad de función no era indivisible, puesto que existían en él
sitios de mutación específicos que podían separarse entre sí por medio de la recombinación génica (Oliver, 1940 y
Lewis, 1944; Benzer, 1955-1959). Benzer propuso entonces una serie de nuevos términos y denominó «cistrón»
(cistron) a la unidad de función genética, «recón» (recon) a la unidad indivisible de recombinación y «mutón»
(muton) a la menor unidad de mutación. Cuando el grupo de Yanofsky, entre los años 1958 y 1964, pudo demostrar
que el cistrón consistía en una porción de ADN en donde se hallaba cifrada colinealmente la información para
sintetizar un único polipéptido (1958-1964), surgió un nuevo concepto de gen como cistrón, quedando
inmortalizado en la hipótesis «un cistrón, un polipéptido» (más tarde redefinida como «un gen o cistrón, un ARNm,
un polipéptido»), que reemplazó a la antigua teoría de «un gen, una enzima». Véase cistron, muton y recon.
4 A partir de 1970, el avance de la biología molecular y los numerosos descubrimientos que ocurrieron desde
entonces han obligado a revisar la concepción clásica (acepción 1) y neoclásica (acepciones 2 y 3) de gen, de modo
que hoy día por gen se entiende:
a) La secuencia de ADN o de ARN que codifica uno o varios productos capaces de desempeñar una función
específica generalmente fuera de su lugar de síntesis. Estos productos pueden ser polipéptidos (es el caso de la
mayoría de los genes) o ARN (ARNt, ARNr). El segmento de ADN o de ARN que codifica un polipéptido contiene
asimismo secuencias reguladoras tales como los promotores, silenciadores, o potenciadores; el polipéptido que
resulta de la traducción de un ARNm puede a su vez escindirse en varios polipéptidos con funciones distintas; un
ARN transcrito también puede originar varios productos funcionales por el fenómeno de corte y empalme alternativo
(véase alternative splicing) o mediante un mecanismo de escisión (por ejemplo, en los ARNr precursores, la escisión
genera los ARNr grande, pequeño y 5S).
b) En los organismos eucariotas, un gen se puede definir asimismo como la combinación de segmentos de ADN que
en conjunto constituyen una unidad de expresión. La expresión lleva a la formación de uno o más productos génicos
funcionales, que pueden ser tanto moléculas de ARN como polipéptidos. Cada gen contiene uno o más segmentos
de ADN que regulan su transcripción y, en consecuencia, su expresión .
Observación: pese a que la noción de factor hereditario nació con Gregor Mendel en 1860, la palabra «gen» se la
debemos al botánico danés Wilhelm Ludwig Johannsen (1857-1927), quien en el primer decenio del siglo xx (1905-
1909) la utilizó por primera vez para designar el elemento unitario responsable de la herencia de un carácter
individual en un organismo –que Hugo de Vries había denominado «pangene» y el propio Mendel había llamado
«Merkmal» (factor, rasgo, carácter unitario)–, con estas palabras: «Das Wort Gen ist völlig frei von jeder
Hypothese; es drückt nur die sichergestellte Tatsache aus, dass viele Eigenschaften des Organismus durch
besondere, trennbare und somit selbständige ‘Zustände’, ‘Grundlagen’, ‘Anlagen’ –kurz, was wir eben Gene nennen
wollen– bedingt sind.» (La palabra ‘gen’ no implica ningún tipo de hipótesis; expresa únicamente el hecho
comprobado de que muchas propiedades del organismo vienen determinadas por ‘condiciones’, ‘bases’ o
‘disposiciones’ especiales, separables y, por lo tanto, independientes; es decir, lo que pretendemos llamar ‘genes’).
genEthics: genoética.
GENETHICS.
genethics: genoética.
Estudio de las cuestiones éticas, sociales o ambientales relacionadas con la utilización de las técnicas de la
ingeniería genética, la biotecnología y otras ramas científicas conexas.
genetic blueprint: juego completo de genes (genoma), material hereditario (ADN o ARN), información genética
(contenida en la secuencia nucleotídica del genoma), constitución genética (genotipo), según el contexto.
La expresión genetic blueprint (o su forma abreviada blueprint) evoca de inmediato en el lector entendido la noción
de genotipo (la constitución genética de una persona: «a detailed plan or program of action»). Sin embargo, en la
práctica, se utiliza como sinónimo de al menos cuatro conceptos claramente diferenciables, aunque estrechamente
emparentados entre sí, como demuestra la siguiente búsqueda en archivos de Nature Genetics:
1 Precedida de adjetivos como entire o complete, normalmente se refiere al juego completo de genes de un
organismo (es decir, al genoma):
Hardly a month goes by without the publication of the entire genetic blueprint —the genome— of some organism
or other. In almost all cases, the organisms concerned are simple [...].
The genome, representing the complete blueprint of the organism, is the natural bounded system in which to
conduct this [...].
Véase GENOME.
2 Material hereditario o genético, molécula portadora de información genética, metafóricamente «hilo de la vida»
(es decir, el ADN o el ARN, según cuál de los dos componga el genoma del organismo en cuestión):
DNA is the genetic blueprint and it is synonymous with life.
Although RNA is generally thought to be a passive genetic blueprint, some RNA molecules, called ribozymes, have
intrinsic enzyme-like activity — they can catalyse.
Véase DNA y RNA.
3 Información genética (contenida en la secuencia nucleotídica del genoma):
The ultimate goal of the human genome project is to analyse the genetic blueprint of our genome and elucidate
the mechanism of control of gene expression [...].
[...] as this discovery was a big leap then, the next step today is to discern the parasite’s blueprint; the genomic
sequence of Plasmodium falciparum.
Véase SEQUENCE.
4 Constitución genética de un individuo (es decir, su genotipo):
[...] characteristics of an organism, which result from the interaction of the organism’s genetic ‘blueprint’ (its
genotype) and the environment.
Véase GENOTYPE.
genome: genoma.
1 Información genética contenida en el juego haploide de cromosomas de un organismo eucariota (o en los
gametos de cada uno de los progenitores de dicho organismo).
2 Juego completo de genes de un organismo, una célula, un orgánulo celular o un virus. Comprende tanto los genes
cromosómicos como los extracromosómicos.
Observación: entre los genetistas de habla hispana también se conoce con el nombre de genomio. Véase asimismo
el «Minidiccionario crítico de dudas», de Fernando Navarro, en el número 17-18 de Panace@, págs. 195-6
(<www.medtrad.org/panacea/IndiceGeneral/n17-18_tradyterm-Minidiccionario.pdf>), donde se brindan cuantiosos
ejemplos de términos que contienen el sufijo -ome.
genomics: genómica.
Ciencia que aborda el estudio de la estructura, el funcionamiento y los cambios evolutivos de los genomas de los
organismos vivos valiéndose de herramientas diversas, como la bioinformática y las micromatrices (microarreglos u
microordenamientos) de ADN («chips» de ADN o «biochips»). Según el objetivo perseguido, puede dividirse en
genómica estructural (structural genomics), genómica funcional (functional genomics) y genómica evolutiva
(evolutionary genomics). La genómica estructural permite construir mapas de ARN transcritos, así como mapas
físicos y genéticos para cada especie; la genómica funcional posibilita el análisis simultáneo de un gran número de
genes en respuesta a un determinado estímulo. A diferencia de la ingeniería genética clásica, que se limita al
análisis y a la caracterización de genes concretos de los organismos, en la genómica moderna se consideran los
genomas de los individuos como un sistema dinámico. De esta manera es posible analizar cómo el genoma cambia
con el tiempo, interactúa e influye en las rutas metabólicas y la fisiología de un organismo.
genotype: genotipo.
1 Constitución genética de un organismo. Comprende toda la información genética codificada en el ADN
cromosómico y extracromosómico.
2 Constitución genética con respecto a los alelos de uno o varios locus en estudio. Si se estudian los genes
responsables de determinados caracteres, el resto del genotipo se denomina residual genotype o background
genotype.
gRNA : ARNg.
GUIDE RNA.
H
haem: hemo.
→ heme
half-chromosome: cromátide.
→ CHROMATID
hapten: hapteno.
Antígeno de tamaño molecular pequeño que es capaz de unirse con un anticuerpo específico, pero que sólo es
inmunógeno (puede suscitar una respuesta inmunitaria) cuando está unido a una macromolécula. Véase ANTIGEN.
HDGS : HDGS.
HOMOLOGY-DEPENDENT GENE SILENCING (HDGS).
helicase: helicasa
Enzima que cataliza la separación de la doble hélice durante la replicación, la transcripción o la reparación del ADN
(ADN-helicasa) o la separación de dos hebras de ARN en los ARN bicatenarios o ARN monocatenarios con
apareamientos internos (ARN-helicasa). Requiere energía procedente de la hidrólisis de un nucleósido trifosfato (por
lo general, ATP).
Observación: en la replicación del ADN, suele dibujarse como un hexámero en forma de anillo que rodea cada una
de las hebras de ADN recién separadas, cerca de la horquilla de replicación (existe una horquilla de replicación en
cada junta de ADN monocatenario y ADN bicatenario). Se mueve de 5’ a 3’ o de 3’ a 5’ a lo largo de la hebra
plantilla, según si rodea la hebra adelantada (de 3’ a 5’) o la hebra retrasada (de 5’ a 3’), siempre pegada a la
horquilla de replicación y en busca de la doble hélice situada detrás de la horquilla. Véase DNA REPLICATION.
helix-loop-helix: hélice-giro-hélice.
HELIX-TURN-HELIX
helix-turn-helix: hélice-giro-hélice.
Motivo estructural compuesto de dos hélices α separadas por un giro ß corto característico de diversas proteínas con
función reguladora que se unen al ADN, como los factores de transcripción.
Observación: estas proteínas suelen ser homodiméricas por lo que las secuencias de ADN que reconocen son
palindrómicas. Una de las dos hélices α es la «hélice de reconocimiento» y como su nombre lo indica, su papel es
reconocer la secuencia específica en el ADN. Son muy abundantes en los organismos procariotas, en los eucariotas
existe un motivo equivalente que se denomina «homeodominio». Véanse HOMEODOMAIN y MOTIF.
hemo-: hemo-
1 Prefijo que expresa relación con la sangre.
2 Prefijo que expresa relación con un grupo hemo. Véase HEME.
Observación: el Oxford Dictionary of Biochemistry and Molecular Biology también recoge las formas hema- y hem-
y, en inglés británico, haemo-, haema- y haem-, además de hemato- (o haemato-). En castellano adopta asimismo
las variantes hemato-, hema- y hemat-.
heterologous: heterólogo.
1. Compuesto de distintos elementos o de elementos similares en distintas proporciones.
2. Dícese de todo aquello derivado o procedente de una especie distinta de la especie de referencia (células
heterólogas, ADN heterólogo, tejido heterólogo, suero heterólogo).
heterozygote : heterocigoto.
Individuo u organismo con alelos distintos en un locus dado. Véase LOCUS y ALLELE.
histone: histona.
Cualquiera de las proteínas básicas de peso molecular variable entre 11 y 21 kDa que constituyen la mitad de la
masa de los cromosomas de las células eucariontes (salvo los espermatozoides). Se clasifican en cinco tipos: H1,
H2A, H2B, H3, H4, de los cuales la H1 se asocia con el ADN conector y el resto con el ADN nucleosómico. Las
histonas H3 y H4 son unas de las proteínas más conservadas que se conocen, señal de que cumplen funciones
idénticas en todos los organismos eucariontes. Véanse CORE DNA, LINKER DNA y NUCLEOSOME.
hnRNA : ARNnh.
HETEROGENEOUS NUCLEAR RNA.
hnRNP : RNPnh.
HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN.
holoenzyme: holoenzima.
1. Enzima con actividad catalítica formado por una porción proteica (la apoenzima) y el cofactor necesario para el
desempeño de su función (ión metálico, grupo prostético o coenzima).
2. Complejo enzimático constituido por todas las subunidades y cofactores necesarios para el desempeño de su
función.
Observación: un ejemplo de holoenzima es la ADN-polimerasa III de E. coli, que es un complejo de 900 kDa
compuesto de 10 proteínas organizadas en cuatro tipos de subcomplejos proteicos.
homeodomain: homeodominio.
Motivo proteico de 60 aminoácidos de unión al ADN codificado por la «caja homeótica» (homeobox) de los genes
homeóticos. Es un motivo de tipo hélice-giro-hélice. Fue caracterizado por primera vez en proteínas codificadas por
genes implicados en la regulación del desarrollo de Drosophila (los genes homeóticos). Las proteínas que contienen
un homodominio se unen a genes que contienen elementos sensibles a dicho dominio –los elementos HRE, del
inglés homeobox responsive elements– y regulan su transcripción. También se pueden unir a ARNm que contienen
HRE y entonces regulan su traducción. Desempeña un papel regulador fundamental en la diferenciación celular que
tiene lugar durante el desarrollo de especies muy diversas, como los helmintos, la mosca de la fruta y los seres
humanos. Véanse HOMEOBOX MOTIF, HOMEOTIC GENE y MOTIF.
homoeology: homeología.
Similitud genética parcial entre cromosomas de una especie alopoliploide. Véase HOMOEOLOGOUS CHROMOSOMES.
homologous: homólogo.
1. Dícese de los órganos o tejidos que están en una posición anatómica o tienen una estructura parecida en
especies con un ancestro en común, aunque sus funciones puedan ser distintas.
2. Dícese de los cromosomas que se aparean durante la meiosis (véase HOMOLOGOUS CHROMOSOME).
3. Dícese de los biopolímeros (como las proteínas) que tienen estructura semejante o desempeñan funciones
idénticas o similares aunque provengan de especies distintas, por derivar, quizás, de un ancestro común.
homologue: homólogo.
Sustantivo jergal para designar cualquier molécula o segmento de ácido nucleico (un gen, por ejemplo) cuya
secuencia es idéntica a la de otro de referencia.
homology: homología.
1 Origen ancestral común de los elementos que se comparan (estructuras biológicas, órganos, genes, etc.), con
independencia de que desempeñen una misma función.
2 Similitud o grado de identidad entre secuencias aminoacídicas o nucleotídicas. El grado de identidad permite
presuponer un origen evolutivo común de las secuencias que se comparan. Estrechamente emparentado con el
concepto de similitud o grado de identidad se halla el de complementariedad de bases, de suerte que, a veces,
tanto la palabra homology como homologous se utilizan más bien en este último sentido. Veamos dos ejemplos:
«For example, various degrees of stringency can be employed during the hybridization, depending on the amount of
probe used for hybridization, the level of complementarity (i.e., homology) between the probe and target DNA
fragment to be detected.» (Por ejemplo, la hibridación se puede hacer en condiciones más o menos rigurosas,
según la cantidad de sonda empleada en ella y el grado de complementariedad [es decir, de homología] entre la
sonda y el fragmento de ADN antiparalelo que se quiere detectar.)
«The resulting intramolecular ligation products are then used as substrates for enzymatic amplification by PCR using
oligonucleotide primers homologous to the ends of the core sequence, but facing in opposite orientations.» (Los
productos resultantes de la unión intramolecular se amplifican luego por medio de una reacción en cadena de la
polimerasa utilizando cebadores complementarios de los extremos de la secuencia flanqueada, pero enfrentados en
dirección opuesta.)
Observación: entre los bioquímicos y biólogos moleculares, la palabra «homología» se viene aplicando desde hace
ya muchos años con un significado distinto del que le otorgaron los biólogos «clásicos». Para éstos, por
«homología» se entiende la existencia de un ancestro común entre las cosas que se comparan. Según Russell
Doolittle (biólogo molecular de la Universidad de California, en San Diego), a fines de la década de 1960, en el
ámbito de la bioquímica de proteínas, autores sin formación biológica clásica empezaron a utilizar el
vocablo homology como sinónimo de similitud (similarity), sin connotaciones evolutivas de ninguna clase,
introduciendo así una nueva acepción molecular del término, que se ha mantenido hasta la fecha (y que coexiste
con la tradicional). Hoy día, por ejemplo, cuando se comparan dos secuencias de aminoácidos o de nucleótidos es
frecuente leer que presentan «un 20 % de homología» (similitud) o que son «un 20 % homólogos» (similares). Para
los biólogos tradicionales, en cambio, los lazos evolutivos no pueden ser parcialmente homólogos, ni las especies
pueden presentar cierta homología, pues la homología es un concepto absoluto (se tiene o no se tiene un ancestro
en común, hay o no hay homología). La se gunda acepción molecular está tan difundida que dificulta la
interpretación de los resultados y las conclusiones experimentales (y no digamos ya de las definiciones en los
glosarios). Hace ya casi veinte años varios autores eminentes dieron la voz de alarma en revistas prestigiosas, y
ello todavía consta en el boletín de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (Lewin, 1987; Reeck y
cols, 1987; IUBMB Newsletter, 1989), pero parece que nadie les hace caso.
homozygote : homocigoto.
Individuo u organismo con alelos idénticos en un locus dado. Véanse ALLELE y LOCUS.
idiotype: idiotipo.
Conjunto de idiótopos presentes en las regiones variables de las cadenas livianas y pesadas (VH y VL,
respectivamente) de un anticuerpo. Pueden estimular la producción de anticuerpos antiidiotípicos.
Véanse ANTIBODY eIDIOTOPE.
immunoblotting: inmunoelectrotransferencia.
→ WESTERN BLOTTING
immunogen: inmunógeno.
Antígeno capaz de suscitar una respuesta inmunitaria adaptativa (humoral o celular) al ingresar en un organismo
inmunocompetente. No todos los antígenos son inmunógenos. Véase ANTIGEN.
immunoglobulin: inmunoglobulina.
→ ANTIBODY
in silico: in silicio.
Locución adverbial muy utilizada en biología molecular para calificar simulaciones, modelos, experimentos o análisis
realizados en la computadora o el ordenador. P. ej.: «[...] This also witnessed the establishment of a new facet of
the study of life, added to its study in vivo and in vitro: the study of living organisms with computers, in silico».
Observación: los archivos de HighWire Press y Nature registran su uso desde 1996, a veces como sinónimo de in
machina y virtual. En los archivos de Science su aparición es posterior a 1999. Según Fernando Navarro, la locución
latina correcta debe ser in silicio (como raramente se escribe) y no in silico, dado que el nombre latino del silicio no
es silicum, sino silicium. Como adjetivo calificativo puede traducirse por «ficticio», «virtual», «aparente», «por
ordenador» o «producido en el ordenador», en oposición a «real»: «these in silico polymorphisms still need to be
validated».
indel: indel.
Acrónimo formado a partir de «insertion-deletion» (inserción-deleción).
«One of the sequences can hold a gap or indel, the result of an insertion or deletion events.» (una de las secuencias
puede contener una interrupción o indel, como resultado de una inserción o una deleción.)
Observación: tanto en inglés como en castellano se escribe normalmente en minúscula como un sustantivo común.
En castellano debería tener género femenino (la indel), pues se refiere a la inserción o a la deleción.
inducer: inductor.
Molécula que induce la síntesis de las enzimas responsables de su metabolismo.
insert: inserto.
Fragmento de ADN heterólogo insertado en un vector de clonación. Suele ser sinónimo de «ADN clonado». Véase
cloned DNA.
insertion: inserción.
Introducción de uno o más pares de bases en una molécula de ácido nucleico. Es un tipo de mutación que suelen
producir los colorantes de acridina o los transposones.
integron: integrón.
Elemento de los genomas bacterianos con capacidad de capturar y expresar genes exógenos que confieren ventajas
selectivas a la bacteria hospedadora (muchos de estos genes exógenos confieren resistencia a antibióticos). Puede
ser móvil (transposónico o plasmídico) o fijo (cromosómico). En su forma más sencilla consta de tres componentes
necesarios para la captura y la expresión del gen exógeno (también denominado «casete génico»): un gen
codificante de la integrasa intI (que es una recombinasa), un lugar de recombinación específico attI para la
integración del gen exógeno y por lo menos un promotor Pant para la expresión de ese gen. En esta configuración, y
sin casete génico, tiene un tamaño aproximado de 1,1 kb.
Observación: descubiertos a principios de 1980, los integrones son elementos antiguos que han ido evolucionando
a la par que el genoma bacteriano. Hubo quien los definió como «sistemas de expresión y adquisición de genes»
(gene acquisition and expression systems), siendo el casete génico la unidad de adquisición o captura de ADN. En la
actualidad, se clasifican en nueve clases según la secuencia de la integrasa componente: las clases In1 a In3
contienen casetes génicos de resistencia a antibióticos; las clases In4 a In7 contienen casetes que no codifican
resistencia a antibióticos, la clase In8 carece de casete génico y la clase In9 contiene un casete de resistencia a
antibióticos y otros casetes génicos de función desconocida. Pueden contener múltiples casetes génicos
incorporados en tándem (se denominan entonces «superintegrones»; puede haber hasta 150 casetes en tándem en
los superintegrones cromosómicos, cada uno flanqueado por sitios de recombinación 59-be), además de genes de
resistencia que no son «casetes» (es decir, no son móviles, sino que son componentes permanentes o fijos del
integrón). La inserción o escisión de casetes génicos de resistencia en un integrón dado desempeña una función
importante en la incorporación y formación de nuevas recombinaciones de genes de resistencia a los antibióticos. El
hecho de que muchos integrones posean más de un casete génico de resistencia y de que algunos integrones se
localicen a su vez dentro de elementos móviles o transferibles, como son los transposones (p.ej.: Tn21 o Tn1696) y
los plásmidos, que también pueden contener genes de resistencia a antibióticos, hace que la selección de uno de los
genes de resistencia del integrón conlleve la selección de los demás genes de resistencia (fenómeno conocido como
«selección en autoestop» de los genes ligados). Se han descubierto integrones en numerosas especies de bacterias,
incluidas las de la familia Enterobacteriaceae y otras bacterias gramnegativas, como Vibrio cholerae y Pseudomonas
aeruginosa, o grampositivas, como Corynebacterium glutamicum, etc.
intein : inteína.
Secuencia interna de aminoácidos que se elimina de una proteína precursora recién traducida por medio de una
reacción de transpeptidación. Véase SPLICING y TRANSPEPTIDATION.
Observación: este nombre deriva por apócope y aféresis de la expresión intervening protein sequence y equivale
conceptualmente a los intrones de los ácidos nucleicos.
intelligent data analysis: prospección de datos.
→ DATA MINING
intron : intrón.
1 Secuencia intragénica de desoxirribonucleótidos que se transcribe pero no se conserva en la molécula de ARN
madura (ARNm, ARNr o ARNt).
