Biosintesis Protein

 melibatkan proses translasi

 merupakan proses yang mengubah informasi genetic yang
terdapat pada mRNA menjadi polipeptida dengan urutan
asam amino tertentu

 translasi melibatkan suatu

sistem
o yang membawa
mRNA dan tRNA
bersama-sama

o mengkatalisis
polimerisasi asam amino -
asam amino
Central dogma menjadi
of genetic
information flow

 komponen yang terlibat:

o mRNA (messenger RNA)
o tRNA (transfer RNA)
o Ribosome
o Ensim2
 Pesan yang ada pada mRNA selalu dibaca dengan arah 5’  3’
 Rantai polipeptida yang dihasilkan berawal dari N terminal dan
berakhir dgn C (karboksi) terminal
 Proses translasi terdiri dari :
o inisiasi
o elongasi
o terminasi

Metabolisme asam amino dan protein TRN/2004 1

Messenger RNA (mRNA)

 diterjemahkan menjadi protein  merupakan RNA rantai

tunggal yang berisi pesan
yang akan pada organisme prokaryotic  pesan untuk
beberapa protein mungkin dibawa atau terdapat pada satu
rantai mRNA : polycistronic message
Hanya ada 4 macam nukleotida (DNA/RNA) & ada 20 asam
amino !!!

 setiap asam amino dikode oleh tiga nukleotida

43  ada 64 kombinasi berbeda

lebih dari cukup untuk mengkode 20 asam amino  hampir

semua asam amino dikode oleh lebih dari 1 kodon

 kodon  urutan 3 nukleotida pada mRNA yang mencirikan

asam amino tertentu
 hubungan antara kodon dengan asam amino yang dikode 
kode genetic
 anti kodon  urutan 3 nukleotida yang terdapat pada tRNA
yang merupakan komplemen dari kodon

 Pd prokaryotic  simple dan tidak bersela

 Pd eukaryotic  ada proses yang diperlukan sebelum mRNA
siap diterjemahkan dalam proses translasi  post translasi
o editing,
o splicing
o poli A tail

Metabolisme asam amino dan protein TRN/2004 2

 K
O
D
E

G
E
N
E
T
I
K

Metabolisme asam amino dan protein TRN/2004 3

 kode genetic  hampir universal untuk semua organisme,
pengecualian ditemukan pada mitokondria dan protozoa

 pengecualian yang sering ditemukan pada bbrp organisme 

UGA  STOP , mengkode Senelosistein

Wobble Hypothesis

Pada umumnya, setiap asam amino dispesifikasikan oleh dua

nukleotida yang pertama dari kodon
Example  Proline mempunyai codon : CC-
Valine mempunyai codon : GU-

Jadi basa nitrogen yang ke-3  tidak tertentu

 kondisi ini memungkin satu tRNA untuk mengenal lebih dari satu
kodon untuk asam amino yang sama

Basa nitrogen yang ke 3  disebut posisi Wobble

( karena ketidakpastian dalam complementary basa nitrogen antara
kodon mRNA dan anti kodon tRNA)

Metabolisme asam amino dan protein TRN/2004 4

  Wobble hipotesis juga untuk keberadaan inosine  uncommon
nucleotide yang dapat berpasangan dengan A,U, atau C
 Stop kodon  UAA, UAG, UGA
 Start kodon  AUG
o Prokaryotic organism  N-formylmethionine
o Eukaryotic organism  methionine

TRANSFER RNA (tRNA)

Ada 61 kodon yang mengkode 20 asam amino,

 macam tRNA yg ada kurang dari <61 karena wobble hipotesis
 tRNA dapat mengidentifikasi lebih dari 1 kodon

struktur tRNA  seperti daun waru

Metabolisme asam amino dan protein TRN/2004 5

Asam amino terikat dengan tRNA molekul dengan ikatan kovalen
antara  gugus karboksil pada asam amino
 gugus hidroksil pada 3’ adenosine dari tangkai akseptor
tRNA

tRNA + asam amino  teraminoasilasi

Aminoacyl-tRNA synthetase  mampu mengidentifikasi asam amino

yang cocok

Metabolisme asam amino dan protein TRN/2004 6

RIBOSOME

 Ribosome terdiri dari multiple protein dan RNA.

 Untuk prokaryotic  70s terdiri dari : 50s dan 30s
 Untuk eukaryotic  80s terdiri dari 60s dan 40s

KECEPATAN TRANSLASI

Pada 37ºC, ribosome dari E. coli mampu mensintesis rantai

polipeptida yang terdiri dari 300 residu asam amino = 20 detik

Hampir sama dengan kecepatan dari transkripsi, sehingga mRNA

dapat ditranslasikan sama cepatnya dengan transkripsinya  kadang
dalam 1 mRNA dapat ditranslasi oleh banyak ribosom 
polyribosome

Metabolisme asam amino dan protein TRN/2004 7

Post translasi

Sebelum polipeptida yang baru ditranslasi dapat aktif  harus dilipat

 membentuk konformasi 3D yang tepat
Folding  dapat berlangsung bersamaan dengan proses translasi
Atau setelah proses translasi selesai
Salah satu contoh preproprotein  preproinsulin

Metabolisme asam amino dan protein TRN/2004 8

Metabolisme asam amino dan protein TRN/2004 9