2 En el transcrito primario, es la secuencia de ribonucleótidos que se elimina durante el proceso de corte y empalme
(ayuste), y que, por lo tanto, no forma parte del transcrito maduro (ARNm, ARNr, ARNt). Se distinguen cuatro tipos
según su forma de eliminación durante el proceso de corte y empalme (ayuste) y la clase de genes en los que se
observan. Los intrones de los grupos I, II y III se escinden mediante reacciones de transesterificación. Los intrones
del grupo I (presentes en los genes de ARNr de algunos organismos eucariotas inferiores –como, por
ejemplo, Tetrahymena thermophila–, en los genes mitocondriales de hongos y en ciertos fagos) se caracterizan por
carecer de secuencias consenso en los sitios de empalme, aunque pueden tenerlas en su interior, y eliminarse por
un proceso autocatalítico estrechamente relacionado con la estructura secundaria y terciaria de la molécula
precursora de ARN (en esta clase de intrones, una guanosina o un nucleótido de guanosina libre –guanilato, GMP,
GDP o GTP– aporta el grupo OH que produce la primera transesterificación; véase la figura siguiente); los intrones
del grupo II (presentes en genes mitocondriales de hongos) disponen de sitios de empalme con secuencias
consenso (responden a la regla GT-AT) y, al igual que los del grupo I, se eliminan mediante un proceso
autocatalítico dependiente de la estructura secundaria y terciaria del ARN (en este caso, una adenina cede el grupo
2’OH que produce la primera transesterificación); los intrones de los genes nucleares o del grupo III son idénticos a
los del grupo II (responden a la regla GT-AT), pero, a diferencia de éstos, necesitan de la presencia del
empalmosoma (o ayustosoma) para escindirse (véanse los círculos amarillos y marrones en la figura de abajo);
tanto en el grupo II como en el grupo III se forma una estructura en lazo característica (lariat) cuando se
empalman los exones; los intrones del grupo IV, presentes en los tRNA eucariotas, son los únicos que no se
eliminan por medio de una reacción de transesterificación, sino a través de un corte endonucleásico con ligamiento
ulterior. Véanse LARIAT, SPLICEOSOME y SPLICING.
Observación: intron es una voz formada por apócope y aféresis a partir de intervening sequence region. En los
organismos eucariotas superiores, la mayoría de los genes se hallan interrumpidos por intrones de longitud por lo
general mayor que la de los exones correspondientes. Puede haber intrones en los genes nucleares que codifican
proteínas, en los genes nucleolares de ARNr o en los genes de ARNt. En los organismos procariotas, los genes
suelen ser continuos, pero se han descubierto intrones en fagos y en algunos ARNt bacterianos (Véase la
ilustración).
Esquema
básico de
una RCP
inversa
según el
protocolo
de ochman
y cols.
(genetics
120: 621-
623, 1988)
(Imagen
diseñada y
cedida
gentilmente
por el
doctor
gonzalo
claros,
basada en
el protocolo
de
ochman).
inversion: inversión.
Giro de 180º de un determinado
segmento cromosómico, con el resultado
de que la secuencia de un gen en el
segmento en cuestión queda invertida
con respecto a la del resto del
cromosoma. Estas inversiones pueden incluir o no el propio centrómero (círculo blanco en el medio de los
segmentos coloreados de la figura de abajo).
IPCR: RCPI
→ INVERSE POLYMERASE CHAIN REACTION.
Observación: pese a que la sigla inglesa de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) sigue siendo todavía la
más frecuente en los textos en castellano, más de diez mil páginas en Google en español justifican ya la adopción
definitiva de la sigla española (RCP) para nombrar este y otros métodos conexos.
isoschizomer: isoesquizómero.
Endonucleasa de restricción que reconoce la misma secuencia de nucleótidos que otra enzima de restricción, con
idéntica especificidad. Por extensión, el término también se aplica a las enzimas de restricción que escinden el ADN
en distintos sitios dentro de la misma secuencia de reconocimiento.
J
jumping gene: transposón.
TRANSPOSABLE ELEMENT.
K
knowledge discovery: prospección de datos.
→ DATA MINING
Se aprecian cinco dominios en rosquilla o kringles (K1, K2, K3, K4 y K5) y en cada
dominio los tres puentes disulfuro (breves líneas transversales entre la cadena de
aminoácidos). (Imagen procedente del sitio web del grupo de Miguel llinás del
Departamento de química de carnegie Mellon:
<www.chem.cmu.edu/groups/llinas/res/structure/hpk.html>. reproducida en esta entrega
con permiso del doctor llinás.)
L
abel: marcador.
Átomo, grupo químico o sustancia indicadora que se une o incorpora estructuralmente a un compuesto químico para
poder identificarlo dentro de un sistema cuando se traslada o es objeto de una transformación química o
bioquímica. Puede ser un isótopo radioactivo o estable (p. ej.: 13C, 14C, 35S, 3H, 125I), un colorante fluorescente (p.
ej.: isotiocianato de fluoresceína, FITC; o dioctadecilindocarbocianina, Dil), una sustancia quimioluminiscente (como
el éster de acridinio) e incluso enzimas (como la peroxidasa, la fosfatasa alcalina o la glucosa-6-fosfato-
deshidrogenasa).
Observación: tiene un significado muy próximo, pero no idéntico, al de trazador (tracer). En química radioanalítica,
por ejemplo, la IUPAC distingue claramente label (definido como «a marker, tag or indicator distinguishable by the
observer but not by the system and used to identify a tracer») de tracer (definido como «labelled member of a
population used to measure certain properties of that population»). En español se habla usualmente de
«marcadores» (radioactivos o fluorescentes) o, menos frecuentemente, de «marca» (radioactiva, fluorescente).
lariat : lazo.
Estructura en forma de lazo que se observa tras la reacción de corte y empalme (ayuste) en los intrones del grupo
II y III. Véanse BRANCH SITE, INTRON y SPLICING.
Observación: los diccionarios de inglés estadounidense indican que esta palabra es un americanismo derivado del
español «la reata».
leader peptide : péptido líder.
LEADER SEQUENCE.
library: genoteca.
Puede ser de ADNg o de ADNc. Véanse CDNA LIBRARY y GENOMIC LIBRARY.
ligand: ligando
1 En un compuesto inorgánico de coordinación, cada átomo o grupo de átomos que está unido al átomo central.
2 Molécula, grupo, ión o átomo que está unido de forma covalente o no covalente a una entidad molecular (que
puede ser poliatómica), considerada de forma arbitraria ‘central’ con respecto al ligando. Por ejemplo, un protón
(H+) puede ser ligando de una proteína, del citrato o del ión superóxido O2-. Puede ser incluso ligando de una
entidad monovalente, como el acetato; en otras circunstancias, se considera que el acetato (AcO-) es ligando del
H+, dado que la definición de entidad central es arbitraria y puede cambiar por conveniencia. Así, los ligandos de la
calmodulina son cuatro iones de calcio si la proteína se considera la entidad central, pero también puede decirse
que los ligandos de los iones de calcio son los grupos carboxilatos de la calmodulina si el ión de calcio se considera
la entidad central. Otros ejemplos de sistemas de ligando-entidad central son los complejos constituidos por un
antígeno y un anticuerpo, una hormona y un receptor o un sustrato y una enzima.
loci : loci.
LOCUS.
locus : locus.
1 Posición que un gen ocupa en el cromosoma o en la molécula de ácido nucleico que funciona como material
hereditario.
2 Segmento de ADN o ARN que coincide con un gen determinado, sin tomar en consideración su secuencia de bases
(es un concepto principalmente topográfico).
Observación: el plural de «locus» es loci en inglés y en latín, pero en español es «locus».
M
maturase: factor de maduración (del preARNm), factor de corte y empalme codificado por intrón.
Proteína codificada por intrones de los grupos I o II. Se une a su intrón codificante e induce el cambio de
conformación necesario para que el intrón se escinda del preARNm respectivo y éste continúe su proceso de
maduración —empalme de exones, poliadenilación y adquisición de la secuencia protectora de guanilatos en el
extremo 5’— hasta convertirse en el ARNm correspondiente.
Observación: el NC-IUBMB, en su introducción a la Classification and Nomenclature of Enzymes by the Reactions
they Catalyse, desaconseja vivamente el uso del sufijo -ase para formar nombres de proteínas carentes de la
actividad catalítica que su nombre supuestamente indica: «The first general principle of these ‘Recommendations’ is
that names purporting to be names of enzymes, especially those ending in -ase, should be used only for single
enzymes, i.e. single catalytic entities. [...] In this context it is appropriate to express disapproval of a loose and
misleading practice that is found in the biological literature. It consists in designation of a natural substance (or
even of an hypothetical active principle), responsible for a physiological or biophysical phenomenon that cannot be
described in terms of a definite chemical reaction, by the name of the phenomenon in conjugation with the suffix -
ase, which implies an individual enzyme. Some examples of such phenomenase nomenclature, which should be
discouraged even if there are reasons to suppose that the particular agent may have enzymic properties, are:
permease, translocase, reparase, joinase, replicase, codase, etc.».
La situación de esta proteína es bastante peculiar; por un lado, tiene un dominio con actividad de endonucleasa y,
en el caso de los intrones del grupo II, otro con actividad de transcriptasa inversa (el sufijo -ase en estos casos está
bien aplicado, puesto que se trata de actividades enzimáticas), pero el dominio al que se le atribuye la
actividad maturase carece de tal actividad (puesto que no convierte el preARNm en ARNm). Por ejemplo, una de
las maturases mejor estudiadas es la proteína LtrA de L. lactis, cuyo nombre oficial completo es en realidad group II
intron-encoded protein ltrA y no maturase (<www.expasy.org/uniprot/P0A3U0>). Se trata de una proteína
multifuncional; en la base de datos Swiss-Prot (<www.expasy.org>) figura con las dos actividades de endonucleasa
y transcriptasa inversa y con una tercera actividad (RNA-maturase activity), que en realidad corresponde a la de las
enzimas de la clase EC 3.1 del NC-IUBMB (hidrolasas de enlaces éster).
Por consiguiente, la designación maturase (formada con el nombre de un fenómeno, la maduración del preARNm,
más el sufijo -ase) contraviene de forma flagrante las normas del NC-IUBMB (de hecho, no hay ninguna enzima que
se llame maturase en la clasificación enzimática de este comité).
Un significado muchísimo más claro trasmite un sinónimo de maturase que es intron-specific splicing factor (factor
de corte y empalme codificado por intrón), aunque está claro que, luego, en la práctica, habrá quien siga
prefiriendo, pese a todo, el calco «madurasa», por su brevedad y tradición, especialmente llegado el caso de que la
proteína figure con el único nombre de maturase en la base de datos correspondiente.
microchip: microchip.
→ CHIP
microsatellite : microsatélite.
ADN sin función conocida del genoma eucariota, formado por repeticiones en serie de unidades compuestas de unos
pocos nucleótidos (menos de una decena), que pueden llegar a tener una longitud total de hasta cien pares de
bases. Se encuentran dispersas por todo el genoma eucariota. Estas unidades nucleotídicas breves se identificaron
por primera vez dentro del ADN satélite, y por su pequeño tamaño recibieron el nombre de «microsatélites».
Véase SATELLITE DNA.
microRNA : microARN.
Pequeñas moléculas de ARN monocatenario (de 21 a 25 nucleótidos) que se aparean con el extremo 3’ de ARNm
homólogos e impiden la traducción de éstos en proteínas. Desempeñan un papel regulador de la traducción.
Véanse STRNA y TRANSLATIONAL REPRESSION.
micRNA : ARNcim.
MESSENGER INTERFERING COMPLEMENTARY RNA.
minisatellite : minisatélite.
ADN sin función conocida del genoma eucariota, formado por repeticiones en serie de unidades compuestas de una
decena de nucleótidos, que pueden llegar a tener una longitud total de 500 a 30 000 pb. Se encuentran dispersas
por todo el genoma eucariota, incluso en los telómeros; por ejemplo, en los telómeros de los cromosomas humanos
existen repeticiones de hexanucleótidos (TTAGGG) de unas 10 000 a 15 000 pb de longitud (la telomerasa añade
estas secuencias para asegurar la multiplicación completa del cromosoma). Estas unidades nucleotídicas breves se
identificaron por primera vez dentro del ADN satélite y por su menor tamaño recibieron el nombre de
«minisatélites». Véase SATELLITE DNA.
miRNA : miARN.
MICRORNA.
moonlighting: multifuncionalidad.
Propiedad de ciertas proteínas de desempeñar funciones múltiples, adicionales o secundarias a su función principal,
mediante la utilización de un mismo dominio o de dominios distintos. Véase MOONLIGHTING PROTEIN.
moonlighting function: función adicional.
→ MOONLIGHTING PROTEIN.
morgan: morgan.
Unidad de distancia arbitraria entre marcadores genéticos equivalente a 100 centimorgans. Apenas se utiliza en la
práctica, pues las determinaciones se hacen en centimorgans. Véase CENTIMORGAN.
mosaic: mosaico.
Organismo constituido por células de diferente constitución génica o cromosómica pese a derivar del mismo cigoto
(a diferencia de la quimera). Véase CHIMERA.
motif: motivo.
1. En los ácidos nucleicos, es una secuencia breve de nucleótidos que suele servir de sitio de reconocimiento para
ciertas proteínas (p.ej., en los genes eucariotas existen motivos nucleotídicos que cumplen una función reguladora o
moduladora de la transcripción). El mismo motivo puede estar presente en una gran variedad de organismos. En
esta acepción significa prácticamente lo mismo que secuencia consenso de nucleótidos; de hecho, a veces se
habla de «motivo TATA» (TATA-box motif, TATA motif) en lugar de «caja TATA» (TATA box), una de las secuencias
consenso características de los promotores eucariotas reconocidos por la ARN-polimerasa II. Véanse BOX, CONSENSUS
SEQUENCE y TATA BOX.
2. En las proteínas, es una pauta característica de plegamiento muy conservada en la naturaleza (se habla así de
los motivos homeobox, dedo de zinc, hélice-giro-hélice, cremallera de leucinas, etc.). En esta acepción puede
equivaler conceptualmente al dominio estructural de las proteínas globulares, aunque un mismo dominio puede
contener más de un motivo; por ejemplo, los dominios de unión a ATP (ATP-binding domains) de las proteínas de la
familia ABC contienen dos motivos característicos denominados Walker A y Walker B, más un tercer motivo
distintivo (signature) denominado C.
3. En las proteínas, coincide con el concepto de dominio funcional. Un mismo motivo o dominio funcional puede
funcionar como dominio estructural (e incluso puede contener varios dominios estructurales), como en el siguiente
ejemplo: «The HMG-1 domain (often referred to as the HMG-1box) is the functional motif of the largest HMG
subfamily, the HMG-1/-2 proteins [...].The HMG-1 domain binds to and bends the minor groove of the DNA. The
HMG-1 domain consists of approximately 80 amino acids and has a characteristic, twisted, L-shaped fold formed by
three α-helical segments.»
4. Cualquier serie de aminoácidos asociada a una determinada función, contigua o alineada con respecto a ciertas
posiciones invariables o conservadas de la secuencia primaria de una proteína. La mutación del motivopuede
acarrear la pérdida de la función de la proteína. En esta acepción tiene un significado muy similar a la de
una secuencia consenso de aminoácidos, aunque en este caso los aminoácidos conservados pueden estar
separados entre sí, como las tres cisteínas (Cys3) y la histidina (His1) del ejemplo siguiente: «The M2 gene of
respiratory syncytial (RS) virus has two open reading frames (ORFs). ORF1 encodes a 22-kDa protein termed M2-
1.The M2-1 protein contains a Cys3-His1 motif (C-X7-C-X5-C-X3-H) near the amino terminus. This motif is conserved
in all human, bovine, and ovine strains of RS virus. A similar motif found in the mammalian transcription factor
Nup475 has been shown to bind zinc. The M2-1 protein of human RS virus functions as a transcription factor which
increases polymerase processivity, and it enhances readthrough of intergenic junctions during RS virus
transcription, thereby acting as a transcription antiterminator. [...] the Cys3 -His1 motif of M2-1 is essential for
maintaining the functional integrity of the protein.». En esta acepción también recibe en inglés el nombre
de rule (regla, norma, pauta).
Observación: la 3.ª acepción de la voz motivo en el diccionario académico es la siguiente: «3. m. En arte, rasgo
característico que se repite en una obra o en un conjunto de ellas.»
mRNA : ARNm.
MESSENGER RNA.
multispecificity: multiespecificidad.
1 Inmunol. Propiedad de un anticuerpo de reconocer y unirse de forma específica a epítopos estructuralmente
distintos de antígenos diferentes. Contradice el concepto clásico de interacción específica de un anticuerpo (o más
precisamente de un parátopo) con un solo epítopo.
2 En sentido general, es la facultad de una proteína de reconocer y unirse a ligandos estructuralmente distintos.
Observación: también recibe el nombre de promiscuidad (PROMISCUITY) y polifuncionalidad
(POLYFUNCTIONALITY).
mutase: mutasa.
Cualquier enzima de la clase de las isomerasas que cataliza el traslado intramolecular de un grupo químico.
Observación: no se trata de una proteína con actividad mutágena. Las isomerasas son enzimas de la Clase EC 5 en
la nomenclatura enzimática del NC-IUBMB.
mutation : mutación.
1 Gene mutation (mutación génica):
a) cualquier cambio que modifica la secuencia de bases de un gen. Este cambio no redunda necesariamente en una
modificación del producto o de la función del producto que el gen codifica, como es el caso de las mutaciones
génicas silenciosas;
b) La transformación de un alelo en otro (A1 g A2).
2 Cromosome mutation (mutación cromosómica): modificación estructural de uno o varios cromosomas.
3 Genome mutation (mutación genómica): modificación del número de cromosomas en el genoma de un
organismo.
4 Mutant (mutante): cualquier organismo portador de una mutación.
muton : mutón.
Término genético en desuso que designa la unidad genética más pequeña que puede mutar. Las técnicas
moleculares han demostrado que se trata de un nucleótido.
N
nascent: incipiente, nuevo, naciente.
Adjetivo que califica a una molécula en vía de síntesis o que acaba de ser sintetizada.
a) nascent RNA (ARN incipiente): molécula de ARN en vía de síntesis;
b) nascent RNA (ARN nuevo): molécula de ARN recién sintetizada;
c) nascent polypeptide (polipéptido naciente):
polipéptido en vía de síntesis que emerge por el
sitio P del ribosoma.
NMD: NMD.
NONSENSE MEDIATED DECAY.
nuclease: nucleasa.
Cualquier enzima de la subclase EC 3.1 que hidroliza los enlaces éster de los ácidos nucleicos. Se clasifica a su vez
en endonucleasa o exonucleasa, según la posición del enlace fosfodiéster que hidroliza, y en ribonucleasa o
desoxirribonucleasa, según el ácido nucleico que sirva de sustrato. Existen nucleasas que reconocen
específicamente los ácidos nucleicos monocatenarios o bicatenarios e incluso las hélices híbridas de ADN y ARN.
VéaseENDONUCLEASE, EXONUCLEASE, DEOXYRIBONUCLEASE y RIBONUCLEASE.
nucleoside : nucleósido.
Compuesto orgánico constituido por una base nitrogenada (púrica, derivada de la purina, o pirimidínica, derivada de
la pirimidina) enlazada mediante el nitrógeno 1 de la pirimidina o el nitrógeno 9 de la purina al carbono 1 de una 2-
desoxi-D-ribosa o de una D-ribosa a través de un enlace N-glucosídico de configuración ß. Según que el azúcar sea
la ribosa o la desoxirribosa, el nucleósido resultante se denomina ribonucleósido (ribonucleoside) o
desoxirribonucleósido (deoxyribonucleoside). Los nucleósidos más comunes de los sistemas biológicos son la
adenosina, la guanosina, la citidina y la uridina (que contienen una ribosa) y la dexosiadenosina, la
desoxiguanosina, la desoxicitidina y la timidina (que contienen una dexosirribosa).
nucleosome: nucleosoma.
Subunidad estructural de la cromatina. Consta de un octámero de histonas y de un segmento de ADN de
aproximadamente 200 pares de bases que se enrolla sobre el octámero dando casi dos vueltas alrededor de él,
como un hilo a su carrete. El octámero está compuesto a su vez de dos moléculas de cada una de las histonas H2A,
H2B, H3 y H4. Véase CHROMATIN, CORE DNA, CORE PARTICLE, HISTONE y LINKER DNA.
nucleotide : nucleótido.
Éster fosfórico de un nucleósido. Consta de uno o más grupos fosforilo que esterifican el grupo hidroxilo en las
posiciones 3’ o 5’ (con mayor frecuencia) del azúcar correspondiente (ribosa o desoxirribosa). Los fosforilos se
clasifican en grupos fosfatos α, ß o γ con arreglo a su proximidad al azúcar. Según que el azúcar sea la ribosa o la
desoxirribosa, el nucleótido resultante se denomina ribonucleótido (ribonucleotide) o desoxirribonucleótido
(deoxyribonucleotide). La base nitrogenada es la portadora de la información genética, mientras que los grupos
fosfato y los azúcares desempeñan una función estructural. Los ribonucleótidos de las células de los organismos son
el ácido adenílico, el ácido guanílico, el ácido uridílico, el ácido citidílico, y los desoxirribonucleótidos el ácido
desoxirriboadenílico, el ácido desoxirriboguanílico, el ácido desoxirribocitidílico y el ácido timidílico.
Observación: con suma frecuencia, en los textos de bioquímica, tanto en inglés como en castellano, los
desoxirribonucleótidos se escriben prescindiendo de la partícula –ribo, así es frecuente ver escrito: desoxiadenílico,
desoxiguanílico y desoxicitidílico. Véase NUCLEOSIDE.
oligonucleotide : oligonucleótido.
Polímero de nucleótidos unidos por enlaces 5’-3’ fosfodiéster de muy breve longitud. Por lo general no supera los 50
nucleótidos. Véase POLYNUCLEOTIDE.
Observación: en la jerga de laboratorio, se conocen más comúnmente con el nombre de «oligos». Incluso es
posible que hasta se escriban así.
omics: ómicas.
Forma abreviada de referirse coloquialmente a diversas esferas emergentes de la biología molecular dedicadas al
estudio de todos los componentes de una determinada clase dentro de un sistema biológico dado, con ayuda de
herramientas automatizadas de análisis a gran escala. Por ejemplo: genomics (genómica, estudio cuantitativo de la
totalidad de genes y secuencias reguladoras y no codificantes contenidas en el
genoma),transcriptomics (transcriptómica, estudio de la población total de ARN
transcritos), proteomics (proteinómica o proteómica, estudio de todas las proteínas sintetizadas y de sus posibles
modificaciones postraduccionales),metabolomics (metabolómica, estudio del complemento de metabolitos de bajo
peso molecular), glycomics (glucómica, estudio de todos los hidratos de
carbono), pharmacogenomics (farmacogenómica, estudio cuantitativo de la forma en que el genotipo afecta a la
respuesta del individuo a un determinado fármaco). (La lista anterior no es exhaustiva.)
Observación: según Günter Kahl (catedrático de Plant Molecular Biology en la Universidad Johann Wolfgang
Goethe, en Frankfurt [Alemania], y autor de The Dictionary of Gene Technology), el término fue acuñado por John
N. Weinstein (Head, Genomics & Bioinformatics Group del National Cancer Institute, Bethesda, Maryland [EE. UU.]).
operator: operador.
Secuencia de ADN específica a la que se une un represor. Véase REPRESSOR.
operon: operón.
Unidad génica de los organismos procariotas formada por un conjunto de genes que desempeñan funciones
metabólicas relacionadas y que se expresan de forma coordinada y regulada.
Observación: el ejemplo típico es el operón lac de E. coli, que codifica las diversas enzimas responsables del
metabolismo de la lactosa. Consta, de izquierda a derecha (de 5’ a 3’), de la secuencia de unión del activador (CAP,
de Catabolite Activator Protein, también conocido con el nombre de CRP, de cAMP Receptor Protein), de un
promotor superpuesto parcialmente a un operador (sitio de unión del represor Lac), que precede a los genes lac
Z (de la enzima betagalactosidasa), lac Y (de la enzima lactosa-permeasa) y lac A (de la enzima tiogalactósido-
transacetilasa). A partir del promotor se transcriben estos tres genes en un mismo ARNm policistrónico, cuya
transcripción es estimulada por el activador en ausencia de glucosa o es reprimida por el represor en ausencia de
lactosa. Es decir, los genes lac de E. coli sólo se expresan de forma eficiente en presencia de lactosa y ausencia de
glucosa a la vez.
ordered clone sequencing: secuenciación jerárquica.
→ HIERARCHICAL SEQUENCING
ORF : ORF.
OPEN READING FRAME.
orthologs: ortólogos.
Genes pertenecientes a especies biológicas distintas derivados de un gen ancestral común por un fenómeno de
especiación y no de duplicación. Normalmente los ortólogos conservan la misma función en las líneas descendientes
del mismo ancestro. Un ejemplo clásico de genes ortólogos son los que codifican las cadenas α de la hemoglobina
humana y murina.
P
paralogous genes: genes parálogos.
→ PARALOGS
paralogs: parálogos.
Genes pertenecientes a una misma especie biológica que derivan de otro por duplicación. Normalmente los
parálogos adquieren con el tiempo funciones distintas (que pueden estar relacionadas con la función original), ya
sea en la misma especie o en las especies que surgen de ella en el curso de la evolución. Un ejemplo clásico de
genes parálogos son los que codifican las cadenas α y β de la hemoglobina humana. Véase DUPLICATION.
paramutation: paramutación.
Silenciamiento de la expresión de un alelo activo por parte de otro inactivo situado en el mismo locus en ciertos
heterocigotos. Los alelos que inducen el silenciamiento se llaman «paramutágenos» (paramutagenic), el alelo
sensible al silenciamiento se llama «paramutable» (paramutable) y las formas alteradas del alelo paramutable se
denominan «paramutadas» o «paramutantes» (paramutant). La paramutación produce en un aumento progresivo
de metilaciones de citosinas en el alelo paramutable. Se trata de un fenómeno de naturaleza epigenética, estable y
heredable (pues los alelos no se reactivan durante la meiosis o la mitosis), descubierto en el maíz. Véase HOMOLOGY-
DEPENDENT GENE SILENCING (HDGS) y LOCUS.
paratope: parátopo.
Región del anticuerpo que se une con el epítopo de un antígeno. Tiene una forma complementaria de la del epítopo
antigénico específico, de modo que este último encaja a la perfección y ello facilita la formación de múltiples enlaces
no covalentes con el parátopo. Así, varios aminoácidos de las regiones hipervariables de las cadenas pesadas y
ligeras del anticuerpo establecen contacto con el antígeno. Véase ANTIBODY.
PCR: PCR.
POLYMERASE CHAIN REACTION.
permease: permeasa.
Proteína o grupo de proteínas que facilita el traslado de un soluto (biomoléculas, iones o proteínas) de un lado a
otro de una membrana biológica mediante un mecanismo de transporte activo (con gasto de energía).
Observación: pertenecen a la clase 2 (transferasas) o 3 (hidrolasas) de la clasificación de la IUBMB. La
oligopéptido-permeasa, por ejemplo, cataliza la siguiente reacción:
ATP + H2O + oligopéptidoexterior = ADP + fosfato+ oligopéptidointerior.
El nombre común de esta última enzima es oligopeptide-transporting ATPase (ATPasa transportadora de
oligopéptidos) y pertenece a la subcategoría EC 3.6.3.23 de la IUBMB.
phage: fago.
Abreviatura de bacteriófago. Véase BACTERIOPHAGE.
phagemid: fagómido.
Vector de clonación mixto, con características de un plásmido y de un fago filamentoso (por lo general, M13 o f1,
pero también puede contener secuencias derivadas del fago λ). Recibe asimismo el nombre de fásmido (phasmid).
Contiene sitios de inicio de la replicación del plásmido y del fago: en el interior de una célula hospedadora funciona
como un plásmido normal, que se replica y cuyas copias se reparten en el momento de la división celular de forma
controlada entre las células hijas, pero si la célula que lo alberga es infectada por un fago filamentoso adecuado (el
fago auxiliar o helper), el fagómido cambia su modo de replicación como resultado de la presencia del producto del
gen II del fago auxiliar en la célula; esta proteína reconoce la secuencia ori(+) de la región intergénica del
fagómido, produce una muesca en el ADNbc e inicia la replicación de éste por el modelo del círculo rodante, igual y
de forma simultánea que el ADNbc del fago auxiliar. De esta manera, la célula acaba exportando dos tipos de
viriones, de aspecto idéntico pero distinto contenido, que contienen el ADNmc genómico del fago auxiliar o una de
las hebras del fagómido. Los viriones que portan el fagómido son infecciosos y pueden inyectar el vector en células
susceptibles, donde se vuelven a comportar como plásmidos bacterianos normales. El fagómido se utiliza para
sintetizar sondas monocatenarias, secuenciar un fragmento clonado y en experimentos de mutagénesis dirigida. Su
principal atractivo consiste en la posibilidad de clonar fragmentos de ADN monocatenario largos, con poco riesgo de
pérdida de segmentos por deleción. Son ejemplos de fagómidos los vectores pUC118 y pUC119, λZAP y los de la
serie pBluescript.
phasmid: fásmido.
PHAGEMID
phenotype: fenotipo.
1 Conjunto de características funcionales y estructurales de un individuo que resultan de la interacción de su
genotipo con el medio ambiente. Véase GENOTYPE.
2 Características codificadas por los alelos de uno o varios locus en estudio.
plantibody: fitoanticuerpo.
Anticuerpo de origen humano o mamífero sintetizado por una planta transgénica.
plasmid: plásmido.
Molécula de ADN bicatenario circular que se multiplica de forma independiente del ADN cromosómico de su
hospedador natural, la célula bacteriana (y más raramente otros microorganismos). Tiene un tamaño variable entre
unas 1-5 kb y más de 100 kb y es portador de genes de resistencia a antibióticos, producción de toxinas y enzimas.
Se replica en la célula hospedadora antes de la división celular y por lo menos una de las copias se transmite a cada
célula hija, pero pueden existir de 1 a 50 copias o más por célula. No se consideran plásmidos ni el ADN
mitocondrial ni el ADN de los cloroplastos. Se utilizan con suma frecuencia como vectores de clonación en ingeniería
genética; en estos casos se reduce su tamaño natural al mínimo a fin de poder insertarles el ADN que se desea
clonar y mejorar la frecuencia de obtención de recombinantes (la transformación con plásmidos de tamaño superior
a 15 kb es extremadamente ineficaz). Entre los vectores plasmídicos más típicos y populares figuran los de la serie
pBR (especialmente el pBR322), derivada del plásmido ColE1 de E.coli, que sintetiza a la colicina E1.
-plast: plasto.
Sufijo derivado del griego que entra en la composición de diversos términos botánicos de origen griego. Designa
una célula (como en bioplasto o protoplasto), un corpúsculo organizado o una partícula organizada (como
encloroplasto, amiloplasto) o bien se relaciona con formar o plasmar. En botánica se utiliza mucho en función
sustantiva como sinónimo estricto de plastidio. Véase PLASTID.
plastidome: plastidoma.
Conjunto de plastidios de una célula vegetal. Véase PLASTOME.
plastome: plastoma.
Genoma de un plastidio.
Observación: en botánica, el término plastoma se utiliza a veces como sinónimo de plastidoma. En cambio, en
biología molecular, la palabra plastoma se usa preferentemente para referirse al genoma de un plastidio.
VéasePLASTIDOME.
poly(A) : poli(A).
Abreviatura de «poliadenilato».
polyadenilation : poliadenilación.
Adición de una secuencia de poliadenilatos en el extremo 3’ de un ARN eucariótico que acaba de ser traducido.
polycistronic mRNA : ARNm policistrónico.
Molécula de ARNm que determina la síntesis de varios productos génicos debido a que contiene más de un marco de
lectura abierto. Es característico de los organismos procariotas.
polymerase : polimerasa.
Nombre común con el que se designan las enzimas que forman polímeros de nucleótidos.
polynucleotide: polinucleótido.
Polímero de nucleótidos unidos por enlaces 5’-3’ fosfodiéster de longitud superior a 50 unidades. Los de menor
longitud se denominan oligonucleótidos. VéaseOLIGONUCLEOTIDE.
porter: transportador.
Proteína o grupo de proteínas de membrana que facilita el traslado de un soluto de un lado a otro de una membrana
biológica, con o sin gasto de energía. Se diferencia en tres tipos básicos, según el número de solutos transportados
y su dirección de traslado: si transporta dos solutos distintos de forma simultánea (o secuencial) y en direcciones
opuestas se llama «antiportador» (antiporter), cuando transporta dos solutos distintos de forma simultánea (o
secuencial) y en la misma dirección se denomina «simportador» (symporter), y si solamente transporta un sustrato
a la vez recibe el nombre de «uniportador» (uniporter).
Observación: en algunos diccionarios especializados de lengua inglesa (el Singleton, entre otros), porter figura
como sinónimo no sólo de transporter, sino también de permease, aunque generalmente este último término se
reserva casi siempre para los sistemas de transporte activo (con gasto de energía). Véase PERMEASE.
→ SYSTEMS BIOLOGY
pre-mRNA : preARNm.
PRECURSOR MRNA.
pre-RISC : preRISC.
Complejo RISC antes de su activación con ATP. Véase RNA-INDUCED SILENCING COMPLEX y RNA INTERFERENCE.
pre-RNA : preARN.
PRECURSOR RNA.
pre-stRNA : preARNtp.
SHORT HAIRPIN RNA.
presequence : presecuencia.
LEADER SEQUENCE.
primase: primasa.
ARN-polimerasa especializada en la replicación del ADN. Cataliza la formación de novo de pequeños fragmentos de
ARN (los cebadores) sobre una de las hebras de ADN que sirve de plantilla. Se activa al asociarse con otras
proteínas que participan en la replicación del ADN, como la ADN-helicasa. Véase DNA REPLICATION, PRIMER y RNA
POLYMERASE.
Observación: esta enzima debería pertenecer en teoría a la clase EC 2.7.7.6 (ARN-polimerasas dirigidas por ADN)
de la nomenclatura enzimática del Comité de Nomenclatura de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología
Molecular (NC-IUBMB), sin embargo no está recogida como tal ni en ésa ni en ninguna otra clase de dicha
nomenclatura. Por otro lado, aunque desde el punto de vista enzimático pueda ser equivalente a otras ARN-
polimerasas celulares, conviene mantener su identidad como una ARN-polimerasa distinta dada su función peculiar
en la replicación del ADN, que no es intercambiable por la de ninguna otra ARN-polimerasa.
primer: cebador.
Oligonucleótido de 5 a 10 nucleótidos de longitud cuyo 3’-OH utiliza la ADN-polimerasa dirigida por ADN como punto
de partida para la síntesis de ADN.
primosome: primosoma.
Complejo de proteínas indispensable para la actividad de la enzima primasa. Posibilita la síntesis de los fragmentos
de Okazaki sobre la cadena retrasada del ADN que se está replicando.
probe: sonda.
Cualquier fragmento de ADN o ARN que ha sido marcado con radionúclidos, fluoróforos u otras moléculas, como la
biotina o la digoxigenina, con objeto de detectar secuencias complementarias en experimentos de hibridación
molecular. Se obtiene por polimerización in vitro a partir de una secuencia complementaria o por purificación de un
fragmento de restricción de un ácido nucleico natural o clonado. Salvo indicación contraria, son fragmentos de ADN.
Cuando el fragmento es de ARN recibe el nombre de «ribosonda» (riboprobe).
Observación: no es lo mismo que ‘grupo indicador’. Véase REPORTER GROUP.
probe, to: hibridar. Producir un híbrido por complementariedad de bases entre un fragmento de ácido nucleico de
la muestra y un fragmento de ácido nucleico marcado, conocido como «sonda» (probe).
«When transferred to a filter and probed with a DNA fragment homologous to just one sequence in the digested
molecule, a single band is seen.» (Cuando los fragmentos digeridos se transfieren a la membrana de filtro e
hibridan con un fragmento de ADN complementario de una secuencia nucleotídica de la molécula digerida, se
observa una única banda.)
proofreading : corrección.
1 En la replicación del ADN, es la actividad exonucleasa de 3’ a 5’ de una polimerasa, que cataliza la hidrólisis de
uno en uno de los nucleótidos no complementarios de la cadena plantilla.
2 En la síntesis de proteínas, es la hidrólisis de un aminoacil-adenilato o de un aminoacil-ARNt por parte de la
aminoacil-ARNt-sintetasa cuando se une un aminoácido equivocado.
3 Asimismo en la síntesis de proteínas, es la liberación del aminoacil-ARNt del sitio ‘A’ del ribosoma justo antes de
la transposición de este último sobre el ARNm, cuando el anticodón del ARNt no se ha apareado correctamente con
el codón del ARNm.
prokaryon: procarion.
Núcleo primitivo compuesto de un ADN genómico que no está delimitado por una membrana de fosfolípidos.
Observación: según Fernando Navarro, en griego, karyon era palabra llana, de modo que etimológicamente debe
escribirse «procarion», sin tilde. En la práctica probablemente sea más frecuente la forma aguda «procarión»,
quizás por influencia del francés.
promoter: promotor.
Secuencia de ADN bicatenario reconocida por la ARN-polimerasa y otros factores de transcripción, necesaria para el
inicio de la transcripción del gen contiguo.
Observación: en los organismos procariotas, el promotor interacciona directamente con la holoenzima con
actividad ARN-polimerasa (unida a una proteína, el factor σ); en los organismos eucariotas, el promotor contiene
secuencias de reconocimiento de factores de transcripción específicos que, al unirse al promotor a través de esas
secuencias, forman un complejo proteico reconocido por la ARN-polimerasa, que entonces se fija alrededor del
nucleótido que marca el inicio de la transcripción. En estos organismos, los promotores reconocidos por las ARN-
polimerasas I y II están localizados en su mayoría antes del nucleótido de inicio de la transcripción
(startpoint, flecha negra en la figura), pero la mayoría de los promotores de la ARN-polimerasa III se sitúan
después del punto de inicio, esto es, dentro de la región codificante.
Una de las posibles configuraciones de un promotor (indispensable para la transcripción de un gen) y un potenciador (dispensable)
de un gen transcrito por la ARN-polimerasa II. El promotor contiene varias secuencias dispersas (caja TATA, caja Inr y caja BRE)
reconocidas por factores de transcripción. La separación entre el potenciador y el promotor puede ser de varias kb. El potenciador
contiene secuencias de reconocimiento de factores de transcripción más juntas. El DNA de la región potenciadora puede plegarse,
de modo que los factores estén en contacto directo con los del promotor. El nucleótido del ADN que marca el inicio de la cadena de
ARN se denomina «inicio transcripcional» (transcription start site o startpoint) y se designa con el número «+1» (flecha).
PTGS : PTGS.
POST-TRANSCRIPTIONAL GENE SILENCING.
Q
quantitative biology: biología de sistemas.
→ SYSTEMS BIOLOGY
RAPD-PCR: RAPD-PCR.
RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA.
RdRP: RdRP.
RNA-DIRECTED RNA POLYMERASE.
reactant: reactante.
Sustancia que se consume en el curso de una reacción química. En las reacciones catalizadas por enzimas, el
reactante es el sustrato de la reacción.
Observación: antiguamente se conocía, y aún hoy todavía se conoce, a veces, con el nombre de reactivo
(reagent). En la actualidad, la IUPAC prefiere reservar la palabra reagent para designar la sustancia analítica que se
añade a un sistema a fin de llevar a cabo una reacción o para determinar si dicha reacción tiene lugar (por ejemplo,
un reactivo analítico). VéaseREAGENT.
read: lectura (de la secuencia nucleotídica); secuencia. (La traducción depende del contexto.)
Secuencia de entre 500 y 1000 nucleótidos obtenida en una secuenciación de ADN.
«The output of the experiment is called a read, and as we said is a 500-1000 long sequence on {A, C, G, T} of
unknown orientation, and with ~ 1% errors.» (El resultado de una secuenciación se llama read [lectura] y, como ya
dijimos, es una secuencia de unos 500 a 1000 nucleótidos (A, C, G, T), de orientación desconocida y que contiene
un 1 % de errores aproximadamente.)
Observación: es sinónimo de sequence read, sequencing read y gel reading (a veces abreviado a reading).
readthrough : ultralectura.
1 readthrough RNA (ARN ultraleído): transcripción del ADN más allá de la secuencia de terminación normal del
gen, cuando la ARN-polimerasa dirigida por ADN no reconoce la señal de finalización de la transcripción.
2 readthrough protein (proteína ultraleída): traducción de una proteína más allá del codón normal de finalización
de lectura del ARNm, cuando el codón de finalización de lectura se convierte por mutación en un codón
determinante de un aminoácido (sense codon).
reagent: reactivo.
1 Sustancia que reacciona con otra o que participa en una reacción química, o que es necesaria para que se lleve a
cabo dicha reacción. Véase REACTANT.
2 Sustancia que se utiliza para detectar o valorar otra sustancia.
reassortant: reordenante.
→ REASSORTANT VIRUS
reassorted genome: genoma reordenado. En los virus de genoma segmentado, es el genoma híbrido que se
genera como resultado de un reordenamiento genómico. Véase GENETIC REASSORTMENT.
recombinagen: recombinógeno.
[Sust.] Agente que fomenta la recombinación genética.
recombinagenic: recombinógeno.
→ RECOMBINOGENIC
Observación: Rieger y cols. atribuyen el término a R. Holliday (1963), con remisión a un artículo sobre la
mitomicina C. Es mucho menos frecuente que la variante gráfica recombinogenic.
recombination: recombinación.
Proceso mediante el cual una o más moléculas de ácido nucleico se reorganizan para generar nuevas asociaciones o
secuencias de genes, alelos u otras secuencias de nucleótidos; puede implicar, por ejemplo, el intercambio físico de
material entre dos moléculas (como es el intercambio de segmentos cromosómicos en la recombinación genética
propiamente dicha), la unión covalente de dos moléculas para formar una sola, la inversión de un segmento dentro
de una molécula.
recombinator: recombinador.
Cualquier secuencia de nucleótidos de un ADN bicatenario que aumenta la frecuencia de recombinación en el sitio
donde se encuentra, así como a sus flancos y en zonas un poco más alejadas de él (como la secuencia chi del
cromosoma de E. coli). Véase CHI SEQUENCE y HOT SPOT.
recombinogen: recombinógeno.
→ RECOMBINAGEN
recombinogenic: recombinógeno.
[Adj.] Que favorece la recombinación o es susceptible de padecerla.
Observación: el calificativo recombinogenic se aplica a secuencias nucleotídicas, moléculas lineales de ADN,
endonucleasas, regiones cromosómicas y a un buen número de sustancias, elementos o procesos cancerígenos o
mutágenos. Dentro de este último grupo figuran, por ejemplo, los rayos ultravioletas, el choque térmico, la
mitomicina C (sustancia alquilante que interconecta —crosslinks— las hebras de ADN complementarias, evita la
síntesis de ADN y puede fomentar el intercambio de segmentos entre cromátides hermanas), el
metoxaleno (sustancia fotoactiva que forma aductos de ADN en presencia de rayos ultravioletas), la
metilnitronitrosoguanidina y la floxuridina (un potente mutágeno y cancerígeno y un antimetabolito antineoplásico,
respectivamente, que fomentan los entrecruzamientos somáticos en células fúngicas). Veamos algunos ejemplos:
«Thymine deprivation is mutagenic and recombinogenic.» (La falta de timina es mutágena y recombinógena.)
«in most species, centromeres and telomeres are less recombinogenic than general euchromatin.» (en la mayoría
de las especies, los centrómeros y los telómeros son menos recombinógenos que la eucromatina en general.)
«La razón de este incremento se debe a que, en los organismos eucariotas, los extremos de ADN libres son
recombinógenos (favorecen la recombinación).»
Por último, como indica Fernando Navarro en su Diccionario crítico de dudas (2005), el sufijo inglés -genic no
corresponde en español a «-génico», sino a «-geno»; ambos (-genic, -geno) se utilizan para designar tanto aquello
que es «capaz de producir lo indicado en la raíz» como lo «originado por la raíz o en la raíz». En cambio, el sufijo «-
génico» se usa principalmente en español para expresar la relación con un adjetivo sustantivado que acaba en «-
geno». No obstante, es cada vez más frecuente la utilización de adjetivos acabados en «-génico» como en inglés.
recombinogenic engineering: ingeniería recombinógena.
Ingeniería genética por intermedio de una recombinación homóloga en E. coli. Se trata de una estrategia
relativamente nueva de obtención de ADN recombinados, sin necesidad de emplear enzimas de restricción ni
ligasas, basada en la recombinación homóloga entre secuencias nucleotídicas de los extremos 3’ y 5’ de un
fragmento lineal de ADN (p. ej.: un fragmento obtenido por RCP, un oligonucleótido), que se introduce en células
de E. coli, y las secuencias complementarias de un ADN endógeno (p. ej.: un plásmido bacteriano o un cromosoma
bacteriano artificial o natural).
recon : recón.
Término genético en desuso que designa la unidad genética indivisible que puede intercambiarse por recombinación.
Las técnicas moleculares han demostrado que se trata de un par de nucleótidos complementarios.
VéaseCISTRON, GENE y MUTON.
repressor: represor.
Proteína con función reguladora que disminuye o inhibe la transcripción de un gen.
Observación: en los organismos procariotas, donde los genes se transcriben usualmente en grupos denominados
operones, el represor se une a una secuencia específica de ADN denominada operador (superpuesta parcialmente al
sitio de unión de la ARN-polimerasa) e inhibe la transcripción de los genes estructurales (p.ej.: como los genes lac
Z, lac Y y lac A del operón lac). En los organismos eucariotas, el modo de acción de los represores es más variado,
pero en general puede decirse que existen cuatro mecanismos principales: a) competición (con el activador): el
represor se une a una secuencia de ADN que se superpone parcialmente con la secuencia de unión de un activador,
con lo cual bloquea la activación del gen; b) inhibición (del activador): el represor se une a una secuencia de
ADN próxima al sitio de unión del activador e interacciona con el activador unido cubriendo parcialmente su dominio
activador; c) represión directa (del aparato transcripcional): el represor se une a una región anterior del gen
(hacia el extremo 5’), interacciona con proteínas del aparato transcripcional unido al promotor e inhibe el inicio de la
transcripción; d) represión indirecta (del aparato transcripcional): quizás el mecanismo más frecuente,
consiste en la atracción de modificadores de histonas, que compactan la cromatina e impiden la unión de factores
de transcripción (p.ej.: histona-desacetilasas, metilasas, etc.).
retrotranscriptase : retrotranscriptasa.
rEVERSE TRANSCRIPTASE.
reversion: reversión.
En sentido amplio, es la restauración parcial o completa del fenotipo normal de un mutante. Se produce por dos
fenómenos distintos: la retromutación y la mutación supresora. Véase REVERSE MUTATION y SUPRESSOR MUTATION.
revertant: revertiente.
1. Adj. Referido a un alelo que ha sido objeto de una reversión . Véase BACK MUTATION.
2. Sust. Organismo que alberga dicho alelo y ha recuperado el fenotipo normal.
RFLP: RFLP.
RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM.
ribonuclease: ribonucleasa.
Nucleasa que hidroliza los enlaces fosfodiéster del ARN. Véase ENDONUCLEASE y EXONUCLEASE.
riboprobe : ribosonda.
Molécula de ARN que sirve de sonda en distintos ensayos de hibridación. Se obtiene por transcripción in vitro de un
ADN clonado.
ribozyme : ribozima.
Molécula de ARN con actividad catalítica. A diferencia de las enzimas verdaderas de naturaleza proteica, la ribozima
puede quedar alterada una vez que ha desempeñado su función.
Observación: Sidney Altman describió por vez primera vez una molécula con estas características en 1981 y la
bautizó con el nombre de «RNasa P» (RNase P). Un año después, Thomas Cech descubría un segundo ARN con
propiedades autocatalíticas en el intrón de 414 nucleótidos del ARNr del protozoario ciliado Tetrahymena
thermophila. Hoy día se conocen aproximadamente unas cien ribozimas. Thomas Cech y Sidney Altman recibieron el
Premio Nobel de química en 1989 por el descubrimiento de las propiedades biocatalíticas del ARN.
RISC : RISC.
RNA-INDUCED SILENCING COMPLEX.
RNA : ARN.
RIBONUCLEIC ACID.
RNAi : iARN.
RNA INTERFERENCE.
RNA-induced silencing complex (RISC) : complejo silenciador inducido por ARN (RISC).
Complejo citoplasmático de unos 500 kDa formado por una molécula de ARNip y una serie de proteínas todavía no
identificadas ni caracterizadas en su totalidad. La molécula de ARNip sirve de guía al complejo ribonucleoproteico
para reconocer y degradar el ARNm específico en el fenómeno de la ribointerferencia. Una de las subunidades de
este complejo riboproteico es una proteína de la familia Argonauta (ago2), también denominada miRNP en las
células humanas. La enzima responsable de la degradación del ARNm es una endorribonucleasa desconocida, que
lleva el nombre provisional de Slicer. Se presume que RISC está asociado a los ribosomas y que sólo se activa en
presencia de ATP; su forma inactiva se denomina pre-RISC o siRNP. Véase RNA INTERFERENCE, SLICER y SMALL
INTERFERING RIBONUCLEOPROTEIN (SI RNP).
RNase: ribonucleasa.
RIBONUCLEASE.
RNAse H: ribonucleasa H.
Enzima que cataliza específicamente la ruptura endonucleolítica de un enlace fosfodiéster entre dos ribonucleótidos
de una doble hélice híbrida de ADN y ARN (la letra hache se debe a la palabra híbrido).
Observación: pertenece a la clase EC 3.1.26.4 del Comité de Nomenclatura de la Unión Internacional de
Bioquímica y Biología Molecular (NC-IUBMB). Su nombre común es «ribonucleasa H de timo de ternero» (calf
thymus ribonuclease H), pero también se conoce como: endoribonuclease H (calf thymus), RNA*DNA hybrid
ribonucleotidohydrolase, hybrid ribonuclease, hybridase, hybridase (ribonuclease H), ribonuclease H, hybrid
nuclease.
rRNA : ARNr.
RIBOSOMAL RNA.
RT-PCR: RT-PCR.
REVERSE TRANSCRIPTASE PCR.
S
same-sense codons: codones sinónimos.
SYNONYMOUS CODON.
scRNA : ARNcp.
SMALL CYTOPLASMIC RNA.
scRNP : RNPcp.
SMALL CYTOPLASMIC RIBONUCLEOPROTEIN
scyrp : scirp.
Voz coloquial derivada del acrónimo inglés scRNP (small cytoplasmic ribonucleoprotein).
Sec61: Sec61.
Complejo constituido por tres clases de polipéptidos transmembranarios (Sec61p, Sec61ß y Sec61γ) que forman el
canal del traslocón propiamente dicho. Cuando la secuencia señal ingresa en el traslocón, el ribosoma se une
firmemente a Sec61, de modo que el poro no queda expuesto al citoplasma. Véase TRANSLOCON.
sequenator: secuenciador.
→ SEQUENCER
sequence: secuencia.
Orden de unión de los monómeros en un biopolímero, por ejemplo, el orden de aminoácidos en un polipéptido (del
extremo N al extremo C) o de nucleótidos en una hebra de ácido nucleico (del extremo 3’ al extremo 5’).
sequencer: secuenciador.
Aparato que sirve para determinar de forma automática la secuencia de los monómeros que componen un polímero
lineal. Existen secuenciadores automáticos de ADN y de proteínas.
sequencing: secuenciación.
Procedimiento analítico que permite determinar la secuencia de aminoácidos de un polipéptido o la secuencia de
nucleótidos de una hebra de ADN o de ARN. Véanse ENZYMATIC SEQUENCING METHOD, CHEMICAL SEQUENCING
METHOD y SOLID-PHASE PEPTIDE SEQUENCING.
Es sustrato de la endorribonucleasa Dícer, que al escindirlo libera un ARN monocatenario de unos 22 nt denominado
«ARN temporal pequeño» (segmento negro de la figura, el ARNtp). El ARNhc se conoce asimismo con el nombre
de stRNA precursor (pre-stRNA). Véase DICER, SMALL TEMPORAL RNA y STRNA PRECURSOR.
shRNA : ARNhc.
SHORT HAIRPIN RNA.
signature: distintivo.
1. (sust.). Aminoácido conservado o secuencia de aminoácidos (motivo proteico) que caracteriza o sirve para
reconocer una proteína o una familia de proteínas. Por ejemplo, se dice que el aminoácido conservado Lys-220
del motivo D de las polimerasas dependientes de ARN es el distintivo o la signature de esas proteínas, o que
el motivo B es el distintivo o la signature de los reguladores ARR que participan en los sistemas de traducción de
señales. Véase MOTIF.
2. (adj.). Que distingue o caracteriza algo. Por ejemplo, el motivo secuencial único, LSGGQ, característico de los
dominios con actividad ATPasa de los transportadores ABC, recibe en inglés la denominación de signature
sequence o canonical signature motif de estos transportadores.
Observación: en la primera acepción, no es incorrecta su traducción literal por «signatura», dado que el DRAE
recoge como primer significado de esta última voz el de «marca o nota puesta en una cosa para distinguirla de
otras». También se ha propuesto «rúbrica» (en su acepción de «rasgo» o «peculiaridad»). En la segunda, en
cambio, el traductor tiene dos opciones, optar bien por el calco semántico «signatura» (con el significado de
«distintivo») y entonces se utiliza de forma apuesta: «motivo signatura» (signature motif), «secuencia signatura»
(sequence motif) o bien traducirlo por el adjetivo «distintivo». Esta última palabra tiene la ventaja de que también
puede usarse en función sustantiva con el significado de «marca o señal característica» y quizás transmita mejor
este significado que «signatura».Véanse SIGNATURE MOTIF y SIGNATURE SEQUENCE.
siRNA : ARNip.
SMALL INTERFERING RNA.
siRNP :RNPip.
PRE-RISC.
Slicer: Eslícer.
Enzima con actividad endorribonucleasa del complejo ribonucleoproteico RISC. Véase RISC, RNA interference.
Observación: el nombre de esta enzima proviene de un juego de palabras entre los verbos to dice (cortar en
cubitos) y to slice (cortar en rebanadas).
snoRNA : ARNnop.
SMALL NUCLEOLAR RNA.
snRNA : ARNnp.
SMALL NUCLEAR RNA.
snRNP : RNPnp.
SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN.
snurp : snurp.
Voz coloquial derivada del acrónimo inglés snRNP (small nuclear ribonucleoprotein).
spacer: espaciador.
1 Biol mol. Espaciador (intragénico o intergénico). Véase TRANSCRIBED SPACER y NON-TRANSCRIBED SPACER.
2 Cromat. (Brazo) espaciador. Véase SPACER ARM.
SRP: SRP.
SIGNAL RECOGNITION PARTICLE.
ssDNA : ADNmc.
SINGLE-STRANDED DNA.
ssRNA : ARNmc.
SINGLE-STRANDED RNA.
STR: STR.
SHORT TANDEM REPEATS .
stRNA: ARNtp.
SMALL TEMPORAL RNA.
substrate: sustrato.
1. Especie química cuya reacción con otro reactivo químico se observa.
2. Molécula o entidad química cuya conversión en un producto o en una serie de productos es catalizada por una o
varias enzimas. También se conoce como «reactante» (reactant) de la reacción química.
3. Solución o mezcla en polvo de todos los ingredientes o elementos necesarios para el crecimiento de un cultivo de
microorganismos o de la formación de un producto.
4. Componente de un medio nutritivo que proporciona los elementos necesarios para el crecimiento de un
microorganismo (p.ej.: carbono, nitrógeno, etc.).
super-integron : superintegrón.
INTEGRON.
supression: supresión.
SUPRESSOR MUTATION.
symporter: simportador.
Transportador de dos solutos en idéntica dirección. Véase PORTER.
system: sistema.
1 Biol. y med. Conjunto de órganos que intervienen en alguna función vegetativa (p. ej.: sistema nervioso, sistema
inmunitario, sistema digestivo).
2 Biol. de sistemas. Grupo de partes o de elementos biológicos interconectados, interactuantes e interdependientes
que conforman una unidad coherente con propiedades intrínsecas nuevas (emergent properties), resultantes de la
interacción de los elementos que lo componen y no de la simple suma de sus partes. Presenta gran estabilidad
fenotípica (robustness) frente a determinadas perturbaciones internas y externas debido a: 1) la existencia de
mecanismos de regulación; 2) su estructura modular (modularity) o, lo que es lo mismo, la existencia de
subunidades funcionales o de subsistemas más sencillos (modules) dentro del sistema, que pueden estudiarse de
forma independiente (p. ej.: los orgánulos forman células que son las unidades constituyentes de los tejidos, y
éstos de los órganos, y éstos de los organismos, y éstos a su vez de una población); 3) la multiplicidad de módulos
o subsistemas que cumplen la misma función (redundancy) de suerte que su eliminación o deterioro no afecta al
resto de las partes; 4) su estabilidad estructural (structural stability), con independencia de que tenga una
estructura física concreta. Así, la utilización de glucosa en las levaduras, la fijación simbiótica de nitrógeno o la
quimiotaxia bacteriana, al igual que un orgánulo, un tipo celular, un tejido, un órgano, un organismo o una
población constituyen ejemplos de sistemas biológicos.
T
targeting sequence : secuencia de acceso.
LEADER SEQUENCE.
terminator: terminador.
Secuencia de ADN bicatenario, contigua al extremo 3’ de un gen, que posibilita la disociación de la ARN-polimerasa
de la hebra de ADN y la liberación de la hebra de ARN recién sintetizada dando por finalizada la transcripción. Sólo
permite la finalización de la transcripción del gen precedente que ha sido previamente «recorrido» por la ARN-
polimerasa.
Observación: en las bacterias existen dos clases de terminadores, los independientes de la proteína ρ (también
llamados terminadores intrínsecos) y los dependientes de ρ. Ambos afectan a la polimerasa una vez que han sido
transcritos (funcionan en el ARN y no en el ADN). En los organismos eucariotas existen terminadores específicos de
las ARN-polimerasas I y III, pero los de la ARN-polimerasa II están menos caracterizados.
TGS :TGS.
TRANSCRIPTIONAL GENE SILENCING (TGS).
throughput: productividad.
Capacidad de producción (número de resultados obtenidos o de procesos realizados) por unidad de tiempo. Por
ejemplo:
In 1986, we developed the first automated DNA sequencer (Smith et al., 1986). From that time until today, there
has been approximately a 2000-fold increase in throughput of DNA sequencing (today’s instruments may sequence
about 1.5 million base pairs per day). My prediction is that over the next 7-10 years, the development of single
molecule DNA sequencing will increase the rate of sequencing by another 2000 - 4000 fold. [Secuenciación
automática de ADN.]
With automation, high throughput is possible. At present, we can process 1200 ligation reactions per day with a
single operator and robotic workstation, and, in the near future, further automation with a robotic arm will permit
processing of 600 reactions per day. [Detección de secuencias específicas de ADN por PCR y discriminación alélica
mediante ligado de oligonucleótidos.]
The method has a high throughput rate, one technician can assay 200 samples in duplicate in a working week.
[Método de radioinmunoanálisis específico para detectar clomipramina.]
Observación: en la Argentina se conoce asimismo como «procesividad».
tracer: trazador.
Sustancia química externa que se mezcla o se une con otra sustancia para determinar la distribución o la
localización de esta última. Así pues, pueden ser trazadores desde antimetabolitos no radioactivos, como la 2-
desoxiglucosa, hasta proteínas o enzimas marcadas con colorantes fluorescentes o con isótopos, como la
seroalbúmina bovina conjugada con isotiocianato de fluoresceína (FITC-BSA), la 14C-putrescina o la aldolasa
conjugada con fluoresceína (FITC-aldolasa), pasando por oligosacáridos marcados con isótopos e incluso colorantes
fluorescentes (como el isotiocianato de fluoresceína y la dioctadecilindocarbocianina) e isótopos de elementos varios
(como 45Ca, 125I o 14C).
Observación: los colorantes fluorescentes e isótopos radioactivos o estables entran en la categoría de lo que la
IUPAC considera labels (marcadores) en el ámbito de la química radioanalítica (por consiguiente, cuando
eltracer sea de esa clase también se puede decir que es un marcador, véase LABEL). No hay uniformidad de criterios
con respecto a la definición de tracer, ni en los archivos de la IUPAC ni en los diccionarios de química y de
bioquímica y biología molecular. (Los ejemplos citados se han extraído de trabajos publicados en estos campos.)
TRAM: TRAM.
TRANSLOCATING CHAIN-ASSOCIATED MEMBRANE PROTEIN.
transactivator: transactivador.
Activador que interacciona de forma directa con la ARN- polimerasa (sin la ayuda de coactivadores).
Véase ACTIVATOR.
transcript : transcrito.
Molécula de ARN transcrita a partir de una hebra complementaria de ADN.
Observaciones: el DRAE recoge la palabra «transcrito» como voz grave y no esdrújula y, por lo tanto, debe llevar
acento prosódico (pero no ortográfico) en la letra i.
transcription : transcripción.
Síntesis de ARN a partir de una hebra de ADN catalizada por la ARN-polimerasa con el auxilio de proteínas
específicas (factores de transcripción). Comprende tres fases denominadas iniciación (initiation), elongación
(elongation) y terminación (termination). En los organismos eucariotas existen tres tipos de transcripción según la
ARN-polimerasa que la lleva a cabo: a) la transcripción de ARNr catalizada por la ARN-polimerasa I, b) la
transcripción de ARNm catalizada por la ARN-polimerasa II, y c) la transcripción de ARNt y otros ARN pequeños
catalizada por la ARN-polimerasa III. En los organismos procariotas existe sólo un tipo de transcripción y de ARN-
polimerasa. Véanse DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE, NONCODING STRAND y RNA-POLYMERASE.
transesterification : transesterificación.
1 Reacción de un éster con un alcohol en presencia de un catalizador en la que se intercambian grupos alcohólicos –
es decir, se forma un segundo éster y un segundo alcohol– sin gasto de energía:
Las enzimas que catalizan estas reacciones son proteasas (tripsina, quimotripsina, papaína, etc.) o esterasas.
2 En el ARN (véase la figura abajo), es la reacción que se produce durante el fenómeno de corte y empalme en los
intrones de los grupos I, II y III; en este caso el grupo acilo es el fosfato de unión de las dos ribosas, y los alcoholes
intercambiados son los del carbono 3’ de distintas moléculas de ribosa.
transformation: transformación.
Proceso de introducción de moléculas de ADN en el interior de las células bacterianas. Se realiza fundamentalmente
mediante dos procedimientos distintos: con la ayuda de sustancias químicas (dimetilsulfóxido, cationes Rb+ , Ca2+ ,
Co2+ , etc.) o mediante electroporación.
transition: transición.
BASE-PAIR SUBSTITUTION.
translocon: traslocón.
Canal de la membrana del retículo endoplásmico que sirve para trasladar una proteína del interior al exterior
celular. Está formado por cinco proteínas o complejos proteicos: el complejo de reconocimiento de la señal (SRP), el
receptor de dicho complejo (receptor del SRP), el complejo proteico Sec61, la proteína de membrana asociada al
polipéptido de exportación (TRAM) y el complejo pentaproteico con actividad peptidasa que escinde el péptido señal.
translocator: transportador.
PORTER.
transpeptidation : transpeptidación.
Reacción de hidrólisis de un enlace peptídico entre dos aminoácidos y posterior restablecimiento del enlace entre
uno de ellos y un tercero sin gasto de energía. Son reacciones catalizadas por peptidil-transferasas y, a veces,
autocatalíticas (es el caso de la eliminación de inteínas). Véase INTEIN y EXTEIN.
transporter: transportador.
porter.
transposition: transposición.
1. Proceso de inserción de una copia de un elemento transponible en otro sitio del genoma; si la copia original
permanece en el sitio de inserción primitivo se llama replicative transposition. En cambio, si el transposón se mueve
como una entidad física de un sitio a otro sin duplicarse se llama nonreplicative transposition.
2. Movimiento de un segmento cromosómico hacia un lugar distinto dentro del mismo o de otro cromosoma, sin
intercambios recíprocos.
3. Cambio de posición de algunos pares de bases en la
misma secuencia de ADN, por ejemplo:
transposon: transposón.
TRANSPOSABLE ELEMENT.
transversion: transversión.
BASE-PAIR SUBSTITUTION.
tRNA : ARNt.
TRANSFER RNA.
tRNAfMet: ARNtfMet.
INITIATOR TRNA.
tRNAiMet: ARNtiMet.
INITIATOR TRNA.
U
ultra high-throughput: adj. de extrema productividad, ultrarrápido.
→ HIGH-THROUGHPUT y THROUGHPUT.
Observación: la IUPAC establece la siguiente diferencia entre high-throughput screening y ultra
high-throughput screening: «High-Throughput Screening (HTS): Process for rapid assessment of the activity of
samples from a combinatorial library or other compound collection, often by running parallel assays in plates of 96
or more wells. A screening rate of 100 000 assays per day has been termed ‘Ultra High Throughput Screening’
(UHTS)». Así pues, al menos en el ámbito de la química combinatoria, sólo a partir de una velocidad de cribado
equivalente a 100 000 ensayos por día se considera ultrarrápido el proceso.
URF : URF.
UNIDENTIFIED READING FRAME.
UTR : UTR.
UNTRANSLATED REGION.
V
variable number of tandem repeats: número variable de repeticiones en tándem.
VARIABLE NUMBER OF TANDEM REPEAT LOCI.
variable number of tandem repeat loci: locus con un número variable de repeticiones en tándem.
Regiones del ADN que contienen una secuencia breve de nucleótidos que se repite en tándem muchas veces. En la
población pueden existir varios alelos por locus, y cada alelo puede tener distinta longitud debido a la variación del
número de repeticiones. Se abrevia «VNTR». Para algunos autores son únicamente los minisatélites, pero otros las
clasifican en minisatélites y microsatélites (es decir que, para estos últimos, las repeticiones cortas en tándem o
microsatélites son un tipo de VNTR). Véase DNA FINGERPRINTING, DNA PROFILING.
VIGS: VIGS.
VIRALLY INDUCED GENE SILENCING.
virally induced gene silencing (VIGS) : silenciamiento génico inducido por virus (VIGS).
RNA INTERFERENCE.
Observación: es un caso de ribointerferencia causada por ARNbc de origen vírico.
viroid : viroide.
Pequeña molécula de ARN monocatenario circular (~350 nt), de multiplicación autónoma, que infecta a las células
de las plantas vasculares. Posee una gran autocomplementariedad de bases, carece de genes y, por lo tanto, no
expresa proteínas ni se encapsida, sólo se multiplica utilizando el aparato sintético de la célula. En cada ciclo de
multiplicación, forma concatámeros que luego se escinden por un mecanismo autocatalítico para fomar nuevos
viroides. Se presume que son intrones convertidos en unidades de multiplicación autónoma, pues tienen actividad
ribonucleasa. Tienen un gran poder infeccioso en las plantas vasculares y se sospecha que también existen en el
reino animal.
virusoide : virusoide.
SATELLITE RNA.
VNTR: VNTR.
VARIABLE NUMBER OF TANDEM REPEATS.
W
Western blot: membrana de Western.
Membrana de filtro que contiene proteínas transferidas y reveladas por el método Western (Western blotting).
Observación: en la jerga de laboratorio se habla coloquialmente de «el western», «el filtro» o «la membrana». En
la práctica se usa como sinónimo de Western blotting.
wobble : titubeo.
Propiedad de reconocimiento de codones y anticodones mediante la cual una base que ocupa la primera posición del
anticodón del ARNt puede aparearse con distintas bases ubicadas en la tercera posición del codón del ARNm, de
suerte que un mismo ARNt es capaz de reconocer más de un codón. Por ejemplo, un único ARNtTyr (anticodón 3’-
AUG-5’) traduce los codones 5’-UAU-3’ y 5’-UAC-3’ en tirosina:
5’ UAC 3’ codón
3’ AUG 5’ anticodón
Si entre codones y anticodones sólo hubiera apareamientos perfectos de bases, las células deberían contener tantas
especies de ARNt como codones existen en el ARNm. Lo cierto es que, debido a este reconocimiento titubeante,
muchos ARNt se aparean con más de un codón. Cabría esperar, pues, que el número de ARNt fuera menor que el
número de codones representantes de aminoácidos del código genético (61). No obstante, se han identificado más
de 80 especies de ARNt en E. coli y hasta 50-100 ARNt distintos en células de animales y vegetales, por lo tanto, la
cantidad de moléculas de ARNt es superior tanto al número de aminoácidos presentes en las proteínas (21) como al
número de codones del código genético.
Z
Zwille protein : proteína Zwille.
Miembro de la familia de proteínas Argonauta (Argonaute proteins), identificado inicialmente en Arabidopsis, donde
interviene en la regulación del desarrollo del meristemo apical durante la embriogénesis. También recibe el nombre
de pinhead.